source: palm/trunk/SOURCE/lpm_init.f90 @ 2156

Last change on this file since 2156 was 2123, checked in by hoffmann, 8 years ago

last commit documented

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 43.8 KB
Line 
1!> @file lpm_init.f90
2!------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of PALM.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
17! Copyright 1997-2017 Leibniz Universitaet Hannover
18!------------------------------------------------------------------------------!
19!
20! Current revisions:
21! -----------------
22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: lpm_init.f90 2123 2017-01-18 12:34:59Z hoffmann $
27!
28! 2122 2017-01-18 12:22:54Z hoffmann
29! Improved initialization of equilibrium aerosol radii
30! Calculation of particle ID
31!
32! 2000 2016-08-20 18:09:15Z knoop
33! Forced header and separation lines into 80 columns
34!
35! 2016-06-09 16:25:25Z suehring
36! Bugfix in determining initial particle height and grid index in case of
37! seed_follows_topography.
38! Bugfix concerning random positions, ensure that particles do not move more
39! than one grid length.
40! Bugfix logarithmic interpolation.
41! Initial setting of sgs_wf_part.
42!
43! 1890 2016-04-22 08:52:11Z hoffmann
44! Initialization of aerosol equilibrium radius not possible in supersaturated
45! environments. Therefore, a maximum supersaturation of -1 % is assumed during
46! initialization.
47!
48! 1873 2016-04-18 14:50:06Z maronga
49! Module renamed (removed _mod
50!
51! 1871 2016-04-15 11:46:09Z hoffmann
52! Initialization of aerosols added.
53!
54! 1850 2016-04-08 13:29:27Z maronga
55! Module renamed
56!
57! 1831 2016-04-07 13:15:51Z hoffmann
58! curvature_solution_effects moved to particle_attributes
59!
60! 1822 2016-04-07 07:49:42Z hoffmann
61! Unused variables removed.
62!
63! 1783 2016-03-06 18:36:17Z raasch
64! netcdf module added
65!
66! 1725 2015-11-17 13:01:51Z hoffmann
67! Bugfix: Processor-dependent seed for random function is generated before it is
68! used.
69!
70! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
71! Renamed prandtl_layer to constant_flux_layer.
72!
73! 1685 2015-10-08 07:32:13Z raasch
74! bugfix concerning vertical index offset in case of ocean
75!
76! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
77! Code annotations made doxygen readable
78!
79! 1575 2015-03-27 09:56:27Z raasch
80! initial vertical particle position is allowed to follow the topography
81!
82! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
83! New particle structure integrated.
84! Kind definition added to all floating point numbers.
85! lpm_init changed form a subroutine to a module.
86!
87! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
88! -netcdf_output
89!
90! 1322 2014-03-20 16:38:49Z raasch
91! REAL functions provided with KIND-attribute
92!
93! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
94! ONLY-attribute added to USE-statements,
95! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
96! kinds are defined in new module kinds,
97! revision history before 2012 removed,
98! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
99! all variable declaration statements
100! bugfix: #if defined( __parallel ) added
101!
102! 1314 2014-03-14 18:25:17Z suehring
103! Vertical logarithmic interpolation of horizontal particle speed for particles
104! between roughness height and first vertical grid level.
105!
106! 1092 2013-02-02 11:24:22Z raasch
107! unused variables removed
108!
109! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
110! code put under GPL (PALM 3.9)
111!
112! 849 2012-03-15 10:35:09Z raasch
113! routine renamed: init_particles -> lpm_init
114! de_dx, de_dy, de_dz are allocated here (instead of automatic arrays in
115! advec_particles),
116! sort_particles renamed lpm_sort_arrays, user_init_particles renamed lpm_init
117!
118! 828 2012-02-21 12:00:36Z raasch
119! call of init_kernels, particle feature color renamed class
120!
121! 824 2012-02-17 09:09:57Z raasch
122! particle attributes speed_x|y|z_sgs renamed rvar1|2|3,
123! array particles implemented as pointer
124!
125! 667 2010-12-23 12:06:00Z suehring/gryschka
126! nxl-1, nxr+1, nys-1, nyn+1 replaced by nxlg, nxrg, nysg, nyng for allocation
127! of arrays.
128!
129! Revision 1.1  1999/11/25 16:22:38  raasch
130! Initial revision
131!
132!
133! Description:
134! ------------
135!> This routine initializes a set of particles and their attributes (position,
136!> radius, ..) which are used by the Lagrangian particle model (see lpm).
137!------------------------------------------------------------------------------!
