source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 2845

Last change on this file since 2845 was 2817, checked in by knoop, 7 years ago

Preliminary gust module interface implemented

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 27.7 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[2000]2!------------------------------------------------------------------------------!
[2696]3! This file is part of the PALM model system.
[1036]4!
[2000]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
[1036]9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
[2718]17! Copyright 1997-2018 Leibniz Universitaet Hannover
[2000]18!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]19!
[254]20! Current revisions:
[1106]21! ------------------
[1961]22!
[2233]23!
[1552]24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 2817 2018-02-19 16:32:21Z raasch $
[2817]27! Preliminary gust module interface implemented
28!
29! 2766 2018-01-22 17:17:47Z kanani
[2766]30! Removed preprocessor directive __chem
31!
32! 2756 2018-01-16 18:11:14Z suehring
[2756]33! Fill values for 3D output of chemical species introduced.
34!
35! 2746 2018-01-15 12:06:04Z suehring
[2746]36! Move flag plant canopy to modules
37!
38! 2718 2018-01-02 08:49:38Z maronga
[2716]39! Corrected "Former revisions" section
40!
41! 2696 2017-12-14 17:12:51Z kanani
42! Change in file header (GPL part)
[2696]43! Implementation of turbulence_closure_mod (TG)
44! Implementation of chemistry module (FK)
45! Set fill values at topography grid points or e.g. non-natural-type surface
46! in case of LSM output (MS)
47!
48! 2512 2017-10-04 08:26:59Z raasch
[2512]49! upper bounds of 3d output changed from nx+1,ny+1 to nx,ny
50! no output of ghost layer data
51!
52! 2292 2017-06-20 09:51:42Z schwenkel
[2292]53! Implementation of new microphysic scheme: cloud_scheme = 'morrison'
54! includes two more prognostic equations for cloud drop concentration (nc) 
55! and cloud water content (qc).
56!
57! 2233 2017-05-30 18:08:54Z suehring
[1552]58!
[2233]59! 2232 2017-05-30 17:47:52Z suehring
60! Adjustments to new topography concept
61!
[2210]62! 2209 2017-04-19 09:34:46Z kanani
63! Added plant canopy model output
64!
[2032]65! 2031 2016-10-21 15:11:58Z knoop
66! renamed variable rho to rho_ocean and rho_av to rho_ocean_av
67!
[2012]68! 2011 2016-09-19 17:29:57Z kanani
69! Flag urban_surface is now defined in module control_parameters,
70! changed prefix for urban surface model output to "usm_",
71! introduced control parameter varnamelength for LEN of trimvar.
72!
[2008]73! 2007 2016-08-24 15:47:17Z kanani
74! Added support for new urban surface model (temporary modifications of
75! SELECT CASE ( ) necessary, see variable trimvar)
76!
[2001]77! 2000 2016-08-20 18:09:15Z knoop
78! Forced header and separation lines into 80 columns
79!
[1981]80! 1980 2016-07-29 15:51:57Z suehring
81! Bugfix, in order to steer user-defined output, setting flag found explicitly
82! to .F.
83!
[1977]84! 1976 2016-07-27 13:28:04Z maronga
85! Output of radiation quantities is now done directly in the respective module
86!
[1973]87! 1972 2016-07-26 07:52:02Z maronga
88! Output of land surface quantities is now done directly in the respective module.
89! Unnecessary directive __parallel removed.
90!
[1961]91! 1960 2016-07-12 16:34:24Z suehring
92! Scalar surface flux added
93!
[1851]94! 1849 2016-04-08 11:33:18Z hoffmann
95! prr moved to arrays_3d
96!
[1823]97! 1822 2016-04-07 07:49:42Z hoffmann
98! prr vertical dimensions set to nzb_do to nzt_do. Unused variables deleted.
99!
[1809]100! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
101! test output removed
102!
[1784]103! 1783 2016-03-06 18:36:17Z raasch
104! name change of netcdf routines and module + related changes
105!
