source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 292

Last change on this file since 292 was 292, checked in by letzel, 14 years ago
  • Typographical errors (netcdf)
  • If the inversion height calculated by the prerun is zero, inflow_damping_height must be explicitly specified (init_3d_model)
  • Small bugfix concerning 3d 64bit netcdf output format (header)
  • Adjustments for lcsgib and lcsgih (subjob)
  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 41.6 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 292 2009-04-16 16:10:51Z letzel $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98     # 16/04/09 - Marcus- Adjustments for lcsgib and lcsgih
99
100
101
102    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
103 delete_dayfile=false
104 group_number=none
105 locat=normal
106 no_default_queue=none
107 no_submit=false
108 job_catalog="~/job_queue"
109 job_name=none
110 local_user=$LOGNAME
111 node_usage=shared
112 numprocs=1
113 punkte="..........................................................."
114 submcom=qsub
115 queue=default
116 remote_host=none
117 remote_user=""
118 verify=true
119
120 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
121 typeset  -i   inumprocs  nodes=tasks_per_node=threads_per_task=1
122 typeset  -L20 spalte1
123 typeset  -R40 spalte2
124 typeset  -L60 spalte3
125
126
127
128    # FEHLERBEHANDLUNG
129    # BEI EXIT:
130 trap 'if [[ $locat != normal ]]
131       then
132          case  $locat  in
133             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
134                       printf " by typing:"
135                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
136             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
137             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
138                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
139          esac
140          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
141          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
142       fi' exit
143
144
145    # BEI TERMINAL-BREAK:
146 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
147       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
148       exit
149      ' 2
150
151
152
153
154    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
155 local_host=$(hostname)
156
157
158
159    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
160    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
161 case  $local_host  in
162     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
163     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
164     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
165     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
166     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
167     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
168     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
169     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
170     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
171     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
172     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
173     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
174     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
175     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
176     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
177     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
178     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
179     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
180     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
181     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
182     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
183     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
184     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
185     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
186     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
187     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
188     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
189     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
190     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
191     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
192     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
193     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
194     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
195     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
196     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
197     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
198     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
199     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
200     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
201                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
202                             locat=parameter; exit;;
203 esac
204
205
206
207    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
208 remote_host=$local_host
209
210
211
212
213    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
214 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
215 do
216   case  $option  in
217       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
218       (d)   delete_dayfile=true;;
219       (D)   no_submit=true;;
220       (g)   group_number=$OPTARG;;
221       (h)   remote_host=$OPTARG;;
222       (m)   memory=$OPTARG;;
223       (n)   job_name=$OPTARG;;
224       (N)   node_usage=$OPTARG;;
225       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
226       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
227       (t)   cputime=$OPTARG;;
228       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
229       (u)   remote_user=$OPTARG;;
230       (v)   verify=false;;
231       (X)   numprocs=$OPTARG;;
232       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
233             locat=option; exit;;
234   esac
235 done
236
237
238    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
239 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
240
241
242    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
243 if [ "$1" = "?" ]
244 then
245   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
246    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
247    printf "\n      Description of available options:\n"
248    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
249    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
250    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
251    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
252    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
253    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
254    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
255    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
256    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
257    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
258    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
259    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
260    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
261    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
262    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
263    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
264    printf "\n "
265    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