138 MODULE lpm_init_mod
139 
140
141    USE arrays_3d,                                                             &
142        ONLY:  de_dx, de_dy, de_dz, zu, zw, z0
143
144    USE control_parameters,                                                    &
145        ONLY:  cloud_droplets, constant_flux_layer, current_timestep_number,   &
146               dz, initializing_actions, message_string, ocean, simulated_time
147
148    USE grid_variables,                                                        &
149        ONLY:  ddx, dx, ddy, dy
150
151    USE indices,                                                               &
152        ONLY:  nx, nxl, nxlg, nxrg, nxr, ny, nyn, nys, nyng, nysg, nz, nzb,    &
153               nzb_w_inner, nzt
154
155    USE kinds
156
157    USE lpm_collision_kernels_mod,                                             &
158        ONLY:  init_kernels
159
160    USE netcdf_interface,                                                      &
161        ONLY:  netcdf_data_format
162
163    USE particle_attributes,                                                   &
164        ONLY:   alloc_factor, bc_par_b, bc_par_lr, bc_par_ns, bc_par_t,        &
165                block_offset, block_offset_def, collision_kernel,              &
166                curvature_solution_effects,                                    &
167                density_ratio, grid_particles,                                 &
168                initial_weighting_factor, ibc_par_b, ibc_par_lr, ibc_par_ns,   &
169                ibc_par_t, iran_part, log_z_z0,                                &
170                max_number_of_particle_groups, maximum_number_of_particles,    &
171                min_nr_particle, mpi_particle_type,                            &
172                number_of_particles,                                           &
173                number_of_particle_groups, number_of_sublayers,                &
174                offset_ocean_nzt, offset_ocean_nzt_m1,                         &
175                particles, particle_advection_start, particle_groups,          &
176                particle_groups_type, particles_per_point,                     &
177                particle_type, pdx, pdy, pdz,                                  &
178                prt_count, psb, psl, psn, psr, pss, pst,                       &
179                radius, random_start_position, read_particles_from_restartfile,&
180                seed_follows_topography, sgs_wf_part, sort_count,              &
181                total_number_of_particles,                                     &
182                use_sgs_for_particles,                                         &
183                write_particle_statistics, uniform_particles, zero_particle,   &
184                z0_av_global
185
186    USE pegrid
187
188    USE random_function_mod,                                                   &
189        ONLY:  random_function
190
191    IMPLICIT NONE
192
193    PRIVATE
194
195    INTEGER(iwp), PARAMETER         :: PHASE_INIT    = 1  !<
196    INTEGER(iwp), PARAMETER, PUBLIC :: PHASE_RELEASE = 2  !<
197
198    INTERFACE lpm_init
199       MODULE PROCEDURE lpm_init
200    END INTERFACE lpm_init
201
202    INTERFACE lpm_create_particle
203       MODULE PROCEDURE lpm_create_particle
204    END INTERFACE lpm_create_particle
205
206    PUBLIC lpm_init, lpm_create_particle
207
208 CONTAINS
209
210!------------------------------------------------------------------------------!
211! Description:
212! ------------
213!> @todo Missing subroutine description.
214!------------------------------------------------------------------------------!
215 SUBROUTINE lpm_init
216
217    USE lpm_collision_kernels_mod,                                             &
218        ONLY:  init_kernels
219
220    IMPLICIT NONE
221
222    INTEGER(iwp) ::  i                           !<
223    INTEGER(iwp) ::  j                           !<
224    INTEGER(iwp) ::  k                           !<
225
226#if defined( __parallel )
227    INTEGER(iwp), DIMENSION(3) ::  blocklengths  !<
228    INTEGER(iwp), DIMENSION(3) ::  displacements !<
229    INTEGER(iwp), DIMENSION(3) ::  types         !<
230#endif
231
232    REAL(wp) ::  height_int                      !<
233    REAL(wp) ::  height_p                        !<
234    REAL(wp) ::  z_p                             !<
235    REAL(wp) ::  z0_av_local                     !<
236
237#if defined( __parallel )
238!
239!-- Define MPI derived datatype for FORTRAN datatype particle_type (see module
240!-- particle_attributes). Integer length is 4 byte, Real is 8 byte
241    blocklengths(1)  = 19;  blocklengths(2)  =   6;  blocklengths(3)  =   1
242    displacements(1) =  0;  displacements(2) = 152;  displacements(3) = 176
243
244    types(1) = MPI_REAL
245    types(2) = MPI_INTEGER
246    types(3) = MPI_UB
247    CALL MPI_TYPE_STRUCT( 3, blocklengths, displacements, types, &
248                          mpi_particle_type, ierr )
249    CALL MPI_TYPE_COMMIT( mpi_particle_type, ierr )
250#endif
251
252!
253!-- In case of oceans runs, the vertical index calculations need an offset,
254!-- because otherwise the k indices will become negative
255    IF ( ocean )  THEN
256       offset_ocean_nzt    = nzt
257       offset_ocean_nzt_m1 = nzt - 1
258    ENDIF
259
260!
261!-- Define block offsets for dividing a gridcell in 8 sub cells
262
263    block_offset(0) = block_offset_def (-1,-1,-1)
264    block_offset(1) = block_offset_def (-1,-1, 0)
265    block_offset(2) = block_offset_def (-1, 0,-1)
266    block_offset(3) = block_offset_def (-1, 0, 0)
267    block_offset(4) = block_offset_def ( 0,-1,-1)
268    block_offset(5) = block_offset_def ( 0,-1, 0)
269    block_offset(6) = block_offset_def ( 0, 0,-1)
270    block_offset(7) = block_offset_def ( 0, 0, 0)
271!
272!-- Check the number of particle groups.
273    IF ( number_of_particle_groups > max_number_of_particle_groups )  THEN
274       WRITE( message_string, * ) 'max_number_of_particle_groups =',      &
275                                  max_number_of_particle_groups ,         &
276                                  '&number_of_particle_groups reset to ', &
277                                  max_number_of_particle_groups
278       CALL message( 'lpm_init', 'PA0213', 0, 1, 0, 6, 0 )
279       number_of_particle_groups = max_number_of_particle_groups
280    ENDIF
281
282!
283!-- Set default start positions, if necessary
284    IF ( psl(1) == 9999999.9_wp )  psl(1) = -0.5_wp * dx
285    IF ( psr(1) == 9999999.9_wp )  psr(1) = ( nx + 0.5_wp ) * dx
286    IF ( pss(1) == 9999999.9_wp )  pss(1) = -0.5_wp * dy
287    IF ( psn(1) == 9999999.9_wp )  psn(1) = ( ny + 0.5_wp ) * dy
288    IF ( psb(1) == 9999999.9_wp )  psb(1) = zu(nz/2)
289    IF ( pst(1) == 9999999.9_wp )  pst(1) = psb(1)
290
291    IF ( pdx(1) == 9999999.9_wp  .OR.  pdx(1) == 0.0_wp )  pdx(1) = dx
292    IF ( pdy(1) == 9999999.9_wp  .OR.  pdy(1) == 0.0_wp )  pdy(1) = dy
293    IF ( pdz(1) == 9999999.9_wp  .OR.  pdz(1) == 0.0_wp )  pdz(1) = zu(2) - zu(1)
294
295    DO  j = 2, number_of_particle_groups
296       IF ( psl(j) == 9999999.9_wp )  psl(j) = psl(j-1)
297       IF ( psr(j) == 9999999.9_wp )  psr(j) = psr(j-1)
298       IF ( pss(j) == 9999999.9_wp )  pss(j) = pss(j-1)
299       IF ( psn(j) == 9999999.9_wp )  psn(j) = psn(j-1)
300       IF ( psb(j) == 9999999.9_wp )  psb(j) = psb(j-1)
301       IF ( pst(j) == 9999999.9_wp )  pst(j) = pst(j-1)
302       IF ( pdx(j) == 9999999.9_wp  .OR.  pdx(j) == 0.0_wp )  pdx(j) = pdx(j-1)
303       IF ( pdy(j) == 9999999.9_wp  .OR.  pdy(j) == 0.0_wp )  pdy(j) = pdy(j-1)
304       IF ( pdz(j) == 9999999.9_wp  .OR.  pdz(j) == 0.0_wp )  pdz(j) = pdz(j-1)
305    ENDDO
306
307!
