source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 366

Last change on this file since 366 was 366, checked in by raasch, 12 years ago

speed optomizations +bugfix in init_ocean

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 43.0 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 366 2009-08-25 08:06:27Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98     # 16/04/09 - Marcus- Adjustments for lcsgib and lcsgih
99     # 21/04/09 - Siggi - adjustments for new IBM at DKRZ, which is now ibmh
100     # 18/05/09 - Siggi - Settings for serial jobs on lcsgi changed
101     # 24/06/09 - BjornM- adjustments for lcxt4 (loading modules manually)
102     # 08/07/09 - Siggi - option -e added (email notification on lcsgih/b)
103     # 20/07/09 - Siggi - On lcsgi, jobs for returning the job protocol are
104     #                    now run on the data nodes (feature=data)
105
106
107    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
108 delete_dayfile=false
109 email_notification=none
110 group_number=none
111 locat=normal
112 no_default_queue=none
113 no_submit=false
114 job_catalog="~/job_queue"
115 job_name=none
116 local_user=$LOGNAME
117 node_usage=shared
118 numprocs=1
119 punkte="..........................................................."
120 submcom=qsub
121 queue=default
122 remote_host=none
123 remote_user=""
124 verify=true
125
126 typeset  -i   cputime=0  memory=0  Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
127 typeset  -i   inumprocs  nodes=0  tasks_per_node=0  threads_per_task=1
128 typeset  -L20 spalte1
129 typeset  -R40 spalte2
130 typeset  -L60 spalte3
131
132
133
134    # FEHLERBEHANDLUNG
135    # BEI EXIT:
136 trap 'if [[ $locat != normal ]]
137       then
138          case  $locat  in
139             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
140                       printf " by typing:"
141                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
142             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
143             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
144                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
145          esac
146          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
147          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
148       fi' exit
149
150
151    # BEI TERMINAL-BREAK:
152 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
153       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
154       exit
155      ' 2
156
157
158
159
160    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
161 local_host=$(hostname)
162
163
164
165    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
166    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
167 case  $local_host  in
168     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
169     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
170     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
171     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
172     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
173     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
174     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
175     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
176     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
177     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
178     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
179     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
180     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
181     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
182     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
183     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
184     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
185     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
186     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
187     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
188     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
189     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
190     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
191     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
192     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
193     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
194     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
195     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
196     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
197     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
198     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
199     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
200     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
201     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
202     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
203     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
204     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
205     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
206     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
207                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
208                             locat=parameter; exit;;
209 esac
210
211
212
213    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
214 remote_host=$local_host
215
216
217
218
219    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
220 while  getopts  :c:dDe:g:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
221 do
222   case  $option  in
223       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
224       (d)   delete_dayfile=true;;
225       (D)   no_submit=true;;
226       (e)   email_notification=$OPTARG;;
227       (g)   group_number=$OPTARG;;
228       (h)   remote_host=$OPTARG;;
229       (m)   memory=$OPTARG;;
230       (n)   job_name=$OPTARG;;
231       (N)   node_usage=$OPTARG;;
232       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
233       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
234       (t)   cputime=$OPTARG;;
235       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
236       (u)   remote_user=$OPTARG;;
237       (v)   verify=false;;
238       (X)   numprocs=$OPTARG;;
239       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
240             locat=option; exit;;
241   esac
242 done
243
244
245    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
246 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
247
248
249    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
250 if [ "$1" = "?" ]
251 then
252   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
253    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
254    printf "\n      Description of available options:\n"
255    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
256    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
257    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
258    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
259    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
260    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
261    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
262    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
263    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
264    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
265    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
266    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
267    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
268    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
269    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
270    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
271    printf "\n "
272    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
273    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
274    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
275    exit
276 fi
277
278
279
280    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
281 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
282 then
283    printf "\n  +++ job-file missing"
284    locat=parameter; exit
285 else
286    if [[ -f $file_to_send ]]
287    then
288       true
289    else
290       printf "\n  +++ job-file: "
291       printf "\n           $file_to_send"
292       printf "\n      does not exist"
293       locat=parameter; exit
294    fi
295 fi
296
297
298
299    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
300    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
301 if [[ $job_name = none ]]
302 then
303    job_name=$file_to_send
304 fi
305 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
306 then
307    printf "\n  +++ job-file name: "
308    printf "\n           $job_name"
309    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
310    locat=parameter; exit
311 fi
312
313
314
315
316    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
317    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
318 if [[ $remote_host = none ]]
319 then
320    printf "\n  +++ host missing"
321    locat=option; exit
322 else
323    case  $remote_host  in
324        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
325        (ibmb)    queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
326        (ibmh)    queue=no_class; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
327        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
328        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
329        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
330        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
331        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
332        (lctit)   queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
333        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
334        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
335        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
336        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
337        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
338        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
339                  locat=parameter; exit;;
340    esac
341 fi
342
343
344    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
345 if [[ $no_default_queue != none ]]
346 then
347    error=false
348    ndq=$no_default_queue
349    case  $remote_host  in
350        (ibm)    case  $ndq  in
351                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
352                     (*)                                     error=true;;
353                 esac;;
354        (ibmb)   case  $ndq  in
355                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
356                     (*)                                     error=true;;
357                 esac;;
358        (ibmh)   case  $ndq  in
359                     (no_class)  error=false;;
360                     (*)                                     error=true;;
361                 esac;;
362        (ibms)   case  $ndq  in
363                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
364                     (*)                                     error=true;;
365                 esac;;
366        (ibmy)   case  $ndq  in
367                     (parallel)                              error=false;;
368                     (*)                                     error=true;;
369                 esac;;
370        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
371                     (testq|serialq|smallq|bigq|workq)       error=false;;
372                     (*)                                     error=true;;
373                 esac;;
374        (lctit)  case  $ndq  in
375                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
376                     (*)                                     error=true;;
377                 esac;;
378        (t3eb)   case  $ndq  in
379                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
380                     (*)    error=true;;
381                 esac;;
382        (necriam) case  $ndq  in
383                     (SP|SS|P6)  error=false;;
384                     (*)    error=true;;
385                 esac;;
386        (t3eh)   case  $ndq  in
387                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
388                     (*)    error=true;;
389                 esac;;
390        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
391                     (low|normal|high)  error=false;;
392                     (*)    error=true;;
393                 esac;;
394        (t3es)  case  $ndq  in
395                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
396                     (*)    error=true;;
397                 esac;;
398        (unics)  case  $ndq  in
399                     (unics|ht)  error=false;;
400                     (*)         error=true;;
401                 esac;;
402    esac
403    if [[ $error = true ]]
404    then
405       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
406       locat=parameter; exit
407    else
408       queue=$no_default_queue
409    fi
410 fi
411
412
413
414    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
415 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
416 then
417    node_usage=shared
418 fi
419
420
421
422    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
423    # AUFTEILEN
424 done=false
425 while [[ $done = false ]]
426 do
427    if (( $cputime <= 0 ))
428    then
429       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
430       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
431       printf "\n  >>> "
432       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
433    else
434       done=true
435    fi
436 done
437 if [[ $remote_host = nech ]]
438 then
439    if (( tasks_per_node != 0 ))
440    then
441       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
442    elif [[ $numprocs != 0 ]]
443    then
444       (( cputime = cputime * numprocs ))
445    fi
446 fi
447 (( stunden  = cputime / 3600 ))
448 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
449 (( minuten  = resttime / 60 ))
450 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
451 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
452
453
454
455    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
456 done=false
457 while [[ $done = false ]]
458 do
459    if (( memory <= 0 ))
460    then
461       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
462       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
463       printf "\n  >>> "
464       read  memory  1>/dev/null  2>&1
465    else
466       done=true
467    fi
468 done
469
470 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
471 then
472    if (( tasks_per_node != 0 ))
473    then
474       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
475    elif [[ $numprocs != 0 ]]
476    then
477       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
478    else
479       (( Memory = memory / 1000 ))
480    fi
481 fi
482
483
484    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
485 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
486 then
487    (( memory = memory * threads_per_task ))
488 fi
489
490
491    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
492 if (( tasks_per_node != 0 ))
493 then
494    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
495 fi
496
497
498
499    # HEADER-AUSGABE
500 if [[ $verify = true ]]
501 then
502    printf "\n\n"
503    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