[1746]106! 1745 2016-02-05 13:06:51Z gronemeier
107! Bugfix: test if time axis limit exceeds moved to point after call of check_open
108!
[1692]109! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
110! Added output of radiative heating rates for RRTMG
111!
[1683]112! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
113! Code annotations made doxygen readable
114!
[1586]115! 1585 2015-04-30 07:05:52Z maronga
116! Added support for RRTMG
117!
[1552]118! 1551 2015-03-03 14:18:16Z maronga
[1551]119! Added suppport for land surface model and radiation model output. In the course
120! of this action, the limits for vertical loops have been changed (from nzb and
121! nzt+1 to nzb_do and nzt_do, respectively in order to allow soil model output).
122! Moreover, a new vertical grid zs was introduced.
[1329]123!
[1360]124! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
125! New particle structure integrated.
126!
[1354]127! 1353 2014-04-08 15:21:23Z heinze
128! REAL constants provided with KIND-attribute
129!
[1329]130! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
131! parts concerning avs output removed,
132! -netcdf output queries
133!
[1321]134! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
[1320]135! ONLY-attribute added to USE-statements,
136! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
137! kinds are defined in new module kinds,
138! old module precision_kind is removed,
139! revision history before 2012 removed,
140! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
141! all variable declaration statements
[674]142!
[1319]143! 1318 2014-03-17 13:35:16Z raasch
144! barrier argument removed from cpu_log,
145! module interfaces removed
146!
[1309]147! 1308 2014-03-13 14:58:42Z fricke
148! Check, if the limit of the time dimension is exceeded for parallel output
149! To increase the performance for parallel output, the following is done:
150! - Update of time axis is only done by PE0
151!
[1245]152! 1244 2013-10-31 08:16:56Z raasch
153! Bugfix for index bounds in case of 3d-parallel output
154!
[1116]155! 1115 2013-03-26 18:16:16Z hoffmann
156! ql is calculated by calc_liquid_water_content
157!
[1107]158! 1106 2013-03-04 05:31:38Z raasch
159! array_kind renamed precision_kind
160!
[1077]161! 1076 2012-12-05 08:30:18Z hoffmann
162! Bugfix in output of ql
163!
[1054]164! 1053 2012-11-13 17:11:03Z hoffmann
165! +nr, qr, prr, qc and averaged quantities
166!
[1037]167! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
168! code put under GPL (PALM 3.9)
169!
[1035]170! 1031 2012-10-19 14:35:30Z raasch
171! netCDF4 without parallel file support implemented
172!
[1008]173! 1007 2012-09-19 14:30:36Z franke
174! Bugfix: missing calculation of ql_vp added
175!
[1]176! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
177! Initial revision
178!
179!
180! Description:
181! ------------
[1682]182!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[1]183!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]184 SUBROUTINE data_output_3d( av )
185 
[1]186
[1320]187    USE arrays_3d,                                                             &
[2292]188        ONLY:  e, nc, nr, p, pt, prr, q, qc, ql, ql_c, ql_v, qr, rho_ocean, s, &
189               sa, tend, u, v, vpt, w
[1320]190       
[1]191    USE averaging
[1320]192       
[2696]193    USE chemistry_model_mod,                                                   &
194        ONLY:  chem_data_output_3d
195
[1320]196    USE cloud_parameters,                                                      &
[1849]197        ONLY:  l_d_cp, pt_d_t
[1320]198       
199    USE control_parameters,                                                    &
[2696]200        ONLY:  air_chemistry, cloud_physics, do3d, do3d_no, do3d_time_count,   &
201               io_blocks, io_group, land_surface, message_string,              &
[2746]202               ntdim_3d, nz_do3d,  plant_canopy,                               &
[2232]203               psolver, simulated_time, time_since_reference_point,            &
204               urban_surface, varnamelength
[1320]205       
206    USE cpulog,                                                                &
207        ONLY:  log_point, cpu_log
[2817]208
209    USE gust_mod,                                                              &
210        ONLY: gust_data_output_3d, gust_module_enabled
[1320]211       
212    USE indices,                                                               &
[2696]213        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxr, ny, nyn, nys, nzb, wall_flags_0
[1320]214       
215    USE kinds
216   
[1551]217    USE land_surface_model_mod,                                                &
[2232]218        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]219
[1783]220#if defined( __netcdf )
221    USE NETCDF
222#endif
223
224    USE netcdf_interface,                                                      &
[2696]225        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
