source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4313

Last change on this file since 4313 was 4182, checked in by scharf, 22 months ago
  • corrected "Former revisions" section
  • minor formatting in "Former revisions" section
  • added "Author" section
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 25.5 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[2000]2!------------------------------------------------------------------------------!
[2696]3! This file is part of the PALM model system.
[1036]4!
[2000]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
[1036]9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
[3655]17! Copyright 1997-2019 Leibniz Universitaet Hannover
[2000]18!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]19!
[254]20! Current revisions:
[1106]21! ------------------
[3589]22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 4182 2019-08-22 15:20:23Z suehring $
[4182]27! Corrected "Former revisions" section
28!
29! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
[4162]30! bugfix for r4155
31!
32! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
[4155]33! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
34!
35! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
[4127]36! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs
37! (merge from branch resler)
38!
39! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
[4048]40! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
41!
42! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
[4039]43! modularize diagnostic output
44!
45! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
[3994]46! output of turbulence intensity added
47!
48! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
[3987]49! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
50!
51! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
[3885]52! Changes related to global restructuring of location messages and introduction
53! of additional debug messages
54!
55! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
[3766]56! unused variables removed
57!
58! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
[3646]59! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant
60! when using wall/soil spinup)
[3582]61!
[4182]62! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
63! Initial revision
64!
65!
[1]66! Description:
67! ------------
[1682]68!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[1]69!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]70 SUBROUTINE data_output_3d( av )
71 
[1]72
[1320]73    USE arrays_3d,                                                             &
[3766]74        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
[3274]75
[1]76    USE averaging
[3274]77
78    USE basic_constants_and_equations_mod,                                     &
79        ONLY:  lv_d_cp
80
81    USE bulk_cloud_model_mod,                                                  &
[3637]82        ONLY:  bulk_cloud_model
[3274]83
[1320]84    USE control_parameters,                                                    &
[3987]85        ONLY:  debug_output_timestep,                                          &
[3885]86               do3d, do3d_no, do3d_time_count, io_blocks, io_group,            &
[4127]87               land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy,  &
88               psolver, time_since_reference_point, urban_surface,             &
89               varnamelength
[3274]90
[1320]91    USE cpulog,                                                                &
92        ONLY:  log_point, cpu_log
[2817]93
[3405]94#if defined( __parallel )
[1320]95    USE indices,                                                               &
[3241]96        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt,     &
97               wall_flags_0
[3405]98#else
99    USE indices,                                                               &
100        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxlg, nxr, nxrg, ny, nyn, nyng, nys, nysg, nzb,  &
101               nzt, wall_flags_0
102#endif
[3274]103
[1320]104    USE kinds
[3274]105
[1551]106    USE land_surface_model_mod,                                                &
[2232]107        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]108
[3637]109    USE module_interface,                                                      &
110        ONLY:  module_interface_data_output_3d
111
[1783]112#if defined( __netcdf )
113    USE NETCDF
114#endif
115
116    USE netcdf_interface,                                                      &
[2696]117        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
[1783]118               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[3294]119
[1320]120    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]121        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
122               particle_advection_start, prt_count
[3637]123
[1]124    USE pegrid
125
[4127]126    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
127        ONLY:  pch_index
128
[1585]129    USE radiation_model_mod,                                                   &
[3814]130        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
[1585]131
[2007]132    USE urban_surface_mod,                                                     &
[2696]133        ONLY:  usm_data_output_3d
[1585]134
[2007]135
[1]136    IMPLICIT NONE
137
[3554]138    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
[2696]139    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
[3554]140    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
141    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
142    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
143    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
144    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
[1682]145    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
146    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]147
[3554]148    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
149    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
[1]150
[3554]151    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
152    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
153    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
[1]154
[3554]155    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
[1]156
[3554]157    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be output
[1]158
[2011]159    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]160
[1]161!
162!-- Return, if nothing to output
163    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
164
[3987]165    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
[3885]166
[1]167    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
168
169!
170!-- Open output file.
[2512]171!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
172!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
173!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]174!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]175    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[2967]176#if defined( __parallel )
[1327]177       CALL check_open( 30 )
[2967]178#endif
[1327]179       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]180    ELSE
[1327]181       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]182    ENDIF
[1]183
184!
