source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 210

Last change on this file since 210 was 210, checked in by raasch, 13 years ago

updates in dvr routines for new dvr version

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 41.4 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 210 2008-11-06 08:54:02Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97
98
99
100    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
101 delete_dayfile=false 
102 group_number=none
103 locat=normal
104 no_default_queue=none
105 no_submit=false
106 job_catalog="~/job_queue"
107 job_name=none
108 local_user=$LOGNAME
109 node_usage=shared
110 numprocs=1
111 punkte="..........................................................."
112 submcom=qsub
113 queue=default
114 remote_host=none
115 remote_user=""
116 verify=true
117
118 typeset  -i   cputime=0  memory=0  Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
119 typeset  -i   inumprocs  nodes=0  tasks_per_node=0  threads_per_task=1
120 typeset  -L20 spalte1
121 typeset  -R40 spalte2
122 typeset  -L60 spalte3
123
124
125
126    # FEHLERBEHANDLUNG
127    # BEI EXIT:
128 trap 'if [[ $locat != normal ]]
129       then
130          case  $locat  in
131             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
132                       printf " by typing:"
133                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
134             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
135             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
136                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
137          esac
138          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
139          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
140       fi' exit
141
142
143    # BEI TERMINAL-BREAK:
144 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
145       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
146       exit
147      ' 2
148
149
150
151
152    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
153 local_host=$(hostname)
154
155
156
157    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
158    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
159 case  $local_host  in
160     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
161     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
162     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
163     (bicegate1)             local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
164     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
165     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
166     (b01*)                  local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
167     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
168     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
169     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
170     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
171     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
172     (gate|n-sx)             local_addres=133.5.178.11;   local_host=neck;;
173     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
174     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
175     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
176     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
177     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
178     (hicegate1)             local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
179     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
180     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
181     (h01*)                  local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
182     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
183     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
184     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
185     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
186     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
187     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
188     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
189     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
190     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
191     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
192     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
193     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
194     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
195     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
196     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
197     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
198                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
199                             locat=parameter; exit;;
200 esac
201
202
203
204    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
205 remote_host=$local_host
206
207
208
209
210    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
211 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
212 do
213   case  $option  in
214       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
215       (d)   delete_dayfile=true;;
216       (D)   no_submit=true;;
217       (g)   group_number=$OPTARG;;
218       (h)   remote_host=$OPTARG;;
219       (m)   memory=$OPTARG;;
220       (n)   job_name=$OPTARG;;
221       (N)   node_usage=$OPTARG;;
222       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
223       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
224       (t)   cputime=$OPTARG;;
225       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
226       (u)   remote_user=$OPTARG;;
227       (v)   verify=false;;
228       (X)   numprocs=$OPTARG;;
229       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
230             locat=option; exit;;
231   esac
232 done
233
234
235    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
236 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
237
238
239    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
240 if [ "$1" = "?" ]
241 then
242   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
243    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
244    printf "\n      Description of available options:\n"
245    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
246    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
247    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
248    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
249    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
250    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
251    printf "\n              lctit, nech, neck, unics"
252    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
253    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
254    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
255    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
256    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
257    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
258    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
259    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
260    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
261    printf "\n "
262    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
263    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
264    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
265    exit
266 fi
267
268
269
270    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