266    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
267    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
268    exit
269 fi
270
271
272
273    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
274 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
275 then
276    printf "\n  +++ job-file missing"
277    locat=parameter; exit
278 else
279    if [[ -f $file_to_send ]]
280    then
281       true
282    else
283       printf "\n  +++ job-file: "
284       printf "\n           $file_to_send"
285       printf "\n      does not exist"
286       locat=parameter; exit
287    fi
288 fi
289
290
291
292    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
293    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
294 if [[ $job_name = none ]]
295 then
296    job_name=$file_to_send
297 fi
298 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
299 then
300    printf "\n  +++ job-file name: "
301    printf "\n           $job_name"
302    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
303    locat=parameter; exit
304 fi
305
306
307
308
309    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
310    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
311 if [[ $remote_host = none ]]
312 then
313    printf "\n  +++ host missing"
314    locat=option; exit
315 else
316    case  $remote_host  in
317        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
318        (ibmb)    queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
319        (ibmh)    queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
320        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
321        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
322        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
323        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
324        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
325        (lctit)   queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
326        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
327        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
328        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
329        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
330        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
331        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
332                  locat=parameter; exit;;
333    esac
334 fi
335
336
337    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
338 if [[ $no_default_queue != none ]]
339 then
340    error=false
341    ndq=$no_default_queue
342    case  $remote_host  in
343        (ibm)    case  $ndq  in
344                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
345                     (*)                                     error=true;;
346                 esac;;
347        (ibmb)   case  $ndq  in
348                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
349                     (*)                                     error=true;;
350                 esac;;
351        (ibmh)   case  $ndq  in
352                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
353                     (*)                                     error=true;;
354                 esac;;
355        (ibms)   case  $ndq  in
356                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
357                     (*)                                     error=true;;
358                 esac;;
359        (ibmy)   case  $ndq  in
360                     (parallel)                              error=false;;
361                     (*)                                     error=true;;
362                 esac;;
363        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
364                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
365                     (*)                                     error=true;;
366                 esac;;
367        (lctit)  case  $ndq  in
368                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
369                     (*)                                     error=true;;
370                 esac;;
371        (t3eb)   case  $ndq  in
372                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
373                     (*)    error=true;;
374                 esac;;
375        (necriam) case  $ndq  in
376                     (SP|SS|P6)  error=false;;
377                     (*)    error=true;;
378                 esac;;
379        (t3eh)   case  $ndq  in
380                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
381                     (*)    error=true;;
382                 esac;;
383        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
384                     (low|normal|high)  error=false;;
385                     (*)    error=true;;
386                 esac;;
387        (t3es)  case  $ndq  in
388                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
389                     (*)    error=true;;
390                 esac;;
391        (unics)  case  $ndq  in
392                     (unics|ht)  error=false;;
393                     (*)         error=true;;
394                 esac;;
395    esac
396    if [[ $error = true ]]
397    then
398       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
399       locat=parameter; exit
400    else
401       queue=$no_default_queue
402    fi
403 fi
404
405
406
407    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
408 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
409 then
410    node_usage=shared
411 fi
412
413
414
415    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
416    # AUFTEILEN
417 done=false
418 while [[ $done = false ]]
419 do
420    if (( $cputime <= 0 ))
421    then
422       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
423       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
424       printf "\n  >>> "
425       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
426    else
427       done=true
428    fi
429 done
430 if [[ $remote_host = nech ]]
431 then
432    if (( tasks_per_node != 0 ))
433    then
434       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
435    elif [[ $numprocs != 0 ]]
436    then
437       (( cputime = cputime * numprocs ))
438    fi
439 fi
440 (( stunden  = cputime / 3600 ))
441 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
442 (( minuten  = resttime / 60 ))
443 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
444 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
445
446
447
448    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
449 done=false
450 while [[ $done = false ]]
451 do
452    if (( memory <= 0 ))
453    then
454       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
455       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
456       printf "\n  >>> "
457       read  memory  1>/dev/null  2>&1
458    else
459       done=true
460    fi
461 done
462
463 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
464 then
465    if (( tasks_per_node != 0 ))
466    then
467       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
468    elif [[ $numprocs != 0 ]]
469    then
470       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
471    else
472       (( Memory = memory / 1000 ))
473    fi
474 fi
475
476
477    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
478 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
479 then
480    (( memory = memory * threads_per_task ))
481 fi
482
483
484    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