504    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
505    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
506    printf "|                                                              | \n"
507    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
508    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
509    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
510    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
511    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
512    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
513    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
514    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
515    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
516    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
517    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
518    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
519    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
520    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
521
522
523       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
524    antwort="dummy"
525    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
526    do
527       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
528    done
529    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
530    then
531       locat=verify; exit
532    fi
533    printf "\n"
534 fi
535
536
537
538    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
539 kennung=$RANDOM
540 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
541 job_to_send=job_to_send_$kennung
542 if [[ $delete_dayfile = false ]]
543 then
544    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
545    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
546 else
547    remote_dayfile=/dev/null
548    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
549    then
550       notification='# @ notification = never'
551    fi
552 fi
553
554
555
556    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
557 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
558 then
559
560    if [[ $remote_host = ibmy ]]
561    then
562       consumable_memory=""
563    else
564       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
565    fi
566
567    if [[ $remote_host = ibmh ]]
568    then
569       data_limit=""
570       network_to_use=""
571       class=""
572       environment=""
573    else
574       class="# @ class = $queue"
575       environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
576       if [[ $queue = cdev ]]
577       then
578          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
579          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
580       else
581          if [[ $remote_host = ibms ]]
582          then
583             network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
584          elif [[ $remote_host = ibmy ]]
585          then
586             network_to_use=""
587          else
588             network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
589             data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
590          fi
591       fi
592    fi
593
594    cat > $job_to_send << %%END%%
595#!/bin/ksh
596# @ shell = /bin/ksh
597
598# @ job_type = parallel
599# @ job_name = palm
600# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
601# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
602# @ output = $remote_dayfile
603# @ error = $remote_dayfile
604# @ image_size = 50
605$class
606$environment
607$network_to_use
608$data_limit
609$notification
610
611%%END%%
612
613    if (( nodes > 0 ))
614    then
615
616       cat >> $job_to_send << %%END%%
617# @ node = $nodes
618# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
619# @ node_usage = $node_usage
620# @ queue
621
622%%END%%
623
624    else
625
626       if [[ $remote_host != ibmy ]]
627       then
628
629          cat >> $job_to_send << %%END%%
630# @ blocking = unlimited
631# @ total_tasks = $numprocs
632# @ node_usage = $node_usage
633# @ queue
634
635%%END%%
636
637       else
638
639          cat >> $job_to_send << %%END%%
640# @ node = 1
641# @ total_tasks = $numprocs
642# @ queue
643
644%%END%%
645
646       fi
647
648    fi
649
650 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
651 then
652
653    cat > $job_to_send << %%END%%
654#!/bin/ksh
655
656# @ job_type = serial
657# @ node_usage = $node_usage
658# @ job_name = palm
659# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
660# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
661# @ output = $remote_dayfile
662# @ error = $remote_dayfile
663$class
664$notification
665
666# @ queue
667
668%%END%%
669
670 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
671 then
672
673    if [[ $numprocs != 0 ]]
674    then
675       cat > $job_to_send << %%END%%
676#!/bin/ksh
677#PBS -N $job_name
678#PBS -A geofysisk
679#PBS -l walltime=$timestring
680#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
681#PBS -l pmem=${memory}mb
682#PBS -m abe
683#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
684#PBS -o $remote_dayfile
685#PBS -j oe
686mpd &
687
688%%END%%
689
690    else
691       cat > $job_to_send << %%END%%
692#!/bin/ksh
693#PBS -N $job_name
694#PBS -A geofysisk
695#PBS -l walltime=$timestring
696#PBS -l ncpus=1
697#PBS -l pmem=${memory}mb
698#PBS -m abe
699#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
700#PBS -o $remote_dayfile
701#PBS -j oe
702
703%%END%%
704
705    fi
706
707 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
708 then
709
710    if [[ $queue = testq  ||  $queue = workq ]]
711    then
712       queue_directive="#PBS -q $queue"
713    else
714       queue_directive=""
715    fi
716
717    if [[ $email_notification = none ]]
718    then
719       email_directive=""
720    else
721       email_directive="#PBS -M $email_notification"
722    fi
723
724    if [[ $numprocs != 0 ]]
725    then
726       cat > $job_to_send << %%END%%
727#!/bin/bash
728#PBS -N $job_name
729#PBS -l walltime=$timestring
730#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
731#PBS -l feature=$sgi_feature
732#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
733#PBS -o $remote_dayfile
734#PBS -j oe
735$queue_directive
736$email_directive
737
738. /usr/share/modules/init/bash
739module load ifort/11.0.069
740module load $mpilib
741# module load mvapich2/1.2rc1-intel
742# module load mvapich2
743module load netcdf
744#export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
745echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
746
747%%END%%
748
749    else
750       cat > $job_to_send << %%END%%
751#PBS -S /bin/bash
752#PBS -N $job_name
753#PBS -l walltime=$timestring
754#PBS -l ncpus=1
755#PBS -o $remote_dayfile
756#PBS -e $remote_dayfile
757
758%%END%%
759
760    fi
761
762 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
763 then
764
765    if [[ $numprocs != 0 ]]
766    then
767       cat > $job_to_send << %%END%%
768#!/bin/ksh
769#PBS -S /bin/ksh
770#PBS -N $job_name
771#PBS -A geofysisk
772#PBS -j oe
773#PBS -l walltime=$timestring
774#PBS -l mppwidth=${numprocs}
775#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
776#PBS -m abe
777#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
778#PBS -o $remote_dayfile
779
780. /opt/modules/default/init/ksh
781module load modules/3.1.6
782module load PrgEnv-pgi/2.1.56HD
783module load Base-opts/2.1.56HD
784module load moab/5.2.5-s13441
785module load torque/2.3.4-snap.200809221601
786
787%%END%%
788
789    else
790       cat > $job_to_send << %%END%%
791#!/bin/ksh
792#PBS -S /bin/ksh
793#PBS -N $job_name
794#PBS -A geofysisk
795#PBS -j oe
796#PBS -l walltime=$timestring
797#PBS -l ncpus=1
798#PBS -l pmem=${memory}mb
799#PBS -m abe
800#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
801#PBS -o $remote_dayfile
802
803. /opt/modules/default/init/ksh
