source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 1279

Last change on this file since 1279 was 1279, checked in by raasch, 10 years ago

tasks_per_node must not be an integral divisor of numprocs any more

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 59.1 KB
RevLine 
[1]1#!/bin/ksh
[1090]2
3# subjob - script for automatic generation and submission of batch-job files
4#          for various batch queuing systems
5
[1046]6#--------------------------------------------------------------------------------#
7# This file is part of PALM.
8#
9# PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
10# of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
11# either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
12#
13# PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
14# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
15# A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16#
17# You should have received a copy of the GNU General Public License along with
18# PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19#
20# Copyright 1997-2012  Leibniz University Hannover
21#--------------------------------------------------------------------------------#
22#
23# Current revisions:
[1090]24# ------------------
[1279]25# node calculation modified due to changes in mrun (tasks_per_node must not be
26# an integral divisor of numprocs any more)
[1046]27#
28# Former revisions:
29# -----------------
[169]30# $Id: subjob 1279 2014-01-28 12:10:14Z raasch $
[1200]31#
[1275]32# 1274 2014-01-09 13:14:54Z heinze
33# adjustments for lccrayh
34#
[1267]35# 1266 2013-12-11 12:07:34Z heinze
36# further adjustments for lccrayb (use msub instead of qsub)
37#
[1265]38# 1264 2013-12-09 12:46:09Z fricke
39# Bugfix: Using number of nodes instead of number of processors (lccrayb)
40#
[1263]41# 1262 2013-12-09 10:57:20Z fricke
42# further adjustments for lccrayb
43#
[1261]44# 1260 2013-12-04 12:48:04Z raasch
45# jaboticaba admitted
46#
[1256]47# 1255 2013-11-07 14:43:35Z raasch
48# further adjustments for lccrayb
49#
[1225]50# 1224 2013-09-16 07:27:23Z raasch
51# first adjustments for lccrayb
52#
[1203]53# 1202 2013-07-10 16:22:07Z witha
54# adjustments for Forwind cluster (lcflow)
55#
[1200]56# 1199 2013-07-05 14:52:22Z raasch
57# adjustments for CSC Helsinki (lccrayf)
58#
[1185]59# use of cluster/express queue enabled (ibmh)
60# vinessa added (imuk)
[1047]61#
[1104]62# 1103 2013-02-20 02:15:53Z raasch
63# bash compatibility adjustments (usage of OPTIND, output formatting with printf
64# instead typeset -L/R),
65# further adjustments for lckyuh
66#
[1100]67# 2013-02-10 01:47:43Z raasch
68# adjustments for Kyushu-Univeristy computing center (lckyuh - hayaka)
69# and for Forwind cluster (lcflow)
70#
[1096]71# 1094 2013-02-03 01:52:12Z raasch
72# new option -P for explicit setting of ssh/scp port,
73# decalpha parts (yonsei) removed
74#
[1091]75# 2013-02-02 07:06:13Z raasch
[1099]76# adjustments for Kyushu-University computing center (lckyut - tatara)
[1091]77# old changelog messages removed
78#
[1047]79# 1046 2012-11-09 14:38:45Z maronga
80# code put under GPL (PALM 3.9)
81#
[1090]82# 08/07/94 - Siggi - first version finished
83# 29/06/94 - Siggi - script development started
84#--------------------------------------------------------------------------------#
85# subjob - script for automatic generation and submission of batch-job files
86#          for various batch queuing systems
87#--------------------------------------------------------------------------------#
[1]88
89
90    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
[352]91 delete_dayfile=false
[799]92 email_notification=none
[122]93 group_number=none
[1]94 locat=normal
95 no_default_queue=none
96 no_submit=false
97 job_catalog="~/job_queue"
98 job_name=none
99 local_user=$LOGNAME
100 node_usage=shared
[475]101 numprocs=0
[1]102 punkte="..........................................................."
103 submcom=qsub
104 queue=default
105 remote_host=none
106 remote_user=""
107 verify=true
108
109 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
[696]110 typeset  -i   inumprocs  mpi_tasks=nodes=processes_per_node=0 tasks_per_node=threads_per_task=1
[1]111
112
113
114    # FEHLERBEHANDLUNG
115    # BEI EXIT:
116 trap 'if [[ $locat != normal ]]
117       then
118          case  $locat  in
119             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
120                       printf " by typing:"
121                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
122             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
123             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
124                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
125          esac
126          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
127          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
128       fi' exit
129
130
131    # BEI TERMINAL-BREAK:
132 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
133       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
134       exit
135      ' 2
136
137
138
139
140    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
141 local_host=$(hostname)
142
143
144
145    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
146    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
[717]147    # Note: One of the entries for "lck" or "lckordi" always has to be
148    # comment out, because the hostname (node*) is same for both machines
[1]149 case  $local_host  in
[1204]150     (ambiel-lx)             local_addres=134.106.74.48;  local_host=lcfor;;
[1]151     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
[1235]152     (austru)                local_addres=130.75.105.128; local_host=lcmuk;;
[102]153     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
[5]154     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
[400]155     (bd1)                   local_addres=130.73.232.64;  local_host=lcsgib;;
156     (bd2)                   local_addres=130.73.232.65;  local_host=lcsgib;;
157     (bd3)                   local_addres=130.73.232.66;  local_host=lcsgib;;
158     (bd4)                   local_addres=130.73.232.67;  local_host=lcsgib;;
159     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
[1103]160     (b04*)                  local_addres=133.5.4.33;     local_host=lckyuh;;
[291]161     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
[749]162     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
[1255]163     (blogin*|bxc*)          local_addres=130.73.233.1;   local_host=lccrayb;;
[1274]164     (hlogin*|hxc*)          local_addres=130.75.4.1;     local_host=lccrayh;;
[12]165     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
[1174]166     (buran)                 local_addres=130.75.105.58;  local_host=lcmuk;;
[372]167     (caurus)                local_addres=130.75.105.19;  local_host=lcmuk;;
[693]168     (climate*)              local_addres=165.132.26.68;  local_host=lcyon;;
[1197]169     (clogin*)               local_addres=86.50.166.21;   local_host=lccrayf;;
[108]170     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[1]171     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
[5]172     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
[108]173     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[1099]174     (flow01)                local_addres=10.141.255.71;  local_host=lcflow;;
175     (flow02)                local_addres=10.141.255.72;  local_host=lcflow;;
[367]176     (node*)                 local_addres=165.132.26.61   local_host=lck;;
[717]177   #  (node*)                 local_addres=210.219.61.8    local_host=lckordi;;
[693]178     (gaia*)                 local_addres=150.183.146.24; local_host=ibmkisti;;
[101]179     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
[1]180     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
[5]181     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
182     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
[1099]183     (hayaka*)               local_addres=133.5.4.33;     local_host=lckyuh;;
[892]184     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxe6;;
[400]185     (hd1)                   local_addres=130.75.4.104;   local_host=lcsgih;;
