source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 291

Last change on this file since 291 was 291, checked in by raasch, 12 years ago

changes for coupling with independent precursor runs; z_i calculation with Sullivan criterion

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 41.4 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 291 2009-04-16 12:07:26Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98
99
100
101    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
102 delete_dayfile=false 
103 group_number=none
104 locat=normal
105 no_default_queue=none
106 no_submit=false
107 job_catalog="~/job_queue"
108 job_name=none
109 local_user=$LOGNAME
110 node_usage=shared
111 numprocs=1
112 punkte="..........................................................."
113 submcom=qsub
114 queue=default
115 remote_host=none
116 remote_user=""
117 verify=true
118
119 typeset  -i   cputime=0  memory=0  Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
120 typeset  -i   inumprocs  nodes=0  tasks_per_node=0  threads_per_task=1
121 typeset  -L20 spalte1
122 typeset  -R40 spalte2
123 typeset  -L60 spalte3
124
125
126
127    # FEHLERBEHANDLUNG
128    # BEI EXIT:
129 trap 'if [[ $locat != normal ]]
130       then
131          case  $locat  in
132             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
133                       printf " by typing:"
134                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
135             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
136             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
137                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
138          esac
139          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
140          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
141       fi' exit
142
143
144    # BEI TERMINAL-BREAK:
145 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
146       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
147       exit
148      ' 2
149
150
151
152
153    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
154 local_host=$(hostname)
155
156
157
158    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
159    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
160 case  $local_host  in
161     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
162     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
163     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
164     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
165     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
166     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
167     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
168     (b01*)                  local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
169     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
170     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
171     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
172     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
173     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
174     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
175     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
176     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
177     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
178     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
179     (hicegate1)             local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
180     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
181     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
182     (h01*)                  local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
183     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
184     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
185     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
186     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
187     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
188     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
189     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
190     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
191     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
192     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
193     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
194     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
195     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
196     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
197     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
198     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
199     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
200                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
201                             locat=parameter; exit;;
202 esac
203
204
205
206    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
207 remote_host=$local_host
208
209
210
211
212    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
213 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
214 do
215   case  $option  in
216       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
217       (d)   delete_dayfile=true;;
218       (D)   no_submit=true;;
219       (g)   group_number=$OPTARG;;
220       (h)   remote_host=$OPTARG;;
221       (m)   memory=$OPTARG;;
222       (n)   job_name=$OPTARG;;
223       (N)   node_usage=$OPTARG;;
224       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
225       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
226       (t)   cputime=$OPTARG;;
227       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
228       (u)   remote_user=$OPTARG;;
229       (v)   verify=false;;
230       (X)   numprocs=$OPTARG;;
231       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
232             locat=option; exit;;
233   esac
234 done
235
236
237    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
238 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
239
240
241    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
242 if [ "$1" = "?" ]
243 then
244   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
245    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
246    printf "\n      Description of available options:\n"
247    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
248    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
249    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
250    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
251    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
252    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
253    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
254    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
255    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
256    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
257    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
258    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
259    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
260    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
261    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
262    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
263    printf "\n "
264    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
265    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
