source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90

Last change on this file was 4828, checked in by Giersch, 5 months ago

Copyright updated to year 2021, interface pmc_sort removed to accelarate the nesting code

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.6 KB
Line 
1!> @file data_output_3d.f90
2!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of the PALM model system.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General
6! Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7! (at your option) any later version.
8!
9! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the
10! implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General
11! Public License for more details.
12!
13! You should have received a copy of the GNU General Public License along with PALM. If not, see
14! <http://www.gnu.org/licenses/>.
15!
16! Copyright 1997-2021 Leibniz Universitaet Hannover
17!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
18!
19! Current revisions:
20! ------------------
21!
22!
23! Former revisions:
24! -----------------
25! $Id: data_output_3d.f90 4828 2021-01-05 11:21:41Z banzhafs $
26! Keep 32-bit output for netcdf_data_output < 5
27!
28! 4768 2020-11-02 19:11:23Z suehring
29! Enable 3D data output also with 64-bit precision
30!
31! 4559 2020-06-11 08:51:48Z raasch
32! file re-formatted to follow the PALM coding standard
33!
34! 4457 2020-03-11 14:20:43Z raasch
35! use statement for exchange horiz added
36!
37! 4444 2020-03-05 15:59:50Z raasch
38! bugfix: cpp-directives for serial mode added
39!
40! 4360 2020-01-07 11:25:50Z suehring
41! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static topography
42! information used in wall_flags_static_0
43!
44! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
45! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
46!
47! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
48! Corrected "Former revisions" section
49!
50! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
51! bugfix for r4155
52!
53! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
54! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
55!
56! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
57! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs (merge from branch resler)
58!
59! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
60! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
61!
62! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
63! modularize diagnostic output
64!
65! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
66! output of turbulence intensity added
67!
68! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
69! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
70!
71! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
72! Changes related to global restructuring of location messages and introduction of additional debug
73! messages
74!
75! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
76! unused variables removed
77!
78! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
79! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant when using wall/soil
80!         spinup)
81!
82! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
83! Initial revision
84!
85!
86! Description:
87! ------------
88!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
89!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
90 SUBROUTINE data_output_3d( av )
91
92
93    USE arrays_3d,                                                                                 &
94        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
95
96    USE averaging
97
98    USE basic_constants_and_equations_mod,                                                         &
99        ONLY:  lv_d_cp
100
101    USE bulk_cloud_model_mod,                                                                      &
102        ONLY:  bulk_cloud_model
103
104    USE control_parameters,                                                                        &
105        ONLY:  debug_output_timestep, do3d, do3d_no, do3d_time_count, land_surface, message_string,&
106               ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy, psolver, time_since_reference_point, urban_surface,&
107               varnamelength
108
109#if defined( __parallel )
110    USE control_parameters,                                                                        &
111        ONLY:  io_blocks, io_group
112#endif
113
114    USE cpulog,                                                                                    &
115        ONLY: cpu_log, log_point
116
117    USE exchange_horiz_mod,                                                                        &
118        ONLY:  exchange_horiz
119
120    USE indices,                                                                                   &
121        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt, wall_flags_total_0
122
123#if ! defined( __parallel )
124    USE indices,                                                                                   &
125        ONLY:  nx, ny
126#endif
127
128    USE kinds
129
130    USE land_surface_model_mod,                                                                    &
131        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
132
133    USE module_interface,                                                                          &
134        ONLY:  module_interface_data_output_3d
135
136#if defined( __netcdf )
137    USE NETCDF
138#endif
139
140    USE netcdf_interface,                                                                          &
141        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat, netcdf_data_format,    &
142               netcdf_handle_error
143
144    USE particle_attributes,                                                                       &
145        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles, particle_advection_start, prt_count
146
147    USE pegrid
148
149    USE plant_canopy_model_mod,                                                                    &
150        ONLY:  pch_index
151
152    USE radiation_model_mod,                                                                       &
153        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
154
155    USE urban_surface_mod,                                                                         &
156        ONLY:  usm_data_output_3d
157
158
159    IMPLICIT NONE
160
161    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
162    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
163    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
164    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
165    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
166    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
167    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
168    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
169    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
170
171    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
172    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
173
174    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
175    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
176    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
177
178    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
179
180    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be
181                                                            !< output
182
183    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
184
185!