308!-- Allocate arrays required for calculating particle SGS velocities.
309!-- Initialize prefactor required for stoachastic Weil equation.
310    IF ( use_sgs_for_particles  .AND.  .NOT. cloud_droplets )  THEN
311       ALLOCATE( de_dx(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg), &
312                 de_dy(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg), &
313                 de_dz(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
314
315       sgs_wf_part = 1.0_wp / 3.0_wp   
316    ENDIF
317
318!
319!-- Allocate array required for logarithmic vertical interpolation of
320!-- horizontal particle velocities between the surface and the first vertical
321!-- grid level. In order to avoid repeated CPU cost-intensive CALLS of
322!-- intrinsic FORTRAN procedure LOG(z/z0), LOG(z/z0) is precalculated for
323!-- several heights. Splitting into 20 sublayers turned out to be sufficient.
324!-- To obtain exact height levels of particles, linear interpolation is applied
325!-- (see lpm_advec.f90).
326    IF ( constant_flux_layer )  THEN
327       
328       ALLOCATE ( log_z_z0(0:number_of_sublayers) ) 
329       z_p         = zu(nzb+1) - zw(nzb)
330
331!
332!--    Calculate horizontal mean value of z0 used for logartihmic
333!--    interpolation. Note: this is not exact for heterogeneous z0.
334!--    However, sensitivity studies showed that the effect is
335!--    negligible.
336       z0_av_local  = SUM( z0(nys:nyn,nxl:nxr) )
337       z0_av_global = 0.0_wp
338
339#if defined( __parallel )
340       CALL MPI_ALLREDUCE(z0_av_local, z0_av_global, 1, MPI_REAL, MPI_SUM, &
341                          comm2d, ierr )
342#else
343       z0_av_global = z0_av_local
344#endif
345
346       z0_av_global = z0_av_global  / ( ( ny + 1 ) * ( nx + 1 ) )
347!
348!--    Horizontal wind speed is zero below and at z0
349       log_z_z0(0) = 0.0_wp
350!
351!--    Calculate vertical depth of the sublayers
352       height_int  = ( z_p - z0_av_global ) / REAL( number_of_sublayers, KIND=wp )
353!
354!--    Precalculate LOG(z/z0)
355       height_p    = z0_av_global
356       DO  k = 1, number_of_sublayers
357
358          height_p    = height_p + height_int
359          log_z_z0(k) = LOG( height_p / z0_av_global )
360
361       ENDDO
362
363    ENDIF
364
365!
366!-- Check boundary condition and set internal variables
367    SELECT CASE ( bc_par_b )
368   
369       CASE ( 'absorb' )
370          ibc_par_b = 1
371
372       CASE ( 'reflect' )
373          ibc_par_b = 2
374         
375       CASE DEFAULT
376          WRITE( message_string, * )  'unknown boundary condition ',   &
377                                       'bc_par_b = "', TRIM( bc_par_b ), '"'
378          CALL message( 'lpm_init', 'PA0217', 1, 2, 0, 6, 0 )
379         
380    END SELECT
381    SELECT CASE ( bc_par_t )
382   
383       CASE ( 'absorb' )
384          ibc_par_t = 1
385
386       CASE ( 'reflect' )
387          ibc_par_t = 2
388         
389       CASE DEFAULT
390          WRITE( message_string, * ) 'unknown boundary condition ',   &
391                                     'bc_par_t = "', TRIM( bc_par_t ), '"'
392          CALL message( 'lpm_init', 'PA0218', 1, 2, 0, 6, 0 )
393         
394    END SELECT
395    SELECT CASE ( bc_par_lr )
396
397       CASE ( 'cyclic' )
398          ibc_par_lr = 0
399
400       CASE ( 'absorb' )
401          ibc_par_lr = 1
402
403       CASE ( 'reflect' )
404          ibc_par_lr = 2
405         
406       CASE DEFAULT
407          WRITE( message_string, * ) 'unknown boundary condition ',   &
408                                     'bc_par_lr = "', TRIM( bc_par_lr ), '"'
409          CALL message( 'lpm_init', 'PA0219', 1, 2, 0, 6, 0 )
410         
411    END SELECT
412    SELECT CASE ( bc_par_ns )
413
414       CASE ( 'cyclic' )
415          ibc_par_ns = 0
416
417       CASE ( 'absorb' )
418          ibc_par_ns = 1
419
420       CASE ( 'reflect' )
421          ibc_par_ns = 2
422         
423       CASE DEFAULT
424          WRITE( message_string, * ) 'unknown boundary condition ',   &
425                                     'bc_par_ns = "', TRIM( bc_par_ns ), '"'
426          CALL message( 'lpm_init', 'PA0220', 1, 2, 0, 6, 0 )
427         
428    END SELECT
429
430!
431!-- Initialize collision kernels
432    IF ( collision_kernel /= 'none' )  CALL init_kernels
433
434!
435!-- For the first model run of a possible job chain initialize the
436!-- particles, otherwise read the particle data from restart file.
437    IF ( TRIM( initializing_actions ) == 'read_restart_data'  &
438         .AND.  read_particles_from_restartfile )  THEN
439
440       CALL lpm_read_restart_file
441
442    ELSE
443
444!
445!--    Allocate particle arrays and set attributes of the initial set of
446!--    particles, which can be also periodically released at later times.
447       ALLOCATE( prt_count(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg), &
448                 grid_particles(nzb+1:nzt,nys:nyn,nxl:nxr) )
449
450       maximum_number_of_particles = 0
451       number_of_particles         = 0
452
453       sort_count = 0
454       prt_count  = 0
455
456!
457!--    initialize counter for particle IDs
458       grid_particles%id_counter = 0
459
460!
461!--    Initialize all particles with dummy values (otherwise errors may
462!--    occur within restart runs). The reason for this is still not clear
463!--    and may be presumably caused by errors in the respective user-interface.
464       zero_particle = particle_type( 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp,  &
465                                      0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp,  &
466                                      0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp,  &
467                                      0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp,          &
468                                      0, 0, 0, 0, .FALSE., -1 )
469
470       particle_groups = particle_groups_type( 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp, 0.0_wp )
471
472!
473!--    Set values for the density ratio and radius for all particle
474!--    groups, if necessary
475       IF ( density_ratio(1) == 9999999.9_wp )  density_ratio(1) = 0.0_wp
476       IF ( radius(1)        == 9999999.9_wp )  radius(1) = 0.0_wp
477       DO  i = 2, number_of_particle_groups
478          IF ( density_ratio(i) == 9999999.9_wp )  THEN
479             density_ratio(i) = density_ratio(i-1)
480          ENDIF
481          IF ( radius(i) == 9999999.9_wp )  radius(i) = radius(i-1)
482       ENDDO
483
484       DO  i = 1, number_of_particle_groups
485          IF ( density_ratio(i) /= 0.0_wp  .AND.  radius(i) == 0 )  THEN
486             WRITE( message_string, * ) 'particle group #', i, 'has a', &
487                                        'density ratio /= 0 but radius = 0'
488             CALL message( 'lpm_init', 'PA0215', 1, 2, 0, 6, 0 )
489          ENDIF
490          particle_groups(i)%density_ratio = density_ratio(i)
491          particle_groups(i)%radius        = radius(i)
492       ENDDO
493
494!
495!--    Set a seed value for the random number generator to be exclusively
496!--    used for the particle code. The generated random numbers should be
497!--    different on the different PEs.
498       iran_part = iran_part + myid
499
500       CALL lpm_create_particle (PHASE_INIT)
501!
502!--    User modification of initial particles
503       CALL user_lpm_init
504
505!
506!--    Open file for statistical informations about particle conditions
507       IF ( write_particle_statistics )  THEN
508          CALL check_open( 80 )
509          WRITE ( 80, 8000 )  current_timestep_number, simulated_time,         &
510                              number_of_particles,                             &
511                              maximum_number_of_particles
512          CALL close_file( 80 )
513       ENDIF
514
515    ENDIF
516
517!
518!-- To avoid programm abort, assign particles array to the local version of
519!-- first grid cell
520    number_of_particles = prt_count(nzb+1,nys,nxl)
521    particles => grid_particles(nzb+1,nys,nxl)%particles(1:number_of_particles)
522!
523!-- Formats
5248000 FORMAT (I6,1X,F7.2,4X,I10,71X,I10)
525
526 END SUBROUTINE lpm_init
527
528!------------------------------------------------------------------------------!
529! Description:
530! ------------
531!> @todo Missing subroutine description.
532!------------------------------------------------------------------------------!
533 SUBROUTINE lpm_create_particle (phase)
534
535    USE lpm_exchange_horiz_mod,                                                &
536        ONLY: lpm_exchange_horiz, lpm_move_particle, realloc_particles_array
537
538    USE lpm_pack_arrays_mod,                                                   &
539        ONLY: lpm_pack_all_arrays
540
541    USE particle_attributes,                                                   &
542        ONLY: deleted_particles, monodisperse_aerosols
543
544    IMPLICIT  NONE
545
546    INTEGER(iwp)               ::  alloc_size  !< relative increase of allocated memory for particles
547    INTEGER(iwp)               ::  i           !< loop variable ( particle groups )
548    INTEGER(iwp)               ::  ip          !< index variable along x
549    INTEGER(iwp)               ::  j           !< loop variable ( particles per point )
550    INTEGER(iwp)               ::  jp          !< index variable along y
551    INTEGER(iwp)               ::  kp          !< index variable along z
552    INTEGER(iwp)               ::  loop_stride !< loop variable for initialization
553    INTEGER(iwp)               ::  n           !< loop variable ( number of particles )
554    INTEGER(iwp)               ::  new_size    !< new size of allocated memory for particles
555
556    INTEGER(iwp), INTENT(IN)   ::  phase       !< mode of inititialization
557
558    INTEGER(iwp), DIMENSION(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) ::  local_count !< start address of new particle
559    INTEGER(iwp), DIMENSION(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) ::  local_start !< start address of new particle
560
561    LOGICAL                    ::  first_stride !< flag for initialization
562
563    REAL(wp)                   ::  pos_x      !< increment for particle position in x     
564    REAL(wp)                   ::  pos_y      !< increment for particle position in y 
565    REAL(wp)                   ::  pos_z      !< increment for particle position in z     
566    REAL(wp)                   ::  rand_contr !< dummy argument for random position
567
568    TYPE(particle_type),TARGET ::  tmp_particle !< temporary particle used for initialization
569
570!
