source: palm/trunk/SCRIPTS/mrun @ 66

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Rev properties set fro scripts, small adjustments for RIAM, fimm (Igor) admitted

  • Property svn:keywords set to Rev
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Line 
1#!/bin/ksh
2
3##!/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/ksh   NEEDED ON NEC AT RIAM !!!!!!!!!!
4
5# mrun - Plot-Shellskript
6# $Id: mrun 61 2007-03-12 05:42:06Z raasch $
7
8     # Prozedur zum Starten von Modellaeufen
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 03/03/94 - Siggi - Entwicklungsbeginn
12     # 21/03/94 - Siggi - Entwicklungsabschluss (Version 1.0)
13     # 09/12/94 - Siggi - allexport unterbunden; statt dessen werden jetzt ein-
14     #                    zelne Variable exportiert. Dies ist noetig, weil an-
15     #                    sonsten irgendein Speicher ueberlaeuft und von mrun
16     #                    aufgerufene Programme (z.B. stageout) mit Fehlern
17     #                    abbrechen (too many arguments)
18     # 20/06/95 - Siggi - noclobber muss explizit abgeschaltet, da jetzt
19     #                    defaultmaessig im RRZN-Profile eingeschaltet
20     # 10/06/97 - Siggi - Zusaetzliche Option -C bei cpp, damit // nicht
21     #                    wegfallen
22     # 25/04/00 - Siggi - Version 1.5
23     #                    remote_addres und remote_user in return_addres bzw.
24     #                    return_username umbenannt, return_username wird dem
25     #                    mrun-Aufruf im Job ueber Option -U mitgegeben.
26     #                    Neue Variable remote_username, die beim interaktiven
27     #                    mrun-Aufruf zwingend ueber die neue Option -u oder
28     #                    in der Konfigurationsdatei angegeben werden muss.
29     # 08/02/01 - Siggi - Alle mrun-Meldungen ins englische uebersetzt,
30     #                    Version 1.7
31     # 05/05/02 - Siggi - Uebersetzungen mittels make-Mechanismus moeglich
32     # 21/11/02 - Siggi - ENV-Variable XLFRTEOPTS wird vor Ausfuehrung auf
33     #                    IBM gesetzt, um Record-Laenge der NAMELIST-Dateien,
34     #                    zu bestimmen; Praeprozessoroptionen haben nun alle
35     #                    die Form -Dtext=text, weil auf IBM sonst text durch
36     #                    die leere Zeichenkette ersetzt wird
37     # 01/08/03 - Siggi  - Test of implementing dvrp+1PE on ibm
38     # 07/01/04 - Siggi  - additional preprocessor directive for ibm included
39     #                     (-D$OMP=OMP) in order to avoid problems with
40     #                     OMP_NUM_THREADS
41     # 04/01/05 - Siggi  - archiving on hanni and berni is done in separate
42     #                     tar files, one for each node used
43     # 07/01/04 - Siggi  - old code for t3e, vpp and hpcs eliminated
44     # 09/01/05 - Siggi  - workaround for getting the IP address on gfdl3
45     # 17/01/05 - Siggi  - job for data transfer to local machine now within
46     #                     job class c1 (HLRN)
47     # 27/01/05 - Siggi  - IP address workaround for gfdl3 removed
48     # 28/01/05 - Siggi  - tar-filenames on $PERM (HLRN) now include the
49     #                     base filename and cycle number
50     # 16/02/05 - Gerald - hababai validated
51     # 14/03/05 - Siggi  - abort on NEC after first runtime error (F_ERRCNT)
52     # 29/03/05 - Marcus - berni*-en0 validated
53     # 21/04/05 - Siggi  - transfer-job-protocol for avs-data is no more stored
54     # 24/04/05 - Siggi  - netcdf support on lcmuk
55     # 25/04/05 - Siggi  - netcdf support on gfld3 (decalpha)
56     # 11/05/05 - Siggi  - files with non-numeric extensions (.xxx after cycle
57     #                     number) can now be used within interactive runs
58     # 12/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibm
59     # 13/05/05 - Siggi  - error in tar-filenames on $PERM (HLRN) removed
60     # 18/05/05 - Siggi  - netcdf support on nec
61     # 24/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibms
62     # 14/06/05 - Siggi  - sleep interval after submit of restart job increased
63     #                     to 30 seconds
64     # 28/06/05 - Siggi  - bora adjusted to new intel compiler (LD_LIBRARY_
65     #                     PATH is temporarily set)
66     # 07/09/05 - Siggi  - setting of MP_EAGER_LIMIT switched off because it
67     #                     caused warnings in the job protocol
68     # 20/10/05 - Siggi  - update of netcdf-version on decalpha (gfdl3)
69     # 25/10/05 - Siggi  - error in listing files for getting the cycle number
70     #                     removed
71     # 26/10/05 - Siggi  - new paths for dvrp-library, transfer of catalogs
72     #                     realized by file attribute trpe
73     # 28/10/05 - Siggi  - if existing, the file extension is output in case
74     #                     of missing input file - no job abort in case of
75     #                     missing input files with file extensions
76     #                     (preliminary solution)
77     # 31/10/05 - Siggi  - data transfer from nech now within seperate job
78     # 04/11/05 - Siggi  - netcdf 3.6.0-p1 on ibmh/ibmb
79     # 07/12/05 - Siggi  - gallego and elephanta admitted
80     # 30/12/05 - Siggi  - gfdl5 (ibmy) admitted
81     # 10/01/06 - Siggi  - cpp directive for NetCDF 64bit support
82     # 20/01/06 - Siggi  - cpp directive for ibmy
83     # 09/02/06 - Siggi  - ibmy admitted for batch mode
84     # 13/04/06 - Siggi  - ostria admitted
85     # 18/04/06 - Siggi  - usage of OpenMP implemented (additional option -O)
86     # 10/05/06 - Siggi  - environment variable XLSMPOPTS set on IBM for
87     #                     optimization of OpenMP runs (option stacksize is
88     #                     necessary for large gridpoint numbers because
89     #                     otherwise a segmentation fault occurs)
90     # 23/05/05 - Siggi  - lctit (SUN Fire X4600) admitted
91     # 21/08/06 - Siggi  - standard mrun path on scirocco is as on bora
92     # 23/08/06 - Siggi  - netcdf support for scirocco (notebook)
93     # 20/09/06 - Marcus - add DVRP library on nech
94     # 24/10/06 - Siggi  - Environment variables for PALM steering are written
95     #                     on local NAMELIST file ENVPAR
96     # 24/11/06 - Siggi  - levanto admitted, maestro switched to ifc 9.1
97     # 28/11/06 - Siggi  - call to interpret_config.x_levanto because of SuSe 10
98     # 06/02/07 - Siggi  - add DVRP library on lcmuk
99     # 07/02/07 - Siggi  - revision of source code handling, source code is
100     #                     now expected in directory given by source_path and
101     #                     not in the current working directory, source code
102     #                     files provided in add_source_path are allways
103     #                     compiled, source code to be compiled is allways
104     #                     sampled in SOURCES_FOR_RUN_$fname which is a
105     #                     subdirectory of the current working directory,
106     #                     -s TEST  changed to  -s WRITE_PERMIT  or -s WP,
107     #                     adapted for RIAM (neck)
108     #                     bugfix for cycle number of output file (extout)
109     #                     all hpmuk-related code removed
110     # 14/02/07 - Siggi  - dvrp support for neck added
111     # 28/02/07 - Siggi  - empty lines in configuration file are accepted
112     #                     mrun_path replaced by PALM_BIN,
113     #                     all machines are calling interpret_config.x
114     # 14/03/07 - Siggi  - fimm admitted, revision number added to terminal
115     #                     output
116
117
118
119 
120    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
121
122 set +o allexport    # SICHERHEITSHALBER UNTERBINDEN, DA SONST EVTL. STAGEOUT
123                     # NICHT LAUEFT (TOO MANY ARGUMENTS - PROBLEM)
124 set +o noclobber    # EXISTIERENDE DATEIEN DUERFEN UEBERSCHRIEBEN WERDEN
125
126 AddFilenames=""
127 additional_conditions=""
128 add_source_path=""
129 afname=""
130 archive_save=true
131 archive_system=none
132 compiler_name=""
133 cond1=""
134 cond2="" 
135 config_file=.mrun.config
136 cpp_opts=""
137 cpumax=0
138 cpurest=0
139 delete_temporary_catalog=true
140 do_batch=false
141 do_compile=true
142 do_remote=false
143 do_stagein=true
144 do_stageout=true
145 do_trace=false
146 email_notification=""
147 exclude=""
148 executable=""
149 execution_error=false
150 filetransfer_protocol=""
151 fname=test
152 fromhost=""
153 host=""
154 host_file=""
155 hp=""
156 ignore_archive_error=false
157 input_list=""
158 interpreted_config_file=""
159 job_on_file=""
160 keep_data_from_previous_run=false
161 localhost_realname=$(hostname)
162 local_compile=false
163 locat=normal
164 mainprog=""
165 makefile=""
166 mc=$0
167 while [[ $(echo $mc | grep -c "/") != 0 ]]
168 do
169    mc=`echo $mc | cut -f2- -d"/"`
170 done
171 module_files=""
172 MODULE_OPTIONS=""
173 mrun_script_name=$mc
174 netcdf_support=false
175 node_usage=default
176 numprocs=""
177 OOPT=""
178 openmp=false
179 output_list=""
180 package_list=""
181 punkte="..........................................................."
182 queue=none
183 read_from_config=""
184 restart_run=false
185 return_addres=$(nslookup `hostname` 2>&1 | grep "Address:" | tail -1 | awk '{print $2}')
186 if [[ $return_addres = 130.75.105.158 ]]
187 then
188    return_addres=172.20.25.41
189    echo "+++ WARNING: return_addres changed to $return_addres !!!!!"
190 fi
191# if [[ $return_addres = 210.117.65.1 ]]
192# if [[ $(nslookup `hostname` 2>&1 | grep -c 210.117.65.1) = 1 ]]
193# then
194#    [[ $localhost_realname = gfdl3.yonsei.ac.kr ]]  &&  return_addres=165.132.26.56
195# fi
196 return_password=""
197 return_username=$LOGNAME
198 remotecall=false
199 remote_username=""
200 run_mode=""
201 scirocco=false
202 store_on_archive_system=true
203 striche="  ----------------------------------------------------------------------------"
204 silent=false
205 source_list=""
206 source_path=SOURCE
207 tasks_per_node=""
208 threads_per_task=1
209 tmpcreate=false
210 tmp_data_catalog=""
211 transfer_problems=false
212 usern=$LOGNAME
213 use_makefile=""
214 working_directory=`pwd`
215 TOPT=""
216 XOPT=""
217 zeit=$( date | cut -c 12-19 )
218
219 typeset -i  iec=0 iic=0 iin=0 ioc=0 iout=0 memory=0 stagein_anz=0 stageout_anz=0
220 typeset -i  cputime i ii icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
221
222 typeset  -R30 calltime
223 typeset  -L20 spalte1
224 typeset  -L40 spalte2
225 typeset  -L60 spalte3
226 typeset  -L35 string1=`date`
227 typeset  -L12 string2=$usern
228 typeset  -L12 string3=$localhost_realname
229 typeset  -L12 string4
230 typeset  -L12 string5
231 typeset  -L30 version="MRUN  2.0 $Rev: 66 $"
232
233
234
235    # EINZELNE VARIABLE FUER HAUPTPROGRAMM EXPORTIEREN
236 export  cpurest fname host localhost return_addres return_username remotecall tasks_per_node
237
238    # FOLGENDE VARIABLEN MUESSEN FUER DIE INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI
239    # EXPORTIERT WERDEN
240 export  afname config_file cpp_opts cpumax do_batch do_trace fname fromhost
241 export  input_list memory numprocs output_list queue run_mode
242
243
244 
245    # FEHLERBEHANDLUNG
246    # BEI EXIT:
247 trap 'if [[ $locat != localhost ]]
248       then
249#          if [[ ! -f ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik ]]
250#          then
251#             cat  >  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik  <<  %STATEND%
252#MRUN-calls on $localhost
253#
254#date and time                      user        localhost   remotehost  termination mrun-command
255#--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
256#%STATEND%
257#             chmod  666  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
258#          fi
259#
260#             # EINTRAG IN DIE STATISTIK-DATEI
261#          string4=$host
262#          string5=$locat
263#          if [[ "$job_on_file" = ""  &&  $locat != control_c  &&  $locat != user_abort ]]
264#          then
265#             if [[ $do_batch = true ]]
266#             then
267#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mrun_com \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
268#             else
269#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mc \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
270#             fi
271#          fi
272          continue
273       fi
274
275       if [[ $locat != normal  &&  $locat != control_c  &&  $locat != local_compile ]]
276       then
277
278              # EVENTUELLE ERROR-KOMMANDOS ABARBEITEN
279          (( i = 0 ))
280          while (( i < iec ))
281          do
282             (( i = i + 1 ))
283             printf "\n  *** Execution of ERROR-command:\n"
284             printf "  >>> ${err_command[$i]}\n"
285             eval  ${err_command[$i]}
286          done
287          if [[ -n $interpreted_config_file ]]  then
288             rm -rf  $interpreted_config_file
289          fi
290          if [[ $tmpcreate = true ]]
291          then
292             printf "\n  *** Contents of \"$TEMPDIR\":\n"
293             ls -al; cd
294             [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
295          fi
296          if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
297          then
298             rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
299          fi
300          printf "\n\n+++ MRUN killed \n\n"
301       elif [[ $locat != control_c ]]
302       then
303          printf "\n\n --> all actions finished\n\n"
304          printf "     Bye, bye $usern !!\n\n"
305       fi' exit
306
307
308    # BEI TERMINAL-BREAK:
309 trap '[[ $tmpcreate = true ]]  &&  (cd; rm -rf $TEMPDIR)
310       if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
311       then
312          rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
313       fi
314       printf "\n+++ MRUN killed by \"^C\" \n\n"
315       locat=control_c
316       exit
317      ' 2
318
319
320    # CHECK IF THE PATH FOR THE PALM BINARIES (SCRIPTS+UTILITY-PROGRAMS) HAS
321    # BEEN SET
322 if [[ "$PALM_BIN" = "" ]]
323 then
324    printf "\n  +++ environment variable PALM_BIN has not been set"
325    printf "\n      please set it to the directory where the PALM scripts are located"
326    locat=palm_bin; exit
327 fi
328
329
330    # EVTL. NAMEN DES LOKALEN RECHNERS MIT UEBERGREIFENDEM NAMEN VERSEHEN
331 case  $localhost_realname  in
332     (atmos)                localhost=lcide;;
333     (bora|breva|elephanta|gallego|gregale|hababai|irifi|levanto|maestro|orkan|ostria|poniente|quanero|scirocco|vorias)  localhost=lcmuk;;
334     (breg*-en0|berni*-en0) localhost=ibmb; archive_system=tivoli;;
335     (cs*)                  localhost=nech; archive_system=ut;;
336     (fimm.bccs.uib.no)     local_host=lcmuk;;
337     (gate|n-sx)            PATH=$PALM_BIN:$PATH:/usr/bin/nqsII; localhost=neck;;
338     (ground.yonsei.ac.kr)  localhost=decalpha;;
339     (gfdl3.yonsei.ac.kr)   localhost=decalpha;;
340     (gfdl5)                localhost=ibmy;;
341     (hreg*-en0|hanni*-en0) localhost=ibmh; archive_system=tivoli;;
342     (nobel*)               localhost=ibms;;
343     (sun1|sun2)            localhost=unics;;
344     (tgg*)                 localhost=lctit;;
345     (*)                    printf "\n  +++ Host \"$localhost_realname\" not admitted for mrun \n"
346                            locat=localhost; exit;;
347 esac
348
349 [[ $localhost_realname = scirocco ]]  &&  scirocco=true
350
351
352 
353    # SHELLSCRIPT-OPTIONEN EINLESEN UND KOMMANDO NEU ZUSAMMENSETZEN, FALLS ES
354    # FUER FOLGEJOBS BENOETIGT WIRD
355 while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:f:Fh:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX: option
356 do
357   case  $option  in
358       (a)   afname=$OPTARG;;
359       (A)   store_on_archive_system=false; mc="$mc -A";;
360       (b)   do_batch=true; mc="$mc -b";;
361       (B)   delete_temporary_catalog=false; mc="$mc -B";;
362       (c)   config_file=$OPTARG; mc="$mc -c$OPTARG";;
363       (C)   restart_run=true; mc="$mc -C";;
364       (d)   fname=$OPTARG; mc="$mc -d$OPTARG";;
365       (D)   cpp_opts="$cpp_opts $OPTARG"; mc="$mc -D$OPTARG";;
366       (f)   filetransfer_protocol=$OPTARG; mc="$mc -f$OPTARG";;
367       (F)   job_on_file="-D"; mc="$mc -F";;
368       (h)   host=$OPTARG; mc="$mc -h$OPTARG";;
369       (H)   fromhost=$OPTARG; mc="$mc -H$OPTARG";;
370       (i)   input_list=$OPTARG; mc="$mc -i'$OPTARG'";;
371       (I)   ignore_archive_error=true; mc="$mc -I";;
372       (k)   keep_data_from_previous_run=true; mc="$mc -k";;
373       (K)   additional_conditions="$OPTARG"; mc="$mc -K$OPTARG";;
374       (m)   memory=$OPTARG; mc="$mc -m$OPTARG";;
375       (M)   makefile=$OPTARG; mc="$mc -M$OPTARG";;
376       (n)   node_usage=$OPTARG; mc="$mc -n$OPTARG";; 
377       (o)   output_list=$OPTARG; mc="$mc -o'$OPTARG'";;
378       (O)   use_openmp=true; mc="$mc -O";;
379       (p)   package_list=$OPTARG; mc="$mc -p'$OPTARG'";;
380       (P)   return_password=$OPTARG; mc="$mc -P$OPTARG";;
381       (q)   queue=$OPTARG; mc="$mc -q$OPTARG";;
382       (r)   run_mode=$OPTARG; mc="$mc -r'$OPTARG'";;
383       (R)   remotecall=true;return_addres=$OPTARG; mc="$mc -R$OPTARG";;
384       (s)   source_list=$OPTARG; mc="$mc -s'$OPTARG'";;
385       (S)   read_from_config=false; mc="$mc -S";;
386       (t)   cpumax=$OPTARG; mc="$mc -t$OPTARG";;
387       (T)   tasks_per_node=$OPTARG; mc="$mc -T$OPTARG";;
388       (u)   remote_username=$OPTARG; mc="$mc -u$OPTARG";;
389       (U)   return_username=$OPTARG; mc="$mc -U$OPTARG";;
390       (v)   silent=true; mc="$mc -v";;
391       (x)   do_trace=true;set -x; mc="$mc -x";;
392       (X)   numprocs=$OPTARG; mc="$mc -X$OPTARG";;
393       (\?)  printf "\n  +++ unknown option $OPTARG \n"
394             printf "\n  --> type \"$0 ?\" for available options \n"
395             locat=parameter;exit;;
396   esac
397 done
398
399
400    # EVTL. POSITIONSPARAMETER EINLESEN
401    # ZUR ZEIT GIBT ES NUR DEN PARAMETER ? (=KURZINFO)
402 shift OPTIND-1
403
404
405    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
406 if [[ "$1" = "?" ]]
407 then
408   (printf "\n  *** mrun can be called as follows:\n"
409    printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X..  <modus>\n"
410    printf "\n      Description of available options:\n"
411    printf "\n      Option  Description                              Default-Value"
412    printf "\n        -a    base name of input files                 equiv. -d"
413    printf "\n        -A    no archiving when using file-attribute fl"
414    printf "\n        -b    batch-job on local machine               ---"
415    printf "\n        -B    do not delete temporary directory at end ---"
416    printf "\n        -c    configuration file                       .mrun.config"
417    printf "\n        -d    base name of files attached to program   test"
418    printf "\n        -D    preprocessor(cpp)-directives             \"\" "
419    printf "\n        -f    filetransfer protocol (ftp or scp)       depending on -h"
420    printf "\n        -F    create remote job file only              ---"
421    printf "\n        -h    execution host                           $localhost_realname"
422    printf "\n        -i    INPUT control list                       \"\" "
423    printf "\n        -I    archiving errors of previous batch-jobs"
424    printf "\n              will be ignored"
425    printf "\n        -k    keep data from previous run"
426    printf "\n        -K    additional conditions for controling"
427    printf "\n              usage of conditional code and"
428    printf "\n              env-variables in configuration file      \"\" "
429    printf "\n        -m    memory demand in MB (batch-jobs)         0 MB"
430    printf "\n        -M    Makefile name                            Makefile"
431    printf "\n        -n    node usage (shared/not_shared)           depending on -h"
432    printf "\n        -o    OUTPUT control list                      \"\" "
433    printf "\n        -O    use OpenMP                               ---"
434    printf "\n        -p    software package list                    \"\" "
435    printf "\n        -q    queue                                    \"$queue\" "
436    printf "\n        -r    run control list (combines -i -o)        \"\" "
437    printf "\n        -s    filenames of routines to be compiled     \"\" "
438    printf "\n              must end with .f, .f90, .F, or .c !"
439    printf "\n              use \"..\" for more than one file and wildcards"
440    printf "\n              -s TEST compiles all files with w-permit"
441    printf "\n        -S    config file interpreted by shellscript   ---"
442    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds (batch)      0"
443    printf "\n        -T    tasks per node                           depending on -h"
444    printf "\n        -u    username on remote machine               \"\" "
445    printf "\n        -v    no prompt for confirmation               ---"
446    printf "\n        -x    tracing of mrun for debug purposes       ---"
447    printf "\n        -X    # of processors (on parallel machines)   1"
448    printf "\n "
449    printf "\n      Possible values of positional parameter <modus>:"
450    printf "\n        \"?\"       -  this outline \n\n") | more
451    exit
452 elif [[ "$1" != "" ]]
453 then
454    printf "\n  +++ positional parameter $1 unknown \n"
455    locat=parameter; exit
456 fi
457
458
459
460    # KURZE STARTMELDUNG
461 printf "\n*** $version "
462 printf "\n    will be executed.     Please wait ..."
463
464
465    # BASISNAME DER INPUT-DATEIEN GLEICH ALLGEMEINEM BASISNAMEN SETZEN,
466    # WENN NICHT VOM BENUTZER ANDERS BESTIMMT
467 [[ "$afname" = "" ]]  &&  afname=$fname
468
469
470    # EVTL. RUN-MODUS DEN I/O-LISTEN HINZUFUEGEN
471 if [[ "$run_mode" != "" ]]
472 then
473    input_list="$input_list $run_mode"
474    output_list="$output_list $run_mode"
475 fi
476
477
478    # RECHNERNAMEN ABSPEICHERN, VON DEM AUS JOB GESTARTET WIRD,
479    # ALLERDINGS NUR DANN, WENN NICHT PER OPTION -H BEREITS EIN WERT
480    # ZUGEWIESEN WURDE (MRUN MACHT DIES IMMER, WENN ES SELBST BATCH-JOBS
481    # STARTET)
482 if [[ "$fromhost" = "" ]]
483 then
484    fromhost=$localhost
485 fi
486
487
488     # PRUEFEN, OB MRUN NUR TESTWEISE AUF DER LOKALEN MASCHINE KOMPILIEREN SOLL
489 if [[ "$source_list" = LOCAL_COMPILE_TEST ]]
490 then
491    source_list=TEST
492    local_compile=true
493    host=$localhost
494 fi
495   
496
497    # PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
498    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
499    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
500    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
501 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
502 then
503    do_batch=true
504    do_remote=true
505    case  $host  in
506        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|neck|lctit|unics)  true;;
507        (*)  printf "\n"
508             printf "\n  +++ execution host \"$host\" not admitted for MRUN,"
509             printf "\n      or NQS not available on execution host!"
510             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
511    esac
512 else
513    host=$localhost
514 fi
515
516
517     # ZUSATZBEDINGUNGEN (OPTION -K) AUSWERTEN
518 if [[ -n $additional_conditions ]]
519 then
520    echo $additional_conditions | cut -d" " -f1-3 | read  cond1  cond2  dummy
521#    cond1=`echo $additional_conditions | cut -d" " -f1`
522#    cond2=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f2`
523#    dummy=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f3`
524    if [[ -n $dummy ]]
525    then
526       printf "\n  +++ more than 2 additional conditions given for Option \"-K\""
527       locat=options; exit
528    fi
529 fi
530
531
532    # PRUEFEN, OB EVTL. BEI VORHERGEHENDEM LAUF (KETTENJOB) EINE
533    # ARCHIVIERUNG FEHLGESCHLAGEN IST
534 if [[ -f ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname ]]
535 then
536    if [[ $ignore_archive_error = false ]]
537    then
538       printf "\n  +++ data archiving of previous run failed"
539       printf "\n      see directory \~/job_queue on remote machine"
540       locat=archive; exit
541    else
542       printf "\n  +++ warning: data archiving in a previous run failed"
543       printf "\n      MRUN continues, trying to get backup copy"
544    fi
545 fi
546
547
548    # PRUEFEN, OB KONFIGURATIONS-DATEI VORHANDEN
549 if [[ ! -f $config_file ]]
550 then
551    printf "\n\n  +++ configuration file: "
552    printf "\n           $config_file"
553    printf "\n      does not exist"
554    locat=connect; exit 
555 fi
556
557
558
559    # LESEN UND INTERPRETIEREN DER KONFIGURATIONS-DATEI VOM SHELLSCRIPT AUS
560    # VORUEBERGEHEND ZWINGEND AUF LINUX-RECHNERN
561 if [[ "$read_from_config" = false ]]
562 then
563
564    [[ $silent = false ]]  &&  printf "\n    Reading the configuration file... "
565    while  read zeile
566    do
567        [[ $silent = false ]]  &&  printf "."
568
569
570          # ZUERST EVENTUELL VORKOMMENDE ENVIRONMENT-VARIABLEN DURCH IHRE WERTE
571          # ERSETZEN
572       eval  zeile=\"$zeile\"
573
574
575          # INTERPRETATION DER ZEILE
576       if [[ "$(echo $zeile)" = "" ]]
577       then
578             # LEERZEILE, KEINE AKTION
579          continue
580
581       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "#" ]]
582       then
583
584             # ZEILE IST KOMMENTARZEILE
585          true
586
587       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "%" ]]
588       then
589
590             # ZEILE DEFINIERT ENVIRONMENT-VARIABLE
591          zeile=$(echo $zeile | cut -c2-)
592          echo $zeile | cut -d" " -f1-5 | read  var  value  for_host  for_cond1  for_cond2
593#          var=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
594#          value=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
595#          for_host=`echo $zeile | cut -d" " -s -f3`
596#          for_cond1=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
597#          for_cond2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
598
599          if [[ "$for_host" = ""  ||  ( "$for_host" = $host  &&  "$for_cond1" = "$cond1"  &&  "$for_cond2" = "$cond2" )  ||  $(echo "$input_list$output_list"|grep -c "$for_host") != 0 ]]
600          then
601
602                # BEI COMPILER- CPP- ODER LINKEROPTIONEN EVTL ":" DURCH " "
603                # ERSETZEN. "::" WIRD DURCH ":" ERSETZT.
604             value=`echo $value | sed 's/::/%DUM%/g' | sed 's/:/ /g' | sed 's/%DUM%/:/g'`
605
606
607                # ENVIRONMENT-VARIABLE WIRD WERT AUS KONFIGURATIONSDATEI
608                # ZUGEWIESEN, WENN SIE SELBST NOCH KEINEN WERT UEBER DIE
609                # ENTSPRECHENDE SCRIPT-OPTION ERHALTEN HAT. SOLCHE
610                # VARIABLEN HAETTEN DANN DEN WERT "" ODER IM INTEGER-FALL DEN
611                # WERT 0.  ALLGEMEINE REGEL ALSO: SCRIPT-OPTION GEHT UEBER
612                # KONFIGURATIONSDATEI
613             if [[ "$(eval echo \$$var)" = ""  ||  "$(eval echo \$$var)" = "0" ]]
614             then
615                eval  $var=\$value
616
617                   # EVTL. BILDSCHIRMAUSGABEN DER ENVIRONMENT-VARIABLEN
618                if [[ $do_trace = true ]]
619                then
620                   printf "\n*** ENVIRONMENT-VARIABLE $var = $value"
621                fi
622             fi
623
624                # WENN ENVIRONMENT-VARIABLE HOST VEREINBART, DANN SOFORT AUSWERTEN
625                # WERT VON do-remote WIRD BEI DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT
626                # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
627                # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
628             if [[ $var = host ]]
629             then
630                if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
631                then
632                   do_batch=true
633                   do_remote=true
634                   case  $host  in
635                       (ibm|ibms|ibmy|lctit|nech|neck|unics)  true;;
636                       (*)  printf "\n  +++ no queueing system available on execution host \"$host\""
637                            locat=nqs; exit;;
638                   esac
639                else
640                   host=$localhost
641                fi
642             fi
643
644                # VOM BENUTZER DEFINIERTE ENVIRONMENT VARIABLEN MUESSEN PRINZIPIELL
645                # EXPORTIERT WERDEN, DA SIE VIELLEICHT IN WEITER UNTEN AUFZURUFEN-
646                # DEN PROGRAMMEN BENOETIGT WERDEN
647             export  $var
648          fi
649
650
651
652
653       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "EC:" ]]
654       then
655
656             # ZEILE DEFINIERT ERROR-KOMMANDO
657          (( iec = iec + 1 ))
658          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
659          err_command[$iec]="$zeile"
660
661       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "IC:" ]]
662       then
663
664             # ZEILE DEFINIERT INPUT-KOMMANDO
665          (( iic = iic + 1 ))
666          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
667          in_command[$iic]="$zeile"
668
669       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "OC:" ]]
670       then
671
672             # ZEILE DEFINIERT OUTPUT-KOMMANDO
673          (( ioc = ioc + 1 ))
674          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
675          out_command[$ioc]="$zeile"
676
677       else
678
679             # ZEILE DEFINIERT DATEIVERBINDUNG. EINLESEN DER DATEIEIGENSCHAFTEN
680             # s2a: in/out - Feld
681             # s2b: loc    - Feld (optional)
682             # s2c: tr/ar  - Feld (optional)
683          echo $zeile | cut -d" " -f1-2 | read  s1  s2
684#          s1=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
685#          s2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
686          s2a=$(echo $s2 | cut -d":" -f1)
687          if [[ $(echo $s2 | grep -c ":") = 0 ]]
688          then
689             s2b=""
690             s2c=""
691          else
692             echo $s2 | cut -d":" -f2-3 | sed 's/:/ /g' | read  s2b  s2c
693#             s2b=`echo $s2 | cut -d":" -f2 | sed 's/:/ /g'`
694#             s2c=`echo $s2 | cut -d":" -s -f3 | sed 's/:/ /g'`
695          fi
696          echo $zeile | cut -d" " -f3-6 | read  s3  s4  s5  s6
697#          s3=`echo $zeile | cut -d" " -f3`
698#          s4=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
699#          s5=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
700#          s6=`echo $zeile | cut -d" " -s -f6`
701
702       
703             # ABSPEICHERN DER DATEIVERBINDUNG, FALLS IN INPUT- ODER OUTPUT-LIST
704             # VERMERKT. VARIABLE S3 KANN AUCH LISTE ENTHALTEN (FELDTRENNER ":")
705             # DATEIVERBINDUNG WIRD DANN NICHT ABGESPEICHERT UND GEPRUEFT, WENN
706             # PROGRAMMLAUF AUF REMOTE-MASCHINE ERFOLGT UND DATEI NUR LOKAL VOR-
707             # HANDEN SEIN MUSS (D.H. s2b = loc)
708          IFSALT="$IFS"; IFS="$IFS:"
709          if [[ "$s2a" = in  &&  ! ( $do_remote = true  &&  ( "$s2b" = loc  ||  "$s2b" = locopt ) ) ]]
710          then
711             found=false
712             for  actual  in  $input_list
713             do
714                for  formal  in  $s3
715                do
716                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-" ]]  &&  found=true
717                done
718             done
719             if [[ $found = true ]]
720             then
721                (( iin = iin + 1 ))
722                localin[$iin]=$s1; transin[$iin]=$s2b; actionin[$iin]=$s2c;
723                typein[$iin]=$s3; pathin[$iin]=$s4; endin[$iin]=$s5;
724                extin[$iin]=$s6
725             fi
726          elif [[ "$s2a" = out  &&  ! ( $do_remote = true  &&  "$s2b" = loc ) ]]
727          then
728             found=false
729             for  actual  in  $output_list
730             do
731                for  formal  in  $s3 
732                do
733                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-"  ]]  &&  found=true
734                done
735             done
736             if [[ $found = true ]]
737             then
738                (( iout = iout + 1 ))
739                localout[$iout]=$s1; actionout[$iout]=$s2c; typeout[$iout]=$s3;
740                pathout[$iout]=$s4; endout[$iout]=$s5; extout[$iout]=$s6
741             fi
742          elif [[ "$s2a" != in  &&  "$s2a" != out ]]
743          then
744             printf "\n  +++ I/O-attribute in configuration file $config_file has the invalid"
745             printf "\n      value \"$s2\". Only \"in\" and \"out\" are allowed!"