186!-- Return, if nothing to output
187    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
188
189    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
190
191    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
192
193!
194!-- Open output file.
195!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its own file and writes
196!-- the data of its subdomain in binary format. After the run, these files are combined to one
197!-- NetCDF file by combine_plot_fields.
198!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
199    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
200#if defined( __parallel )
201       CALL check_open( 30 )
202#endif
203       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
204    ELSE
205       CALL check_open( 106+av*10 )
206    ENDIF
207
208!
209!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this limit is exceeded.
210!-- This could be the case, if the simulated time exceeds the given end time by the length of the
211!-- given output interval.
212    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
213       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
214          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',                      &
215                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ',        &
216                                      'number of output time levels is ',                          &
217                                      'exceeded.'
218          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
219          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
220          RETURN
221       ENDIF
222    ENDIF
223
224!
225!-- Update the netCDF time axis.
226!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the performance.
227#if defined( __netcdf )
228    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
229    IF ( myid == 0 )  THEN
230       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),                                  &
231                               (/ time_since_reference_point /),                                   &
232                               start = (/ do3d_time_count(av) /),                                  &
233                               count = (/ 1 /) )
234       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
235    ENDIF
236#endif
237
238!
239!-- Loop over all variables to be written.
240    ivar = 1
241
242    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
243
244!
245!--    Initiate found flag and resorting flag
246       found = .FALSE.
247       resorted = .FALSE.
248       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
249
250!
251!--    Temporary solution to account for data output within the new urban surface model
252!--    (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
253!--    Store the array chosen on the temporary array.
254       nzb_do   = nzb
255!
256!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model these index is determined by
257!--    pch_index.
258       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
259          nzt_do   = pch_index
260       ELSE
261          nzt_do   = nz_do3d
262       ENDIF
263
264!
265!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
266       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
267!
268!--    Before each output, set array local_pf to fill value
269       local_pf = REAL( fill_value, KIND=wp )
270!
271!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
272       flag_nr = 0
273
274       SELECT CASE ( trimvar )
275
276          CASE ( 'e' )
277             IF ( av == 0 )  THEN
278                to_be_resorted => e
279             ELSE
280                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) )  THEN
281                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
282                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
283                ENDIF
284                to_be_resorted => e_av
285             ENDIF
286
287          CASE ( 'thetal' )
288             IF ( av == 0 )  THEN
289                to_be_resorted => pt
290             ELSE
291                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) )  THEN
292                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
293                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
294                ENDIF
295                to_be_resorted => lpt_av
296             ENDIF
297
298          CASE ( 'p' )
299             IF ( av == 0 )  THEN
300                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
301                to_be_resorted => p
302             ELSE
303                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) )  THEN
304                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
305                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
306                ENDIF
307                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
308                to_be_resorted => p_av
309             ENDIF
310
311          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
312             IF ( av == 0 )  THEN
313                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
314                   tend = prt_count
315                ELSE
316                   tend = 0.0_wp
317                ENDIF
318                DO  i = nxl, nxr
319                   DO  j = nys, nyn
320                      DO  k = nzb_do, nzt_do
321                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
322                      ENDDO
323                   ENDDO
324                ENDDO
325                resorted = .TRUE.
326             ELSE
327                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) )  THEN
328                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
329                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
330                ENDIF
331                to_be_resorted => pc_av
332             ENDIF
333
334          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
335             IF ( av == 0 )  THEN
336                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
337                   DO  i = nxl, nxr
338                      DO  j = nys, nyn
339                         DO  k = nzb_do, nzt_do
340                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
341                            IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
342                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
343                            s_r2 = 0.0_wp
344                            s_r3 = 0.0_wp
345                            DO  n = 1, number_of_particles
346                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
347                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * particles(n)%weight_factor
348                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * particles(n)%weight_factor
349                               ENDIF
350                            ENDDO
351                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
352                               mean_r = s_r3 / s_r2
353                            ELSE
354                               mean_r = 0.0_wp
355                            ENDIF
356                            tend(k,j,i) = mean_r
357                         ENDDO
358                      ENDDO
359                   ENDDO
360                ELSE
361                   tend = 0.0_wp
362                ENDIF
363                DO  i = nxl, nxr
364                   DO  j = nys, nyn
365                      DO  k = nzb_do, nzt_do
366                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
367                      ENDDO
368                   ENDDO
369                ENDDO
370                resorted = .TRUE.
