Ignore:
Timestamp:
Oct 21, 2016 3:57:50 PM (7 years ago)
Author:
gronemeier
Message:

updated mrun.config blogs for HLRNIII

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.hlrnIII

    r1959 r2034  
    3333#
    3434# HLRN-III Hannover
    35 %tmp_user_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayh parallel
    36 %tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayh parallel
     35%tmp_user_catalog    /gfs2/tmp/<replace_by_your_HLRN-III_username>      lccrayh parallel
     36%tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>/palm_restart_data     lccrayh parallel
    3737%compiler_name       ftn                                                lccrayh parallel
    3838%compiler_name_ser   ftn                                                lccrayh parallel
    3939%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayh parallel
    4040%mopts               -j:4                                               lccrayh parallel
    41 %fopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic                    lccrayh parallel
    42 %lopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic:-dynamic           lccrayh parallel
     41%fopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic           lccrayh parallel
     42%lopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic:-dynamic  lccrayh parallel
    4343%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                lccrayh parallel
    4444%memory              2300                                               lccrayh parallel
    4545%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel   lccrayh parallel
    46 %login_init_cmd      module:swap:cray-mpich:cray-mpich/7.2.4            lccrayh parallel
     46%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                          lccrayh parallel
    4747#
    4848# HLRN-III Hannover debug/trace mode
    49 %tmp_user_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayh parallel trace
    50 %tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayh parallel trace
     49%tmp_user_catalog    /gfs2/tmp/<replace_by_your_HLRN-III_username>      lccrayh parallel trace
     50%tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>/palm_restart_data     lccrayh parallel trace
    5151%compiler_name       ftn                                                lccrayh parallel trace
    5252%compiler_name_ser   ftn                                                lccrayh parallel trace
    5353%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayh parallel trace
    5454%mopts               -j:4                                               lccrayh parallel trace
    55 %fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp             lccrayh parallel trace
    56 %lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp             lccrayh parallel trace
     55%fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc     lccrayh parallel trace
     56%lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc     lccrayh parallel trace
    5757%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                lccrayh parallel trace
    5858%memory              2300                                               lccrayh parallel trace
    5959%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel   lccrayh parallel trace
     60%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                          lccrayh parallel trace
     61#
     62# HLRN-III Hannover haswell
     63%tmp_user_catalog    /gfs2/tmp/<replace_by_your_HLRN-III_username>      lccrayh parallel has
     64%tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>/palm_restart_data     lccrayh parallel has
     65%compiler_name       ftn                                                lccrayh parallel has
     66%compiler_name_ser   ftn                                                lccrayh parallel has
     67%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayh parallel has
     68%feature             mpp2                                               lccrayh parallel has
     69%mopts               -j:4                                               lccrayh parallel has
     70%fopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic lccrayh parallel has
     71%lopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic:-dynamic   lccrayh parallel has
     72%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                lccrayh parallel has
     73%memory              2300                                               lccrayh parallel has
     74%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel:craype-haswell   lccrayh parallel has
     75%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf:craype-ivybridge         lccrayh parallel has
    6076#
    6177# HLRN-III Berlin
    62 %tmp_user_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayb parallel
    63 %tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayb parallel
     78%tmp_user_catalog    /gfs2/tmp/<replace_by_your_HLRN-III_username>      lccrayb parallel
     79%tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>/palm_restart_data     lccrayb parallel
    6480%compiler_name       ftn                                                lccrayb parallel
    6581%compiler_name_ser   ftn                                                lccrayb parallel
    6682%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayb parallel
    6783%mopts               -j:4                                               lccrayb parallel
    68 %fopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic                    lccrayb parallel
    69 %lopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic:-dynamic           lccrayb parallel
     84%fopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic           lccrayb parallel
     85%lopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic:-dynamic  lccrayb parallel
    7086%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                lccrayb parallel
    7187%memory              2300                                               lccrayb parallel
    7288%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel   lccrayb parallel
    73 %login_init_cmd      module:swap:cce:cce/8.4.0.219:module:swap:cray-mpich:cray-mpich/7.2.4                lccrayb parallel
     89%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                          lccrayb parallel
    7490#
    7591# HLRN-III Berlin debug/trace mode
    76 %tmp_user_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayb parallel trace
    77 %tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>     lccrayb parallel trace
     92%tmp_user_catalog    /gfs2/tmp/<replace_by_your_HLRN-III_username>      lccrayb parallel trace
     93%tmp_data_catalog    /gfs2/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>/palm_restart_data     lccrayb parallel trace
    7894%compiler_name       ftn                                                lccrayb parallel trace
    7995%compiler_name_ser   ftn                                                lccrayb parallel trace
    8096%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayb parallel trace
    8197%mopts               -j:4                                               lccrayb parallel trace
    82 %fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp             lccrayb parallel trace
    83 %lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp             lccrayb parallel trace
     98%fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc     lccrayb parallel trace
     99%lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc     lccrayb parallel trace
    84100%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                lccrayb parallel trace
    85101%memory              2300                                               lccrayb parallel trace
    86102%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel   lccrayb parallel trace
    87 #             
     103%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                          lccrayb parallel trace
     104#
    88105%write_binary        true                             restart
    89106#
    90107#----------------------------------------------------------------------------
    91 # INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:" 
     108# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
    92109#----------------------------------------------------------------------------
    93110#IC:
    94111IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export ATP_ENABLED=1
    95112IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_GNI_BTE_MULTI_CHANNEL=disabled
    96 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export APRUN_XFER_LIMITS=1
    97 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export APRUN_XFER_STACK_LIMIT=0
    98 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  ulimit -v unlimited
    99 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  ulimit -s unlimited
    100 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS_DISPLAY=1
    101 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_STATS=1
    102 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  E8="=8"
    103 IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS="*DATA_**:striping_factor"\$E8
     113#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export APRUN_XFER_LIMITS=1
     114#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export APRUN_XFER_STACK_LIMIT=0
     115#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  ulimit -v unlimited
     116#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  ulimit -s unlimited
     117#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS_DISPLAY=1
     118#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_STATS=1
     119#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  E8="=8"
     120#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS="*DATA_**:striping_factor"\$E8
    104121IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export ATP_ENABLED=1
    105122IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_GNI_BTE_MULTI_CHANNEL=disabled
    106 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export APRUN_XFER_LIMITS=1
    107 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export APRUN_XFER_STACK_LIMIT=0
    108 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  ulimit -v unlimited
    109 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  ulimit -s unlimited
    110 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS_DISPLAY=1
    111 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_STATS=1
    112 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  E8="=8"
    113 IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS="*DATA_**:striping_factor"\$E8
     123#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export APRUN_XFER_LIMITS=1
     124#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export APRUN_XFER_STACK_LIMIT=0
     125#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  ulimit -v unlimited
     126#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  ulimit -s unlimited
     127#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS_DISPLAY=1
     128#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_STATS=1
     129#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  E8="=8"
     130#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS="*DATA_**:striping_factor"\$E8
    114131#
    115132#----------------------------------------------------------------------------
     