746             locat=connect; exit
747          fi
748          IFS="$IFSALT"
749       fi
750    done < $config_file
751
752 else
753
754
755       # INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI MITTELS FORTRAN 90 - PROGRAMM
756    [[ $silent = false ]]  &&  printf "..."
757    export  cond1 cond2 config_file do_remote do_trace input_list localhost output_list
758    export  interpreted_config_file=.icf.$RANDOM
759
760#    case  $localhost_realname  in
761#        (caurus|twister)      interpret_config.hp;;
762#        (bora|breva|elephanta|gallego|gregale|hababai|maestro|orkan|ostria)  export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/muksoft/packages/intel_ifc/8.1/lib/; interpret_config_9.x;;
763#        (levanto|vorias)      export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/muksoft/packages/intel/ifort/9.1.037/lib/; interpret_config_9.x_levanto;;
764#        (quanero)             export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel_fc_80/lib; interpret_config_9.x;;
765#        (*)                   interpret_config.x;;
766#    esac
767
768    if [[ $localhost_realname = "gate" ]]
769    then
770       interpret_config_gate.x
771    else
772       interpret_config.x
773    fi
774
775       # AUSFUEHRUNG DER GENERIERTEN SHELL-KOMMANDOS IN DIESER SHELL
776    chmod  u+x  $interpreted_config_file
777    export PATH=$PATH:.
778    . $interpreted_config_file
779    rm  $interpreted_config_file
780
781 fi
782
783
784    # QUELLTEXTVERZEICHNIS AUF LOKALER MASCHINE AUS KONFIGURATIONSDATEI
785    # BESTIMMEN (WUERDE SONST EVTL. DAS VERZEICHNIS DES JEWEILS UNTER -h
786    # ANGEGEBENEN REMOTE-RECHNERS SEIN)
787    # BEI BATCH-JOBS SIND DIE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE SCHON KOMPLETT
788 if [[ "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
789 then
790
791       # ZUERST PRUEFEN, OB EIN GLOBALER QUELLTEXTPFAD FUER ALLE RECHNER
792       # VEREINBART WURDE
793    source_path=""
794    line=""
795    grep "%source_path" $config_file  >  tmp_mrun
796    while read line
797    do
798       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
799       then
800          if [[ "$(echo $line | cut -d" " -f3)" = "" ]]
801          then
802             global_source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
803          fi
804       fi
805    done  <  tmp_mrun
806
807    line=""
808    found=false
809    grep  " $localhost" $config_file | grep "%source_path"  >  tmp_mrun
810    while read line
811    do
812       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
813       then
814          if [[ $found = true ]]
815          then
816             printf "\n\n  +++ more than one source path found in configuration file"
817             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
818             locat=source_path; exit
819          fi
820          source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
821          found=true
822       fi
823    done  <  tmp_mrun
824    rm  tmp_mrun
825
826    if [[ "$source_path" = "" ]]
827    then
828       if [[ "$global_source_path" != "" ]]
829       then
830          source_path=$global_source_path
831       else
832          printf "\n\n  +++ no source path found in configuration file"
833          printf "\n      for local host \"$localhost\" "
834          locat=source_path; exit
835       fi
836    fi
837    eval source_path=$source_path
838
839    if [[ ! -d $source_path ]]
840    then
841       printf "\n\n  +++ source path \"$source_path\" on local host"
842       printf "\n      \"$localhost\" does not exist"
843       locat=source_path; exit
844    fi
845
846 fi
847
848
849
850    # NOCHMAL PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
851    # (HOST KANN IN KONFIGURATIONSDATEI ANDERS FESTGELEGT WORDEN SEIN)
852    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
853    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
854    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
855 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
856 then
857    do_batch=true
858    do_remote=true
859    case  $host  in
860        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lctit|nech|neck|unics)  true;;
861        (*)  printf "\n"
862             printf "\n  +++ execution host \"$host\" not admitted for MRUN,"
863             printf "\n      or no queueing system available on execution host!"
864             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
865    esac
866 else
867    host=$localhost
868 fi
869
870
871    # PRUEFUNG EINIGER PROZESSORZAHLANGABEN BEI RECHNUNGEN AUF PARALLELRECHNERN
872 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
873 then
874
875       # PRUEFEN, OB DIE ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN PES ANGEGEBEN WURDE
876    if [[ ! -n $numprocs ]]
877    then
878       printf "\n"
879       printf "\n  +++ option \"-K parallel\" requires additional specification"
880       printf "\n      of the number of processors to be used by"
881       printf "\n      mrun-option \"-X\" or by environment-variable"
882       printf "\n      \"numprocs\" in the configuration file"
883       locat=numprocs; (( iec = 0 )); exit 
884    fi
885
886       # PRUEFEN, OB DIE PROZESSORANZAHL PRO KNOTEN ANGEGEBEN WURDE (GGF.
887       # DEFAULT-WERT SETZEN) UND OB SIE EIN GANZZAHLIGER TEILER DER
888       # GESAMTPROZESSORANZAHL IST
889    if [[ $host = nech  ||  $host = neck  ||  $host = ibmh  ||  $host = ibmb  ||  $host = ibms ]]
890    then
891       [[ "$tasks_per_node" = "" ]]  &&  tasks_per_node=6
892       (( ival = $tasks_per_node ))
893       (( pes = numprocs ))
894#       if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics+1PE) = 1 ]]
895#       then
896#          (( pes = pes - 1 ))
897#       fi
898       (( ii = pes / ival ))
899       if (( pes - ii * ival > 0 ))
900       then
901          printf "\n"
902          printf "\n  +++ tasks per node (option \"-T\") must be an integral"
903          printf "\n      divisor of the total number of processors (option \"-X\")"
904          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
905          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
906       fi
907    fi
908
909       # IBMY HAT NUR EINEN KNOTEN
910    if [[ $host = ibmy ]]
911    then
912       if [[ "$tasks_per_node" != ""  &&  "$tasks_per_node" != "$numprocs" ]]
913       then
914          printf "\n"
915          printf "\n  +++ on ibmy, tasks per node (option \"-T\") must be equal to the"
916          printf "\n      total number of processors (option \"-X\")"
917          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
918          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
919       fi
920    fi
921
922       # FALLS OPENMP PARALLELISIERUNG VERWENDET WERDEN SOLL, ANZAHL VON THREADS
923       # SETZEN UND ZAHL DER TASKS PRO KNOTEN AUF 1 SETZEN
924    if [[ $use_openmp = true ]]
925    then
926       threads_per_task=$tasks_per_node
927       tasks_per_node=1
928    fi
929    OOPT="-O $threads_per_task"
930    TOPT="-T $tasks_per_node"
931
932       # GESAMTZAHL DER KNOTEN BESTIMMEN
933    if [[ "$tasks_per_node" != "" ]]
934    then
935       (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
936    fi
937
938       # PRUEFEN, OB NODE USAGE EINEN ERLAUBTEN WERT HAT BZW. DEN DEFAULT
939       # SETZEN
940    if [[ $node_usage = default ]]
941    then
942       if [[ $host = ibms ]]
943       then
944          node_usage=shared
945       else
946          node_usage=not_shared
947       fi
948    fi
949    if [[ $node_usage != shared  &&  $node_usage != not_shared ]]
950    then
951       printf "\n"
952       printf "\n  +++ node usage (option \"-n\") is only allowed to be set"
953       printf "\n      \"shared\" or \"not_shared\""
954       locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
955    fi
956
957 fi
958
959    # PRUEFEN, OB HOSTFILE EXISTIERT
960 if [[ -n $hostfile ]]
961 then
962    if [[ ! -f $hostfile ]]
963    then
964       printf "\n"
965       printf "\n  +++ hostfile \"$hostfile\" does not exist"
966       locat=hostfile; exit
967    fi
968 fi
969
970    # PRUEFEN, OB RHOSTS DATEI EXISTIERT. GEGEBENENFALLS ANLEGEN BZW. ERWEITERN
971 if [[ $host = ibmy  &&  $do_remote = false ]]
972 then
973    if [[ ! -f $HOME/.rhosts ]]
974    then
975       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >  $HOME/.rhosts
976       printf "\n\n  *** file:"
977       printf "\n           $HOME/.rhosts"
978       printf "\n      was created\n"
979    fi
980    if [[ $(grep -c gfdl5.yonsei.ac.kr $HOME/.rhosts) = 0 ]]
981    then
982       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >>  $HOME/.rhosts
983       printf "\n\n  *** file:"
984       printf "\n           $HOME/.rhosts"
985       printf "\n      was extended by the name of the current host\n"
986    fi
987 fi
988
989    # DEFAULT-DATEITRANSFER-PROTOKOLL FESTLEGEN
990 if [[ "$filetransfer_protocol" = "" ]]
991 then
992    case  $host  in
993        (nech|neck|ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lctit)  filetransfer_protocol=scp;;
994        (*)              filetransfer_protocol=ftp;;
995    esac
996 fi
997
998    # PRUEFEN, OB ZULAESSIGES DATEITRANSFER-PROTOKOLL GEWAEHLT WURDE
999 if [[ "$filetransfer_protocol" != ftp  &&  "$filetransfer_protocol" != scp ]]
1000 then
1001    printf "\n"
1002    printf "\n  +++ illegal value \"$filetransfer_protocol\" for Option -f"
1003    printf "\n      only \"ftp\" or \"scp\" are allowed"
1004    locat=options; exit
1005 fi
1006
1007
1008    # FALLS NICHT VORGEGEBEN, DEFAULT-QUEUE AUF DER ZIELMASCHINE FESTLEGEN
1009 if [[ $queue = none ]]
1010 then
1011    case  $host  in
1012        (ibmb)       if [[ $node_usage = shared ]]
1013                     then
1014                        queue=cshare
1015                     else
1016                        queue=csolo
1017                     fi;;
1018        (ibmh)       if [[ $node_usage = shared ]]
1019                     then
1020                        queue=cshare
1021                     else
1022                        queue=csolo
1023                     fi;;
1024        (ibmy)       queue=parallel;;
1025        (lctit)      queue=default;;
1026        (nech)       queue=none;;
1027        (neck)       queue=P;;
1028        (unics)      queue=unics;;
1029    esac
1030 fi
1031
1032
1033    # EVTL. NETCDF-UNTERSTUETZUNG SETZEN
1034 case  $host  in
1035     (decalpha)   netcdf_support=true
1036                  netcdf_path=/usr/local/netcdf-3.5.1;;
1037     (ibmb|ibmh)  netcdf_support=true
1038                  netcdf_path=/aws/dataformats/netcdf-3.6.0-p1/64-32;;
1039     (ibms)       netcdf_support=true
1040                  netcdf_path=/applic/lib/NETCDF64;;
1041     (ibmy)       netcdf_support=true
1042                  netcdf_path=/usr1/users/raasch/pub/netcdf-3.6.0-p1;;
1043     (lcmuk)      netcdf_support=true
1044                  if [[ $scirocco = true ]]
1045                  then
1046                     netcdf_path=/opt/netcdf/3.6.2-beta4
1047                  else
1048                     netcdf_path=/muksoft/packages/netcdf/linux
1049                  fi;;
1050     (lctit)      netcdf_support=true
1051                  netcdf_path=/home2/usr5/mkanda/netcdf-3.6.1;;
1052     (nech)       netcdf_support=true
1053                  netcdf_path=/pool/SX-6/netcdf/netcdf-3.6.0-p1;;
1054     (neck)       netcdf_support=true
1055                  netcdf_path=/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/netcdf-3.6.0-p1;;
1056 esac
1057
1058
1059    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN DER INPUT-FILES BILDEN,
1060    # INPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1061    # ERMITTELN
1062 (( i = 0 ))
1063 while (( i < iin ))
1064 do
1065    (( i = i + 1 ))
1066    (( maxcycle = 0 ))
1067
1068       # NAMENSBILDUNG (EVTL. IST FESTER DATEINAME VORGEGEBEN)
1069    if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1070    then
1071       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1072                                                    # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1073       eval filename=${pathin[$i]}/${endin[$i]}
1074    else
1075       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1076                                                             # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1077       eval filename=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}
1078    fi
1079
1080       # PRUEFEN AUF VORHANDENSEIN
1081    if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1082          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1083          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1084    then
1085          # DATEIEN MIT EXTENSION (Z.B. NC) MUESSEN NICHT ZWINGEND VORHANDEN
1086          # SEIN, DESHALB IN SOLCHEN FAELLEN KEIN ABBRUCH. DIES IST NUR EINE
1087          # VORUEBERGEHENDE LOESUNG (OKT 05). NICHT ZWINGEND BENOETIGTE
1088          # EINGABEDATEIEN SOLLTEN EINE SPEZIELLE OPTION IN DER DATEI-
1089          # VERBINDUNGSANWEISUNG BEKOMMEN (Z.B. inopt?)
1090       if [[ "${transin[$i]}" != "locopt" ]]
1091       then
1092          printf "\n\n  +++ INPUT-file: "
1093          if [[ "${extin[$i]}" = "" ]]
1094          then
1095             printf "\n           $filename"
1096          else
1097             printf "\n           $filename.${extin[$i]}"
1098          fi
1099          printf "\n      does not exist\n"
1100          locat=input; exit
1101       else
1102          transin[$i]="unavailable"
1103       fi
1104    else
1105
1106          # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1107       ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1108       ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1109       while  read zeile
1110       do
1111          cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1112          if [[ "$cycle" = "$zeile" ]]
1113          then
1114             (( icycle = 0 ))
1115          elif [[ "$cycle" = "${extin[$i]}" ]]
1116          then
1117             (( icycle = 0 ))
1118          else
1119             (( icycle = $cycle ))
1120          fi
1121          if (( icycle > maxcycle ))
1122          then
1123             (( maxcycle = icycle ))
1124             file_to_be_used=$zeile
1125          fi
1126       done <filelist
1127       rm filelist
1128
1129          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN
1130       if (( maxcycle > 0 ))
1131       then
1132          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1133          then
1134             filename=${filename}.$maxcycle.${extin[$i]}
1135          else
1136             filename=${filename}.$maxcycle
1137          fi
1138       else
1139          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1140          then
1141             filename=${filename}.${extin[$i]}
1142          fi
1143       fi
1144       
1145          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1146          # DA SPAETER BEI RUECKSPEICHERN VOM ARCHIVSYSTEM EVTL. BENOETIGT
1147       absnamein[$i]=$filename
1148       if (( maxcycle > 0 ))
1149       then
1150          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1151          then
1152             frelin[$i]=${endin[$i]}.$maxcycle
1153          else
1154             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}.$maxcycle
1155          fi
1156       else
1157          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1158          then
1159             frelin[$i]=${endin[$i]}
1160          else
1161             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}
1162          fi
1163       fi
1164
1165    fi
1166 done
1167       
1168
1169    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN (OHNE $ ODER ~) DER OUTPUT-FILES BILDEN,
1170    # OUTPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1171    # ERMITTELN ODER, FALLS NICHT VORHANDEN, PRUEFEN, OB SIE SICH ANLEGEN LASSEN
1172    # DIESE AKTIONEN FINDEN NICHT STATT, WENN PROGRAMM AUF REMOTE-MASCHINE
1173    # RECHNET UND DATEI ANSCHLIESSEND TRANSFERIERT WERDEN SOLL!
1174 (( i = 0 ))
1175 while (( i < iout ))
1176 do
1177    (( i = i + 1 ))
1178    if [[ ! ( $fromhost != $localhost  &&  ( "${actionout[$i]}" = tr || "${actionout[$i]}" = tra || "${actionout[$i]}" = trpe ) ) ]]
1179    then
1180       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
1181       then
1182          actionout[$i]=""
1183       elif [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
1184       then
1185          actionout[$i]=a
1186       fi
1187       (( maxcycle = 0 ))
1188       eval filename=${pathout[$i]}/${fname}${endout[$i]}
1189       eval catalogname=${pathout[$i]}
1190       if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1191             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1192             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1193       then
1194     
1195             # OUTPUT-DATEI NICHT VORHANDEN. PRUEFEN, OB ANLEGEN MOEGLICH.