804module load modules/3.1.6
805module load PrgEnv-pgi/2.1.56HD
806module load Base-opts/2.1.56HD
807module load moab/5.2.5-s13441
808module load torque/2.3.4-snap.200809221601
809
810%%END%%
811
812    fi
813
814 elif [[ $remote_host = nech ]]
815 then
816
817    if (( nodes > 1 ))
818    then
819       cat > $job_to_send << %%END%%
820#!/bin/ksh
821#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
822#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
823#PBS -b $nodes
824#PBS -o $remote_dayfile
825#PBS -N palm
826#PBS -j o
827#PBS -T mpisx
828
829%%END%%
830
831    elif [[ $numprocs != 0 ]]
832    then
833       cat > $job_to_send << %%END%%
834#!/bin/ksh
835#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
836#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
837#PBS -o $remote_dayfile
838#PBS -N palm
839#PBS -j o
840
841%%END%%
842
843    else
844       cat > $job_to_send << %%END%%
845#!/bin/ksh
846#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
847#PBS -o $remote_dayfile
848#PBS -j o
849
850%%END%%
851
852    fi
853
854 elif [[ $remote_host = necriam ]]
855 then
856
857    if (( nodes > 1 ))
858    then
859       cat > $job_to_send << %%END%%
860#!/bin/ksh
861#PBS -b $nodes
862#PBS -o $remote_dayfile
863#PBS -N $job_name
864#PBS -j o
865#PBS -v MPIPROGINV=YES
866
867%%END%%
868
869    elif [[ $numprocs != 0 ]]
870    then
871       cat > $job_to_send << %%END%%
872#!/bin/ksh
873#PBS -q ${queue}
874#PBS -o $remote_dayfile
875#PBS -N $job_name
876#PBS -j o
877#PBS -v MPIPROGINV=YES
878
879%%END%%
880
881    else
882       cat > $job_to_send << %%END%%
883#!/bin/ksh
884#PBS -o $remote_dayfile
885#PBS -j o
886
887%%END%%
888
889    fi
890
891 elif [[ $remote_host = lctit ]]
892 then
893    cat > $job_to_send << %%END%%
894#!/bin/bash
895#$ -S /bin/bash
896cd $job_catalog
897export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
898echo \$PATH
899
900%%END%%
901
902       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
903  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
904    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
905
906 else
907
908    cat > $job_to_send << %%END%%
909# @\$-q ${queue}
910# @\$-l${qsubtime} $timestring
911# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
912# @\$-o $remote_dayfile
913# @\$-eo
914
915%%END%%
916
917 fi
918
919
920    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
921    # BEI EXIT VERANLASSEN
922    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
923    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
924 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
925 then
926    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
927    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
928    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
929    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
930    then
931       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
932       then
933          return_queue=c1
934       elif [[ $remote_host = ibms ]]
935       then
936          return_queue=p_normal
937       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
938       then
939          return_queue=serial
940       elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
941       then
942          return_queue=serialq
943       elif [[ $remote_host = lctit ]]
944       then
945          return_queue=sla3
946       elif [[ $remote_host = necriam ]]
947       then
948          return_queue=SP
949       else
950          return_queue=unknown
951       fi
952
953       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
954       then
955
956          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
957          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
958          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
959          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
960          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
961          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
962          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
963          if [[ $host != "ibmh" ]]
964          then
965             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
966          fi
967          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
968          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
969
970          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
971          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
972
973          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
974          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
975          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
976
977       elif [[ $remote_host = nech ]]
978       then
979          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
980          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
981          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
982          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
983          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
984          echo " "                                 >>  $job_to_send
985          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
986          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
987          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
988          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
989          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
990
991       elif [[ $remote_host = necriam ]]
992       then
993          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
994          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
995          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
996          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
997          echo " "                                 >>  $job_to_send
998          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
999          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1000          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1001          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1002
1003       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1004       then
1005          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1006          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1007          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
1008          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
1009          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
1010          echo "#PBS -l feature=data"                    >>  $job_to_send
1011          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1012          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
1013          echo " "                                 >>  $job_to_send
1014          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
1015          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1016          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1017          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1018          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1019
1020       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1021       then
1022          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
1023          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
1024          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
1025          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
1026          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1027          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1028          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
1029
1030       else
1031
