source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4447

Last change on this file since 4447 was 4444, checked in by raasch, 5 years ago

bugfix: cpp-directives for serial mode added

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 25.9 KB
Line 
1!> @file data_output_3d.f90
2!------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of the PALM model system.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
17! Copyright 1997-2020 Leibniz Universitaet Hannover
18!------------------------------------------------------------------------------!
19!
20! Current revisions:
21! ------------------
22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 4444 2020-03-05 15:59:50Z oliver.maas $
27! bugfix: cpp-directives for serial mode added
28!
29! 4360 2020-01-07 11:25:50Z suehring
30! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static
31! topography information used in wall_flags_static_0
32!
33! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
34! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
35!
36! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
37! Corrected "Former revisions" section
38!
39! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
40! bugfix for r4155
41!
42! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
43! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
44!
45! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
46! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs
47! (merge from branch resler)
48!
49! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
50! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
51!
52! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
53! modularize diagnostic output
54!
55! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
56! output of turbulence intensity added
57!
58! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
59! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
60!
61! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
62! Changes related to global restructuring of location messages and introduction
63! of additional debug messages
64!
65! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
66! unused variables removed
67!
68! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
69! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant
70! when using wall/soil spinup)
71!
72! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
73! Initial revision
74!
75!
76! Description:
77! ------------
78!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
79!------------------------------------------------------------------------------!
80 SUBROUTINE data_output_3d( av )
81 
82
83    USE arrays_3d,                                                             &
84        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
85
86    USE averaging
87
88    USE basic_constants_and_equations_mod,                                     &
89        ONLY:  lv_d_cp
90
91    USE bulk_cloud_model_mod,                                                  &
92        ONLY:  bulk_cloud_model
93
94    USE control_parameters,                                                    &
95        ONLY:  debug_output_timestep, do3d, do3d_no, do3d_time_count,          &
96               land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy,  &
97               psolver, time_since_reference_point, urban_surface,             &
98               varnamelength
99
100#if defined( __parallel )
101    USE control_parameters,                                                    &
102        ONLY:  io_blocks, io_group
103#endif
104
105    USE cpulog,                                                                &
106        ONLY:  log_point, cpu_log
107
108    USE indices,                                                               &
109        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt,     &
110               wall_flags_total_0
111
112#if ! defined( __parallel )
113    USE indices,                                                               &
114        ONLY:  nx, ny
115#endif
116
117    USE kinds
118
119    USE land_surface_model_mod,                                                &
120        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
121
122    USE module_interface,                                                      &
123        ONLY:  module_interface_data_output_3d
124
125#if defined( __netcdf )
126    USE NETCDF
127#endif
128
129    USE netcdf_interface,                                                      &
130        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
131               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
132
133    USE particle_attributes,                                                   &
134        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
135               particle_advection_start, prt_count
136
137    USE pegrid
138
139    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
140        ONLY:  pch_index
141
142    USE radiation_model_mod,                                                   &
143        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
144
145    USE urban_surface_mod,                                                     &
146        ONLY:  usm_data_output_3d
147
148
149    IMPLICIT NONE
150
151    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
152    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
153    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
154    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
155    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
156    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
157    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
158    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
159    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
160
161    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
162    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
163
164    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
165    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
166    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
167
168    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
169
170    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be output
171
172    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
173
174!
175!-- Return, if nothing to output
176    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
177
178    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
179
180    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
181
182!
183!-- Open output file.
184!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
185!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
186!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
187!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
188    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
189#if defined( __parallel )
190       CALL check_open( 30 )
191#endif
192       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
193    ELSE
194       CALL check_open( 106+av*10 )
195    ENDIF
196
197!
198!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
199!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
200!-- the given end time by the length of the given output interval.
201    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
202       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
203          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',               &
204                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ', & 
205                                      'number of output time levels is ',                   &
206                                      'exceeded.'
207          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
208          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
209          RETURN
210       ENDIF
211    ENDIF
212
213!
214!-- Update the netCDF time axis
215!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
216!-- performance.
217#if defined( __netcdf )
218    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
219    IF ( myid == 0 )  THEN
220       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
221                               (/ time_since_reference_point /),            &
222                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
223                               count = (/ 1 /) )
224       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
225    ENDIF
226#endif
227
228!
229!-- Loop over all variables to be written.
230    ivar = 1
231
232    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
233
234!
235!--    Initiate found flag and resorting flag
236       found = .FALSE.
237       resorted = .FALSE.
238       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
239
240!
241!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
242!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
243!--    Store the array chosen on the temporary array.
244       nzb_do   = nzb
245!
246!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model
247!--    these index is determined by pch_index.
248       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
249          nzt_do   = pch_index
250       ELSE
251          nzt_do   = nz_do3d
252       ENDIF
253
254!
255!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
256       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
257!
258!--    Before each output, set array local_pf to fill value
259       local_pf = fill_value
260!