266    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
267    exit
268 fi
269
270
271
272    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
273 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
274 then
275    printf "\n  +++ job-file missing"
276    locat=parameter; exit
277 else
278    if [[ -f $file_to_send ]]
279    then
280       true
281    else
282       printf "\n  +++ job-file: "
283       printf "\n           $file_to_send"
284       printf "\n      does not exist"
285       locat=parameter; exit
286    fi
287 fi
288
289
290
291    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
292    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
293 if [[ $job_name = none ]]
294 then
295    job_name=$file_to_send
296 fi
297 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
298 then
299    printf "\n  +++ job-file name: "
300    printf "\n           $job_name"
301    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
302    locat=parameter; exit
303 fi
304
305
306
307
308    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
309    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
310 if [[ $remote_host = none ]]
311 then
312    printf "\n  +++ host missing"
313    locat=option; exit
314 else
315    case  $remote_host  in
316        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
317        (ibmb)    queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
318        (ibmh)    queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
319        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
320        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
321        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
322        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
323        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
324        (lctit)   queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
325        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
326        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
327        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
328        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
329        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
330        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
331                  locat=parameter; exit;;
332    esac
333 fi
334
335
336    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
337 if [[ $no_default_queue != none ]]
338 then
339    error=false
340    ndq=$no_default_queue
341    case  $remote_host  in
342        (ibm)    case  $ndq  in
343                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
344                     (*)                                     error=true;;
345                 esac;;
346        (ibmb)   case  $ndq  in
347                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
348                     (*)                                     error=true;;
349                 esac;;
350        (ibmh)   case  $ndq  in
351                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
352                     (*)                                     error=true;;
353                 esac;;
354        (ibms)   case  $ndq  in
355                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
356                     (*)                                     error=true;;
357                 esac;;
358        (ibmy)   case  $ndq  in
359                     (parallel)                              error=false;;
360                     (*)                                     error=true;;
361                 esac;;
362        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
363                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
364                     (*)                                     error=true;;
365                 esac;;
366        (lctit)  case  $ndq  in
367                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
368                     (*)                                     error=true;;
369                 esac;;
370        (t3eb)   case  $ndq  in
371                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
372                     (*)    error=true;;
373                 esac;;
374        (necriam) case  $ndq  in
375                     (SP|SS|P6)  error=false;;
376                     (*)    error=true;;
377                 esac;;
378        (t3eh)   case  $ndq  in
379                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
380                     (*)    error=true;;
381                 esac;;
382        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
383                     (low|normal|high)  error=false;;
384                     (*)    error=true;;
385                 esac;;
386        (t3es)  case  $ndq  in
387                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
388                     (*)    error=true;;
389                 esac;;
390        (unics)  case  $ndq  in
391                     (unics|ht)  error=false;;
392                     (*)         error=true;;
393                 esac;;
394    esac
395    if [[ $error = true ]]
396    then
397       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
398       locat=parameter; exit
399    else
400       queue=$no_default_queue
401    fi
402 fi
403
404
405
406    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
407 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
408 then
409    node_usage=shared
410 fi
411
412
413
414    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
415    # AUFTEILEN
416 done=false
417 while [[ $done = false ]]
418 do
419    if (( $cputime <= 0 ))
420    then
421       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
422       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
423       printf "\n  >>> "
424       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
425    else
426       done=true
427    fi
428 done
429 if [[ $remote_host = nech ]]
430 then
431    if (( tasks_per_node != 0 ))
432    then
433       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
434    elif [[ $numprocs != 0 ]]
435    then
436       (( cputime = cputime * numprocs ))
437    fi
438 fi
439 (( stunden  = cputime / 3600 ))
440 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
441 (( minuten  = resttime / 60 ))
442 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
443 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
444
445
446
447    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
448 done=false
449 while [[ $done = false ]]
450 do
451    if (( memory <= 0 ))
452    then
453       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
454       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
455       printf "\n  >>> "
456       read  memory  1>/dev/null  2>&1
457    else
458       done=true
459    fi
460 done
461
462 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
463 then
464    if (( tasks_per_node != 0 ))
465    then
466       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
467    elif [[ $numprocs != 0 ]]
468    then
469       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
470    else
471       (( Memory = memory / 1000 ))
472    fi
473 fi
474
475
476    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
477 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
478 then
479    (( memory = memory * threads_per_task ))
480 fi
481
482
483    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
484 if (( tasks_per_node != 0 ))
