source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 352

Last change on this file since 352 was 352, checked in by raasch, 14 years ago

+option -e in subjob

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 42.8 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 352 2009-07-08 16:26:02Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98     # 16/04/09 - Marcus- Adjustments for lcsgib and lcsgih
99     # 21/04/09 - Siggi - adjustments for new IBM at DKRZ, which is now ibmh
100     # 18/05/09 - Siggi - Settings for serial jobs on lcsgi changed
101     # 24/06/09 - BjornM- adjustments for lcxt4 (loading modules manually)
102     # 08/07/09 - Siggi - option -e added (email notification on lcsgih/b)
103
104
105    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
106 delete_dayfile=false
107 email_notification=none
108 group_number=none
109 locat=normal
110 no_default_queue=none
111 no_submit=false
112 job_catalog="~/job_queue"
113 job_name=none
114 local_user=$LOGNAME
115 node_usage=shared
116 numprocs=1
117 punkte="..........................................................."
118 submcom=qsub
119 queue=default
120 remote_host=none
121 remote_user=""
122 verify=true
123
124 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
125 typeset  -i   inumprocs  nodes=tasks_per_node=threads_per_task=1
126 typeset  -L20 spalte1
127 typeset  -R40 spalte2
128 typeset  -L60 spalte3
129
130
131
132    # FEHLERBEHANDLUNG
133    # BEI EXIT:
134 trap 'if [[ $locat != normal ]]
135       then
136          case  $locat  in
137             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
138                       printf " by typing:"
139                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
140             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
141             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
142                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
143          esac
144          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
145          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
146       fi' exit
147
148
149    # BEI TERMINAL-BREAK:
150 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
151       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
152       exit
153      ' 2
154
155
156
157
158    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
159 local_host=$(hostname)
160
161
162
163    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
164    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
165 case  $local_host  in
166     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
167     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
168     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
169     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
170     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
171     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
172     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
173     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
174     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
175     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
176     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
177     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
178     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
179     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
180     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
181     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
182     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
183     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
184     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
185     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
186     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
187     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
188     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
189     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
190     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
191     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
192     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
193     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
194     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
195     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
196     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
197     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
198     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
199     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
200     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
201     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
202     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
203     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
204     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
205                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
206                             locat=parameter; exit;;
207 esac
208
209
210
211    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
212 remote_host=$local_host
213
214
215
216
217    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
218 while  getopts  :c:dDe:g:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
219 do
220   case  $option  in
221       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
222       (d)   delete_dayfile=true;;
223       (D)   no_submit=true;;
224       (e)   email_notification=$OPTARG;;
225       (g)   group_number=$OPTARG;;
226       (h)   remote_host=$OPTARG;;
227       (m)   memory=$OPTARG;;
228       (n)   job_name=$OPTARG;;
229       (N)   node_usage=$OPTARG;;
230       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
231       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
232       (t)   cputime=$OPTARG;;
233       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
234       (u)   remote_user=$OPTARG;;
235       (v)   verify=false;;
236       (X)   numprocs=$OPTARG;;
237       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
238             locat=option; exit;;
239   esac
240 done
241
242
243    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
244 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
245
246
247    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
248 if [ "$1" = "?" ]
249 then
250   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
251    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
252    printf "\n      Description of available options:\n"
253    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
254    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
255    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
256    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
257    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
258    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
259    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
260    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
261    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
262    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
263    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
264    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
265    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
266    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
267    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
268    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
269    printf "\n "
270    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
271    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
272    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