261!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
262       flag_nr = 0
263
264       SELECT CASE ( trimvar )
265
266          CASE ( 'e' )
267             IF ( av == 0 )  THEN
268                to_be_resorted => e
269             ELSE
270                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) ) THEN
271                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
272                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
273                ENDIF
274                to_be_resorted => e_av
275             ENDIF
276
277          CASE ( 'thetal' )
278             IF ( av == 0 )  THEN
279                to_be_resorted => pt
280             ELSE
281                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) ) THEN
282                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
283                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
284                ENDIF
285                to_be_resorted => lpt_av
286             ENDIF
287
288          CASE ( 'p' )
289             IF ( av == 0 )  THEN
290                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
291                to_be_resorted => p
292             ELSE
293                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) ) THEN
294                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
295                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
296                ENDIF
297                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
298                to_be_resorted => p_av
299             ENDIF
300
301          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
302             IF ( av == 0 )  THEN
303                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
304                   tend = prt_count
305                ELSE
306                   tend = 0.0_wp
307                ENDIF
308                DO  i = nxl, nxr
309                   DO  j = nys, nyn
310                      DO  k = nzb_do, nzt_do
311                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
312                      ENDDO
313                   ENDDO
314                ENDDO
315                resorted = .TRUE.
316             ELSE
317                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) ) THEN
318                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
319                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
320                ENDIF
321                to_be_resorted => pc_av
322             ENDIF
323
324          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
325             IF ( av == 0 )  THEN
326                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
327                   DO  i = nxl, nxr
328                      DO  j = nys, nyn
329                         DO  k = nzb_do, nzt_do
330                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
331                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
332                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
333                            s_r2 = 0.0_wp
334                            s_r3 = 0.0_wp
335                            DO  n = 1, number_of_particles
336                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
337                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
338                                         particles(n)%weight_factor
339                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
340                                         particles(n)%weight_factor
341                               ENDIF
342                            ENDDO
343                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
344                               mean_r = s_r3 / s_r2
345                            ELSE
346                               mean_r = 0.0_wp
347                            ENDIF
348                            tend(k,j,i) = mean_r
349                         ENDDO
350                      ENDDO
351                   ENDDO
352                ELSE
353                   tend = 0.0_wp
354                ENDIF
355                DO  i = nxl, nxr
356                   DO  j = nys, nyn
357                      DO  k = nzb_do, nzt_do
358                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
359                      ENDDO
360                   ENDDO
361                ENDDO
362                resorted = .TRUE.
363             ELSE
364                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) ) THEN
365                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
366                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
367                ENDIF
368                to_be_resorted => pr_av
369             ENDIF
370
371          CASE ( 'theta' )
372             IF ( av == 0 )  THEN
373                IF ( .NOT. bulk_cloud_model ) THEN
374                   to_be_resorted => pt
375                ELSE
376                   DO  i = nxl, nxr
377                      DO  j = nys, nyn
378                         DO  k = nzb_do, nzt_do
379                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp *            &
380                                                          d_exner(k) *         &
381                                                          ql(k,j,i)
382                         ENDDO
383                      ENDDO
384                   ENDDO
385                   resorted = .TRUE.
386                ENDIF
387             ELSE
388                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) ) THEN
389                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
390                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
391                ENDIF
392                to_be_resorted => pt_av
393             ENDIF
394
395          CASE ( 'q' )
396             IF ( av == 0 )  THEN
397                to_be_resorted => q
398             ELSE
399                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) ) THEN
400                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
401                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
402                ENDIF
403                to_be_resorted => q_av
404             ENDIF
405
406          CASE ( 'ql' )
407             IF ( av == 0 )  THEN
408                to_be_resorted => ql
409             ELSE
410                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) ) THEN
411                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
412                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
413                ENDIF
414                to_be_resorted => ql_av
415             ENDIF
416
417          CASE ( 'ql_c' )
418             IF ( av == 0 )  THEN
419                to_be_resorted => ql_c
420             ELSE
421                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) ) THEN
422                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
423                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
424                ENDIF
425                to_be_resorted => ql_c_av
426             ENDIF
427
428          CASE ( 'ql_v' )
429             IF ( av == 0 )  THEN
430                to_be_resorted => ql_v
431             ELSE
432                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) ) THEN
433                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
434                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
435                ENDIF
436                to_be_resorted => ql_v_av
437             ENDIF
438
439          CASE ( 'ql_vp' )
440             IF ( av == 0 )  THEN
441                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
442                   DO  i = nxl, nxr
443                      DO  j = nys, nyn
444                         DO  k = nzb_do, nzt_do
445                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
446                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
447                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
448                            DO  n = 1, number_of_particles
449                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
450                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
451                                                 particles(n)%weight_factor /  &
452                                                 prt_count(k,j,i)
453                               ENDIF
454                            ENDDO
455                         ENDDO
456                      ENDDO
457                   ENDDO
458                ELSE
459                   tend = 0.0_wp
460                ENDIF
461                DO  i = nxl, nxr
462                   DO  j = nys, nyn
463                      DO  k = nzb_do, nzt_do
464                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
465                      ENDDO
466                   ENDDO
467                ENDDO
468                resorted = .TRUE.
