source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4592

Last change on this file since 4592 was 4559, checked in by raasch, 4 years ago

files re-formatted to follow the PALM coding standard

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.3 KB
Line 
1!> @file data_output_3d.f90
2!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of the PALM model system.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General
6! Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7! (at your option) any later version.
8!
9! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the
10! implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General
11! Public License for more details.
12!
13! You should have received a copy of the GNU General Public License along with PALM. If not, see
14! <http://www.gnu.org/licenses/>.
15!
16! Copyright 1997-2020 Leibniz Universitaet Hannover
17!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
18!
19! Current revisions:
20! ------------------
21!
22!
23! Former revisions:
24! -----------------
25! $Id: data_output_3d.f90 4559 2020-06-11 08:51:48Z raasch $
26! file re-formatted to follow the PALM coding standard
27!
28! 4457 2020-03-11 14:20:43Z raasch
29! use statement for exchange horiz added
30!
31! 4444 2020-03-05 15:59:50Z raasch
32! bugfix: cpp-directives for serial mode added
33!
34! 4360 2020-01-07 11:25:50Z suehring
35! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static topography
36! information used in wall_flags_static_0
37!
38! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
39! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
40!
41! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
42! Corrected "Former revisions" section
43!
44! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
45! bugfix for r4155
46!
47! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
48! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
49!
50! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
51! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs (merge from branch resler)
52!
53! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
54! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
55!
56! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
57! modularize diagnostic output
58!
59! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
60! output of turbulence intensity added
61!
62! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
63! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
64!
65! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
66! Changes related to global restructuring of location messages and introduction of additional debug
67! messages
68!
69! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
70! unused variables removed
71!
72! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
73! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant when using wall/soil
74!         spinup)
75!
76! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
77! Initial revision
78!
79!
80! Description:
81! ------------
82!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
83!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
84 SUBROUTINE data_output_3d( av )
85
86
87    USE arrays_3d,                                                                                 &
88        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
89
90    USE averaging
91
92    USE basic_constants_and_equations_mod,                                                         &
93        ONLY:  lv_d_cp
94
95    USE bulk_cloud_model_mod,                                                                      &
96        ONLY:  bulk_cloud_model
97
98    USE control_parameters,                                                                        &
99        ONLY:  debug_output_timestep, do3d, do3d_no, do3d_time_count, land_surface, message_string,&
100               ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy, psolver, time_since_reference_point, urban_surface,&
101               varnamelength
102
103#if defined( __parallel )
104    USE control_parameters,                                                                        &
105        ONLY:  io_blocks, io_group
106#endif
107
108    USE cpulog,                                                                                    &
109        ONLY: cpu_log, log_point
110
111    USE exchange_horiz_mod,                                                                        &
112        ONLY:  exchange_horiz
113
114    USE indices,                                                                                   &
115        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt, wall_flags_total_0
116
117#if ! defined( __parallel )
118    USE indices,                                                                                   &
119        ONLY:  nx, ny
120#endif
121
122    USE kinds
123
124    USE land_surface_model_mod,                                                                    &
125        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
126
127    USE module_interface,                                                                          &
128        ONLY:  module_interface_data_output_3d
129
130#if defined( __netcdf )
131    USE NETCDF
132#endif
133
134    USE netcdf_interface,                                                                          &
135        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat, netcdf_data_format,    &
136               netcdf_handle_error
137
138    USE particle_attributes,                                                                       &
139        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles, particle_advection_start, prt_count
140
141    USE pegrid
142
143    USE plant_canopy_model_mod,                                                                    &
144        ONLY:  pch_index
145
146    USE radiation_model_mod,                                                                       &
147        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
148
149    USE urban_surface_mod,                                                                         &
150        ONLY:  usm_data_output_3d
151
152
153    IMPLICIT NONE
154
155    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
156    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
157    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
158    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
159    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
160    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
161    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
162    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
163    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
164
165    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
166    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
167
168    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
169    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
170    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
171
172    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
173
174    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be
175                                                            !< output
176
177    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
178
179!