1196          if  cat /dev/null > $filename 
1197          then
1198             rm  $filename
1199          else
1200
1201                # PRUEFEN, OB KATALOG VORHANDEN UND EVTL. DIESEN ANLEGEN
1202             if [[ ! -d $catalogname ]]
1203             then
1204                if  mkdir -p  $catalogname
1205                then
1206                   printf "\n\n  *** directory:"
1207                   printf "\n           $catalogname"
1208                   printf "\n      was created\n"
1209                else
1210                   printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1211                   printf "\n           $filename"
1212                   printf "\n      cannot be created, because directory does not exist"
1213                   printf "\n      and cannot be created either"
1214                   printf "\n"
1215                   locat=output  ; exit
1216                fi 2>/dev/null
1217             else
1218                printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1219                printf "\n           $filename"
1220                printf "\n      cannot be created, although directory exists"
1221                printf "\n"
1222                locat=output  ; exit
1223             fi
1224          fi 2>/dev/null
1225       else
1226
1227             # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1228          ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1229          ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1230          while  read zeile
1231          do
1232             cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1233             if [[ "$cycle" = "$zeile"  ||  "$cycle" = ${extout[$i]} ]]
1234             then
1235                (( icycle = 1 ))
1236             else
1237                (( icycle = $cycle + 1 ))
1238             fi
1239             if (( icycle > maxcycle ))
1240             then
1241                (( maxcycle = icycle ))
1242             fi
1243          done <filelist
1244          rm filelist
1245       fi
1246
1247          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN UND PRUEFEN, OB SICH
1248          # DATEI AUCH WIRKLICH ANLEGEN LAESST. IM APPEND-FALL MUSS AN DEN
1249          # HOECHSTEN VORHANDENEN ZYKLUS-ANGEHAENGT WERDEN. ANLAGEPRUEFUNG
1250          # IST DANN NATUERLICH NICHT ZULAESSIG BZW. MOEGLICH
1251       if [[ "${actionout[$i]}" != a ]]
1252       then
1253          if (( maxcycle > 0 ))
1254          then
1255             filename=${filename}.$maxcycle
1256             if  cat /dev/null > $filename 
1257             then
1258                rm  $filename
1259             else
1260                printf "\n  +++ OUTPUT-file:"
1261                printf "\n           $filename"
1262                printf "\n      cannot be created"
1263                locat=output  ; exit
1264             fi
1265          fi
1266       else
1267          (( maxcycle = maxcycle - 1 ))
1268          if (( maxcycle > 0 ))
1269          then
1270             filename=${filename}.$maxcycle
1271          fi
1272       fi
1273       
1274          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1275          # DA SPAETER BEI ABLAGE AUF ARCHIVSYSTEM BZW. FUER
1276          # DATEI OUTPUT_FILE_CONNECTIONS EVTL. BENOETIGT
1277       pathout[$i]=$filename
1278       if (( maxcycle > 0 ))
1279       then
1280          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}.$maxcycle
1281       else
1282          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}
1283       fi
1284
1285    fi
1286 done
1287
1288
1289     # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM ODER NUR EIN AUSFUEHRBARES
1290     # PROGRAMM VEREINBART WURDE (IN DIESEM FALL BRAUCHT IM WEITEREN NICHT
1291     # UEBERSETZT ZU WERDEN)
1292 if [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" = "" ]]
1293 then
1294    printf "\n  +++ neither main program nor executable defined"
1295    locat=source; exit
1296 elif [[ "$mainprog" != ""  &&  "$executable" != "" ]]
1297 then
1298    printf "\n  +++ main program as well as executable defined"
1299    locat=source; exit
1300 elif [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" != "" ]]
1301 then
1302    do_compile=false
1303 fi
1304
1305
1306    # ALLE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE ZUSAMMENSAMMELN
1307    # BEI BATCH-JOBS IST DIES NICHT NOETIG, WEIL DIE PROGRAMMTEILE BEREITS DURCH
1308    # DEN MRUN-AUFRUF ERMITTELT SIND, DER DEN BATCH-JOB GENERIERT HAT, UND
1309    # IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_... ABGELEGT SIND
1310 if [[ $do_compile = true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1311 then
1312
1313    [[ "$source_list" = LM ]]  &&  source_list=LOCALLY_MODIFIED
1314    [[ "$source_list" = WP ]]  &&  source_list=WRITE_PERMIT
1315
1316    if [[ $restart_run != true ]]
1317    then
1318       rm -rf  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1319       mkdir   SOURCES_FOR_RUN_$fname
1320    fi
1321
1322
1323       # EVTL. ZU UEBERSETZENDE PROGRAMMTEILE DADURCH BESTIMMEN, DASS GEPRUEFT
1324       # WIRD, WELCHE DATEIEN WRITE-PERMIT BESITZEN (DATEIEN SOLLTEN DESHALB
1325       # UNTER RCS-KONTROLLE STEHEN). MIT DER VARIABLEN EXCLUDE KOENNEN
1326       # BESTIMMTE DATEIEN GRUNDSAETZLICH VON DER UEBERSETZUNG AUSGESCHLOSSEN
1327       # WERDEN. DIES IST NUR BEI MANUELLEM START VON MRUN DURCH DEN BENUTZER
1328       # MOEGLICH, DA BEI AUTOMATISCHEN RESTARTS TEST DURCH DIE TATSAECHLICH
1329       # ZU UBERSETZENDEN DATEIEN ERSETZT IST.
1330       # ALLE ERMITTELTEN DATEIEN WERDEN IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_...
1331       # GESAMMELT
1332    if [[ "$source_list" = WRITE_PERMIT ]]
1333    then
1334
1335       source_list=""
1336       cd  $source_path
1337
1338
1339          # ALLE MOEGLICHEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1340       Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1341       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Names"
1342       Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1343       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1344       Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1345       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1346       Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1347       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1348       Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1349       [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1350
1351
1352          # DATEIEN MIT WRITE-PERMIT NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1353       for  dateiname  in  $Filenames
1354       do
1355          if [[ -w $dateiname ]]
1356          then
1357             if [[ "$exclude" = ""  ||  $(echo $exclude | grep -c $dateiname) = 0 ]]
1358             then
1359                cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1360                source_list=$source_list"$dateiname "
1361             fi
1362          fi
1363       done
1364
1365       cd -  > /dev/null
1366
1367
1368    elif [[ "$source_list" = LOCALLY_MODIFIED ]]
1369    then
1370
1371          # MODIFIZIERTE DATEIEN DER SVN-ARBEITSKOPIE BESTIMMEN
1372       source_list=""
1373       cd  $source_path
1374
1375
1376          # PRUEFEN, OB VERZEICHNIS UEBERHAUPT UNTER SVN-KONTROLLE STEHT
1377       if [[ ! -d .svn ]]
1378       then
1379          printf "\n\n  +++ source directory"
1380          printf "\n         \"$source_path\" "
1381          printf "\n         is not under control of \"subversion\"."
1382          printf "\n         Please do not use mrun-option \"-s LOCALLY MODIFIED\"\n"
1383       fi
1384
1385
1386          # ALLE MODIFIZIERTEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1387       Filenames=""
1388       svn status  |  while  read line
1389       do
1390          firstc=`echo $line | cut -c1`
1391          if [[ $firstc = M  ||  $firstc = "?" ]]
1392          then
1393             Name=`echo "$line" | cut -c8-`
1394             extension=`echo $Name | cut -d. -f2`
1395             if [[ "$extension" = f90 || "$extension" = F90 || "$extension" = f || "$extension" = F || "$extension" = c ]]
1396             then
1397                Filenames="$Filenames "$Name
1398             fi
1399          fi
1400       done
1401
1402
1403          # DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1404       for  dateiname  in  $Filenames
1405       do
1406          cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1407          source_list=$source_list"$dateiname "
1408       done
1409
1410       cd -  > /dev/null
1411
1412
1413       # MITTELS OPTION -s ANGEGEBENE DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1414       # BEI AUTOMATISCHEN FORTSETZUNGSLAEUFEN SIND DORT SCHON ALLE DATEIEN
1415       # VORHANDEN
1416    elif [[ "$source_list" != ""  &&  $restart_run != true ]]
1417    then
1418
1419       cd  $source_path
1420
1421       for  filename  in  $source_list
1422       do
1423
1424             # QUELLTEXT-DATEI DARF KEINE PFADE BEINHALTEN
1425          if [[ $(print $filename | grep -c "/") != 0 ]]
1426          then
1427             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1428             printf "\n      must not contain (\"/\") "
1429             locat=source; exit
1430          fi
1431
1432          if [[ ! -f $filename ]]
1433          then
1434             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1435             printf "\n      does not exist"
1436             locat=source; exit
1437          else
1438             cp  $filename  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1439          fi
1440
1441       done
1442
1443       cd -  > /dev/null
1444
1445    fi
1446
1447
1448       # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM VORHANDEN UND ES EVTL. IN DER
1449       # LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE MIT ENTHALTEN IST (WENN
1450       # NICHT, WIRD ES DIESER LISTE HINZUGEFUEGT)
1451    if [[ $restart_run != true ]]
1452    then
1453
1454       if [[ ! -f "$source_path/$mainprog" ]]
1455       then
1456          printf "\n\n  +++ main program:  $mainprog"
1457          printf "\n      does not exist in source directory"
1458          printf "\n      \"$source_path\"\n"
1459          locat=source; exit
1460       else
1461          if [[ $(echo $source_list | grep -c $mainprog) = 0 ]]
1462          then
1463             cp  $source_path/$mainprog  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1464             source_list=${mainprog}" $source_list"
1465          fi
1466       fi
1467    fi
1468
1469
1470       # DATEIEN AUS ZUSAETZLICHEM QUELLVERZEICHNIS HINZUFUEGEN
1471    if [[ $restart_run != true  &&  "$add_source_path" != "" ]]
1472    then
1473
1474          # GIBT ES DAS VERZEICHNIS UEBERHAUPT?
1475       if [[ ! -d $add_source_path ]]
1476       then
1477          printf "\n\n  +++ WARNING: additional source code directory"
1478          printf "\n      \"$add_source_path\" "
1479          printf "\n      does not exist or is not a directory."
1480          printf "\n      No source code will be used from this directory!\n"
1481          add_source_path=""
1482          sleep 3
1483       else
1484
1485          cd $add_source_path
1486
1487          Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1488          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$Names"
1489          Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1490          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1491          Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1492          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1493          Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1494          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1495          Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1496          [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1497
1498          cd -  > /dev/null
1499          cd  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1500
1501          for  dateiname  in  $AddFilenames
1502          do
1503             if [[ -f $dateiname ]]
1504             then
1505                printf "\n  +++ source code file \"$dateiname\" found in additional"
1506                printf "\n      source code directory \"$add_source_path\" "
1507                printf "\n      as well as in directory \"$source_path\"."
1508                locat=source; exit
1509             fi
1510
1511             cp  $add_source_path/$dateiname  .
1512             source_list="$source_list $dateiname"
1513
1514                # Default User-Interface von der Liste entfernen, falls Datei
1515                # ein User-Interface enthaelt
1516             if [[ $( cat $dateiname | grep -c "END SUBROUTINE user_parin" ) != 0 ]]
1517             then
1518                if [[ $dateiname != user_interface.f90  &&  -f user_interface.f90 ]]
1519                then
1520                   rm -rf  user_interface.f90
1521                   source_list=`echo $source_list | sed -e 's/user_interface.f90//'`
1522                   printf "\n\n  *** default \"user_interface.f90\" removed from the files to be translated"
1523                   printf "\n      since a user-interface is found in file"
1524                   printf "\n      \"$add_source_path/$dateiname\" \n"
1525                   sleep 3
1526                else
1527                   printf "\n\n  *** user-interface file \"$dateiname\" "
1528                   printf "\n      added to the files to be translated \n"
1529                   sleep 3
1530                fi
1531             fi
1532          done
1533
1534          cd -  > /dev/null
1535       fi
1536    fi
1537
1538
1539       # ALLE UNTERPROGRAMME, DIE ZU VEREINBARTEN SOFTWAREPAKETEN GEHOEREN,
1540       # DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN HINZUFUEGEN
1541    if [[ $restart_run != true  &&  -n $package_list ]]
1542    then
1543
1544       cd  $source_path
1545
1546       for  package  in  $package_list
1547       do
1548
1549          [[ $package = "dvrp_graphics+1PE" ]]  &&  package=dvrp_graphics
1550
1551             # ERMITTELE ALLE DATEIEN, DIE ZUM PAKET GEHOEREN
1552             # FEHLERMELDUNGEN WERDEN ABGEFANGEN, DA * AUCH VERZEICHNISSNAMEN
1553             # LIEFERT
1554          package_source_list=`grep "defined( __$package " * 2>/dev/null | cut -f1 -d:`
1555
1556
1557             # FUEGE DIESE DATEIEN DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN
1558             # HINZU, FALLS SIE NOCH NICHT DAZUGEHOEREN
1559          for  source_list_name  in  $package_source_list
1560          do
1561             if [[ $(echo $source_list | grep -c $source_list_name) = 0 ]]
1562             then
1563
1564                    # NUR DATEIEN MIT GUELTIGEN ENDUNGEN VERWENDEN
1565                ending=`echo $source_list_name | cut -f2 -d.`
1566                if [[ "$ending" = f90  ||  "$ending" = F90  ||  "$ending" = f  ||  "$ending" = F  ||  "$ending" = c ]]
1567                then
1568                   cp  $source_list_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1569                   source_list="$source_list $source_list_name"
1570                fi
1571             fi
1572          done
1573       done
1574
1575       cd -  > /dev/null
1576    fi
1577
1578
1579       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1580       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1581    if [[ "$use_makefile" = true  &&  "$restart_run" != true ]]
1582    then
1583       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1584       if [[ ! -f $makefile ]]
1585       then
1586          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1587          printf "\n      provide this file or set \"use_makefile=false\" in configuration file\n"
1588          locat=make; exit
1589       else
1590          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1591       fi
1592    fi
1593
1594 fi  # do_compile=true
1595
1596
1597    # FALLS PROGRAMMTEILE UEBERSETZT WERDEN SOLLEN, FOLGEN JETZT EINIGE
1598    # UEBERPRUEFUNGEN UND DAS SETZEN DER PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN
1599 if [[ $do_compile = true ]]
1600 then
1601
1602       # PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN ZUM SELEKTIVEN AUSWAEHLEN VON CODETEILEN
1603       # ZUSAMMENSETZEN
1604    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1605    then
1606       PPOPTS=-Dibm=ibm
1607    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = nec ]]
1608    then
1609       PPOPTS=-Dnec
1610    else
1611       PPOPTS=-D$localhost
1612    fi
1613    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1614    then
1615       [[ -n $cond1 ]]               &&  PPOPTS="$PPOPTS -D$cond1=$cond1"
1616       [[ -n $cond2 ]]               &&  PPOPTS="$PPOPTS -D$cond2=$cond2"
1617       if [[ $netcdf_support = true ]]
1618       then
1619          PPOPTS="$PPOPTS -Dnetcdf=netcdf"
1620          [[ $localhost != ibms ]]      &&  PPOPTS="$PPOPTS -Dnetcdf_64bit=netcdf_64bit"
1621       fi
1622       if [[ $localhost = ibmy ]]
1623       then
1624          PPOPTS="$PPOPTS -Dibmy_special=ibmy_special"
1625       fi
1626    else
1627       [[ -n $cond1 ]]               &&  PPOPTS="$PPOPTS -D$cond1"
1628       [[ -n $cond2 ]]               &&  PPOPTS="$PPOPTS -D$cond2"
1629       if [[ $netcdf_support = true ]]
1630       then
1631          PPOPTS="$PPOPTS -Dnetcdf"
1632          [[ $localhost != decalpha  &&  $localhost != lctit ]]  &&  PPOPTS="$PPOPTS -Dnetcdf_64bit"
1633       fi
1634    fi
1635    if [[ -n $package_list ]]
1636    then
1637       for  package  in  $package_list
1638       do