469             ELSE
470                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) ) THEN
471                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
472                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
473                ENDIF
474                to_be_resorted => ql_vp_av
475             ENDIF
476
477          CASE ( 'qv' )
478             IF ( av == 0 )  THEN
479                DO  i = nxl, nxr
480                   DO  j = nys, nyn
481                      DO  k = nzb_do, nzt_do
482                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
483                      ENDDO
484                   ENDDO
485                ENDDO
486                resorted = .TRUE.
487             ELSE
488                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) ) THEN
489                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
490                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
491                ENDIF
492                to_be_resorted => qv_av
493             ENDIF
494
495          CASE ( 's' )
496             IF ( av == 0 )  THEN
497                to_be_resorted => s
498             ELSE
499                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) ) THEN
500                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
501                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
502                ENDIF
503                to_be_resorted => s_av
504             ENDIF
505
506          CASE ( 'u' )
507             flag_nr = 1
508             IF ( av == 0 )  THEN
509                to_be_resorted => u
510             ELSE
511                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) ) THEN
512                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
513                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
514                ENDIF
515                to_be_resorted => u_av
516             ENDIF
517
518          CASE ( 'v' )
519             flag_nr = 2
520             IF ( av == 0 )  THEN
521                to_be_resorted => v
522             ELSE
523                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) ) THEN
524                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
525                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
526                ENDIF
527                to_be_resorted => v_av
528             ENDIF
529
530          CASE ( 'thetav' )
531             IF ( av == 0 )  THEN
532                to_be_resorted => vpt
533             ELSE
534                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) ) THEN
535                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
536                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
537                ENDIF
538                to_be_resorted => vpt_av
539             ENDIF
540
541          CASE ( 'w' )
542             flag_nr = 3
543             IF ( av == 0 )  THEN
544                to_be_resorted => w
545             ELSE
546                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) ) THEN
547                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
548                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
549                ENDIF
550                to_be_resorted => w_av
551             ENDIF
552
553          CASE DEFAULT
554!
555!--          Quantities of other modules
556             IF ( .NOT. found )  THEN
557                CALL module_interface_data_output_3d(                          &
558                        av, trimvar, found, local_pf,                          &
559                        fill_value, resorted, nzb_do, nzt_do                   &
560                     )
561             ENDIF
562
563!
564!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
565             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
566!
567!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
568                nzb_do = nz_urban_b
569                nzt_do = nz_urban_t
570
571                DEALLOCATE ( local_pf )
572                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
573                local_pf = fill_value
574
575                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf,         &
576                                         nzb_do, nzt_do )
577                resorted = .TRUE.
578
579!
580!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
581                IF ( .NOT. found )  THEN
582                   nzb_do = nzb
583                   nzt_do = nz_do3d
584
585                   DEALLOCATE ( local_pf )
586                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
587                ENDIF
588
589             ENDIF
590
591!
592!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
593             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
594!
595!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
596                nzb_do = nzb_soil
597                nzt_do = nzt_soil
598
599                DEALLOCATE ( local_pf )
600                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
601                local_pf = fill_value
602
603                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
604                resorted = .TRUE.
605
606!
607!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
608                IF ( .NOT. found )  THEN
609                   nzb_do = nzb
610                   nzt_do = nz_do3d
611
612                   DEALLOCATE ( local_pf )
613                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
614                ENDIF
615
616             ENDIF
617
618             IF ( .NOT. found )  THEN
619                message_string =  'no output available for: ' //               &
620                                  TRIM( do3d(av,ivar) )
621                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
622             ENDIF
623
624       END SELECT
625
626!
627!--    Resort the array to be output, if not done above
628       IF ( .NOT. resorted )  THEN
629          DO  i = nxl, nxr
630             DO  j = nys, nyn
631                DO  k = nzb_do, nzt_do
632                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
633                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
634                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
635                                      BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
636                ENDDO
637             ENDDO
638          ENDDO
639       ENDIF
640
641!
642!--    Output of the 3D-array
643#if defined( __parallel )
644       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
645!
646!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
647!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
648!--       combine_plot_fields
649          IF ( myid == 0 )  THEN
650             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
651                           do3d_time_count(av), av
652          ENDIF
653          DO  i = 0, io_blocks-1
654             IF ( i == io_group )  THEN
655                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
656                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
657             ENDIF
658
659             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
660
661          ENDDO
662
663       ELSE
664#if defined( __netcdf )
665!
666!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
667!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
668!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
669!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
670!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
671!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
672!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
673!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
674!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
675!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
676!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
677!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
678!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
679!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
680!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
681!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
682!          ELSE
683             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
684                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
685                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
686                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
687!          ENDIF
688          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
689#endif
690       ENDIF
691#else
692#if defined( __netcdf )
693       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),        &
694                         local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),          &
695                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),       &
696                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
697       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
698#endif
699#endif
700
701       ivar = ivar + 1
702
703!
704!--    Deallocate temporary array
705       DEALLOCATE ( local_pf )
706
707    ENDDO
708
709    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
710
711    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
712
713
714 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.