Ignore:
Timestamp:
Dec 9, 2020 1:08:08 PM (11 months ago)
Author:
gronemeier
Message:

add additional output paths to palm.iofiles and update configuration files accordingly

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • palm/trunk/SCRIPTS/.palm.iofiles

    r4781 r4814  
    11#$Id$
    22#
    3 #---------------------------------------------------------------------------------------------
     3#------------------------------------------------------------------------------------------------------------
    44# List of input-files
    5 #---------------------------------------------------------------------------------------------
    6 PARIN                    in:tr      d3#      $base_data/$run_identifier/INPUT          _p3d*
    7 PARIN                    in:tr      d3r      $base_data/$run_identifier/INPUT          _p3dr*
    8 PARIN                    in:tr      pcr      $base_data/$run_identifier/INPUT          _pcr*
    9 NAVIGATION_DATA          inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _nav*
    10 TOPOGRAPHY_DATA          inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _topo*
    11 PLANT_CANOPY_DATA_3D     inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _canopy*
    12 PIDS_STATIC              inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _static*
    13 PIDS_DYNAMIC             inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _dynamic*
    14 PIDS_SALSA               inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _salsa*
    15 PIDS_CHEM                inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _chemistry*
    16 PIDS_UVEM                inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _uvlookup*
    17 PIDS_VM                  inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _vmeas*
    18 PIDS_WTM                 inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _wtmpar*
    19 rrtmg_lw.nc              inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _rlw
    20 rrtmg_sw.nc              inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _rsw
    21 WTM_DATA                 inopt:tr   d3#:d3r  $base_data/$run_identifier/INPUT          _wtm
    22 BININ                    in:lnpe    d3r:rec  $fast_io_catalog/$run_identifier/RESTART  _d3d*
    23 PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:lnpe    prtr     $fast_io_catalog/$run_identifier/RESTART  _rprt
    24 SVFIN                    in:lnpe    svfin    $fast_io_catalog/$run_identifier/SVF      _svf*
    25 DATA_1D_FL_NETCDF        inopt      flr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _fl*       nc
    26 DATA_1D_PR_NETCDF        inopt      prr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _pr*       nc
    27 DATA_1D_SP_NETCDF        inopt      spr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _sp*       nc
    28 DATA_1D_TS_NETCDF        inopt      tsr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _ts*       nc
    29 DATA_1D_PTS_NETCDF       inopt      ptsr     $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _pts*      nc
    30 DATA_1D_SPTS_NETCDF      inopt      sptsr    $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _spts*     nc
    31 DATA_2D_XY_NETCDF        inopt      xyr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _xy*       nc
    32 DATA_2D_XY_AV_NETCDF     inopt      xyr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_xy*    nc
    33 DATA_2D_XZ_NETCDF        inopt      xzr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _xz*       nc
    34 DATA_2D_XZ_AV_NETCDF     inopt      xzr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_xz*    nc
    35 DATA_2D_YZ_NETCDF        inopt      yzr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _yz*       nc
    36 DATA_2D_YZ_AV_NETCDF     inopt      yzr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_yz*    nc
    37 DATA_3D_NETCDF           inopt      3dr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _3d*       nc
    38 DATA_3D_AV_NETCDF        inopt      3dr      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_3d*    nc
    39 DATA_MASK_NETCDF         inopt      mar      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _masked    nc
    40 DATA_MASK_AV_NETCDF      inopt      mar      $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_masked nc
    41 DATA_PRT_NETCDF          inopt:pe   prtr     $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _prt*
     5#------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     6PARIN                    in:tr      d3#        $base_data/$run_identifier/INPUT            _p3d*
     7PARIN                    in:tr      d3r        $base_data/$run_identifier/INPUT            _p3dr*
     8PARIN                    in:tr      pcr        $base_data/$run_identifier/INPUT            _pcr*
     9NAVIGATION_DATA          inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _nav*
     10TOPOGRAPHY_DATA          inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _topo*
     11PLANT_CANOPY_DATA_3D     inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _canopy*
     12PIDS_STATIC              inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _static*
     13PIDS_DYNAMIC             inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _dynamic*
     14PIDS_SALSA               inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _salsa*
     15PIDS_CHEM                inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _chemistry*
     16PIDS_UVEM                inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _uvlookup*
     17PIDS_VM                  inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _vmeas*
