Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

Ignore:
Timestamp:
Jan 12, 2009 3:32:23 PM (16 years ago)
Author:
raasch
Message:

new environment variable mpilib in configuration file, used by mrun, mbuild, and subjob; small bugfix concerning t<0 in init_cloud_physics

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • palm/trunk/SCRIPTS/mrun

    r220 r221  
    164164     #                     default source-code filenames are allowed
    165165     # 14/11/08 - Siggi  - cond1 and cond2 are part of the depository name
     166     # 08/01/09 - Siggi  - mpi module on sgi machines to be used can be set
     167     #                     with environment variable mpilib
    166168
    167169
    … …  
    20152017 fi
    20162018
     2019
     2020    # SET DEFAULT VALUE FOR MPI MODULE TO BE USED ON SGI-ALTIX
     2021 if [[ $host = lcsgib  ||  $host = lcsgih ]]
     2022 then
     2023    [[ "$mpilib" = "" ]]  &&  export mpilib=mpt
     2024 fi
     2025
     2026
     2027
    20172028###########################################################################
    20182029# HEADER-AUSGABE
    … …  
    23692380       elif [[ $localhost = lcsgib ]]
    23702381       then
    2371           printf "      compiler is called via ssh on \"bicegate\" \n"
    2372           ssh  130.73.232.102  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load mpt; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
     2382          printf "      compiler is called via ssh on \"bicegate\" using module \"$mpilib\" \n"
     2383          ssh  130.73.232.102  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load $mpilib; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
    23732384          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
    23742385          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
    23752386       elif [[ $localhost = lcsgih ]]
    23762387       then
    2377           printf "      compiler is called via ssh on \"hicegate2\" \n"
    2378           ssh  130.75.4.103  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load mpt; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" 2>&1 "
    2379 #          ssh  130.75.4.102  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load mvapich2; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" 2>&1 "
    2380 #          print  ". /usr/share/modules/init/bash; module load mpt; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" " | ssh  ${usern}@130.75.4.102  2>&1
     2388          printf "      compiler is called via ssh on \"hicegate2\" using module \"$mpilib\" \n"
     2389          ssh  130.75.4.103  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load $mpilib; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" 2>&1 "
    23812390          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
    23822391          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
    … …  
    28302839          fi
    28312840          printf "\n\n"
    2832 #          ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
    2833 #          export MV2_NUM_PORTS=2
    2834 #          export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
    2835 #          mpiexec    ./a.out  $ROPTS
    2836 #          export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
    28372841           echo "no_coupling"  >  runfile_atmos
    2838            mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS
     2842           if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
     2843           then
     2844#              export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
     2845              mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS
     2846           elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
     2847           then
     2848#              ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
     2849#              export MV2_NUM_PORTS=2
     2850#              export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
     2851              mpiexec    ./a.out  $ROPTS
     2852           fi
    28392853       else
    28402854          printf "\n  +++ no debug available on \"$localhost\" "
    … …  
    29983012                if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
    29993013                then
    3000 #                   ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
    3001 #                   export MV2_NUM_PORTS=2
    3002 #                   export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
    3003 #                   mpiexec    ./a.out  $ROPTS
    3004 #                   export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
    3005                    mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS
     3014                   if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
     3015                   then
     3016#                      export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
     3017                      mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS
     3018                   elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
     3019                   then
     3020#                      ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
     3021#                      export MV2_NUM_PORTS=2
     3022#                      export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
     3023                      mpiexec    ./a.out  $ROPTS
     3024                   fi
    30063025                elif [[ $host = lcxt4 ]]
    30073026                then
    … …  
    30273046                   then
    30283047
    3029                       mpiexec_mpt -np $iia  ./palm  $ROPTS < runfile_atmos &
    3030                       mpiexec_mpt -np $iio  ./palm  $ROPTS < runfile_ocean &
     3048                      if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
     3049                      then
     3050#                         export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
     3051                         mpiexec_mpt -np $iia  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
     3052                         mpiexec_mpt -np $iio  ./a.out  $ROPTS < runfile_ocean &
     3053                      elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
     3054                      then
     3055#                         ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
     3056#                         export MV2_NUM_PORTS=2
     3057#                         export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
     3058                         mpiexec -n $iia  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
     3059                         mpiexec -n $iio  ./a.out  $ROPTS < runfile_ocean &
     3060                      fi
    30313061
    30323062                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
    … …  
    30513081                   then
    30523082
    3053                       mpiexec_mpt  -np $ii  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos
     3083                      if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
     3084                      then
     3085#                         export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
     3086                         mpiexec_mpt -np $ii  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos
     3087                      elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
     3088                      then
     3089#                         ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
     3090#                         export MV2_NUM_PORTS=2
     3091#                         export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
     3092                         mpiexec  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos
     3093                      fi
    30543094
    30553095                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |