source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 320

Last change on this file since 320 was 312, checked in by raasch, 12 years ago

adjustments for IBM at DKRZ (ibmh)

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 41.9 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 312 2009-05-12 10:54:28Z letzel $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98     # 16/04/09 - Marcus- Adjustments for lcsgib and lcsgih
99     # 21/04/09 - Siggi - adjustments for new IBM at DKRZ, which is now ibmh
100
101
102
103    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
104 delete_dayfile=false 
105 group_number=none
106 locat=normal
107 no_default_queue=none
108 no_submit=false
109 job_catalog="~/job_queue"
110 job_name=none
111 local_user=$LOGNAME
112 node_usage=shared
113 numprocs=1
114 punkte="..........................................................."
115 submcom=qsub
116 queue=default
117 remote_host=none
118 remote_user=""
119 verify=true
120
121 typeset  -i   cputime=0  memory=0  Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
122 typeset  -i   inumprocs  nodes=0  tasks_per_node=0  threads_per_task=1
123 typeset  -L20 spalte1
124 typeset  -R40 spalte2
125 typeset  -L60 spalte3
126
127
128
129    # FEHLERBEHANDLUNG
130    # BEI EXIT:
131 trap 'if [[ $locat != normal ]]
132       then
133          case  $locat  in
134             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
135                       printf " by typing:"
136                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
137             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
138             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
139                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
140          esac
141          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
142          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
143       fi' exit
144
145
146    # BEI TERMINAL-BREAK:
147 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
148       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
149       exit
150      ' 2
151
152
153
154
155    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
156 local_host=$(hostname)
157
158
159
160    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
161    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
162 case  $local_host  in
163     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
164     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
165     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
166     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
167     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
168     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
169     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
170     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
171     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
172     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
173     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
174     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
175     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
176     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
177     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
178     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
179     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
180     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
181     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
182     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
183     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
184     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
185     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
186     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
187     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
188     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
189     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
190     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
191     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
192     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
193     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
194     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
195     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
196     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
197     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
198     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
199     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
200     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
201     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
202                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
203                             locat=parameter; exit;;
204 esac
205
206
207
208    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
209 remote_host=$local_host
210
211
212
213
214    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
215 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
216 do
217   case  $option  in
218       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
219       (d)   delete_dayfile=true;;
220       (D)   no_submit=true;;
221       (g)   group_number=$OPTARG;;
222       (h)   remote_host=$OPTARG;;
223       (m)   memory=$OPTARG;;
224       (n)   job_name=$OPTARG;;
225       (N)   node_usage=$OPTARG;;
226       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
227       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
228       (t)   cputime=$OPTARG;;
229       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
230       (u)   remote_user=$OPTARG;;
231       (v)   verify=false;;
232       (X)   numprocs=$OPTARG;;
233       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
234             locat=option; exit;;
235   esac
236 done
237
238
239    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
240 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
241
242
243    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
244 if [ "$1" = "?" ]
245 then
246   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
247    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
248    printf "\n      Description of available options:\n"
249    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
250    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
251    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
252    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
253    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
254    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
255    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
256    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
257    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
258    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
259    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
260    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
261    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
262    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
263    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
264    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
265    printf "\n "
266    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
267    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
268    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
269    exit
270 fi
271
272
273
274    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
275 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
276 then
277    printf "\n  +++ job-file missing"
278    locat=parameter; exit
279 else
280    if [[ -f $file_to_send ]]
281    then
282       true
283    else
284       printf "\n  +++ job-file: "
285       printf "\n           $file_to_send"
286       printf "\n      does not exist"
287       locat=parameter; exit
288    fi
289 fi
290
291
292
293    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
294    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
295 if [[ $job_name = none ]]
296 then
297    job_name=$file_to_send
298 fi
299 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
300 then
301    printf "\n  +++ job-file name: "
302    printf "\n           $job_name"
303    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
304    locat=parameter; exit
305 fi
306
307
308
309
310    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
311    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
312 if [[ $remote_host = none ]]
313 then
314    printf "\n  +++ host missing"
315    locat=option; exit
316 else
317    case  $remote_host  in
318        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
319        (ibmb)    queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
320        (ibmh)    queue=no_class; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
321        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
322        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
323        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
324        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
325        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
326        (lctit)   queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
327        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
328        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
329        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
330        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
331        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
332        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
333                  locat=parameter; exit;;
334    esac
335 fi
336
337
338    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
339 if [[ $no_default_queue != none ]]
340 then
341    error=false
342    ndq=$no_default_queue
343    case  $remote_host  in
344        (ibm)    case  $ndq  in
345                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
346                     (*)                                     error=true;;
347                 esac;;
348        (ibmb)   case  $ndq  in
349                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
350                     (*)                                     error=true;;
351                 esac;;
352        (ibmh)   case  $ndq  in
353                     (no_class)  error=false;;
354                     (*)                                     error=true;;
355                 esac;;
356        (ibms)   case  $ndq  in
357                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
358                     (*)                                     error=true;;
359                 esac;;
360        (ibmy)   case  $ndq  in
361                     (parallel)                              error=false;;
362                     (*)                                     error=true;;
363                 esac;;
364        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
365                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
366                     (*)                                     error=true;;
367                 esac;;
368        (lctit)  case  $ndq  in
369                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
370                     (*)                                     error=true;;
371                 esac;;
372        (t3eb)   case  $ndq  in
373                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
374                     (*)    error=true;;
375                 esac;;
376        (necriam) case  $ndq  in
377                     (SP|SS|P6)  error=false;;
378                     (*)    error=true;;
379                 esac;;
380        (t3eh)   case  $ndq  in
381                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
382                     (*)    error=true;;
383                 esac;;
384        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
385                     (low|normal|high)  error=false;;
386                     (*)    error=true;;
387                 esac;;
388        (t3es)  case  $ndq  in
389                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
390                     (*)    error=true;;
391                 esac;;
392        (unics)  case  $ndq  in
393                     (unics|ht)  error=false;;
394                     (*)         error=true;;
395                 esac;;
396    esac
397    if [[ $error = true ]]
398    then
399       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
400       locat=parameter; exit
401    else
402       queue=$no_default_queue
403    fi
404 fi
405
406
407
408    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
409 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
410 then
411    node_usage=shared
412 fi
413
414
415
416    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
417    # AUFTEILEN
418 done=false
419 while [[ $done = false ]]
420 do
421    if (( $cputime <= 0 ))
422    then
423       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
424       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
425       printf "\n  >>> "
426       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
427    else
428       done=true
429    fi
430 done
431 if [[ $remote_host = nech ]]
432 then
433    if (( tasks_per_node != 0 ))
434    then
435       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
436    elif [[ $numprocs != 0 ]]
437    then
438       (( cputime = cputime * numprocs ))
439    fi
440 fi
441 (( stunden  = cputime / 3600 ))
442 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
443 (( minuten  = resttime / 60 ))
444 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
445 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
446
447
448
449    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
450 done=false
451 while [[ $done = false ]]
452 do
453    if (( memory <= 0 ))
454    then
455       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
456       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
457       printf "\n  >>> "
458       read  memory  1>/dev/null  2>&1
459    else
460       done=true
461    fi
462 done
463
464 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
465 then
466    if (( tasks_per_node != 0 ))
467    then
468       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
469    elif [[ $numprocs != 0 ]]
470    then
471       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
472    else
473       (( Memory = memory / 1000 ))
474    fi
475 fi
476
477
478    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
479 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
480 then
481    (( memory = memory * threads_per_task ))
482 fi
483
484
485    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
486 if (( tasks_per_node != 0 ))
487 then
488    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
489 fi
490
491
492
493    # HEADER-AUSGABE
494 if [[ $verify = true ]]
495 then
496    printf "\n\n"
