source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 1201

Last change on this file since 1201 was 1200, checked in by raasch, 11 years ago

last commit documented

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 55.4 KB
RevLine 
[1]1#!/bin/ksh
[1090]2
3# subjob - script for automatic generation and submission of batch-job files
4#          for various batch queuing systems
5
[1046]6#--------------------------------------------------------------------------------#
7# This file is part of PALM.
8#
9# PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
10# of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
11# either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
12#
13# PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
14# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
15# A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16#
17# You should have received a copy of the GNU General Public License along with
18# PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19#
20# Copyright 1997-2012  Leibniz University Hannover
21#--------------------------------------------------------------------------------#
22#
23# Current revisions:
[1090]24# ------------------
[1200]25#
[1046]26#
27# Former revisions:
28# -----------------
[169]29# $Id: subjob 1200 2013-07-05 15:29:59Z witha $
[1200]30#
31# 1199 2013-07-05 14:52:22Z raasch
32# adjustments for CSC Helsinki (lccrayf)
33#
[1185]34# use of cluster/express queue enabled (ibmh)
35# vinessa added (imuk)
[1047]36#
[1104]37# 1103 2013-02-20 02:15:53Z raasch
38# bash compatibility adjustments (usage of OPTIND, output formatting with printf
39# instead typeset -L/R),
40# further adjustments for lckyuh
41#
[1100]42# 2013-02-10 01:47:43Z raasch
43# adjustments for Kyushu-Univeristy computing center (lckyuh - hayaka)
44# and for Forwind cluster (lcflow)
45#
[1096]46# 1094 2013-02-03 01:52:12Z raasch
47# new option -P for explicit setting of ssh/scp port,
48# decalpha parts (yonsei) removed
49#
[1091]50# 2013-02-02 07:06:13Z raasch
[1099]51# adjustments for Kyushu-University computing center (lckyut - tatara)
[1091]52# old changelog messages removed
53#
[1047]54# 1046 2012-11-09 14:38:45Z maronga
55# code put under GPL (PALM 3.9)
56#
[1090]57# 08/07/94 - Siggi - first version finished
58# 29/06/94 - Siggi - script development started
59#--------------------------------------------------------------------------------#
60# subjob - script for automatic generation and submission of batch-job files
61#          for various batch queuing systems
62#--------------------------------------------------------------------------------#
[1]63
64
65    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
[352]66 delete_dayfile=false
[799]67 email_notification=none
[122]68 group_number=none
[1]69 locat=normal
70 no_default_queue=none
71 no_submit=false
72 job_catalog="~/job_queue"
73 job_name=none
74 local_user=$LOGNAME
75 node_usage=shared
[475]76 numprocs=0
[1]77 punkte="..........................................................."
78 submcom=qsub
79 queue=default
80 remote_host=none
81 remote_user=""
82 verify=true
83
84 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
[696]85 typeset  -i   inumprocs  mpi_tasks=nodes=processes_per_node=0 tasks_per_node=threads_per_task=1
[1]86
87
88
89    # FEHLERBEHANDLUNG
90    # BEI EXIT:
91 trap 'if [[ $locat != normal ]]
92       then
93          case  $locat  in
94             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
95                       printf " by typing:"
96                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
97             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
98             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
99                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
100          esac
101          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
102          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
103       fi' exit
104
105
106    # BEI TERMINAL-BREAK:
107 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
108       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
109       exit
110      ' 2
111
112
113
114
115    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
116 local_host=$(hostname)
117
118
119
120    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
121    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
[717]122    # Note: One of the entries for "lck" or "lckordi" always has to be
123    # comment out, because the hostname (node*) is same for both machines
[1]124 case  $local_host  in
125     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
[102]126     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
[5]127     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
[400]128     (bd1)                   local_addres=130.73.232.64;  local_host=lcsgib;;
129     (bd2)                   local_addres=130.73.232.65;  local_host=lcsgib;;
130     (bd3)                   local_addres=130.73.232.66;  local_host=lcsgib;;
131     (bd4)                   local_addres=130.73.232.67;  local_host=lcsgib;;
132     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
[1103]133     (b04*)                  local_addres=133.5.4.33;     local_host=lckyuh;;
[291]134     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
[749]135     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
[12]136     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
[1174]137     (buran)                 local_addres=130.75.105.58;  local_host=lcmuk;;
[372]138     (caurus)                local_addres=130.75.105.19;  local_host=lcmuk;;
[693]139     (climate*)              local_addres=165.132.26.68;  local_host=lcyon;;
[1197]140     (clogin*)               local_addres=86.50.166.21;   local_host=lccrayf;;
[108]141     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[1]142     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
[5]143     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
[108]144     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[1099]145     (flow01)                local_addres=10.141.255.71;  local_host=lcflow;;
146     (flow02)                local_addres=10.141.255.72;  local_host=lcflow;;
[367]147     (node*)                 local_addres=165.132.26.61   local_host=lck;;
[717]148   #  (node*)                 local_addres=210.219.61.8    local_host=lckordi;;
[693]149     (gaia*)                 local_addres=150.183.146.24; local_host=ibmkisti;;
[101]150     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
[1]151     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
[5]152     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
153     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
[1099]154     (hayaka*)               local_addres=133.5.4.33;     local_host=lckyuh;;
[892]155     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxe6;;
[400]156     (hd1)                   local_addres=130.75.4.104;   local_host=lcsgih;;
157     (hd2)                   local_addres=130.75.4.105;   local_host=lcsgih;;
158     (hd3)                   local_addres=130.75.4.106;   local_host=lcsgih;;
159     (hd4)                   local_addres=130.75.4.107;   local_host=lcsgih;;
[739]160     (hicegate0)             local_addres=130.75.4.101;   local_host=lcsgih;;
[292]161     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[210]162     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
[440]163     (hx*)                   local_addres=133.3.51.11;    local_host=lckyoto;;
[749]164     (inferno)               local_addres=130.75.105.5;   local_host=lcmuk;;
[5]165     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
