source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 2975

Last change on this file since 2975 was 2967, checked in by raasch, 7 years ago

bugfix: missing parallel cpp-directives added

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 27.8 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[2000]2!------------------------------------------------------------------------------!
[2696]3! This file is part of the PALM model system.
[1036]4!
[2000]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
[1036]9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
[2718]17! Copyright 1997-2018 Leibniz Universitaet Hannover
[2000]18!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]19!
[254]20! Current revisions:
[1106]21! ------------------
[1961]22!
[2233]23!
[1552]24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 2967 2018-04-13 11:22:08Z suehring $
[2967]27! bugfix: missing parallel cpp-directives added
28!
29! 2817 2018-02-19 16:32:21Z knoop
[2817]30! Preliminary gust module interface implemented
31!
32! 2766 2018-01-22 17:17:47Z kanani
[2766]33! Removed preprocessor directive __chem
34!
35! 2756 2018-01-16 18:11:14Z suehring
[2756]36! Fill values for 3D output of chemical species introduced.
37!
38! 2746 2018-01-15 12:06:04Z suehring
[2746]39! Move flag plant canopy to modules
40!
41! 2718 2018-01-02 08:49:38Z maronga
[2716]42! Corrected "Former revisions" section
43!
44! 2696 2017-12-14 17:12:51Z kanani
45! Change in file header (GPL part)
[2696]46! Implementation of turbulence_closure_mod (TG)
47! Implementation of chemistry module (FK)
48! Set fill values at topography grid points or e.g. non-natural-type surface
49! in case of LSM output (MS)
50!
51! 2512 2017-10-04 08:26:59Z raasch
[2512]52! upper bounds of 3d output changed from nx+1,ny+1 to nx,ny
53! no output of ghost layer data
54!
55! 2292 2017-06-20 09:51:42Z schwenkel
[2292]56! Implementation of new microphysic scheme: cloud_scheme = 'morrison'
57! includes two more prognostic equations for cloud drop concentration (nc) 
58! and cloud water content (qc).
59!
60! 2233 2017-05-30 18:08:54Z suehring
[1552]61!
[2233]62! 2232 2017-05-30 17:47:52Z suehring
63! Adjustments to new topography concept
64!
[2210]65! 2209 2017-04-19 09:34:46Z kanani
66! Added plant canopy model output
67!
[2032]68! 2031 2016-10-21 15:11:58Z knoop
69! renamed variable rho to rho_ocean and rho_av to rho_ocean_av
70!
[2012]71! 2011 2016-09-19 17:29:57Z kanani
72! Flag urban_surface is now defined in module control_parameters,
73! changed prefix for urban surface model output to "usm_",
74! introduced control parameter varnamelength for LEN of trimvar.
75!
[2008]76! 2007 2016-08-24 15:47:17Z kanani
77! Added support for new urban surface model (temporary modifications of
78! SELECT CASE ( ) necessary, see variable trimvar)
79!
[2001]80! 2000 2016-08-20 18:09:15Z knoop
81! Forced header and separation lines into 80 columns
82!
[1981]83! 1980 2016-07-29 15:51:57Z suehring
84! Bugfix, in order to steer user-defined output, setting flag found explicitly
85! to .F.
86!
[1977]87! 1976 2016-07-27 13:28:04Z maronga
88! Output of radiation quantities is now done directly in the respective module
89!
[1973]90! 1972 2016-07-26 07:52:02Z maronga
91! Output of land surface quantities is now done directly in the respective module.
92! Unnecessary directive __parallel removed.
93!
[1961]94! 1960 2016-07-12 16:34:24Z suehring
95! Scalar surface flux added
96!
[1851]97! 1849 2016-04-08 11:33:18Z hoffmann
98! prr moved to arrays_3d
99!
[1823]100! 1822 2016-04-07 07:49:42Z hoffmann
101! prr vertical dimensions set to nzb_do to nzt_do. Unused variables deleted.
102!
[1809]103! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
104! test output removed
105!