571!-- Calculate particle positions and store particle attributes, if
572!-- particle is situated on this PE
573    DO  loop_stride = 1, 2
574       first_stride = (loop_stride == 1)
575       IF ( first_stride )   THEN
576          local_count = 0           ! count number of particles
577       ELSE
578          local_count = prt_count   ! Start address of new particles
579       ENDIF
580
581       n = 0
582       DO  i = 1, number_of_particle_groups
583
584          pos_z = psb(i)
585
586          DO WHILE ( pos_z <= pst(i) )
587
588             pos_y = pss(i)
589
590             DO WHILE ( pos_y <= psn(i) )
591
592                IF ( pos_y >= ( nys - 0.5_wp ) * dy  .AND.  &
593                     pos_y <  ( nyn + 0.5_wp ) * dy )  THEN
594
595                   pos_x = psl(i)
596
597            xloop: DO WHILE ( pos_x <= psr(i) )
598
599                      IF ( pos_x >= ( nxl - 0.5_wp ) * dx  .AND.  &
600                           pos_x <  ( nxr + 0.5_wp ) * dx )  THEN
601
602                         DO  j = 1, particles_per_point
603
604                            n = n + 1
605                            tmp_particle%x             = pos_x
606                            tmp_particle%y             = pos_y
607                            tmp_particle%z             = pos_z
608                            tmp_particle%age           = 0.0_wp
609                            tmp_particle%age_m         = 0.0_wp
610                            tmp_particle%dt_sum        = 0.0_wp
611                            tmp_particle%user          = 0.0_wp !unused, free for the user
612                            tmp_particle%e_m           = 0.0_wp
613                            IF ( curvature_solution_effects )  THEN
614!
615!--                            Initial values (internal timesteps, derivative)
616!--                            for Rosenbrock method
617                               tmp_particle%rvar1      = 1.0E-6_wp     !last Rosenbrock timestep
618                               tmp_particle%rvar2      = 0.1E-6_wp     !dry aerosol radius
619                               tmp_particle%rvar3      = -9999999.9_wp !unused in this configuration
620                            ELSE
621!
622!--                            Initial values for SGS velocities
623                               tmp_particle%rvar1      = 0.0_wp
624                               tmp_particle%rvar2      = 0.0_wp
625                               tmp_particle%rvar3      = 0.0_wp
626                            ENDIF
627                            tmp_particle%speed_x       = 0.0_wp
628                            tmp_particle%speed_y       = 0.0_wp
629                            tmp_particle%speed_z       = 0.0_wp
630                            tmp_particle%origin_x      = pos_x
631                            tmp_particle%origin_y      = pos_y
632                            tmp_particle%origin_z      = pos_z
633                            tmp_particle%radius        = particle_groups(i)%radius
634                            tmp_particle%weight_factor = initial_weighting_factor
635                            tmp_particle%class         = 1
636                            tmp_particle%group         = i
637                            tmp_particle%id1           = 0 
638                            tmp_particle%id2           = 0 
639                            tmp_particle%particle_mask = .TRUE.
640                            tmp_particle%block_nr      = -1
641!
642!--                         Determine the grid indices of the particle position
643                            ip = ( tmp_particle%x + 0.5_wp * dx ) * ddx
644                            jp = ( tmp_particle%y + 0.5_wp * dy ) * ddy
645                            kp = tmp_particle%z / dz + 1 + offset_ocean_nzt
646
647                            IF ( seed_follows_topography )  THEN
648!
649!--                            Particle height is given relative to topography
650                               kp = kp + nzb_w_inner(jp,ip)
651                               tmp_particle%z = tmp_particle%z +               &
652                                                         zw(nzb_w_inner(jp,ip))
653                               IF ( kp > nzt )  THEN
654                                  pos_x = pos_x + pdx(i)
655                                  CYCLE xloop
656                               ENDIF
657                            ELSEIF ( .NOT. seed_follows_topography .AND.       &
658                                     tmp_particle%z <= zw(nzb_w_inner(jp,ip)) )  THEN
659                               pos_x = pos_x + pdx(i)
660                               CYCLE xloop                               
661                            ENDIF
662
663                            local_count(kp,jp,ip) = local_count(kp,jp,ip) + 1
664                            IF ( .NOT. first_stride )  THEN
665                               IF ( ip < nxl  .OR.  jp < nys  .OR.  kp < nzb+1 )  THEN
666                                  write(6,*) 'xl ',ip,jp,kp,nxl,nys,nzb+1
667                               ENDIF
668                               IF ( ip > nxr  .OR.  jp > nyn  .OR.  kp > nzt )  THEN
669                                  write(6,*) 'xu ',ip,jp,kp,nxr,nyn,nzt
670                               ENDIF
671                               grid_particles(kp,jp,ip)%particles(local_count(kp,jp,ip)) = tmp_particle
672
673                            ENDIF
674                         ENDDO
675
676                      ENDIF
677
678                      pos_x = pos_x + pdx(i)
679
680                   ENDDO xloop
681
682                ENDIF
683
684                pos_y = pos_y + pdy(i)
685
686             ENDDO
687
688             pos_z = pos_z + pdz(i)
689
690          ENDDO
691
692       ENDDO
693
694       IF ( first_stride )  THEN
695          DO  ip = nxl, nxr
696             DO  jp = nys, nyn
697                DO  kp = nzb+1, nzt
698                   IF ( phase == PHASE_INIT )  THEN
699                      IF ( local_count(kp,jp,ip) > 0 )  THEN
700                         alloc_size = MAX( INT( local_count(kp,jp,ip) *        &
701                            ( 1.0_wp + alloc_factor / 100.0_wp ) ),            &
702                            min_nr_particle )
703                      ELSE
704                         alloc_size = min_nr_particle
705                      ENDIF
706                      ALLOCATE(grid_particles(kp,jp,ip)%particles(1:alloc_size))
707                      DO  n = 1, alloc_size
708                         grid_particles(kp,jp,ip)%particles(n) = zero_particle
709                      ENDDO
710                   ELSEIF ( phase == PHASE_RELEASE )  THEN
711                      IF ( local_count(kp,jp,ip) > 0 )  THEN
712                         new_size   = local_count(kp,jp,ip) + prt_count(kp,jp,ip)
713                         alloc_size = MAX( INT( new_size * ( 1.0_wp +          &
714                            alloc_factor / 100.0_wp ) ), min_nr_particle )
715                         IF( alloc_size > SIZE( grid_particles(kp,jp,ip)%particles) )  THEN
716                           CALL realloc_particles_array(ip,jp,kp,alloc_size)
717                         ENDIF
718                      ENDIF
719                   ENDIF
720
721                ENDDO
722             ENDDO
723          ENDDO
724       ENDIF
725
726    ENDDO
727
728    local_start = prt_count+1
729    prt_count   = local_count
730
731!