273    exit
274 fi
275
276
277
278    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
279 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
280 then
281    printf "\n  +++ job-file missing"
282    locat=parameter; exit
283 else
284    if [[ -f $file_to_send ]]
285    then
286       true
287    else
288       printf "\n  +++ job-file: "
289       printf "\n           $file_to_send"
290       printf "\n      does not exist"
291       locat=parameter; exit
292    fi
293 fi
294
295
296
297    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
298    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
299 if [[ $job_name = none ]]
300 then
301    job_name=$file_to_send
302 fi
303 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
304 then
305    printf "\n  +++ job-file name: "
306    printf "\n           $job_name"
307    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
308    locat=parameter; exit
309 fi
310
311
312
313
314    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
315    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
316 if [[ $remote_host = none ]]
317 then
318    printf "\n  +++ host missing"
319    locat=option; exit
320 else
321    case  $remote_host  in
322        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
323        (ibmb)    queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
324        (ibmh)    queue=no_class; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
325        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
326        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
327        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
328        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
329        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
330        (lctit)   queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
331        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
332        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
333        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
334        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
335        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
336        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
337                  locat=parameter; exit;;
338    esac
339 fi
340
341
342    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
343 if [[ $no_default_queue != none ]]
344 then
345    error=false
346    ndq=$no_default_queue
347    case  $remote_host  in
348        (ibm)    case  $ndq  in
349                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
350                     (*)                                     error=true;;
351                 esac;;
352        (ibmb)   case  $ndq  in
353                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
354                     (*)                                     error=true;;
355                 esac;;
356        (ibmh)   case  $ndq  in
357                     (no_class)  error=false;;
358                     (*)                                     error=true;;
359                 esac;;
360        (ibms)   case  $ndq  in
361                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
362                     (*)                                     error=true;;
363                 esac;;
364        (ibmy)   case  $ndq  in
365                     (parallel)                              error=false;;
366                     (*)                                     error=true;;
367                 esac;;
368        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
369                     (testq|serialq|smallq|bigq)             error=false;;
370                     (*)                                     error=true;;
371                 esac;;
372        (lctit)  case  $ndq  in
373                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
374                     (*)                                     error=true;;
375                 esac;;
376        (t3eb)   case  $ndq  in
377                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
378                     (*)    error=true;;
379                 esac;;
380        (necriam) case  $ndq  in
381                     (SP|SS|P6)  error=false;;
382                     (*)    error=true;;
383                 esac;;
384        (t3eh)   case  $ndq  in
385                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
386                     (*)    error=true;;
387                 esac;;
388        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
389                     (low|normal|high)  error=false;;
390                     (*)    error=true;;
391                 esac;;
392        (t3es)  case  $ndq  in
393                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
394                     (*)    error=true;;
395                 esac;;
396        (unics)  case  $ndq  in
397                     (unics|ht)  error=false;;
398                     (*)         error=true;;
399                 esac;;
400    esac
401    if [[ $error = true ]]
402    then
403       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
404       locat=parameter; exit
405    else
406       queue=$no_default_queue
407    fi
408 fi
409
410
411
412    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
413 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
414 then
415    node_usage=shared
416 fi
417
418
419
420    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
421    # AUFTEILEN
422 done=false
423 while [[ $done = false ]]
424 do
425    if (( $cputime <= 0 ))
426    then
427       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
428       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
429       printf "\n  >>> "
430       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
431    else
432       done=true
433    fi
434 done
435 if [[ $remote_host = nech ]]
436 then
437    if (( tasks_per_node != 0 ))
438    then
439       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
440    elif [[ $numprocs != 0 ]]
441    then
442       (( cputime = cputime * numprocs ))
443    fi
444 fi
445 (( stunden  = cputime / 3600 ))
446 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
447 (( minuten  = resttime / 60 ))
448 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
449 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
450
451
452
453    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
454 done=false
455 while [[ $done = false ]]
456 do
457    if (( memory <= 0 ))
458    then
459       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
460       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
461       printf "\n  >>> "
462       read  memory  1>/dev/null  2>&1
463    else
464       done=true
465    fi
466 done
467
468 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
469 then
470    if (( tasks_per_node != 0 ))
471    then
472       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
473    elif [[ $numprocs != 0 ]]
474    then
475       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
476    else
477       (( Memory = memory / 1000 ))
478    fi
479 fi
480
481
482    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
483 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
484 then
485    (( memory = memory * threads_per_task ))
486 fi
487
488
489    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
490 if (( tasks_per_node != 0 ))
491 then
492    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
493 fi
494
495
496
497    # HEADER-AUSGABE
498 if [[ $verify = true ]]
499 then
500    printf "\n\n"
501    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
502    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
503    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