271 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
272 then
273    printf "\n  +++ job-file missing"
274    locat=parameter; exit
275 else
276    if [[ -f $file_to_send ]]
277    then
278       true
279    else
280       printf "\n  +++ job-file: "
281       printf "\n           $file_to_send"
282       printf "\n      does not exist"
283       locat=parameter; exit
284    fi
285 fi
286
287
288
289    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
290    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
291 if [[ $job_name = none ]]
292 then
293    job_name=$file_to_send
294 fi
295 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
296 then
297    printf "\n  +++ job-file name: "
298    printf "\n           $job_name"
299    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
300    locat=parameter; exit
301 fi
302
303
304
305
306    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
307    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
308 if [[ $remote_host = none ]]
309 then
310    printf "\n  +++ host missing"
311    locat=option; exit
312 else
313    case  $remote_host  in
314        (ibm)    queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
315        (ibmb)   queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
316        (ibmh)   queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
317        (ibms)   queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
318        (ibmy)   queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
319        (lcfimm) remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
320        (lcsgib) queue=smallq; remote_addres=130.73.232.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
321        (lcsgih) queue=smallq; remote_addres=130.75.4.103; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
322        (lctit)  queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
323        (lcxt4)  remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
324        (nech)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
325        (neck)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=133.5.178.11; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
326        (vpp)    qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
327        (unics)  qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
328        (*)      printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
329                 locat=parameter; exit;;
330    esac
331 fi
332
333
334    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
335 if [[ $no_default_queue != none ]]
336 then
337    error=false
338    ndq=$no_default_queue
339    case  $remote_host  in
340        (ibm)    case  $ndq  in
341                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
342                     (*)                                     error=true;;
343                 esac;;
344        (ibmb)   case  $ndq  in
345                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
346                     (*)                                     error=true;;
347                 esac;;
348        (ibmh)   case  $ndq  in
349                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
350                     (*)                                     error=true;;
351                 esac;;
352        (ibms)   case  $ndq  in
353                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
354                     (*)                                     error=true;;
355                 esac;;
356        (ibmy)   case  $ndq  in
357                     (parallel)                              error=false;;
358                     (*)                                     error=true;;
359                 esac;;
360        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
361                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
362                     (*)                                     error=true;;
363                 esac;;
364        (lctit)  case  $ndq  in
365                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
366                     (*)                                     error=true;;
367                 esac;;
368        (t3eb)   case  $ndq  in
369                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
370                     (*)    error=true;;
371                 esac;;
372        (t3eh)   case  $ndq  in
373                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
374                     (*)    error=true;;
375                 esac;;
376        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
377                     (low|normal|high)  error=false;;
378                     (*)    error=true;;
379                 esac;;
380        (t3es)  case  $ndq  in
381                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
382                     (*)    error=true;;
383                 esac;;
384        (unics)  case  $ndq  in
385                     (unics|ht)  error=false;;
386                     (*)         error=true;;
387                 esac;;
388    esac
389    if [[ $error = true ]]
390    then
391       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
392       locat=parameter; exit
393    else
394       queue=$no_default_queue
395    fi
396 fi
397
398
399
400    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
401 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
402 then
403    node_usage=shared
404 fi
405
406
407
408    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
409    # AUFTEILEN
410 done=false
411 while [[ $done = false ]]
412 do
413    if (( $cputime <= 0 ))
414    then
415       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
416       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
417       printf "\n  >>> "
418       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
419    else
420       done=true
421    fi
422 done
423 if [[ $remote_host = nech ]]
424 then
425    if (( tasks_per_node != 0 ))
426    then
427       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
428    elif [[ $numprocs != 0 ]]
429    then
430       (( cputime = cputime * numprocs ))
431    fi
432 fi
433 (( stunden  = cputime / 3600 ))
434 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
435 (( minuten  = resttime / 60 ))
436 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
437 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
438
439
440
441    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
442 done=false
443 while [[ $done = false ]]
444 do
445    if (( memory <= 0 ))
446    then
447       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
448       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
449       printf "\n  >>> "
450       read  memory  1>/dev/null  2>&1
451    else
452       done=true
453    fi
454 done
455
456 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = neck ]]
457 then
458    if (( tasks_per_node != 0 ))
459    then
460       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
461    elif [[ $numprocs != 0 ]]
462    then
463       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
464    else
465       (( Memory = memory / 1000 ))
466    fi
467 fi
468
469
470    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
471 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
472 then
473    (( memory = memory * threads_per_task ))
474 fi
475
476
477    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
478 if (( tasks_per_node != 0 ))
479 then
480    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
481 fi
482
483
484
485    # HEADER-AUSGABE
