Changeset 191 for palm/trunk/SCRIPTS/mrun
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- Aug 27, 2008 2:34:51 PM (16 years ago)
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palm/trunk/SCRIPTS/mrun (modified) (5 diffs)
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palm/trunk/SCRIPTS/mrun
r188 r191 1114 1114 fi;; 1115 1115 (ibmy) queue=parallel;; 1116 (lcsgib) queue=bigq;; 1117 (lcsgih) queue=bigq;; 1116 1118 (lctit) queue=sla3;; 1117 1119 (nech) queue=none;; … … 1387 1389 1388 1390 1391 # SOURCE-VERZEICHNIS ZUM AUFSAMMELN DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE 1392 # ERZEUGEN. HIERHIN WERDEN SPAETER IM FALL VON BATCH-JOBS AUCH DAS MRUN- 1393 # SCRIPTS SOWIE DIE KONFIGURATIONSDATEI KOPIERT 1394 if [[ $restart_run != true ]] 1395 then 1396 rm -rf SOURCES_FOR_RUN_$fname 1397 mkdir SOURCES_FOR_RUN_$fname 1398 fi 1399 1400 1389 1401 # ALLE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE ZUSAMMENSAMMELN 1390 1402 # BEI BATCH-JOBS IST DIES NICHT NOETIG, WEIL DIE PROGRAMMTEILE BEREITS DURCH … … 1396 1408 [[ "$source_list" = LM ]] && source_list=LOCALLY_MODIFIED 1397 1409 [[ "$source_list" = WP ]] && source_list=WRITE_PERMIT 1398 1399 if [[ $restart_run != true ]]1400 then1401 rm -rf SOURCES_FOR_RUN_$fname1402 mkdir SOURCES_FOR_RUN_$fname1403 fi1404 1410 1405 1411 … … 2833 2839 if [[ $host = lcsgih || $host = lcsgib ]] 2834 2840 then 2835 # mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $ii a.out $ROPTS 2836 ulimit -s 30000 2837 ulimit -a 2838 # mpirun_rsh -hostfile $PBS_NODEFILE -np $ii OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS palm $ROPTS 2841 ulimit -s 30000 # A too large stack size causes problems 2839 2842 export MV2_NUM_PORTS=2 2840 2843 # export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3 … … 3767 3770 3768 3771 3769 # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL) 3770 # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES 3771 if [[ $do_compile = true ]] 3772 then 3773 3774 source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname 3775 3776 # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN 3777 # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE 3778 # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI) 3779 echo "mkdir SOURCES_FOR_RUN_$fname" >> $jobfile 3780 echo "export SOURCES_COMPLETE=true" >> $jobfile 3781 echo "cd SOURCES_FOR_RUN_$fname" >> $jobfile 3782 3783 for filename in $source_list 3784 do 3772 # BEREITSTELLUNG VON QUELLTEXTEN, MRUN-SCRIPTS UND KONFIGURATIONS- 3773 # DATEI FUER DEN JOB 3774 if [[ $( echo $host | cut -c1-5 ) = lcsgi ]] 3775 then 3776 3777 # KONFIGURATIONSDATEI UND MRUN_SCRIPT IN DAS SOURCE-VERZEICHNIS 3778 # KOPIEREN 3779 if [[ $restart_run != true ]] 3780 then 3781 cp $config_file $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname 3782 cp ${PALM_BIN}/$mrun_script_name $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname 3783 fi 3784 3785 # SOURCE-VERZEICHNIS VOM LOKALEN RECHNER PER SCP TRANSFERIEREN 3786 echo "set -x" >> $jobfile 3787 echo "scp -r $return_username@$return_addres:$working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname ." >> $jobfile 3788 # MRUN-SCRIPTS UND KONFIGURATIONSDATEI IN DAS AKTUELLE ARBEITS- 3789 # VERZEICHNIS VERSCHIEBEN 3790 echo "mv SOURCES_FOR_RUN_$fname/$config_file . " >> $jobfile 3791 echo "mv SOURCES_FOR_RUN_$fname/$mrun_script_name . " >> $jobfile 3792 echo "execute_mrun=true" >> $jobfile 3793 echo " " >> $jobfile 3794 3795 