Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

Changeset 206 for palm/trunk/SCRIPTS


Ignore:
Timestamp:
Oct 13, 2008 2:59:11 PM (16 years ago)
Author:
raasch
Message:

ocean-atmosphere coupling realized with MPI-1, adjustments in mrun, mbuild, subjob for lcxt4

Location:
palm/trunk/SCRIPTS
Files:
4 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.default

    r182 r206  
    5353%sgi_feature       ice                                        lcsgih parallel
    5454#%remote_username   <replace by your HLRN username>            lcsgih parallel
    55 %compiler_name     mpif90                                     lcsgih parallel
     55%compiler_name     ifort                                      lcsgih parallel
    5656%compiler_name_ser ifort                                      lcsgih parallel
    5757%cpp_options       -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf_64bit   lcsgih parallel
    … …  
    5959%netcdf_lib        -L/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:-lnetcdf:-lnetcdff      lcsgih parallel
    6060%fopts             -g:-w:-xT:-O3:-cpp:-openmp:-r8:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian  lcsgih parallel
    61 %lopts             -g:-w:-xT:-O3:-cpp:-openmp:-r8:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-Vaxlib:-i-dynamic      lcsgih parallel
     61%lopts             -g:-w:-xT:-O3:-cpp:-openmp:-r8:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-Vaxlib:-i-dynamic:-lmpi   lcsgih parallel
    6262#%tmp_data_catalog  /gfs1/work/<replace by your HLRN username>/palm_restart_data      lcsgih parallel
    6363#%tmp_user_catalog  /gfs1/tmp/<replace by your HLRN username>                         lcsgih parallel
    … …  
    6565%sgi_feature       ice                                        lcsgih parallel debug
    6666#%remote_username   <replace by your HLRN username>            lcsgih parallel debug
    67 %compiler_name     mpif90                                     lcsgih parallel debug
     67%compiler_name     ifort                                      lcsgih parallel debug
    6868%compiler_name_ser ifort                                      lcsgih parallel debug
    6969%cpp_options       -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf_64bit   lcsgih parallel debug
    … …  
    7171%netcdf_lib        -L/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:-lnetcdf:-lnetcdff      lcsgih parallel debug
    7272%fopts             -C:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-O0:-cpp:-r8:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian  lcsgih parallel debug
    73 %lopts             -C:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-O0:-cpp:-r8:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-Vaxlib:-i-dynamic      lcsgih parallel debug
     73%lopts             -C:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-O0:-cpp:-r8:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-Vaxlib:-lmpi           lcsgih parallel debug
    7474#%tmp_data_catalog  /gfs1/work/<replace by your HLRN username>/palm_restart_data      lcsgih parallel debug
    7575#%tmp_user_catalog  /gfs1/tmp/<replace by your HLRN username>                         lcsgih parallel debug