[1784]106! 1783 2016-03-06 18:36:17Z raasch
107! name change of netcdf routines and module + related changes
108!
[1746]109! 1745 2016-02-05 13:06:51Z gronemeier
110! Bugfix: test if time axis limit exceeds moved to point after call of check_open
111!
[1692]112! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
113! Added output of radiative heating rates for RRTMG
114!
[1683]115! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
116! Code annotations made doxygen readable
117!
[1586]118! 1585 2015-04-30 07:05:52Z maronga
119! Added support for RRTMG
120!
[1552]121! 1551 2015-03-03 14:18:16Z maronga
[1551]122! Added suppport for land surface model and radiation model output. In the course
123! of this action, the limits for vertical loops have been changed (from nzb and
124! nzt+1 to nzb_do and nzt_do, respectively in order to allow soil model output).
125! Moreover, a new vertical grid zs was introduced.
[1329]126!
[1360]127! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
128! New particle structure integrated.
129!
[1354]130! 1353 2014-04-08 15:21:23Z heinze
131! REAL constants provided with KIND-attribute
132!
[1329]133! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
134! parts concerning avs output removed,
135! -netcdf output queries
136!
[1321]137! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
[1320]138! ONLY-attribute added to USE-statements,
139! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
140! kinds are defined in new module kinds,
141! old module precision_kind is removed,
142! revision history before 2012 removed,
143! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
144! all variable declaration statements
[674]145!
[1319]146! 1318 2014-03-17 13:35:16Z raasch
147! barrier argument removed from cpu_log,
148! module interfaces removed
149!
[1309]150! 1308 2014-03-13 14:58:42Z fricke
151! Check, if the limit of the time dimension is exceeded for parallel output
152! To increase the performance for parallel output, the following is done:
153! - Update of time axis is only done by PE0
154!
[1245]155! 1244 2013-10-31 08:16:56Z raasch
156! Bugfix for index bounds in case of 3d-parallel output
157!
[1116]158! 1115 2013-03-26 18:16:16Z hoffmann
159! ql is calculated by calc_liquid_water_content
160!
[1107]161! 1106 2013-03-04 05:31:38Z raasch
162! array_kind renamed precision_kind
163!
[1077]164! 1076 2012-12-05 08:30:18Z hoffmann
165! Bugfix in output of ql
166!
[1054]167! 1053 2012-11-13 17:11:03Z hoffmann
168! +nr, qr, prr, qc and averaged quantities
169!
[1037]170! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
171! code put under GPL (PALM 3.9)
172!
[1035]173! 1031 2012-10-19 14:35:30Z raasch
174! netCDF4 without parallel file support implemented
175!
[1008]176! 1007 2012-09-19 14:30:36Z franke
177! Bugfix: missing calculation of ql_vp added
178!
[1]179! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
180! Initial revision
181!
182!
183! Description:
184! ------------
[1682]185!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[1]186!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]187 SUBROUTINE data_output_3d( av )
188 
[1]189
[1320]190    USE arrays_3d,                                                             &
[2292]191        ONLY:  e, nc, nr, p, pt, prr, q, qc, ql, ql_c, ql_v, qr, rho_ocean, s, &
192               sa, tend, u, v, vpt, w
[1320]193       
[1]194    USE averaging
[1320]195       
[2696]196    USE chemistry_model_mod,                                                   &
197        ONLY:  chem_data_output_3d
198
[1320]199    USE cloud_parameters,                                                      &
[1849]200        ONLY:  l_d_cp, pt_d_t
[1320]201       
202    USE control_parameters,                                                    &
[2696]203        ONLY:  air_chemistry, cloud_physics, do3d, do3d_no, do3d_time_count,   &
204               io_blocks, io_group, land_surface, message_string,              &
[2746]205               ntdim_3d, nz_do3d,  plant_canopy,                               &
[2232]206               psolver, simulated_time, time_since_reference_point,            &
207               urban_surface, varnamelength
[1320]208       
209    USE cpulog,                                                                &
210        ONLY:  log_point, cpu_log
[2817]211
212    USE gust_mod,                                                              &
213        ONLY: gust_data_output_3d, gust_module_enabled
[1320]214       
215    USE indices,                                                               &
[2696]216        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxr, ny, nyn, nys, nzb, wall_flags_0
[1320]217       
218    USE kinds
219   
[1551]220    USE land_surface_model_mod,                                                &
[2232]221        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]222
[1783]223#if defined( __netcdf )
224    USE NETCDF
225#endif
226
227    USE netcdf_interface,                                                      &
[2696]228        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
