Ignore:
Timestamp:
Jul 10, 2013 4:22:07 PM (11 years ago)
Author:
witha
Message:

script adjustments for Forwind cluster (lcflow)

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.forwind

    r1152 r1202  
    1010# by "/iwes/" if your user directory resides in /iwes/.
    1111################################################################################
    12 %output_data       /data/work/fw/<REPLACE BY YOUR USERNAME>/palm/current_version/JOBS
     12%output_data       /data/work/gpfs/fw/<REPLACE BY YOUR USERNAME>/palm/current_version/JOBS
    1313%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
    1414%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
     
    6666################################################################################
    6767%remote_username   <USERNAME_FLOW>                                                                                               lcflow parallel
    68 %tmp_user_catalog  /data/work/fw/$remote_username/tmp                                                                            lcflow parallel
    69 %tmp_data_catalog  /data/work/fw/$remote_username/palm_restart_data                                                              lcflow parallel
     68%tmp_user_catalog  /data/work/gpfs/fw/$remote_username/tmp                                                                            lcflow parallel
     69%tmp_data_catalog  /data/work/gpfs/fw/$remote_username/palm_restart_data                                                              lcflow parallel
    7070%compiler_name     mpiifort                                                                                                      lcflow parallel
    7171%compiler_name_ser ifort                                                                                                         lcflow parallel
     
    7777%lopts             -xhost:-O3:-fpp:-r8:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-static-intel:-Wl,-rpath:/cm/shared/apps/intel/ics-2011.0.013/composerxe-2011.0.084/compiler/lib/intel64          lcflow parallel
    7878%login_init_cmd    .:/etc/bashrc                     lcflow parallel
    79 %modules           sge/6.2u5p2:netcdf/4.2.1.1/intel/64/2011.0.013:netcdf-fortran/4.2/intel/64/2011.0.013:intel/ics/64/2011.0.013:intel/impi/64/4.0.1.007:hdf5/1.8.9/intel/64/2011.0.013:qt4     lcflow parallel
     79%modules           sge/6.2u5p2:netcdf/4.2.1.1/intel/64/2011.0.013:netcdf-fortran/4.2/intel/64/2011.0.013:intel/ics/64/2011.0.013:intel/impi/64/4.1.0.024:hdf5/1.8.9/intel/64/2011.0.013:qt4     lcflow parallel
    8080%disc_space        50                                                                                                            lcflow parallel
    8181#
     
    108108# List of input-files
    109109#----------------------------------------------------------------------------
    110 PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
    111 PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
    112 TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
    113 BININ                    in:loc:flpe   d3f:rec  $base_data/$fname/RESTART  _d3d
    114 PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
    115 DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $output_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
    116 DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $output_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
    117 DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $output_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
    118 DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $output_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
    119 DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $output_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
    120 DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $output_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
    121 DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $output_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
    122 DATA_2D_XZ_AV_NETCDF     in:locopt     xzf      $output_data/$fname/OUTPUT   _xz_av  nc
    123 DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $output_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
    124 DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $output_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
    125 DATA_3D_AV_NETCDF        in:locopt     3df      $output_data/$fname/OUTPUT   _3d_av  nc
    126 DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $output_data/$fname/OUTPUT   _prt
     110PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT     _p3d
     111PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT     _p3df
     112TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT     _topo
     113BININ                    in:loc:flpe   d3f:rec  $base_data/$fname/RESTART   _d3d
     114PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART   _rprt
     115DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $output_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
     116DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $output_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
     117DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $output_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
     118DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $output_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
     119DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
     120DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
     121DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
     122DATA_2D_XZ_AV_NETCDF     in:locopt     xzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
     123DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
     124DATA_2D_YZ_AV_NETCDF     in:locopt     yzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
     125DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $output_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
     126DATA_3D_AV_NETCDF        in:locopt     3df      $output_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
     127DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $output_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
    127128#
    128129#----------------------------------------------------------------------------
     
    139140CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
    140141#
    141 DATA_1D_PR_NETCDF      out:loc    pr#       $output_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
    142 DATA_1D_PR_NETCDF      out:loc    prf       $output_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
    143 DATA_1D_SP_NETCDF      out:loc    sp#       $output_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
    144 DATA_1D_SP_NETCDF      out:loc    spf       $output_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
    145 DATA_1D_TS_NETCDF      out:loc    ts#       $output_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
    146 DATA_1D_TS_NETCDF      out:loc    tsf       $output_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
    147 DATA_1D_PTS_NETCDF     out:loc    pts#      $output_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
    148 DATA_1D_PTS_NETCDF     out:loc    ptsf      $output_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
    149 DATA_2D_XY_NETCDF      out:loc    xy#:xyf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
    150 DATA_2D_XY_AV_NETCDF   out:loc    xy#:xyf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
    151 DATA_2D_XZ_NETCDF      out:loc    xz#:xzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
    152 DATA_2D_XZ_AV_NETCDF   out:loc    xz#:xzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
    153 DATA_2D_YZ_NETCDF      out:loc    yz#:yzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
    154 DATA_2D_YZ_AV_NETCDF   out:loc    yz#:yzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
    155 DATA_3D_NETCDF         out:loc    3d#:3df   $output_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
    156 DATA_3D_AV_NETCDF      out:loc    3d#:3df   $output_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
     142DATA_1D_PR_NETCDF      out:loc    pr#       $output_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
     143DATA_1D_PR_NETCDF      out:loc    prf       $output_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
     144DATA_1D_SP_NETCDF      out:loc    sp#       $output_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
     145DATA_1D_SP_NETCDF      out:loc    spf       $output_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
     146DATA_1D_TS_NETCDF      out:loc    ts#       $output_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
     147DATA_1D_TS_NETCDF      out:loc    tsf       $output_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
     148DATA_1D_PTS_NETCDF     out:loc    pts#      $output_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
     149DATA_1D_PTS_NETCDF     out:loc    ptsf      $output_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
     150DATA_2D_XY_NETCDF      out:loc    xy#:xyf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xy      nc
     151DATA_2D_XY_AV_NETCDF   out:loc    xy#:xyf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xy_av   nc
     152DATA_2D_XZ_NETCDF      out:loc    xz#:xzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xz      nc
     153DATA_2D_XZ_AV_NETCDF   out:loc    xz#:xzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xz_av   nc
     154DATA_2D_YZ_NETCDF      out:loc    yz#:yzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _yz      nc
     155DATA_2D_YZ_AV_NETCDF   out:loc    yz#:yzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _yz_av   nc
     156DATA_3D_NETCDF         out:loc    3d#:3df   $output_data/$fname/OUTPUT  _3d      nc
     157DATA_3D_AV_NETCDF      out:loc    3d#:3df   $output_data/$fname/OUTPUT  _3d_av   nc
    157158DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
    158159DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
     
    195196DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
    196197DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
    197 DATA_PRT_NETCDF        out:loc:pe prt#:prtf $output_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
    198 DATA_PRT_NETCDF        out:loc:pe prt#:prtf $output_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
     198DATA_PRT_NETCDF        out:loc:pe prt#:prtf $output_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
    199199DATA_DVR               out:loc:pe dvr       $output_data/$fname/OUTPUT  _dvr
    200200#
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.