source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 259

Last change on this file since 259 was 259, checked in by raasch, 13 years ago

subjob update for NEC-SX9 at RIAM

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 41.3 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 259 2009-03-16 00:21:34Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98
99
100
101    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
102 delete_dayfile=false 
103 group_number=none
104 locat=normal
105 no_default_queue=none
106 no_submit=false
107 job_catalog="~/job_queue"
108 job_name=none
109 local_user=$LOGNAME
110 node_usage=shared
111 numprocs=1
112 punkte="..........................................................."
113 submcom=qsub
114 queue=default
115 remote_host=none
116 remote_user=""
117 verify=true
118
119 typeset  -i   cputime=0  memory=0  Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
120 typeset  -i   inumprocs  nodes=0  tasks_per_node=0  threads_per_task=1
121 typeset  -L20 spalte1
122 typeset  -R40 spalte2
123 typeset  -L60 spalte3
124
125
126
127    # FEHLERBEHANDLUNG
128    # BEI EXIT:
129 trap 'if [[ $locat != normal ]]
130       then
131          case  $locat  in
132             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
133                       printf " by typing:"
134                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
135             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
136             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
137                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
138          esac
139          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
140          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
141       fi' exit
142
143
144    # BEI TERMINAL-BREAK:
145 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
146       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
147       exit
148      ' 2
149
150
151
152
153    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
154 local_host=$(hostname)
155
156
157
158    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
159    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
160 case  $local_host  in
161     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
162     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
163     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
164     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
165     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
166     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
167     (b01*)                  local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
168     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
169     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
170     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
171     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
172     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
173     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
174     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
175     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
176     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
177     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
178     (hicegate1)             local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
179     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
180     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
181     (h01*)                  local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
182     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
183     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
184     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
185     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
186     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
187     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
188     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
189     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
190     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
191     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
192     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
193     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
194     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
195     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
196     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
197     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
198     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
199                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
200                             locat=parameter; exit;;
201 esac
202
203
204
205    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
206 remote_host=$local_host
207
208
209
210
211    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
212 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
213 do
214   case  $option  in
215       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
216       (d)   delete_dayfile=true;;
217       (D)   no_submit=true;;
218       (g)   group_number=$OPTARG;;
219       (h)   remote_host=$OPTARG;;
220       (m)   memory=$OPTARG;;
221       (n)   job_name=$OPTARG;;
222       (N)   node_usage=$OPTARG;;
223       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
224       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
225       (t)   cputime=$OPTARG;;
226       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
227       (u)   remote_user=$OPTARG;;
228       (v)   verify=false;;
229       (X)   numprocs=$OPTARG;;
230       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
231             locat=option; exit;;
232   esac
233 done
234
235
236    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
237 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
238
239
240    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
241 if [ "$1" = "?" ]
242 then
243   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
244    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
245    printf "\n      Description of available options:\n"
246    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
247    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
248    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
249    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
250    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
251    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
252    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
253    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
254    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
255    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
256    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
257    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
258    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
259    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
260    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
261    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
262    printf "\n "
263    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
264    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
265    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
266    exit
267 fi
268
269
270