[1783]229               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[1320]230       
231    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]232        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
233               particle_advection_start, prt_count
[1320]234       
[1]235    USE pegrid
236
[2209]237    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
[2746]238        ONLY:  pcm_data_output_3d
[2209]239       
[1585]240    USE radiation_model_mod,                                                   &
[2696]241        ONLY:  nzub, nzut, radiation, radiation_data_output_3d
[1585]242
[2696]243    USE turbulence_closure_mod,                                                &
244        ONLY:  tcm_data_output_3d
245
[2007]246    USE urban_surface_mod,                                                     &
[2696]247        ONLY:  usm_data_output_3d
[1585]248
[2007]249
[1]250    IMPLICIT NONE
251
[1682]252    INTEGER(iwp) ::  av        !<
[2696]253    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
[1682]254    INTEGER(iwp) ::  i         !<
255    INTEGER(iwp) ::  if        !<
256    INTEGER(iwp) ::  j         !<
257    INTEGER(iwp) ::  k         !<
258    INTEGER(iwp) ::  n         !<
259    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
260    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]261
[1682]262    LOGICAL      ::  found     !<
263    LOGICAL      ::  resorted  !<
[1]264
[1682]265    REAL(wp)     ::  mean_r    !<
266    REAL(wp)     ::  s_r2      !<
267    REAL(wp)     ::  s_r3      !<
[1]268
[1682]269    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !<
[1]270
[1682]271    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !<
[1]272
[2011]273    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]274
[1]275!
276!-- Return, if nothing to output
277    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
278
279    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
280
281!
282!-- Open output file.
[2512]283!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
284!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
285!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]286!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]287    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[2967]288#if defined( __parallel )
[1327]289       CALL check_open( 30 )
[2967]290#endif
[1327]291       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]292    ELSE
[1327]293       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]294    ENDIF
[1]295
296!
[1745]297!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
298!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
299!-- the given end time by the length of the given output interval.
300    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
301       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
302          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',  &
303                                      simulated_time, '&because the maximum ', & 
304                                      'number of output time levels is ',      &
305                                      'exceeded.'
306          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
307          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
308          RETURN
309       ENDIF
310    ENDIF
311
312!
[1031]313!-- Update the netCDF time axis
[1308]314!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
315!-- performance.
[1]316#if defined( __netcdf )
[1308]317    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
318    IF ( myid == 0 )  THEN
[1327]319       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
320                               (/ time_since_reference_point /),            &
321                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
322                               count = (/ 1 /) )
[1783]323       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]324    ENDIF
325#endif
326
327!
328!-- Loop over all variables to be written.
329    if = 1
330
331    DO  WHILE ( do3d(av,if)(1:1) /= ' ' )
[2007]332
[1]333!
[2007]334!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
335!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]336!--    Store the array chosen on the temporary array.
[2007]337       trimvar = TRIM( do3d(av,if) )
[2011]338       IF ( urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
[2007]339          trimvar = 'usm_output'
340          resorted = .TRUE.
341          nzb_do   = nzub
342          nzt_do   = nzut
343       ELSE
344          resorted = .FALSE.
345          nzb_do   = nzb
346          nzt_do   = nz_do3d
347       ENDIF
[1551]348!
[1980]349!--    Set flag to steer output of radiation, land-surface, or user-defined
350!--    quantities
351       found = .FALSE.
352!
[1551]353!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]354       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]355!
356!--    Before each output, set array local_pf to fill value
357       local_pf = fill_value
358!