  • palm/trunk/SCRIPTS/mbuild

    r201 r206  
    9494     # 21/07/08 - Siggi - mainprog (executable) is added to the tar-file
    9595     #                    ({mainprog}_current_version)
     96     # 02/10/08 - Siggi - adapted for lcxt4
    9697
    9798
    … …  
    729730        (lcsgih)         remote_addres=130.75.4.102;;
    730731        (lctit)          remote_addres=172.17.75.161;;
     732        (lcxt4)          remote_addres=129.177.20.113;;
    731733        (decalpha)       remote_addres=165.132.26.56;;
    732734        (ibmb)           remote_addres=130.73.230.10;;
    … …  
    12351237                ssh  ${remote_username}@${remote_addres} "[[ ! -d ${remote_md} ]]  &&  (echo \"  *** ${remote_md} will be created\"; mkdir -p  ${remote_md})"
    12361238             else
    1237                    # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
     1239                   # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
    12381240                   # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
    12391241                print "[[ ! -d ${remote_md} ]]  &&  (echo \"  *** ${remote_md} will be created\"; mkdir -p  ${remote_md})"  |  ssh ${remote_username}@${remote_addres}  2>&1
    … …  
    12411243             if [[ $local_host = decalpha ]]
    12421244             then
    1243                    # DECALPHA BENUTZT BEI NICHTANGABE DES VOLLSTÄNDIGEN PFADES
     1245                   # DECALPHA BENUTZT BEI NICHTANGABE DES VOLLSTï¿œNDIGEN PFADES
    12441246                   # IRGENDEIN ANDERES SCP (WAS NICHT FUNKTIONIERT). AUSSERDEM
    12451247                   # KOENNEN DOLLAR-ZEICHEN NICHT BENUTZT WERDEN
    … …  
    12581260                ssh  ${remote_username}@${remote_addres}  "cd ${remote_md}; [[ -f ${mainprog}_current_version.tar ]]  &&  tar -xf  ${mainprog}_current_version.tar"
    12591261             else
    1260                    # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
     1262                   # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
    12611263                   # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
    12621264                print  "cd ${remote_md}; [[ -f ${mainprog}_current_version.tar ]]  &&  tar -xf  ${mainprog}_current_version.tar"  |  ssh  ${remote_username}@${remote_addres}  2>&1
    … …  
    12701272                ssh  ${remote_username}@${remote_addres}  "cd ${remote_md}; tar -xf  ${mainprog}_sources.tar"
    12711273             else
    1272                    # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
     1274                   # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
    12731275                   # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
    12741276                print  "cd ${remote_md}; tar -xf  ${mainprog}_sources.tar"  |  ssh  ${remote_username}@${remote_addres}  2>&1
    … …  
    13191321                   print "cd ${remote_md}; echo $make_call_string > LAST_MAKE_CALL; chmod u+x LAST_MAKE_CALL; $make_call_string; [[ \$? != 0 ]] && echo MAKE_ERROR" | ssh  ${remote_username}@${remote_addres} 2>&1 | tee ${remote_host}_last_make_protokoll
    13201322                done
     1323
     1324             elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
     1325             then
     1326
     1327                print "cd ${remote_md}; echo $make_call_string > LAST_MAKE_CALL; chmod u+x LAST_MAKE_CALL; $make_call_string; [[ \$? != 0 ]] && echo MAKE_ERROR" | ssh  ${remote_username}@${remote_addres} 2>&1 | tee ${remote_host}_last_make_protokoll
    13211328
    13221329             else
    … …  
    13571364                ssh  ${remote_username}@${remote_addres}  "cd ${remote_md}; chmod u+w *; tar -cf  ${mainprog}_current_version.tar  ${mainprog}  *.f90 *.o *.mod"
    13581365             else
    1359                    # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
     1366                   # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
    13601367                   # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
    13611368                print  "cd ${remote_md}; chmod u+w *; tar -cf  ${mainprog}_current_version.tar  ${mainprog}  *.f90 *.o *.mod"  |  ssh  ${remote_username}@${remote_addres}  2>&1
    … …  
    13851392                ssh  ${remote_username}@${remote_addres} "[[ ! -d ${remote_ud} ]]  &&  (echo \"  *** ${remote_ud} will be created\"; mkdir -p  ${remote_ud}); [[ ! -d ${remote_ud}/../SCRIPTS ]]  &&  (echo \"  *** ${remote_ud}/../SCRIPTS will be created\"; mkdir -p ${remote_ud}/../SCRIPTS)"
    13861393             else
    1387                    # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
     1394                   # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
    13881395                   # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
    13891396                print "[[ ! -d ${remote_ud} ]]  &&  (echo \"  *** ${remote_ud} will be created\"; mkdir -p  ${remote_ud}); [[ ! -d ${remote_ud}/../SCRIPTS ]]  &&  (echo \"  *** ${remote_ud}/../SCRIPTS will be created\"; mkdir -p  ${remote_ud}/../SCRIPTS)"  |  ssh ${remote_username}@${remote_addres}  2>&1
    … …  
    13931400             if [[ $local_host = decalpha ]]
    13941401             then
    1395                    # DECALPHA BENUTZT BEI NICHTANGABE DES VOLLSTÄNDIGEN PFADES
     1402                   # DECALPHA BENUTZT BEI NICHTANGABE DES VOLLSTï¿œNDIGEN PFADES
    13961403                   # IRGENDEIN ANDERES SCP (WAS NICHT FUNKTIONIERT). AUSSERDEM
    13971404                   # KOENNEN DOLLAR-ZEICHEN NICHT BENUTZT WERDEN
    … …  
    14091416             if [[ $local_host = decalpha ]]
    14101417             then
    1411                    # DECALPHA BENUTZT BEI NICHTANGABE DES VOLLSTÄNDIGEN PFADES
     1418                   # DECALPHA BENUTZT BEI NICHTANGABE DES VOLLSTï¿œNDIGEN PFADES
    14121419                   # IRGENDEIN ANDERES SCP (WAS NICHT FUNKTIONIERT). AUSSERDEM
    14131420                   # KOENNEN DOLLAR-ZEICHEN NICHT BENUTZT WERDEN