485 then
486    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
487 fi
488
489
490
491    # HEADER-AUSGABE
492 if [[ $verify = true ]]
493 then
494    printf "\n\n"
495    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
496    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
497    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
498    printf "|                                                              | \n"
499    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
500    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
501    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
502    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
503    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
504    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
505    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
506    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
507    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
508    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
509    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
510    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
511    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
512    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
513
514
515       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
516    antwort="dummy"
517    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
518    do
519       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
520    done
521    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
522    then
523       locat=verify; exit
524    fi
525    printf "\n"
526 fi
527
528
529
530    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
531 kennung=$RANDOM
532 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
533 job_to_send=job_to_send_$kennung
534 if [[ $delete_dayfile = false ]]
535 then
536    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
537    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
538 else
539    remote_dayfile=/dev/null
540    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
541    then
542       notification='# @ notification = never'
543    fi
544 fi
545
546
547
548    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
549 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
550 then
551
552    if [[ $remote_host = ibmy ]]
553    then
554       consumable_memory=""
555    else
556       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
557    fi
558    if [[ $queue = cdev ]]
559    then
560       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
561       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
562    else
563       if [[ $remote_host = ibms ]]
564       then
565          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
566       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
567       then
568          network_to_use=""
569       else
570          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
571          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
572       fi
573    fi
574
575    cat > $job_to_send << %%END%%
576#!/bin/ksh
577
578# @ job_type = parallel
579# @ job_name = palm
580# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
581# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
582# @ output = $remote_dayfile
583# @ error = $remote_dayfile
584# @ image_size = 50
585# @ class = $queue
586# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
587$network_to_use
588$data_limit
589$notification
590
591%%END%%
592
593    if (( nodes > 0 ))
594    then
595
596       cat >> $job_to_send << %%END%%
597# @ node = $nodes
598# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
599# @ node_usage = $node_usage
600# @ queue
601
602%%END%%
603
604    else
605
606       if [[ $remote_host != ibmy ]]
607       then
608
609          cat >> $job_to_send << %%END%%
610# @ blocking = unlimited
611# @ total_tasks = $numprocs
612# @ node_usage = $node_usage
613# @ queue
614
615%%END%%
616
617       else
618
619          cat >> $job_to_send << %%END%%
620# @ node = 1
621# @ total_tasks = $numprocs
622# @ queue
623
624%%END%%
625
626       fi
627
628    fi
629
630 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
631 then
632
633    cat > $job_to_send << %%END%%
634#!/bin/ksh
635
636# @ job_type = serial
637# @ node_usage = $node_usage
638# @ job_name = palm
639# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
640# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
641# @ output = $remote_dayfile
642# @ error = $remote_dayfile
643# @ class = $queue
644$notification
645
646# @ queue
647
648%%END%%
649
650 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
651 then
652
653    if [[ $numprocs != 0 ]]
654    then
655       cat > $job_to_send << %%END%%
656#!/bin/ksh
657#PBS -N $job_name
658#PBS -A geofysisk
659#PBS -l walltime=$timestring
660#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
661#PBS -l pmem=${memory}mb
662#PBS -m abe
663#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
664#PBS -o $remote_dayfile
665#PBS -j oe
666mpd &
667
668%%END%%
669
670    else
671       cat > $job_to_send << %%END%%
672#!/bin/ksh
673#PBS -N $job_name
674#PBS -A geofysisk
675#PBS -l walltime=$timestring
676#PBS -l ncpus=1
677#PBS -l pmem=${memory}mb
678#PBS -m abe
679#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
680#PBS -o $remote_dayfile
681#PBS -j oe
682
683%%END%%
684
685    fi
686
687 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
688 then
689
690    if [[ $queue = testq ]]
691    then
692       queue_directive="#PBS -q $queue"
693    else
694       queue_directive=""
695    fi
696
697    if [[ $numprocs != 0 ]]
698    then
699       cat > $job_to_send << %%END%%
700#!/bin/bash
701#PBS -N $job_name
702#PBS -l walltime=$timestring
703#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
704#PBS -l feature=$sgi_feature
705#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
706#PBS -o $remote_dayfile
707#PBS -j oe
708$queue_directive
709
710. /usr/share/modules/init/bash
711module load $mpilib
712# module load mvapich2/1.2rc1-intel
713# module load mvapich2
714module load netcdf
715export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
716echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
717
718%%END%%
719
720    else
721       cat > $job_to_send << %%END%%
722#PBS -S /bin/bash
723#PBS -N $job_name
724#PBS -l walltime=$timestring
725#PBS -l ncpus=1
726#PBS -o $remote_dayfile
727#PBS -e $remote_dayfile
728
729%%END%%
730
731    fi
732
733 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
734 then
735
736    if [[ $numprocs != 0 ]]
737    then
738       cat > $job_to_send << %%END%%
739#!/bin/ksh
740#PBS -S /bin/ksh
741#PBS -N $job_name
742#PBS -A geofysisk
743#PBS -j oe
744#PBS -l walltime=$timestring
745#PBS -l mppwidth=${numprocs}
746#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
747#PBS -m abe
748#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
749#PBS -o $remote_dayfile
750
751%%END%%
752
753    else
754       cat > $job_to_send << %%END%%
755#!/bin/ksh
756#PBS -S /bin/ksh
757#PBS -N $job_name
758#PBS -A geofysisk
759#PBS -j oe
760#PBS -l walltime=$timestring
761#PBS -l ncpus=1
762#PBS -l pmem=${memory}mb
763#PBS -m abe
764#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
765#PBS -o $remote_dayfile
766
767%%END%%
768
769    fi
770
771 elif [[ $remote_host = nech ]]
772 then
773
774    if (( nodes > 1 ))
775    then
776       cat > $job_to_send << %%END%%