271    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
272 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
273 then
274    printf "\n  +++ job-file missing"
275    locat=parameter; exit
276 else
277    if [[ -f $file_to_send ]]
278    then
279       true
280    else
281       printf "\n  +++ job-file: "
282       printf "\n           $file_to_send"
283       printf "\n      does not exist"
284       locat=parameter; exit
285    fi
286 fi
287
288
289
290    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
291    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
292 if [[ $job_name = none ]]
293 then
294    job_name=$file_to_send
295 fi
296 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
297 then
298    printf "\n  +++ job-file name: "
299    printf "\n           $job_name"
300    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
301    locat=parameter; exit
302 fi
303
304
305
306
307    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
308    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
309 if [[ $remote_host = none ]]
310 then
311    printf "\n  +++ host missing"
312    locat=option; exit
313 else
314    case  $remote_host  in
315        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
316        (ibmb)    queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
317        (ibmh)    queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
318        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
319        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
320        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
321        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
322        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
323        (lctit)   queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
324        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
325        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
326        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
327        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
328        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
329        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
330                  locat=parameter; exit;;
331    esac
332 fi
333
334
335    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
336 if [[ $no_default_queue != none ]]
337 then
338    error=false
339    ndq=$no_default_queue
340    case  $remote_host  in
341        (ibm)    case  $ndq  in
342                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
343                     (*)                                     error=true;;
344                 esac;;
345        (ibmb)   case  $ndq  in
346                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
347                     (*)                                     error=true;;
348                 esac;;
349        (ibmh)   case  $ndq  in
350                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
351                     (*)                                     error=true;;
352                 esac;;
353        (ibms)   case  $ndq  in
354                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
355                     (*)                                     error=true;;
356                 esac;;
357        (ibmy)   case  $ndq  in
358                     (parallel)                              error=false;;
359                     (*)                                     error=true;;
360                 esac;;
361        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
362                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
363                     (*)                                     error=true;;
364                 esac;;
365        (lctit)  case  $ndq  in
366                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
367                     (*)                                     error=true;;
368                 esac;;
369        (t3eb)   case  $ndq  in
370                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
371                     (*)    error=true;;
372                 esac;;
373        (necriam) case  $ndq  in
374                     (SP|SS|P6)  error=false;;
375                     (*)    error=true;;
376                 esac;;
377        (t3eh)   case  $ndq  in
378                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
379                     (*)    error=true;;
380                 esac;;
381        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
382                     (low|normal|high)  error=false;;
383                     (*)    error=true;;
384                 esac;;
385        (t3es)  case  $ndq  in
386                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
387                     (*)    error=true;;
388                 esac;;
389        (unics)  case  $ndq  in
390                     (unics|ht)  error=false;;
391                     (*)         error=true;;
392                 esac;;
393    esac
394    if [[ $error = true ]]
395    then
396       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
397       locat=parameter; exit
398    else
399       queue=$no_default_queue
400    fi
401 fi
402
403
404
405    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
406 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
407 then
408    node_usage=shared
409 fi
410
411
412
413    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
414    # AUFTEILEN
415 done=false
416 while [[ $done = false ]]
417 do
418    if (( $cputime <= 0 ))
419    then
420       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
421       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
422       printf "\n  >>> "
423       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
424    else
425       done=true
426    fi
427 done
428 if [[ $remote_host = nech ]]
429 then
430    if (( tasks_per_node != 0 ))
431    then
432       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
433    elif [[ $numprocs != 0 ]]
434    then
435       (( cputime = cputime * numprocs ))
436    fi
437 fi
438 (( stunden  = cputime / 3600 ))
439 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
440 (( minuten  = resttime / 60 ))
441 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
442 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
443
444
445
446    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
447 done=false
448 while [[ $done = false ]]
449 do
450    if (( memory <= 0 ))
451    then
452       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
453       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
454       printf "\n  >>> "
455       read  memory  1>/dev/null  2>&1
456    else
457       done=true
458    fi
459 done
460
461 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
462 then
463    if (( tasks_per_node != 0 ))
464    then
465       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
466    elif [[ $numprocs != 0 ]]
467    then
468       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
469    else
470       (( Memory = memory / 1000 ))
471    fi
472 fi
473
474
475    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
476 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
477 then
478    (( memory = memory * threads_per_task ))
479 fi
480
481
482    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
483 if (( tasks_per_node != 0 ))
484 then
485    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
486 fi