497    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
498    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
499    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
500    printf "|                                                              | \n"
501    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
502    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
503    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
504    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
505    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
506    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
507    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
508    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
509    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
510    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
511    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
512    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
513    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
514    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
515
516
517       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
518    antwort="dummy"
519    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
520    do
521       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
522    done
523    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
524    then
525       locat=verify; exit
526    fi
527    printf "\n"
528 fi
529
530
531
532    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
533 kennung=$RANDOM
534 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
535 job_to_send=job_to_send_$kennung
536 if [[ $delete_dayfile = false ]]
537 then
538    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
539    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
540 else
541    remote_dayfile=/dev/null
542    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
543    then
544       notification='# @ notification = never'
545    fi
546 fi
547
548
549
550    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
551 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
552 then
553
554    if [[ $remote_host = ibmy ]]
555    then
556       consumable_memory=""
557    else
558       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
559    fi
560
561    if [[ $remote_host = ibmh ]]
562    then
563       data_limit=""
564       network_to_use=""
565       class=""
566       environment=""
567    else
568       class="# @ class = $queue"
569       environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
570       if [[ $queue = cdev ]]
571       then
572          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
573          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
574       else
575          if [[ $remote_host = ibms ]]
576          then
577             network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
578          elif [[ $remote_host = ibmy ]]
579          then
580             network_to_use=""
581          else
582             network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
583             data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
584          fi
585       fi
586    fi
587
588    cat > $job_to_send << %%END%%
589#!/bin/ksh
590# @ shell = /bin/ksh
591
592# @ job_type = parallel
593# @ job_name = palm
594# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
595# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
596# @ output = $remote_dayfile
597# @ error = $remote_dayfile
598# @ image_size = 50
599$class
600$environment
601$network_to_use
602$data_limit
603$notification
604
605%%END%%
606
607    if (( nodes > 0 ))
608    then
609
610       cat >> $job_to_send << %%END%%
611# @ node = $nodes
612# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
613# @ node_usage = $node_usage
614# @ queue
615
616%%END%%
617
618    else
619
620       if [[ $remote_host != ibmy ]]
621       then
622
623          cat >> $job_to_send << %%END%%
624# @ blocking = unlimited
625# @ total_tasks = $numprocs
626# @ node_usage = $node_usage
627# @ queue
628
629%%END%%
630
631       else
632
633          cat >> $job_to_send << %%END%%
634# @ node = 1
635# @ total_tasks = $numprocs
636# @ queue
637
638%%END%%
639
640       fi
641
642    fi
643
644 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
645 then
646
647    cat > $job_to_send << %%END%%
648#!/bin/ksh
649
650# @ job_type = serial
651# @ node_usage = $node_usage
652# @ job_name = palm
653# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
654# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
655# @ output = $remote_dayfile
656# @ error = $remote_dayfile
657$class
658$notification
659
660# @ queue
661
662%%END%%
663
664 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
665 then
666
667    if [[ $numprocs != 0 ]]
668    then
669       cat > $job_to_send << %%END%%
670#!/bin/ksh
671#PBS -N $job_name
672#PBS -A geofysisk
673#PBS -l walltime=$timestring
674#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
675#PBS -l pmem=${memory}mb
676#PBS -m abe
677#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
678#PBS -o $remote_dayfile
679#PBS -j oe
680mpd &
681
682%%END%%
683
684    else
685       cat > $job_to_send << %%END%%
686#!/bin/ksh
687#PBS -N $job_name
688#PBS -A geofysisk
689#PBS -l walltime=$timestring
690#PBS -l ncpus=1
691#PBS -l pmem=${memory}mb
692#PBS -m abe
693#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
694#PBS -o $remote_dayfile
695#PBS -j oe
696
697%%END%%
698
699    fi
700
701 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
702 then
703
704    if [[ $queue = testq ]]
705    then
706       queue_directive="#PBS -q $queue"
707    else
708       queue_directive=""
709    fi
710
711    if [[ $numprocs != 0 ]]
712    then
713       cat > $job_to_send << %%END%%
714#!/bin/bash
715#PBS -N $job_name
716#PBS -l walltime=$timestring
717#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
718#PBS -l feature=$sgi_feature
719#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
720#PBS -o $remote_dayfile
721#PBS -j oe
722$queue_directive
723
724. /usr/share/modules/init/bash
725module load $mpilib
726# module load mvapich2/1.2rc1-intel
727# module load mvapich2
728module load netcdf
729export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
730echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
731
732%%END%%
733
734    else
735       cat > $job_to_send << %%END%%
736#PBS -S /bin/bash
737#PBS -N $job_name
738#PBS -l walltime=$timestring
739#PBS -l ncpus=1
740#PBS -o $remote_dayfile
741#PBS -e $remote_dayfile
742
743%%END%%
744
745    fi
746
747 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
748 then
749
750    if [[ $numprocs != 0 ]]
751    then
752       cat > $job_to_send << %%END%%
753#!/bin/ksh
754#PBS -S /bin/ksh
755#PBS -N $job_name
756#PBS -A geofysisk
757#PBS -j oe
758#PBS -l walltime=$timestring
759#PBS -l mppwidth=${numprocs}
760#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
761#PBS -m abe
762#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
763#PBS -o $remote_dayfile
764
765%%END%%
766
767    else
768       cat > $job_to_send << %%END%%
769#!/bin/ksh
770#PBS -S /bin/ksh
771#PBS -N $job_name
772#PBS -A geofysisk
773#PBS -j oe
774#PBS -l walltime=$timestring
775#PBS -l ncpus=1
776#PBS -l pmem=${memory}mb
777#PBS -m abe
778#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
779#PBS -o $remote_dayfile
780
781%%END%%
782
783    fi
784
785 elif [[ $remote_host = nech ]]
786 then
787
788    if (( nodes > 1 ))
789    then
790       cat > $job_to_send << %%END%%
791#!/bin/ksh