732!-- Calculate particle IDs
733    DO  ip = nxl, nxr
734       DO  jp = nys, nyn
735          DO  kp = nzb+1, nzt
736             number_of_particles = prt_count(kp,jp,ip)
737             IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
738             particles => grid_particles(kp,jp,ip)%particles(1:number_of_particles)
739
740             DO  n = local_start(kp,jp,ip), number_of_particles  !only new particles
741
742                particles(n)%id1 = 10000 * grid_particles(kp,jp,ip)%id_counter + kp
743                particles(n)%id2 = 10000 * jp + ip
744
745                grid_particles(kp,jp,ip)%id_counter =                          &
746                                         grid_particles(kp,jp,ip)%id_counter + 1
747
748             ENDDO
749
750          ENDDO
751       ENDDO
752    ENDDO
753
754!
755!-- Initialize aerosol background spectrum
756    IF ( curvature_solution_effects  .AND.  .NOT. monodisperse_aerosols )  THEN
757       CALL lpm_init_aerosols(local_start)
758    ENDIF
759
760!
761!-- Add random fluctuation to particle positions.
762    IF ( random_start_position )  THEN
763       DO  ip = nxl, nxr
764          DO  jp = nys, nyn
765             DO  kp = nzb+1, nzt
766                number_of_particles = prt_count(kp,jp,ip)
767                IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
768                particles => grid_particles(kp,jp,ip)%particles(1:number_of_particles)
769!
770!--             Move only new particles. Moreover, limit random fluctuation
771!--             in order to prevent that particles move more than one grid box,
772!--             which would lead to problems concerning particle exchange
773!--             between processors in case pdx/pdy are larger than dx/dy,
774!--             respectively. 
775                DO  n = local_start(kp,jp,ip), number_of_particles
776                   IF ( psl(particles(n)%group) /= psr(particles(n)%group) )  THEN
777                      rand_contr = ( random_function( iran_part ) - 0.5_wp ) * &
778                                     pdx(particles(n)%group)
779                      particles(n)%x = particles(n)%x +                        &
780                              MERGE( rand_contr, SIGN( dx, rand_contr ), &
781                                     ABS( rand_contr ) < dx                    &
782                                   ) 
783                   ENDIF
784                   IF ( pss(particles(n)%group) /= psn(particles(n)%group) )  THEN
785                      rand_contr = ( random_function( iran_part ) - 0.5_wp ) * &
786                                     pdy(particles(n)%group)
787                      particles(n)%y = particles(n)%y +                        &
788                              MERGE( rand_contr, SIGN( dy, rand_contr ), &
789                                     ABS( rand_contr ) < dy                    &
790                                   ) 
791                   ENDIF
792                   IF ( psb(particles(n)%group) /= pst(particles(n)%group) )  THEN
793                      rand_contr = ( random_function( iran_part ) - 0.5_wp ) * &
794                                     pdz(particles(n)%group)
795                      particles(n)%z = particles(n)%z +                        &
796                              MERGE( rand_contr, SIGN( dz, rand_contr ), &
797                                     ABS( rand_contr ) < dz                    &
798                                   ) 
799                   ENDIF
800                ENDDO
801!
802!--             Identify particles located outside the model domain and reflect
803!--             or absorb them if necessary.
804                CALL lpm_boundary_conds( 'bottom/top' )
805!
806!--             Furthermore, remove particles located in topography. Note, as
807!--             the particle speed is still zero at this point, wall
808!--             reflection boundary conditions will not work in this case.
809                particles =>                                                   &
810                       grid_particles(kp,jp,ip)%particles(1:number_of_particles)
811                DO  n = local_start(kp,jp,ip), number_of_particles
812                   i = ( particles(n)%x + 0.5_wp * dx ) * ddx
813                   j = ( particles(n)%y + 0.5_wp * dy ) * ddy
814                   IF ( particles(n)%z <= zw(nzb_w_inner(j,i)) )  THEN
815                      particles(n)%particle_mask = .FALSE.
816                      deleted_particles = deleted_particles + 1
817                   ENDIF
818                ENDDO
819             ENDDO
820          ENDDO
821       ENDDO
822!
823!--    Exchange particles between grid cells and processors
824       CALL lpm_move_particle
825       CALL lpm_exchange_horiz
826
827    ENDIF
828!
829!-- In case of random_start_position, delete particles identified by
830!-- lpm_exchange_horiz and lpm_boundary_conds. Then sort particles into blocks,
831!-- which is needed for a fast interpolation of the LES fields on the particle
832!-- position.
833    CALL lpm_pack_all_arrays
834
835!
836!-- Determine maximum number of particles (i.e., all possible particles that
837!-- have been allocated) and the current number of particles
838    DO  ip = nxl, nxr
839       DO  jp = nys, nyn
840          DO  kp = nzb+1, nzt
841             maximum_number_of_particles = maximum_number_of_particles         &
842                                           + SIZE(grid_particles(kp,jp,ip)%particles)
843             number_of_particles         = number_of_particles                 &
844                                           + prt_count(kp,jp,ip)
845          ENDDO
846       ENDDO
847    ENDDO
848!