1639          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1640          then
1641             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1642             then
1643                PPOPTS="$PPOPTS -D$package=$package"
1644             else
1645                PPOPTS="$PPOPTS -Ddvrp_graphics"
1646                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1647             fi
1648          else
1649             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1650             then
1651                PPOPTS="$PPOPTS -D$package"
1652             else
1653                PPOPTS="$PPOPTS -Ddvrp_graphics"
1654                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1655             fi
1656          fi
1657       done
1658    fi
1659    if [[ -n $cpp_opts ]]
1660    then
1661       for  popts  in  $cpp_opts
1662       do
1663          PPOPTS="$PPOPTS -D$popts"
1664       done
1665    fi
1666
1667       # -D ARGUMENTEN EINEN DOPPELTEN UNTERSTRICH VORANSTELLEN
1668    PPOPTS=`echo " $PPOPTS" | sed 's/ -D/ -D__/g'`
1669
1670       # OPTION ZUM EINSCHALTEN DES PRAEPROZESSORS HINZUFUEGEN
1671    if [[ $host = decalpha ]]
1672    then
1673       C_PPOPTS="-cpp  -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION -DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION $PPOPTS"
1674    elif [[ $(echo $host | cut -c1-3) = ibm ]]
1675    then
1676          # blanks in PPOPTS muessen durch "," ersetzt werden
1677       PPOPTS=`echo $PPOPTS | sed 's/ -/,-/g'`
1678       C_PPOPTS="-qsuffix=cpp=f90 -WF,-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION,$PPOPTS"
1679    elif [[ $host = lcmuk ]]
1680    then
1681       C_PPOPTS="$PPOPTS -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION -DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION"
1682    elif [[ $host = lctit ]]
1683    then
1684       C_PPOPTS="$PPOPTS -Mpreprocess -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION -DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION"
1685    elif [[ $(echo $host | cut -c1-3) = nec ]]
1686    then
1687       C_PPOPTS="-Ep -DMPI_REAL=MPI_REAL8 -DMPI_2REAL=MPI_2REAL8 -DSCFFT=dzfft -DCSFFT=zdfft $PPOPTS"
1688    else
1689       C_PPOPTS="$PPOPTS"
1690    fi
1691
1692 else
1693
1694
1695       # BEI LOKALEN RECHNUNGEN PRUEFEN, OB EXECUTABLE VORHANDEN
1696    if [[ $do_remote = false ]]
1697    then
1698       if [[ ! -f $executable ]]
1699       then
1700          printf "\n  +++ executable file:  $executable"
1701          printf "\n      does not exist"
1702          locat=executable; exit
1703       fi
1704    fi
1705 fi
1706
1707
1708    # JOBMODUS FESTSTELLEN
1709 if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH  &&  $localhost != lctit  ||  "$QUEUE" != interactive  &&  $localhost = lctit ]]
1710 then
1711    jobmo=BATCH
1712 else
1713    jobmo=INTERACTIVE
1714 fi
1715
1716
1717    # HOSTSPEZIFISCHE DEFAULT-COMPILER SETZEN, FALLS NICHT BEREITS
1718    # DURCH BENUTZER ANDERWEITIG VEREINBART
1719 if [[ "$compiler_name" = "" ]]
1720 then
1721    case  $localhost  in
1722        (unics)                                 compiler_name=f77;;
1723        (lcmuk)                                 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
1724                                                then
1725                                                   compiler_name=mpif90
1726                                                else
1727                                                   compiler_name=ifc
1728                                                fi;;
1729        (lctit)                                 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
1730                                                then
1731                                                   compiler_name=mpif90
1732                                                   echo ">>> compiler=mpif90"
1733                                                else
1734                                                   compiler_name=pgf95
1735                                                   echo ">>> compiler=pgf95"
1736                                                fi;;
1737        (nech)                                  compiler_name=sxmpif90;;
1738        (decalpha)                              compiler_name=f95;;
1739        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy)               compiler_name=mpxlf95_r;;
1740        (*)      printf "\n  +++ unknown host name: $localhost \n";
1741                 locat=localhost; exit;;
1742    esac
1743 fi
1744
1745
1746    # COMPILER AUF NECK UEBERSCHREIBEN
1747 [[ $localhost = neck ]]  &&  compiler_name=mpif90
1748
1749
1750
1751    # PRAEPROZESSOR-PFAD BESTIMMEN
1752 case  $localhost  in
1753     (decalpha|ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|unics)  praeproc=cpp;;
1754 esac
1755
1756
1757    # TEMPORAEREN KATALOGNAMEN BESTIMMEN
1758 kennung=$RANDOM
1759 if [[ "$tmp_user_catalog" = "" ]]
1760 then
1761    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1762    then
1763       tmp_user_catalog=$TMPDIR
1764    elif [[ $localhost = nech ]]
1765    then
1766       tmp_user_catalog=$WRKSHR
1767    else
1768       tmp_user_catalog=/tmp
1769    fi
1770 fi
1771 TEMPDIR=$tmp_user_catalog/${usern}.$kennung
1772
1773
1774    # KATALOGNAMEN FUER ZWISCHENSPEICHERUNG VON FORTSETZUNGSLAUFDATEIEN
1775    # BESTIMMEN
1776 if [[ "$tmp_data_catalog" = "" ]]
1777 then
1778    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1779    then
1780       tmp_data_catalog=$WORK/mrun_restart_data
1781    elif [[ $localhost = nech ]]
1782    then
1783       tmp_data_catalog=$WRKSHR/mrun_restart_data
1784    else
1785       tmp_data_catalog=/tmp/mrun_restart_data
1786    fi
1787 fi
1788
1789
1790    # EVENTUELL BEI LOKALEN RECHNUNGEN $-ZEICHEN IN ENVIRONMENT-VARIABLEN
1791    # ERSETZEN
1792 if [[ $do_remote = false  &&  $do_compile = true ]]
1793 then
1794    eval  fopts=\"$fopts\"
1795    eval  lopts=\"$lopts\"
1796 fi
1797
1798
1799
1800    # COMPILE- UND LINK-OPTIONEN BESTIMMEN
1801 FOPTS="$fopts"
1802 LOPTS="$lopts"
1803 ROPTS="$ropts"
1804 if [[ ( $(echo $host | cut -c1-3) = nec  ||  $(echo $host | cut -c1-3) = ibm  ||  $host = lctit )  &&  -n $numprocs ]]
1805 then
1806    XOPT="-X $numprocs"
1807 fi
1808
1809
1810    # BEI VERWENDUNG VON DVRP-SOFTWARE MUSS ENTSPECHENDE GRAFIK-BIBLIOTHEK
1811    # MIT EINGEBUNDEN WERDEN
1812 if [[ -n $package_list ]]
1813 then
1814    if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
1815    then
1816
1817          # DVRP-GRAFIK GIBT ES NUR AUF DER IBM AM HLRN, AUF NECH/NECK UND
1818          # DEM NOTEBOOK SCIROCCO
1819       if [[ $host != ibmh  &&  $host != nech  &&  $host != neck  &&  $host != lcmuk  &&  "$local_compile" != true ]]
1820       then
1821          printf "\n"
1822          printf "\n  +++ option -p with package \"dvrp_graphics\" only allowed on nech and ibmh"
1823          locat=parameter; exit
1824       fi
1825       if [[ $host = ibmh ]]
1826       then
1827          if [[ $cond1 = debug  ||  $cond2 = debug ]]
1828          then
1829             FOPTS="-I/home/h/hzazchmi/lib/debug  $FOPTS"
1830             LOPTS="$LOPTS -L/home/h/hzazchmi/lib/debug -lDVRP2 -lftp"
1831          else
1832             FOPTS="-I/home/h/nikevita/lib_stable/optimize  $FOPTS"
1833             LOPTS="$LOPTS -L/home/h/nikevita/lib_stable/optimize -lDVRP2 -lftp"
1834          fi
1835       elif [[ $host = nech ]]
1836       then
1837          FOPTS="-I/import/ds9b/ipf2/b/b323014/lib/optimize  $FOPTS"
1838          LOPTS="$LOPTS -L/import/ds9b/ipf2/b/b323014/lib/optimize -lDVRP2 -lftp"
1839       elif [[ $host = neck ]]
1840       then
1841          FOPTS="-I/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/dvrp  $FOPTS"
1842          LOPTS="$LOPTS -L/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/dvrp -lDVRP2 -lftp"
1843       elif [[ $host = lcmuk ]]
1844       then
1845          FOPTS="-I/usr/local/lib/dvrp/optimize  $FOPTS"
1846          LOPTS="$LOPTS -L/usr/local/lib/dvrp/optimize -lDVRP2 -lftp"
1847       fi
1848    fi
1849 fi
1850
1851
1852    # EVTL. EINBINDEN DER NETCDF-BIBLIOTHEK
1853 if [[ $netcdf_support = true ]]
1854 then
1855    case  $host  in
1856       (decalpha)         FOPTS="-I${netcdf_path}/include  $FOPTS"
1857                          LOPTS="$LOPTS -L${netcdf_path}/lib -lnetcdf";;
1858       (ibmb|ibmh)        FOPTS="-I ${netcdf_path}/include-64  $FOPTS"
1859                          LOPTS="$LOPTS -L${netcdf_path}/lib -lnetcdf";;
1860       (ibms)             FOPTS="-I /applic/netcdf64/src/f90  $FOPTS"
1861                          LOPTS="$LOPTS -L${netcdf_path} -lnetcdf";;
1862       (ibmy)             FOPTS="-I ${netcdf_path}/include  $FOPTS"
1863                          LOPTS="$LOPTS -L${netcdf_path}/lib -lnetcdf";;
1864       (lcmuk|nech|neck)  FOPTS="-I ${netcdf_path}/include  $FOPTS"
1865                          LOPTS="$LOPTS -L${netcdf_path}/lib -lnetcdf";;
1866       (lctit)            FOPTS="-I ${netcdf_path}/src/f90  $FOPTS"
1867                          LOPTS="$LOPTS -L${netcdf_path}/src/libsrc -lnetcdf";;
1868
1869    esac
1870 fi
1871
1872    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT. (CPUMAX WIRD ALS ENV-VARIABLE VOM HAUTPRO-
1873    # GRAMM BENOETIGT
1874 done=false
1875 while [[ $done = false ]]
1876 do
1877    cputime=$cpumax
1878    if (( $cputime == 0 ))
1879    then
1880       printf "\n  +++ cpu-time is undefined"
1881       printf "\n  >>> Please type CPU-time in seconds as INTEGER:"
1882       printf "\n  >>> "
1883       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
1884    else
1885       done=true
1886    fi
1887    cpumax=$cputime
1888 done
1889
1890 (( minuten = cputime / 60 ))
1891 (( sekunden = cputime - minuten * 60 ))
1892
1893
1894    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
1895 if [[ $do_batch = true ]]
1896 then
1897    done=false
1898    while [[ $done = false ]]
1899    do
1900       if (( memory == 0 ))
1901       then
1902          printf "\n  +++ memory demand is undefined"
1903          printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
1904          printf "\n  >>> "
1905          read  memory  1>/dev/null  2>&1
1906       else
1907          done=true
1908       fi
1909    done
1910 fi
1911
1912
1913    # PRUEFEN, OB FUER REMOTE-RECHNUNGEN EIN BENUTZERNAME ANGEGEBEN WURDE
1914 if [[ $do_remote = true  &&  -z $remote_username ]]
1915 then
1916    while [[ -z $remote_username ]]
1917    do
1918       printf "\n  +++ username on remote host \"$host\" is undefined"
1919       printf "\n  >>> Please type username:"
1920       printf "\n  >>> "
1921       read  remote_username
1922    done
1923    mc="$mc -u$remote_username"
1924 fi
1925
1926###########################################################################
1927# HEADER-AUSGABE
1928###########################################################################
1929
1930
1931 calltime=$(date)
1932 printf "\n"
1933# [[ $silent = false ]]  &&  clear
1934 printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
1935 printf "| $version$calltime | \n"
1936 printf "|                                                              | \n"
1937 spalte1="called on:"; spalte2=$localhost_realname
1938 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1939 if [[ $local_compile = false ]]
1940 then
1941    if [[ $do_remote = true ]]
1942    then
1943       spalte1="execution on:"; spalte2="$host (username: $remote_username)"
1944    else
1945       spalte1="execution on:"; spalte2="$host ($localhost_realname)"
1946    fi
1947 else
1948    spalte1="compiling test only!"; spalte2=""
1949 fi
1950 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1951 if [[ -n $numprocs ]]
1952 then
1953    spalte1="number of PEs:"; spalte2=$numprocs
1954    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1955 fi
1956 if [[ -n $tasks_per_node ]]
1957 then
1958    spalte1="tasks per node:"; spalte2="$tasks_per_node (number of nodes: $nodes)"
1959    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1960 fi
1961 if [[ $threads_per_task != 1 ]]
1962 then
1963    spalte1="threads per task:"; spalte2="$threads_per_task"
1964    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1965 fi
1966 printf "|                                                              | \n"
1967 if [[ $do_compile = true ]]
1968 then
1969    spalte1=cpp-directives:; spalte2=$C_PPOPTS
1970    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1971    zeile=$(echo "$C_PPOPTS" | cut -c41-)
1972    while [[ "$zeile" != "" ]]
1973    do
1974       spalte1=""
1975       spalte2=$zeile
1976       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1977       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1978    done
1979
1980    spalte1=compiler-options:; spalte2="$FOPTS $MODULE_OPTIONS"
1981    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1982    zeile=$(echo "$FOPTS $MODULE_OPTIONS" | cut -c41-)
1983    while [[ "$zeile" != "" ]]
1984    do
1985       spalte1=""
1986       spalte2=$zeile
1987       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1988       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1989    done
1990
1991    spalte1=linker-options:; spalte2=$LOPTS
1992    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1993    zeile=$(echo "$LOPTS" | cut -c41-)
1994    while [[ "$zeile" != "" ]]
1995    do
1996       spalte1=""
1997       spalte2=$zeile
1998       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1999       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2000    done
2001
2002    spalte1="main program":; spalte2=$mainprog
2003    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2004    if [[ "$use_makefile" = true ]]
2005    then
2006       spalte1="using \"make\" for com"; spalte2="piling and linking"
2007       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2008    fi
2009#    if [[ $vtk_graphics = true ]]
2010#    then
2011#       spalte1=""; spalte2="wird in C++ - Programm eingebunden (vtk)"
2012#       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2013#    fi
2014 else
2015    spalte1=executable:; spalte2=$executable
2016    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2017 fi
2018 printf "|                                                              | \n"
2019 spalte1="base name of files":; spalte2=$fname
2020 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2021 if [[ $fname != $afname ]]
2022 then
2023    spalte1="base name of input files":; spalte2=$afname
2024    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2025 fi
2026 spalte1="INPUT control list":; spalte2=$input_list
2027 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2028 spalte1="OUTPUT control list":; spalte2=$output_list
2029 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2030
2031 if [[ $do_batch = true  ||  "$LOADLBATCH" = yes ]]
2032 then
2033    spalte1="memory demand / PE":; spalte2="$memory MB"
2034    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2035    spalte1=CPU-time:; spalte2="$minuten:$sekunden"
2036    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2037 fi
2038
2039 if [[ $do_compile = true ]]
2040 then
2041    printf "|                                                              | \n"
2042    printf "| Files to be compiled:                                        | \n"
2043    zeile=$source_list
2044    while [[ "$zeile" != "" ]]
2045    do
2046       spalte3=$zeile
2047       printf "| $spalte3 | \n"
2048       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c61-)
2049    done
2050 fi
2051 printf "#--------------------------------------------------------------#"
2052
2053
2054
2055    # BEDINGTE AUSGABE DER DATEIVERBINDUNGEN
2056 if [[ $do_trace = true ]]
2057 then
2058    (( i = 0 ))
2059    while (( i < iin ))
2060    do
2061       (( i = i + 1 ))
2062       if (( i == 1 ))
2063       then
2064          printf "\n\n >>> INPUT-file assignments:\n"
2065       fi
2066       printf "\n     ${localin[$i]} :  ${absnamein[$i]}"
2067    done
2068    (( i = 0 ))
2069    while (( i < iout ))
2070    do
2071       (( i = i + 1 ))
2072       if (( i == 1 ))
2073       then
2074          printf "\n\n >>> OUTPUT-file assignments:\n"
2075       fi
2076       printf "\n     ${localout[$i]} :  ${pathout[$i]}"
2077    done
2078    (( i = 0 ))
2079    while (( i < iic ))
2080    do
2081       (( i = i + 1 ))
2082       if (( i == 1 ))
2083       then
2084          printf "\n\n >>> INPUT-commands:\n"
2085       fi
2086       printf "\n     ${in_command[$i]}" 
2087    done
2088    (( i = 0 ))
2089    while (( i < ioc ))
2090    do
2091       (( i = i + 1 ))
2092       if (( i == 1 ))
2093       then
2094          printf "\n\n >>> OUTPUT-commands:\n"
2095       fi
2096       printf "\n     ${out_command[$i]}" 
2097    done
2098 fi
2099
2100
2101    # ABFRAGEN BEI AUFRUF AUF LOKALER MASCHINE
2102 if [[ $remotecall = false  &&  $silent = false  &&  $jobmo != BATCH ]]
2103 then
2104    antwort=dummy
2105    printf "\n\n"
2106    while [[ "$antwort" != y  &&  "$antwort" != Y  &&  "$antwort" != n  &&  "$antwort" != N ]]
2107    do
2108       printf " >>> everything o.k. (y/n) ?  "
2109       read  antwort
2110    done
2111    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
2112    then
2113       locat=user_abort; (( iec = 0 )); exit
2114    fi
2115    if [[ $do_batch = true ]]
2116    then
2117       printf " >>> batch-job will be created and submitted"
2118    else
2119       if [[ $local_compile = false ]]
2120       then
2121          printf " >>> MRUN will now continue to execute on this machine"
2122       else
2123          printf " >>> a test compilation will now be carried out on this machine"
2124       fi
2125    fi
2126 fi
2127 
2128
2129
2130