     18PIDS_WTM                 inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _wtmpar*
     19rrtmg_lw.nc              inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _rlw
     20rrtmg_sw.nc              inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _rsw
     21WTM_DATA                 inopt:tr   d3#:d3r    $base_data/$run_identifier/INPUT            _wtm
     22BININ                    in:lnpe    d3r:cyclic $restart_data_path/$run_identifier/RESTART  _d3d*
     23PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:lnpe    prtr       $restart_data_path/$run_identifier/RESTART  _rprt
     24SVFIN                    in:lnpe    svfin      $restart_data_path/$run_identifier/SVF      _svf*
     25DATA_1D_FL_NETCDF        inopt      flr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _fl*       nc
     26DATA_1D_PR_NETCDF        inopt      prr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _pr*       nc
     27DATA_1D_PTS_NETCDF       inopt      ptsr       $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _pts*      nc
     28DATA_1D_SP_NETCDF        inopt      spr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _sp*       nc
     29DATA_1D_SPTS_NETCDF      inopt      sptsr      $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _spts*     nc
     30DATA_1D_TS_NETCDF        inopt      tsr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _ts*       nc
     31DATA_2D_XY_AV_NETCDF     inopt      xyr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _av_xy*    nc
     32DATA_2D_XY_NETCDF        inopt      xyr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _xy*       nc
     33DATA_2D_XZ_AV_NETCDF     inopt      xzr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _av_xz*    nc
     34DATA_2D_XZ_NETCDF        inopt      xzr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _xz*       nc
     35DATA_2D_YZ_AV_NETCDF     inopt      yzr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _av_yz*    nc
     36DATA_2D_YZ_NETCDF        inopt      yzr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _yz*       nc
     37DATA_3D_NETCDF           inopt      3dr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _3d*       nc
     38DATA_3D_AV_NETCDF        inopt      3dr        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _av_3d*    nc
     39DATA_MASK_AV_NETCDF      inopt      mar        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _av_masked nc
     40DATA_MASK_NETCDF         inopt      mar        $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _masked    nc
     41#DATA_PRT_NETCDF          inopt:pe   prtr       $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT    _prt*      nc
    4242#
    43 #---------------------------------------------------------------------------------------------
     43#------------------------------------------------------------------------------------------------------------
    4444# List of output-files
    45 #---------------------------------------------------------------------------------------------
    46 BINOUT*                    out:lnpe restart   $fast_io_catalog/$run_identifier/RESTART  _d3d
    47 PARTICLE_RESTART_DATA_OUT* out:lnpe prt#:prtr $fast_io_catalog/$run_identifier/RESTART  _rprt
    48 SVFOUT*                    out:lnpe svfout    $fast_io_catalog/$run_identifier/SVF      _svf
     45#------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     46BINOUT*                    out:lnpe restart:pcr $restart_data_path/$run_identifier/RESTART    _d3d
     47PARTICLE_RESTART_DATA_OUT* out:lnpe prt#:prtr   $restart_data_path/$run_identifier/RESTART    _rprt
     48SVFOUT*                    out:lnpe svfout      $restart_data_path/$run_identifier/SVF        _svf
    4949#
    50 STDOUT*                    out:tr   d3#:pcr   $base_data/$run_identifier/MONITORING     _stdout
    51 STDOUT*                    out:tra  d3r       $base_data/$run_identifier/MONITORING     _stdout
    52 RUN_CONTROL*               out:tr   d3#:pcr   $base_data/$run_identifier/MONITORING     _rc
    53 RUN_CONTROL*               out:tra  d3r       $base_data/$run_identifier/MONITORING     _rc
    54 HEADER*                    out:tr   d3#:pcr   $base_data/$run_identifier/MONITORING     _header
    55 HEADER*                    out:tra  d3r       $base_data/$run_identifier/MONITORING     _header
    56 CPU_MEASURES*              out:tr   d3#:pcr   $base_data/$run_identifier/MONITORING     _cpu
    57 CPU_MEASURES*              out:tra  d3r       $base_data/$run_identifier/MONITORING     _cpu
    58 PARTICLE_INFO*             out:tr   pt#       $base_data/$run_identifier/MONITORING     _prt_info
    59 PARTICLE_INFO*             out:tra  ptr       $base_data/$run_identifier/MONITORING     _prt_info
    60 LIST_PROFIL*               out:tr   *         $base_data/$run_identifier/MONITORING     _list_pr
     50PARIN*                     out:tr   d3#:d3r:pcr $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _parin
     51STDOUT*                    out:tr   d3#:d3r:pcr $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _stdout
     52RUN_CONTROL*               out:tr   d3#:d3r:pcr $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _rc
     53HEADER*                    out:tr   d3#:d3r:pcr $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _header
     54CPU_MEASURES*              out:tr   d3#:d3r:pcr $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _cpu
     55PARTICLE_INFOS*            out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _prt_info