504    printf "|                                                              | \n"
505    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
506    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
507    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
508    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
509    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
510    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
511    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
512    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
513    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
514    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
515    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
516    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
517    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
518    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
519
520
521       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
522    antwort="dummy"
523    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
524    do
525       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
526    done
527    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
528    then
529       locat=verify; exit
530    fi
531    printf "\n"
532 fi
533
534
535
536    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
537 kennung=$RANDOM
538 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
539 job_to_send=job_to_send_$kennung
540 if [[ $delete_dayfile = false ]]
541 then
542    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
543    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
544 else
545    remote_dayfile=/dev/null
546    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
547    then
548       notification='# @ notification = never'
549    fi
550 fi
551
552
553
554    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
555 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
556 then
557
558    if [[ $remote_host = ibmy ]]
559    then
560       consumable_memory=""
561    else
562       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
563    fi
564
565    if [[ $remote_host = ibmh ]]
566    then
567       data_limit=""
568       network_to_use=""
569       class=""
570       environment=""
571    else
572       class="# @ class = $queue"
573       environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
574       if [[ $queue = cdev ]]
575       then
576          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
577          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
578       else
579          if [[ $remote_host = ibms ]]
580          then
581             network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
582          elif [[ $remote_host = ibmy ]]
583          then
584             network_to_use=""
585          else
586             network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
587             data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
588          fi
589       fi
590    fi
591
592    cat > $job_to_send << %%END%%
593#!/bin/ksh
594# @ shell = /bin/ksh
595
596# @ job_type = parallel
597# @ job_name = palm
598# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
599# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
600# @ output = $remote_dayfile
601# @ error = $remote_dayfile
602# @ image_size = 50
603$class
604$environment
605$network_to_use
606$data_limit
607$notification
608
609%%END%%
610
611    if (( nodes > 0 ))
612    then
613
614       cat >> $job_to_send << %%END%%
615# @ node = $nodes
616# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
617# @ node_usage = $node_usage
618# @ queue
619
620%%END%%
621
622    else
623
624       if [[ $remote_host != ibmy ]]
625       then
626
627          cat >> $job_to_send << %%END%%
628# @ blocking = unlimited
629# @ total_tasks = $numprocs
630# @ node_usage = $node_usage
631# @ queue
632
633%%END%%
634
635       else
636
637          cat >> $job_to_send << %%END%%
638# @ node = 1
639# @ total_tasks = $numprocs
640# @ queue
641
642%%END%%
643
644       fi
645
646    fi
647
648 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
649 then
650
651    cat > $job_to_send << %%END%%
652#!/bin/ksh
653
654# @ job_type = serial
655# @ node_usage = $node_usage
656# @ job_name = palm
657# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
658# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
659# @ output = $remote_dayfile
660# @ error = $remote_dayfile
661$class
662$notification
663
664# @ queue
665
666%%END%%
667
668 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
669 then
670
671    if [[ $numprocs != 0 ]]
672    then
673       cat > $job_to_send << %%END%%
674#!/bin/ksh
675#PBS -N $job_name
676#PBS -A geofysisk
677#PBS -l walltime=$timestring
678#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
679#PBS -l pmem=${memory}mb
680#PBS -m abe
681#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
682#PBS -o $remote_dayfile
683#PBS -j oe
684mpd &
685
686%%END%%
687
688    else
689       cat > $job_to_send << %%END%%
690#!/bin/ksh
691#PBS -N $job_name
692#PBS -A geofysisk
693#PBS -l walltime=$timestring
694#PBS -l ncpus=1
695#PBS -l pmem=${memory}mb
696#PBS -m abe
697#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
698#PBS -o $remote_dayfile
699#PBS -j oe
700
701%%END%%
702
703    fi
704
705 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
706 then
707
708    if [[ $queue = testq ]]
709    then
710       queue_directive="#PBS -q $queue"
711    else
712       queue_directive=""
713    fi
714
715    if [[ $email_notification = none ]]
716    then
717       email_directive=""
718    else
719       email_directive="#PBS -M $email_notification"
720    fi
721
722    if [[ $numprocs != 0 ]]
723    then
724       cat > $job_to_send << %%END%%
725#!/bin/bash
726#PBS -N $job_name
727#PBS -l walltime=$timestring
728#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
729#PBS -l feature=$sgi_feature
730#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
731#PBS -o $remote_dayfile
732#PBS -j oe
733$queue_directive
734$email_directive
735
736. /usr/share/modules/init/bash
737module load $mpilib
738# module load mvapich2/1.2rc1-intel
739# module load mvapich2
740module load netcdf
741export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
742echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
743
744%%END%%
745
746    else
747       cat > $job_to_send << %%END%%
748#PBS -S /bin/bash
749#PBS -N $job_name
750#PBS -l walltime=$timestring
751#PBS -l ncpus=1
752#PBS -o $remote_dayfile
753#PBS -e $remote_dayfile
754
755%%END%%
756
757    fi
758
759 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
760 then
761
762    if [[ $numprocs != 0 ]]
763    then
764       cat > $job_to_send << %%END%%
765#!/bin/ksh
766#PBS -S /bin/ksh
767#PBS -N $job_name
768#PBS -A geofysisk
769#PBS -j oe
770#PBS -l walltime=$timestring
771#PBS -l mppwidth=${numprocs}
772#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
773#PBS -m abe
774#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
775#PBS -o $remote_dayfile
776
777. /opt/modules/default/init/ksh
778module load modules/3.1.6
779module load PrgEnv-pgi/2.1.56HD
780module load Base-opts/2.1.56HD
781module load moab/5.2.5-s13441
782module load torque/2.3.4-snap.200809221601
783
784%%END%%
785
786    else
787       cat > $job_to_send << %%END%%
788#!/bin/ksh
789#PBS -S /bin/ksh
790#PBS -N $job_name
791#PBS -A geofysisk
792#PBS -j oe
793#PBS -l walltime=$timestring
794#PBS -l ncpus=1
795#PBS -l pmem=${memory}mb
796#PBS -m abe
797#PBS -M maronga@muk.uni-hannover.de
798#PBS -o $remote_dayfile
799
800. /opt/modules/default/init/ksh
801module load modules/3.1.6
802module load PrgEnv-pgi/2.1.56HD
803module load Base-opts/2.1.56HD