359!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
360       flag_nr = 0
[1551]361
[2007]362       SELECT CASE ( trimvar )
[1]363
364          CASE ( 'e' )
365             IF ( av == 0 )  THEN
366                to_be_resorted => e
367             ELSE
368                to_be_resorted => e_av
369             ENDIF
370
[771]371          CASE ( 'lpt' )
372             IF ( av == 0 )  THEN
373                to_be_resorted => pt
374             ELSE
375                to_be_resorted => lpt_av
376             ENDIF
377
[2292]378          CASE ( 'nc' )
379             IF ( av == 0 )  THEN
380                to_be_resorted => nc
381             ELSE
382                to_be_resorted => nc_av
383             ENDIF
384
[1053]385          CASE ( 'nr' )
386             IF ( av == 0 )  THEN
387                to_be_resorted => nr
388             ELSE
389                to_be_resorted => nr_av
390             ENDIF
391
[1]392          CASE ( 'p' )
393             IF ( av == 0 )  THEN
[727]394                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]395                to_be_resorted => p
396             ELSE
[727]397                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]398                to_be_resorted => p_av
399             ENDIF
400
401          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
402             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]403                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
404                   tend = prt_count
405                ELSE
406                   tend = 0.0_wp
407                ENDIF
[2512]408                DO  i = nxl, nxr
409                   DO  j = nys, nyn
[1551]410                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]411                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
412                      ENDDO
413                   ENDDO
414                ENDDO
415                resorted = .TRUE.
416             ELSE
417                to_be_resorted => pc_av
418             ENDIF
419
[1359]420          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]421             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]422                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
423                   DO  i = nxl, nxr
424                      DO  j = nys, nyn
[1551]425                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]426                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
427                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
428                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
429                            s_r2 = 0.0_wp
430                            s_r3 = 0.0_wp
431                            DO  n = 1, number_of_particles
432                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
433                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
434                                         particles(n)%weight_factor
435                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
436                                         particles(n)%weight_factor
437                               ENDIF
438                            ENDDO
439                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
440                               mean_r = s_r3 / s_r2
441                            ELSE
442                               mean_r = 0.0_wp
443                            ENDIF
444                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]445                         ENDDO
446                      ENDDO
447                   ENDDO
[1359]448                ELSE
449                   tend = 0.0_wp
450                ENDIF
[2512]451                DO  i = nxl, nxr
452                   DO  j = nys, nyn
[1551]453                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]454                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
455                      ENDDO
456                   ENDDO
457                ENDDO
458                resorted = .TRUE.
459             ELSE
460                to_be_resorted => pr_av
461             ENDIF
462
[1053]463          CASE ( 'prr' )
464             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]465                DO  i = nxl, nxr
466                   DO  j = nys, nyn
[1822]467                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]468                         local_pf(i,j,k) = prr(k,j,i)
469                      ENDDO
470                   ENDDO
471                ENDDO
472             ELSE
[2512]473                DO  i = nxl, nxr
474                   DO  j = nys, nyn
[1822]475                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]476                         local_pf(i,j,k) = prr_av(k,j,i)
477                      ENDDO
478                   ENDDO
479                ENDDO
480             ENDIF
481             resorted = .TRUE.
482
[1]483          CASE ( 'pt' )
484             IF ( av == 0 )  THEN
485                IF ( .NOT. cloud_physics ) THEN
486                   to_be_resorted => pt
487                ELSE
[2512]488                   DO  i = nxl, nxr
489                      DO  j = nys, nyn
[1551]490                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1320]491                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + l_d_cp *             &
492                                                          pt_d_t(k) *          &
[1]493                                                          ql(k,j,i)
494                         ENDDO
495                      ENDDO
496                   ENDDO
497                   resorted = .TRUE.