186     (hd2)                   local_addres=130.75.4.105;   local_host=lcsgih;;
187     (hd3)                   local_addres=130.75.4.106;   local_host=lcsgih;;
188     (hd4)                   local_addres=130.75.4.107;   local_host=lcsgih;;
[739]189     (hicegate0)             local_addres=130.75.4.101;   local_host=lcsgih;;
[292]190     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[210]191     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
[440]192     (hx*)                   local_addres=133.3.51.11;    local_host=lckyoto;;
[749]193     (inferno)               local_addres=130.75.105.5;   local_host=lcmuk;;
[5]194     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
[1260]195     (jaboticaba)            local_addres=150.163.25.181; local_host=lcbr;;
[407]196     (sno)                   local_addres=130.75.105.113; local_host=lcmuk;;
[5]197     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
[1040]198     (login*)                local_addres=118.128.66.223; local_host=lckiaps;;
[5]199     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
[1099]200     (meller)                local_addres=134.106.74.155; local_host=lcfor;;
[437]201     (meteo-login*)          local_addres=193.166.211.144;local_host=lcxt5m;;
[892]202     (hexagon*)              local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxe6;;
[1]203     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
[5]204     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
205     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
[205]206     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
[1099]207     (pcj*)                  local_addres=172.31.120.1;   local_host=lckyut;;
[789]208     (pingui)                local_addres=134.106.74.118; local_host=lcfor;;
[5]209     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
[622]210     (rte*)                  local_addres=133.5.185.60;   local_host=lcrte;;
[1197]211     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
212     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
[1]213     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
[1204]214     (shiokaze-lx)           local_addres=134.106.74.123; local_host=lcfor;;
[1197]215     (sisu-login*)           local_addres=86.50.166.21;   local_host=lccrayf;;
[799]216     (solano)                local_addres=130.75.105.110; local_host=lcmuk;;
[1090]217     (sugoka*)               local_addres=172.31.120.1;   local_host=lckyut;;
[1]218     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
[259]219     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
[635]220     (t2a*)                  local_addres=10.1.6.165;     local_host=lctit;;
[1021]221     (urban*)                local_addres=147.46.30.151   local_host=lcsb;;
[1184]222     (vinessa)               local_addres=130.75.105.112; local_host=lcmuk;;
[1]223     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
[622]224     (*.cc.kyushu-u.ac.jp)   local_addres=133.5.4.129;    local_host=ibmku;;
[1]225     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
[1255]226                             printf "\n      please contact the PALM group at IMUK";
[1]227                             locat=parameter; exit;;
228 esac
229
230
231
232    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
233 remote_host=$local_host
234
235
236
237
238    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
[1094]239 while  getopts  :c:dDe:g:h:m:n:N:O:P:q:t:T:u:vX:  option
[1]240 do
241   case  $option  in
242       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
243       (d)   delete_dayfile=true;;
244       (D)   no_submit=true;;
[352]245       (e)   email_notification=$OPTARG;;
[125]246       (g)   group_number=$OPTARG;;
[1]247       (h)   remote_host=$OPTARG;;
248       (m)   memory=$OPTARG;;
249       (n)   job_name=$OPTARG;;
250       (N)   node_usage=$OPTARG;;
251       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
[1094]252       (P)   scp_port=$OPTARG;;
[1]253       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
254       (t)   cputime=$OPTARG;;
255       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
256       (u)   remote_user=$OPTARG;;
257       (v)   verify=false;;
258       (X)   numprocs=$OPTARG;;
259       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
260             locat=option; exit;;
261   esac
262 done
263
264
265    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
[1103]266 (( to_shift = $OPTIND - 1 ))
267 shift $to_shift; file_to_send=$1
[1]268
269
270    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
271 if [ "$1" = "?" ]
272 then
273   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
274    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
275    printf "\n      Description of available options:\n"
276    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
277    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
278    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
279    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
280    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
[693]281    printf "\n              ibm, ibmh, ibmkisti, ibmku, ibms, ibmy, lc...,"
[1040]282    printf "\n              lckiaps, lctit, nech, necriam, unics"
[1]283    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
284    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
285    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
[1094]286    printf "\n        -P    ssh/scp port                        default port"
[1]287    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
288    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
289    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
290    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
291    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
292    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
293    printf "\n "
294    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
295    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
296    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
297    exit
298 fi
299
300
301
302    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
303 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
304 then
305    printf "\n  +++ job-file missing"
306    locat=parameter; exit
307 else
308    if [[ -f $file_to_send ]]
309    then
310       true
311    else
312       printf "\n  +++ job-file: "
313       printf "\n           $file_to_send"
314       printf "\n      does not exist"
315       locat=parameter; exit
316    fi
317 fi
318
319
320
321    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
322    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
323 if [[ $job_name = none ]]
324 then
325    job_name=$file_to_send
326 fi
327 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
328 then
329    printf "\n  +++ job-file name: "
330    printf "\n           $job_name"
331    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
332    locat=parameter; exit
333 fi
334
335
336
337
338    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
339    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
340 if [[ $remote_host = none ]]
341 then
342    printf "\n  +++ host missing"
343    locat=option; exit
344 else
345    case  $remote_host  in
[251]346        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[1184]347        (ibmh)    queue=cluster; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[693]348        (ibmkisti) queue=class.32plus; remote_addres=150.183.146.24; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[622]349        (ibmku)   queue=s4; remote_addres=133.5.4.129; submcom=/usr/local/bin/llsubmit;;
[251]350        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
351        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[1262]352        (lccrayb) queue=testq; remote_addres=130.73.233.1; submcom=/opt/moab/7.2.6/bin/msub;;
[1274]353        (lccrayh) queue=mpp1testq; remote_addres=130.75.4.1; submcom=/opt/moab/7.2.6/bin/msub;;
[1197]354        (lccrayf) queue=small; remote_addres=86.50.166.21; submcom=/opt/slurm/default/bin/sbatch;;
[251]355        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