487
488
489
490    # HEADER-AUSGABE
491 if [[ $verify = true ]]
492 then
493    printf "\n\n"
494    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
495    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
496    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
497    printf "|                                                              | \n"
498    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
499    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
500    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
501    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
502    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
503    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
504    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
505    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
506    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
507    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
508    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
509    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
510    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
511    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
512
513
514       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
515    antwort="dummy"
516    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
517    do
518       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
519    done
520    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
521    then
522       locat=verify; exit
523    fi
524    printf "\n"
525 fi
526
527
528
529    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
530 kennung=$RANDOM
531 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
532 job_to_send=job_to_send_$kennung
533 if [[ $delete_dayfile = false ]]
534 then
535    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
536    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
537 else
538    remote_dayfile=/dev/null
539    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
540    then
541       notification='# @ notification = never'
542    fi
543 fi
544
545
546
547    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
548 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
549 then
550
551    if [[ $remote_host = ibmy ]]
552    then
553       consumable_memory=""
554    else
555       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
556    fi
557    if [[ $queue = cdev ]]
558    then
559       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
560       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
561    else
562       if [[ $remote_host = ibms ]]
563       then
564          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
565       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
566       then
567          network_to_use=""
568       else
569          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
570          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
571       fi
572    fi
573
574    cat > $job_to_send << %%END%%
575#!/bin/ksh
576
577# @ job_type = parallel
578# @ job_name = palm
579# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
580# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
581# @ output = $remote_dayfile
582# @ error = $remote_dayfile
583# @ image_size = 50
584# @ class = $queue
585# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
586$network_to_use
587$data_limit
588$notification
589
590%%END%%
591
592    if (( nodes > 0 ))
593    then
594
595       cat >> $job_to_send << %%END%%
596# @ node = $nodes
597# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
598# @ node_usage = $node_usage
599# @ queue
600
601%%END%%
602
603    else
604
605       if [[ $remote_host != ibmy ]]
606       then
607
608          cat >> $job_to_send << %%END%%
609# @ blocking = unlimited
610# @ total_tasks = $numprocs
611# @ node_usage = $node_usage
612# @ queue
613
614%%END%%
615
616       else
617
618          cat >> $job_to_send << %%END%%
619# @ node = 1
620# @ total_tasks = $numprocs
621# @ queue
622
623%%END%%
624
625       fi
626
627    fi
628
629 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
630 then
631
632    cat > $job_to_send << %%END%%
633#!/bin/ksh
634
635# @ job_type = serial
636# @ node_usage = $node_usage
637# @ job_name = palm
638# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
639# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
640# @ output = $remote_dayfile
641# @ error = $remote_dayfile
642# @ class = $queue
643$notification
644
645# @ queue
646
647%%END%%
648
649 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
650 then
651
652    if [[ $numprocs != 0 ]]
653    then
654       cat > $job_to_send << %%END%%
655#!/bin/ksh
656#PBS -N $job_name
657#PBS -A geofysisk
658#PBS -l walltime=$timestring
659#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
660#PBS -l pmem=${memory}mb
661#PBS -m abe
662#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
663#PBS -o $remote_dayfile
664#PBS -j oe
665mpd &
666
667%%END%%
668
669    else
670       cat > $job_to_send << %%END%%
671#!/bin/ksh
672#PBS -N $job_name
673#PBS -A geofysisk
674#PBS -l walltime=$timestring
675#PBS -l ncpus=1
676#PBS -l pmem=${memory}mb
677#PBS -m abe
678#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
679#PBS -o $remote_dayfile
680#PBS -j oe
681
682%%END%%
683
684    fi
685
686 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
687 then
688
689    if [[ $queue = testq ]]
690    then
691       queue_directive="#PBS -q $queue"
692    else
693       queue_directive=""
694    fi
695
696    if [[ $numprocs != 0 ]]
697    then
698       cat > $job_to_send << %%END%%
699#!/bin/bash
700#PBS -N $job_name
701#PBS -l walltime=$timestring
702#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
703#PBS -l feature=$sgi_feature
704#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
705#PBS -o $remote_dayfile
706#PBS -j oe
707$queue_directive
708
709. /usr/share/modules/init/bash
710module load $mpilib
711# module load mvapich2/1.2rc1-intel
712# module load mvapich2
713module load netcdf
714export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
715echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
716
717%%END%%
718
719    else
720       cat > $job_to_send << %%END%%
721#PBS -S /bin/bash
722#PBS -N $job_name
723#PBS -l walltime=$timestring
724#PBS -l ncpus=1
725#PBS -o $remote_dayfile
726#PBS -e $remote_dayfile
727
728%%END%%
729
730    fi
731
732 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
733 then
734
735    if [[ $numprocs != 0 ]]
736    then
737       cat > $job_to_send << %%END%%
738#!/bin/ksh
739#PBS -S /bin/ksh
740#PBS -N $job_name
741#PBS -A geofysisk
742#PBS -j oe
743#PBS -l walltime=$timestring
744#PBS -l mppwidth=${numprocs}
745#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
746#PBS -m abe
747#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
748#PBS -o $remote_dayfile
749
750%%END%%
751
752    else
753       cat > $job_to_send << %%END%%
754#!/bin/ksh
755#PBS -S /bin/ksh
756#PBS -N $job_name
757#PBS -A geofysisk
758#PBS -j oe
759#PBS -l walltime=$timestring
760#PBS -l ncpus=1
761#PBS -l pmem=${memory}mb
762#PBS -m abe
763#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
764#PBS -o $remote_dayfile
765
766%%END%%
767
768    fi
769
770 elif [[ $remote_host = nech ]]
771 then
772
773    if (( nodes > 1 ))
774    then
775       cat > $job_to_send << %%END%%
776#!/bin/ksh