[407]166     (sno)                   local_addres=130.75.105.113; local_host=lcmuk;;
[5]167     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
[1040]168     (login*)                local_addres=118.128.66.223; local_host=lckiaps;;
[5]169     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
[1099]170     (meller)                local_addres=134.106.74.155; local_host=lcfor;;
[437]171     (meteo-login*)          local_addres=193.166.211.144;local_host=lcxt5m;;
[892]172     (hexagon*)              local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxe6;;
[1]173     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
[5]174     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
175     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
[205]176     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
[1099]177     (pcj*)                  local_addres=172.31.120.1;   local_host=lckyut;;
[789]178     (pingui)                local_addres=134.106.74.118; local_host=lcfor;;
[5]179     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
[622]180     (rte*)                  local_addres=133.5.185.60;   local_host=lcrte;;
[1197]181     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
182     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
[1]183     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
[1197]184     (sisu-login*)           local_addres=86.50.166.21;   local_host=lccrayf;;
[799]185     (solano)                local_addres=130.75.105.110; local_host=lcmuk;;
[1090]186     (sugoka*)               local_addres=172.31.120.1;   local_host=lckyut;;
[1]187     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
[259]188     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
[635]189     (t2a*)                  local_addres=10.1.6.165;     local_host=lctit;;
[1021]190     (urban*)                local_addres=147.46.30.151   local_host=lcsb;;
[1184]191     (vinessa)               local_addres=130.75.105.112; local_host=lcmuk;;
[1]192     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
[622]193     (*.cc.kyushu-u.ac.jp)   local_addres=133.5.4.129;    local_host=ibmku;;
[1]194     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
195                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
196                             locat=parameter; exit;;
197 esac
198
199
200
201    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
202 remote_host=$local_host
203
204
205
206
207    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
[1094]208 while  getopts  :c:dDe:g:h:m:n:N:O:P:q:t:T:u:vX:  option
[1]209 do
210   case  $option  in
211       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
212       (d)   delete_dayfile=true;;
213       (D)   no_submit=true;;
[352]214       (e)   email_notification=$OPTARG;;
[125]215       (g)   group_number=$OPTARG;;
[1]216       (h)   remote_host=$OPTARG;;
217       (m)   memory=$OPTARG;;
218       (n)   job_name=$OPTARG;;
219       (N)   node_usage=$OPTARG;;
220       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
[1094]221       (P)   scp_port=$OPTARG;;
[1]222       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
223       (t)   cputime=$OPTARG;;
224       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
225       (u)   remote_user=$OPTARG;;
226       (v)   verify=false;;
227       (X)   numprocs=$OPTARG;;
228       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
229             locat=option; exit;;
230   esac
231 done
232
233
234    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
[1103]235 (( to_shift = $OPTIND - 1 ))
236 shift $to_shift; file_to_send=$1
[1]237
238
239    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
240 if [ "$1" = "?" ]
241 then
242   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
243    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
244    printf "\n      Description of available options:\n"
245    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
246    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
247    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
248    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
249    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
[693]250    printf "\n              ibm, ibmh, ibmkisti, ibmku, ibms, ibmy, lc...,"
[1040]251    printf "\n              lckiaps, lctit, nech, necriam, unics"
[1]252    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
253    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
254    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
[1094]255    printf "\n        -P    ssh/scp port                        default port"
[1]256    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
257    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
258    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
259    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
260    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
261    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
262    printf "\n "
263    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
264    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
265    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
266    exit
267 fi
268
269
270
271    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
272 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
273 then
274    printf "\n  +++ job-file missing"
275    locat=parameter; exit
276 else
277    if [[ -f $file_to_send ]]
278    then
279       true
280    else
281       printf "\n  +++ job-file: "
282       printf "\n           $file_to_send"
283       printf "\n      does not exist"
284       locat=parameter; exit
285    fi
286 fi
287
288
289
290    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
291    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
292 if [[ $job_name = none ]]
293 then
294    job_name=$file_to_send
295 fi
296 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
297 then
298    printf "\n  +++ job-file name: "
299    printf "\n           $job_name"
300    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
301    locat=parameter; exit
302 fi
303
304
305
306
307    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
308    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
309 if [[ $remote_host = none ]]
310 then
311    printf "\n  +++ host missing"
312    locat=option; exit
313 else
314    case  $remote_host  in
[251]315        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[1184]316        (ibmh)    queue=cluster; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[693]317        (ibmkisti) queue=class.32plus; remote_addres=150.183.146.24; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[622]318        (ibmku)   queue=s4; remote_addres=133.5.4.129; submcom=/usr/local/bin/llsubmit;;
[251]319        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
320        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[1197]321        (lccrayf) queue=small; remote_addres=86.50.166.21; submcom=/opt/slurm/default/bin/sbatch;;
[251]322        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
[1099]323        (lcflow)  remote_addres=10.140.1.71; submcom=/cm/shared/apps/sge/6.2u5p2/bin/lx26-amd64/qsub;;
[440]324        (lckyoto) remote_addres=133.3.51.11; submcom=/thin/local/bin/qsub;;
[540]325        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.104; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
326        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.101; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
[367]327        (lck)     remote_addres=165.132.26.61; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[1040]328        (lckiaps) remote_addres=118.128.66.223; submcom=/cm/shared/apps/pbspro/11.0.2.110766/bin/qsub;;