371             ELSE
372                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) )  THEN
373                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
374                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
375                ENDIF
376                to_be_resorted => pr_av
377             ENDIF
378
379          CASE ( 'theta' )
380             IF ( av == 0 )  THEN
381                IF ( .NOT. bulk_cloud_model )  THEN
382                   to_be_resorted => pt
383                ELSE
384                   DO  i = nxl, nxr
385                      DO  j = nys, nyn
386                         DO  k = nzb_do, nzt_do
387                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp * d_exner(k) * ql(k,j,i)
388                         ENDDO
389                      ENDDO
390                   ENDDO
391                   resorted = .TRUE.
392                ENDIF
393             ELSE
394                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) )  THEN
395                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
396                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
397                ENDIF
398                to_be_resorted => pt_av
399             ENDIF
400
401          CASE ( 'q' )
402             IF ( av == 0 )  THEN
403                to_be_resorted => q
404             ELSE
405                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) )  THEN
406                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
407                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
408                ENDIF
409                to_be_resorted => q_av
410             ENDIF
411
412          CASE ( 'ql' )
413             IF ( av == 0 )  THEN
414                to_be_resorted => ql
415             ELSE
416                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) )  THEN
417                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
418                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
419                ENDIF
420                to_be_resorted => ql_av
421             ENDIF
422
423          CASE ( 'ql_c' )
424             IF ( av == 0 )  THEN
425                to_be_resorted => ql_c
426             ELSE
427                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) )  THEN
428                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
429                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
430                ENDIF
431                to_be_resorted => ql_c_av
432             ENDIF
433
434          CASE ( 'ql_v' )
435             IF ( av == 0 )  THEN
436                to_be_resorted => ql_v
437             ELSE
438                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) )  THEN
439                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
440                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
441                ENDIF
442                to_be_resorted => ql_v_av
443             ENDIF
444
445          CASE ( 'ql_vp' )
446             IF ( av == 0 )  THEN
447                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
448                   DO  i = nxl, nxr
449                      DO  j = nys, nyn
450                         DO  k = nzb_do, nzt_do
451                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
452                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
453                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
454                            DO  n = 1, number_of_particles
455                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
456                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                                     &
457                                                 particles(n)%weight_factor / prt_count(k,j,i)
458                               ENDIF
459                            ENDDO
460                         ENDDO
461                      ENDDO
462                   ENDDO
463                ELSE
464                   tend = 0.0_wp
465                ENDIF
466                DO  i = nxl, nxr
467                   DO  j = nys, nyn
468                      DO  k = nzb_do, nzt_do
469                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
470                      ENDDO
471                   ENDDO
472                ENDDO
473                resorted = .TRUE.
474             ELSE
475                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) )  THEN
476                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
477                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
478                ENDIF
479                to_be_resorted => ql_vp_av
480             ENDIF
481
482          CASE ( 'qv' )
483             IF ( av == 0 )  THEN
484                DO  i = nxl, nxr
485                   DO  j = nys, nyn
486                      DO  k = nzb_do, nzt_do
487                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
488                      ENDDO
489                   ENDDO
490                ENDDO
491                resorted = .TRUE.
