source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 208

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ocean-atmosphere coupling realized with MPI-1, adjustments in mrun, mbuild, subjob for lcxt4

  • Property svn:keywords set to Id Rev
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RevLine 
[1]1#!/bin/ksh
[82]2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
[169]3# $Id: subjob 206 2008-10-13 14:59:11Z raasch $
[1]4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
[5]81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
[35]82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
[82]83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
[102]84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
[108]85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
[113]86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
[118]87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
[122]89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
[125]90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
[129]91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
[164]92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
[179]94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
[205]95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
[206]96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
[1]97
98
[206]99
[1]100    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
101 delete_dayfile=false
[122]102 group_number=none
[1]103 locat=normal
104 no_default_queue=none
105 no_submit=false
106 job_catalog="~/job_queue"
107 job_name=none
108 local_user=$LOGNAME
109 node_usage=shared
110 numprocs=1
111 punkte="..........................................................."
112 submcom=qsub
113 queue=default
114 remote_host=none
115 remote_user=""
116 verify=true
117
118 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
119 typeset  -i   inumprocs  nodes=tasks_per_node=threads_per_task=1
120 typeset  -L20 spalte1
121 typeset  -R40 spalte2
122 typeset  -L60 spalte3
123
124
125
126    # FEHLERBEHANDLUNG
127    # BEI EXIT:
128 trap 'if [[ $locat != normal ]]
129       then
130          case  $locat  in
131             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
132                       printf " by typing:"
133                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
134             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
135             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
136                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
137          esac
138          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
139          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
140       fi' exit
141
142
143    # BEI TERMINAL-BREAK:
144 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
145       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
146       exit
147      ' 2
148
149
150
151
152    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
153 local_host=$(hostname)
154
155
156
157    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
158    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
159 case  $local_host  in
160     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
[102]161     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
[5]162     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
[1]163     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
[12]164     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
[196]165     (b01*)                  local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
[108]166     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[1]167     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
[5]168     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
[108]169     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[101]170     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
[35]171     (gate|n-sx)             local_addres=133.5.178.11;   local_host=neck;;
[1]172     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
173     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
[5]174     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
175     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
[164]176     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
[1]177     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
[181]178     (h01*)                  local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[5]179     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
180     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
181     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
[164]182     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
[1]183     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
[5]184     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
185     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
[205]186     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
[5]187     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
[1]188     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
[181]189     (service100)            local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[1]190     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
[181]191     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[196]192     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
[1]193     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
194     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
195     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
196                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
197                             locat=parameter; exit;;
198 esac
199
200
201
202    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
203 remote_host=$local_host
204
205
206
207
208    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
[122]209 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
[1]210 do
211   case  $option  in
212       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
213       (d)   delete_dayfile=true;;
214       (D)   no_submit=true;;
[125]215       (g)   group_number=$OPTARG;;
[1]216       (h)   remote_host=$OPTARG;;
217       (m)   memory=$OPTARG;;
218       (n)   job_name=$OPTARG;;
219       (N)   node_usage=$OPTARG;;
220       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
221       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
222       (t)   cputime=$OPTARG;;
223       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
224       (u)   remote_user=$OPTARG;;
225       (v)   verify=false;;
226       (X)   numprocs=$OPTARG;;
227       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
228             locat=option; exit;;
229   esac
230 done
231
232
233    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
234 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
235
236
237    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
238 if [ "$1" = "?" ]
239 then
240   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
241    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
242    printf "\n      Description of available options:\n"
243    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
244    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
245    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
246    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
247    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
[5]248    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
[35]249    printf "\n              lctit, nech, neck, unics"
[1]250    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
251    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
252    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
