source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4470

Last change on this file since 4470 was 4457, checked in by raasch, 5 years ago

ghost point exchange modularized, bugfix for wrong 2d-exchange

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.1 KB
Line 
1!> @file data_output_3d.f90
2!------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of the PALM model system.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
17! Copyright 1997-2020 Leibniz Universitaet Hannover
18!------------------------------------------------------------------------------!
19!
20! Current revisions:
21! ------------------
22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 4457 2020-03-11 14:20:43Z maronga $
27! use statement for exchange horiz added
28!
29! 4444 2020-03-05 15:59:50Z raasch
30! bugfix: cpp-directives for serial mode added
31!
32! 4360 2020-01-07 11:25:50Z suehring
33! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static
34! topography information used in wall_flags_static_0
35!
36! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
37! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
38!
39! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
40! Corrected "Former revisions" section
41!
42! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
43! bugfix for r4155
44!
45! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
46! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
47!
48! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
49! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs
50! (merge from branch resler)
51!
52! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
53! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
54!
55! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
56! modularize diagnostic output
57!
58! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
59! output of turbulence intensity added
60!
61! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
62! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
63!
64! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
65! Changes related to global restructuring of location messages and introduction
66! of additional debug messages
67!
68! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
69! unused variables removed
70!
71! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
72! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant
73! when using wall/soil spinup)
74!
75! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
76! Initial revision
77!
78!
79! Description:
80! ------------
81!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
82!------------------------------------------------------------------------------!
83 SUBROUTINE data_output_3d( av )
84 
85
86    USE arrays_3d,                                                             &
87        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
88
89    USE averaging
90
91    USE basic_constants_and_equations_mod,                                     &
92        ONLY:  lv_d_cp
93
94    USE bulk_cloud_model_mod,                                                  &
95        ONLY:  bulk_cloud_model
96
97    USE control_parameters,                                                    &
98        ONLY:  debug_output_timestep, do3d, do3d_no, do3d_time_count,          &
99               land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy,  &
100               psolver, time_since_reference_point, urban_surface,             &
101               varnamelength
102
103#if defined( __parallel )
104    USE control_parameters,                                                    &
105        ONLY:  io_blocks, io_group
106#endif
107
108    USE cpulog,                                                                &
109        ONLY:  log_point, cpu_log
110
111    USE exchange_horiz_mod,                                                    &
112        ONLY:  exchange_horiz
113
114    USE indices,                                                               &
115        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt,     &
116               wall_flags_total_0
117
118#if ! defined( __parallel )
119    USE indices,                                                               &
120        ONLY:  nx, ny
121#endif
122
123    USE kinds
124
125    USE land_surface_model_mod,                                                &
126        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
127
128    USE module_interface,                                                      &
129        ONLY:  module_interface_data_output_3d
130
131#if defined( __netcdf )
132    USE NETCDF
133#endif
134
135    USE netcdf_interface,                                                      &
136        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
137               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
138
139    USE particle_attributes,                                                   &
140        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
141               particle_advection_start, prt_count
142
143    USE pegrid
144
145    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
146        ONLY:  pch_index
147
148    USE radiation_model_mod,                                                   &
149        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
150
151    USE urban_surface_mod,                                                     &
152        ONLY:  usm_data_output_3d
153
154
155    IMPLICIT NONE
156
157    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
158    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
159    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
160    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
161    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
162    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
163    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
164    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
165    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
166
167    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
168    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
169
170    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
171    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
172    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
173
174    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
175
176    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be output
177
178    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
179
180!
181!-- Return, if nothing to output
182    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
183
184    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
185
186    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
187
188!
189!-- Open output file.
190!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
191!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
192!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
193!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
194    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
195#if defined( __parallel )
196       CALL check_open( 30 )
197#endif
198       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
199    ELSE
200       CALL check_open( 106+av*10 )
201    ENDIF
202
203!
204!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
205!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
206!-- the given end time by the length of the given output interval.
207    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
208       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
209          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',               &
210                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ', & 
211                                      'number of output time levels is ',                   &
212                                      'exceeded.'
213          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
214          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
215          RETURN
216       ENDIF
217    ENDIF
218
219!
220!-- Update the netCDF time axis
221!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
222!-- performance.
223#if defined( __netcdf )
224    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
225    IF ( myid == 0 )  THEN
226       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
227                               (/ time_since_reference_point /),            &
228                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
229                               count = (/ 1 /) )
230       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
231    ENDIF
232#endif
233
234!
235!-- Loop over all variables to be written.
236    ivar = 1
237
238    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
239
240!
241!--    Initiate found flag and resorting flag
242       found = .FALSE.
243       resorted = .FALSE.
244       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
245
246!
247!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
248!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
249!--    Store the array chosen on the temporary array.
250       nzb_do   = nzb
251!
252!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model
253!--    these index is determined by pch_index.
254       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
255          nzt_do   = pch_index
256       ELSE
257          nzt_do   = nz_do3d
258       ENDIF
259
260!
261!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
262       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
263!
264!--    Before each output, set array local_pf to fill value
265       local_pf = fill_value
266!