[1099]356        (lcflow)  remote_addres=10.140.1.71; submcom=/cm/shared/apps/sge/6.2u5p2/bin/lx26-amd64/qsub;;
[440]357        (lckyoto) remote_addres=133.3.51.11; submcom=/thin/local/bin/qsub;;
[540]358        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.104; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
359        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.101; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
[367]360        (lck)     remote_addres=165.132.26.61; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[1040]361        (lckiaps) remote_addres=118.128.66.223; submcom=/cm/shared/apps/pbspro/11.0.2.110766/bin/qsub;;
[717]362        (lckordi) remote_addres=210.219.61.8; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[1099]363        (lckyuh)  remote_addres=133.5.4.33; submcom=/usr/bin/pjsub;;
[1090]364        (lckyut)  remote_addres=133.5.4.37; submcom=/usr/bin/pjsub;;
[1021]365        (lcsb)    remote_addres=147.46.30.151; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[635]366        (lctit)   queue=S; remote_addres=10.1.6.165; submcom=/opt/pbs/tools/bin/t2sub;;
[892]367        (lcxe6)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.5.10/bin/qsub;;
[437]368        (lcxt5m)  remote_addres=193.166.211.144; submcom=/opt/pbs/10.1.0.91350/bin/qsub;;
[693]369        (lcyon)   remote_addres=165.132.26.68; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[251]370        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
371        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
372        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
373        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
374        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
375                  locat=parameter; exit;;
[1]376    esac
377 fi
378
379
380    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
381 if [[ $no_default_queue != none ]]
382 then
383    error=false
384    ndq=$no_default_queue
385    case  $remote_host  in
386        (ibm)    case  $ndq  in
387                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
388                     (*)                                     error=true;;
389                 esac;;
390        (ibmh)   case  $ndq  in
[1184]391                     (cluster|express)  error=false;;
[1]392                     (*)                                     error=true;;
393                 esac;;
[693]394        (ibmkisti)   case  $ndq  in
395                     (class.32plus|class.1-2|class.2-32)  error=false;;
396                     (*)                                     error=true;;
397                 esac;;
[622]398        (ibmku)  case  $ndq  in
399                     (sdbg1|sdbg2|sdbg4|s4|s16|s32|s32-s)    error=false;;
400                     (*)                                     error=true;;
401                 esac;;
[1]402        (ibms)   case  $ndq  in
403                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
404                     (*)                                     error=true;;
405                 esac;;
406        (ibmy)   case  $ndq  in
407                     (parallel)                              error=false;;
408                     (*)                                     error=true;;
409                 esac;;
[1224]410        (lccrayb) case  $ndq  in
[1274]411                     (mpp1q|testq|specialm1q)                error=false;;
[1224]412                     (*)                                     error=true;;
413                 esac;;
[1274]414        (lccrayh) case  $ndq  in
415                     (mpp1q|mpp1testq|specialm1q|dataq)      error=false;;
416                     (*)                                     error=true;;
417                 esac;;
[1197]418        (lccrayf) case  $ndq  in
419                     (usup|test*|small|large)                error=false;;
420                     (*)                                     error=true;;
421                 esac;;
[1099]422        (lcflow) case  $ndq  in
423                     (cfd_lom_long.q|cfd_him_long.q|cfd_lom_serl.q|cfd_lom_shrt.q|cfd_him_shrt.q)  error=false;;
424                     (*)                                     error=true;;
425                 esac;;
[1040]426        (lckiaps) case  $ndq  in
427                     (express|normal)                        error=false;;
428                     (*)                                     error=true;;
429                 esac;;
[440]430        (lckyoto) case  $ndq  in
431                     (eh|ph)                                 error=false;;
432                     (*)                                     error=true;;
433                 esac;;
[1099]434        (lckyuh) case  $ndq  in
435                     (fx-dbg|fx-single|fx-small|fx-middle|fx-large)  error=false;;
436                     (*)                                     error=true;;
437                 esac;;
[1090]438        (lckyut) case  $ndq  in
439                     (cx-dbg|cx-single|cx-small|cx-middle|cx-large)  error=false;;
440                     (*)                                     error=true;;
441                 esac;;
[191]442        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
[416]443                     (testq|serialq|smallq|mediumq|bigq|workq|dataq|permq|special1q)       error=false;;
[191]444                     (*)                                     error=true;;
445                 esac;;
[1]446        (lctit)  case  $ndq  in
[635]447                     (G|L128|L256|L512H|S|S96|V)             error=false;;
[1]448                     (*)                                     error=true;;
449                 esac;;
450        (t3eb)   case  $ndq  in
451                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
452                     (*)    error=true;;
453                 esac;;
[251]454        (necriam) case  $ndq  in
[253]455                     (SP|SS|P6)  error=false;;
[251]456                     (*)    error=true;;
457                 esac;;
[1]458        (t3eh)   case  $ndq  in
459                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
460                     (*)    error=true;;
461                 esac;;
462        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
463                     (low|normal|high)  error=false;;
464                     (*)    error=true;;
465                 esac;;
466        (t3es)  case  $ndq  in
467                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
468                     (*)    error=true;;
469                 esac;;
470        (unics)  case  $ndq  in
471                     (unics|ht)  error=false;;
472                     (*)         error=true;;
473                 esac;;
474    esac
475    if [[ $error = true ]]
476    then
477       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
478       locat=parameter; exit
479    else
480       queue=$no_default_queue
481    fi
482 fi
483
484
485
486    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
487    # AUFTEILEN
488 done=false
489 while [[ $done = false ]]
490 do
491    if (( $cputime <= 0 ))
492    then
493       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
494       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
495       printf "\n  >>> "
496       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
497    else
498       done=true
499    fi
500 done
501 if [[ $remote_host = nech ]]
502 then
503    if (( tasks_per_node != 0 ))
504    then
505       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
506    elif [[ $numprocs != 0 ]]
507    then
508       (( cputime = cputime * numprocs ))
509    fi
510 fi
511 (( stunden  = cputime / 3600 ))
512 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
513 (( minuten  = resttime / 60 ))
514 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
515 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
516
517
518
519    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
520 done=false
521 while [[ $done = false ]]
522 do
523    if (( memory <= 0 ))
524    then
525       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
526       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
527       printf "\n  >>> "