486 if [[ $verify = true ]]
487 then
488    printf "\n\n"
489    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
490    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
491    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
492    printf "|                                                              | \n"
493    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
494    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
495    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
496    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
497    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
498    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
499    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
500    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
501    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
502    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
503    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
504    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
505    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
506    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
507
508
509       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
510    antwort="dummy"
511    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
512    do
513       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
514    done
515    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
516    then
517       locat=verify; exit
518    fi
519    printf "\n"
520 fi
521
522
523
524    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
525 kennung=$RANDOM
526 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
527 job_to_send=job_to_send_$kennung
528 if [[ $delete_dayfile = false ]]
529 then
530    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
531    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
532 else
533    remote_dayfile=/dev/null
534    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
535    then
536       notification='# @ notification = never'
537    fi
538 fi
539
540
541
542    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
543 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
544 then
545
546    if [[ $remote_host = ibmy ]]
547    then
548       consumable_memory=""
549    else
550       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
551    fi
552    if [[ $queue = cdev ]]
553    then
554       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
555       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
556    else
557       if [[ $remote_host = ibms ]]
558       then
559          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
560       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
561       then
562          network_to_use=""
563       else
564          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
565          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
566       fi
567    fi
568
569    cat > $job_to_send << %%END%%
570#!/bin/ksh
571
572# @ job_type = parallel
573# @ job_name = palm
574# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
575# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
576# @ output = $remote_dayfile
577# @ error = $remote_dayfile
578# @ image_size = 50
579# @ class = $queue
580# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
581$network_to_use
582$data_limit
583$notification
584
585%%END%%
586
587    if (( nodes > 0 ))
588    then
589
590       cat >> $job_to_send << %%END%%
591# @ node = $nodes
592# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
593# @ node_usage = $node_usage
594# @ queue
595
596%%END%%
597
598    else
599
600       if [[ $remote_host != ibmy ]]
601       then
602
603          cat >> $job_to_send << %%END%%
604# @ blocking = unlimited
605# @ total_tasks = $numprocs
606# @ node_usage = $node_usage
607# @ queue
608
609%%END%%
610
611       else
612
613          cat >> $job_to_send << %%END%%
614# @ node = 1
615# @ total_tasks = $numprocs
616# @ queue
617
618%%END%%
619
620       fi
621
622    fi
623
624 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
625 then
626
627    cat > $job_to_send << %%END%%
628#!/bin/ksh
629
630# @ job_type = serial
631# @ node_usage = $node_usage
632# @ job_name = palm
633# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
634# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
635# @ output = $remote_dayfile
636# @ error = $remote_dayfile
637# @ class = $queue
638$notification
639
640# @ queue
641
642%%END%%
643
644 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
645 then
646
647    if [[ $numprocs != 0 ]]
648    then
649       cat > $job_to_send << %%END%%
650#!/bin/ksh
651#PBS -N $job_name
652#PBS -A geofysisk
653#PBS -l walltime=$timestring
654#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
655#PBS -l pmem=${memory}mb
656#PBS -m abe
657#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
658#PBS -o $remote_dayfile
659#PBS -j oe
660mpd &
661
662%%END%%
663
664    else
665       cat > $job_to_send << %%END%%
666#!/bin/ksh
667#PBS -N $job_name
668#PBS -A geofysisk
669#PBS -l walltime=$timestring
670#PBS -l ncpus=1
671#PBS -l pmem=${memory}mb
672#PBS -m abe
673#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
674#PBS -o $remote_dayfile
675#PBS -j oe
676
677%%END%%
678
679    fi
680
681 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
682 then
683
684    if [[ $queue = testq ]]
685    then
686       queue_directive="#PBS -q $queue"
687    else
688       queue_directive=""
689    fi
690
691    if [[ $numprocs != 0 ]]
692    then
693       cat > $job_to_send << %%END%%
694#!/bin/bash
695#PBS -N $job_name
696#PBS -l walltime=$timestring
697#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
698#PBS -l feature=$sgi_feature
699#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
700#PBS -o $remote_dayfile
701#PBS -j oe
702$queue_directive
703
704. /usr/share/modules/init/bash
705module load mpt/1.21
706# module load mvapich2/1.2rc1-intel
707# module load mvapich2
708module load netcdf
709export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
710echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
711
712%%END%%
713
714    else
715       cat > $job_to_send << %%END%%
716#PBS -S /bin/bash
717#PBS -N $job_name
718#PBS -l walltime=$timestring
719#PBS -l ncpus=1
720#PBS -o $remote_dayfile
721#PBS -e $remote_dayfile
722
723%%END%%
724
725    fi
726
727 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
728 then
729
730    if [[ $numprocs != 0 ]]
731    then
732       cat > $job_to_send << %%END%%
733#!/bin/ksh
734#PBS -S /bin/ksh
735#PBS -N $job_name
736#PBS -A geofysisk
737#PBS -j oe
738#PBS -l walltime=$timestring
739#PBS -l mppwidth=${numprocs}
740#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
741#PBS -m abe
742#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
743#PBS -o $remote_dayfile
744
745%%END%%
746
747    else
748       cat > $job_to_send << %%END%%
749#!/bin/ksh
750#PBS -S /bin/ksh
751#PBS -N $job_name
752#PBS -A geofysisk
753#PBS -j oe
754#PBS -l walltime=$timestring
755#PBS -l ncpus=1
756#PBS -l pmem=${memory}mb
757#PBS -m abe
758#PBS -M bjorn.maronga@student.uib.no
759#PBS -o $remote_dayfile
760
761%%END%%
762
763    fi
764
765 elif [[ $remote_host = nech ]]
766 then
767
768    if (( nodes > 1 ))
769    then
770       cat > $job_to_send << %%END%%
771#!/bin/ksh
772#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
773#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
774#PBS -b $nodes
775#PBS -o $remote_dayfile
776#PBS -N palm
777#PBS -j o