849!-- Calculate the number of particles of the total domain
850#if defined( __parallel )
851    IF ( collective_wait )  CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
852    CALL MPI_ALLREDUCE( number_of_particles, total_number_of_particles, 1, &
853    MPI_INTEGER, MPI_SUM, comm2d, ierr )
854#else
855    total_number_of_particles = number_of_particles
856#endif
857
858    RETURN
859
860 END SUBROUTINE lpm_create_particle
861
862 SUBROUTINE lpm_init_aerosols(local_start)
863
864    USE arrays_3d,                                                             &
865        ONLY: hyp, pt, q 
866
867    USE cloud_parameters,                                                      &
868        ONLY: l_d_rv, rho_l, r_v
869
870    USE constants,                                                             &
871        ONLY: pi
872
873    USE kinds
874
875    USE particle_attributes,                                                   &
876        ONLY: init_aerosol_probabilistic, molecular_weight_of_solute,          &
877              molecular_weight_of_water, n1, n2, n3, rho_s, rm1, rm2, rm3,     &
878              s1, s2, s3, vanthoff
879
880    IMPLICIT NONE
881
882    REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE ::  cdf     !< CDF of aerosol spectrum
883    REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE ::  r_temp  !< dry aerosol radius spectrum
884
885    REAL(wp)  :: afactor            !< curvature effects
886    REAL(wp)  :: bfactor            !< solute effects
887    REAL(wp)  :: dr                 !< width of radius bin
888    REAL(wp)  :: e_a                !< vapor pressure
889    REAL(wp)  :: e_s                !< saturation vapor pressure
890    REAL(wp)  :: n_init             !< sum of all aerosol concentrations
891    REAL(wp)  :: pdf                !< PDF of aerosol spectrum
892    REAL(wp)  :: rmin = 1.0e-8_wp   !< minimum aerosol radius
893    REAL(wp)  :: rmax = 1.0e-6_wp   !< maximum aerosol radius
894    REAL(wp)  :: rs_rand            !< random number
895    REAL(wp)  :: r_mid              !< mean radius
896    REAL(wp)  :: sigma              !< surface tension
897    REAL(wp)  :: t_int              !< temperature
898    REAL(wp)  :: weight_sum         !< sum of all weighting factors
899
900    INTEGER(iwp), DIMENSION(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg), INTENT(IN) ::  local_start !<
901
902    INTEGER(iwp)  :: n              !<
903    INTEGER(iwp)  :: nn             !<
904    INTEGER(iwp)  :: no_bins = 999  !< number of bins
905    INTEGER(iwp)  :: ip             !<
906    INTEGER(iwp)  :: jp             !<
907    INTEGER(iwp)  :: kp             !<
908
909    LOGICAL ::  new_pdf = .FALSE.   !< check if aerosol PDF has to be recalculated
910
911!
912!-- Compute aerosol background distribution
913    IF ( init_aerosol_probabilistic )  THEN
914       ALLOCATE( cdf(0:no_bins), r_temp(0:no_bins) )
915       DO n = 0, no_bins
916          r_temp(n) = EXP( LOG(rmin) + ( LOG(rmax) - LOG(rmin ) ) /            &
917                           REAL(no_bins, KIND=wp) * REAL(n, KIND=wp) )
918
919          cdf(n) = 0.0_wp
920          n_init = n1 + n2 + n3
921          IF ( n1 > 0.0_wp )  THEN
922             cdf(n) = cdf(n) + n1 / n_init * ( 0.5_wp + 0.5_wp *        &
923                                  ERF( LOG( r_temp(n) / rm1 ) /         &
924                                       ( SQRT(2.0_wp) * LOG(s1) )       &
925                                     ) )
926          ENDIF
927          IF ( n2 > 0.0_wp )  THEN
928             cdf(n) = cdf(n) + n2 / n_init * ( 0.5_wp + 0.5_wp *        &
929                                  ERF( LOG( r_temp(n) / rm2 ) /         &
930                                       ( SQRT(2.0_wp) * LOG(s2) )       &
931                                     ) )
932          ENDIF
933          IF ( n3 > 0.0_wp )  THEN
934             cdf(n) = cdf(n) + n3 / n_init * ( 0.5_wp + 0.5_wp *        &
935                                  ERF( LOG( r_temp(n) / rm3 ) /         &
936                                       ( SQRT(2.0_wp) * LOG(s3) )       &
937                                     ) )
938          ENDIF
939
940       ENDDO
941    ENDIF
942
943    DO  ip = nxl, nxr
944       DO  jp = nys, nyn
945          DO  kp = nzb+1, nzt
946
947             number_of_particles = prt_count(kp,jp,ip)
948             IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
949             particles => grid_particles(kp,jp,ip)%particles(1:number_of_particles)
950!
951!--          Initialize the aerosols with a predefined spectral distribution
952!--          of the dry radius (logarithmically increasing bins) and a varying
953!--          weighting factor
954             IF ( .NOT. init_aerosol_probabilistic )  THEN
955
956                new_pdf = .FALSE.
957                IF ( .NOT. ALLOCATED( r_temp ) )  THEN
958                   new_pdf = .TRUE.
959                ELSE
960                   IF ( SIZE( r_temp ) .NE. &
961                        number_of_particles - local_start(kp,jp,ip) + 2 )  THEN
962                      new_pdf = .TRUE.
963                      DEALLOCATE( r_temp )
964                   ENDIF
965                ENDIF
966
967                IF ( new_pdf )  THEN
968
969                   no_bins = number_of_particles + 1 - local_start(kp,jp,ip)
970                   ALLOCATE( r_temp(0:no_bins) )
971
972                   DO n = 0, no_bins
973                      r_temp(n) = EXP( LOG(rmin) + ( LOG(rmax) - LOG(rmin ) ) / &
974                                       REAL(no_bins, KIND=wp) *                 &
975                                       REAL(n, KIND=wp) )
976                   ENDDO
977
978                ENDIF
979
980!