528       read  memory  1>/dev/null  2>&1
529    else
530       done=true
531    fi
532 done
533
[251]534 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
[1]535 then
536    if (( tasks_per_node != 0 ))
537    then
538       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
539    elif [[ $numprocs != 0 ]]
540    then
541       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
542    else
543       (( Memory = memory / 1000 ))
544    fi
[635]545 elif [[ $remote_host = lctit ]]
546 then
547    (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
[1]548 fi
549
550
551    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
552 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
553 then
554    (( memory = memory * threads_per_task ))
555 fi
556
557
558    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
559 if (( tasks_per_node != 0 ))
560 then
[1279]561    (( nodes = ( numprocs - 1 ) / ( tasks_per_node * threads_per_task ) + 1 ))
[1]562 fi
563
[1094]564
[622]565    # Calculate number of processes per node
566 (( processes_per_node = tasks_per_node * threads_per_task ))
[1]567
[1094]568
[696]569    # Calculate number of MPI tasks
570 (( mpi_tasks = numprocs / threads_per_task ))
[1]571
[696]572
[1094]573    # Set port number option for calls of ssh/scp, subjob and batch_scp scripts
574 if [[ "$scp_port" != "" ]]
575 then
576    PORTOPT="-P $scp_port"
577    SSH_PORTOPT="-p $scp_port"
578 fi
579
580
[1]581    # HEADER-AUSGABE
582 if [[ $verify = true ]]
583 then
584    printf "\n\n"
585    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
586    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
[1103]587    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "$spalte2"
[1]588    printf "|                                                              | \n"
589    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
[1103]590    spalte1=$(echo local_host$punkte | cut -c-20)
591    spalte2=$punkte$local_host
592    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
593    spalte1=$(echo remote_host$punkte | cut -c-20)
594    spalte2=$punkte$remote_host
595    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
596    spalte1=$(echo queue$punkte | cut -c-20)
597    spalte2=$punkte$queue
598    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
599    spalte1=$(echo memory$punkte | cut -c-20)
600    spalte2="$punkte$memory mb"
601    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
602    spalte1=$(echo cputime$punkte | cut -c-20)
603    spalte2="$punkte$cputime sec"
604    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
605    spalte1=$(echo job_name$punkte | cut -c-20)
606    spalte2="$punkte$job_name"
607    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
[1]608    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
609
610
611       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
612    antwort="dummy"
613    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
614    do
615       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
616    done
617    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
618    then
619       locat=verify; exit
620    fi
621    printf "\n"
622 fi
623
624
625
626    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
627 kennung=$RANDOM
628 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
629 job_to_send=job_to_send_$kennung
630 if [[ $delete_dayfile = false ]]
631 then
632    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
633    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
634 else
635    remote_dayfile=/dev/null
636 fi
637
638
639
[622]640    # Generate the batch job scripts (qsub/msub/LoadLeveler)
[1]641 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
642 then
643
[622]644       # General LoadLeveler settings
645    execute_in_shell="#!/bin/ksh"
646    use_shell="# @ shell = /bin/ksh"
647    consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
648    class="# @ class = $queue"
649    environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
650    network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
651    data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
652    image_size="# @ image_size = 50"
[693]653    wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring"
[312]654
[693]655    if [[ $email_notification = none ]]
656    then
657       notify_user=""
658    else
659       notify_user="# @ notify_user = $email_notification"
660       if [[ $delete_dayfile = true ]]
661       then
662          notification='# @ notification = never'
663       fi
664    fi
[622]665
[312]666    if [[ $remote_host = ibmh ]]
[1]667    then
[312]668       data_limit=""
669       network_to_use=""
[1184]670       class="# @ class = $queue"
[312]671       environment=""
[814]672       rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
673       task_affinity="# @ task_affinity = core(1)"
[693]674    elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
675    then
676       network_to_use="# @ network.MPI = sn_all,shared,US"
677       wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = $timestring"
[696]678       if [[ $threads_per_task = 1 ]]
679       then
680          rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
681          mcm_affinity_options="# @ mcm_affinity_options = mcm_mem_pref mcm_sni_none mcm_distribute"
682       fi
[693]683       environment=""
684       use_shell=""
685       data_limit=""
686       image_size=""
[622]687    elif [[ $remote_host = ibmku ]]
688    then
689       execute_in_shell="#!/usr/bin/ksh"
690       use_shell="# @ shell = /usr/bin/ksh"
691       consumable_memory=""
692       environment=""
693       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
694       data_limit=""
695       image_size=""
696    elif [[ $remote_host = ibms ]]
697    then
698       network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
699    elif [[ $remote_host = ibmy ]]
700    then
701       consumable_memory=""
702       network_to_use=""
[1]703    fi
704
705    cat > $job_to_send << %%END%%
[622]706$execute_in_shell
707$use_shell
[1]708
709# @ job_type = parallel
[693]710# @ job_name = $job_name
[1]711# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
712# @ output = $remote_dayfile
713# @ error = $remote_dayfile
[693]714$wall_clock_limit
[622]715$image_size
[312]716$class
717$environment
[1]718$network_to_use
719$data_limit
[693]720$rset
721$mcm_affinity_options
[814]722$task_affinity
[1]723$notification
[693]724$notify_user
[1]725
726%%END%%
727
728    if (( nodes > 0 ))
729    then
730
[693]731       if [[ $remote_host != ibmkisti ]]
732       then
733
734          cat >> $job_to_send << %%END%%
[1]735# @ node = $nodes
[622]736# @ tasks_per_node = $processes_per_node
[1]737# @ node_usage = $node_usage
738# @ queue
739
740%%END%%
741
[693]742       else
743
744          cat >> $job_to_send << %%END%%
[696]745# @ total_tasks = $mpi_tasks
[693]746# @ blocking = unlimited
747# @ queue
748
749%%END%%
750
751       fi
752
[1]753    else
754
755       if [[ $remote_host != ibmy ]]
756       then
757
758          cat >> $job_to_send << %%END%%
759# @ blocking = unlimited
760# @ total_tasks = $numprocs
761# @ node_usage = $node_usage
762# @ queue
763
764%%END%%
765
766       else
767
768          cat >> $job_to_send << %%END%%
769# @ node = 1
770# @ total_tasks = $numprocs
771# @ queue
772
773%%END%%
774
775       fi
776
777    fi
778
[696]779       # workaround because of silly job filter on ibmkisti
780    if [[ $remote_host = ibmkisti  &&  $threads_per_task != 1 ]]
781    then
782       echo  "export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task"  >>  $job_to_send
783    fi
784
[1]785 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
786 then
787
788    cat > $job_to_send << %%END%%
789#!/bin/ksh
790
791# @ job_type = serial
792# @ node_usage = $node_usage
793# @ job_name = palm
794# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
795# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
796# @ output = $remote_dayfile
797# @ error = $remote_dayfile
[312]798$class
[1]799$notification
800
801# @ queue
802
803%%END%%
804
[1274]805 elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
[1224]806 then
807
808    if [[ $numprocs != 0 ]]