[717]329        (lckordi) remote_addres=210.219.61.8; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[1099]330        (lckyuh)  remote_addres=133.5.4.33; submcom=/usr/bin/pjsub;;
[1090]331        (lckyut)  remote_addres=133.5.4.37; submcom=/usr/bin/pjsub;;
[1021]332        (lcsb)    remote_addres=147.46.30.151; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[635]333        (lctit)   queue=S; remote_addres=10.1.6.165; submcom=/opt/pbs/tools/bin/t2sub;;
[892]334        (lcxe6)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.5.10/bin/qsub;;
[437]335        (lcxt5m)  remote_addres=193.166.211.144; submcom=/opt/pbs/10.1.0.91350/bin/qsub;;
[693]336        (lcyon)   remote_addres=165.132.26.68; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
[251]337        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
338        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
339        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
340        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
341        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
342                  locat=parameter; exit;;
[1]343    esac
344 fi
345
346
347    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
348 if [[ $no_default_queue != none ]]
349 then
350    error=false
351    ndq=$no_default_queue
352    case  $remote_host  in
353        (ibm)    case  $ndq  in
354                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
355                     (*)                                     error=true;;
356                 esac;;
357        (ibmh)   case  $ndq  in
[1184]358                     (cluster|express)  error=false;;
[1]359                     (*)                                     error=true;;
360                 esac;;
[693]361        (ibmkisti)   case  $ndq  in
362                     (class.32plus|class.1-2|class.2-32)  error=false;;
363                     (*)                                     error=true;;
364                 esac;;
[622]365        (ibmku)  case  $ndq  in
366                     (sdbg1|sdbg2|sdbg4|s4|s16|s32|s32-s)    error=false;;
367                     (*)                                     error=true;;
368                 esac;;
[1]369        (ibms)   case  $ndq  in
370                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
371                     (*)                                     error=true;;
372                 esac;;
373        (ibmy)   case  $ndq  in
374                     (parallel)                              error=false;;
375                     (*)                                     error=true;;
376                 esac;;
[1197]377        (lccrayf) case  $ndq  in
378                     (usup|test*|small|large)                error=false;;
379                     (*)                                     error=true;;
380                 esac;;
[1099]381        (lcflow) case  $ndq  in
382                     (cfd_lom_long.q|cfd_him_long.q|cfd_lom_serl.q|cfd_lom_shrt.q|cfd_him_shrt.q)  error=false;;
383                     (*)                                     error=true;;
384                 esac;;
[1040]385        (lckiaps) case  $ndq  in
386                     (express|normal)                        error=false;;
387                     (*)                                     error=true;;
388                 esac;;
[440]389        (lckyoto) case  $ndq  in
390                     (eh|ph)                                 error=false;;
391                     (*)                                     error=true;;
392                 esac;;
[1099]393        (lckyuh) case  $ndq  in
394                     (fx-dbg|fx-single|fx-small|fx-middle|fx-large)  error=false;;
395                     (*)                                     error=true;;
396                 esac;;
[1090]397        (lckyut) case  $ndq  in
398                     (cx-dbg|cx-single|cx-small|cx-middle|cx-large)  error=false;;
399                     (*)                                     error=true;;
400                 esac;;
[191]401        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
[416]402                     (testq|serialq|smallq|mediumq|bigq|workq|dataq|permq|special1q)       error=false;;
[191]403                     (*)                                     error=true;;
404                 esac;;
[1]405        (lctit)  case  $ndq  in
[635]406                     (G|L128|L256|L512H|S|S96|V)             error=false;;
[1]407                     (*)                                     error=true;;
408                 esac;;
409        (t3eb)   case  $ndq  in
410                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
411                     (*)    error=true;;
412                 esac;;
[251]413        (necriam) case  $ndq  in
[253]414                     (SP|SS|P6)  error=false;;
[251]415                     (*)    error=true;;
416                 esac;;
[1]417        (t3eh)   case  $ndq  in
418                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
419                     (*)    error=true;;
420                 esac;;
421        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
422                     (low|normal|high)  error=false;;
423                     (*)    error=true;;
424                 esac;;
425        (t3es)  case  $ndq  in
426                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
427                     (*)    error=true;;
428                 esac;;
429        (unics)  case  $ndq  in
430                     (unics|ht)  error=false;;
431                     (*)         error=true;;
432                 esac;;
433    esac
434    if [[ $error = true ]]
435    then
436       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
437       locat=parameter; exit
438    else
439       queue=$no_default_queue
440    fi
441 fi
442
443
444
445    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
446    # AUFTEILEN
447 done=false
448 while [[ $done = false ]]
449 do
450    if (( $cputime <= 0 ))
451    then
452       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
453       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
454       printf "\n  >>> "
455       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
456    else
457       done=true
458    fi
459 done
460 if [[ $remote_host = nech ]]
461 then
462    if (( tasks_per_node != 0 ))
463    then
464       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
465    elif [[ $numprocs != 0 ]]
466    then
467       (( cputime = cputime * numprocs ))
468    fi
469 fi
470 (( stunden  = cputime / 3600 ))
471 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
472 (( minuten  = resttime / 60 ))
473 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
474 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
475
476
477
478    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
479 done=false
480 while [[ $done = false ]]
481 do
482    if (( memory <= 0 ))
483    then
484       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
485       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
486       printf "\n  >>> "
487       read  memory  1>/dev/null  2>&1
488    else
489       done=true
490    fi
491 done
492
[251]493 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
[1]494 then
495    if (( tasks_per_node != 0 ))
496    then
497       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
498    elif [[ $numprocs != 0 ]]
499    then
500       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
501    else
502       (( Memory = memory / 1000 ))
503    fi
[635]504 elif [[ $remote_host = lctit ]]
505 then