778#PBS -T mpisx
779
780%%END%%
781
782    elif [[ $numprocs != 0 ]]
783    then
784       cat > $job_to_send << %%END%%
785#!/bin/ksh
786#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
787#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
788#PBS -o $remote_dayfile
789#PBS -N palm
790#PBS -j o
791
792%%END%%
793
794    else
795       cat > $job_to_send << %%END%%
796#!/bin/ksh
797#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
798#PBS -o $remote_dayfile
799#PBS -j o
800
801%%END%%
802
803    fi
804
805 elif [[ $remote_host = neck ]]
806 then
807
808    if (( nodes > 1 ))
809    then
810       cat > $job_to_send << %%END%%
811#!/bin/ksh
812#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
813#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
814#PBS -b $nodes
815#PBS -o $remote_dayfile
816#PBS -N palm
817#PBS -j o
818#PBS -T mpisx
819
820%%END%%
821
822    elif [[ $numprocs != 0 ]]
823    then
824       cat > $job_to_send << %%END%%
825#!/bin/ksh
826#PBS -q ${queue}
827#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
828#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
829#PBS -o $remote_dayfile
830#PBS -N palm
831#PBS -j o
832#PBS -T mpisx
833
834%%END%%
835
836    else
837       cat > $job_to_send << %%END%%
838#!/bin/ksh
839#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
840#PBS -o $remote_dayfile
841#PBS -j o
842
843%%END%%
844
845    fi
846
847 elif [[ $remote_host = lctit ]]
848 then
849    cat > $job_to_send << %%END%%
850#!/bin/bash
851#$ -S /bin/bash
852cd $job_catalog
853export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
854echo \$PATH
855
856%%END%%
857
858       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
859  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
860    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
861
862 else
863
864    cat > $job_to_send << %%END%%
865# @\$-q ${queue}
866# @\$-l${qsubtime} $timestring
867# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
868# @\$-o $remote_dayfile
869# @\$-eo
870
871%%END%%
872
873 fi
874
875
876    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
877    # BEI EXIT VERANLASSEN
878    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
879    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
880 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
881 then
882    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
883    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
884    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
885    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
886    then
887       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
888       then
889          return_queue=c1
890       elif [[ $remote_host = ibms ]]
891       then
892          return_queue=p_normal
893       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
894       then
895          return_queue=serial
896       elif [[ $remote_host = lctit ]]
897       then
898          return_queue=sla3
899       elif [[ $remote_host = neck ]]
900       then
901          return_queue=S
902       else
903          return_queue=unknown
904       fi
905
906       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
907       then
908
909          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
910          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
911          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
912          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
913          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
914          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
915          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
916          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
917          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
918          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
919
920          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
921          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
922
923          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
924          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
925          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
926
927       elif [[ $remote_host = nech ]]
928       then
929          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
930          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
931          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
932          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
933          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
934          echo " "                                 >>  $job_to_send
935          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
936          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
937          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
938          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
939          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
940
941       elif [[ $remote_host = neck ]]
942       then
943          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
944          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
945          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
946          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
947          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
948          echo " "                                 >>  $job_to_send
949          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
950          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
951          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
952          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
953
954       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
955       then
956          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
957          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
958          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
959          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
960          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
961          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
962          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
963          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
964          echo " "                                 >>  $job_to_send
965          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
966          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
967          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
968          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
969          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
970
971       elif [[ $remote_host = lctit ]]
972       then
973          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
974          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
975          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
976          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
977          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
978          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
979          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
980
981       else
982
983          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
984          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
985          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
986          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