777#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
778#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
779#PBS -b $nodes
780#PBS -o $remote_dayfile
781#PBS -N palm
782#PBS -j o
783#PBS -T mpisx
784
785%%END%%
786
787    elif [[ $numprocs != 0 ]]
788    then
789       cat > $job_to_send << %%END%%
790#!/bin/ksh
791#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
792#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
793#PBS -o $remote_dayfile
794#PBS -N palm
795#PBS -j o
796
797%%END%%
798
799    else
800       cat > $job_to_send << %%END%%
801#!/bin/ksh
802#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
803#PBS -o $remote_dayfile
804#PBS -j o
805
806%%END%%
807
808    fi
809
810 elif [[ $remote_host = necriam ]]
811 then
812
813    if (( nodes > 1 ))
814    then
815       cat > $job_to_send << %%END%%
816#!/bin/ksh
817#PBS -b $nodes
818#PBS -o $remote_dayfile
819#PBS -N $job_name
820#PBS -j o
821#PBS -v MPIPROGINV=YES
822
823%%END%%
824
825    elif [[ $numprocs != 0 ]]
826    then
827       cat > $job_to_send << %%END%%
828#!/bin/ksh
829#PBS -q ${queue}
830#PBS -o $remote_dayfile
831#PBS -N $job_name
832#PBS -j o
833#PBS -v MPIPROGINV=YES
834
835%%END%%
836
837    else
838       cat > $job_to_send << %%END%%
839#!/bin/ksh
840#PBS -o $remote_dayfile
841#PBS -j o
842
843%%END%%
844
845    fi
846
847 elif [[ $remote_host = lctit ]]
848 then
849    cat > $job_to_send << %%END%%
850#!/bin/bash
851#$ -S /bin/bash
852cd $job_catalog
853export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
854echo \$PATH
855
856%%END%%
857
858       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
859  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
860    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
861
862 else
863
864    cat > $job_to_send << %%END%%
865# @\$-q ${queue}
866# @\$-l${qsubtime} $timestring
867# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
868# @\$-o $remote_dayfile
869# @\$-eo
870
871%%END%%
872
873 fi
874
875
876    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
877    # BEI EXIT VERANLASSEN
878    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
879    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
880 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
881 then
882    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
883    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
884    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
885    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
886    then
887       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
888       then
889          return_queue=c1
890       elif [[ $remote_host = ibms ]]
891       then
892          return_queue=p_normal
893       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
894       then
895          return_queue=serial
896       elif [[ $remote_host = lctit ]]
897       then
898          return_queue=sla3
899       elif [[ $remote_host = necriam ]]
900       then
901          return_queue=SP
902       else
903          return_queue=unknown
904       fi
905
906       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
907       then
908
909          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
910          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
911          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
912          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
913          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
914          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
915          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
916          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
917          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
918          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
919
920          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
921          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
922
923          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
924          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
925          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
926
927       elif [[ $remote_host = nech ]]
928       then
929          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
930          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
931          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
932          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
933          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
934          echo " "                                 >>  $job_to_send
935          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
936          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
937          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
938          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
939          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
940
941       elif [[ $remote_host = necriam ]]
942       then
943          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
944          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
945          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
946          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
947          echo " "                                 >>  $job_to_send
948          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
949          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
950          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
951          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
952
953       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
954       then
955          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
956          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
957          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
958          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
959          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
960          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
961          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
962          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
963          echo " "                                 >>  $job_to_send
964          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
965          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
966          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
967          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
968          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
969
970       elif [[ $remote_host = lctit ]]
971       then
972          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
973          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
974          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
975          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
976          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
977          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
978          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
979
980       else
981
982          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
983          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
984          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
985          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