else 3796 3797 # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL) 3798 # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES 3799 if [[ $do_compile = true ]] 3800 then 3801 3802 source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname 3803 3804 # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN 3805 # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE 3806 # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI) 3807 echo "mkdir SOURCES_FOR_RUN_$fname" >> $jobfile 3808 echo "export SOURCES_COMPLETE=true" >> $jobfile 3809 echo "cd SOURCES_FOR_RUN_$fname" >> $jobfile 3810 3811 for filename in $source_list 3812 do 3813 # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN 3814 echo "cat > $filename << \"%END%\"" >> $jobfile 3815 cat $source_catalog/$filename >> $jobfile 3816 echo " " >> $jobfile 3817 echo "%END%" >> $jobfile 3818 echo " " >> $jobfile 3819 done 3820 3785 3821 # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN 3786 echo "cat > $filename << \"%END%\"">> $jobfile3787 cat $source_catalog/ $filename>> $jobfile3822 echo "cat > Makefile << \"%END%\"" >> $jobfile 3823 cat $source_catalog/Makefile >> $jobfile 3788 3824 echo " " >> $jobfile 3789 3825 echo "%END%" >> $jobfile 3790 3826 echo " " >> $jobfile 3791 done 3792 3827 3828 echo "cd - > /dev/null" >> $jobfile 3829 3830 fi 3831 3832 3833 # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI 3793 3834 # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN 3794 echo "cat > Makefile << \"%END%\"" >> $jobfile 3795 cat $source_catalog/Makefile >> $jobfile 3796 echo " " >> $jobfile 3797 echo "%END%" >> $jobfile 3798 echo " " >> $jobfile 3799 3800 echo "cd - > /dev/null" >> $jobfile 3801 3802 fi 3803 3804 3805 # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI 3806 # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN 3807 echo "cat > $config_file << \"%END%\"" >> $jobfile 3808 cat $config_file >> $jobfile 3809 echo "%END%" >> $jobfile 3810 echo " " >> $jobfile 3811 3812 3813 # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION 3814 # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN 3815 echo "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\"" >> $jobfile 3816 cat ${PALM_BIN}/$mrun_script_name >> $jobfile 3817 echo "%END%" >> $jobfile 3818 if [[ $host = lctit ]] 3819 then 3820 echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >> $jobfile 3821 echo "mv mrun_new $mrun_script_name" >> $jobfile 3822 fi 3823 echo "chmod u+x $mrun_script_name" >> $jobfile 3824 echo "execute_mrun=true" >> $jobfile 3825 echo " " >> $jobfile 3835 echo "cat > $config_file << \"%END%\"" >> $jobfile 3836 cat $config_file >> $jobfile 3837 echo "%END%" >> $jobfile 3838 echo " " >> $jobfile 3839 3840 3841 # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION 3842 # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN 3843 echo "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\"" >> $jobfile 3844 cat ${PALM_BIN}/$mrun_script_name >> $jobfile 3845 echo "%END%" >> $jobfile 3846 if [[ $host = lctit ]] 3847 then 3848 echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >> $jobfile 3849 echo "mv mrun_new $mrun_script_name" >> $jobfile 3850 fi 3851 echo "chmod u+x $mrun_script_name" >> $jobfile 3852 echo "execute_mrun=true" >> $jobfile 3853 echo " " >> $jobfile 3854 3855 fi 3856 3826 3857 3827 3858 # EVTL. BENOETIGTE INPUT-DATEIEN PER FTP HOLEN ODER DEM JOB DIREKT
Note: See TracChangeset
for help on using the changeset viewer.