2131     # FALLS AUF DIESER MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
2132     # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
2133 if [[ $do_batch = false ]]
2134 then
2135
2136
2137       # TEMPORAEREN KATALOG ERZEUGEN
2138    mkdir -p  $TEMPDIR
2139    chmod  go+rx  $TEMPDIR
2140    tmpcreate=true
2141
2142
2143       # SAEMTLICHE QUELLTEXT-DATEIEN BZW. AUSFUEHRBARES PROGRAMM IN
2144       # TEMPORAERES VERZEICHNIS KOPIEREN
2145    if [[ $do_compile = true ]]
2146    then
2147
2148          # ON NEC, COMPILATION IS DONE ON HOST CROSS VIA CROSS COMPILING
2149          # CREATE A TEMPORARY DIRECTORY ON THAT MACHINE (HOME MOUNTED VIA NFS)
2150       if [[ $localhost = nech ]]
2151       then
2152          TEMPDIR_COMPILE=$HOME/work/${usern}.$kennung
2153          if  mkdir -p  $TEMPDIR_COMPILE
2154          then
2155             printf "\n  *** \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2156             printf "\n      is generated as temporary directory for cross compiling\n"
2157          else
2158             printf "\n  +++ creating directory \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2159             printf "\n      needed for cross compilation failed"
2160             locat=compile
2161             exit
2162          fi
2163       else
2164          TEMPDIR_COMPILE=$TEMPDIR
2165       fi
2166
2167       if [[ "$use_makefile" = true ]]
2168       then
2169
2170             # PFADNAMEN FUER DAS MAKE-DEPOSITORY ERMITTELN
2171          line=""
2172          grep "%depository_path" $config_file  |  while read line
2173          do
2174             if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2175             then
2176                if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f3)" = "" ]]
2177                then
2178                   global_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2179                fi
2180             fi
2181          done
2182
2183          line=""
2184          grep  " $localhost" $config_file | grep "%depository_path"  |  while read line
2185          do
2186             if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2187             then
2188                local_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2189             fi
2190          done
2191
2192          if [[ "$local_depository_path" = "" ]]
2193          then
2194             if [[ "$global_depository_path" != "" ]]
2195             then
2196                local_depository_path=$global_depository_path
2197             else
2198                printf "\n\n  +++ no depository path found in configuration file"
2199                printf "\n      for local host \"$localhost\" "
2200                printf "\n      please set \"\%depository_path\" in configuration file\n"
2201                locat=config_file; exit
2202             fi
2203          fi
2204          eval local_depository_path=$local_depository_path
2205
2206          basename=`print $mainprog | cut -f1 -d"."`
2207          eval make_depository=${local_depository_path}/${basename}_current_version.tar
2208          if [[ ! -f $make_depository ]]
2209          then
2210             printf "\n"
2211             printf "\n  *** WARNING: make depository \"$make_depository\" not found"
2212             printf "\n               \"make\" will fail, if the Makefile or other source files are missing\n"
2213          else
2214             cp  $make_depository  $TEMPDIR_COMPILE
2215             cd  $TEMPDIR_COMPILE
2216             tar -xf  $make_depository  >  /dev/null  2>&1
2217             cd -  > /dev/null
2218          fi
2219
2220          cp  SOURCES_FOR_RUN_$fname/*  $TEMPDIR_COMPILE
2221
2222             # FALLS USER-INTERFACE VORHANDEN UND AUF DATEI MIT ANDEREM NAMEN
2223             # ALS user_interface.f90 LIEGT, DIESEN GEAENDERTEN NAMEN INS
2224             # MAKEFILE EINTRAGEN
2225          cd  $TEMPDIR_COMPILE
2226          interface_file=`grep -l "END SUBROUTINE user_parin" $source_list`
2227          if [[ "$interface_file" != "" ]]
2228          then
2229             interface_file=`echo $interface_file | cut -d"." -f1`
2230             mv  Makefile  Makefile_old
2231             sed "s/user_interface/$interface_file/g"  Makefile_old  >  Makefile
2232          fi
2233          cd -  > /dev/null
2234       fi
2235    else
2236       cp  $executable   ${TEMPDIR}/a.out
2237    fi
2238
2239
2240       # WECHSEL IN TEMPORAEREN KATALOG
2241    cd $TEMPDIR
2242    printf "\n  *** changed to temporary directory: $TEMPDIR"
2243
2244
2245       # OUTPUT-DATEI-VERBINDUNGEN AUF TEMPORAERER DATEI ABLEGEN
2246       # DIESE DATEI KANN VON SPAETER AUFZURUFENDEN BENUTZERPROZEDUREN GELESEN
2247       # WERDEN, UM ZU LOKALEN DATEINAMEN GEHOERENDE PERMANENTE NAMEN ZU
2248       # ERMITTELN
2249    (( i = 0 ))
2250    while (( i < iout ))
2251    do
2252       (( i = i + 1 ))
2253       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = tra  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
2254       then
2255          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2256       else
2257          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${frelout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2258       fi
2259    done
2260
2261
2262       # EVTL. UEBERSETZUNGSAKTIONEN STARTEN
2263    if [[ $do_compile = true ]]
2264    then
2265
2266
2267          # COMPILING WITH MAKE (ON NEC COMPILER IS CALLED ON HOST CROSS)
2268       if [[ "$use_makefile" = true ]]
2269       then
2270          printf "\n\n\n  *** compilation starts \n$striche\n"
2271          printf "  *** compilation with make using following options:\n"
2272          printf "      compilername:             $compiler_name\n"
2273          printf "      options:                  $FOPTS\n"
2274          printf "      preprocessor-directives:  $C_PPOPTS \n"
2275          printf "      linker-options:           $LOPTS \n"
2276          printf "      source code files:        $source_list \n"
2277
2278          if [[ $localhost = nech ]]
2279          then
2280             ssh  136.172.44.192 -l $usern ". /SX/opt/etc/initsx.sh; cd \$HOME/work/${usern}.$kennung; sxmake -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$C_PPOPTS\"  F90FLAGS=\"$FOPTS\"  LDFLAGS=\"$LOPTS\" "
2281             cp  $TEMPDIR_COMPILE/a.out  .
2282             [[ $? != 0 ]]  &&  compile_error=true
2283             rm -rf  $TEMPDIR_COMPILE
2284          else
2285             make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT="$C_PPOPTS"  F90FLAGS="$FOPTS"  LDFLAGS="$LOPTS"
2286          fi
2287
2288          # UEBERSETZUNG "VON HAND" (OHNE MAKE)
2289       else
2290
2291
2292             # UEBERSETZUNG DER QUELLTEXT-DATEIEN UND DES HAUPTPROGRAMMS
2293             # $CPPOPTS FUER CPP-PRAEPROZESSOR WURDEN OBEN BESTIMMT
2294          printf "\n\n\n  *** compilation starts \n$striche\n"
2295
2296
2297             # VORWEG EVTL. UEBERSETZUNG VON PROGRAMMTEILEN MIT SPEZIELLEN
2298             # COMPILERN UND/ODER COMPILEROPTIONEN. DIESE WERDEN BEI DER SPAETEREN
2299             # EIGENTLICHEN UEBERSETZUNG ALS OBJECT-FILES EINGEBUNDEN
2300          new_source_list=""
2301          for  filename  in  $source_list
2302          do
2303
2304             basename=`print $filename | cut -f1 -d"."`
2305
2306                # EVTL. SPEZIELLEN COMPILER FUER UP BESTIMMEN
2307             comp_var=$(eval echo \$comp_$basename)  # \$ liefert evtl. fuer source alternativ vereinbarten Compiler
2308             comp_opt_var=$(eval echo \$$basename)  # \$$ liefert evtl. fuer source vereinbarte Compiler-Environment-Variable
2309
2310             if [[ "$comp_var" = ""  &&  "$comp_opt_var" = "" ]]
2311             then
2312                new_source_list="$new_source_list "$filename
2313             else
2314
2315                if [[ "$comp_var" = "" ]]
2316                then
2317                   SPECIAL_COMPILER=$compiler_name
2318                else
2319                   SPECIAL_COMPILER=$comp_var
2320                fi
2321
2322                if [[ "$comp_opt_var" = "" ]]
2323                then
2324                   SPECIAL_FOPTS=$FOPTS
2325                else
2326                   SPECIAL_FOPTS="$parallel_options $(eval echo \$$comp_opt_var)"
2327                fi
2328
2329                printf "  *** compiling of $filename with special compiler call: $SPECIAL_COMPILER  $CPPOPTS  -c $SPECIAL_FOPTS \n"
2330                $SPECIAL_COMPILER  $C_PPOPTS  -c $SPECIAL_FOPTS  $MODULE_OPTIONS  $filename 
2331                if [[ $? != 0 ]]
2332                then
2333                   printf "\n  +++ compiling error occured"
2334                   locat=compile
2335                   exit
2336                fi
2337                new_source_list="$new_source_list "${basename}.o
2338             fi
2339          done
2340          source_list="$new_source_list"
2341
2342
2343             # EIGENTLICHE UEBERSETZUNG MIT DEN NORMALEN OPTIONEN
2344          printf "  *** compilation with standard options: $compiler_name $FOPTS $MODULE_OPTIONS \n"
2345          printf "      preprocessor-directives:           $C_PPOPTS \n"
2346          printf "      linker-options:                    $LOPTS \n"
2347          printf "      source code files:                 $source_list \n"
2348
2349          $compiler_name  $C_PPOPTS  $FOPTS  $MODULE_OPTIONS  $LOPTS  $source_list 
2350
2351       fi
2352       if [[ $? != 0  ||  "$compile_error" = true  ||  "$module_compile_error" = true ]]
2353       then
2354          printf "\n  +++ error occured while compiling or linking"
2355          locat=compile
2356          exit
2357       else
2358          printf "$striche\n  *** compilation finished \n"
2359       fi
2360    fi
2361
2362
2363       # FALLS NUR TESTWEISE KOMPILIERT WERDEN SOLLTE, IST MRUN JETZT FERTIG
2364    if [[ $local_compile = true ]]
2365    then
2366       cd  $HOME
2367       rm -rf $TEMPDIR
2368       locat=local_compile; exit
2369    fi
2370
2371
2372       # BEREITSTELLEN DER INPUT-DATEIEN
2373       # SCHLEIFE UEBER ALLE VOM BENUTZER ANGEGEBENEN DATEIEN
2374    (( i = 0 ))
2375    while (( i < iin ))
2376    do
2377       (( i = i + 1 ))
2378       if (( i == 1 ))
2379       then
2380          printf "\n\n  *** providing INPUT-files:\n$striche"
2381       fi
2382
2383
2384          # OPTIONALE DATEIEN BEI NICHTVORHANDENSEIN UEBERGEHEN
2385       if [[ "${transin[$i]}" = unavailable ]]
2386       then
2387          if [[ "${extin[$i]}" = ""  ||  "${extin[$i]}" = " " ]]
2388          then
2389             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}\" "
2390             printf "\n               is not available!"
2391          else
2392             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}.${extin[$i]}\" "
2393             printf "\n               is not available!"
2394          fi
2395          continue
2396       fi
2397
2398          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2399       files_for_pes=false; datentyp=file
2400       if [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2401       then
2402          files_for_pes=true; datentyp=directory
2403          actionin[$i]=""
2404       elif [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2405       then
2406          actionin[$i]=""
2407       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2408       then
2409          files_for_pes=true; datentyp=directory
2410          actionin[$i]="ar"
2411       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2412       then
2413          actionin[$i]="ar"
2414       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2415       then
2416          files_for_pes=true; datentyp=directory
2417          actionin[$i]="fl"
2418       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2419       then
2420          actionin[$i]="fl"
2421       fi
2422
2423       if [[ $files_for_pes = true ]]
2424       then
2425          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}/....  to  ${localin[$i]}"
2426       else
2427          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}  to  ${localin[$i]}"
2428       fi
2429
2430          # INPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. ES WIRD GEPRUEFT,
2431          # OB DIESE DATEI NOCH AUF DEM TEMPORAEREN DATENKATALOG VORHANDEN
2432          # IST. FALLS NICHT, WIRD VERSUCHT, SIE ANSCHLIESSEND VOM ARCHIV-
2433          # SERVER ZU HOLEN
2434       if [[ "${actionin[$i]}" = fl ]]
2435       then
2436          printf "\n      $datentyp will be fetched from temporary directory \"${tmp_data_catalog}\" !"
2437          if [[ $files_for_pes = false ]]
2438          then
2439             if [[ -f "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2440             then
2441                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2442                got_tmp[$i]=true
2443             elif [[ -f "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2444             then
2445                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2446                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2447                cp  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2448             else
2449                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2450                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2451                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2452                actionin[$i]=ar
2453             fi
2454          else
2455             if [[ -d "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2456             then
2457                mkdir  ${localin[$i]}
2458                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}/*  ${localin[$i]}
2459                got_tmp[$i]=true
2460             elif [[ -d "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2461             then
2462                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2463                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2464                cp -r  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2465             else
2466                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2467                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2468                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2469                actionin[$i]=ar
2470             fi
2471          fi
2472       fi
2473
2474
2475          # DATEI LIEGT AUF ARCHIV-SERVER
2476       if [[ "${actionin[$i]}" = ar ]]
2477       then
2478
2479          if [[ $files_for_pes = false ]]
2480          then
2481             printf "\n      file will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2482          else
2483             printf "\n      directory will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2484          fi
2485
2486          file_restored=false
2487
2488          if [[ $archive_system = asterix ]]
2489          then
2490             do_stagein=true
2491             (( stagein_anz = 0 ))
2492             while [[ $do_stagein = true ]]
2493             do
2494                if [[ $files_for_pes = false ]]
2495                then
2496                   stagein  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2497                else
2498                   stagein  -t  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2499                fi
2500                cat  STAGEIN_OUTPUT
2501                if [[ $(grep -c "st.msg:i24"  STAGEIN_OUTPUT) != 0 ]]
2502                then
2503                   file_restored=true
2504                   do_stagein=false
2505                else
2506                   (( stagein_anz = stagein_anz + 1 ))
2507                   if (( stagein_anz == 10 ))
2508                   then
2509                      printf "\n  +++ stagein stoped after 10 tries"
2510                      locat=stage
2511                      exit
2512                   fi
2513                   printf "\n  +++ restoring from archive failed, trying again:"
2514                   sleep 900
2515                fi
2516             done
2517          elif [[ $archive_system = DMF ]]
2518          then
2519             if [[ $files_for_pes = false ]]
2520             then
2521                printf "\n  +++ restoring of single files impossible with $archive_system !\n"
2522                locat=DMF
2523                exit
2524             else
2525                find  $ARCHIVE/${frelin[$i]}  -type m  -print  |  dmget
2526                cp  -r $ARCHIVE/${frelin[$i]}  $PWD
2527                file_restored=true
2528             fi
2529          elif [[ $archive_system = tivoli ]]
2530          then
2531             if [[ $files_for_pes = false ]]
2532             then
2533                if [[ $localhost = ibmh ]]
2534                then
2535                   ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2536                else
2537                   ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2538                fi
2539             else
2540                (( inode = 0 ))
2541                while (( inode < nodes ))
2542                do
2543                   if [[ $localhost = ibmh ]]
2544                   then
2545                      ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2546                   else
2547                      ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2548                   fi
2549                   (( inode = inode + 1 ))
2550                done
2551             fi
2552             file_restored=true
2553          elif [[ $archive_system = ut ]]
2554          then
2555             if [[ $files_for_pes = false ]]
2556             then
2557                cp  $UT/${frelin[$i]}  .