809    then
810       cat > $job_to_send << %%END%%
[1255]811#!/bin/bash
[1224]812#PBS -N $job_name
813#PBS -l walltime=$timestring
[1264]814#PBS -l nodes=$nodes:ppn=$processes_per_node
[1224]815#PBS -o $remote_dayfile
816#PBS -j oe
817#PBS -q $queue
818
819$module_calls
820
821%%END%%
822
823    else
824
825       continue
826
827    fi
828
[1197]829 elif [[ $remote_host = lccrayf ]]
830 then
831
832    if [[ $numprocs != 0 ]]
833    then
834       cat > $job_to_send << %%END%%
835#!/bin/bash -l
836#SBATCH -J $job_name
837#SBATCH -t $timestring
838#SBATCH -N $nodes
839#SBATCH --ntasks-per-node=$processes_per_node
840#SBATCH -p $queue
841#SBATCH -o $remote_dayfile
842#SBATCH -e $remote_dayfile
843
844$init_cmds
845$module_calls
846
847%%END%%
848
849    else
850       cat > $job_to_send << %%END%%
851#!/bin/bash -l
852#SBATCH -J $job_name
853#SBATCH -t $timestring
854#SBATCH -l ncpus=1
855#SBATCH -l pmem=${memory}mb
856#SBATCH -m abe
857#SBATCH -o $remote_dayfile
858#SBATCH -e $remote_dayfile
859
860$init_cmds
861$module_calls
862
863%%END%%
864
865    fi
866
[108]867 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
868 then
869
870    if [[ $numprocs != 0 ]]
871    then
872       cat > $job_to_send << %%END%%
873#!/bin/ksh
874#PBS -N $job_name
[552]875#PBS -A $project_account
[108]876#PBS -l walltime=$timestring
[622]877#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$processes_per_node
[108]878#PBS -l pmem=${memory}mb
879#PBS -m abe
880#PBS -o $remote_dayfile
881#PBS -j oe
882mpd &
883
884%%END%%
885
[168]886    else
887       cat > $job_to_send << %%END%%
888#!/bin/ksh
889#PBS -N $job_name
[552]890#PBS -A $project_account
[168]891#PBS -l walltime=$timestring
892#PBS -l ncpus=1
893#PBS -l pmem=${memory}mb
894#PBS -m abe
895#PBS -o $remote_dayfile
896#PBS -j oe
897
898%%END%%
899
900    fi
901
[1099]902 elif [[ $remote_host = lcflow ]]
903 then
[1202]904    if [ $memory -gt 1800 ]; then
[1099]905      use_himem=""
906    else
907      use_himem="#"
908    fi
909    if [[ $numprocs != 0 ]]
910    then
[1202]911      pe_set="#$ -pe impi41 $numprocs"
[1099]912    else
[1202]913      pe_set="#$ -pe impi41 1"
[1099]914    fi
915    if [[ $queue = default ]]
916    then
917      queue_set=""
918    else
919      queue_set="#$ -q $queue"
920    fi
921    [[ "$disc_space" = "" ]]  &&  disc_space=50
922
923       cat > $job_to_send << %%END%%
924#!/bin/bash
925#$ -S /bin/bash
926#$ -N $job_name
927#$ -cwd
928#$ -l h_rt=$timestring
929#$ -l h_vmem=${memory}M
930#$ -o $remote_dayfile
931#$ -j y
932$pe_set
933#$ -R y
934${use_himem}#$ -l highmem=true
935#$ -l h_fsize=${disc_space}G
936$queue_set
937
938%%END%%
939
[1021]940 elif [[ $remote_host = lck || $remote_host = lckordi || $remote_host = lcsb ]]
[368]941 then
942
943    if [[ $numprocs != 0 ]]
944    then
945       cat > $job_to_send << %%END%%
946#!/bin/ksh
947#PBS -N $job_name
948#PBS -l walltime=$timestring
949#PBS -l ncpus=$numprocs
950#PBS -l pmem=${memory}mb
951#PBS -o $remote_dayfile
[1021]952#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
[368]953#PBS -j oe
954
955mpd &
956
957%%END%%
958
959    else
960       cat > $job_to_send << %%END%%
961#!/bin/ksh
962#PBS -N $job_name
963#PBS -l walltime=$timestring
964#PBS -l ncpus=1
965#PBS -l pmem=${memory}mb
966#PBS -o $remote_dayfile
967#PBS -j oe
968
969%%END%%
970
971    fi
972
[1040]973 elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
974 then
975
976    if [[ $numprocs != 0 ]]
977    then
978       cat > $job_to_send << %%END%%
979#!/bin/ksh
980#PBS -N $job_name
981#PBS -l walltime=$timestring
982#PBS -l select=1:ncpus=$numprocs
983#PBS -l pmem=${memory}mb
984#PBS -q $queue
985#PBS -o $remote_dayfile
986#PBS -j oe
987#PBS -V
988
989%%END%%
990
991    else
992       cat > $job_to_send << %%END%%
993#!/bin/ksh
994#PBS -N $job_name
995#PBS -l walltime=$timestring
996#PBS -l ncpus=1
997#PBS -l pmem=${memory}mb
998#PBS -o $remote_dayfile
999#PBS -j oe
1000
1001%%END%%
1002
1003    fi
1004
[693]1005 elif [[ $remote_host = lcyon ]]
1006 then
1007
1008    if [[ $numprocs != 0 ]]
1009    then
1010       cat > $job_to_send << %%END%%
1011#!/bin/ksh
1012#PBS -N $job_name
1013#PBS -l walltime=$timestring
1014#PBS -l ncpus=$numprocs
1015#PBS -l pmem=${memory}mb
1016#PBS -o $remote_dayfile
1017#PBS -j oe
1018
1019%%END%%
1020
1021    else
1022       cat > $job_to_send << %%END%%
1023#!/bin/ksh
1024#PBS -N $job_name
1025#PBS -l walltime=$timestring
1026#PBS -l ncpus=1
1027#PBS -l pmem=${memory}mb
1028#PBS -o $remote_dayfile
1029#PBS -j oe
1030
1031%%END%%
1032
1033    fi
1034
[181]1035 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
[179]1036 then
1037
[376]1038    if [[ "$sgi_feature" != "" ]]
1039    then
1040       feature_directive="#PBS -l feature=$sgi_feature"
1041    else
1042       feature_directive=""
1043    fi
[799]1044
[416]1045    if [[ $queue = dataq || $queue = permq ]]
[399]1046    then
1047       feature_directive="#PBS -l feature=data"
1048    fi
[376]1049
[789]1050    if [[ $queue = testq  || $queue = mediumq  ||  $queue = bigq  ||  $queue = workq  ||  $queue = dataq  ||  $queue = permq ||  $queue = serialq  ||  $queue = special1q ]]
[191]1051    then
1052       queue_directive="#PBS -q $queue"
1053    else
1054       queue_directive=""
1055    fi
1056
[352]1057    if [[ $email_notification = none ]]
1058    then
1059       email_directive=""
1060    else
1061       email_directive="#PBS -M $email_notification"
1062    fi
1063
[179]1064    if [[ $numprocs != 0 ]]
1065    then
1066       cat > $job_to_send << %%END%%
[181]1067#!/bin/bash
[179]1068#PBS -N $job_name
1069#PBS -l walltime=$timestring
[622]1070#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
[181]1071#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
[179]1072#PBS -o $remote_dayfile
1073#PBS -j oe
[376]1074$feature_directive
[191]1075$queue_directive
[352]1076$email_directive
[179]1077
[622]1078eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
1079#. /usr/share/modules/init/bash
[892]1080$init_cmds
[493]1081$module_calls
[374]1082
[181]1083echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
[179]1084
1085%%END%%
1086
1087    else
1088       cat > $job_to_send << %%END%%
1089#PBS -S /bin/bash
1090#PBS -N $job_name
1091#PBS -l walltime=$timestring
1092#PBS -l ncpus=1
1093#PBS -o $remote_dayfile
[475]1094#PBS -j oe
[400]1095$queue_directive
1096$email_directive
[179]1097
[622]1098eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
1099#. /usr/share/modules/init/bash
[892]1100$init_cmds
[493]1101$module_calls
[475]1102
[179]1103%%END%%
1104
1105    fi
1106
[892]1107 elif [[ $remote_host = lcxe6 ]]
[164]1108 then
1109
1110    if [[ $numprocs != 0 ]]
1111    then
1112       cat > $job_to_send << %%END%%
[799]1113#!/bin/ksh
[164]1114#PBS -S /bin/ksh
1115#PBS -N $job_name
[552]1116#PBS -A $project_account
[206]1117#PBS -j oe
[164]1118#PBS -l walltime=$timestring
1119#PBS -l mppwidth=${numprocs}
[622]1120#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
[164]1121#PBS -m abe
1122#PBS -o $remote_dayfile
[492]1123$email_directive
[164]1124
[892]1125$init_cmds
[493]1126$module_calls
[343]1127
[164]1128%%END%%
1129
[108]1130    else
1131       cat > $job_to_send << %%END%%
1132#!/bin/ksh
[168]1133#PBS -S /bin/ksh
[108]1134#PBS -N $job_name
[552]1135#PBS -A $project_account
[206]1136#PBS -j oe
[108]1137#PBS -l walltime=$timestring
1138#PBS -l ncpus=1
1139#PBS -l pmem=${memory}mb
1140#PBS -m abe
[492]1141$email_directive
[108]1142#PBS -o $remote_dayfile
1143
[892]1144$init_cmds
[493]1145$module_calls
[343]1146
[108]1147%%END%%
1148
1149    fi
1150
[440]1151 elif [[ $remote_host = lckyoto ]]
[437]1152 then
1153
[440]1154       cat > $job_to_send << %%END%%
[799]1155#!/bin/ksh
[440]1156# @\$-o $remote_dayfile
1157# @\$-eo -oi
1158# @\$-lP 16
[799]1159# @\$-lp 1
[440]1160# @\$-lm 28gb  -llm unlimited -ls unlimited
1161# @\$-q $queue
1162# @\$-Pvn abs_pack
1163##for intel? @\$-Pvn abs_unpack -Pvs unpack -Pvc unpack
1164#. /thin/local/etc/setprofile/intel-11.0.sh
1165#. /thin/local/etc/setprofile/mvapich2-1.4+intel-11.0.sh
1166. ~/.myprofile
1167#. /home2/t/t51254/palm/current_version/myprofile
1168#. /thin/apps/pgi/mpi.sh
1169#
1170env
1171#
1172set -x
1173
1174%%END%%
1175
1176 elif [[ $remote_host = lcxt5m ]]