     56LIST_PROFIL*               out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/MONITORING  _list_pr
    6157#
    62 SURFACE_DATA_BIN*          out:lnpe *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _surf
    63 SURFACE_DATA_AV_BIN*       out:lnpe *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_surf
    64 SURFACE_DATA_NETCDF*       out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _surf      nc
    65 SURFACE_DATA_AV_NETCDF*    out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_surf   nc
    66 #
    67 DATA_1D_FL_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _fl        nc
    68 DATA_1D_PR_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _pr        nc
    69 DATA_1D_SP_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _sp        nc
    70 DATA_1D_TS_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _ts        nc
    71 DATA_1D_PTS_NETCDF*        out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _pts       nc
    72 DATA_1D_SPTS_NETCDF*       out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _spts      nc
    73 DATA_2D_XY_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _xy        nc
    74 DATA_2D_XY_AV_NETCDF*      out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_xy     nc
    75 DATA_2D_XZ_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _xz        nc
    76 DATA_2D_XZ_AV_NETCDF*      out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_xz     nc
    77 DATA_2D_YZ_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _yz        nc
    78 DATA_2D_YZ_AV_NETCDF*      out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_yz     nc
    79 DATA_3D_NETCDF*            out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _3d        nc
    80 DATA_3D_AV_NETCDF*         out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_3d     nc
    81 DATA_MASK_NETCDF*          out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _masked    nc
    82 DATA_MASK_AV_NETCDF*       out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _av_masked nc
    83 DATA_AGT_NETCDF*           out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _agt       nc
    84 VM_OUTPUT*                 out:pe   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _vm
    85 #
    86 DATA_PRT_NETCDF*           out:pe   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _prt
    87 DATA_PRT_NETCDF*           out:trpe *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _prt
    88 PARTICLE_DATA*             out:lnpe *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT         _prt_dat
    89 #
    90 DATA_1D_TS_WTM_NETCDF*     out:tr   *         $base_data/$run_identifier/OUTPUT          _wtm       nc
     58DATA_1D_FL_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _fl          nc
     59DATA_1D_PR_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _pr          nc
     60DATA_1D_PTS_NETCDF*        out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _pts         nc
     61DATA_1D_SP_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _sp          nc
     62DATA_1D_SPTS_NETCDF*       out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _spts        nc
     63DATA_1D_TS_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _ts          nc
     64DATA_1D_TS_WTM_NETCDF*     out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _wtm         nc
     65DATA_2D_XY_AV_NETCDF*      out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_xy       nc
     66DATA_2D_XY_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _xy          nc
     67DATA_2D_XZ_AV_NETCDF*      out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_xz       nc
     68DATA_2D_XZ_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _xz          nc
     69DATA_2D_YZ_AV_NETCDF*      out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_yz       nc
     70DATA_2D_YZ_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _yz          nc
     71DATA_3D_AV_NETCDF*         out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_3d       nc
     72DATA_3D_NETCDF*            out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _3d          nc
     73DATA_AGT_NETCDF*           out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _agt         nc
     74DATA_MASK_AV_NETCDF*       out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_masked   nc
     75DATA_MASK_NETCDF*          out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _masked      nc
     76#DATA_PRT_NETCDF*           out:pe   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _prt         nc
     77#DATA_PRT_NETCDF*           out:trpe *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _prt         nc
     78PARTICLE_DATA*             out:lnpe *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _prt_bin
     79SURFACE_DATA_AV_BIN*       out:lnpe *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_surf_bin
     80SURFACE_DATA_BIN*          out:lnpe *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _surf_bin
     81SURFACE_DATA_AV_NETCDF*    out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _av_surf     nc
     82SURFACE_DATA_NETCDF*       out:tr   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _surf        nc
     83VM_OUTPUT*                 out:pe   *           $output_data_path/$run_identifier/OUTPUT      _vm
     84#------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     85# Deprecated settings (will be removed in a future revision)
     86#------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     87BININ                      in:lnpe  rec         $restart_data_path/$run_identifier/RESTART  _d3d*
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.