  • palm/trunk/SCRIPTS/mrun

    r204 r206  
    154154     # 08/08/08 - Marcus - typo removed in lcxt4 branch
    155155     # 17/09/08 - Siggi  - restart mechanism adjusted for lcsgi
     156     # 02/10/09 - BjornM - argument "-Y" modified, adjustments for coupled runs
    156157 
    157158    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
    … …  
    171172 cond2=""
    172173 config_file=.mrun.config
     174 coupled_dist=""
     175 coupled_mode="mpi1"
    173176 cpp_opts=""
    174177 cpp_options=""
    … …  
    219222 node_usage=default
    220223 numprocs=""
     224 numprocs_atmos=0
     225 numprocs_ocean=0
    221226 OOPT=""
    222227 openmp=false
    … …  
    262267
    263268 typeset -i  iec=0 iic=0 iin=0 ioc=0 iout=0 memory=0 stagein_anz=0 stageout_anz=0
    264  typeset -i  cputime i ii iii icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
     269 typeset -i  cputime i ii iia iii iio icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
    265270
    266271 typeset  -R30 calltime
    … …  
    381386    # SHELLSCRIPT-OPTIONEN EINLESEN UND KOMMANDO NEU ZUSAMMENSETZEN, FALLS ES
    382387    # FUER FOLGEJOBS BENOETIGT WIRD
    383  while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:Fg:G:h:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX:Y option
     388 while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:Fg:G:h:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX:Y: option
    384389 do
    385390   case  $option  in
    … …  
    420425       (x)   do_trace=true;set -x; mc="$mc -x";;
    421426       (X)   numprocs=$OPTARG; mc="$mc -X$OPTARG";;
    422        (Y)   run_coupled_model=true; mc="$mc -Y";;
     427       (Y)   run_coupled_model=true; coupled_dist=$OPTARG; mc="$mc -Y'$OPTARG'";;
    423428       (\?)  printf "\n  +++ unknown option $OPTARG \n"
    424429             printf "\n  --> type \"$0 ?\" for available options \n"
    … …  
    437442 then
    438443   (printf "\n  *** mrun can be called as follows:\n"
    439     printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X.. <modus>\n"
     444    printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X.. -Y.. <modus>\n"
    440445    printf "\n      Description of available options:\n"
    441446    printf "\n      Option  Description                              Default-Value"
    … …  
    475480    printf "\n        -x    tracing of mrun for debug purposes       ---"
    476481    printf "\n        -X    # of processors (on parallel machines)   1"
    477     printf "\n        -Y    run coupled model                        ---"
     482    printf "\n        -Y    run coupled model, \"#1 #2\" with"
     483    printf "\n              #1 atmosphere and #2 ocean processors    \"#/2 #/2\" depending on -X"
    478484    printf "\n "
    479485    printf "\n      Possible values of positional parameter <modus>:"
    … …  
    509515 while read line
    510516 do
    511     if [[ "$line" != ""  ||  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
     517    if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
    512518    then
    513519       HOSTNAME=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
    … …  
    530536    locat=localhost; exit
    531537 fi
    532 
    533538
    534539
    … …  
    586591    do_remote=true
    587592    case  $host  in
    588         (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|neck|lcsgib|lcsgih|lctit|unics)  true;;
     593        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|neck|lcsgib|lcsgih|lctit|unics|lcxt4)  true;;
    589594        (*)  printf "\n"
    590595             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
    … …  
    609614       locat=options; exit
    610615    fi
     616 fi
     617
     618
     619      # KOPPLUNGSEIGENSCHAFTEN (-Y) AUSWERTEN UND coupled_mode BESTIMMEN
     620 if [[ $run_coupled_model = true ]]
     621 then
     622
     623    if  [[ -n $coupled_dist ]]
     624    then
     625
     626       numprocs_atmos=`echo $coupled_dist | cut -d" " -s -f1`
     627       numprocs_ocean=`echo $coupled_dist | cut -d" " -s -f2`
     628
     629       if (( $numprocs_ocean + $numprocs_atmos != $numprocs ))
     630       then
     631
     632          printf "\n  +++ number of processors does not fit to specification by \"-Y\"."
     633          printf "\n      PEs (total)     : $numprocs"
     634          printf "\n      PEs (atmosphere): $numprocs_atmos"
     635          printf "\n      PEs (ocean)     : $numprocs_ocean"
     636          locat=coupling; exit
     637
     638          # REARRANGING BECAUSE CURRENTLY ONLY 1:1 TOPOLOGIES ARE SUPPORTED
     639          # THIS SHOULD BE REMOVED IN FUTURE
     640       elif (( $numprocs_ocean != $numprocs_atmos ))
     641       then
     642
     643          printf "\n  +++ currently only 1:1 topologies are supported"
     644          printf "\n      PEs (total)     : $numprocs"
     645          printf "\n      PEs (atmosphere): $numprocs_atmos"
     646          printf "\n      PEs (ocean)     : $numprocs_ocean"
     647          (( numprocs_atmos = $numprocs / 2 ))
     648          (( numprocs_ocean = $numprocs / 2 ))
     649          printf "\n  +++ rearranged topology to $numprocs_atmos:$numprocs_ocean"
     650
     651       fi
     652
     653    else
     654
     655       (( numprocs_ocean = $numprocs / 2 ))
     656       (( numprocs_atmos = $numprocs / 2 ))
     657
     658    fi
     659    coupled_dist=`echo "$numprocs_atmos $numprocs_ocean"`
     660
     661       # GET coupled_mode FROM THE CONFIG FILE
     662    line=""
     663    grep  "%cpp_options.*-D__mpi2.*$host" $config_file  >  tmp_mrun
     664    while read line
     665    do
     666       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" &&  ( $(echo $line | cut -d" " -s -f4) = $cond1 || $(echo $line | cut -d" " -s -f4)  = $cond2 ) ]]
     667       then
     668          coupled_mode="mpi2"
     669       fi
     670    done < tmp_mrun
     671
    611672 fi
    612673
    … …  
    705766                   do_remote=true
    706767                   case  $host  in
    707                        (ibm|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|neck|unics)  true;;
     768                       (ibm|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|neck|unics|lcxt4)  true;;
    708769                       (*)  printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