    117134#----------------------------------------------------------------------------
    118135EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
    119 EC:pwd; ls -al
    120136#
    121137#----------------------------------------------------------------------------
     
    139155LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
    140156WTM_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _wtm
    141 BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
     157BININ                    in:loc:flpe   d3f:cycfill  $base_data/$fname/RESTART  _d3d
    142158PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
    143159DATA_1D_FL_NETCDF        in:locopt     flf      $base_data/$fname/OUTPUT   _fl     nc
     
    170186TURBINE_PARAMETERS04  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters04
    171187#
    172 DATA_1D_FL_NETCDF    out:loc:tr   fl#:flf   $base_data/$fname/OUTPUT  _fl     nc
    173 DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
    174 DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
    175 DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
    176 DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
    177 DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
    178 DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
    179 DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
    180 DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
    181 DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
    182 DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
    183 DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
    184 DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
     188DATA_1D_FL_NETCDF    out:loc:tr   fl#:flf   $base_data/$fname/OUTPUT  _fl      nc
     189DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
     190DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
     191DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
     192DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
     193DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy      nc
     194DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av   nc
     195DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz      nc
     196DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av   nc
     197DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz      nc
     198DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av   nc
     199DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d      nc
     200DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av   nc
    185201DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
    186202DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
     
    223239DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
    224240DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
    225 DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
    226 DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
    227 DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr 
     241DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
     242DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
     243DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
    228244#
    229245DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.