[1745]185!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
186!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
187!-- the given end time by the length of the given output interval.
188    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
189       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
[3646]190          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',               &
191                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ', & 
192                                      'number of output time levels is ',                   &
[1745]193                                      'exceeded.'
194          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
195          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
196          RETURN
197       ENDIF
198    ENDIF
199
200!
[1031]201!-- Update the netCDF time axis
[1308]202!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
203!-- performance.
[1]204#if defined( __netcdf )
[1308]205    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
206    IF ( myid == 0 )  THEN
[1327]207       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
208                               (/ time_since_reference_point /),            &
209                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
210                               count = (/ 1 /) )
[1783]211       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]212    ENDIF
213#endif
214
215!
216!-- Loop over all variables to be written.
[3554]217    ivar = 1
[1]218
[3554]219    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
[2007]220
[1]221!
[3637]222!--    Initiate found flag and resorting flag
223       found = .FALSE.
224       resorted = .FALSE.
[4127]225       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
226
[3637]227!
228!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
[2007]229!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]230!--    Store the array chosen on the temporary array.
[3637]231       nzb_do   = nzb
[4127]232!
233!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model
234!--    these index is determined by pch_index.
235       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
236          nzt_do   = pch_index
237       ELSE
238          nzt_do   = nz_do3d
239       ENDIF
[3637]240
[1551]241!
242!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]243       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]244!
245!--    Before each output, set array local_pf to fill value
246       local_pf = fill_value
247!
248!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
249       flag_nr = 0
[1551]250
[2007]251       SELECT CASE ( trimvar )
[1]252
253          CASE ( 'e' )
254             IF ( av == 0 )  THEN
255                to_be_resorted => e
256             ELSE
[3004]257                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) ) THEN
258                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
259                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
260                ENDIF
[1]261                to_be_resorted => e_av
262             ENDIF
263
[3421]264          CASE ( 'thetal' )
[771]265             IF ( av == 0 )  THEN
266                to_be_resorted => pt
267             ELSE
[3004]268                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) ) THEN
269                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
270                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
271                ENDIF
[771]272                to_be_resorted => lpt_av
273             ENDIF
274
[1]275          CASE ( 'p' )
276             IF ( av == 0 )  THEN
[727]277                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]278                to_be_resorted => p
279             ELSE
[3004]280                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) ) THEN
281                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
282                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
283                ENDIF
[727]284                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]285                to_be_resorted => p_av
286             ENDIF
287
288          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
289             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]290                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]291                   tend = prt_count
292                ELSE
293                   tend = 0.0_wp
294                ENDIF
[2512]295                DO  i = nxl, nxr
296                   DO  j = nys, nyn
[1551]297                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]298                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
299                      ENDDO
300                   ENDDO
301                ENDDO
302                resorted = .TRUE.
303             ELSE
[3004]304                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) ) THEN
305                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
306                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
307                ENDIF
[1]308                to_be_resorted => pc_av
309             ENDIF
310
[1359]311          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]312             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]313                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]314                   DO  i = nxl, nxr
315                      DO  j = nys, nyn
[1551]316                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]317                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
318                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
319                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
320                            s_r2 = 0.0_wp
321                            s_r3 = 0.0_wp
322                            DO  n = 1, number_of_particles
323                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
324                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
325                                         particles(n)%weight_factor
326                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
327                                         particles(n)%weight_factor
328                               ENDIF
329                            ENDDO
330                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
331                               mean_r = s_r3 / s_r2
332                            ELSE
333                               mean_r = 0.0_wp
334                            ENDIF
335                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]336                         ENDDO
337                      ENDDO
338                   ENDDO
[1359]339                ELSE
340                   tend = 0.0_wp
341                ENDIF
[2512]342                DO  i = nxl, nxr
343                   DO  j = nys, nyn
[1551]344                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]345                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
346                      ENDDO
347                   ENDDO
348                ENDDO
349                resorted = .TRUE.