492             ELSE
493                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) )  THEN
494                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
495                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
496                ENDIF
497                to_be_resorted => qv_av
498             ENDIF
499
500          CASE ( 's' )
501             IF ( av == 0 )  THEN
502                to_be_resorted => s
503             ELSE
504                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) )  THEN
505                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
506                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
507                ENDIF
508                to_be_resorted => s_av
509             ENDIF
510
511          CASE ( 'u' )
512             flag_nr = 1
513             IF ( av == 0 )  THEN
514                to_be_resorted => u
515             ELSE
516                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) )  THEN
517                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
518                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
519                ENDIF
520                to_be_resorted => u_av
521             ENDIF
522
523          CASE ( 'v' )
524             flag_nr = 2
525             IF ( av == 0 )  THEN
526                to_be_resorted => v
527             ELSE
528                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) )  THEN
529                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
530                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
531                ENDIF
532                to_be_resorted => v_av
533             ENDIF
534
535          CASE ( 'thetav' )
536             IF ( av == 0 )  THEN
537                to_be_resorted => vpt
538             ELSE
539                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) )  THEN
540                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
541                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
542                ENDIF
543                to_be_resorted => vpt_av
544             ENDIF
545
546          CASE ( 'w' )
547             flag_nr = 3
548             IF ( av == 0 )  THEN
549                to_be_resorted => w
550             ELSE
551                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) )  THEN
552                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
553                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
554                ENDIF
555                to_be_resorted => w_av
556             ENDIF
557
558          CASE DEFAULT
559!
560!--          Quantities of other modules
561             IF ( .NOT. found )  THEN
562                CALL module_interface_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, fill_value,    &
563                                                      resorted, nzb_do, nzt_do                     &
564                                                    )
565             ENDIF
566
567!
568!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
569             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
570!
571!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
572                nzb_do = nz_urban_b
573                nzt_do = nz_urban_t
574
575                DEALLOCATE ( local_pf )
576                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
577                local_pf = fill_value
578
579                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, nzb_do, nzt_do )
580                resorted = .TRUE.
581
582!
583!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
584                IF ( .NOT. found )  THEN
585                   nzb_do = nzb
586                   nzt_do = nz_do3d
587
588                   DEALLOCATE ( local_pf )
589                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
590                ENDIF
591
592             ENDIF
593
594!
595!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
596             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
597!
598!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
599                nzb_do = nzb_soil
600                nzt_do = nzt_soil
601
602                DEALLOCATE ( local_pf )
603                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
604                local_pf = fill_value
605
606                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
607                resorted = .TRUE.
608
609!
610!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
611                IF ( .NOT. found )  THEN
612                   nzb_do = nzb
613                   nzt_do = nz_do3d
614
615                   DEALLOCATE ( local_pf )
616                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
617                ENDIF
618
619             ENDIF
620
621             IF ( .NOT. found )  THEN
622                message_string =  'no output available for: ' // TRIM( do3d(av,ivar) )
623                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
624             ENDIF
625
626       END SELECT
627
628!
629!--    Resort the array to be output, if not done above
630       IF ( .NOT. resorted )  THEN
631          DO  i = nxl, nxr
632             DO  j = nys, nyn
633                DO  k = nzb_do, nzt_do
634                   local_pf(i,j,k) = MERGE( to_be_resorted(k,j,i),                                 &
635                                            REAL( fill_value, KIND = wp ),                         &
636                                            BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
637                ENDDO
638             ENDDO
639          ENDDO
640       ENDIF
641
642!
643!--    Output of the 3D-array
644#if defined( __parallel )
645       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
646!
647!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in FORTRAN binary format here, and
648!--       later collected into one file by combine_plot_fields
649          IF ( myid == 0 )  THEN
650             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point, do3d_time_count(av), av
651          ENDIF
652          DO  i = 0, io_blocks-1
653             IF ( i == io_group )  THEN
654                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
655                WRITE ( 30 )  REAL( local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do), KIND = sp )
656             ENDIF
657
658             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
659
660          ENDDO
661
662       ELSE
663#if defined( __netcdf )
664!
665!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
666!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
667!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
668!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
669!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
670!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
671!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
672!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
673!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
674!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
675!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
676!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
677!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
678!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
679!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
680!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
681!          ELSE
682!
683!--       Call for parallel runs
684          nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                             &
685                                   local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                        &
686                                   start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),      &
687                                   count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /)          &
688                                 )
689!          ENDIF
690          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
691#endif
692       ENDIF
693#else
694#if defined( __netcdf )
695!
696!--    Call for non-parallel runs
697       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                                &
698                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                            &
699                               start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),                         &
700                               count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
701       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
702#endif
703#endif
704
705       ivar = ivar + 1
706
707!
708!--    Deallocate temporary array
709       DEALLOCATE ( local_pf )
710
711    ENDDO
712
713    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
714
715    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
716
717
718 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.