253    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
254    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
255    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
256    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
257    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
258    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
259    printf "\n "
260    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
261    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
262    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
263    exit
264 fi
265
266
267
268    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
269 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
270 then
271    printf "\n  +++ job-file missing"
272    locat=parameter; exit
273 else
274    if [[ -f $file_to_send ]]
275    then
276       true
277    else
278       printf "\n  +++ job-file: "
279       printf "\n           $file_to_send"
280       printf "\n      does not exist"
281       locat=parameter; exit
282    fi
283 fi
284
285
286
287    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
288    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
289 if [[ $job_name = none ]]
290 then
291    job_name=$file_to_send
292 fi
293 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
294 then
295    printf "\n  +++ job-file name: "
296    printf "\n           $job_name"
297    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
298    locat=parameter; exit
299 fi
300
301
302
303
304    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
305    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
306 if [[ $remote_host = none ]]
307 then
308    printf "\n  +++ host missing"
309    locat=option; exit
310 else
311    case  $remote_host  in
312        (ibm)    queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
313        (ibmb)   queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
314        (ibmh)   queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
315        (ibms)   queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
316        (ibmy)   queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[108]317        (lcfimm) remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
[196]318        (lcsgib) queue=smallq; remote_addres=130.73.232.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
[191]319        (lcsgih) queue=smallq; remote_addres=130.75.4.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
[118]320        (lctit)  queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
[164]321        (lcxt4)  remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
[1]322        (nech)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
[35]323        (neck)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=133.5.178.11; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
[1]324        (vpp)    qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
325        (unics)  qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
326        (*)      printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
327                 locat=parameter; exit;;
328    esac
329 fi
330
331
332    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
333 if [[ $no_default_queue != none ]]
334 then
335    error=false
336    ndq=$no_default_queue
337    case  $remote_host  in
338        (ibm)    case  $ndq  in
339                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
340                     (*)                                     error=true;;
341                 esac;;
342        (ibmb)   case  $ndq  in
343                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
344                     (*)                                     error=true;;
345                 esac;;
346        (ibmh)   case  $ndq  in
[113]347                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
[1]348                     (*)                                     error=true;;
349                 esac;;
350        (ibms)   case  $ndq  in
351                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
352                     (*)                                     error=true;;
353                 esac;;
354        (ibmy)   case  $ndq  in
355                     (parallel)                              error=false;;
356                     (*)                                     error=true;;
357                 esac;;
[191]358        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
359                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
360                     (*)                                     error=true;;
361                 esac;;
[1]362        (lctit)  case  $ndq  in
[129]363                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
[1]364                     (*)                                     error=true;;
365                 esac;;
366        (t3eb)   case  $ndq  in
367                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
368                     (*)    error=true;;
369                 esac;;
370        (t3eh)   case  $ndq  in
371                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
372                     (*)    error=true;;
373                 esac;;
374        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
375                     (low|normal|high)  error=false;;
376                     (*)    error=true;;
377                 esac;;
378        (t3es)  case  $ndq  in
379                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
380                     (*)    error=true;;
381                 esac;;
382        (unics)  case  $ndq  in
383                     (unics|ht)  error=false;;
384                     (*)         error=true;;
385                 esac;;
386    esac
387    if [[ $error = true ]]
388    then
389       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
390       locat=parameter; exit
391    else
392       queue=$no_default_queue
393    fi
394 fi
395
396
397
398    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
399 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
400 then
401    node_usage=shared
402 fi
403
404
405
406    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
407    # AUFTEILEN
408 done=false
409 while [[ $done = false ]]
410 do
411    if (( $cputime <= 0 ))
412    then
413       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
414       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
415       printf "\n  >>> "
416       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
417    else
418       done=true
419    fi
420 done
421 if [[ $remote_host = nech ]]
422 then
423    if (( tasks_per_node != 0 ))
424    then
425       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
426    elif [[ $numprocs != 0 ]]
427    then
428       (( cputime = cputime * numprocs ))
429    fi
430 fi
431 (( stunden  = cputime / 3600 ))
432 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
433 (( minuten  = resttime / 60 ))
434 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
435 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
436
437
438
439    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
440 done=false
441 while [[ $done = false ]]
442 do
443    if (( memory <= 0 ))
444    then
445       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
446       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
447       printf "\n  >>> "
448       read  memory  1>/dev/null  2>&1
449    else
450       done=true
451    fi
452 done
453
[35]454 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = neck ]]
[1]455 then
456    if (( tasks_per_node != 0 ))
457    then
458       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
459    elif [[ $numprocs != 0 ]]
460    then
461       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