506    (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
[1]507 fi
508
509
510    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
511 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
512 then
513    (( memory = memory * threads_per_task ))
514 fi
515
516
517    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
518 if (( tasks_per_node != 0 ))
519 then
[622]520    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
[1]521 fi
522
[1094]523
[622]524    # Calculate number of processes per node
525 (( processes_per_node = tasks_per_node * threads_per_task ))
[1]526
[1094]527
[696]528    # Calculate number of MPI tasks
529 (( mpi_tasks = numprocs / threads_per_task ))
[1]530
[696]531
[1094]532    # Set port number option for calls of ssh/scp, subjob and batch_scp scripts
533 if [[ "$scp_port" != "" ]]
534 then
535    PORTOPT="-P $scp_port"
536    SSH_PORTOPT="-p $scp_port"
537 fi
538
539
[1]540    # HEADER-AUSGABE
541 if [[ $verify = true ]]
542 then
543    printf "\n\n"
544    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
545    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
[1103]546    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "$spalte2"
[1]547    printf "|                                                              | \n"
548    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
[1103]549    spalte1=$(echo local_host$punkte | cut -c-20)
550    spalte2=$punkte$local_host
551    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
552    spalte1=$(echo remote_host$punkte | cut -c-20)
553    spalte2=$punkte$remote_host
554    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
555    spalte1=$(echo queue$punkte | cut -c-20)
556    spalte2=$punkte$queue
557    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
558    spalte1=$(echo memory$punkte | cut -c-20)
559    spalte2="$punkte$memory mb"
560    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
561    spalte1=$(echo cputime$punkte | cut -c-20)
562    spalte2="$punkte$cputime sec"
563    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
564    spalte1=$(echo job_name$punkte | cut -c-20)
565    spalte2="$punkte$job_name"
566    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
[1]567    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
568
569
570       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
571    antwort="dummy"
572    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
573    do
574       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
575    done
576    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
577    then
578       locat=verify; exit
579    fi
580    printf "\n"
581 fi
582
583
584
585    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
586 kennung=$RANDOM
587 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
588 job_to_send=job_to_send_$kennung
589 if [[ $delete_dayfile = false ]]
590 then
591    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
592    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
593 else
594    remote_dayfile=/dev/null
595 fi
596
597
598
[622]599    # Generate the batch job scripts (qsub/msub/LoadLeveler)
[1]600 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
601 then
602
[622]603       # General LoadLeveler settings
604    execute_in_shell="#!/bin/ksh"
605    use_shell="# @ shell = /bin/ksh"
606    consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
607    class="# @ class = $queue"
608    environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
609    network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
610    data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
611    image_size="# @ image_size = 50"
[693]612    wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring"
[312]613
[693]614    if [[ $email_notification = none ]]
615    then
616       notify_user=""
617    else
618       notify_user="# @ notify_user = $email_notification"
619       if [[ $delete_dayfile = true ]]
620       then
621          notification='# @ notification = never'
622       fi
623    fi
[622]624
[312]625    if [[ $remote_host = ibmh ]]
[1]626    then
[312]627       data_limit=""
628       network_to_use=""
[1184]629       class="# @ class = $queue"
[312]630       environment=""
[814]631       rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
632       task_affinity="# @ task_affinity = core(1)"
[693]633    elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
634    then
635       network_to_use="# @ network.MPI = sn_all,shared,US"
636       wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = $timestring"
[696]637       if [[ $threads_per_task = 1 ]]
638       then
639          rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
640          mcm_affinity_options="# @ mcm_affinity_options = mcm_mem_pref mcm_sni_none mcm_distribute"
641       fi
[693]642       environment=""
643       use_shell=""
644       data_limit=""
645       image_size=""
[622]646    elif [[ $remote_host = ibmku ]]
647    then
648       execute_in_shell="#!/usr/bin/ksh"
649       use_shell="# @ shell = /usr/bin/ksh"
650       consumable_memory=""
651       environment=""
652       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
653       data_limit=""
654       image_size=""
655    elif [[ $remote_host = ibms ]]
656    then
657       network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
658    elif [[ $remote_host = ibmy ]]
659    then
660       consumable_memory=""
661       network_to_use=""
[1]662    fi
663
664    cat > $job_to_send << %%END%%
[622]665$execute_in_shell
666$use_shell
[1]667
668# @ job_type = parallel
[693]669# @ job_name = $job_name
[1]670# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
671# @ output = $remote_dayfile
672# @ error = $remote_dayfile
[693]673$wall_clock_limit
[622]674$image_size
[312]675$class
676$environment
[1]677$network_to_use
678$data_limit
[693]679$rset
680$mcm_affinity_options
[814]681$task_affinity
[1]682$notification
[693]683$notify_user
[1]684
685%%END%%
686
687    if (( nodes > 0 ))
688    then
689
[693]690       if [[ $remote_host != ibmkisti ]]
691       then
692
693          cat >> $job_to_send << %%END%%
[1]694# @ node = $nodes
[622]695# @ tasks_per_node = $processes_per_node
[1]696# @ node_usage = $node_usage
697# @ queue
698
699%%END%%
700
[693]701       else
702
703          cat >> $job_to_send << %%END%%
[696]704# @ total_tasks = $mpi_tasks
[693]705# @ blocking = unlimited
706# @ queue
707
708%%END%%
709
710       fi
711
[1]712    else
713
714       if [[ $remote_host != ibmy ]]
715       then
716
717          cat >> $job_to_send << %%END%%
718# @ blocking = unlimited
719# @ total_tasks = $numprocs
720# @ node_usage = $node_usage
721# @ queue
722
723%%END%%
724
725       else
726
727          cat >> $job_to_send << %%END%%
728# @ node = 1
729# @ total_tasks = $numprocs
730# @ queue
731
732%%END%%
733
734       fi
735
736    fi
737
[696]738       # workaround because of silly job filter on ibmkisti
739    if [[ $remote_host = ibmkisti  &&  $threads_per_task != 1 ]]
740    then
741       echo  "export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task"  >>  $job_to_send
742    fi
743
[1]744 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
745 then
746
747    cat > $job_to_send << %%END%%
748#!/bin/ksh
749
750# @ job_type = serial
751# @ node_usage = $node_usage
752# @ job_name = palm
753# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
754# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
755# @ output = $remote_dayfile
756# @ error = $remote_dayfile
[312]757$class
[1]758$notification
759
760# @ queue
761
762%%END%%
763
[1197]764 elif [[ $remote_host = lccrayf ]]
765 then
766
767    if [[ $numprocs != 0 ]]
768    then