1177 then
1178
[437]1179    if [[ $numprocs != 0 ]]
1180    then
1181       cat > $job_to_send << %%END%%
[799]1182#!/bin/ksh
[437]1183#PBS -S /bin/ksh
1184#PBS -N $job_name
1185#PBS -j oe
1186#PBS -l walltime=$timestring
1187#PBS -l mppwidth=${numprocs}
[622]1188#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
[437]1189#PBS -m abe
1190#PBS -o $remote_dayfile
1191
[892]1192$init_cmds
[493]1193$module_calls
[437]1194
1195%%END%%
1196
1197    else
1198       cat > $job_to_send << %%END%%
1199#!/bin/ksh
1200#PBS -S /bin/ksh
1201#PBS -N $job_name
1202#PBS -j oe
1203#PBS -l walltime=$timestring
1204#PBS -l ncpus=1
1205#PBS -l pmem=${memory}mb
1206#PBS -m abe
1207#PBS -o $remote_dayfile
1208
[892]1209$init_cmds
[493]1210$module_calls
[437]1211
1212%%END%%
1213
1214    fi
1215
[1099]1216 elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1217 then
1218    cat > $job_to_send << %%END%%
1219#!/bin/bash
1220#PJM -L "rscgrp=$queue"
1221#PJM -L "node=$nodes"
1222#PJM --mpi "proc=$numprocs"
1223#PJM -L "elapse=$timestring"
1224#PJM -o $remote_dayfile
1225#PJM -j
1226#PJM -X
1227#PJM --no-stging
1228
1229export LANG=en_US.UTF-8
1230%%END%%
1231
[1090]1232 elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1233 then
1234    cat > $job_to_send << %%END%%
1235#!/bin/bash
[1099]1236#PJM -L "rscgrp=$queue"
[1090]1237#PJM -L "vnode=$numprocs"
1238#PJM -L "vnode-core=1"
1239#PJM -L "elapse=$timestring"
1240#PJM --mpi proc=$numprocs
1241#PJM -o $remote_dayfile
1242#PJM -j
[1099]1243#PJM -X
1244#PJM --no-stging
[1090]1245
1246export LANG=en_US.UTF-8
1247%%END%%
1248
[1]1249 elif [[ $remote_host = nech ]]
1250 then
1251
1252    if (( nodes > 1 ))
1253    then
1254       cat > $job_to_send << %%END%%
1255#!/bin/ksh
[622]1256#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
[1]1257#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1258#PBS -b $nodes
1259#PBS -o $remote_dayfile
1260#PBS -N palm
1261#PBS -j o
1262#PBS -T mpisx
1263
1264%%END%%
1265
1266    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1267    then
1268       cat > $job_to_send << %%END%%
1269#!/bin/ksh
[622]1270#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
[1]1271#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1272#PBS -o $remote_dayfile
1273#PBS -N palm
1274#PBS -j o
1275
1276%%END%%
1277
1278    else
1279       cat > $job_to_send << %%END%%
1280#!/bin/ksh
1281#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
1282#PBS -o $remote_dayfile
1283#PBS -j o
1284
1285%%END%%
1286
1287    fi
1288
[251]1289 elif [[ $remote_host = necriam ]]
[35]1290 then
1291
1292    if (( nodes > 1 ))
1293    then
1294       cat > $job_to_send << %%END%%
1295#!/bin/ksh
1296#PBS -b $nodes
1297#PBS -o $remote_dayfile
[253]1298#PBS -N $job_name
[35]1299#PBS -j o
[251]1300#PBS -v MPIPROGINV=YES
[35]1301
1302%%END%%
1303
1304    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1305    then
1306       cat > $job_to_send << %%END%%
1307#!/bin/ksh
1308#PBS -q ${queue}
1309#PBS -o $remote_dayfile
[253]1310#PBS -N $job_name
[35]1311#PBS -j o
[251]1312#PBS -v MPIPROGINV=YES
[35]1313
1314%%END%%
1315
1316    else
1317       cat > $job_to_send << %%END%%
1318#!/bin/ksh
1319#PBS -o $remote_dayfile
1320#PBS -j o
1321
1322%%END%%
1323
1324    fi
1325
[1]1326 elif [[ $remote_host = lctit ]]
1327 then
1328    cat > $job_to_send << %%END%%
[635]1329#!/bin/ksh
[892]1330$init_cmds
[678]1331$module_calls
1332
[1]1333%%END%%
1334
1335       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
[678]1336    if [[ $tasks_per_node != $processes_per_node ]]
1337    then
1338       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1339    else
1340       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -l place=scatter -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1341    fi
[1]1342
1343 else
1344
1345    cat > $job_to_send << %%END%%
1346# @\$-q ${queue}
1347# @\$-l${qsubtime} $timestring
1348# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
1349# @\$-o $remote_dayfile
1350# @\$-eo
1351
1352%%END%%
1353
1354 fi
1355
1356
1357    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
1358    # BEI EXIT VERANLASSEN
1359    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
1360    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
1361 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
1362 then
1363    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
1364    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
1365    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
[1274]1366    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $remote_host = lccrayb  ||  $remote_host = lccrayh  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lcflow  ||  $remote_host = lckiaps  ||  $remote_host = lckyu* ]]
[1]1367    then
[622]1368       if [[ $remote_host = ibmh ]]
[1]1369       then
1370          return_queue=c1
[693]1371       elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
1372       then
1373          return_queue=class.1-2
[622]1374       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1375       then
1376          return_queue=sdbg2
[1]1377       elif [[ $remote_host = ibms ]]
1378       then
1379          return_queue=p_normal
1380       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
1381       then
1382          return_queue=serial
[325]1383       elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
1384       then
[326]1385          return_queue=serialq
[251]1386       elif [[ $remote_host = necriam ]]
[1]1387       then
[253]1388          return_queue=SP
[1274]1389       elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
[1255]1390       then
1391          return_queue=dataq
[1040]1392       elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
1393       then
1394          return_queue=express
[1099]1395       elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1396       then
1397          return_queue=cx-single
[1090]1398       elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1399       then
1400          return_queue=cx-single
[1]1401       else
1402          return_queue=unknown
1403       fi
1404
1405       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1406       then
1407
[622]1408          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1409          then
1410             echo "echo \"#!/usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1411             echo "echo \"# @ shell = /usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1412          else
1413             echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1414          fi
[1]1415          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1416          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1417          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1418          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
1419          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1420          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
[312]1421          if [[ $host != "ibmh" ]]
1422          then
1423             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1424          fi
[1]1425          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1426          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
1427
1428          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1429          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
1430
1431          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
[1094]1432          echo "echo \"batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
[622]1433          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1434          then
1435             echo "echo \"rm  scpjob.$kennung\" >> scpjob.$kennung"   >>  $job_to_send
1436          fi
[1]1437          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
1438
1439       elif [[ $remote_host = nech ]]
1440       then
1441          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
1442          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1443          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
1444          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1445          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1446          echo " "                                 >>  $job_to_send
