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Oct 21, 2016 3:57:50 PM (5 years ago)
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gronemeier
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updated mrun.config blogs for HLRNIII

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  • palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.forwind_hlrnIII

    r1959 r2034  
    6060%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayh parallel
    6161%mopts               -j:4                                                              lccrayh parallel
    62 %fopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic                                   lccrayh parallel
    63 %lopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic:-dynamic                          lccrayh parallel
     62%fopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic                lccrayh parallel
     63%lopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic:-dynamic       lccrayh parallel
    6464%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                               lccrayh parallel
    6565%memory              2300                                                              lccrayh parallel
    6666%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel                  lccrayh parallel
     67%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                                         lccrayh parallel
    6768#
    6869# HLRN-III Hannover debug/trace mode
     
    7374%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayh parallel trace
    7475%mopts               -j:4                                                              lccrayh parallel trace
    75 %fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp                            lccrayh parallel trace
    76 %lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp                            lccrayh parallel trace
     76%fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc                    lccrayh parallel trace
     77%lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc                    lccrayh parallel trace
    7778%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                               lccrayh parallel trace
    7879%memory              2300                                                              lccrayh parallel trace
    7980%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel                  lccrayh parallel trace
     81%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                                         lccrayh parallel trace
     82#
     83# HLRN-III Hannover haswell
     84%tmp_user_catalog    /gfs1/tmp/<replace_by_your_HLRN-III_username>      lccrayh parallel has
     85%tmp_data_catalog    /gfs1/work/<replace_by_your_HLRN-III_username>/palm_restart_data     lccrayh parallel has
     86%compiler_name       ftn                                                lccrayh parallel has
     87%compiler_name_ser   ftn                                                lccrayh parallel has
     88%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayh parallel has
     89%feature             mpp2                                               lccrayh parallel has
     90%mopts               -j:4                                               lccrayh parallel has
     91%fopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic lccrayh parallel has
     92%lopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic:-dynamic   lccrayh parallel has
     93%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                lccrayh parallel has
     94%memory              2300                                               lccrayh parallel has
     95%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel:craype-haswell   lccrayh parallel has
     96%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf:craype-ivybridge         lccrayh parallel has
    8097#
    8198# HLRN-III Berlin
     
    86103%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayb parallel
    87104%mopts               -j:4                                                              lccrayb parallel
    88 %fopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic                                   lccrayb parallel
    89 %lopts               -em:-O3:-hnoomp:-hfp3:-hdynamic:-dynamic                          lccrayb parallel
     105%fopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic                lccrayb parallel
     106%lopts               -em:-K:trap=fp:-O3:-hnoomp:-hnoacc:-hfp3:-hdynamic:-dynamic       lccrayb parallel
    90107%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                               lccrayb parallel
    91108%memory              2300                                                              lccrayb parallel
    92109%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel                  lccrayb parallel
     110%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                                         lccrayb parallel
    93111#
    94112# HLRN-III Berlin debug/trace mode
     
    99117%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__fftw   lccrayb parallel trace
    100118%mopts               -j:4                                                              lccrayb parallel trace
    101 %fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp                            lccrayb parallel trace
    102 %lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp                            lccrayb parallel trace
     119%fopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc                    lccrayb parallel trace
     120%lopts               -eD:-em:-g:-R:b:-K:trap=fp:-O0:-hnoomp:-hnoacc                    lccrayb parallel trace
    103121%remote_username     <replace_by_your_HLRN-III_username>                               lccrayb parallel trace
    104122%memory              2300                                                              lccrayb parallel trace
    105123%modules             fftw:cray-hdf5-parallel:cray-netcdf-hdf5parallel                  lccrayb parallel trace
     124%login_init_cmd      module:unload:cray-netcdf                                         lccrayb parallel trace
    106125#
    107126%write_binary                true                             restart
     
    111130#----------------------------------------------------------------------------
    112131#IC:
     132IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export ATP_ENABLED=1
     133IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_GNI_BTE_MULTI_CHANNEL=disabled
     134#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export APRUN_XFER_LIMITS=1
     135#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export APRUN_XFER_STACK_LIMIT=0
     136#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  ulimit -v unlimited
     137#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  ulimit -s unlimited
     138#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS_DISPLAY=1
     139#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_STATS=1
     140#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  E8="=8"
     141#IC:[[ \$localhost = lccrayb ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS="*DATA_**:striping_factor"\$E8
     142IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export ATP_ENABLED=1
     143IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_GNI_BTE_MULTI_CHANNEL=disabled
     144#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export APRUN_XFER_LIMITS=1
     145#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export APRUN_XFER_STACK_LIMIT=0
     146#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  ulimit -v unlimited
     147#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  ulimit -s unlimited
     148#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS_DISPLAY=1
     149#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_STATS=1
     150#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  E8="=8"
     151#IC:[[ \$localhost = lccrayh ]]  &&  export MPICH_MPIIO_HINTS="*DATA_**:striping_factor"\$E8
    113152#
    114153#----------------------------------------------------------------------------
     
    116155#----------------------------------------------------------------------------
    117156EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
    118 EC:pwd; ls -al
    119157#
    120158#----------------------------------------------------------------------------
     
    138176LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
    139177WTM_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _wtm
    140 BININ                    in:loc:flpe   d3f:rec  $base_data/$fname/RESTART   _d3d
     178BININ                    in:loc:flpe   d3f:rec:cycfill  $base_data/$fname/RESTART   _d3d
    141179PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART   _rprt
    142180DATA_1D_FL_NETCDF        in:locopt     flf      $output_data/$fname/OUTPUT  _fl     nc
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.