792#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
793#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
794#PBS -b $nodes
795#PBS -o $remote_dayfile
796#PBS -N palm
797#PBS -j o
798#PBS -T mpisx
799
800%%END%%
801
802    elif [[ $numprocs != 0 ]]
803    then
804       cat > $job_to_send << %%END%%
805#!/bin/ksh
806#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
807#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
808#PBS -o $remote_dayfile
809#PBS -N palm
810#PBS -j o
811
812%%END%%
813
814    else
815       cat > $job_to_send << %%END%%
816#!/bin/ksh
817#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
818#PBS -o $remote_dayfile
819#PBS -j o
820
821%%END%%
822
823    fi
824
825 elif [[ $remote_host = necriam ]]
826 then
827
828    if (( nodes > 1 ))
829    then
830       cat > $job_to_send << %%END%%
831#!/bin/ksh
832#PBS -b $nodes
833#PBS -o $remote_dayfile
834#PBS -N $job_name
835#PBS -j o
836#PBS -v MPIPROGINV=YES
837
838%%END%%
839
840    elif [[ $numprocs != 0 ]]
841    then
842       cat > $job_to_send << %%END%%
843#!/bin/ksh
844#PBS -q ${queue}
845#PBS -o $remote_dayfile
846#PBS -N $job_name
847#PBS -j o
848#PBS -v MPIPROGINV=YES
849
850%%END%%
851
852    else
853       cat > $job_to_send << %%END%%
854#!/bin/ksh
855#PBS -o $remote_dayfile
856#PBS -j o
857
858%%END%%
859
860    fi
861
862 elif [[ $remote_host = lctit ]]
863 then
864    cat > $job_to_send << %%END%%
865#!/bin/bash
866#$ -S /bin/bash
867cd $job_catalog
868export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
869echo \$PATH
870
871%%END%%
872
873       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
874  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
875    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
876
877 else
878
879    cat > $job_to_send << %%END%%
880# @\$-q ${queue}
881# @\$-l${qsubtime} $timestring
882# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
883# @\$-o $remote_dayfile
884# @\$-eo
885
886%%END%%
887
888 fi
889
890
891    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
892    # BEI EXIT VERANLASSEN
893    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
894    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
895 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
896 then
897    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
898    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
899    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
900    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
901    then
902       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
903       then
904          return_queue=c1
905       elif [[ $remote_host = ibms ]]
906       then
907          return_queue=p_normal
908       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
909       then
910          return_queue=serial
911       elif [[ $remote_host = lctit ]]
912       then
913          return_queue=sla3
914       elif [[ $remote_host = necriam ]]
915       then
916          return_queue=SP
917       else
918          return_queue=unknown
919       fi
920
921       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
922       then
923
924          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
925          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
926          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
927          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
928          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
929          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
930          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
931          if [[ $host != "ibmh" ]]
932          then
933             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
934          fi
935          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
936          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
937
938          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
939          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
940
941          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
942          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
943          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
944
945       elif [[ $remote_host = nech ]]
946       then
947          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
948          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
949          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
950          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
951          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
952          echo " "                                 >>  $job_to_send
953          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
954          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
955          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
956          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
957          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
958
959       elif [[ $remote_host = necriam ]]
960       then
961          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
962          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
963          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
964          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
965          echo " "                                 >>  $job_to_send
966          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
967          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
968          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
969          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
970
971       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
972       then
973          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
974          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
975          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
976          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
977          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
978          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
979          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
980          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
981          echo " "                                 >>  $job_to_send
982          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
983          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
984          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
985          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
986          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
987
988       elif [[ $remote_host = lctit ]]
989       then
990          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
991          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
992          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
993          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
994          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
995          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
996          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
997
998       else
999
1000          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1001          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1002          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1003          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1004          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1005          then