180!-- Return, if nothing to output
181    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
182
183    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
184
185    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
186
187!
188!-- Open output file.
189!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its own file and writes
190!-- the data of its subdomain in binary format. After the run, these files are combined to one
191!-- NetCDF file by combine_plot_fields.
192!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
193    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
194#if defined( __parallel )
195       CALL check_open( 30 )
196#endif
197       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
198    ELSE
199       CALL check_open( 106+av*10 )
200    ENDIF
201
202!
203!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this limit is exceeded.
204!-- This could be the case, if the simulated time exceeds the given end time by the length of the
205!-- given output interval.
206    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
207       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
208          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',                      &
209                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ',        &
210                                      'number of output time levels is ',                          &
211                                      'exceeded.'
212          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
213          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
214          RETURN
215       ENDIF
216    ENDIF
217
218!
219!-- Update the netCDF time axis.
220!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the performance.
221#if defined( __netcdf )
222    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
223    IF ( myid == 0 )  THEN
224       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),                                  &
225                               (/ time_since_reference_point /),                                   &
226                               start = (/ do3d_time_count(av) /),                                  &
227                               count = (/ 1 /) )
228       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
229    ENDIF
230#endif
231
232!
233!-- Loop over all variables to be written.
234    ivar = 1
235
236    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
237
238!
239!--    Initiate found flag and resorting flag
240       found = .FALSE.
241       resorted = .FALSE.
242       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
243
244!
245!--    Temporary solution to account for data output within the new urban surface model
246!--    (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
247!--    Store the array chosen on the temporary array.
248       nzb_do   = nzb
249!
250!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model these index is determined by
251!--    pch_index.
252       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
253          nzt_do   = pch_index
254       ELSE
255          nzt_do   = nz_do3d
256       ENDIF
257
258!
259!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
260       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
261!
262!--    Before each output, set array local_pf to fill value
263       local_pf = fill_value
264!
265!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
266       flag_nr = 0
267
268       SELECT CASE ( trimvar )
269
270          CASE ( 'e' )
271             IF ( av == 0 )  THEN
272                to_be_resorted => e
273             ELSE
274                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) )  THEN
275                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
276                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
277                ENDIF
278                to_be_resorted => e_av
279             ENDIF
280
281          CASE ( 'thetal' )
282             IF ( av == 0 )  THEN
283                to_be_resorted => pt
284             ELSE
285                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) )  THEN
286                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
287                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
288                ENDIF
289                to_be_resorted => lpt_av
290             ENDIF
291
292          CASE ( 'p' )
293             IF ( av == 0 )  THEN
294                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
295                to_be_resorted => p
296             ELSE
297                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) )  THEN
298                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
299                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
300                ENDIF
301                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
302                to_be_resorted => p_av
303             ENDIF
304
305          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
306             IF ( av == 0 )  THEN
307                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
308                   tend = prt_count
309                ELSE
310                   tend = 0.0_wp
311                ENDIF
312                DO  i = nxl, nxr
313                   DO  j = nys, nyn
314                      DO  k = nzb_do, nzt_do
315                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
316                      ENDDO
317                   ENDDO
318                ENDDO
319                resorted = .TRUE.
320             ELSE
321                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) )  THEN
322                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
323                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
324                ENDIF
325                to_be_resorted => pc_av
326             ENDIF
327
328          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
329             IF ( av == 0 )  THEN
330                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
331                   DO  i = nxl, nxr
332                      DO  j = nys, nyn
333                         DO  k = nzb_do, nzt_do
334                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
335                            IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
336                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
337                            s_r2 = 0.0_wp
338                            s_r3 = 0.0_wp
339                            DO  n = 1, number_of_particles
340                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
341                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * particles(n)%weight_factor
342                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * particles(n)%weight_factor
343                               ENDIF
344                            ENDDO
345                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
346                               mean_r = s_r3 / s_r2
347                            ELSE
348                               mean_r = 0.0_wp
349                            ENDIF
350                            tend(k,j,i) = mean_r
351                         ENDDO
352                      ENDDO
353                   ENDDO
354                ELSE
355                   tend = 0.0_wp
356                ENDIF
357                DO  i = nxl, nxr
358                   DO  j = nys, nyn
359                      DO  k = nzb_do, nzt_do
360                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
361                      ENDDO
362                   ENDDO
363                ENDDO
364                resorted = .TRUE.