804module load moab/5.2.5-s13441
805module load torque/2.3.4-snap.200809221601
806
807%%END%%
808
809    fi
810
811 elif [[ $remote_host = nech ]]
812 then
813
814    if (( nodes > 1 ))
815    then
816       cat > $job_to_send << %%END%%
817#!/bin/ksh
818#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
819#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
820#PBS -b $nodes
821#PBS -o $remote_dayfile
822#PBS -N palm
823#PBS -j o
824#PBS -T mpisx
825
826%%END%%
827
828    elif [[ $numprocs != 0 ]]
829    then
830       cat > $job_to_send << %%END%%
831#!/bin/ksh
832#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
833#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
834#PBS -o $remote_dayfile
835#PBS -N palm
836#PBS -j o
837
838%%END%%
839
840    else
841       cat > $job_to_send << %%END%%
842#!/bin/ksh
843#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
844#PBS -o $remote_dayfile
845#PBS -j o
846
847%%END%%
848
849    fi
850
851 elif [[ $remote_host = necriam ]]
852 then
853
854    if (( nodes > 1 ))
855    then
856       cat > $job_to_send << %%END%%
857#!/bin/ksh
858#PBS -b $nodes
859#PBS -o $remote_dayfile
860#PBS -N $job_name
861#PBS -j o
862#PBS -v MPIPROGINV=YES
863
864%%END%%
865
866    elif [[ $numprocs != 0 ]]
867    then
868       cat > $job_to_send << %%END%%
869#!/bin/ksh
870#PBS -q ${queue}
871#PBS -o $remote_dayfile
872#PBS -N $job_name
873#PBS -j o
874#PBS -v MPIPROGINV=YES
875
876%%END%%
877
878    else
879       cat > $job_to_send << %%END%%
880#!/bin/ksh
881#PBS -o $remote_dayfile
882#PBS -j o
883
884%%END%%
885
886    fi
887
888 elif [[ $remote_host = lctit ]]
889 then
890    cat > $job_to_send << %%END%%
891#!/bin/bash
892#$ -S /bin/bash
893cd $job_catalog
894export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
895echo \$PATH
896
897%%END%%
898
899       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
900  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
901    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
902
903 else
904
905    cat > $job_to_send << %%END%%
906# @\$-q ${queue}
907# @\$-l${qsubtime} $timestring
908# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
909# @\$-o $remote_dayfile
910# @\$-eo
911
912%%END%%
913
914 fi
915
916
917    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
918    # BEI EXIT VERANLASSEN
919    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
920    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
921 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
922 then
923    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
924    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
925    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
926    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
927    then
928       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
929       then
930          return_queue=c1
931       elif [[ $remote_host = ibms ]]
932       then
933          return_queue=p_normal
934       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
935       then
936          return_queue=serial
937       elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
938       then
939          return_queue=serialq
940       elif [[ $remote_host = lctit ]]
941       then
942          return_queue=sla3
943       elif [[ $remote_host = necriam ]]
944       then
945          return_queue=SP
946       else
947          return_queue=unknown
948       fi
949
950       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
951       then
952
953          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
954          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
955          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
956          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
957          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
958          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
959          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
960          if [[ $host != "ibmh" ]]
961          then
962             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
963          fi
964          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
965          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
966
967          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
968          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
969
970          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
971          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
972          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
973
974       elif [[ $remote_host = nech ]]
975       then
976          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
977          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
978          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
979          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
980          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
981          echo " "                                 >>  $job_to_send
982          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
983          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
984          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
985          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
986          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
987
988       elif [[ $remote_host = necriam ]]
989       then
990          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
991          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
992          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
993          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
994          echo " "                                 >>  $job_to_send
995          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
996          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
997          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
998          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
999
1000       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1001       then
1002          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1003          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1004          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
1005          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
1006          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
1007          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
1008          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1009          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
1010          echo " "                                 >>  $job_to_send
1011          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
1012          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1013          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1014          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1015          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1016
1017       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1018       then
1019          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
1020          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
1021          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
1022          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
1023          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1024          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1025          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
1026
1027       else
1028
