source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 2639

Last change on this file since 2639 was 2512, checked in by raasch, 7 years ago

upper bounds of cross section and 3d output changed from nx+1,ny+1 to nx,ny; no output if redundant ghost layer data to NetCDF files

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 25.2 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[2000]2!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]3! This file is part of PALM.
4!
[2000]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
[1036]9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
[2101]17! Copyright 1997-2017 Leibniz Universitaet Hannover
[2000]18!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]19!
[254]20! Current revisions:
[1106]21! ------------------
[1961]22!
[2233]23!
[1552]24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 2512 2017-10-04 08:26:59Z raasch $
[2512]27! upper bounds of 3d output changed from nx+1,ny+1 to nx,ny
28! no output of ghost layer data
29!
30! 2292 2017-06-20 09:51:42Z schwenkel
[2292]31! Implementation of new microphysic scheme: cloud_scheme = 'morrison'
32! includes two more prognostic equations for cloud drop concentration (nc) 
33! and cloud water content (qc).
34!
35! 2233 2017-05-30 18:08:54Z suehring
[1552]36!
[2233]37! 2232 2017-05-30 17:47:52Z suehring
38! Adjustments to new topography concept
39!
[2210]40! 2209 2017-04-19 09:34:46Z kanani
41! Added plant canopy model output
42!
[2032]43! 2031 2016-10-21 15:11:58Z knoop
44! renamed variable rho to rho_ocean and rho_av to rho_ocean_av
45!
[2012]46! 2011 2016-09-19 17:29:57Z kanani
47! Flag urban_surface is now defined in module control_parameters,
48! changed prefix for urban surface model output to "usm_",
49! introduced control parameter varnamelength for LEN of trimvar.
50!
[2008]51! 2007 2016-08-24 15:47:17Z kanani
52! Added support for new urban surface model (temporary modifications of
53! SELECT CASE ( ) necessary, see variable trimvar)
54!
[2001]55! 2000 2016-08-20 18:09:15Z knoop
56! Forced header and separation lines into 80 columns
57!
[1981]58! 1980 2016-07-29 15:51:57Z suehring
59! Bugfix, in order to steer user-defined output, setting flag found explicitly
60! to .F.
61!
[1977]62! 1976 2016-07-27 13:28:04Z maronga
63! Output of radiation quantities is now done directly in the respective module
64!
[1973]65! 1972 2016-07-26 07:52:02Z maronga
66! Output of land surface quantities is now done directly in the respective module.
67! Unnecessary directive __parallel removed.
68!
[1961]69! 1960 2016-07-12 16:34:24Z suehring
70! Scalar surface flux added
71!
[1851]72! 1849 2016-04-08 11:33:18Z hoffmann
73! prr moved to arrays_3d
74!
[1823]75! 1822 2016-04-07 07:49:42Z hoffmann
76! prr vertical dimensions set to nzb_do to nzt_do. Unused variables deleted.
77!
[1809]78! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
79! test output removed
80!
[1784]81! 1783 2016-03-06 18:36:17Z raasch
82! name change of netcdf routines and module + related changes
83!
[1746]84! 1745 2016-02-05 13:06:51Z gronemeier
85! Bugfix: test if time axis limit exceeds moved to point after call of check_open
86!
[1692]87! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
88! Added output of radiative heating rates for RRTMG
89!
[1683]90! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
91! Code annotations made doxygen readable
92!
[1586]93! 1585 2015-04-30 07:05:52Z maronga
94! Added support for RRTMG
95!
[1552]96! 1551 2015-03-03 14:18:16Z maronga
[1551]97! Added suppport for land surface model and radiation model output. In the course
98! of this action, the limits for vertical loops have been changed (from nzb and
99! nzt+1 to nzb_do and nzt_do, respectively in order to allow soil model output).
100! Moreover, a new vertical grid zs was introduced.
[1329]101!
[1360]102! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
103! New particle structure integrated.
104!
[1354]105! 1353 2014-04-08 15:21:23Z heinze
106! REAL constants provided with KIND-attribute
107!
[1329]108! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
109! parts concerning avs output removed,
110! -netcdf output queries
111!
[1321]112! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
[1320]113! ONLY-attribute added to USE-statements,
114! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
115! kinds are defined in new module kinds,
116! old module precision_kind is removed,
117! revision history before 2012 removed,
118! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
119! all variable declaration statements
[674]120!
[1319]121! 1318 2014-03-17 13:35:16Z raasch
122! barrier argument removed from cpu_log,
123! module interfaces removed
124!
[1309]125! 1308 2014-03-13 14:58:42Z fricke
126! Check, if the limit of the time dimension is exceeded for parallel output
127! To increase the performance for parallel output, the following is done:
128! - Update of time axis is only done by PE0
129!
[1245]130! 1244 2013-10-31 08:16:56Z raasch
131! Bugfix for index bounds in case of 3d-parallel output
132!
[1116]133! 1115 2013-03-26 18:16:16Z hoffmann
134! ql is calculated by calc_liquid_water_content
135!
[1107]136! 1106 2013-03-04 05:31:38Z raasch
137! array_kind renamed precision_kind
138!
[1077]139! 1076 2012-12-05 08:30:18Z hoffmann
140! Bugfix in output of ql
141!
[1054]142! 1053 2012-11-13 17:11:03Z hoffmann
143! +nr, qr, prr, qc and averaged quantities
144!
[1037]145! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
146! code put under GPL (PALM 3.9)
147!
[1035]148! 1031 2012-10-19 14:35:30Z raasch
149! netCDF4 without parallel file support implemented
150!
[1008]151! 1007 2012-09-19 14:30:36Z franke
152! Bugfix: missing calculation of ql_vp added
153!
[1]154! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
155! Initial revision
156!
157!
158! Description:
159! ------------
[1682]160!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[1]161!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]162 SUBROUTINE data_output_3d( av )
163 
[1]164
[1320]165    USE arrays_3d,                                                             &
[2292]166        ONLY:  e, nc, nr, p, pt, prr, q, qc, ql, ql_c, ql_v, qr, rho_ocean, s, &
167               sa, tend, u, v, vpt, w
[1320]168       
[1]169    USE averaging
[1320]170       
171    USE cloud_parameters,                                                      &
[1849]172        ONLY:  l_d_cp, pt_d_t
[1320]173       
174    USE control_parameters,                                                    &
[1822]175        ONLY:  cloud_physics, do3d, do3d_no, do3d_time_count, io_blocks,       &
[2232]176               io_group, land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d,      &
177               psolver, simulated_time, time_since_reference_point,            &
178               urban_surface, varnamelength
[1320]179       
180    USE cpulog,                                                                &
181        ONLY:  log_point, cpu_log
182       
183    USE indices,                                                               &
[2512]184        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxr, ny, nyn, nys, nzb
[1320]185       
186    USE kinds
187   
[1551]188    USE land_surface_model_mod,                                                &
[2232]189        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]190
[1783]191#if defined( __netcdf )
192    USE NETCDF
193#endif
194
195    USE netcdf_interface,                                                      &
196        ONLY:  id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,                &
197               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[1320]198       
199    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]200        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
201               particle_advection_start, prt_count
[1320]202       
[1]203    USE pegrid
204
[2209]205    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
206        ONLY:  pcm_data_output_3d, plant_canopy
207       
[1585]208    USE radiation_model_mod,                                                   &
[1976]209        ONLY:  radiation, radiation_data_output_3d
[1585]210
[2007]211    USE urban_surface_mod,                                                     &
[2011]212        ONLY:  nzub, nzut, usm_data_output_3d
[1585]213
[2007]214
[1]215    IMPLICIT NONE
216
[1682]217    INTEGER(iwp) ::  av        !<
218    INTEGER(iwp) ::  i         !<
219    INTEGER(iwp) ::  if        !<
220    INTEGER(iwp) ::  j         !<
221    INTEGER(iwp) ::  k         !<
222    INTEGER(iwp) ::  n         !<
223    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
224    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]225
[1682]226    LOGICAL      ::  found     !<
227    LOGICAL      ::  resorted  !<
[1]228
[1682]229    REAL(wp)     ::  mean_r    !<
230    REAL(wp)     ::  s_r2      !<
231    REAL(wp)     ::  s_r3      !<
[1]232
[1682]233    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !<
[1]234
[1682]235    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !<
[1]236
[2011]237    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]238
[1]239!
240!-- Return, if nothing to output
241    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
242
243    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
244
245!
246!-- Open output file.
[2512]247!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
248!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
249!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]250!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]251    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
252       CALL check_open( 30 )
253       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]254    ELSE
[1327]255       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]256    ENDIF
[1]257
258!
[1745]259!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
260!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
261!-- the given end time by the length of the given output interval.
262    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
263       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
264          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',  &
265                                      simulated_time, '&because the maximum ', & 
266                                      'number of output time levels is ',      &
267                                      'exceeded.'
268          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
269          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
270          RETURN
271       ENDIF
272    ENDIF
273
274!
[1031]275!-- Update the netCDF time axis
[1308]276!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
277!-- performance.
[1]278#if defined( __netcdf )
[1308]279    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
280    IF ( myid == 0 )  THEN
[1327]281       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
282                               (/ time_since_reference_point /),            &
283                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
284                               count = (/ 1 /) )
[1783]285       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]286    ENDIF
287#endif
288
289!
290!-- Loop over all variables to be written.
291    if = 1
292
293    DO  WHILE ( do3d(av,if)(1:1) /= ' ' )
[2007]294
[1]295!
[2007]296!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
297!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]298!--    Store the array chosen on the temporary array.
[2007]299       trimvar = TRIM( do3d(av,if) )
[2011]300       IF ( urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
[2007]301          trimvar = 'usm_output'
302          resorted = .TRUE.
303          nzb_do   = nzub
304          nzt_do   = nzut
305       ELSE
306          resorted = .FALSE.
307          nzb_do   = nzb
308          nzt_do   = nz_do3d
309       ENDIF
[1551]310!
[1980]311!--    Set flag to steer output of radiation, land-surface, or user-defined
312!--    quantities
313       found = .FALSE.
314!
[1551]315!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]316       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[1551]317
[2007]318       SELECT CASE ( trimvar )
[1]319
320          CASE ( 'e' )
321             IF ( av == 0 )  THEN
322                to_be_resorted => e
323             ELSE
324                to_be_resorted => e_av
325             ENDIF
326
[771]327          CASE ( 'lpt' )
328             IF ( av == 0 )  THEN
329                to_be_resorted => pt
330             ELSE
331                to_be_resorted => lpt_av
332             ENDIF
333
[2292]334          CASE ( 'nc' )
335             IF ( av == 0 )  THEN
336                to_be_resorted => nc
337             ELSE
338                to_be_resorted => nc_av
339             ENDIF
340
[1053]341          CASE ( 'nr' )
342             IF ( av == 0 )  THEN
343                to_be_resorted => nr
344             ELSE
345                to_be_resorted => nr_av
346             ENDIF
347
[1]348          CASE ( 'p' )
349             IF ( av == 0 )  THEN
[727]350                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]351                to_be_resorted => p
352             ELSE
[727]353                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]354                to_be_resorted => p_av
355             ENDIF
356
357          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
358             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]359                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
360                   tend = prt_count
361                ELSE
362                   tend = 0.0_wp
363                ENDIF
[2512]364                DO  i = nxl, nxr
365                   DO  j = nys, nyn
[1551]366                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]367                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
368                      ENDDO
369                   ENDDO
370                ENDDO
371                resorted = .TRUE.
372             ELSE
373                to_be_resorted => pc_av
374             ENDIF
375
[1359]376          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]377             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]378                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
379                   DO  i = nxl, nxr
380                      DO  j = nys, nyn
[1551]381                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]382                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
383                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
384                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
385                            s_r2 = 0.0_wp
386                            s_r3 = 0.0_wp
387                            DO  n = 1, number_of_particles
388                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
389                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
390                                         particles(n)%weight_factor
391                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
392                                         particles(n)%weight_factor
393                               ENDIF
394                            ENDDO
395                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
396                               mean_r = s_r3 / s_r2
397                            ELSE
398                               mean_r = 0.0_wp
399                            ENDIF
400                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]401                         ENDDO
402                      ENDDO
403                   ENDDO
[1359]404                ELSE
405                   tend = 0.0_wp
406                ENDIF
[2512]407                DO  i = nxl, nxr
408                   DO  j = nys, nyn
[1551]409                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]410                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
411                      ENDDO
412                   ENDDO
413                ENDDO
414                resorted = .TRUE.
415             ELSE
416                to_be_resorted => pr_av
417             ENDIF
418
[1053]419          CASE ( 'prr' )
420             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]421                DO  i = nxl, nxr
422                   DO  j = nys, nyn
[1822]423                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]424                         local_pf(i,j,k) = prr(k,j,i)
425                      ENDDO
426                   ENDDO
427                ENDDO
428             ELSE
[2512]429                DO  i = nxl, nxr
430                   DO  j = nys, nyn
[1822]431                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]432                         local_pf(i,j,k) = prr_av(k,j,i)
433                      ENDDO
434                   ENDDO
435                ENDDO
436             ENDIF
437             resorted = .TRUE.
438
[1]439          CASE ( 'pt' )
440             IF ( av == 0 )  THEN
441                IF ( .NOT. cloud_physics ) THEN
442                   to_be_resorted => pt
443                ELSE
[2512]444                   DO  i = nxl, nxr
445                      DO  j = nys, nyn
[1551]446                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1320]447                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + l_d_cp *             &
448                                                          pt_d_t(k) *          &
[1]449                                                          ql(k,j,i)
450                         ENDDO
451                      ENDDO
452                   ENDDO
453                   resorted = .TRUE.
454                ENDIF
455             ELSE
456                to_be_resorted => pt_av
457             ENDIF
458
459          CASE ( 'q' )
460             IF ( av == 0 )  THEN
461                to_be_resorted => q
462             ELSE
463                to_be_resorted => q_av
464             ENDIF
[691]465
[1053]466          CASE ( 'qc' )
[1]467             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]468                to_be_resorted => qc
[1]469             ELSE
[1115]470                to_be_resorted => qc_av
[1]471             ENDIF
472
[1053]473          CASE ( 'ql' )
474             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]475                to_be_resorted => ql
[1053]476             ELSE
[1115]477                to_be_resorted => ql_av
[1053]478             ENDIF
479
[1]480          CASE ( 'ql_c' )
481             IF ( av == 0 )  THEN
482                to_be_resorted => ql_c
483             ELSE
484                to_be_resorted => ql_c_av
485             ENDIF
486
487          CASE ( 'ql_v' )
488             IF ( av == 0 )  THEN
489                to_be_resorted => ql_v
490             ELSE
491                to_be_resorted => ql_v_av
492             ENDIF
493
494          CASE ( 'ql_vp' )
495             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]496                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
497                   DO  i = nxl, nxr
498                      DO  j = nys, nyn
[1551]499                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]500                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
501                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
502                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
503                            DO  n = 1, number_of_particles
504                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
505                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
506                                                 particles(n)%weight_factor /  &
507                                                 prt_count(k,j,i)
508                               ENDIF
509                            ENDDO
[1007]510                         ENDDO
511                      ENDDO
512                   ENDDO
[1359]513                ELSE
514                   tend = 0.0_wp
515                ENDIF
[2512]516                DO  i = nxl, nxr
517                   DO  j = nys, nyn
[1551]518                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]519                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
520                      ENDDO
521                   ENDDO
522                ENDDO
523                resorted = .TRUE.
[1]524             ELSE
525                to_be_resorted => ql_vp_av
526             ENDIF
527
[1053]528          CASE ( 'qr' )
529             IF ( av == 0 )  THEN
530                to_be_resorted => qr
531             ELSE
532                to_be_resorted => qr_av
533             ENDIF
534
[1]535          CASE ( 'qv' )
536             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]537                DO  i = nxl, nxr
538                   DO  j = nys, nyn
[1551]539                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]540                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
541                      ENDDO
542                   ENDDO
543                ENDDO
544                resorted = .TRUE.
545             ELSE
546                to_be_resorted => qv_av
547             ENDIF
548
[2031]549          CASE ( 'rho_ocean' )
[96]550             IF ( av == 0 )  THEN
[2031]551                to_be_resorted => rho_ocean
[96]552             ELSE
[2031]553                to_be_resorted => rho_ocean_av
[96]554             ENDIF
[691]555
[1]556          CASE ( 's' )
557             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]558                to_be_resorted => s
[1]559             ELSE
[355]560                to_be_resorted => s_av
[1]561             ENDIF
[691]562
[96]563          CASE ( 'sa' )
564             IF ( av == 0 )  THEN
565                to_be_resorted => sa
566             ELSE
567                to_be_resorted => sa_av
568             ENDIF
[691]569
[1]570          CASE ( 'u' )
571             IF ( av == 0 )  THEN
572                to_be_resorted => u
573             ELSE
574                to_be_resorted => u_av
575             ENDIF
576
577          CASE ( 'v' )
578             IF ( av == 0 )  THEN
579                to_be_resorted => v
580             ELSE
581                to_be_resorted => v_av
582             ENDIF
583
584          CASE ( 'vpt' )
585             IF ( av == 0 )  THEN
586                to_be_resorted => vpt
587             ELSE
588                to_be_resorted => vpt_av
589             ENDIF
590
591          CASE ( 'w' )
592             IF ( av == 0 )  THEN
593                to_be_resorted => w
594             ELSE
595                to_be_resorted => w_av
596             ENDIF
[2007]597!             
598!--       Block of urban surface model outputs   
599          CASE ( 'usm_output' )
600             CALL usm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,     &
601                                         nzb_do, nzt_do )
[1]602
603          CASE DEFAULT
[1972]604
[1]605!
[1972]606!--          Land surface quantity
607             IF ( land_surface )  THEN
608!
609!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
610                nzb_do = nzb_soil
611                nzt_do = nzt_soil
612
613                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]614                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[1972]615
616                CALL lsm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf )
617                resorted = .TRUE.
[1976]618
619!
620!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
621                IF ( .NOT. found )  THEN
622                   nzb_do = nzb
623                   nzt_do = nz_do3d
624
625                   DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]626                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )                 
[1976]627                ENDIF
628
[1972]629             ENDIF
630
631!
[1976]632!--          Radiation quantity
633             IF ( .NOT. found  .AND.  radiation )  THEN
634                CALL radiation_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,         &
635                                               local_pf )
636                resorted = .TRUE.
637             ENDIF
638
639!
[2209]640!--          Plant canopy model output
641             IF ( .NOT. found  .AND.  plant_canopy )  THEN
642                CALL pcm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,         &
643                                               local_pf )
644                resorted = .TRUE.
645             ENDIF
646
647!
[1]648!--          User defined quantity
[1972]649             IF ( .NOT. found )  THEN
650                CALL user_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,    &
651                                          nzb_do, nzt_do )
652                resorted = .TRUE.
653             ENDIF
[1]654
[254]655             IF ( .NOT. found )  THEN
[1320]656                message_string =  'no output available for: ' //               &
[274]657                                  TRIM( do3d(av,if) )
[254]658                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]659             ENDIF
660
661       END SELECT
662
663!
664!--    Resort the array to be output, if not done above
665       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]666          DO  i = nxl, nxr
667             DO  j = nys, nyn
[1551]668                DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]669                   local_pf(i,j,k) = to_be_resorted(k,j,i)
670                ENDDO
671             ENDDO
672          ENDDO
673       ENDIF
674
675!
[1327]676!--    Output of the 3D-array
677#if defined( __parallel )
678       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]679!
[1327]680!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
681!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
682!--       combine_plot_fields
683          IF ( myid == 0 )  THEN
684             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
685                           do3d_time_count(av), av
[1]686          ENDIF
[1327]687          DO  i = 0, io_blocks-1
688             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]689                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[1551]690                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]691             ENDIF
[1972]692
[1327]693             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]694
[1327]695          ENDDO
[559]696
[1327]697       ELSE
[646]698#if defined( __netcdf )
[493]699!
[1327]700!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]701!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
702!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
703!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
704!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
705!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
706!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
707!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
708!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
709!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
710!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
711!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
712!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
713!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
714!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
715!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
716!          ELSE
[1327]717             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]718                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
719                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
720                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[2512]721!          ENDIF
[1783]722          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]723#endif
[1327]724       ENDIF
[1]725#else
726#if defined( __netcdf )
[1327]727       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),        &
[1551]728                         local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),        &
[1327]729                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),     &
[2512]730                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]731       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]732#endif
733#endif
734
735       if = if + 1
736
737!
[1551]738!--    Deallocate temporary array
739       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]740
[1551]741    ENDDO
[1]742
[1318]743    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]744
745!
746!-- Formats.
[1320]7473300 FORMAT ('variable ',I4,'  file=',A,'  filetype=unformatted  skip=',I12/   &
[1]748             'label = ',A,A)
749
750 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.