267!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
268       flag_nr = 0
269
270       SELECT CASE ( trimvar )
271
272          CASE ( 'e' )
273             IF ( av == 0 )  THEN
274                to_be_resorted => e
275             ELSE
276                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) ) THEN
277                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
278                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
279                ENDIF
280                to_be_resorted => e_av
281             ENDIF
282
283          CASE ( 'thetal' )
284             IF ( av == 0 )  THEN
285                to_be_resorted => pt
286             ELSE
287                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) ) THEN
288                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
289                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
290                ENDIF
291                to_be_resorted => lpt_av
292             ENDIF
293
294          CASE ( 'p' )
295             IF ( av == 0 )  THEN
296                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
297                to_be_resorted => p
298             ELSE
299                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) ) THEN
300                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
301                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
302                ENDIF
303                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
304                to_be_resorted => p_av
305             ENDIF
306
307          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
308             IF ( av == 0 )  THEN
309                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
310                   tend = prt_count
311                ELSE
312                   tend = 0.0_wp
313                ENDIF
314                DO  i = nxl, nxr
315                   DO  j = nys, nyn
316                      DO  k = nzb_do, nzt_do
317                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
318                      ENDDO
319                   ENDDO
320                ENDDO
321                resorted = .TRUE.
322             ELSE
323                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) ) THEN
324                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
325                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
326                ENDIF
327                to_be_resorted => pc_av
328             ENDIF
329
330          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
331             IF ( av == 0 )  THEN
332                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
333                   DO  i = nxl, nxr
334                      DO  j = nys, nyn
335                         DO  k = nzb_do, nzt_do
336                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
337                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
338                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
339                            s_r2 = 0.0_wp
340                            s_r3 = 0.0_wp
341                            DO  n = 1, number_of_particles
342                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
343                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
344                                         particles(n)%weight_factor
345                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
346                                         particles(n)%weight_factor
347                               ENDIF
348                            ENDDO
349                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
350                               mean_r = s_r3 / s_r2
351                            ELSE
352                               mean_r = 0.0_wp
353                            ENDIF
354                            tend(k,j,i) = mean_r
355                         ENDDO
356                      ENDDO
357                   ENDDO
358                ELSE
359                   tend = 0.0_wp
360                ENDIF
361                DO  i = nxl, nxr
362                   DO  j = nys, nyn
363                      DO  k = nzb_do, nzt_do
364                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
365                      ENDDO
366                   ENDDO
367                ENDDO
368                resorted = .TRUE.
369             ELSE
370                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) ) THEN
371                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
372                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
373                ENDIF
374                to_be_resorted => pr_av
375             ENDIF
376
377          CASE ( 'theta' )
378             IF ( av == 0 )  THEN
379                IF ( .NOT. bulk_cloud_model ) THEN
380                   to_be_resorted => pt
381                ELSE
382                   DO  i = nxl, nxr
383                      DO  j = nys, nyn
384                         DO  k = nzb_do, nzt_do
385                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp *            &
386                                                          d_exner(k) *         &
387                                                          ql(k,j,i)
388                         ENDDO
389                      ENDDO
390                   ENDDO
391                   resorted = .TRUE.
392                ENDIF
393             ELSE
394                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) ) THEN
395                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
396                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
397                ENDIF
398                to_be_resorted => pt_av
399             ENDIF
400
401          CASE ( 'q' )
402             IF ( av == 0 )  THEN
403                to_be_resorted => q
404             ELSE
405                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) ) THEN
406                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
407                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
408                ENDIF
409                to_be_resorted => q_av
410             ENDIF
411
412          CASE ( 'ql' )
413             IF ( av == 0 )  THEN
414                to_be_resorted => ql
415             ELSE
416                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) ) THEN
417                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
418                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
419                ENDIF
420                to_be_resorted => ql_av
421             ENDIF
422
423          CASE ( 'ql_c' )
424             IF ( av == 0 )  THEN
425                to_be_resorted => ql_c
426             ELSE
427                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) ) THEN
428                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
429                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
430                ENDIF
431                to_be_resorted => ql_c_av
432             ENDIF
433
434          CASE ( 'ql_v' )
435             IF ( av == 0 )  THEN
436                to_be_resorted => ql_v
437             ELSE
438                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) ) THEN
439                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
440                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
441                ENDIF
442                to_be_resorted => ql_v_av
443             ENDIF
444
445          CASE ( 'ql_vp' )
446             IF ( av == 0 )  THEN
447                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
448                   DO  i = nxl, nxr
449                      DO  j = nys, nyn
450                         DO  k = nzb_do, nzt_do
451                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
452                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
453                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
454                            DO  n = 1, number_of_particles
455                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
456                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
457                                                 particles(n)%weight_factor /  &
458                                                 prt_count(k,j,i)
459                               ENDIF
460                            ENDDO
461                         ENDDO
462                      ENDDO
463                   ENDDO
464                ELSE
465                   tend = 0.0_wp
466                ENDIF
467                DO  i = nxl, nxr
468                   DO  j = nys, nyn
469                      DO  k = nzb_do, nzt_do
470                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
471                      ENDDO
472                   ENDDO
473                ENDDO
474                resorted = .TRUE.