498                ENDIF
499             ELSE
500                to_be_resorted => pt_av
501             ENDIF
502
503          CASE ( 'q' )
504             IF ( av == 0 )  THEN
505                to_be_resorted => q
506             ELSE
507                to_be_resorted => q_av
508             ENDIF
[691]509
[1053]510          CASE ( 'qc' )
[1]511             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]512                to_be_resorted => qc
[1]513             ELSE
[1115]514                to_be_resorted => qc_av
[1]515             ENDIF
516
[1053]517          CASE ( 'ql' )
518             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]519                to_be_resorted => ql
[1053]520             ELSE
[1115]521                to_be_resorted => ql_av
[1053]522             ENDIF
523
[1]524          CASE ( 'ql_c' )
525             IF ( av == 0 )  THEN
526                to_be_resorted => ql_c
527             ELSE
528                to_be_resorted => ql_c_av
529             ENDIF
530
531          CASE ( 'ql_v' )
532             IF ( av == 0 )  THEN
533                to_be_resorted => ql_v
534             ELSE
535                to_be_resorted => ql_v_av
536             ENDIF
537
538          CASE ( 'ql_vp' )
539             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]540                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
541                   DO  i = nxl, nxr
542                      DO  j = nys, nyn
[1551]543                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]544                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
545                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
546                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
547                            DO  n = 1, number_of_particles
548                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
549                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
550                                                 particles(n)%weight_factor /  &
551                                                 prt_count(k,j,i)
552                               ENDIF
553                            ENDDO
[1007]554                         ENDDO
555                      ENDDO
556                   ENDDO
[1359]557                ELSE
558                   tend = 0.0_wp
559                ENDIF
[2512]560                DO  i = nxl, nxr
561                   DO  j = nys, nyn
[1551]562                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]563                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
564                      ENDDO
565                   ENDDO
566                ENDDO
567                resorted = .TRUE.
[1]568             ELSE
569                to_be_resorted => ql_vp_av
570             ENDIF
571
[1053]572          CASE ( 'qr' )
573             IF ( av == 0 )  THEN
574                to_be_resorted => qr
575             ELSE
576                to_be_resorted => qr_av
577             ENDIF
578
[1]579          CASE ( 'qv' )
580             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]581                DO  i = nxl, nxr
582                   DO  j = nys, nyn
[1551]583                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]584                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
585                      ENDDO
586                   ENDDO
587                ENDDO
588                resorted = .TRUE.
589             ELSE
590                to_be_resorted => qv_av
591             ENDIF
592
[2031]593          CASE ( 'rho_ocean' )
[96]594             IF ( av == 0 )  THEN
[2031]595                to_be_resorted => rho_ocean
[96]596             ELSE
[2031]597                to_be_resorted => rho_ocean_av
[96]598             ENDIF
[691]599
[1]600          CASE ( 's' )
601             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]602                to_be_resorted => s
[1]603             ELSE
[355]604                to_be_resorted => s_av
[1]605             ENDIF
[691]606
[96]607          CASE ( 'sa' )
608             IF ( av == 0 )  THEN
609                to_be_resorted => sa
610             ELSE
611                to_be_resorted => sa_av
612             ENDIF
[691]613
[1]614          CASE ( 'u' )
[2696]615             flag_nr = 1
[1]616             IF ( av == 0 )  THEN
617                to_be_resorted => u
618             ELSE
619                to_be_resorted => u_av
620             ENDIF
621
622          CASE ( 'v' )
[2696]623             flag_nr = 2
[1]624             IF ( av == 0 )  THEN
625                to_be_resorted => v
626             ELSE
627                to_be_resorted => v_av
628             ENDIF
629
630          CASE ( 'vpt' )
631             IF ( av == 0 )  THEN
632                to_be_resorted => vpt
633             ELSE
634                to_be_resorted => vpt_av
635             ENDIF
636
637          CASE ( 'w' )
[2696]638             flag_nr = 3
[1]639             IF ( av == 0 )  THEN
640                to_be_resorted => w
641             ELSE
642                to_be_resorted => w_av
643             ENDIF
[2007]644!             
645!--       Block of urban surface model outputs   
646          CASE ( 'usm_output' )
647             CALL usm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,     &
648                                         nzb_do, nzt_do )
[1]649
650          CASE DEFAULT
[1972]651
[1]652!
[1972]653!--          Land surface quantity
654             IF ( land_surface )  THEN
655!