462    else
463       (( Memory = memory / 1000 ))
464    fi
465 fi
466
467
468    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
469 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
470 then
471    (( memory = memory * threads_per_task ))
472 fi
473
474
475    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
476 if (( tasks_per_node != 0 ))
477 then
478    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
479 fi
480
481
482
483    # HEADER-AUSGABE
484 if [[ $verify = true ]]
485 then
486    printf "\n\n"
487    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
488    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
489    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
490    printf "|                                                              | \n"
491    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
492    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
493    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
494    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
495    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
496    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
497    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
498    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
499    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
500    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
501    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
502    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
503    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
504    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
505
506
507       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
508    antwort="dummy"
509    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
510    do
511       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
512    done
513    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
514    then
515       locat=verify; exit
516    fi
517    printf "\n"
518 fi
519
520
521
522    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
523 kennung=$RANDOM
524 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
525 job_to_send=job_to_send_$kennung
526 if [[ $delete_dayfile = false ]]
527 then
528    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
529    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
530 else
531    remote_dayfile=/dev/null
532    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
533    then
534       notification='# @ notification = never'
535    fi
536 fi
537
538
539
540    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
541 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
542 then
543
544    if [[ $remote_host = ibmy ]]
545    then
546       consumable_memory=""
547    else
548       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
549    fi
550    if [[ $queue = cdev ]]
551    then
552       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
553       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
554    else
555       if [[ $remote_host = ibms ]]
556       then
557          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
558       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
559       then
560          network_to_use=""
561       else
562          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
563          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
564       fi
565    fi
566
567    cat > $job_to_send << %%END%%
568#!/bin/ksh
569
570# @ job_type = parallel
571# @ job_name = palm
572# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
573# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
574# @ output = $remote_dayfile
575# @ error = $remote_dayfile
576# @ image_size = 50
577# @ class = $queue
578# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
579$network_to_use
580$data_limit
581$notification
582
583%%END%%
584
585    if (( nodes > 0 ))
586    then
587
588       cat >> $job_to_send << %%END%%
589# @ node = $nodes
590# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
591# @ node_usage = $node_usage
592# @ queue
593
594%%END%%
595
596    else
597
598       if [[ $remote_host != ibmy ]]
599       then
600
601          cat >> $job_to_send << %%END%%
602# @ blocking = unlimited
603# @ total_tasks = $numprocs
604# @ node_usage = $node_usage
605# @ queue
606
607%%END%%
608
609       else
610
611          cat >> $job_to_send << %%END%%
612# @ node = 1
613# @ total_tasks = $numprocs
614# @ queue
615
616%%END%%
617
618       fi
619
620    fi
621
622 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
623 then
624
625    cat > $job_to_send << %%END%%
626#!/bin/ksh
627
628# @ job_type = serial
629# @ node_usage = $node_usage
630# @ job_name = palm
631# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
632# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
633# @ output = $remote_dayfile
634# @ error = $remote_dayfile
635# @ class = $queue
636$notification
637
638# @ queue
639
640%%END%%
641
[108]642 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
643 then
644
645    if [[ $numprocs != 0 ]]
646    then
647       cat > $job_to_send << %%END%%
648#!/bin/ksh
649#PBS -N $job_name
[206]650#PBS -A geofysisk
[108]651#PBS -l walltime=$timestring
652#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
653#PBS -l pmem=${memory}mb
654#PBS -m abe
[206]655#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
[108]656#PBS -o $remote_dayfile
657#PBS -j oe
658mpd &
659
660%%END%%
661
[168]662    else
663       cat > $job_to_send << %%END%%
664#!/bin/ksh
665#PBS -N $job_name
[206]666#PBS -A geofysisk
[168]667#PBS -l walltime=$timestring
668#PBS -l ncpus=1
669#PBS -l pmem=${memory}mb
670#PBS -m abe
[206]671#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
[168]672#PBS -o $remote_dayfile
673#PBS -j oe
674
675%%END%%
676
677    fi
678
[181]679 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
[179]680 then
681
[191]682    if [[ $queue = testq ]]
683    then
684       queue_directive="#PBS -q $queue"
685    else
686       queue_directive=""
687    fi
688
[179]689    if [[ $numprocs != 0 ]]
690    then
691       cat > $job_to_send << %%END%%
[181]692#!/bin/bash
[179]693#PBS -N $job_name
694#PBS -l walltime=$timestring
[181]695#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
696#PBS -l feature=$sgi_feature
697#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
[179]698#PBS -o $remote_dayfile
699#PBS -j oe
[191]700$queue_directive
[179]701
702. /usr/share/modules/init/bash
[196]703module load mpt
704# module load mvapich2/1.2rc1-intel
705# module load mvapich2
[179]706module load netcdf
[181]707export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
708echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
[179]709
710%%END%%
711
712    else
713       cat > $job_to_send << %%END%%
714#PBS -S /bin/bash
715#PBS -N $job_name
716#PBS -l walltime=$timestring
717#PBS -l ncpus=1
718#PBS -o $remote_dayfile
719#PBS -e $remote_dayfile
720
721%%END%%
722
723    fi
724
[164]725 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
726 then
727
728    if [[ $numprocs != 0 ]]
729    then
730       cat > $job_to_send << %%END%%
731#!/bin/ksh
732#PBS -S /bin/ksh
733#PBS -N $job_name
[206]734#PBS -A geofysisk
735#PBS -j oe
[164]736#PBS -l walltime=$timestring
737#PBS -l mppwidth=${numprocs}
738#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
739#PBS -m abe
[206]740#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
[164]741#PBS -o $remote_dayfile
742
743%%END%%
744
[108]745    else
746       cat > $job_to_send << %%END%%
747#!/bin/ksh
[168]748#PBS -S /bin/ksh
[108]749#PBS -N $job_name
[206]750#PBS -A geofysisk
751#PBS -j oe
[108]752#PBS -l walltime=$timestring
753#PBS -l ncpus=1
754#PBS -l pmem=${memory}mb
755#PBS -m abe
[206]756#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