777#!/bin/ksh
778#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
779#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
780#PBS -b $nodes
781#PBS -o $remote_dayfile
782#PBS -N palm
783#PBS -j o
784#PBS -T mpisx
785
786%%END%%
787
788    elif [[ $numprocs != 0 ]]
789    then
790       cat > $job_to_send << %%END%%
791#!/bin/ksh
792#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
793#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
794#PBS -o $remote_dayfile
795#PBS -N palm
796#PBS -j o
797
798%%END%%
799
800    else
801       cat > $job_to_send << %%END%%
802#!/bin/ksh
803#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
804#PBS -o $remote_dayfile
805#PBS -j o
806
807%%END%%
808
809    fi
810
811 elif [[ $remote_host = necriam ]]
812 then
813
814    if (( nodes > 1 ))
815    then
816       cat > $job_to_send << %%END%%
817#!/bin/ksh
818#PBS -b $nodes
819#PBS -o $remote_dayfile
820#PBS -N $job_name
821#PBS -j o
822#PBS -v MPIPROGINV=YES
823
824%%END%%
825
826    elif [[ $numprocs != 0 ]]
827    then
828       cat > $job_to_send << %%END%%
829#!/bin/ksh
830#PBS -q ${queue}
831#PBS -o $remote_dayfile
832#PBS -N $job_name
833#PBS -j o
834#PBS -v MPIPROGINV=YES
835
836%%END%%
837
838    else
839       cat > $job_to_send << %%END%%
840#!/bin/ksh
841#PBS -o $remote_dayfile
842#PBS -j o
843
844%%END%%
845
846    fi
847
848 elif [[ $remote_host = lctit ]]
849 then
850    cat > $job_to_send << %%END%%
851#!/bin/bash
852#$ -S /bin/bash
853cd $job_catalog
854export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
855echo \$PATH
856
857%%END%%
858
859       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
860  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
861    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
862
863 else
864
865    cat > $job_to_send << %%END%%
866# @\$-q ${queue}
867# @\$-l${qsubtime} $timestring
868# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
869# @\$-o $remote_dayfile
870# @\$-eo
871
872%%END%%
873
874 fi
875
876
877    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
878    # BEI EXIT VERANLASSEN
879    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
880    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
881 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
882 then
883    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
884    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
885    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
886    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
887    then
888       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
889       then
890          return_queue=c1
891       elif [[ $remote_host = ibms ]]
892       then
893          return_queue=p_normal
894       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
895       then
896          return_queue=serial
897       elif [[ $remote_host = lctit ]]
898       then
899          return_queue=sla3
900       elif [[ $remote_host = necriam ]]
901       then
902          return_queue=SP
903       else
904          return_queue=unknown
905       fi
906
907       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
908       then
909
910          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
911          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
912          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
913          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
914          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
915          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
916          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
917          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
918          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
919          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
920
921          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
922          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
923
924          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
925          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
926          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
927
928       elif [[ $remote_host = nech ]]
929       then
930          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
931          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
932          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
933          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
934          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
935          echo " "                                 >>  $job_to_send
936          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
937          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
938          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
939          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
940          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
941
942       elif [[ $remote_host = necriam ]]
943       then
944          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
945          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
946          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
947          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
948          echo " "                                 >>  $job_to_send
949          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
950          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
951          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
952          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
953
954       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
955       then
956          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
957          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
958          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
959          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
960          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
961          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
962          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
963          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
964          echo " "                                 >>  $job_to_send
965          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
966          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
967          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
968          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
969          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
970
971       elif [[ $remote_host = lctit ]]
972       then
973          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
974          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
975          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
976          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
977          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
978          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
979          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
980
981       else
982
983          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
984          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
985          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
986          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