1006             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1007          fi
1008          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1009#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1010          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1011          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1012          echo " "                                 >>  $job_to_send
1013          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1014          then
1015             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1016             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1017          fi
1018          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1019          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1020          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1021          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1022       fi
1023
1024       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1025       then
1026          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1027       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1028       then
1029          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1030          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1031       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1032       then
1033          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1034          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1035          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1036          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1037       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1038       then
1039          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1040       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1041       then
1042          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1043       else
1044          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1045       fi
1046       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1047       if [[ $remote_host = nech ]]
1048       then
1049          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1050       fi
1051    else
1052#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1053       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1054    fi
1055    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1056    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1057    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1058 fi
1059
1060
1061
1062    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1063 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1064
1065 if [[ $remote_host = ibm ]]
1066 then
1067    echo " "         >>  $job_to_send
1068    echo "exit"      >>  $job_to_send
1069 fi
1070 if [[ $remote_host = lctit ]]
1071 then
1072    echo " "                               >>  $job_to_send
1073    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1074 fi
1075
1076
1077
1078    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1079 if [[ -z $remote_user ]]
1080 then
1081    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1082    then
1083       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1084    fi
1085 fi
1086
1087
1088
1089    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1090 if [[ $no_submit = false ]]
1091 then
1092    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1093    then
1094       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1095       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1096       then
1097          job_catalog_save=$job_catalog
1098          job_catalog=job_queue
1099       elif [[ $remote_host = nech ]]
1100       then
1101          job_catalog_save=$job_catalog
1102          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1103       fi
1104       if [[ $local_host = decalpha ]]
1105       then
1106             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1107             # PASSWORT AB
1108          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1109       elif [[ $remote_host = nech ]]
1110       then
1111             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1112             # TRANSFERIERT WERDEN
1113          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1114       else
1115          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1116       fi
1117       if [[ $? = 1 ]]
1118       then
1119          locat=scp; exit
1120       fi
1121       if [[ $remote_host = ibms ]]
1122       then
1123          job_catalog=$job_catalog_save
1124       fi
1125       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1126    else
1127       eval  job_catalog=$job_catalog
1128       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1129    fi
1130
1131
1132
1133       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1134    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1135    then
1136       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1137       if [[ $remote_host != lctit ]]
1138       then
1139          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1140       else
1141             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1142             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1143             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1144          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1145          echo "first try" > send_protocol
1146          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1147          do
1148             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1149             then
1150                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1151             else
1152                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1153             fi
1154             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1 
1155             cat send_protocol
1156          done
1157          sleep 10
1158          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1159          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1160          rm  send_protocol
1161       fi
1162
1163       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1164    else
1165       cd  $job_catalog
1166       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1167       then
1168          eval  $submcom  $job_on_remhost
1169       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1170       then
1171          eval  $submcom  $job_on_remhost
1172          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1173          chmod  u+x  $job_on_remhost
1174       elif [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1175       then
1176          eval  $submcom  $job_on_remhost
1177       elif [[ $local_host = nech ]]
1178       then
1179          if [[ $queue = default ]]
1180          then
1181             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1182          else
1183             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1184          fi
1185       else
1186          qsub  $job_on_remhost
1187       fi
1188          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1189       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1190       cd  -  > /dev/null
1191    fi
1192 fi
1193
1194
1195
1196    # ABSCHLUSSARBEITEN
1197
1198 if [[ $no_submit = false ]]
1199 then
1200    rm  $job_to_send
1201 fi
1202 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.