350             ELSE
[3004]351                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) ) THEN
352                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
353                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
354                ENDIF
[1]355                to_be_resorted => pr_av
356             ENDIF
357
[3421]358          CASE ( 'theta' )
[1]359             IF ( av == 0 )  THEN
[3274]360                IF ( .NOT. bulk_cloud_model ) THEN
[1]361                   to_be_resorted => pt
362                ELSE
[2512]363                   DO  i = nxl, nxr
364                      DO  j = nys, nyn
[1551]365                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[3274]366                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp *            &
367                                                          d_exner(k) *         &
[1]368                                                          ql(k,j,i)
369                         ENDDO
370                      ENDDO
371                   ENDDO
372                   resorted = .TRUE.
373                ENDIF
374             ELSE
[3004]375                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) ) THEN
376                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
377                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
378                ENDIF
[1]379                to_be_resorted => pt_av
380             ENDIF
381
382          CASE ( 'q' )
383             IF ( av == 0 )  THEN
384                to_be_resorted => q
385             ELSE
[3004]386                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) ) THEN
387                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
388                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
389                ENDIF
[1]390                to_be_resorted => q_av
391             ENDIF
[691]392
[1053]393          CASE ( 'ql' )
394             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]395                to_be_resorted => ql
[1053]396             ELSE
[3004]397                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) ) THEN
398                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
399                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
400                ENDIF
[1115]401                to_be_resorted => ql_av
[1053]402             ENDIF
403
[1]404          CASE ( 'ql_c' )
405             IF ( av == 0 )  THEN
406                to_be_resorted => ql_c
407             ELSE
[3004]408                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) ) THEN
409                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
410                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
411                ENDIF
[1]412                to_be_resorted => ql_c_av
413             ENDIF
414
415          CASE ( 'ql_v' )
416             IF ( av == 0 )  THEN
417                to_be_resorted => ql_v
418             ELSE
[3004]419                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) ) THEN
420                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
421                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
422                ENDIF
[1]423                to_be_resorted => ql_v_av
424             ENDIF
425
426          CASE ( 'ql_vp' )
427             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]428                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]429                   DO  i = nxl, nxr
430                      DO  j = nys, nyn
[1551]431                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]432                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
433                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
434                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
435                            DO  n = 1, number_of_particles
436                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
437                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
438                                                 particles(n)%weight_factor /  &
439                                                 prt_count(k,j,i)
440                               ENDIF
441                            ENDDO
[1007]442                         ENDDO
443                      ENDDO
444                   ENDDO
[1359]445                ELSE
446                   tend = 0.0_wp
447                ENDIF
[2512]448                DO  i = nxl, nxr
449                   DO  j = nys, nyn
[1551]450                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]451                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
452                      ENDDO
453                   ENDDO
454                ENDDO
455                resorted = .TRUE.
[1]456             ELSE
[3004]457                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) ) THEN
458                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
459                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
460                ENDIF
[1]461                to_be_resorted => ql_vp_av
462             ENDIF
463
464          CASE ( 'qv' )
465             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]466                DO  i = nxl, nxr
467                   DO  j = nys, nyn
[1551]468                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]469                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
470                      ENDDO
471                   ENDDO
472                ENDDO
473                resorted = .TRUE.
474             ELSE
[3004]475                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) ) THEN
476                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
477                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
478                ENDIF
[1]479                to_be_resorted => qv_av
480             ENDIF
481
482          CASE ( 's' )
483             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]484                to_be_resorted => s
[1]485             ELSE
[3004]486                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) ) THEN
487                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
488                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
489                ENDIF
[355]490                to_be_resorted => s_av
[1]491             ENDIF
[691]492
[1]493          CASE ( 'u' )
[2696]494             flag_nr = 1
[1]495             IF ( av == 0 )  THEN
496                to_be_resorted => u
497             ELSE
[3004]498                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) ) THEN
499                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
500                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
501                ENDIF
[1]502                to_be_resorted => u_av
503             ENDIF
504
505          CASE ( 'v' )
[2696]506             flag_nr = 2
[1]507             IF ( av == 0 )  THEN
508                to_be_resorted => v
509             ELSE
[3004]510                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) ) THEN
511                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
512                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
513                ENDIF
[1]514                to_be_resorted => v_av
515             ENDIF
516
[3421]517          CASE ( 'thetav' )
[1]518             IF ( av == 0 )  THEN
519                to_be_resorted => vpt
520             ELSE
[3004]521                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) ) THEN
522                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
523                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
524                ENDIF
[1]525                to_be_resorted => vpt_av
526             ENDIF
527
528          CASE ( 'w' )
[2696]529             flag_nr = 3
[1]530             IF ( av == 0 )  THEN
531                to_be_resorted => w
532             ELSE
[3004]533                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) ) THEN
534                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
535                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
536                ENDIF
[1]537                to_be_resorted => w_av
538             ENDIF
539
540          CASE DEFAULT
[3637]541!