2558             else
2559                (( inode = 0 ))
2560                while (( inode < nodes ))
2561                do
2562                   tar  xf  $UT/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar
2563                   (( inode = inode + 1 ))
2564                done
2565             fi
2566             file_restored=true
2567          else
2568             printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"   restore impossible!"
2569             locat=rearchive
2570             exit
2571          fi
2572
2573          if [[ $file_restored = true ]]
2574          then
2575
2576                # DATEI AUCH AUF TEMPORAERES DATENVERZEICHNIS LEGEN, DAMIT
2577                # SIE BEI WEITEREN ZUGRIFFEN NOCH VORHANDEN IST
2578             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog; chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
2579             if [[ $files_for_pes = false ]]
2580             then
2581                ln  -f  ${frelin[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2582             else
2583                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2584                ln  -f  ${frelin[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2585             fi
2586             got_tmp[$i]=true
2587
2588                # DATEI UNTER LOKALEM NAMEN ZUR VERFUEGUNG STELLEN
2589             mv  ${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2590
2591          fi
2592       fi
2593
2594
2595          # DATEI LIEGT IM VOM BENUTZER ANGEGEBENEN VERZEICHNIS
2596       if [[ "${actionin[$i]}" = ""  ||  "${actionin[$i]}" = "di"  ||  "${actionin[$i]}" = "npe" ]]
2597       then
2598
2599          if [[ "${actionin[$i]}" = "npe"  &&  -n $numprocs ]]
2600          then
2601
2602                # DATEI WIRD FUER DIE PROZESSOREN EINES PARALLERECHNERS BEREITGESTELLT
2603             printf "\n      file will be provided for $numprocs processors"
2604             mkdir  ${localin[$i]}
2605             ival=$numprocs
2606             (( ii = 0 ))
2607             while (( ii <= ival-1 ))
2608             do
2609                if (( ii < 10 ))
2610                then
2611                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_000$ii
2612                elif (( ii < 100 ))
2613                then
2614                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_00$ii
2615                elif (( ii < 1000 ))
2616                then
2617                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_0$ii
2618                else
2619                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_$ii
2620                fi
2621                (( ii = ii + 1 ))
2622             done
2623
2624          else
2625
2626             if [[ $files_for_pes = true ]]
2627             then
2628
2629                   # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
2630                   # DATEIEN WERDEN BEREITGESTELLT, INDEM ZUERST DER GESAMTE
2631                   # KATALOGINHALT KOPIERT UND DANN DIE EINZELNEN DATEIEN
2632                   # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
2633                printf "\n      providing $numprocs files for the respective processors"
2634                mkdir  ${localin[$i]}
2635                cp -r  ${absnamein[$i]}/*  ${localin[$i]}
2636
2637             else
2638                   # BEREITSTELLUNG AUF EINPROZESSORRECHNERN
2639                cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2640             fi
2641          fi
2642       fi
2643
2644    done
2645    if (( i != 0 ))
2646    then
2647       printf "\n$striche\n  *** all INPUT-files provided \n"
2648    fi
2649
2650
2651       # NAMELIST-DATEI MIT WERTEN VON ENVIRONMENT-VARIABLEN ERZEUGEN (ZU
2652       # LESEN VON PALM)
2653    cat  >  ENVPAR  <<  %%END%%
2654 &envpar  run_identifier = '$fname', host = '$localhost',
2655          write_binary = '$write_binary', tasks_per_node = $tasks_per_node,
2656          maximum_cpu_time_allowed = ${cpumax}. /
2657
2658%%END%%
2659
2660
2661       # EVENTUELLE INPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2662    (( i = 0 ))
2663    while (( i < iic ))
2664    do
2665       (( i = i + 1 ))
2666       if (( i == 1 ))
2667       then
2668          printf "\n\n  *** execution of INPUT-commands:\n$striche"
2669       fi
2670       printf "\n  >>> ${in_command[$i]}"
2671       eval  ${in_command[$i]}
2672       if (( i == iic ))
2673       then
2674          printf "\n$striche\n"
2675       fi
2676    done
2677
2678
2679       # VERBLEIBENDE CPU-ZEIT BERECHNEN
2680    cpurest=${cpumax}.
2681
2682
2683       # PROGRAMMSTART
2684    printf "\n\n  *** execution starts in directory\n      \"`pwd`\"\n$striche\n"
2685    PATH=$PATH:$TEMPDIR
2686
2687    if [[ "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ]]
2688    then
2689       if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH ]]
2690       then
2691          printf "\n  +++ debug is allowed in interactive mode only"
2692          locat=debug
2693          exit
2694       fi
2695       if [[ $localhost = decalpha ]]
2696       then
2697          dxladebug  a.out
2698       elif [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
2699       then
2700
2701             # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2702          export MP_SHARED_MEMORY=yes
2703          export AIXTHREADS_SCOPE=S
2704          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2705          export AUTHSTATE=files
2706          export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2707
2708             # FOLLOWING OPTIONS ARE MANDATORY FOR TOTALVIEW
2709          export MP_ADAPTER_USE=shared
2710          export MP_CPU_USE=multiple
2711          export MP_TIMEOUT=1200
2712
2713          unset  MP_TASK_AFFINITY
2714
2715             # SO FAR, TOTALVIEW NEEDS HOSTFILE MECHANISM FOR EXECUTION
2716          #(( ii = 1 ))
2717          #while (( ii <= $numprocs ))
2718          #do
2719          #   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2720          #   (( ii = ii + 1 ))
2721          #done
2722          #export MP_HOSTFILE=hostfile
2723
2724          if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2725          then
2726             totalview   poe  a.out  $ROPTS
2727          else
2728             echo totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2729             export TVDSVRLAUNCHCMD=ssh
2730             totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2731          fi
2732       else 
2733          printf "\n  +++ no debug available on \"$localhost\" "
2734          printf "\n      or not implemented in mrun so far"
2735          locat=debug
2736          exit
2737       fi
2738    else
2739       if [[ -n $numprocs ]]
2740       then
2741
2742             # RUNNING THE PROGRAM ON PARALLEL MACHINES
2743          if [[ $(echo $host | cut -c1-3) = ibm ]]
2744          then
2745                # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2746             export MP_SHARED_MEMORY=yes
2747             export AIXTHREAD_SCOPE=S
2748             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2749             export XLSMPOPTS="spins=0:yields=0:stack=20000000"
2750             export AUTHSTATE=files
2751             export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2752             #  export MP_PRINTENV=yes
2753
2754                # TUNING-VARIABLEN ZUR VERBESSERUNG DER KOMMUNIKATION
2755                # ZEIGEN ABER DERZEIT (SEP 04, FEDERATION) KAUM WIRKUNG
2756             export MP_WAIT_MODE=poll
2757             [[ $node_usage = not_shared ]]  &&  export MP_SINGLE_THREAD=yes
2758#             export MP_EAGER_LIMIT=65535
2759
2760#                # TESTWEISE FUER TURBOMPI (JAN 05)
2761#             export MPJ_MTAB=128
2762#             export MPJ_ALLTOALL=1
2763#             export MPJ_ALLTOALLV=1
2764
2765             if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2766             then
2767                printf "\n--- Control: OMP_NUM_THREADS = \"$OMP_NUM_THREADS\" \n"
2768                if [[ "$cond1" = hpmcount  ||  "$cond2" = hpmcount ]]
2769                then
2770                   /opt/optibm/HPM_2_4_1/bin/hpmcount  a.out  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2771                else
2772                   poe ./a.out  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2773                fi
2774             else
2775                if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms ]]
2776                then
2777                   poe  a.out  -procs $numprocs  -nodes 1  -rmpool 0  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2778                elif [[ $localhost = ibmy ]]
2779                then
2780                   if [[ -f $hostfile ]]
2781                   then
2782                      cp  $hostfile  hostfile
2783                   else
2784                      (( ii = 1 ))
2785                      while (( ii <= $numprocs ))
2786                      do
2787                         echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2788                         (( ii = ii + 1 ))
2789                      done
2790                   fi
2791                   export MP_HOSTFILE=hostfile
2792                   ./a.out  -procs $tasks_per_node  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2793                else
2794                   if [[ "$host_file" = "" ]]
2795                   then
2796                      printf "\n  +++ no hostfile given in configuration file"
2797                      locat=config_file
2798                      exit
2799                   else
2800                      eval host_file=$host_file
2801                   fi
2802                   export MP_HOSTFILE=$host_file
2803                   poe  a.out  -procs $numprocs  -tasks_per_node $numprocs  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2804                fi
2805             fi
2806          elif [[ $host = nech  ||  $host = neck ]]
2807          then
2808             (( ii = nodes ))
2809             if [[ $ii = 1 ]]
2810             then
2811                export F_ERRCNT=0        # acceptable number of errors before program is stopped
2812                export MPIPROGINF=YES
2813                #  export F_TRACE=YES|FMT1|FMT2  # output of ftrace informations to job protocol
2814                echo "*** execution on single node with mpirun"
2815                mpirun  -np $numprocs  ./a.out  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2816             else
2817                (( i = 0 ))
2818                while (( i < ii ))
2819                do
2820                   echo "-h $i  -p $tasks_per_node  -e ./mpi_exec_shell"  >>  multinode_config
2821                   (( i = i + 1 ))
2822                done
2823
2824                echo "#!/bin/sh"                         >   mpi_exec_shell
2825                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2826                echo "set -u"                            >>  mpi_exec_shell
2827                echo "F_ERRCNT=0"                        >>  mpi_exec_shell
2828                echo "MPIPROGINV=YES"                    >>  mpi_exec_shell
2829                echo "OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task" >>  mpi_exec_shell
2830                echo "cpurest=$cpurest"                  >>  mpi_exec_shell
2831                echo "fname=$fname"                      >>  mpi_exec_shell
2832                echo "localhost=$localhost"              >>  mpi_exec_shell
2833                echo "return_addres=$return_addres"      >>  mpi_exec_shell
2834                echo "return_username=$return_username"  >>  mpi_exec_shell
2835                echo "tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  mpi_exec_shell
2836                echo "write_binary=$write_binary"        >>  mpi_exec_shell
2837                echo "use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2838                echo "  "                                >>  mpi_exec_shell
2839                echo "export F_ERRCNT"                   >>  mpi_exec_shell
2840                echo "export MPIPROGINV"                 >>  mpi_exec_shell
2841                echo "export OMP_NUM_THREADS"            >>  mpi_exec_shell
2842                echo "export cpurest"                    >>  mpi_exec_shell
2843                echo "export fname"                      >>  mpi_exec_shell
2844                echo "export localhost"                  >>  mpi_exec_shell
2845                echo "export return_addres"              >>  mpi_exec_shell
2846                echo "export return_username"            >>  mpi_exec_shell
2847                echo "export tasks_per_node"             >>  mpi_exec_shell
2848                echo "export write_binary"               >>  mpi_exec_shell
2849                echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2850                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2851                echo "exec  ./a.out > aout_output  2>&1" >>  mpi_exec_shell
2852
2853                chmod u+x  mpi_exec_shell
2854                export MPIPROGINF=YES
2855                mpirun  -f multinode_config  &
2856                wait
2857
2858             fi
2859          elif [[ $host = lcmuk ]]
2860          then
2861
2862                # COPY HOSTFILE FROM SOURCE DIRECTORY OR CREATE IT, IF IT
2863                # DOES NOT EXIST
2864             if [[ -f $hostfile ]]
2865             then
2866                cp  $hostfile  hostfile
2867             else
2868                (( ii = 1 ))
2869                while (( ii <= $numprocs / $threads_per_task ))
2870                do
2871                   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2872                   (( ii = ii + 1 ))
2873                done
2874             fi
2875             (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
2876             eval zeile=\"`head -n $ii  hostfile`\"
2877             printf "\n  *** running on: $zeile"
2878             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2879             if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2880             then
2881                printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
2882             fi
2883             printf "\n\n"
2884             if [[ $scirocco = true ]]
2885             then
2886                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS   >  aout_output  2>&1
2887             else
2888                mpirun  -machinefile hostfile  -np $ii  a.out  $ROPTS   >  aout_output  2>&1
2889             fi
2890          elif [[ $host = decalpha ]]
2891          then
2892             dmpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2893          elif [[ $host = lctit ]]
2894          then
2895             export runfile=runfile.$kennung
2896
2897             echo "cd $PWD"                                  >   $runfile
2898             echo "export OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"  >>  $runfile
2899             echo "export cpurest=$cpurest"                  >>  $runfile
2900             echo "export fname=$fname"                      >>  $runfile
2901             echo "export localhost=$localhost"              >>  $runfile
2902             echo "export return_addres=$return_addres"      >>  $runfile
2903             echo "export return_username=$return_username"  >>  $runfile
2904             echo "export tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  $runfile
2905             echo "export write_binary=$write_binary"        >>  $runfile
2906             echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  $runfile
2907             echo "./a.out"                                  >>  $runfile
2908             chmod  u+x  $runfile
2909
2910             if [[ "$QUEUE" = interactive ]]
2911             then
2912                mpirun  -np $numprocs  $runfile  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2913             else
2914                n1ge  -fore  -mpi $numprocs  -q $queue  $runfile  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2915             fi
2916
2917             rm  $runfile
2918          else
2919             mpprun  -n $numprocs  a.out  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2920          fi
2921          [[ $? != 0 ]]  &&  execution_error=true
2922
2923
2924             # PERFORMANCE-AUSWERTUNG MIT APPRENTICE
2925          if [[ "$cond1" = apprentice  ||  "$cond2" = apprentice ]]
2926          then
2927             apprentice
2928          fi
2929       else
2930          a.out  $ROPTS  >  aout_output  2>&1
2931       fi
2932    fi
2933    if [[ $? != 0  ||  $execution_error = true ]]
2934    then
2935
2936          # ABBRUCH BEI LAUFZEITFEHLER
2937       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output
2938       printf "\n  +++ runtime error occured"
2939       locat=execution
2940       exit
2941    else
2942       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output
2943       printf "\n$striche\n  *** execution finished \n"
2944    fi
2945
2946
2947
2948       # EVENTUELLE OUTPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2949    (( i = 0 ))
2950    while (( i < ioc ))
2951    do
2952       (( i = i + 1 ))
2953       if (( i == 1 ))
2954       then
2955          printf "\n\n  *** execution of OUTPUT-commands:\n$striche"
2956       fi
2957       printf "\n  >>> ${out_command[$i]}"
2958       eval  ${out_command[$i]}
2959       if (( i == ioc ))
2960       then
2961          printf "\n$striche\n"
2962       fi
2963    done
2964
2965
2966       # EVTL. INHALT DES AKTUELLEN VERZEICHNISSES AUSGEBEN
2967    if [[ $do_trace = true ]]
2968    then
2969       printf "\n\n"
2970       ls -al
2971    fi
2972
2973
2974
2975       # OUTPUT-DATEIEN AN IHRE ZIELORTE KOPIEREN
2976    (( i = 0 ))
2977    while (( i < iout ))
2978    do
2979       (( i = i + 1 ))
2980       if (( i == 1 ))
2981       then
2982          printf "\n\n  *** saving OUTPUT-files:\n$striche"
2983       fi
2984
2985          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2986       files_for_pes=false; filetyp=file
2987       if [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2988       then
2989          files_for_pes=true; filetyp=directory
2990          actionout[$i]=""
2991       elif [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2992       then
2993          actionout[$i]=""
2994       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2995       then
2996          files_for_pes=true; filetyp=directory
2997          actionout[$i]="ar"
2998       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2999       then
3000          actionout[$i]="ar"
3001       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
3002       then
3003          files_for_pes=true; filetyp=directory
3004          actionout[$i]="fl"
3005       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3006       then
3007          actionout[$i]="fl"
3008       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  -n $numprocs ]]
3009       then
3010          files_for_pes=true; filetyp=directory
3011          actionout[$i]="tr"
3012       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3013       then
3014          actionout[$i]="tr"
3015       fi
3016
3017       if [[ ! -f ${localout[$i]}  &&  $files_for_pes = false ]]
3018       then
3019          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}  does not exist\n"
3020       elif [[ ! -f ${localout[$i]}/_0000  &&  $files_for_pes = true ]]
3021       then
3022          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}/....  does not exist\n"
3023       else
3024
3025
3026             # KOPIEREN PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3027             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3028             # REMOTE-RECHNUNGEN
3029          if [[ "${actionout[$i]}" = tr ]]
3030          then
3031             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3032             then
3033                if [[ $files_for_pes = false ]]
3034                then
3035                   cps=""
3036                   cst=""
3037                else
3038                   cps=-c
3039                   cst="/"
3040                fi
3041                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3042                then
3043
3044                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3045                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3046                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3047                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3048                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3049                   then
3050                      ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3051                   else
3052                      mkdir  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3053                      ln  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3054                   fi
3055
3056                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3057                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3058                   if [[ $filetransfer_protocol = ftp ]]
3059                   then
3060                      if [[ $files_for_pes = true ]]
3061                      then
3062                         printf "\n  +++ WARNING: no transfer of catalogs via ftpcopy\n"
3063                      fi
3064                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  by FTP in seperate job to"
3065                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3066                      printf "\n              or higher cycle\n"
3067                      echo "ftpcopy -b -m $return_addres $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3068                   else
3069                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP in seperate job to"
3070                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst"
3071                      printf "\n              or higher cycle\n"
3072                      echo "batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3073                   fi
3074                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3075
3076                   if [[ $localhost = nech ]]
3077                   then
3078                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  -f $filetransfer_protocol  transfer_${localout[$i]}
3079                   else
3080                      if [[ "$LOGNAME" = b323013 ]]
3081                      then
3082                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -f $filetransfer_protocol  transfer_${localout[$i]}
3083                      else
3084                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -f $filetransfer_protocol  transfer_${localout[$i]}
3085                      fi
3086                   fi
3087
3088                else
3089
3090                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3091                   transfer_failed=false
3092                   if [[ $filetransfer_protocol = ftp ]]
3093                   then
3094                      if [[ $files_for_pes = true ]]
3095                      then
3096                         printf "\n  +++ WARNING: no transfer of catalogs via ftpcopy\n"
3097                      fi
3098                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  by FTP to"
3099                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3100                      ftpcopy -b -m $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3101                      [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3102                   else
3103                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP to"
3104                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst\n"
3105                      batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3106                      [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3107                   fi
3108
3109                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3110                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3111                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3112                   then
3113                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3114                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3115
3116                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3117                         # ANLEGEN.