365             ELSE
366                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) )  THEN
367                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
368                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
369                ENDIF
370                to_be_resorted => pr_av
371             ENDIF
372
373          CASE ( 'theta' )
374             IF ( av == 0 )  THEN
375                IF ( .NOT. bulk_cloud_model )  THEN
376                   to_be_resorted => pt
377                ELSE
378                   DO  i = nxl, nxr
379                      DO  j = nys, nyn
380                         DO  k = nzb_do, nzt_do
381                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp * d_exner(k) * ql(k,j,i)
382                         ENDDO
383                      ENDDO
384                   ENDDO
385                   resorted = .TRUE.
386                ENDIF
387             ELSE
388                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) )  THEN
389                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
390                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
391                ENDIF
392                to_be_resorted => pt_av
393             ENDIF
394
395          CASE ( 'q' )
396             IF ( av == 0 )  THEN
397                to_be_resorted => q
398             ELSE
399                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) )  THEN
400                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
401                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
402                ENDIF
403                to_be_resorted => q_av
404             ENDIF
405
406          CASE ( 'ql' )
407             IF ( av == 0 )  THEN
408                to_be_resorted => ql
409             ELSE
410                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) )  THEN
411                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
412                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
413                ENDIF
414                to_be_resorted => ql_av
415             ENDIF
416
417          CASE ( 'ql_c' )
418             IF ( av == 0 )  THEN
419                to_be_resorted => ql_c
420             ELSE
421                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) )  THEN
422                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
423                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
424                ENDIF
425                to_be_resorted => ql_c_av
426             ENDIF
427
428          CASE ( 'ql_v' )
429             IF ( av == 0 )  THEN
430                to_be_resorted => ql_v
431             ELSE
432                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) )  THEN
433                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
434                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
435                ENDIF
436                to_be_resorted => ql_v_av
437             ENDIF
438
439          CASE ( 'ql_vp' )
440             IF ( av == 0 )  THEN
441                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
442                   DO  i = nxl, nxr
443                      DO  j = nys, nyn
444                         DO  k = nzb_do, nzt_do
445                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
446                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
447                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
448                            DO  n = 1, number_of_particles
449                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
450                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                                     &
451                                                 particles(n)%weight_factor / prt_count(k,j,i)
452                               ENDIF
453                            ENDDO
454                         ENDDO
455                      ENDDO
456                   ENDDO
457                ELSE
458                   tend = 0.0_wp
459                ENDIF
460                DO  i = nxl, nxr
461                   DO  j = nys, nyn
462                      DO  k = nzb_do, nzt_do
463                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
464                      ENDDO
465                   ENDDO
466                ENDDO
467                resorted = .TRUE.
468             ELSE
469                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) )  THEN
470                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
471                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
472                ENDIF
473                to_be_resorted => ql_vp_av
474             ENDIF
475
476          CASE ( 'qv' )
477             IF ( av == 0 )  THEN
478                DO  i = nxl, nxr
479                   DO  j = nys, nyn
480                      DO  k = nzb_do, nzt_do
481                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
482                      ENDDO
483                   ENDDO
484                ENDDO
485                resorted = .TRUE.