542!--          Quantities of other modules
543             IF ( .NOT. found )  THEN
544                CALL module_interface_data_output_3d(                          &
545                        av, trimvar, found, local_pf,                          &
546                        fill_value, resorted, nzb_do, nzt_do                   &
547                     )
[3294]548             ENDIF
549
[1972]550!
[3637]551!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
552             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
553!
554!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
[3814]555                nzb_do = nz_urban_b
556                nzt_do = nz_urban_t
[1972]557
558                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]559                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]560                local_pf = fill_value
[1972]561
[3637]562                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf,         &
563                                         nzb_do, nzt_do )
[1972]564                resorted = .TRUE.
[1976]565
566!
567!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
568                IF ( .NOT. found )  THEN
569                   nzb_do = nzb
570                   nzt_do = nz_do3d
571
572                   DEALLOCATE ( local_pf )
[3637]573                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[1976]574                ENDIF
575
[1972]576             ENDIF
577
[3637]578!
579!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
580             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
581!
582!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
583                nzb_do = nzb_soil
584                nzt_do = nzt_soil
[1976]585
[3637]586                DEALLOCATE ( local_pf )
587                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
588                local_pf = fill_value
[2817]589
[3637]590                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
[2696]591                resorted = .TRUE.
592
[3467]593!
[3637]594!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
595                IF ( .NOT. found )  THEN
596                   nzb_do = nzb
597                   nzt_do = nz_do3d
[2209]598
[3637]599                   DEALLOCATE ( local_pf )
600                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
601                ENDIF
[3448]602
[1972]603             ENDIF
[1]604
[254]605             IF ( .NOT. found )  THEN
[1320]606                message_string =  'no output available for: ' //               &
[3554]607                                  TRIM( do3d(av,ivar) )
[254]608                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]609             ENDIF
610
611       END SELECT
612
613!
614!--    Resort the array to be output, if not done above
615       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]616          DO  i = nxl, nxr
617             DO  j = nys, nyn
[1551]618                DO  k = nzb_do, nzt_do
[2696]619                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
620                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
621                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
622                                      BTEST( wall_flags_0(k,j,i), flag_nr ) )
[1]623                ENDDO
624             ENDDO
625          ENDDO
626       ENDIF
627
628!
[1327]629!--    Output of the 3D-array
630#if defined( __parallel )
631       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]632!
[1327]633!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
634!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
635!--       combine_plot_fields
636          IF ( myid == 0 )  THEN
637             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
638                           do3d_time_count(av), av
[1]639          ENDIF
[1327]640          DO  i = 0, io_blocks-1
641             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]642                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[1551]643                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]644             ENDIF
[1972]645
[1327]646             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]647
[1327]648          ENDDO
[559]649
[1327]650       ELSE
[646]651#if defined( __netcdf )
[493]652!
[1327]653!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]654!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
[3554]655!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]656!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
657!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
658!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
659!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]660!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]661!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
662!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
663!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
664!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]665!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]666!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
667!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
668!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
669!          ELSE
[3554]670             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[1551]671                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
672                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
673                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[2512]674!          ENDIF
[1783]675          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]676#endif
[1327]677       ENDIF
[1]678#else
679#if defined( __netcdf )
[3554]680       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),        &
[4155]681                         local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),          &
682                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),       &
[4162]683                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]684       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]685#endif
686#endif
687
[3554]688       ivar = ivar + 1
[1]689
690!
[1551]691!--    Deallocate temporary array
692       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]693
[1551]694    ENDDO
[1]695
[1318]696    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]697
[3987]698    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
[3885]699
[3987]700
[1]701 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.