769       cat > $job_to_send << %%END%%
770#!/bin/bash -l
771#SBATCH -J $job_name
772#SBATCH -t $timestring
773#SBATCH -N $nodes
774#SBATCH --ntasks-per-node=$processes_per_node
775#SBATCH -p $queue
776#SBATCH -o $remote_dayfile
777#SBATCH -e $remote_dayfile
778
779$init_cmds
780$module_calls
781
782%%END%%
783
784    else
785       cat > $job_to_send << %%END%%
786#!/bin/bash -l
787#SBATCH -J $job_name
788#SBATCH -t $timestring
789#SBATCH -l ncpus=1
790#SBATCH -l pmem=${memory}mb
791#SBATCH -m abe
792#SBATCH -o $remote_dayfile
793#SBATCH -e $remote_dayfile
794
795$init_cmds
796$module_calls
797
798%%END%%
799
800    fi
801
[108]802 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
803 then
804
805    if [[ $numprocs != 0 ]]
806    then
807       cat > $job_to_send << %%END%%
808#!/bin/ksh
809#PBS -N $job_name
[552]810#PBS -A $project_account
[108]811#PBS -l walltime=$timestring
[622]812#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$processes_per_node
[108]813#PBS -l pmem=${memory}mb
814#PBS -m abe
815#PBS -o $remote_dayfile
816#PBS -j oe
817mpd &
818
819%%END%%
820
[168]821    else
822       cat > $job_to_send << %%END%%
823#!/bin/ksh
824#PBS -N $job_name
[552]825#PBS -A $project_account
[168]826#PBS -l walltime=$timestring
827#PBS -l ncpus=1
828#PBS -l pmem=${memory}mb
829#PBS -m abe
830#PBS -o $remote_dayfile
831#PBS -j oe
832
833%%END%%
834
835    fi
836
[1099]837 elif [[ $remote_host = lcflow ]]
838 then
839    if [ $memory -gt 1900 ]; then
840      use_himem=""
841    else
842      use_himem="#"
843    fi
844    if [[ $numprocs != 0 ]]
845    then
846      pe_set="#$ -pe impi $numprocs"
847    else
848      pe_set="#$ -pe impi 1"
849    fi
850    if [[ $queue = default ]]
851    then
852      queue_set=""
853    else
854      queue_set="#$ -q $queue"
855    fi
856    [[ "$disc_space" = "" ]]  &&  disc_space=50
857
858       cat > $job_to_send << %%END%%
859#!/bin/bash
860#$ -S /bin/bash
861#$ -N $job_name
862#$ -cwd
863#$ -l h_rt=$timestring
864#$ -l h_vmem=${memory}M
865#$ -o $remote_dayfile
866#$ -j y
867$pe_set
868#$ -R y
869${use_himem}#$ -l highmem=true
870#$ -l h_fsize=${disc_space}G
871$queue_set
872
873%%END%%
874
[1021]875 elif [[ $remote_host = lck || $remote_host = lckordi || $remote_host = lcsb ]]
[368]876 then
877
878    if [[ $numprocs != 0 ]]
879    then
880       cat > $job_to_send << %%END%%
881#!/bin/ksh
882#PBS -N $job_name
883#PBS -l walltime=$timestring
884#PBS -l ncpus=$numprocs
885#PBS -l pmem=${memory}mb
886#PBS -o $remote_dayfile
[1021]887#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
[368]888#PBS -j oe
889
890mpd &
891
892%%END%%
893
894    else
895       cat > $job_to_send << %%END%%
896#!/bin/ksh
897#PBS -N $job_name
898#PBS -l walltime=$timestring
899#PBS -l ncpus=1
900#PBS -l pmem=${memory}mb
901#PBS -o $remote_dayfile
902#PBS -j oe
903
904%%END%%
905
906    fi
907
[1040]908 elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
909 then
910
911    if [[ $numprocs != 0 ]]
912    then
913       cat > $job_to_send << %%END%%
914#!/bin/ksh
915#PBS -N $job_name
916#PBS -l walltime=$timestring
917#PBS -l select=1:ncpus=$numprocs
918#PBS -l pmem=${memory}mb
919#PBS -q $queue
920#PBS -o $remote_dayfile
921#PBS -j oe
922#PBS -V
923
924%%END%%
925
926    else
927       cat > $job_to_send << %%END%%
928#!/bin/ksh
929#PBS -N $job_name
930#PBS -l walltime=$timestring
931#PBS -l ncpus=1
932#PBS -l pmem=${memory}mb
933#PBS -o $remote_dayfile
934#PBS -j oe
935
936%%END%%
937
938    fi
939
[693]940 elif [[ $remote_host = lcyon ]]
941 then
942
943    if [[ $numprocs != 0 ]]
944    then
945       cat > $job_to_send << %%END%%
946#!/bin/ksh
947#PBS -N $job_name
948#PBS -l walltime=$timestring
949#PBS -l ncpus=$numprocs
950#PBS -l pmem=${memory}mb
951#PBS -o $remote_dayfile
952#PBS -j oe
953
954%%END%%
955
956    else
957       cat > $job_to_send << %%END%%
958#!/bin/ksh
959#PBS -N $job_name
960#PBS -l walltime=$timestring
961#PBS -l ncpus=1
962#PBS -l pmem=${memory}mb
963#PBS -o $remote_dayfile
964#PBS -j oe
965
966%%END%%
967
968    fi
969
[181]970 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
[179]971 then
972
[376]973    if [[ "$sgi_feature" != "" ]]
974    then
975       feature_directive="#PBS -l feature=$sgi_feature"
976    else
977       feature_directive=""
978    fi
[799]979
[416]980    if [[ $queue = dataq || $queue = permq ]]
[399]981    then
982       feature_directive="#PBS -l feature=data"
983    fi
[376]984
[789]985    if [[ $queue = testq  || $queue = mediumq  ||  $queue = bigq  ||  $queue = workq  ||  $queue = dataq  ||  $queue = permq ||  $queue = serialq  ||  $queue = special1q ]]
[191]986    then
987       queue_directive="#PBS -q $queue"
988    else
989       queue_directive=""
990    fi
991
[352]992    if [[ $email_notification = none ]]
993    then
994       email_directive=""
995    else
996       email_directive="#PBS -M $email_notification"
997    fi
998
[179]999    if [[ $numprocs != 0 ]]
1000    then
1001       cat > $job_to_send << %%END%%
[181]1002#!/bin/bash
[179]1003#PBS -N $job_name
1004#PBS -l walltime=$timestring
[622]1005#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
[181]1006#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
[179]1007#PBS -o $remote_dayfile
1008#PBS -j oe
[376]1009$feature_directive
[191]1010$queue_directive
[352]1011$email_directive
[179]1012
[622]1013eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
1014#. /usr/share/modules/init/bash
[892]1015$init_cmds
[493]1016$module_calls
[374]1017
[181]1018echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
[179]1019
1020%%END%%
1021
1022    else
1023       cat > $job_to_send << %%END%%
1024#PBS -S /bin/bash
1025#PBS -N $job_name
1026#PBS -l walltime=$timestring
1027#PBS -l ncpus=1
1028#PBS -o $remote_dayfile
[475]1029#PBS -j oe
[400]1030$queue_directive
1031$email_directive
[179]1032
[622]1033eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
1034#. /usr/share/modules/init/bash
[892]1035$init_cmds
[493]1036$module_calls
[475]1037
[179]1038%%END%%
1039
1040    fi
1041
[892]1042 elif [[ $remote_host = lcxe6 ]]
[164]1043 then
1044
1045    if [[ $numprocs != 0 ]]
1046    then
1047       cat > $job_to_send << %%END%%
[799]1048#!/bin/ksh
[164]1049#PBS -S /bin/ksh
1050#PBS -N $job_name
[552]1051#PBS -A $project_account
[206]1052#PBS -j oe
[164]1053#PBS -l walltime=$timestring
1054#PBS -l mppwidth=${numprocs}
[622]1055#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
[164]1056#PBS -m abe
1057#PBS -o $remote_dayfile
[492]1058$email_directive
[164]1059
[892]1060$init_cmds
[493]1061$module_calls
[343]1062
[164]1063%%END%%
1064
[108]1065    else
1066       cat > $job_to_send << %%END%%
1067#!/bin/ksh
[168]1068#PBS -S /bin/ksh
[108]1069#PBS -N $job_name
[552]1070#PBS -A $project_account
[206]1071#PBS -j oe
[108]1072#PBS -l walltime=$timestring
1073#PBS -l ncpus=1
1074#PBS -l pmem=${memory}mb
1075#PBS -m abe
[492]1076$email_directive
[108]1077#PBS -o $remote_dayfile
1078
[892]1079$init_cmds
[493]1080$module_calls
[343]1081
[108]1082%%END%%
1083
1084    fi
1085
[440]1086 elif [[ $remote_host = lckyoto ]]
[437]1087 then
1088
[440]1089       cat > $job_to_send << %%END%%
[799]1090#!/bin/ksh
[440]1091# @\$-o $remote_dayfile
1092# @\$-eo -oi
1093# @\$-lP 16
[799]1094# @\$-lp 1
[440]1095# @\$-lm 28gb  -llm unlimited -ls unlimited
1096# @\$-q $queue
1097# @\$-Pvn abs_pack
1098##for intel? @\$-Pvn abs_unpack -Pvs unpack -Pvc unpack
1099#. /thin/local/etc/setprofile/intel-11.0.sh
1100#. /thin/local/etc/setprofile/mvapich2-1.4+intel-11.0.sh
1101. ~/.myprofile
1102#. /home2/t/t51254/palm/current_version/myprofile
1103#. /thin/apps/pgi/mpi.sh
1104#
1105env
1106#
1107set -x
1108
1109%%END%%
1110
1111 elif [[ $remote_host = lcxt5m ]]
1112 then
1113
[437]1114    if [[ $numprocs != 0 ]]
1115    then
1116       cat > $job_to_send << %%END%%
[799]1117#!/bin/ksh
[437]1118#PBS -S /bin/ksh
1119#PBS -N $job_name
1120#PBS -j oe
1121#PBS -l walltime=$timestring
1122#PBS -l mppwidth=${numprocs}
[622]1123#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
[437]1124#PBS -m abe
1125#PBS -o $remote_dayfile
1126
[892]1127$init_cmds
[493]1128$module_calls
[437]1129
1130%%END%%
1131
1132    else
1133       cat > $job_to_send << %%END%%
1134#!/bin/ksh
1135#PBS -S /bin/ksh
1136#PBS -N $job_name
1137#PBS -j oe
1138#PBS -l walltime=$timestring
1139#PBS -l ncpus=1
1140#PBS -l pmem=${memory}mb
1141#PBS -m abe
1142#PBS -o $remote_dayfile
1143
[892]1144$init_cmds
[493]1145$module_calls
[437]1146
1147%%END%%
1148
1149    fi
1150
[1099]1151 elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1152 then
1153    cat > $job_to_send << %%END%%
1154#!/bin/bash
1155#PJM -L "rscgrp=$queue"
1156#PJM -L "node=$nodes"
1157#PJM --mpi "proc=$numprocs"
1158#PJM -L "elapse=$timestring"
1159#PJM -o $remote_dayfile
1160#PJM -j
1161#PJM -X
1162#PJM --no-stging
1163
1164export LANG=en_US.UTF-8
1165%%END%%
1166
[1090]1167 elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1168 then
1169    cat > $job_to_send << %%END%%
1170#!/bin/bash
[1099]1171#PJM -L "rscgrp=$queue"
[1090]1172#PJM -L "vnode=$numprocs"
1173#PJM -L "vnode-core=1"
1174#PJM -L "elapse=$timestring"
1175#PJM --mpi proc=$numprocs
1176#PJM -o $remote_dayfile
1177#PJM -j
[1099]1178#PJM -X
1179#PJM --no-stging
[1090]1180
1181export LANG=en_US.UTF-8
1182%%END%%
1183
[1]1184 elif [[ $remote_host = nech ]]
1185 then
1186
1187    if (( nodes > 1 ))
1188    then
1189       cat > $job_to_send << %%END%%
1190#!/bin/ksh
[622]1191#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
[1]1192#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1193#PBS -b $nodes
1194#PBS -o $remote_dayfile
1195#PBS -N palm
1196#PBS -j o
1197#PBS -T mpisx
1198
1199%%END%%
1200
1201    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1202    then
1203       cat > $job_to_send << %%END%%
1204#!/bin/ksh
[622]1205#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
[1]1206#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1207#PBS -o $remote_dayfile
1208#PBS -N palm
1209#PBS -j o
1210
1211%%END%%
1212
1213    else
1214       cat > $job_to_send << %%END%%
1215#!/bin/ksh
1216#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
1217#PBS -o $remote_dayfile
1218#PBS -j o
1219
1220%%END%%
1221
1222    fi
1223
[251]1224 elif [[ $remote_host = necriam ]]
[35]1225 then
1226
1227    if (( nodes > 1 ))
1228    then
1229       cat > $job_to_send << %%END%%
1230#!/bin/ksh
1231#PBS -b $nodes
1232#PBS -o $remote_dayfile
[253]1233#PBS -N $job_name
[35]1234#PBS -j o
[251]1235#PBS -v MPIPROGINV=YES
[35]1236
1237%%END%%
1238
1239    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1240    then
1241       cat > $job_to_send << %%END%%
1242#!/bin/ksh
1243#PBS -q ${queue}
1244#PBS -o $remote_dayfile
[253]1245#PBS -N $job_name
[35]1246#PBS -j o
[251]1247#PBS -v MPIPROGINV=YES
[35]1248
1249%%END%%
1250
1251    else
1252       cat > $job_to_send << %%END%%
1253#!/bin/ksh
1254#PBS -o $remote_dayfile
1255#PBS -j o
1256
1257%%END%%
1258
1259    fi
1260
[1]1261 elif [[ $remote_host = lctit ]]
1262 then
1263    cat > $job_to_send << %%END%%
[635]1264#!/bin/ksh
[892]1265$init_cmds
[678]1266$module_calls
1267
[1]1268%%END%%
1269
1270       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
[678]1271    if [[ $tasks_per_node != $processes_per_node ]]
1272    then
1273       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1274    else
1275       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -l place=scatter -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1276    fi
[1]1277
1278 else
1279
1280    cat > $job_to_send << %%END%%
1281# @\$-q ${queue}
1282# @\$-l${qsubtime} $timestring
1283# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
1284# @\$-o $remote_dayfile
1285# @\$-eo
1286
1287%%END%%
1288
1289 fi
1290
1291
1292    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
1293    # BEI EXIT VERANLASSEN
1294    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
1295    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
1296 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
1297 then
1298    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
1299    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
1300    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
[1099]1301    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lcflow  ||  $remote_host = lckiaps  ||  $remote_host = lckyu* ]]
[1]1302    then
[622]1303       if [[ $remote_host = ibmh ]]
[1]1304       then
1305          return_queue=c1
[693]1306       elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
1307       then
1308          return_queue=class.1-2
[622]1309       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1310       then
1311          return_queue=sdbg2
[1]1312       elif [[ $remote_host = ibms ]]
1313       then
1314          return_queue=p_normal
1315       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
1316       then
1317          return_queue=serial
[325]1318       elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
1319       then
[326]1320          return_queue=serialq
[251]1321       elif [[ $remote_host = necriam ]]
[1]1322       then
[253]1323          return_queue=SP
[1040]1324       elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
1325       then
1326          return_queue=express
[1099]1327       elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1328       then
1329          return_queue=cx-single
[1090]1330       elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1331       then
1332          return_queue=cx-single
[1]1333       else
1334          return_queue=unknown
1335       fi
1336
1337       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1338       then
1339
[622]1340          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1341          then
1342             echo "echo \"#!/usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1343             echo "echo \"# @ shell = /usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1344          else
1345             echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1346          fi
[1]1347          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1348          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1349          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1350          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
1351          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1352          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
[312]1353          if [[ $host != "ibmh" ]]
1354          then
1355             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1356          fi
[1]1357          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1358          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
1359
1360          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1361          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
1362
1363          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
[1094]1364          echo "echo \"batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
[622]1365          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1366          then
1367             echo "echo \"rm  scpjob.$kennung\" >> scpjob.$kennung"   >>  $job_to_send
1368          fi
[1]1369          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
1370
1371       elif [[ $remote_host = nech ]]
1372       then
1373          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
1374          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1375          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
1376          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1377          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1378          echo " "                                 >>  $job_to_send
1379          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1380          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
[1094]1381          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[1]1382          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1383          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1384
[251]1385       elif [[ $remote_host = necriam ]]
[35]1386       then
1387          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1388          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
1389          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1390          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1391          echo " "                                 >>  $job_to_send
1392          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1393          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[35]1394          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1395          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1396
[1099]1397       elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1398       then
1399          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1400          echo "#!/bin/bash"                       >>  $job_to_send
1401          echo "#PJM -L \"node=1\""                >>  $job_to_send
1402          echo "#PJM -L \"rscgrp=$return_queue\""  >>  $job_to_send
1403          echo "#PJM --no-stging"                  >>  $job_to_send
1404          echo "#PJM -L \"elapse=30:00\""          >>  $job_to_send
1405          echo "#PJM -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1406          echo "#PJM -j"                           >>  $job_to_send
1407          echo " "                                 >>  $job_to_send
1408          echo "export LANG=en_US.UTF-8"           >>  $job_to_send
1409          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1410          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1411          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1412          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1413
[1090]1414       elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1415       then
1416          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1417          echo "#!/bin/bash"                       >>  $job_to_send
1418          echo "#PJM -L \"vnode=1\""               >>  $job_to_send
1419          echo "#PJM -L \"rscgrp=$return_queue\""  >>  $job_to_send
1420          echo "#PJM --no-stging"                  >>  $job_to_send
1421          echo "#PJM -L \"elapse=30:00\""          >>  $job_to_send
1422          echo "#PJM -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1423          echo "#PJM -j"                           >>  $job_to_send
1424          echo " "                                 >>  $job_to_send
1425          echo "export LANG=en_US.UTF-8"           >>  $job_to_send
1426          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1427          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[1090]1428          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1429          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1430
[181]1431       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1432       then
1433          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1434          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1435          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
[325]1436          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
[181]1437          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
[366]1438          echo "#PBS -l feature=data"                    >>  $job_to_send
[181]1439          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1440          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
1441          echo " "                                 >>  $job_to_send
1442          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
1443          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1444          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
[181]1445          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1446          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1447
[1099]1448       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1449       then
1450          echo "cat > scpjob.${kennung}.tmp << %%END%%"                  >>  $job_to_send
1451          echo "#!/bin/bash"                                             >>  $job_to_send
1452          echo "SGEPREFIX -S /bin/bash"                                  >>  $job_to_send
1453          echo "SGEPREFIX -N transfer_$job_name"                         >>  $job_to_send
1454          echo "SGEPREFIX -cwd"                                          >>  $job_to_send
1455          echo "SGEPREFIX -l h_rt=01:00:00"                              >>  $job_to_send
1456          echo "SGEPREFIX -l h_vmem=100M"                                >>  $job_to_send
1457          echo "SGEPREFIX -j y"                                          >>  $job_to_send
1458          echo "SGEPREFIX -o ${local_host}_${job_name}_scpjob_$kennung"  >>  $job_to_send 
1459          echo " "                                                       >>  $job_to_send 
1460          echo "set -x"                                                  >>  $job_to_send 
1461          echo "export PALM_BIN=$PALM_BIN" | sed -e 's:'$HOME':$HOME:'   >>  $job_to_send
1462          echo "export PATH=\$PATH:\$PALM_BIN"                           >>  $job_to_send
1463          echo ""                                 >>  $job_to_send         
1464          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1465          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1466          echo "rm -f scpjob.${kennung}"                                 >>  $job_to_send         
1467          echo "%%END%%"                                                 >>  $job_to_send
1468          echo "sed -e 's/SGEPREFIX/#$/g' scpjob.${kennung}.tmp > scpjob.${kennung}" >>  $job_to_send         
1469          echo "rm -f scpjob.${kennung}.tmp"                             >>  $job_to_send         
1470
[1]1471       else
1472
1473          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1474          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1475          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1476          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1477          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1478          then
1479             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1480          fi
1481          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1482#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1483          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1484          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1485          echo " "                                 >>  $job_to_send
1486          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1487          then
1488             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1489             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1490          fi
1491          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
[1094]1492          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
[1]1493          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1494          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1495       fi
1496
1497       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1498       then
1499          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
[181]1500       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1501       then
[748]1502          echo "rm -rf \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1503          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"                         >>  $job_to_send
1504          echo "msub  scpjob.$kennung"                               >>  $job_to_send
[1]1505       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1506       then
1507          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1508       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1509       then
1510          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
[1043]1511       elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
1512       then
1513          echo "mv  scpjob.$kennung  $job_catalog"           >>  $job_to_send
[1094]1514          echo "ssh $SSH_PORTOPT ${remote_username}@${remote_addres}  \"$submcom ${job_catalog}/scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
[1043]1515          echo "rm  ${job_catalog}/scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
[1099]1516       elif [[ $remote_host = lckyu* ]]
[1090]1517       then
[1094]1518          echo "scp $PORTOPT scpjob.$kennung  ${remote_username}@${remote_addres}:job_queue"           >>  $job_to_send
1519          echo "ssh $SSH_PORTOPT ${remote_username}@${remote_addres}  \"cd job_queue; $submcom scpjob.$kennung; rm scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
[1099]1520       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1521       then
1522          echo "mv  scpjob.$kennung  $job_catalog"           >>  $job_to_send
1523          echo "ssh ${remote_username}@${remote_addres}  \"$init_cmds $module_calls cd $job_catalog; $submcom scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
[1]1524       else
[1040]1525          echo "$submcom  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
[1]1526       fi
[1043]1527       if [[ $remote_host != ibmku  &&  $remote_host != lckiaps ]]
[622]1528       then
1529          echo "rm  scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1530       fi
[1]1531       if [[ $remote_host = nech ]]
1532       then
1533          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1534       fi
1535    else
1536#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1537       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1538    fi
1539    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1540    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1541    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1542 fi
1543
1544
1545
1546    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1547 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
[69]1548
[1]1549 if [[ $remote_host = ibm ]]
1550 then
1551    echo " "         >>  $job_to_send
1552    echo "exit"      >>  $job_to_send
1553 fi
[635]1554
1555    # remove job file
[1099]1556 if [[ $remote_host = lctit  ||  $remote_host = ibmku  ||  $remote_host = lcflow ]]
[69]1557 then
1558    echo " "                               >>  $job_to_send
1559    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1560 fi
[1]1561
1562
1563
1564    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1565 if [[ -z $remote_user ]]
1566 then
1567    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1568    then
1569       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1570    fi
1571 fi
1572
1573
1574
1575    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1576 if [[ $no_submit = false ]]
1577 then
1578    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1579    then
1580       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
[82]1581       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
[1]1582       then
[82]1583          job_catalog_save=$job_catalog
1584          job_catalog=job_queue
1585       elif [[ $remote_host = nech ]]
1586       then
1587          job_catalog_save=$job_catalog
1588          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1589       fi
[1096]1590       if [[ $remote_host = nech ]]
[82]1591       then
1592             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1593             # TRANSFERIERT WERDEN
[1094]1594          scp  $PORTOPT  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1595       else
[1094]1596          scp  $PORTOPT  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1597       fi
[82]1598       if [[ $? = 1 ]]
1599       then
1600          locat=scp; exit
1601       fi
1602       if [[ $remote_host = ibms ]]
1603       then
1604          job_catalog=$job_catalog_save
1605       fi
[1]1606       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1607    else
1608       eval  job_catalog=$job_catalog
1609       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1610    fi
1611
1612
1613
1614       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1615    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1616    then
1617       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
[635]1618
1619       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  &&  $prio = true ]]
[1]1620       then
[635]1621          printf "\n >>> submit with HLRN qos-feature hiprio...\n"
[1094]1622          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom -l qos=hiprio $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
[635]1623       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1624       then
[1094]1625          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
[1099]1626       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1627       then
1628          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "$init_cmds $module_calls cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
[1]1629       else
[1094]1630          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
[82]1631       fi
[1]1632
1633       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1634    else
1635       cd  $job_catalog
[1199]1636       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $local_host = lccrayf ]]
[1]1637       then
1638          eval  $submcom  $job_on_remhost
[1099]1639       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxe6  ||  $localhost = lck  || $localhost = lckordi ||  $localhost = lcyon || $localhost = lcsb  ||  $localhost = lckyu* ]]
[108]1640       then
[635]1641          chmod  u+x  $job_on_remhost
[108]1642          eval  $submcom  $job_on_remhost
[1]1643       elif [[ $local_host = nech ]]
1644       then
1645          if [[ $queue = default ]]
1646          then
[799]1647             eval  $submcom  $job_on_remhost
[1]1648          else
[799]1649             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost
[1]1650          fi
1651       else
1652          qsub  $job_on_remhost
1653       fi
[622]1654
1655          # Jobfile must not be deleted on lctit/ibmku!! This will be done
1656          # only at the end of the job.
[1099]1657       if [[ $local_host != lctit  &&  $local_host != ibmku  &&  $local_host != lcflow ]]
[622]1658       then
1659          rm  $job_on_remhost
1660       fi
[1]1661       cd  -  > /dev/null
1662    fi
1663 fi
1664
1665
1666
1667    # ABSCHLUSSARBEITEN
1668
1669 if [[ $no_submit = false ]]
1670 then
[1099]1671    rm  -f $job_to_send
[1]1672 fi
1673 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.