475             ELSE
476                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) ) THEN
477                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
478                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
479                ENDIF
480                to_be_resorted => ql_vp_av
481             ENDIF
482
483          CASE ( 'qv' )
484             IF ( av == 0 )  THEN
485                DO  i = nxl, nxr
486                   DO  j = nys, nyn
487                      DO  k = nzb_do, nzt_do
488                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
489                      ENDDO
490                   ENDDO
491                ENDDO
492                resorted = .TRUE.
493             ELSE
494                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) ) THEN
495                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
496                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
497                ENDIF
498                to_be_resorted => qv_av
499             ENDIF
500
501          CASE ( 's' )
502             IF ( av == 0 )  THEN
503                to_be_resorted => s
504             ELSE
505                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) ) THEN
506                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
507                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
508                ENDIF
509                to_be_resorted => s_av
510             ENDIF
511
512          CASE ( 'u' )
513             flag_nr = 1
514             IF ( av == 0 )  THEN
515                to_be_resorted => u
516             ELSE
517                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) ) THEN
518                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
519                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
520                ENDIF
521                to_be_resorted => u_av
522             ENDIF
523
524          CASE ( 'v' )
525             flag_nr = 2
526             IF ( av == 0 )  THEN
527                to_be_resorted => v
528             ELSE
529                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) ) THEN
530                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
531                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
532                ENDIF
533                to_be_resorted => v_av
534             ENDIF
535
536          CASE ( 'thetav' )
537             IF ( av == 0 )  THEN
538                to_be_resorted => vpt
539             ELSE
540                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) ) THEN
541                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
542                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
543                ENDIF
544                to_be_resorted => vpt_av
545             ENDIF
546
547          CASE ( 'w' )
548             flag_nr = 3
549             IF ( av == 0 )  THEN
550                to_be_resorted => w
551             ELSE
552                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) ) THEN
553                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
554                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
555                ENDIF
556                to_be_resorted => w_av
557             ENDIF
558
559          CASE DEFAULT
560!
561!--          Quantities of other modules
562             IF ( .NOT. found )  THEN
563                CALL module_interface_data_output_3d(                          &
564                        av, trimvar, found, local_pf,                          &
565                        fill_value, resorted, nzb_do, nzt_do                   &
566                     )
567             ENDIF
568
569!
570!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
571             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
572!
573!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
574                nzb_do = nz_urban_b
575                nzt_do = nz_urban_t
576
577                DEALLOCATE ( local_pf )
578                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
579                local_pf = fill_value
580
581                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf,         &
582                                         nzb_do, nzt_do )
583                resorted = .TRUE.
584
585!
586!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
587                IF ( .NOT. found )  THEN
588                   nzb_do = nzb
589                   nzt_do = nz_do3d
590
591                   DEALLOCATE ( local_pf )
592                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
593                ENDIF
594
595             ENDIF
596
597!
598!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
599             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
600!
601!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
602                nzb_do = nzb_soil
603                nzt_do = nzt_soil
604
605                DEALLOCATE ( local_pf )
606                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
607                local_pf = fill_value
608
609                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
610                resorted = .TRUE.
611
612!
613!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
614                IF ( .NOT. found )  THEN
615                   nzb_do = nzb
616                   nzt_do = nz_do3d
617
618                   DEALLOCATE ( local_pf )
619                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
620                ENDIF
621
622             ENDIF
623
624             IF ( .NOT. found )  THEN
625                message_string =  'no output available for: ' //               &
626                                  TRIM( do3d(av,ivar) )
627                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
628             ENDIF
629
630       END SELECT
631
632!
633!--    Resort the array to be output, if not done above
634       IF ( .NOT. resorted )  THEN
635          DO  i = nxl, nxr
636             DO  j = nys, nyn
637                DO  k = nzb_do, nzt_do
638                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
639                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
640                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
641                                      BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
642                ENDDO
643             ENDDO
644          ENDDO
645       ENDIF
646
647!
648!--    Output of the 3D-array
649#if defined( __parallel )
650       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
651!
652!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
653!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
654!--       combine_plot_fields
655          IF ( myid == 0 )  THEN
656             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
657                           do3d_time_count(av), av
658          ENDIF
659          DO  i = 0, io_blocks-1
660             IF ( i == io_group )  THEN
661                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
662                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
663             ENDIF
664
665             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
666
667          ENDDO
668
669       ELSE
670#if defined( __netcdf )
671!
672!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
673!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
674!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
675!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
676!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
677!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
678!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
679!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
680!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
681!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
682!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
683!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
684!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
685!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
686!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
687!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
688!          ELSE
689             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
690                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
691                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
692                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
693!          ENDIF
694          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
695#endif
696       ENDIF
697#else
698#if defined( __netcdf )
699       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),        &
700                         local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),          &
701                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),       &
702                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
703       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
704#endif
705#endif
706
707       ivar = ivar + 1
708
709!
710!--    Deallocate temporary array
711       DEALLOCATE ( local_pf )
712
713    ENDDO
714
715    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
716
717    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
718
719
720 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.