1032          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1033          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1034          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1035          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1036          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1037          then
1038             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1039          fi
1040          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1041#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1042          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1043          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1044          echo " "                                 >>  $job_to_send
1045          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1046          then
1047             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1048             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1049          fi
1050          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1051          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1052          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1053          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1054       fi
1055
1056       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1057       then
1058          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1059       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1060       then
1061          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1062          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1063       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1064       then
1065          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1066          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1067          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1068          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1069       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1070       then
1071          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1072       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1073       then
1074          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1075       else
1076          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1077       fi
1078       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1079       if [[ $remote_host = nech ]]
1080       then
1081          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1082       fi
1083    else
1084#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1085       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1086    fi
1087    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1088    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1089    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1090 fi
1091
1092
1093
1094    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1095 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1096
1097 if [[ $remote_host = ibm ]]
1098 then
1099    echo " "         >>  $job_to_send
1100    echo "exit"      >>  $job_to_send
1101 fi
1102 if [[ $remote_host = lctit ]]
1103 then
1104    echo " "                               >>  $job_to_send
1105    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1106 fi
1107
1108
1109
1110    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1111 if [[ -z $remote_user ]]
1112 then
1113    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1114    then
1115       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1116    fi
1117 fi
1118
1119
1120
1121    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1122 if [[ $no_submit = false ]]
1123 then
1124    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1125    then
1126       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1127       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1128       then
1129          job_catalog_save=$job_catalog
1130          job_catalog=job_queue
1131       elif [[ $remote_host = nech ]]
1132       then
1133          job_catalog_save=$job_catalog
1134          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1135       fi
1136       if [[ $local_host = decalpha ]]
1137       then
1138             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1139             # PASSWORT AB
1140          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1141       elif [[ $remote_host = nech ]]
1142       then
1143             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1144             # TRANSFERIERT WERDEN
1145          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1146       else
1147          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1148       fi
1149       if [[ $? = 1 ]]
1150       then
1151          locat=scp; exit
1152       fi
1153       if [[ $remote_host = ibms ]]
1154       then
1155          job_catalog=$job_catalog_save
1156       fi
1157       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1158    else
1159       eval  job_catalog=$job_catalog
1160       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1161    fi
1162
1163
1164
1165       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1166    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1167    then
1168       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1169       if [[ $remote_host != lctit ]]
1170       then
1171          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1172       else
1173             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1174             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1175             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1176          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1177          echo "first try" > send_protocol
1178          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1179          do
1180             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1181             then
1182                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1183             else
1184                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1185             fi
1186             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1 
1187             cat send_protocol
1188          done
1189          sleep 10
1190          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1191          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1192          rm  send_protocol
1193       fi
1194
1195       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1196    else
1197       cd  $job_catalog
1198       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1199       then
1200          eval  $submcom  $job_on_remhost
1201       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1202       then
1203          eval  $submcom  $job_on_remhost
1204          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1205          chmod  u+x  $job_on_remhost
1206       elif [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1207       then
1208          eval  $submcom  $job_on_remhost
1209       elif [[ $local_host = nech ]]
1210       then
1211          if [[ $queue = default ]]
1212          then
1213             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1214          else
1215             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1216          fi
1217       else
1218          qsub  $job_on_remhost
1219       fi
1220          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1221       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1222       cd  -  > /dev/null
1223    fi
1224 fi
1225
1226
1227
1228    # ABSCHLUSSARBEITEN
1229
1230 if [[ $no_submit = false ]]
1231 then
1232    rm  $job_to_send
1233 fi
1234 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.