[1783]226               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[1320]227       
228    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]229        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
230               particle_advection_start, prt_count
[1320]231       
[1]232    USE pegrid
233
[2209]234    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
[2746]235        ONLY:  pcm_data_output_3d
[2209]236       
[1585]237    USE radiation_model_mod,                                                   &
[2696]238        ONLY:  nzub, nzut, radiation, radiation_data_output_3d
[1585]239
[2696]240    USE turbulence_closure_mod,                                                &
241        ONLY:  tcm_data_output_3d
242
[2007]243    USE urban_surface_mod,                                                     &
[2696]244        ONLY:  usm_data_output_3d
[1585]245
[2007]246
[1]247    IMPLICIT NONE
248
[1682]249    INTEGER(iwp) ::  av        !<
[2696]250    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
[1682]251    INTEGER(iwp) ::  i         !<
252    INTEGER(iwp) ::  if        !<
253    INTEGER(iwp) ::  j         !<
254    INTEGER(iwp) ::  k         !<
255    INTEGER(iwp) ::  n         !<
256    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
257    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]258
[1682]259    LOGICAL      ::  found     !<
260    LOGICAL      ::  resorted  !<
[1]261
[1682]262    REAL(wp)     ::  mean_r    !<
263    REAL(wp)     ::  s_r2      !<
264    REAL(wp)     ::  s_r3      !<
[1]265
[1682]266    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !<
[1]267
[1682]268    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !<
[1]269
[2011]270    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]271
[1]272!
273!-- Return, if nothing to output
274    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
275
276    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
277
278!
279!-- Open output file.
[2512]280!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
281!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
282!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]283!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]284    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
285       CALL check_open( 30 )
286       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]287    ELSE
[1327]288       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]289    ENDIF
[1]290
291!
[1745]292!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
293!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
294!-- the given end time by the length of the given output interval.
295    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
296       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
297          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',  &
298                                      simulated_time, '&because the maximum ', & 
299                                      'number of output time levels is ',      &
300                                      'exceeded.'
301          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
302          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
303          RETURN
304       ENDIF
305    ENDIF
306
307!
[1031]308!-- Update the netCDF time axis
[1308]309!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
310!-- performance.
[1]311#if defined( __netcdf )
[1308]312    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
313    IF ( myid == 0 )  THEN
[1327]314       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
315                               (/ time_since_reference_point /),            &
316                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
317                               count = (/ 1 /) )
[1783]318       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]319    ENDIF
320#endif
321
322!
323!-- Loop over all variables to be written.
324    if = 1
325
326    DO  WHILE ( do3d(av,if)(1:1) /= ' ' )
[2007]327
[1]328!
[2007]329!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
330!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]331!--    Store the array chosen on the temporary array.
[2007]332       trimvar = TRIM( do3d(av,if) )
[2011]333       IF ( urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
[2007]334          trimvar = 'usm_output'
335          resorted = .TRUE.
336          nzb_do   = nzub
337          nzt_do   = nzut
338       ELSE
339          resorted = .FALSE.
340          nzb_do   = nzb
341          nzt_do   = nz_do3d
342       ENDIF
[1551]343!
[1980]344!--    Set flag to steer output of radiation, land-surface, or user-defined
345!--    quantities
346       found = .FALSE.
347!
[1551]348!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]349       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]350!
351!--    Before each output, set array local_pf to fill value
352       local_pf = fill_value
353!