    709770                            printf "\n      is not available"
    … …  
    9601021    do_remote=true
    9611022    case  $host  in
    962         (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|neck|unics)  true;;
     1023        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|neck|unics|lcxt4)  true;;
    9631024        (*)  printf "\n"
    9641025             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
    … …  
    28672928                fi
    28682929             else
    2869                 ((  iii = ii / 2 ))
    2870                 echo "atmosphere_to_ocean"  >  runfile_atmos
    2871                 echo "ocean_to_atmosphere"  >  runfile_ocean
    2872 
    2873                 printf "\n      coupled run ($iii atmosphere, $iii ocean)"
     2930
     2931                    # currently there is no full MPI-2 support on ICE and XT4
     2932                (( iia = $numprocs_atmos / $threads_per_task ))
     2933                (( iio = $numprocs_ocean / $threads_per_task ))
     2934                printf "\n      coupled run ($iia atmosphere, $iio ocean)"
     2935                printf "\n      using $coupled_mode coupling"
    28742936                printf "\n\n"
    28752937
    2876                 if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
     2938                if [[ $coupled_mode = "mpi2" ]]
    28772939                then
    2878 
    2879                    mpiexec  -n $iii  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos &
    2880                    mpiexec  -n $iii  a.out  $ROPTS  <  runfile_ocean &
    2881 #                   head  -n $iii  $PBS_NODEFILE  >  nodefile_atmos
    2882 #                   echo "--- nodefile_atmos:"
    2883 #                   cat nodefile_atmos
    2884 #                   tail  -n $iii  $PBS_NODEFILE  >  nodefile_ocean
    2885 #                   echo "--- nodefile_ocean:"
    2886 #                   cat nodefile_ocean
    2887 #                   export  PBS_NODEFILE=${PWD}/nodefile_atmos
    2888 #                   mpiexec_mpt -np $iii   ./a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos &
    2889 #                   export  PBS_NODEFILE=${PWD}/nodefile_ocean
    2890 #                   mpiexec_mpt -np $iii   ./a.out  $ROPTS  <  runfile_ocean &
    2891 
    2892 
    2893                 elif [[ $host = lcxt4 ]]
    2894                 then
    2895                    aprun  -n $iii  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS  &
    2896                    aprun  -n $iii  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_ocean  $ROPTS  &
     2940                   echo "atmosphere_to_ocean $iia $iio"  >  runfile_atmos
     2941                   echo "ocean_to_atmosphere $iia $iio"  >  runfile_ocean
     2942                   if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
     2943                   then
     2944
     2945                      mpiexec_mpt -np $iia  ./palm  $ROPTS < runfile_atmos &
     2946                      mpiexec_mpt -np $iio  ./palm  $ROPTS < runfile_ocean &
     2947
     2948                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
     2949                   then
     2950
     2951                      aprun  -n $iia  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS  &
     2952                      aprun  -n $iio  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_ocean  $ROPTS  &
     2953
     2954                   else
     2955                          # WORKAROUND BECAUSE mpiexec WITH -env option IS NOT AVAILABLE ON SOME SYSTEMS
     2956                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iia  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos &
     2957                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iio  a.out  $ROPTS  <  runfile_ocean &
     2958#                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iia  -env coupling_mode atmosphere_to_ocean  a.out  $ROPTS  &
     2959#                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iio  -env coupling_mode ocean_to_atmosphere  a.out  $ROPTS  &
     2960                   fi
     2961                   wait
     2962
    28972963                else
    28982964
    2899                       # WORKAROUND BECAUSE mpiexec WITH -env option IS NOT AVAILABLE ON SOME SYSTEMS
    2900                    mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos &
    2901                    mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  a.out  $ROPTS  <  runfile_ocean &
    2902 #                   mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  -env coupling_mode atmosphere_to_ocean  a.out  $ROPTS  &
    2903 #                   mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  -env coupling_mode ocean_to_atmosphere  a.out  $ROPTS  &
     2965                   echo "coupled_run $iia $iio"  >  runfile_atmos
     2966                   if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
     2967                   then
     2968
     2969                      mpiexec_mpt  -np $ii  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos
     2970
     2971                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
     2972                   then
     2973
     2974                      aprun  -n $ii  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS
     2975
     2976                   fi
     2977                   wait
    29042978                fi
    2905                 wait
    2906              fi
    29072979
    29082980#             if [[ $scirocco = true ]]
    … …  
    29122984#                mpirun  -machinefile hostfile  -np $ii  a.out  $ROPTS
    29132985#             fi
    2914 
     2986             fi
    29152987          elif [[ $host = decalpha ]]
    29162988          then
    … …  
    37783850    [[ $delete_temporary_catalog = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -B"
    37793851    [[ $node_usage != default  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != novice ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -n $node_usage"
    3780     [[ $run_coupled_model = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -Y"
     3852    [[ $run_coupled_model = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -Y \"$coupled_dist\""
    37813853    if [[ $do_remote = true ]]
    37823854    then