[108]757#PBS -o $remote_dayfile
758
759%%END%%
760
761    fi
762
[1]763 elif [[ $remote_host = nech ]]
764 then
765
766    if (( nodes > 1 ))
767    then
768       cat > $job_to_send << %%END%%
769#!/bin/ksh
770#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
771#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
772#PBS -b $nodes
773#PBS -o $remote_dayfile
774#PBS -N palm
775#PBS -j o
776#PBS -T mpisx
777
778%%END%%
779
780    elif [[ $numprocs != 0 ]]
781    then
782       cat > $job_to_send << %%END%%
783#!/bin/ksh
784#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
785#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
786#PBS -o $remote_dayfile
787#PBS -N palm
788#PBS -j o
789
790%%END%%
791
792    else
793       cat > $job_to_send << %%END%%
794#!/bin/ksh
795#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
796#PBS -o $remote_dayfile
797#PBS -j o
798
799%%END%%
800
801    fi
802
[35]803 elif [[ $remote_host = neck ]]
804 then
805
806    if (( nodes > 1 ))
807    then
808       cat > $job_to_send << %%END%%
809#!/bin/ksh
810#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
811#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
812#PBS -b $nodes
813#PBS -o $remote_dayfile
814#PBS -N palm
815#PBS -j o
816#PBS -T mpisx
817
818%%END%%
819
820    elif [[ $numprocs != 0 ]]
821    then
822       cat > $job_to_send << %%END%%
823#!/bin/ksh
824#PBS -q ${queue}
825#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
826#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
827#PBS -o $remote_dayfile
828#PBS -N palm
829#PBS -j o
830#PBS -T mpisx
831
832%%END%%
833
834    else
835       cat > $job_to_send << %%END%%
836#!/bin/ksh
837#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
838#PBS -o $remote_dayfile
839#PBS -j o
840
841%%END%%
842
843    fi
844
[1]845 elif [[ $remote_host = lctit ]]
846 then
847    cat > $job_to_send << %%END%%
848#!/bin/bash
849#$ -S /bin/bash
850cd $job_catalog
[69]851export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
852echo \$PATH
[1]853
854%%END%%
855
856       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
[118]857  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
[122]858    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
[1]859
860 else
861
862    cat > $job_to_send << %%END%%
863# @\$-q ${queue}
864# @\$-l${qsubtime} $timestring
865# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
866# @\$-o $remote_dayfile
867# @\$-eo
868
869%%END%%
870
871 fi
872
873
874    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
875    # BEI EXIT VERANLASSEN
876    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
877    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
878 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
879 then
880    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
881    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
882    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
[181]883    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
[1]884    then
885       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
886       then
887          return_queue=c1
888       elif [[ $remote_host = ibms ]]
889       then
890          return_queue=p_normal
891       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
892       then
893          return_queue=serial
894       elif [[ $remote_host = lctit ]]
895       then
[118]896          return_queue=sla3
[35]897       elif [[ $remote_host = neck ]]
[1]898       then
[35]899          return_queue=S
[1]900       else
901          return_queue=unknown
902       fi
903
904       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
905       then
906
907          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
908          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
909          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
910          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
911          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
912          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
913          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
914          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
915          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
916          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
917
918          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
919          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
920
921          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
922          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
923          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
924
925       elif [[ $remote_host = nech ]]
926       then
927          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
928          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
929          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
930          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
931          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
932          echo " "                                 >>  $job_to_send
933          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
934          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
935          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
936          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
937          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
938
[35]939       elif [[ $remote_host = neck ]]
940       then
941          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
942          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
943          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
944          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
945          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
946          echo " "                                 >>  $job_to_send
947          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
948          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
949          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
950          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
951
[181]952       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
953       then
954          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
955          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
956          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
957          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
958          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
959          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
960          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
961          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
962          echo " "                                 >>  $job_to_send
963          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
964          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
965          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
966          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
967          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
968
[1]969       elif [[ $remote_host = lctit ]]
970       then
971          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
972          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
973          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
974          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
975          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
976          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
977          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
978
979       else
980