354!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
355       flag_nr = 0
[1551]356
[2007]357       SELECT CASE ( trimvar )
[1]358
359          CASE ( 'e' )
360             IF ( av == 0 )  THEN
361                to_be_resorted => e
362             ELSE
363                to_be_resorted => e_av
364             ENDIF
365
[771]366          CASE ( 'lpt' )
367             IF ( av == 0 )  THEN
368                to_be_resorted => pt
369             ELSE
370                to_be_resorted => lpt_av
371             ENDIF
372
[2292]373          CASE ( 'nc' )
374             IF ( av == 0 )  THEN
375                to_be_resorted => nc
376             ELSE
377                to_be_resorted => nc_av
378             ENDIF
379
[1053]380          CASE ( 'nr' )
381             IF ( av == 0 )  THEN
382                to_be_resorted => nr
383             ELSE
384                to_be_resorted => nr_av
385             ENDIF
386
[1]387          CASE ( 'p' )
388             IF ( av == 0 )  THEN
[727]389                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]390                to_be_resorted => p
391             ELSE
[727]392                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]393                to_be_resorted => p_av
394             ENDIF
395
396          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
397             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]398                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
399                   tend = prt_count
400                ELSE
401                   tend = 0.0_wp
402                ENDIF
[2512]403                DO  i = nxl, nxr
404                   DO  j = nys, nyn
[1551]405                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]406                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
407                      ENDDO
408                   ENDDO
409                ENDDO
410                resorted = .TRUE.
411             ELSE
412                to_be_resorted => pc_av
413             ENDIF
414
[1359]415          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]416             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]417                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
418                   DO  i = nxl, nxr
419                      DO  j = nys, nyn
[1551]420                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]421                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
422                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
423                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
424                            s_r2 = 0.0_wp
425                            s_r3 = 0.0_wp
426                            DO  n = 1, number_of_particles
427                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
428                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
429                                         particles(n)%weight_factor
430                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
431                                         particles(n)%weight_factor
432                               ENDIF
433                            ENDDO
434                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
435                               mean_r = s_r3 / s_r2
436                            ELSE
437                               mean_r = 0.0_wp
438                            ENDIF
439                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]440                         ENDDO
441                      ENDDO
442                   ENDDO
[1359]443                ELSE
444                   tend = 0.0_wp
445                ENDIF
[2512]446                DO  i = nxl, nxr
447                   DO  j = nys, nyn
[1551]448                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]449                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
450                      ENDDO
451                   ENDDO
452                ENDDO
453                resorted = .TRUE.
454             ELSE
455                to_be_resorted => pr_av
456             ENDIF
457
[1053]458          CASE ( 'prr' )
459             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]460                DO  i = nxl, nxr
461                   DO  j = nys, nyn
[1822]462                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]463                         local_pf(i,j,k) = prr(k,j,i)
464                      ENDDO
465                   ENDDO
466                ENDDO
467             ELSE
[2512]468                DO  i = nxl, nxr
469                   DO  j = nys, nyn
[1822]470                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]471                         local_pf(i,j,k) = prr_av(k,j,i)
472                      ENDDO
473                   ENDDO
474                ENDDO
475             ENDIF
476             resorted = .TRUE.
477
[1]478          CASE ( 'pt' )
479             IF ( av == 0 )  THEN
480                IF ( .NOT. cloud_physics ) THEN
481                   to_be_resorted => pt
482                ELSE
[2512]483                   DO  i = nxl, nxr
484                      DO  j = nys, nyn
[1551]485                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1320]486                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + l_d_cp *             &
487                                                          pt_d_t(k) *          &
[1]488                                                          ql(k,j,i)
489                         ENDDO
490                      ENDDO
491                   ENDDO
492                   resorted = .TRUE.
493                ENDIF
494             ELSE
495                to_be_resorted => pt_av
496             ENDIF
497
498          CASE ( 'q' )
499             IF ( av == 0 )  THEN
500                to_be_resorted => q
501             ELSE
502                to_be_resorted => q_av
503             ENDIF
[691]504
[1053]505          CASE ( 'qc' )
[1]506             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]507                to_be_resorted => qc
[1]508             ELSE
[1115]509                to_be_resorted => qc_av
[1]510             ENDIF
511
[1053]512          CASE ( 'ql' )
513             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]514                to_be_resorted => ql
[1053]515             ELSE
[1115]516                to_be_resorted => ql_av
[1053]517             ENDIF
518
[1]519          CASE ( 'ql_c' )
520             IF ( av == 0 )  THEN
521                to_be_resorted => ql_c
522             ELSE
523                to_be_resorted => ql_c_av
524             ENDIF
525
526          CASE ( 'ql_v' )
527             IF ( av == 0 )  THEN
528                to_be_resorted => ql_v
529             ELSE
530                to_be_resorted => ql_v_av
531             ENDIF
532
533          CASE ( 'ql_vp' )
534             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]535                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
536                   DO  i = nxl, nxr
537                      DO  j = nys, nyn
[1551]538                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]539                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
540                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
541                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
542                            DO  n = 1, number_of_particles
543                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
544                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
545                                                 particles(n)%weight_factor /  &
546                                                 prt_count(k,j,i)
547                               ENDIF
548                            ENDDO
[1007]549                         ENDDO
550                      ENDDO
551                   ENDDO
[1359]552                ELSE
553                   tend = 0.0_wp
554                ENDIF
[2512]555                DO  i = nxl, nxr
556                   DO  j = nys, nyn
[1551]557                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]558                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
559                      ENDDO
560                   ENDDO
561                ENDDO
562                resorted = .TRUE.
[1]563             ELSE
564                to_be_resorted => ql_vp_av
565             ENDIF
566
[1053]567          CASE ( 'qr' )
568             IF ( av == 0 )  THEN
569                to_be_resorted => qr
570             ELSE
571                to_be_resorted => qr_av
572             ENDIF
573
[1]574          CASE ( 'qv' )
575             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]576                DO  i = nxl, nxr
577                   DO  j = nys, nyn
[1551]578                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]579                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
580                      ENDDO
581                   ENDDO
582                ENDDO
583                resorted = .TRUE.
584             ELSE
585                to_be_resorted => qv_av
586             ENDIF
587
[2031]588          CASE ( 'rho_ocean' )
[96]589             IF ( av == 0 )  THEN
[2031]590                to_be_resorted => rho_ocean
[96]591             ELSE
[2031]592                to_be_resorted => rho_ocean_av
[96]593             ENDIF
[691]594
[1]595          CASE ( 's' )
596             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]597                to_be_resorted => s
[1]598             ELSE
[355]599                to_be_resorted => s_av
[1]600             ENDIF
[691]601
[96]602          CASE ( 'sa' )
603             IF ( av == 0 )  THEN
604                to_be_resorted => sa
605             ELSE
606                to_be_resorted => sa_av
607             ENDIF
[691]608
[1]609          CASE ( 'u' )
[2696]610             flag_nr = 1
[1]611             IF ( av == 0 )  THEN
612                to_be_resorted => u
613             ELSE
614                to_be_resorted => u_av
615             ENDIF
616
617          CASE ( 'v' )
[2696]618             flag_nr = 2
[1]619             IF ( av == 0 )  THEN
620                to_be_resorted => v
621             ELSE
622                to_be_resorted => v_av
623             ENDIF
624
625          CASE ( 'vpt' )
626             IF ( av == 0 )  THEN
627                to_be_resorted => vpt
628             ELSE
629                to_be_resorted => vpt_av
630             ENDIF
631
632          CASE ( 'w' )
[2696]633             flag_nr = 3
[1]634             IF ( av == 0 )  THEN
635                to_be_resorted => w
636             ELSE
637                to_be_resorted => w_av
638             ENDIF
[2007]639!             
640!--       Block of urban surface model outputs   
641          CASE ( 'usm_output' )
642             CALL usm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,     &
643                                         nzb_do, nzt_do )
[1]644
645          CASE DEFAULT
[1972]646
[1]647!
[1972]648!--          Land surface quantity
649             IF ( land_surface )  THEN
650!
651!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
652                nzb_do = nzb_soil
653                nzt_do = nzt_soil
654
655                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]656                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]657                local_pf = fill_value
[1972]658
659                CALL lsm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf )
660                resorted = .TRUE.
[1976]661
662!
663!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
664                IF ( .NOT. found )  THEN
665                   nzb_do = nzb
666                   nzt_do = nz_do3d
667
668                   DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]669                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )                 
[1976]670                ENDIF
671
[1972]672             ENDIF
673
[2696]674             IF ( .NOT. found )  THEN
675                CALL tcm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf )
676                resorted = .TRUE.
677             ENDIF
678
[1972]679!
[1976]680!--          Radiation quantity
681             IF ( .NOT. found  .AND.  radiation )  THEN
682                CALL radiation_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,         &
683                                               local_pf )
684                resorted = .TRUE.
685             ENDIF
686
687!
[2817]688!--          Gust module quantities
689             IF ( .NOT. found  .AND.  gust_module_enabled )  THEN
690                CALL gust_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,    &
691                                          nzb_do, nzt_do )
692                resorted = .TRUE.
693             ENDIF
694
695!
[2696]696!--          Chemistry model output
697             IF ( .NOT. found  .AND.  air_chemistry )  THEN
698                CALL chem_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,              &
[2756]699                                          local_pf, fill_value )
[2696]700                resorted = .TRUE.
701             ENDIF
702
703!
[2209]704!--          Plant canopy model output
705             IF ( .NOT. found  .AND.  plant_canopy )  THEN
[2696]706                CALL pcm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,     &
707                                         fill_value )
[2209]708                resorted = .TRUE.
709             ENDIF
710
711!
[1]712!--          User defined quantity
[1972]713             IF ( .NOT. found )  THEN
714                CALL user_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,    &
715                                          nzb_do, nzt_do )
716                resorted = .TRUE.
717             ENDIF
[1]718
[254]719             IF ( .NOT. found )  THEN
[1320]720                message_string =  'no output available for: ' //               &
[274]721                                  TRIM( do3d(av,if) )
[254]722                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]723             ENDIF
724
725       END SELECT
726
727!
728!--    Resort the array to be output, if not done above
729       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]730          DO  i = nxl, nxr
731             DO  j = nys, nyn
[1551]732                DO  k = nzb_do, nzt_do
[2696]733                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
734                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
735                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
736                                      BTEST( wall_flags_0(k,j,i), flag_nr ) )
[1]737                ENDDO
738             ENDDO
739          ENDDO
740       ENDIF
741
742!
[1327]743!--    Output of the 3D-array
744#if defined( __parallel )
745       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]746!
[1327]747!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
748!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
749!--       combine_plot_fields
750          IF ( myid == 0 )  THEN
751             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
752                           do3d_time_count(av), av
[1]753          ENDIF
[1327]754          DO  i = 0, io_blocks-1
755             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]756                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[1551]757                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]758             ENDIF
[1972]759
[1327]760             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]761
[1327]762          ENDDO
[559]763
[1327]764       ELSE
[646]765#if defined( __netcdf )
[493]766!
[1327]767!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]768!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
769!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
770!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
771!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
772!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
773!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
774!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
775!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
776!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
777!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
778!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
779!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
780!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
781!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
782!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
783!          ELSE
[1327]784             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]785                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
786                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
787                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[2512]788!          ENDIF
[1783]789          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]790#endif
[1327]791       ENDIF
[1]792#else
793#if defined( __netcdf )
[1327]794       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),        &
[1551]795                         local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),        &
[1327]796                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),     &
[2512]797                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]798       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]799#endif
800#endif
801
802       if = if + 1
803
804!
[1551]805!--    Deallocate temporary array
806       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]807
[1551]808    ENDDO
[1]809
[1318]810    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]811
812!
813!-- Formats.
[1320]8143300 FORMAT ('variable ',I4,'  file=',A,'  filetype=unformatted  skip=',I12/   &
[1]815             'label = ',A,A)
816
817 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.