485 if (( tasks_per_node != 0 ))
486 then
487    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
488 fi
489
490
491
492    # HEADER-AUSGABE
493 if [[ $verify = true ]]
494 then
495    printf "\n\n"
496    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
497    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
498    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
499    printf "|                                                              | \n"
500    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
501    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
502    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
503    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
504    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
505    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
506    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
507    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
508    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
509    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
510    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
511    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
512    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
513    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
514
515
516       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
517    antwort="dummy"
518    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
519    do
520       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
521    done
522    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
523    then
524       locat=verify; exit
525    fi
526    printf "\n"
527 fi
528
529
530
531    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
532 kennung=$RANDOM
533 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
534 job_to_send=job_to_send_$kennung
535 if [[ $delete_dayfile = false ]]
536 then
537    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
538    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
539 else
540    remote_dayfile=/dev/null
541    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
542    then
543       notification='# @ notification = never'
544    fi
545 fi
546
547
548
549    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
550 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
551 then
552
553    if [[ $remote_host = ibmy ]]
554    then
555       consumable_memory=""
556    else
557       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
558    fi
559    if [[ $queue = cdev ]]
560    then
561       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
562       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
563    else
564       if [[ $remote_host = ibms ]]
565       then
566          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
567       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
568       then
569          network_to_use=""
570       else
571          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
572          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
573       fi
574    fi
575
576    cat > $job_to_send << %%END%%
577#!/bin/ksh
578
579# @ job_type = parallel
580# @ job_name = palm
581# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
582# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
583# @ output = $remote_dayfile
584# @ error = $remote_dayfile
585# @ image_size = 50
586# @ class = $queue
587# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
588$network_to_use
589$data_limit
590$notification
591
592%%END%%
593
594    if (( nodes > 0 ))
595    then
596
597       cat >> $job_to_send << %%END%%
598# @ node = $nodes
599# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
600# @ node_usage = $node_usage
601# @ queue
602
603%%END%%
604
605    else
606
607       if [[ $remote_host != ibmy ]]
608       then
609
610          cat >> $job_to_send << %%END%%
611# @ blocking = unlimited
612# @ total_tasks = $numprocs
613# @ node_usage = $node_usage
614# @ queue
615
616%%END%%
617
618       else
619
620          cat >> $job_to_send << %%END%%
621# @ node = 1
622# @ total_tasks = $numprocs
623# @ queue
624
625%%END%%
626
627       fi
628
629    fi
630
631 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
632 then
633
634    cat > $job_to_send << %%END%%
635#!/bin/ksh
636
637# @ job_type = serial
638# @ node_usage = $node_usage
639# @ job_name = palm
640# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
641# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
642# @ output = $remote_dayfile
643# @ error = $remote_dayfile
644# @ class = $queue
645$notification
646
647# @ queue
648
649%%END%%
650
651 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
652 then
653
654    if [[ $numprocs != 0 ]]
655    then
656       cat > $job_to_send << %%END%%
657#!/bin/ksh
658#PBS -N $job_name
659#PBS -A geofysisk
660#PBS -l walltime=$timestring
661#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
662#PBS -l pmem=${memory}mb
663#PBS -m abe
664#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
665#PBS -o $remote_dayfile
666#PBS -j oe
667mpd &
668
669%%END%%
670
671    else
672       cat > $job_to_send << %%END%%
673#!/bin/ksh
674#PBS -N $job_name
675#PBS -A geofysisk
676#PBS -l walltime=$timestring
677#PBS -l ncpus=1
678#PBS -l pmem=${memory}mb
679#PBS -m abe
680#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
681#PBS -o $remote_dayfile
682#PBS -j oe
683
684%%END%%
685
686    fi
687
688 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
689 then
690
691    if [[ $queue = testq ]]
692    then
693       queue_directive="#PBS -q $queue"
694    else
695       queue_directive=""
696    fi
697
698    if [[ $numprocs != 0 ]]
699    then
700       cat > $job_to_send << %%END%%
701#!/bin/bash
702#PBS -N $job_name
703#PBS -l walltime=$timestring
704#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
705#PBS -l feature=$sgi_feature
706#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
707#PBS -o $remote_dayfile
708#PBS -j oe
709$queue_directive
710
711. /usr/share/modules/init/bash
712module load $mpilib
713# module load mvapich2/1.2rc1-intel
714# module load mvapich2
715module load netcdf
716export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
717echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
718
719%%END%%
720
721    else
722       cat > $job_to_send << %%END%%
723#PBS -S /bin/bash
724#PBS -N $job_name
725#PBS -l walltime=$timestring
726#PBS -l ncpus=1
727#PBS -o $remote_dayfile
728#PBS -e $remote_dayfile
729
730%%END%%
731
732    fi
733
734 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
735 then
736
737    if [[ $numprocs != 0 ]]
738    then
739       cat > $job_to_send << %%END%%
740#!/bin/ksh
741#PBS -S /bin/ksh
742#PBS -N $job_name
743#PBS -A geofysisk
744#PBS -j oe
745#PBS -l walltime=$timestring
746#PBS -l mppwidth=${numprocs}
747#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
748#PBS -m abe
749#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
750#PBS -o $remote_dayfile
751
752%%END%%
753
754    else
755       cat > $job_to_send << %%END%%
756#!/bin/ksh
757#PBS -S /bin/ksh
758#PBS -N $job_name
759#PBS -A geofysisk
760#PBS -j oe
761#PBS -l walltime=$timestring
762#PBS -l ncpus=1
763#PBS -l pmem=${memory}mb
764#PBS -m abe
765#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
766#PBS -o $remote_dayfile
767
768%%END%%
769
770    fi
771
772 elif [[ $remote_host = nech ]]
773 then
774
775    if (( nodes > 1 ))
776    then
777       cat > $job_to_send << %%END%%
778#!/bin/ksh