981          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
982          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
983          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
984          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
985          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
986          then
987             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
988          fi
989          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
990#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
991          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
992          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
993          echo " "                                 >>  $job_to_send
994          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
995          then
996             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
997             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
998          fi
999          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1000          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1001          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1002          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1003       fi
1004
1005       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1006       then
1007          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
[181]1008       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1009       then
1010          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1011          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
[1]1012       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1013       then
1014          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1015          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1016          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1017          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1018       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1019       then
1020          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1021       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1022       then
1023          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1024       else
1025          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1026       fi
1027       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1028       if [[ $remote_host = nech ]]
1029       then
1030          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1031       fi
1032    else
1033#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1034       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1035    fi
1036    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1037    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1038    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1039 fi
1040
1041
1042
1043    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1044 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
[69]1045
[1]1046 if [[ $remote_host = ibm ]]
1047 then
1048    echo " "         >>  $job_to_send
1049    echo "exit"      >>  $job_to_send
1050 fi
[69]1051 if [[ $remote_host = lctit ]]
1052 then
1053    echo " "                               >>  $job_to_send
1054    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1055 fi
[1]1056
1057
1058
1059    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1060 if [[ -z $remote_user ]]
1061 then
1062    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1063    then
1064       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1065    fi
1066 fi
1067
1068
1069
1070    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1071 if [[ $no_submit = false ]]
1072 then
1073    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1074    then
1075       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
[82]1076       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
[1]1077       then
[82]1078          job_catalog_save=$job_catalog
1079          job_catalog=job_queue
1080       elif [[ $remote_host = nech ]]
1081       then
1082          job_catalog_save=$job_catalog
1083          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1084       fi
1085       if [[ $local_host = decalpha ]]
1086       then
1087             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1088             # PASSWORT AB
1089          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1090       elif [[ $remote_host = nech ]]
1091       then
1092             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1093             # TRANSFERIERT WERDEN
1094          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1095       else
[82]1096          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1097       fi
[82]1098       if [[ $? = 1 ]]
1099       then
1100          locat=scp; exit
1101       fi
1102       if [[ $remote_host = ibms ]]
1103       then
1104          job_catalog=$job_catalog_save
1105       fi
[1]1106       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1107    else
1108       eval  job_catalog=$job_catalog
1109       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1110    fi
1111
1112
1113
1114       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1115    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1116    then
1117       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
[82]1118       if [[ $remote_host != lctit ]]
[1]1119       then
[191]1120          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
[1]1121       else
[206]1122             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
[82]1123             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1124             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1125          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1126          echo "first try" > send_protocol
1127          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1128          do
1129             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1130             then
1131                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1132             else
1133                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1134             fi
1135             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1
1136             cat send_protocol
1137          done
1138          sleep 10
1139          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1140          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1141          rm  send_protocol
1142       fi
[1]1143
1144       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1145    else
1146       cd  $job_catalog
1147       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1148       then
1149          eval  $submcom  $job_on_remhost
[164]1150       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
[108]1151       then
1152          eval  $submcom  $job_on_remhost
1153          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1154          chmod  u+x  $job_on_remhost
[1]1155       elif [[ $local_host = nech ]]
1156       then
1157          if [[ $queue = default ]]
1158          then
1159             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1160          else
1161             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1162          fi
1163       else
1164          qsub  $job_on_remhost
1165       fi
[69]1166          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1167       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
[1]1168       cd  -  > /dev/null
1169    fi
1170 fi
1171
1172
1173
1174    # ABSCHLUSSARBEITEN
1175
1176 if [[ $no_submit = false ]]
1177 then
1178    rm  $job_to_send
1179 fi
1180 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.