1447          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1448          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
[1094]1449          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[1]1450          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1451          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1452
[251]1453       elif [[ $remote_host = necriam ]]
[35]1454       then
1455          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1456          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
1457          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1458          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1459          echo " "                                 >>  $job_to_send
1460          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1461          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[35]1462          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1463          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1464
[1099]1465       elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1466       then
1467          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1468          echo "#!/bin/bash"                       >>  $job_to_send
1469          echo "#PJM -L \"node=1\""                >>  $job_to_send
1470          echo "#PJM -L \"rscgrp=$return_queue\""  >>  $job_to_send
1471          echo "#PJM --no-stging"                  >>  $job_to_send
1472          echo "#PJM -L \"elapse=30:00\""          >>  $job_to_send
1473          echo "#PJM -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1474          echo "#PJM -j"                           >>  $job_to_send
1475          echo " "                                 >>  $job_to_send
1476          echo "export LANG=en_US.UTF-8"           >>  $job_to_send
1477          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1478          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1479          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1480          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1481
[1090]1482       elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1483       then
1484          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1485          echo "#!/bin/bash"                       >>  $job_to_send
1486          echo "#PJM -L \"vnode=1\""               >>  $job_to_send
1487          echo "#PJM -L \"rscgrp=$return_queue\""  >>  $job_to_send
1488          echo "#PJM --no-stging"                  >>  $job_to_send
1489          echo "#PJM -L \"elapse=30:00\""          >>  $job_to_send
1490          echo "#PJM -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1491          echo "#PJM -j"                           >>  $job_to_send
1492          echo " "                                 >>  $job_to_send
1493          echo "export LANG=en_US.UTF-8"           >>  $job_to_send
1494          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1495          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[1090]1496          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1497          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1498
[181]1499       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1500       then
1501          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1502          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1503          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
[325]1504          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
[181]1505          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
[366]1506          echo "#PBS -l feature=data"                    >>  $job_to_send
[181]1507          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1508          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
1509          echo " "                                 >>  $job_to_send
1510          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
1511          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1512          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[181]1513          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1514          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1515
[1274]1516       elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
[1255]1517       then
1518          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"        >>  $job_to_send
1519          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1520          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
1521          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
[1262]1522          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
[1255]1523          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1524          echo "#PBS -j oe"                              >>  $job_to_send
1525          echo " "                                       >>  $job_to_send
1526          echo "set -x"                                  >>  $job_to_send
1527          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1528          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1529          echo "%%END%%"                                 >>  $job_to_send
1530
[1099]1531       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1532       then
1533          echo "cat > scpjob.${kennung}.tmp << %%END%%"                  >>  $job_to_send
1534          echo "#!/bin/bash"                                             >>  $job_to_send
1535          echo "SGEPREFIX -S /bin/bash"                                  >>  $job_to_send
1536          echo "SGEPREFIX -N transfer_$job_name"                         >>  $job_to_send
1537          echo "SGEPREFIX -cwd"                                          >>  $job_to_send
1538          echo "SGEPREFIX -l h_rt=01:00:00"                              >>  $job_to_send
[1202]1539          echo "SGEPREFIX -l h_vmem=500M"                                >>  $job_to_send
1540          echo "SGEPREFIX -l excl_flow=false"                            >>  $job_to_send
[1099]1541          echo "SGEPREFIX -j y"                                          >>  $job_to_send
1542          echo "SGEPREFIX -o ${local_host}_${job_name}_scpjob_$kennung"  >>  $job_to_send 
1543          echo " "                                                       >>  $job_to_send 
1544          echo "set -x"                                                  >>  $job_to_send 
1545          echo "export PALM_BIN=$PALM_BIN" | sed -e 's:'$HOME':$HOME:'   >>  $job_to_send
1546          echo "export PATH=\$PATH:\$PALM_BIN"                           >>  $job_to_send
1547          echo ""                                 >>  $job_to_send         
1548          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1549          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1550          echo "rm -f scpjob.${kennung}"                                 >>  $job_to_send         
1551          echo "%%END%%"                                                 >>  $job_to_send
1552          echo "sed -e 's/SGEPREFIX/#$/g' scpjob.${kennung}.tmp > scpjob.${kennung}" >>  $job_to_send         
1553          echo "rm -f scpjob.${kennung}.tmp"                             >>  $job_to_send         
1554
[1]1555       else
1556
1557          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1558          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1559          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1560          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1561          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1562          then
1563             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1564          fi
1565          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1566#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1567          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1568          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1569          echo " "                                 >>  $job_to_send
1570          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1571          then