1029          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1030          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1031          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1032          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1033          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1034          then
1035             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1036          fi
1037          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1038#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1039          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1040          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1041          echo " "                                 >>  $job_to_send
1042          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1043          then
1044             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1045             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1046          fi
1047          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1048          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1049          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1050          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1051       fi
1052
1053       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1054       then
1055          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1056       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1057       then
1058          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1059          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1060       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1061       then
1062          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1063          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1064          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1065          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1066       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1067       then
1068          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1069       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1070       then
1071          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1072       else
1073          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1074       fi
1075       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1076       if [[ $remote_host = nech ]]
1077       then
1078          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1079       fi
1080    else
1081#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1082       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1083    fi
1084    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1085    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1086    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1087 fi
1088
1089
1090
1091    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1092 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1093
1094 if [[ $remote_host = ibm ]]
1095 then
1096    echo " "         >>  $job_to_send
1097    echo "exit"      >>  $job_to_send
1098 fi
1099 if [[ $remote_host = lctit ]]
1100 then
1101    echo " "                               >>  $job_to_send
1102    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1103 fi
1104
1105
1106
1107    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1108 if [[ -z $remote_user ]]
1109 then
1110    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1111    then
1112       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1113    fi
1114 fi
1115
1116
1117
1118    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1119 if [[ $no_submit = false ]]
1120 then
1121    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1122    then
1123       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1124       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1125       then
1126          job_catalog_save=$job_catalog
1127          job_catalog=job_queue
1128       elif [[ $remote_host = nech ]]
1129       then
1130          job_catalog_save=$job_catalog
1131          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1132       fi
1133       if [[ $local_host = decalpha ]]
1134       then
1135             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1136             # PASSWORT AB
1137          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1138       elif [[ $remote_host = nech ]]
1139       then
1140             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1141             # TRANSFERIERT WERDEN
1142          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1143       else
1144          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1145       fi
1146       if [[ $? = 1 ]]
1147       then
1148          locat=scp; exit
1149       fi
1150       if [[ $remote_host = ibms ]]
1151       then
1152          job_catalog=$job_catalog_save
1153       fi
1154       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1155    else
1156       eval  job_catalog=$job_catalog
1157       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1158    fi
1159
1160
1161
1162       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1163    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1164    then
1165       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1166       if [[ $remote_host != lctit ]]
1167       then
1168          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1169       else
1170             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1171             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1172             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1173          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1174          echo "first try" > send_protocol
1175          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1176          do
1177             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1178             then
1179                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1180             else
1181                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1182             fi
1183             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1
1184             cat send_protocol
1185          done
1186          sleep 10
1187          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1188          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1189          rm  send_protocol
1190       fi
1191
1192       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1193    else
1194       cd  $job_catalog
1195       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1196       then
1197          eval  $submcom  $job_on_remhost
1198       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1199       then
1200          eval  $submcom  $job_on_remhost
1201          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1202          chmod  u+x  $job_on_remhost
1203       elif [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1204       then
1205          eval  $submcom  $job_on_remhost
1206       elif [[ $local_host = nech ]]
1207       then
1208          if [[ $queue = default ]]
1209          then
1210             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1211          else
1212             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1213          fi
1214       else
1215          qsub  $job_on_remhost
1216       fi
1217          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1218       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1219       cd  -  > /dev/null
1220    fi
1221 fi
1222
1223
1224
1225    # ABSCHLUSSARBEITEN
1226
1227 if [[ $no_submit = false ]]
1228 then
1229    rm  $job_to_send
1230 fi
1231 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.