  • palm/trunk/SCRIPTS/subjob

    r205 r206  
    9494     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
    9595     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
     96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
     97
    9698
    9799
    … …  
    646648#!/bin/ksh
    647649#PBS -N $job_name
    648 #PBS -A nersc
     650#PBS -A geofysisk
    649651#PBS -l walltime=$timestring
    650652#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
    651653#PBS -l pmem=${memory}mb
    652654#PBS -m abe
    653 #PBS -M igore@nersc.no
     655#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
    654656#PBS -o $remote_dayfile
    655657#PBS -j oe
    … …  
    662664#!/bin/ksh
    663665#PBS -N $job_name
    664 #PBS -A nersc
     666#PBS -A geofysisk
    665667#PBS -l walltime=$timestring
    666668#PBS -l ncpus=1
    667669#PBS -l pmem=${memory}mb
    668670#PBS -m abe
    669 #PBS -M igore@nersc.no
     671#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
    670672#PBS -o $remote_dayfile
    671673#PBS -j oe
    … …  
    730732#PBS -S /bin/ksh
    731733#PBS -N $job_name
    732 #PBS -A nersc
     734#PBS -A geofysisk
     735#PBS -j oe
    733736#PBS -l walltime=$timestring
    734737#PBS -l mppwidth=${numprocs}
    735738#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
    736739#PBS -m abe
    737 #PBS -M igore@nersc.no
     740#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
    738741#PBS -o $remote_dayfile
    739 #PBS -e $remote_dayfile
    740742
    741743%%END%%
    … …  
    746748#PBS -S /bin/ksh
    747749#PBS -N $job_name
    748 #PBS -A nersc
     750#PBS -A geofysisk
     751#PBS -j oe
    749752#PBS -l walltime=$timestring
    750753#PBS -l ncpus=1
    751754#PBS -l pmem=${memory}mb
    752755#PBS -m abe
    753 #PBS -M igore@nersc.no
     756#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
    754757#PBS -o $remote_dayfile
    755 #PBS -e $remote_dayfile
    756758
    757759%%END%%
    … …  
    11181120          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
    11191121       else
    1120              # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
     1122             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
    11211123             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
    11221124             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |