source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 2312

Last change on this file since 2312 was 2292, checked in by schwenkel, 7 years ago

implementation of new bulk microphysics scheme

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 25.8 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[2000]2!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]3! This file is part of PALM.
4!
[2000]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
[1036]9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
[2101]17! Copyright 1997-2017 Leibniz Universitaet Hannover
[2000]18!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]19!
[254]20! Current revisions:
[1106]21! ------------------
[1961]22!
[2233]23!
[1552]24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 2292 2017-06-20 09:51:42Z hoffmann $
[2292]27! Implementation of new microphysic scheme: cloud_scheme = 'morrison'
28! includes two more prognostic equations for cloud drop concentration (nc) 
29! and cloud water content (qc).
30!
31! 2233 2017-05-30 18:08:54Z suehring
[1552]32!
[2233]33! 2232 2017-05-30 17:47:52Z suehring
34! Adjustments to new topography concept
35!
[2210]36! 2209 2017-04-19 09:34:46Z kanani
37! Added plant canopy model output
38!
[2032]39! 2031 2016-10-21 15:11:58Z knoop
40! renamed variable rho to rho_ocean and rho_av to rho_ocean_av
41!
[2012]42! 2011 2016-09-19 17:29:57Z kanani
43! Flag urban_surface is now defined in module control_parameters,
44! changed prefix for urban surface model output to "usm_",
45! introduced control parameter varnamelength for LEN of trimvar.
46!
[2008]47! 2007 2016-08-24 15:47:17Z kanani
48! Added support for new urban surface model (temporary modifications of
49! SELECT CASE ( ) necessary, see variable trimvar)
50!
[2001]51! 2000 2016-08-20 18:09:15Z knoop
52! Forced header and separation lines into 80 columns
53!
[1981]54! 1980 2016-07-29 15:51:57Z suehring
55! Bugfix, in order to steer user-defined output, setting flag found explicitly
56! to .F.
57!
[1977]58! 1976 2016-07-27 13:28:04Z maronga
59! Output of radiation quantities is now done directly in the respective module
60!
[1973]61! 1972 2016-07-26 07:52:02Z maronga
62! Output of land surface quantities is now done directly in the respective module.
63! Unnecessary directive __parallel removed.
64!
[1961]65! 1960 2016-07-12 16:34:24Z suehring
66! Scalar surface flux added
67!
[1851]68! 1849 2016-04-08 11:33:18Z hoffmann
69! prr moved to arrays_3d
70!
[1823]71! 1822 2016-04-07 07:49:42Z hoffmann
72! prr vertical dimensions set to nzb_do to nzt_do. Unused variables deleted.
73!
[1809]74! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
75! test output removed
76!
[1784]77! 1783 2016-03-06 18:36:17Z raasch
78! name change of netcdf routines and module + related changes
79!
[1746]80! 1745 2016-02-05 13:06:51Z gronemeier
81! Bugfix: test if time axis limit exceeds moved to point after call of check_open
82!
[1692]83! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
84! Added output of radiative heating rates for RRTMG
85!
[1683]86! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
87! Code annotations made doxygen readable
88!
[1586]89! 1585 2015-04-30 07:05:52Z maronga
90! Added support for RRTMG
91!
[1552]92! 1551 2015-03-03 14:18:16Z maronga
[1551]93! Added suppport for land surface model and radiation model output. In the course
94! of this action, the limits for vertical loops have been changed (from nzb and
95! nzt+1 to nzb_do and nzt_do, respectively in order to allow soil model output).
96! Moreover, a new vertical grid zs was introduced.
[1329]97!
[1360]98! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
99! New particle structure integrated.
100!
[1354]101! 1353 2014-04-08 15:21:23Z heinze
102! REAL constants provided with KIND-attribute
103!
[1329]104! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
105! parts concerning avs output removed,
106! -netcdf output queries
107!
[1321]108! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
[1320]109! ONLY-attribute added to USE-statements,
110! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
111! kinds are defined in new module kinds,
112! old module precision_kind is removed,
113! revision history before 2012 removed,
114! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
115! all variable declaration statements
[674]116!
[1319]117! 1318 2014-03-17 13:35:16Z raasch
118! barrier argument removed from cpu_log,
119! module interfaces removed
120!
[1309]121! 1308 2014-03-13 14:58:42Z fricke
122! Check, if the limit of the time dimension is exceeded for parallel output
123! To increase the performance for parallel output, the following is done:
124! - Update of time axis is only done by PE0
125!
[1245]126! 1244 2013-10-31 08:16:56Z raasch
127! Bugfix for index bounds in case of 3d-parallel output
128!
[1116]129! 1115 2013-03-26 18:16:16Z hoffmann
130! ql is calculated by calc_liquid_water_content
131!
[1107]132! 1106 2013-03-04 05:31:38Z raasch
133! array_kind renamed precision_kind
134!
[1077]135! 1076 2012-12-05 08:30:18Z hoffmann
136! Bugfix in output of ql
137!
[1054]138! 1053 2012-11-13 17:11:03Z hoffmann
139! +nr, qr, prr, qc and averaged quantities
140!
[1037]141! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
142! code put under GPL (PALM 3.9)
143!
[1035]144! 1031 2012-10-19 14:35:30Z raasch
145! netCDF4 without parallel file support implemented
146!
[1008]147! 1007 2012-09-19 14:30:36Z franke
148! Bugfix: missing calculation of ql_vp added
149!
[1]150! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
151! Initial revision
152!
153!
154! Description:
155! ------------
[1682]156!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[1]157!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]158 SUBROUTINE data_output_3d( av )
159 
[1]160
[1320]161    USE arrays_3d,                                                             &
[2292]162        ONLY:  e, nc, nr, p, pt, prr, q, qc, ql, ql_c, ql_v, qr, rho_ocean, s, &
163               sa, tend, u, v, vpt, w
[1320]164       
[1]165    USE averaging
[1320]166       
167    USE cloud_parameters,                                                      &
[1849]168        ONLY:  l_d_cp, pt_d_t
[1320]169       
170    USE control_parameters,                                                    &
[1822]171        ONLY:  cloud_physics, do3d, do3d_no, do3d_time_count, io_blocks,       &
[2232]172               io_group, land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d,      &
173               psolver, simulated_time, time_since_reference_point,            &
174               urban_surface, varnamelength
[1320]175       
176    USE cpulog,                                                                &
177        ONLY:  log_point, cpu_log
178       
179    USE indices,                                                               &
[1822]180        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxlg, nxr, nxrg, ny, nyn, nyng, nys, nysg, nzb
[1320]181       
182    USE kinds
183   
[1551]184    USE land_surface_model_mod,                                                &
[2232]185        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]186
[1783]187#if defined( __netcdf )
188    USE NETCDF
189#endif
190
191    USE netcdf_interface,                                                      &
192        ONLY:  id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,                &
193               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[1320]194       
195    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]196        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
197               particle_advection_start, prt_count
[1320]198       
[1]199    USE pegrid
200
[2209]201    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
202        ONLY:  pcm_data_output_3d, plant_canopy
203       
[1585]204    USE radiation_model_mod,                                                   &
[1976]205        ONLY:  radiation, radiation_data_output_3d
[1585]206
[2007]207    USE urban_surface_mod,                                                     &
[2011]208        ONLY:  nzub, nzut, usm_data_output_3d
[1585]209
[2007]210
[1]211    IMPLICIT NONE
212
[1682]213    INTEGER(iwp) ::  av        !<
214    INTEGER(iwp) ::  i         !<
215    INTEGER(iwp) ::  if        !<
216    INTEGER(iwp) ::  j         !<
217    INTEGER(iwp) ::  k         !<
218    INTEGER(iwp) ::  n         !<
219    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
220    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]221
[1682]222    LOGICAL      ::  found     !<
223    LOGICAL      ::  resorted  !<
[1]224
[1682]225    REAL(wp)     ::  mean_r    !<
226    REAL(wp)     ::  s_r2      !<
227    REAL(wp)     ::  s_r3      !<
[1]228
[1682]229    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !<
[1]230
[1682]231    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !<
[1]232
[2011]233    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]234
[1]235!
236!-- Return, if nothing to output
237    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
238
239    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
240
241!
242!-- Open output file.
243!-- Also creates coordinate and fld-file for AVS.
[1031]244!-- For classic or 64bit netCDF output or output of other (old) data formats,
[493]245!-- for a run on more than one PE, each PE opens its own file and
[1]246!-- writes the data of its subdomain in binary format (regardless of the format
247!-- the user has requested). After the run, these files are combined to one
248!-- file by combine_plot_fields in the format requested by the user (netcdf
[493]249!-- and/or avs).
[1031]250!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]251    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
252       CALL check_open( 30 )
253       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]254    ELSE
[1327]255       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]256    ENDIF
[1]257
258!
[1745]259!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
260!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
261!-- the given end time by the length of the given output interval.
262    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
263       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
264          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',  &
265                                      simulated_time, '&because the maximum ', & 
266                                      'number of output time levels is ',      &
267                                      'exceeded.'
268          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
269          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
270          RETURN
271       ENDIF
272    ENDIF
273
274!
[1031]275!-- Update the netCDF time axis
[1308]276!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
277!-- performance.
[1]278#if defined( __netcdf )
[1308]279    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
280    IF ( myid == 0 )  THEN
[1327]281       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
282                               (/ time_since_reference_point /),            &
283                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
284                               count = (/ 1 /) )
[1783]285       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]286    ENDIF
287#endif
288
289!
290!-- Loop over all variables to be written.
291    if = 1
292
293    DO  WHILE ( do3d(av,if)(1:1) /= ' ' )
[2007]294
[1]295!
[2007]296!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
297!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]298!--    Store the array chosen on the temporary array.
[2007]299       trimvar = TRIM( do3d(av,if) )
[2011]300       IF ( urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
[2007]301          trimvar = 'usm_output'
302          resorted = .TRUE.
303          nzb_do   = nzub
304          nzt_do   = nzut
305       ELSE
306          resorted = .FALSE.
307          nzb_do   = nzb
308          nzt_do   = nz_do3d
309       ENDIF
[1551]310!
[1980]311!--    Set flag to steer output of radiation, land-surface, or user-defined
312!--    quantities
313       found = .FALSE.
314!
[1551]315!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
316       ALLOCATE( local_pf(nxlg:nxrg,nysg:nyng,nzb_do:nzt_do) )
317
[2007]318       SELECT CASE ( trimvar )
[1]319
320          CASE ( 'e' )
321             IF ( av == 0 )  THEN
322                to_be_resorted => e
323             ELSE
324                to_be_resorted => e_av
325             ENDIF
326
[771]327          CASE ( 'lpt' )
328             IF ( av == 0 )  THEN
329                to_be_resorted => pt
330             ELSE
331                to_be_resorted => lpt_av
332             ENDIF
333
[2292]334          CASE ( 'nc' )
335             IF ( av == 0 )  THEN
336                to_be_resorted => nc
337             ELSE
338                to_be_resorted => nc_av
339             ENDIF
340
[1053]341          CASE ( 'nr' )
342             IF ( av == 0 )  THEN
343                to_be_resorted => nr
344             ELSE
345                to_be_resorted => nr_av
346             ENDIF
347
[1]348          CASE ( 'p' )
349             IF ( av == 0 )  THEN
[727]350                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]351                to_be_resorted => p
352             ELSE
[727]353                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]354                to_be_resorted => p_av
355             ENDIF
356
357          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
358             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]359                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
360                   tend = prt_count
361                   CALL exchange_horiz( tend, nbgp )
362                ELSE
363                   tend = 0.0_wp
364                ENDIF
[667]365                DO  i = nxlg, nxrg
366                   DO  j = nysg, nyng
[1551]367                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]368                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
369                      ENDDO
370                   ENDDO
371                ENDDO
372                resorted = .TRUE.
373             ELSE
[667]374                CALL exchange_horiz( pc_av, nbgp )
[1]375                to_be_resorted => pc_av
376             ENDIF
377
[1359]378          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]379             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]380                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
381                   DO  i = nxl, nxr
382                      DO  j = nys, nyn
[1551]383                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]384                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
385                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
386                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
387                            s_r2 = 0.0_wp
388                            s_r3 = 0.0_wp
389                            DO  n = 1, number_of_particles
390                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
391                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
392                                         particles(n)%weight_factor
393                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
394                                         particles(n)%weight_factor
395                               ENDIF
396                            ENDDO
397                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
398                               mean_r = s_r3 / s_r2
399                            ELSE
400                               mean_r = 0.0_wp
401                            ENDIF
402                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]403                         ENDDO
404                      ENDDO
405                   ENDDO
[1359]406                   CALL exchange_horiz( tend, nbgp )
407                ELSE
408                   tend = 0.0_wp
409                ENDIF
[667]410                DO  i = nxlg, nxrg
411                   DO  j = nysg, nyng
[1551]412                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]413                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
414                      ENDDO
415                   ENDDO
416                ENDDO
417                resorted = .TRUE.
418             ELSE
[667]419                CALL exchange_horiz( pr_av, nbgp )
[1]420                to_be_resorted => pr_av
421             ENDIF
422
[1053]423          CASE ( 'prr' )
424             IF ( av == 0 )  THEN
425                CALL exchange_horiz( prr, nbgp )
426                DO  i = nxlg, nxrg
427                   DO  j = nysg, nyng
[1822]428                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]429                         local_pf(i,j,k) = prr(k,j,i)
430                      ENDDO
431                   ENDDO
432                ENDDO
433             ELSE
434                CALL exchange_horiz( prr_av, nbgp )
435                DO  i = nxlg, nxrg
436                   DO  j = nysg, nyng
[1822]437                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1053]438                         local_pf(i,j,k) = prr_av(k,j,i)
439                      ENDDO
440                   ENDDO
441                ENDDO
442             ENDIF
443             resorted = .TRUE.
444
[1]445          CASE ( 'pt' )
446             IF ( av == 0 )  THEN
447                IF ( .NOT. cloud_physics ) THEN
448                   to_be_resorted => pt
449                ELSE
[667]450                   DO  i = nxlg, nxrg
451                      DO  j = nysg, nyng
[1551]452                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1320]453                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + l_d_cp *             &
454                                                          pt_d_t(k) *          &
[1]455                                                          ql(k,j,i)
456                         ENDDO
457                      ENDDO
458                   ENDDO
459                   resorted = .TRUE.
460                ENDIF
461             ELSE
462                to_be_resorted => pt_av
463             ENDIF
464
465          CASE ( 'q' )
466             IF ( av == 0 )  THEN
467                to_be_resorted => q
468             ELSE
469                to_be_resorted => q_av
470             ENDIF
[691]471
[1053]472          CASE ( 'qc' )
[1]473             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]474                to_be_resorted => qc
[1]475             ELSE
[1115]476                to_be_resorted => qc_av
[1]477             ENDIF
478
[1053]479          CASE ( 'ql' )
480             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]481                to_be_resorted => ql
[1053]482             ELSE
[1115]483                to_be_resorted => ql_av
[1053]484             ENDIF
485
[1]486          CASE ( 'ql_c' )
487             IF ( av == 0 )  THEN
488                to_be_resorted => ql_c
489             ELSE
490                to_be_resorted => ql_c_av
491             ENDIF
492
493          CASE ( 'ql_v' )
494             IF ( av == 0 )  THEN
495                to_be_resorted => ql_v
496             ELSE
497                to_be_resorted => ql_v_av
498             ENDIF
499
500          CASE ( 'ql_vp' )
501             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]502                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
503                   DO  i = nxl, nxr
504                      DO  j = nys, nyn
[1551]505                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]506                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
507                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
508                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
509                            DO  n = 1, number_of_particles
510                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
511                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
512                                                 particles(n)%weight_factor /  &
513                                                 prt_count(k,j,i)
514                               ENDIF
515                            ENDDO
[1007]516                         ENDDO
517                      ENDDO
518                   ENDDO
[1359]519                   CALL exchange_horiz( tend, nbgp )
520                ELSE
521                   tend = 0.0_wp
522                ENDIF
[1007]523                DO  i = nxlg, nxrg
524                   DO  j = nysg, nyng
[1551]525                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]526                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
527                      ENDDO
528                   ENDDO
529                ENDDO
530                resorted = .TRUE.
[1]531             ELSE
[1007]532                CALL exchange_horiz( ql_vp_av, nbgp )
[1]533                to_be_resorted => ql_vp_av
534             ENDIF
535
[1053]536          CASE ( 'qr' )
537             IF ( av == 0 )  THEN
538                to_be_resorted => qr
539             ELSE
540                to_be_resorted => qr_av
541             ENDIF
542
[1]543          CASE ( 'qv' )
544             IF ( av == 0 )  THEN
[667]545                DO  i = nxlg, nxrg
546                   DO  j = nysg, nyng
[1551]547                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]548                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
549                      ENDDO
550                   ENDDO
551                ENDDO
552                resorted = .TRUE.
553             ELSE
554                to_be_resorted => qv_av
555             ENDIF
556
[2031]557          CASE ( 'rho_ocean' )
[96]558             IF ( av == 0 )  THEN
[2031]559                to_be_resorted => rho_ocean
[96]560             ELSE
[2031]561                to_be_resorted => rho_ocean_av
[96]562             ENDIF
[691]563
[1]564          CASE ( 's' )
565             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]566                to_be_resorted => s
[1]567             ELSE
[355]568                to_be_resorted => s_av
[1]569             ENDIF
[691]570
[96]571          CASE ( 'sa' )
572             IF ( av == 0 )  THEN
573                to_be_resorted => sa
574             ELSE
575                to_be_resorted => sa_av
576             ENDIF
[691]577
[1]578          CASE ( 'u' )
579             IF ( av == 0 )  THEN
580                to_be_resorted => u
581             ELSE
582                to_be_resorted => u_av
583             ENDIF
584
585          CASE ( 'v' )
586             IF ( av == 0 )  THEN
587                to_be_resorted => v
588             ELSE
589                to_be_resorted => v_av
590             ENDIF
591
592          CASE ( 'vpt' )
593             IF ( av == 0 )  THEN
594                to_be_resorted => vpt
595             ELSE
596                to_be_resorted => vpt_av
597             ENDIF
598
599          CASE ( 'w' )
600             IF ( av == 0 )  THEN
601                to_be_resorted => w
602             ELSE
603                to_be_resorted => w_av
604             ENDIF
[2007]605!             
606!--       Block of urban surface model outputs   
607          CASE ( 'usm_output' )
608             CALL usm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,     &
609                                         nzb_do, nzt_do )
[1]610
611          CASE DEFAULT
[1972]612
[1]613!
[1972]614!--          Land surface quantity
615             IF ( land_surface )  THEN
616!
617!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
618                nzb_do = nzb_soil
619                nzt_do = nzt_soil
620
621                DEALLOCATE ( local_pf )
622                ALLOCATE( local_pf(nxlg:nxrg,nysg:nyng,nzb_do:nzt_do) )
623
624                CALL lsm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf )
625                resorted = .TRUE.
[1976]626
627!
628!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
629                IF ( .NOT. found )  THEN
630                   nzb_do = nzb
631                   nzt_do = nz_do3d
632
633                   DEALLOCATE ( local_pf )
634                   ALLOCATE( local_pf(nxlg:nxrg,nysg:nyng,nzb_do:nzt_do) )                 
635                ENDIF
636
[1972]637             ENDIF
638
639!
[1976]640!--          Radiation quantity
641             IF ( .NOT. found  .AND.  radiation )  THEN
642                CALL radiation_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,         &
643                                               local_pf )
644                resorted = .TRUE.
645             ENDIF
646
647!
[2209]648!--          Plant canopy model output
649             IF ( .NOT. found  .AND.  plant_canopy )  THEN
650                CALL pcm_data_output_3d( av, do3d(av,if), found,         &
651                                               local_pf )
652                resorted = .TRUE.
653             ENDIF
654
655!
[1]656!--          User defined quantity
[1972]657             IF ( .NOT. found )  THEN
658                CALL user_data_output_3d( av, do3d(av,if), found, local_pf,    &
659                                          nzb_do, nzt_do )
660                resorted = .TRUE.
661             ENDIF
[1]662
[254]663             IF ( .NOT. found )  THEN
[1320]664                message_string =  'no output available for: ' //               &
[274]665                                  TRIM( do3d(av,if) )
[254]666                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]667             ENDIF
668
669       END SELECT
670
671!
672!--    Resort the array to be output, if not done above
673       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[667]674          DO  i = nxlg, nxrg
675             DO  j = nysg, nyng
[1551]676                DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]677                   local_pf(i,j,k) = to_be_resorted(k,j,i)
678                ENDDO
679             ENDDO
680          ENDDO
681       ENDIF
682
683!
[1327]684!--    Output of the 3D-array
685#if defined( __parallel )
686       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]687!
[1327]688!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
689!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
690!--       combine_plot_fields
691          IF ( myid == 0 )  THEN
692             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
693                           do3d_time_count(av), av
[1]694          ENDIF
[1327]695          DO  i = 0, io_blocks-1
696             IF ( i == io_group )  THEN
[1551]697                WRITE ( 30 )  nxlg, nxrg, nysg, nyng, nzb_do, nzt_do
698                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]699             ENDIF
[1972]700
[1327]701             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]702
[1327]703          ENDDO
[559]704
[1327]705       ELSE
[646]706#if defined( __netcdf )
[493]707!
[1327]708!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
709!--       Do not output redundant ghost point data except for the
710!--       boundaries of the total domain.
711          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
712             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]713                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
714                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
715                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1327]716          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
717             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]718                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
719                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
720                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1327]721          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
722             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]723                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
724                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
725                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1327]726          ELSE
727             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),  &
[1551]728                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
729                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
730                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1327]731          ENDIF
[1783]732          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]733#endif
[1327]734       ENDIF
[1]735#else
736#if defined( __netcdf )
[1327]737       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,if),        &
[1551]738                         local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),        &
[1327]739                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),     &
[1551]740                         count = (/ nx+2, ny+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]741       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]742#endif
743#endif
744
745       if = if + 1
746
747!
[1551]748!--    Deallocate temporary array
749       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]750
[1551]751    ENDDO
[1]752
[1318]753    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]754
755!
756!-- Formats.
[1320]7573300 FORMAT ('variable ',I4,'  file=',A,'  filetype=unformatted  skip=',I12/   &
[1]758             'label = ',A,A)
759
760 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.