779#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
780#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
781#PBS -b $nodes
782#PBS -o $remote_dayfile
783#PBS -N palm
784#PBS -j o
785#PBS -T mpisx
786
787%%END%%
788
789    elif [[ $numprocs != 0 ]]
790    then
791       cat > $job_to_send << %%END%%
792#!/bin/ksh
793#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
794#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
795#PBS -o $remote_dayfile
796#PBS -N palm
797#PBS -j o
798
799%%END%%
800
801    else
802       cat > $job_to_send << %%END%%
803#!/bin/ksh
804#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
805#PBS -o $remote_dayfile
806#PBS -j o
807
808%%END%%
809
810    fi
811
812 elif [[ $remote_host = necriam ]]
813 then
814
815    if (( nodes > 1 ))
816    then
817       cat > $job_to_send << %%END%%
818#!/bin/ksh
819#PBS -b $nodes
820#PBS -o $remote_dayfile
821#PBS -N $job_name
822#PBS -j o
823#PBS -v MPIPROGINV=YES
824
825%%END%%
826
827    elif [[ $numprocs != 0 ]]
828    then
829       cat > $job_to_send << %%END%%
830#!/bin/ksh
831#PBS -q ${queue}
832#PBS -o $remote_dayfile
833#PBS -N $job_name
834#PBS -j o
835#PBS -v MPIPROGINV=YES
836
837%%END%%
838
839    else
840       cat > $job_to_send << %%END%%
841#!/bin/ksh
842#PBS -o $remote_dayfile
843#PBS -j o
844
845%%END%%
846
847    fi
848
849 elif [[ $remote_host = lctit ]]
850 then
851    cat > $job_to_send << %%END%%
852#!/bin/bash
853#$ -S /bin/bash
854cd $job_catalog
855export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
856echo \$PATH
857
858%%END%%
859
860       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
861  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
862    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
863
864 else
865
866    cat > $job_to_send << %%END%%
867# @\$-q ${queue}
868# @\$-l${qsubtime} $timestring
869# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
870# @\$-o $remote_dayfile
871# @\$-eo
872
873%%END%%
874
875 fi
876
877
878    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
879    # BEI EXIT VERANLASSEN
880    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
881    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
882 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
883 then
884    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
885    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
886    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
887    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
888    then
889       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
890       then
891          return_queue=c1
892       elif [[ $remote_host = ibms ]]
893       then
894          return_queue=p_normal
895       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
896       then
897          return_queue=serial
898       elif [[ $remote_host = lctit ]]
899       then
900          return_queue=sla3
901       elif [[ $remote_host = necriam ]]
902       then
903          return_queue=SP
904       else
905          return_queue=unknown
906       fi
907
908       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
909       then
910
911          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
912          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
913          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
914          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
915          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
916          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
917          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
918          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
919          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
920          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
921
922          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
923          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
924
925          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
926          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
927          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
928
929       elif [[ $remote_host = nech ]]
930       then
931          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
932          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
933          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
934          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
935          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
936          echo " "                                 >>  $job_to_send
937          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
938          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
939          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
940          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
941          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
942
943       elif [[ $remote_host = necriam ]]
944       then
945          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
946          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
947          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
948          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
949          echo " "                                 >>  $job_to_send
950          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
951          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
952          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
953          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
954
955       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
956       then
957          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
958          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
959          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
960          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
961          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
962          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
963          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
964          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
965          echo " "                                 >>  $job_to_send
966          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
967          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
968          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
969          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
970          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
971
972       elif [[ $remote_host = lctit ]]
973       then
974          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
975          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
976          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
977          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
978          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
979          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
980          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
981
982       else
983
984          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
985          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
986          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
987          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
988          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