981!--             Calculate radius and concentration of each aerosol
982                DO n = local_start(kp,jp,ip), number_of_particles
983
984                   nn = n - local_start(kp,jp,ip)
985
986                   r_mid = SQRT( r_temp(nn) * r_temp(nn+1) )
987                   dr    = r_temp(nn+1) - r_temp(nn)
988
989                   pdf    = 0.0_wp
990                   n_init = n1 + n2 + n3
991                   IF ( n1 > 0.0_wp )  THEN
992                      pdf = pdf + n1 / n_init * ( 1.0_wp / ( r_mid * LOG(s1) *      &
993                                                             SQRT( 2.0_wp * pi )    &
994                                                           ) *                      &
995                                                  EXP( -( LOG( r_mid / rm1 ) )**2 / &
996                                                       ( 2.0_wp * LOG(s1)**2 )      &
997                                                     )                              &
998                                                )
999                   ENDIF
1000                   IF ( n2 > 0.0_wp )  THEN
1001                      pdf = pdf + n2 / n_init * ( 1.0_wp / ( r_mid * LOG(s2) *      &
1002                                                             SQRT( 2.0_wp * pi )    &
1003                                                           ) *                      &
1004                                                  EXP( -( LOG( r_mid / rm2 ) )**2 / &
1005                                                       ( 2.0_wp * LOG(s2)**2 )      &
1006                                                     )                              &
1007                                                )
1008                   ENDIF
1009                   IF ( n3 > 0.0_wp )  THEN
1010                      pdf = pdf + n3 / n_init * ( 1.0_wp / ( r_mid * LOG(s3) *      &
1011                                                             SQRT( 2.0_wp * pi )    &
1012                                                           ) *                      &
1013                                                  EXP( -( LOG( r_mid / rm3 ) )**2 / &
1014                                                       ( 2.0_wp * LOG(s3)**2 )      &
1015                                                     )                              &
1016                                                )
1017                   ENDIF
1018
1019                   particles(n)%rvar2         = r_mid
1020                   particles(n)%weight_factor = pdf * dr
1021
1022                END DO
1023!
1024!--             Adjust weighting factors to initialize the same number of aerosols
1025!--             in every grid box
1026                weight_sum = SUM(particles(local_start(kp,jp,ip):number_of_particles)%weight_factor)
1027
1028                particles(local_start(kp,jp,ip):number_of_particles)%weight_factor =     &
1029                   particles(local_start(kp,jp,ip):number_of_particles)%weight_factor /  &
1030                   weight_sum * initial_weighting_factor * ( no_bins + 1 )
1031
1032             ENDIF
1033!
1034!--          Initialize the aerosols with a predefined weighting factor but
1035!--          a randomly choosen dry radius
1036             IF ( init_aerosol_probabilistic )  THEN
1037
1038                DO  n = local_start(kp,jp,ip), number_of_particles  !only new particles
1039
1040                   rs_rand = -1.0_wp
1041                   DO WHILE ( rs_rand .LT. cdf(0)  .OR.  rs_rand .GE. cdf(no_bins)  )
1042                      rs_rand = random_function( iran_part )
1043                   ENDDO
1044!
1045!--                Determine aerosol dry radius by a random number generator
1046                   DO nn = 0, no_bins-1
1047                      IF ( cdf(nn) .LE. rs_rand  .AND.  cdf(nn+1) .GT. rs_rand )  THEN
1048                         particles(n)%rvar2 = r_temp(nn) + ( r_temp(nn+1) - r_temp(nn) ) / &
1049                                              ( cdf(nn+1) - cdf(nn) ) * ( rs_rand - cdf(nn) )
1050                         EXIT
1051                      ENDIF
1052                   ENDDO
1053
1054                ENDDO
1055
1056             ENDIF
1057
1058!
1059!--          Set particle radius to equilibrium radius based on the environmental
1060!--          supersaturation (Khvorostyanov and Curry, 2007, JGR). This avoids
1061!--          the sometimes lengthy growth toward their equilibrium radius within
1062!--          the simulation.
1063             t_int  = pt(kp,jp,ip) * ( hyp(kp) / 100000.0_wp )**0.286_wp
1064
1065             e_s = 611.0_wp * EXP( l_d_rv * ( 3.6609E-3_wp - 1.0_wp / t_int ) )
1066             e_a = q(kp,jp,ip) * hyp(kp) / ( 0.378_wp * q(kp,jp,ip) + 0.622_wp )
1067
1068             sigma   = 0.0761_wp - 0.000155_wp * ( t_int - 273.15_wp )
1069             afactor = 2.0_wp * sigma / ( rho_l * r_v * t_int )
1070
1071             bfactor = vanthoff * molecular_weight_of_water *    &
1072                       rho_s / ( molecular_weight_of_solute * rho_l )
1073!
1074!--          The formula is only valid for subsaturated environments. For
1075!--          supersaturations higher than -5 %, the supersaturation is set to -5%.
1076             IF ( e_a / e_s >= 0.95_wp )  e_a = 0.95_wp * e_s
1077
1078             DO  n = local_start(kp,jp,ip), number_of_particles  !only new particles
1079!
1080!--             For details on this equation, see Eq. (14) of Khvorostyanov and
1081!--             Curry (2007, JGR)
1082                particles(n)%radius = bfactor**0.3333333_wp *                  &
1083                   particles(n)%rvar2 / ( 1.0_wp - e_a / e_s )**0.3333333_wp / &
1084                   ( 1.0_wp + ( afactor / ( 3.0_wp * bfactor**0.3333333_wp *   &
1085                     particles(n)%rvar2 ) ) /                                  &
1086                     ( 1.0_wp - e_a / e_s )**0.6666666_wp                      &
1087                   )
1088
1089             ENDDO
1090
1091          ENDDO
1092       ENDDO
1093    ENDDO
1094!
1095!-- Deallocate used arrays
1096    IF ( ALLOCATED(r_temp) )  DEALLOCATE( r_temp )
1097    IF ( ALLOCATED(cdf) )     DEALLOCATE( cdf )
1098
1099 END SUBROUTINE lpm_init_aerosols
1100
1101END MODULE lpm_init_mod
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.