986          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
987          then
988             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
989          fi
990          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
991#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
992          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
993          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
994          echo " "                                 >>  $job_to_send
995          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
996          then
997             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
998             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
999          fi
1000          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1001          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1002          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1003          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1004       fi
1005
1006       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1007       then
1008          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1009       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1010       then
1011          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1012          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1013       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1014       then
1015          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1016          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1017          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1018          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1019       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1020       then
1021          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1022       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1023       then
1024          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1025       else
1026          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1027       fi
1028       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1029       if [[ $remote_host = nech ]]
1030       then
1031          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1032       fi
1033    else
1034#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1035       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1036    fi
1037    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1038    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1039    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1040 fi
1041
1042
1043
1044    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1045 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1046
1047 if [[ $remote_host = ibm ]]
1048 then
1049    echo " "         >>  $job_to_send
1050    echo "exit"      >>  $job_to_send
1051 fi
1052 if [[ $remote_host = lctit ]]
1053 then
1054    echo " "                               >>  $job_to_send
1055    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1056 fi
1057
1058
1059
1060    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1061 if [[ -z $remote_user ]]
1062 then
1063    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1064    then
1065       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1066    fi
1067 fi
1068
1069
1070
1071    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1072 if [[ $no_submit = false ]]
1073 then
1074    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1075    then
1076       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1077       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1078       then
1079          job_catalog_save=$job_catalog
1080          job_catalog=job_queue
1081       elif [[ $remote_host = nech ]]
1082       then
1083          job_catalog_save=$job_catalog
1084          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1085       fi
1086       if [[ $local_host = decalpha ]]
1087       then
1088             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1089             # PASSWORT AB
1090          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1091       elif [[ $remote_host = nech ]]
1092       then
1093             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1094             # TRANSFERIERT WERDEN
1095          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1096       else
1097          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1098       fi
1099       if [[ $? = 1 ]]
1100       then
1101          locat=scp; exit
1102       fi
1103       if [[ $remote_host = ibms ]]
1104       then
1105          job_catalog=$job_catalog_save
1106       fi
1107       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1108    else
1109       eval  job_catalog=$job_catalog
1110       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1111    fi
1112
1113
1114
1115       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1116    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1117    then
1118       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1119       if [[ $remote_host != lctit ]]
1120       then
1121          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1122       else
1123             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1124             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1125             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1126          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1127          echo "first try" > send_protocol
1128          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1129          do
1130             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1131             then
1132                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1133             else
1134                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1135             fi
1136             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1 
1137             cat send_protocol
1138          done
1139          sleep 10
1140          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1141          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1142          rm  send_protocol
1143       fi
1144
1145       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1146    else
1147       cd  $job_catalog
1148       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1149       then
1150          eval  $submcom  $job_on_remhost
1151       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1152       then
1153          eval  $submcom  $job_on_remhost
1154          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1155          chmod  u+x  $job_on_remhost
1156       elif [[ $local_host = nech ]]
1157       then
1158          if [[ $queue = default ]]
1159          then
1160             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1161          else
1162             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1163          fi
1164       else
1165          qsub  $job_on_remhost
1166       fi
1167          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1168       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1169       cd  -  > /dev/null
1170    fi
1171 fi
1172
1173
1174
1175    # ABSCHLUSSARBEITEN
1176
1177 if [[ $no_submit = false ]]
1178 then
1179    rm  $job_to_send
1180 fi
1181 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.