987          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
988          then
989             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
990          fi
991          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
992#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
993          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
994          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
995          echo " "                                 >>  $job_to_send
996          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
997          then
998             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
999             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1000          fi
1001          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1002          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1003          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1004          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1005       fi
1006
1007       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1008       then
1009          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1010       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1011       then
1012          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1013          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1014       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1015       then
1016          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1017          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1018          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1019          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1020       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1021       then
1022          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1023       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1024       then
1025          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1026       else
1027          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1028       fi
1029       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1030       if [[ $remote_host = nech ]]
1031       then
1032          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1033       fi
1034    else
1035#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1036       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1037    fi
1038    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1039    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1040    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1041 fi
1042
1043
1044
1045    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1046 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1047
1048 if [[ $remote_host = ibm ]]
1049 then
1050    echo " "         >>  $job_to_send
1051    echo "exit"      >>  $job_to_send
1052 fi
1053 if [[ $remote_host = lctit ]]
1054 then
1055    echo " "                               >>  $job_to_send
1056    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1057 fi
1058
1059
1060
1061    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1062 if [[ -z $remote_user ]]
1063 then
1064    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1065    then
1066       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1067    fi
1068 fi
1069
1070
1071
1072    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1073 if [[ $no_submit = false ]]
1074 then
1075    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1076    then
1077       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1078       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1079       then
1080          job_catalog_save=$job_catalog
1081          job_catalog=job_queue
1082       elif [[ $remote_host = nech ]]
1083       then
1084          job_catalog_save=$job_catalog
1085          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1086       fi
1087       if [[ $local_host = decalpha ]]
1088       then
1089             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1090             # PASSWORT AB
1091          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1092       elif [[ $remote_host = nech ]]
1093       then
1094             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1095             # TRANSFERIERT WERDEN
1096          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1097       else
1098          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1099       fi
1100       if [[ $? = 1 ]]
1101       then
1102          locat=scp; exit
1103       fi
1104       if [[ $remote_host = ibms ]]
1105       then
1106          job_catalog=$job_catalog_save
1107       fi
1108       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1109    else
1110       eval  job_catalog=$job_catalog
1111       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1112    fi
1113
1114
1115
1116       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1117    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1118    then
1119       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1120       if [[ $remote_host != lctit ]]
1121       then
1122          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1123       else
1124             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFï¿œHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1125             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1126             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1127          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1128          echo "first try" > send_protocol
1129          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1130          do
1131             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1132             then
1133                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1134             else
1135                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1136             fi
1137             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1 
1138             cat send_protocol
1139          done
1140          sleep 10
1141          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1 
1142          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1143          rm  send_protocol
1144       fi
1145
1146       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1147    else
1148       cd  $job_catalog
1149       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1150       then
1151          eval  $submcom  $job_on_remhost
1152       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1153       then
1154          eval  $submcom  $job_on_remhost
1155          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1156          chmod  u+x  $job_on_remhost
1157       elif [[ $local_host = nech ]]
1158       then
1159          if [[ $queue = default ]]
1160          then
1161             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1162          else
1163             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1164          fi
1165       else
1166          qsub  $job_on_remhost
1167       fi
1168          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1169       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1170       cd  -  > /dev/null
1171    fi
1172 fi
1173
1174
1175
1176    # ABSCHLUSSARBEITEN
1177
1178 if [[ $no_submit = false ]]
1179 then
1180    rm  $job_to_send
1181 fi
1182 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.