987          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
988          then
989             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
990          fi
991          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
992#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
993          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
994          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
995          echo " "                                 >>  $job_to_send
996          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
997          then
998             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
999             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1000          fi
1001          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1002          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1003          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1004          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1005       fi
1006
1007       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1008       then
1009          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1010       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1011       then
1012          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1013          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1014       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1015       then
1016          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1017          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1018          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1019          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1020       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1021       then
1022          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1023       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1024       then
1025          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1026       else
1027          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1028       fi
1029       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1030       if [[ $remote_host = nech ]]
1031       then
1032          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1033       fi
1034    else
1035#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1036       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1037    fi
1038    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1039    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1040    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1041 fi
1042
1043
1044
1045    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1046 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1047
1048 if [[ $remote_host = ibm ]]
1049 then
1050    echo " "         >>  $job_to_send
1051    echo "exit"      >>  $job_to_send
1052 fi
1053 if [[ $remote_host = lctit ]]
1054 then
1055    echo " "                               >>  $job_to_send
1056    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1057 fi
1058
1059
1060
1061    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1062 if [[ -z $remote_user ]]
1063 then
1064    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1065    then
1066       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1067    fi
1068 fi
1069
1070
1071
1072    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1073 if [[ $no_submit = false ]]
1074 then
1075    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1076    then
1077       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1078       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1079       then
1080          job_catalog_save=$job_catalog
1081          job_catalog=job_queue
1082       elif [[ $remote_host = nech ]]
1083       then
1084          job_catalog_save=$job_catalog
1085          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1086       fi
1087       if [[ $local_host = decalpha ]]
1088       then
1089             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1090             # PASSWORT AB
1091          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1092       elif [[ $remote_host = nech ]]
1093       then
1094             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1095             # TRANSFERIERT WERDEN
1096          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1097       else
1098          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1099       fi
1100       if [[ $? = 1 ]]
1101       then
1102          locat=scp; exit
1103       fi
1104       if [[ $remote_host = ibms ]]
1105       then
1106          job_catalog=$job_catalog_save
1107       fi
1108       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1109    else
1110       eval  job_catalog=$job_catalog
1111       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1112    fi
1113
1114
1115
1116       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1117    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1118    then
1119       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1120       if [[ $remote_host != lctit ]]
1121       then
1122          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1123       else
1124             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1125             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1126             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1127          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1128          echo "first try" > send_protocol
1129          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1130          do
1131             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1132             then
1133                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1134             else
1135                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1136             fi
1137             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1 
1138             cat send_protocol
1139          done
1140          sleep 10
1141          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1142          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1143          rm  send_protocol
1144       fi
1145
1146       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1147    else
1148       cd  $job_catalog
1149       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1150       then
1151          eval  $submcom  $job_on_remhost
1152       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1153       then
1154          eval  $submcom  $job_on_remhost
1155          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1156          chmod  u+x  $job_on_remhost
1157       elif [[ $local_host = nech ]]
1158       then
1159          if [[ $queue = default ]]
1160          then
1161             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1162          else
1163             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1164          fi
1165       else
1166          qsub  $job_on_remhost
1167       fi
1168          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1169       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1170       cd  -  > /dev/null
1171    fi
1172 fi
1173
1174
1175
1176    # ABSCHLUSSARBEITEN
1177
1178 if [[ $no_submit = false ]]
1179 then
1180    rm  $job_to_send
1181 fi
1182 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.