656!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
657                nzb_do = nzb_soil
658                nzt_do = nzt_soil
659
660                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]661                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]662                local_pf = fill_value
[1972]663
664                CALL lsm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf )
665                resorted = .TRUE.
[1976]666
667!
668!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
669                IF ( .NOT. found )  THEN
670                   nzb_do = nzb
671                   nzt_do = nz_do3d
672
673                   DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]674                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )                 
[1976]675                ENDIF
676
[1972]677             ENDIF
678
[2696]679             IF ( .NOT. found )  THEN
680                CALL tcm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf )
681                resorted = .TRUE.
682             ENDIF
683
[1972]684!
[1976]685!--          Radiation quantity
686             IF ( .NOT. found  .AND.  radiation )  THEN
687                CALL radiation_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,         &
688                                               local_pf )
689                resorted = .TRUE.
690             ENDIF
691
692!
[2817]693!--          Gust module quantities
694             IF ( .NOT. found  .AND.  gust_module_enabled )  THEN
695                CALL gust_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,    &
696                                          nzb_do, nzt_do )
697                resorted = .TRUE.
698             ENDIF
699
700!
[2696]701!--          Chemistry model output
702             IF ( .NOT. found  .AND.  air_chemistry )  THEN
703                CALL chem_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,              &
[2756]704                                          local_pf, fill_value )
[2696]705                resorted = .TRUE.
706             ENDIF
707
708!
[2209]709!--          Plant canopy model output
710             IF ( .NOT. found  .AND.  plant_canopy )  THEN
[2696]711                CALL pcm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,     &
712                                         fill_value )
[2209]713                resorted = .TRUE.
714             ENDIF
715
716!
[1]717!--          User defined quantity
[1972]718             IF ( .NOT. found )  THEN
719                CALL user_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,    &
720                                          nzb_do, nzt_do )
721                resorted = .TRUE.
722             ENDIF
[1]723
[254]724             IF ( .NOT. found )  THEN
[1320]725                message_string =  'no output available for: ' //               &
[274]726                                  TRIM( do3d(av,if) )
[254]727                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]728             ENDIF
729
730       END SELECT
731
732!
733!--    Resort the array to be output, if not done above
734       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]735          DO  i = nxl, nxr
736             DO  j = nys, nyn
[1551]737                DO  k = nzb_do, nzt_do
[2696]738                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
739                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
740                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
741                                      BTEST( wall_flags_0(k,j,i), flag_nr ) )
[1]742                ENDDO
743             ENDDO
744          ENDDO
745       ENDIF
746
747!
[1327]748!--    Output of the 3D-array
749#if defined( __parallel )
750       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]751!
[1327]752!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
753!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
754!--       combine_plot_fields
755          IF ( myid == 0 )  THEN
756             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
757                           do3d_time_count(av), av
[1]758          ENDIF
[1327]759          DO  i = 0, io_blocks-1
760             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]761                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[1551]762                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]763             ENDIF
[1972]764
[1327]765             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]766
[1327]767          ENDDO
[559]768
[1327]769       ELSE
[646]770#if defined( __netcdf )
[493]771!
[1327]772!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]773!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
774!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
775!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
776!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
777!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
778!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
779!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
780!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
781!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
782!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
783!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
784!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
785!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
786!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
787!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
788!          ELSE
[1327]789             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]790                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
791                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
792                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[2512]793!          ENDIF
[1783]794          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]795#endif
[1327]796       ENDIF
[1]797#else
798#if defined( __netcdf )
[1327]799       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),        &
[1551]800                         local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),        &
[1327]801                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),     &
[2512]802                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]803       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]804#endif
805#endif
806
807       if = if + 1
808
809!
[1551]810!--    Deallocate temporary array
811       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]812
[1551]813    ENDDO
[1]814
[1318]815    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]816
817!
818!-- Formats.
[1320]8193300 FORMAT ('variable ',I4,'  file=',A,'  filetype=unformatted  skip=',I12/   &
[1]820             'label = ',A,A)
821
822 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.