486             ELSE
487                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) )  THEN
488                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
489                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
490                ENDIF
491                to_be_resorted => qv_av
492             ENDIF
493
494          CASE ( 's' )
495             IF ( av == 0 )  THEN
496                to_be_resorted => s
497             ELSE
498                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) )  THEN
499                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
500                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
501                ENDIF
502                to_be_resorted => s_av
503             ENDIF
504
505          CASE ( 'u' )
506             flag_nr = 1
507             IF ( av == 0 )  THEN
508                to_be_resorted => u
509             ELSE
510                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) )  THEN
511                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
512                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
513                ENDIF
514                to_be_resorted => u_av
515             ENDIF
516
517          CASE ( 'v' )
518             flag_nr = 2
519             IF ( av == 0 )  THEN
520                to_be_resorted => v
521             ELSE
522                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) )  THEN
523                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
524                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
525                ENDIF
526                to_be_resorted => v_av
527             ENDIF
528
529          CASE ( 'thetav' )
530             IF ( av == 0 )  THEN
531                to_be_resorted => vpt
532             ELSE
533                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) )  THEN
534                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
535                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
536                ENDIF
537                to_be_resorted => vpt_av
538             ENDIF
539
540          CASE ( 'w' )
541             flag_nr = 3
542             IF ( av == 0 )  THEN
543                to_be_resorted => w
544             ELSE
545                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) )  THEN
546                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
547                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
548                ENDIF
549                to_be_resorted => w_av
550             ENDIF
551
552          CASE DEFAULT
553!
554!--          Quantities of other modules
555             IF ( .NOT. found )  THEN
556                CALL module_interface_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, fill_value,    &
557                                                      resorted, nzb_do, nzt_do                     &
558                                                    )
559             ENDIF
560
561!
562!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
563             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
564!
565!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
566                nzb_do = nz_urban_b
567                nzt_do = nz_urban_t
568
569                DEALLOCATE ( local_pf )
570                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
571                local_pf = fill_value
572
573                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, nzb_do, nzt_do )
574                resorted = .TRUE.
575
576!
577!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
578                IF ( .NOT. found )  THEN
579                   nzb_do = nzb
580                   nzt_do = nz_do3d
581
582                   DEALLOCATE ( local_pf )
583                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
584                ENDIF
585
586             ENDIF
587
588!
589!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
590             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
591!
592!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
593                nzb_do = nzb_soil
594                nzt_do = nzt_soil
595
596                DEALLOCATE ( local_pf )
597                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
598                local_pf = fill_value
599
600                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
601                resorted = .TRUE.
602
603!
604!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
605                IF ( .NOT. found )  THEN
606                   nzb_do = nzb
607                   nzt_do = nz_do3d
608
609                   DEALLOCATE ( local_pf )
610                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
611                ENDIF
612
613             ENDIF
614
615             IF ( .NOT. found )  THEN
616                message_string =  'no output available for: ' // TRIM( do3d(av,ivar) )
617                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
618             ENDIF
619
620       END SELECT
621
622!
623!--    Resort the array to be output, if not done above
624       IF ( .NOT. resorted )  THEN
625          DO  i = nxl, nxr
626             DO  j = nys, nyn
627                DO  k = nzb_do, nzt_do
628                   local_pf(i,j,k) = MERGE( to_be_resorted(k,j,i),                                 &
629                                            REAL( fill_value, KIND = wp ),                         &
630                                            BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
631                ENDDO
632             ENDDO
633          ENDDO
634       ENDIF
635
636!
637!--    Output of the 3D-array
638#if defined( __parallel )
639       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
640!
641!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in FORTRAN binary format here, and
642!--       later collected into one file by combine_plot_fields
643          IF ( myid == 0 )  THEN
644             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point, do3d_time_count(av), av
645          ENDIF
646          DO  i = 0, io_blocks-1
647             IF ( i == io_group )  THEN
648                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
649                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
650             ENDIF
651
652             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
653
654          ENDDO
655
656       ELSE
657#if defined( __netcdf )
658!
659!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
660!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
661!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
662!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
663!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
664!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
665!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
666!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
667!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
668!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
669!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
670!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
671!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
672!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
673!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
674!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
675!          ELSE
676             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                          &
677                                     local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                      &
678                                     start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),    &
679                                     count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /)        &
680                                   )
681!          ENDIF
682          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
683#endif
684       ENDIF
685#else
686#if defined( __netcdf )
687       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                                &
688                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                            &
689                               start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),                         &
690                               count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
691       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
692#endif
693#endif
694
695       ivar = ivar + 1
696
697!
698!--    Deallocate temporary array
699       DEALLOCATE ( local_pf )
700
701    ENDDO
702
703    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
704
705    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
706
707
708 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.