989          then
990             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
991          fi
992          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
993#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
994          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
995          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
996          echo " "                                 >>  $job_to_send
997          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
998          then
999             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1000             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1001          fi
1002          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1003          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1004          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1005          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1006       fi
1007
1008       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1009       then
1010          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1011       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1012       then
1013          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1014          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1015       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1016       then
1017          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1018          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1019          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1020          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1021       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1022       then
1023          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1024       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1025       then
1026          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1027       else
1028          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1029       fi
1030       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1031       if [[ $remote_host = nech ]]
1032       then
1033          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1034       fi
1035    else
1036#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1037       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1038    fi
1039    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1040    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1041    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1042 fi
1043
1044
1045
1046    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1047 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1048
1049 if [[ $remote_host = ibm ]]
1050 then
1051    echo " "         >>  $job_to_send
1052    echo "exit"      >>  $job_to_send
1053 fi
1054 if [[ $remote_host = lctit ]]
1055 then
1056    echo " "                               >>  $job_to_send
1057    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1058 fi
1059
1060
1061
1062    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1063 if [[ -z $remote_user ]]
1064 then
1065    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1066    then
1067       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1068    fi
1069 fi
1070
1071
1072
1073    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1074 if [[ $no_submit = false ]]
1075 then
1076    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1077    then
1078       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1079       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1080       then
1081          job_catalog_save=$job_catalog
1082          job_catalog=job_queue
1083       elif [[ $remote_host = nech ]]
1084       then
1085          job_catalog_save=$job_catalog
1086          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1087       fi
1088       if [[ $local_host = decalpha ]]
1089       then
1090             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1091             # PASSWORT AB
1092          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1093       elif [[ $remote_host = nech ]]
1094       then
1095             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1096             # TRANSFERIERT WERDEN
1097          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1098       else
1099          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1100       fi
1101       if [[ $? = 1 ]]
1102       then
1103          locat=scp; exit
1104       fi
1105       if [[ $remote_host = ibms ]]
1106       then
1107          job_catalog=$job_catalog_save
1108       fi
1109       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1110    else
1111       eval  job_catalog=$job_catalog
1112       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1113    fi
1114
1115
1116
1117       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1118    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1119    then
1120       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1121       if [[ $remote_host != lctit ]]
1122       then
1123          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1124       else
1125             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1126             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1127             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1128          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1129          echo "first try" > send_protocol
1130          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1131          do
1132             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1133             then
1134                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1135             else
1136                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1137             fi
1138             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1
1139             cat send_protocol
1140          done
1141          sleep 10
1142          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1143          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1144          rm  send_protocol
1145       fi
1146
1147       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1148    else
1149       cd  $job_catalog
1150       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1151       then
1152          eval  $submcom  $job_on_remhost
1153       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1154       then
1155          eval  $submcom  $job_on_remhost
1156          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1157          chmod  u+x  $job_on_remhost
1158       elif [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1159       then
1160          eval  $submcom  $job_on_remhost
1161       elif [[ $local_host = nech ]]
1162       then
1163          if [[ $queue = default ]]
1164          then
1165             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1166          else
1167             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1168          fi
1169       else
1170          qsub  $job_on_remhost
1171       fi
1172          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1173       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1174       cd  -  > /dev/null
1175    fi
1176 fi
1177
1178
1179
1180    # ABSCHLUSSARBEITEN
1181
1182 if [[ $no_submit = false ]]
1183 then
1184    rm  $job_to_send
1185 fi
1186 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.