1572             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1573             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1574          fi
1575          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1576          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
[1]1577          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1578          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1579       fi
1580
1581       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1582       then
1583          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
[1274]1584       elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
[1255]1585       then
[1266]1586          echo "msub -q $return_queue  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
[181]1587       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1588       then
[748]1589          echo "rm -rf \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1590          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"                         >>  $job_to_send
1591          echo "msub  scpjob.$kennung"                               >>  $job_to_send
[1]1592       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1593       then
1594          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1595       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1596       then
1597          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
[1043]1598       elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
1599       then
1600          echo "mv  scpjob.$kennung  $job_catalog"           >>  $job_to_send
[1094]1601          echo "ssh $SSH_PORTOPT ${remote_username}@${remote_addres}  \"$submcom ${job_catalog}/scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
[1043]1602          echo "rm  ${job_catalog}/scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
[1099]1603       elif [[ $remote_host = lckyu* ]]
[1090]1604       then
[1094]1605          echo "scp $PORTOPT scpjob.$kennung  ${remote_username}@${remote_addres}:job_queue"           >>  $job_to_send
1606          echo "ssh $SSH_PORTOPT ${remote_username}@${remote_addres}  \"cd job_queue; $submcom scpjob.$kennung; rm scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
[1099]1607       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1608       then
1609          echo "mv  scpjob.$kennung  $job_catalog"           >>  $job_to_send
[1202]1610          echo "/usr/bin/ssh ${remote_username}@${remote_addres}  \"$init_cmds $module_calls cd $job_catalog; $submcom scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
[1]1611       else
[1040]1612          echo "$submcom  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
[1]1613       fi
[1043]1614       if [[ $remote_host != ibmku  &&  $remote_host != lckiaps ]]
[622]1615       then
1616          echo "rm  scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1617       fi
[1]1618       if [[ $remote_host = nech ]]
1619       then
1620          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1621       fi
1622    else
1623#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1624       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1625    fi
1626    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1627    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1628    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1629 fi
1630
1631
1632
1633    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1634 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
[69]1635
[1]1636 if [[ $remote_host = ibm ]]
1637 then
1638    echo " "         >>  $job_to_send
1639    echo "exit"      >>  $job_to_send
1640 fi
[635]1641
1642    # remove job file
[1099]1643 if [[ $remote_host = lctit  ||  $remote_host = ibmku  ||  $remote_host = lcflow ]]
[69]1644 then
1645    echo " "                               >>  $job_to_send
1646    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1647 fi
[1]1648
1649
1650
1651    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1652 if [[ -z $remote_user ]]
1653 then
1654    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1655    then
1656       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1657    fi
1658 fi
1659
1660
1661
1662    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1663 if [[ $no_submit = false ]]
1664 then
1665    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1666    then
1667       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
[82]1668       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
[1]1669       then
[82]1670          job_catalog_save=$job_catalog
1671          job_catalog=job_queue
1672       elif [[ $remote_host = nech ]]
1673       then
1674          job_catalog_save=$job_catalog
1675          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1676       fi
[1096]1677       if [[ $remote_host = nech ]]
[82]1678       then
1679             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1680             # TRANSFERIERT WERDEN
[1094]1681          scp  $PORTOPT  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1682       else
[1094]1683          scp  $PORTOPT  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1684       fi
[82]1685       if [[ $? = 1 ]]
1686       then
1687          locat=scp; exit
1688       fi
1689       if [[ $remote_host = ibms ]]
1690       then
1691          job_catalog=$job_catalog_save
1692       fi
[1]1693       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1694    else
1695       eval  job_catalog=$job_catalog
1696       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1697    fi
1698
1699
1700
1701       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1702    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1703    then
1704       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
[635]1705
1706       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  &&  $prio = true ]]
[1]1707       then
[635]1708          printf "\n >>> submit with HLRN qos-feature hiprio...\n"
[1094]1709          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom -l qos=hiprio $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
[635]1710       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1711       then
[1094]1712          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
[1099]1713       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1714       then
[1202]1715          /usr/bin/ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "$init_cmds $module_calls cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
[1]1716       else
[1094]1717          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
[82]1718       fi
[1]1719
1720       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1721    else
1722       cd  $job_catalog
[1224]1723       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $local_host | cut -c1-6) = lccray ]]
[1]1724       then
1725          eval  $submcom  $job_on_remhost
[1099]1726       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxe6  ||  $localhost = lck  || $localhost = lckordi ||  $localhost = lcyon || $localhost = lcsb  ||  $localhost = lckyu* ]]
[108]1727       then
[635]1728          chmod  u+x  $job_on_remhost
[108]1729          eval  $submcom  $job_on_remhost
[1]1730       elif [[ $local_host = nech ]]
1731       then
1732          if [[ $queue = default ]]
1733          then
[799]1734             eval  $submcom  $job_on_remhost
[1]1735          else
[799]1736             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost
[1]1737          fi
1738       else
1739          qsub  $job_on_remhost
1740       fi
[622]1741
1742          # Jobfile must not be deleted on lctit/ibmku!! This will be done
1743          # only at the end of the job.
[1099]1744       if [[ $local_host != lctit  &&  $local_host != ibmku  &&  $local_host != lcflow ]]
[622]1745       then
1746          rm  $job_on_remhost
1747       fi
[1]1748       cd  -  > /dev/null
1749    fi
1750 fi
1751
1752
1753
1754    # ABSCHLUSSARBEITEN
1755
1756 if [[ $no_submit = false ]]
1757 then
[1099]1758    rm  -f $job_to_send
[1]1759 fi
[1266]1760 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.