3118                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3119                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3120                      then
3121                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3122                         printf "      $local_catalog \n"
3123                         mkdir -p  $local_catalog
3124                      fi
3125                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3126                      transfer_problems=true
3127                   fi
3128                fi
3129             else
3130
3131                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR KOPIERT WIRD
3132                actionout[$i]=""
3133             fi
3134          fi
3135
3136
3137             # APPEND PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3138             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3139             # REMOTE-RECHNUNGEN
3140          if [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
3141          then
3142             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3143             then
3144                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3145                then
3146
3147                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3148                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3149                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3150                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3151                   ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3152
3153                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3154                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3155                   if [[ $filetransfer_protocol = ftp ]]
3156                   then
3157                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by FTP in seperate job to"
3158                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3159                      printf "\n              or higher cycle\n"
3160                      echo "ftpcopy -A -b -m $return_addres $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3161                   else
3162                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP in seperate job to"
3163                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3164                      printf "\n              or higher cycle\n"
3165                      echo "batch_scp -A -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3166                   fi
3167                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3168
3169                   if [[ $localhost = nech ]]
3170                   then
3171                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  -f $filetransfer_protocol  transfer_${localout[$i]}
3172                   else
3173                      if [[ $LOGNAME = b323013 ]]
3174                      then
3175                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -f $filetransfer_protocol  transfer_${localout[$i]}
3176                      else
3177                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -f $filetransfer_protocol  transfer_${localout[$i]}
3178                      fi
3179                   fi
3180
3181                else
3182
3183                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3184                   transfer_failed=false
3185                   if [[ $filetransfer_protocol = ftp ]]
3186                   then
3187                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by FTP to"
3188                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3189                      ftpcopy -A -b -m $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3190                      [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3191                   else
3192                      printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP to"
3193                      printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3194                      batch_scp -A -b -m -u $return_username  $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3195                      [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3196                   fi
3197
3198                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3199                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3200                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3201                   then
3202                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3203                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3204
3205                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3206                         # ANLEGEN
3207                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3208                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3209                      then
3210                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3211                         printf "      $local_catalog \n"
3212                         mkdir -p  $local_catalog
3213                      fi
3214
3215                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3216                      transfer_problems=true
3217                   fi
3218                fi
3219             else
3220
3221                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR APPEND AUF
3222                   # LOKALER MASCHINE DURCHGEFUEHRT WIRD
3223                actionout[$i]=a
3224             fi
3225          fi
3226
3227
3228             # OUTPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. DATEI WIRD PER
3229             # LINK AUF DEN TEMPORAEREN DATENKATALOG GELEGT. OPTION -f WIRD
3230             # VERWENDET, FALLS DORT NOCH EINE DATEI GLEICHEN NAMENS VORHANDEN
3231             # SEIN SOLLTE. ANSCHLIESSEND WIRD SEINE ARCHIVIERUNG ANGESTOSSEN
3232          if [[ "${actionout[$i]}" = fl ]]
3233          then
3234             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3235             chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3236             if [[ $files_for_pes = false ]]
3237             then
3238                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3239                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3240                ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3241             else
3242                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/....  to"
3243                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3244                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3245                ln -f  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3246             fi
3247
3248
3249                # ARCHIVIERUNGSJOB WIRD ERZEUGT UND ABGESCHICKT
3250             if [[ $store_on_archive_system = true ]]
3251             then
3252
3253                if [[ $archive_system = asterix ]]
3254                then
3255                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3256                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3257                   then
3258                      echo "stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3259                   else
3260                      echo "stageout -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3261                   fi
3262                   echo "cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"               >> archive_${frelout[$i]}
3263                   echo "if [[ \$(grep -c \"st.msg:150\"  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung) != 0 ]]" >> archive_${frelout[$i]}
3264                   echo "then"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3265                   echo "   do_stageout=false"                       >> archive_${frelout[$i]}
3266                   echo "else"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3267                   echo "   echo \"  +++ $filetyp ${frelout[$i]}  could not be stored on archive-system\" " >> archive_${frelout[$i]}
3268                   echo "   cat  /dev/null  >  ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname" >> archive_${frelout[$i]}
3269                   echo "   cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung  >  ~/job_queue/archive_${frelout[$i]}_error" >> archive_${frelout[$i]}
3270                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} will be copied to \$WORK as backup\" " >> archive_${frelout[$i]}
3271                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3272                   then
3273                      echo "   cp   ${frelout[$i]}  \$WORK"                    >> archive_${frelout[$i]}
3274                   else
3275                      echo "   cp -r  ${frelout[$i]}  \$WORK/${frelout[$i]}"   >> archive_${frelout[$i]}
3276                   fi
3277                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} saved\" " >> archive_${frelout[$i]}
3278                   echo "fi"                                         >> archive_${frelout[$i]}
3279                   echo "rm  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"              >> archive_${frelout[$i]}
3280                elif [[ $archive_system = DMF ]]
3281                then
3282                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3283                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3284                   then
3285                      printf "\n  +++ archiving of single files impossible with $archive_system !\n"
3286                      locat=DMF
3287                      exit
3288                   else
3289                         # FUER RECHNER IN JUELICH. DORT KOENNTEN AUCH
3290                         # EINZELNE DATEIEN GESICHERT WERDEN (SPAETER KORR.)
3291                      echo "rm -rf  \$ARCHIVE/${frelout[$i]}"     >> archive_${frelout[$i]}
3292                      echo "cp -r  ${frelout[$i]}  \$ARCHIVE"     >> archive_${frelout[$i]}
3293                   fi
3294                elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3295                then
3296                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3297                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3298                   then
3299                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3300                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3301                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3302                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3303                   else
3304
3305                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3306                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3307                      echo "[[ ! -d \$PERM/${frelout[$i]} ]] && mkdir $PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3308                      cd  $tmp_data_catalog
3309                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3310                      cd -  > /dev/null
3311                      (( inode = 0 ))
3312                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3313                      while (( inode < nodes ))
3314                      do
3315#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3316                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3317                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3318#                         echo "*** tasks_per_node = \"$tasks_per_node\" "
3319#                         echo "*** files = \"$files\" "
3320#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3321                         echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3322                         echo "dsmc incremental  \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar" >> archive_${frelout[$i]}
3323                         echo "dsmmigrate \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar"        >> archive_${frelout[$i]}
3324                         (( inode = inode + 1 ))
3325                      done
3326#                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3327#                      echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3328                   fi
3329                elif [[ $archive_system = ut ]]
3330                then
3331                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3332                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3333                   then
3334                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3335                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3336                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3337                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3338                   else
3339
3340                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3341                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3342                      echo "[[ ! -d \$UT/${frelout[$i]} ]] && mkdir $UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3343                      cd  $tmp_data_catalog
3344                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3345                      cd -  > /dev/null
3346                      (( inode = 0 ))
3347                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3348                      while (( inode < nodes ))
3349                      do
3350                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3351                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3352                         echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3353                         (( inode = inode + 1 ))
3354                      done
3355                   fi
3356                elif [[ $archive_system = none ]]
3357                then
3358                   printf "              +++ archiving on $localhost not available!\n"
3359                fi
3360
3361                if [[ $archive_system != none ]]
3362                then
3363                   if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb ]]
3364                   then
3365                      subjob  -d  -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 7200  -f $filetransfer_protocol  archive_${frelout[$i]}
3366                   elif [[ $localhost = nech ]]
3367                   then
3368                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  -f $filetransfer_protocol  archive_${frelout[$i]}
3369                   fi
3370                   printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3371                fi
3372             else
3373                printf "              +++ caution: option -A is switched on. No archiving on $archive_system!\n"
3374             fi
3375
3376
3377                # LEERDATEI IM BENUTZERVERZEICHNIS ANLEGEN, DAMIT BEKANNT IST,
3378                # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3379             if [[ $files_for_pes = false ]]
3380             then
3381                cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3382             else
3383                mkdir -p  ${pathout[$i]}
3384             fi
3385
3386          fi
3387
3388
3389             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE ZUM ARCHIV-SYSTEM
3390             # AUSSERDEM MUSS LEERDATEI ANGELEGT WERDEN, DAMIT BEKANNT IST,
3391             # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3392             # FALLS IRGENDEINE (VON MEHREREN) ARCHIVIERUNGEN SCHIEF GEHT,
3393             # WIRD FLAG GESETZT UND BLEIBT AUCH BEI WEITEREN ORDNUNGS-
3394             # GEMAESSEN ARCHIVIERUNGEN GESETZT
3395          if [[ "${actionout[$i]}" = ar ]]
3396          then
3397             if [[ $files_for_pes = false ]]
3398             then
3399                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3400                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3401                printf "\n              File will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3402             else
3403                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to"
3404                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3405                printf "\n              Directory will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3406             fi
3407             mv  ${localout[$i]}  ${frelout[$i]}
3408
3409             file_saved=false
3410
3411             if [[ $archive_system = asterix ]]
3412             then
3413                do_stageout=true
3414                (( stageout_anz = 0 ))
3415                while [[ $do_stageout = true ]]
3416                do
3417                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3418                   then
3419                      stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3420                   else
3421                      stageout  -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3422                   fi
3423                   cat  STAGE_OUTPUT
3424                   if [[ $(grep -c "st.msg:150"  STAGE_OUTPUT) != 0 ]]
3425                   then
3426                      file_saved=true
3427                      do_stageout=false
3428                   else
3429                      if [[ $files_for_pes = false ]]
3430                      then
3431                         printf "\n  +++ file ${frelout[$i]}  could not be saved on archive-system"
3432                      else
3433                         printf "\n  +++ directory ${frelout[$i]} could not be saved on archive-system"
3434                      fi
3435                      (( stageout_anz = stageout_anz + 1 ))
3436                      if (( stageout_anz == 10 ))
3437                      then
3438                         printf "\n  +++ stoped after 10 unsuccessful tries!"
3439                         archive_save=false
3440                         do_stageout=false
3441                      else
3442                         printf "\n  *** new try to store on archive after 15 min:"
3443                         sleep 900
3444                      fi
3445                   fi
3446                done
3447             elif [[ $archive_system = DMF ]]
3448             then
3449                if [[ $files_for_pes = false ]]
3450                then
3451                   printf "\n  +++ archiving of single files impossible on $archive_system!\n"
3452                   locat=DMF
3453                   exit
3454                else
3455                   rm -rf  $ARCHIVE/${frelout[$i]}
3456                   cp -r  ${frelout[$i]}  $ARCHIVE
3457                fi
3458                file_saved=true
3459             elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3460             then
3461                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3462                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3463                   # GELEGT WERDEN
3464                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3465                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3466                if [[ $files_for_pes = false ]]
3467                then
3468                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3469                else
3470                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3471                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3472                fi
3473
3474                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3475                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3476                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3477                if [[ $files_for_pes = false ]]
3478                then
3479                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3480                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3481                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3482                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3483                else
3484                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3485                   echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3486                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3487                fi
3488
3489                subjob  -v  -d  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 7200  -f $filetransfer_protocol  archive_${frelout[$i]}
3490                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3491                file_saved=true
3492
3493             elif [[ $archive_system = ut ]]
3494             then
3495                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3496                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3497                   # GELEGT WERDEN
3498                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3499                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3500                if [[ $files_for_pes = false ]]
3501                then
3502                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3503                else
3504                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3505                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3506                fi
3507
3508                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3509                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3510                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3511                if [[ $files_for_pes = false ]]
3512                then
3513                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3514                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3515                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3516                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3517                else
3518                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3519                   echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3520                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3521                fi
3522
3523                subjob  -v  -c /pf/b/$usern/job_queue  -d  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  -f $filetransfer_protocol  archive_${frelout[$i]}
3524                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3525                file_saved=true
3526
3527             else
3528                printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"  archiving impossible!"
3529                archive_save=false
3530             fi
3531             if [[ $file_saved = true ]]
3532             then
3533                if [[ $files_for_pes = false ]]
3534                then
3535                   cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3536                else
3537                   mkdir -p  ${pathout[$i]}
3538                fi
3539             fi
3540          fi
3541
3542             # APPEND AUF LOKALER MASCHINE
3543          if [[ "${actionout[$i]}" = "a" ]]
3544          then
3545             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append to  ${pathout[$i]}\n"
3546             cat  ${localout[$i]}  >>  ${pathout[$i]}
3547          fi
3548
3549             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE
3550             # ES MUSS KOPIERT WERDEN, DA MOVE NICHT UEBER FILESYSTEM HINAUS MOEGLICH
3551          if [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = false ]]
3552          then
3553
3554                # KOPIEREN AUF EINPROZESSORMASCHINE
3555             if [[ "${extout[$i]}" != " "  &&  "${extout[$i]}" != "" ]]
3556             then
3557                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}\n"
3558                cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3559             else
3560                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}\n"
3561                cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3562             fi
3563
3564          elif [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = true ]]
3565          then
3566
3567                # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
3568                # DATEIEN WERDEN ERST IN EINEM KATALOG GESAMMELT UND DIESER
3569                # WIRD DANN KOPIERT
3570                # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
3571             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to  ${pathout[$i]}\n"
3572             cp -r  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3573
3574          fi
3575       fi
3576    done
3577    if (( i != 0 ))
3578    then
3579       if [[ $transfer_problems = true ]]
3580       then
3581          printf "\n$striche\n  *** OUTPUT-files saved"
3582          printf "\n  +++ WARNING: some data transfers failed! \n"
3583       else
3584          printf "\n$striche\n  *** all OUTPUT-files saved \n"
3585       fi
3586    fi
3587
3588
3589       # EVENTUELL FOLGEJOB STARTEN
3590       # DATEI CONTINUE_RUN MUSS VOM BENUTZERPROGRAMM AUS ERZEUGT WERDEN
3591    if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3592    then
3593
3594       if [[ $archive_save = true ]]
3595       then
3596
3597             # ZUERST IN MRUN-AUFRUF OPTIONEN FUER FORTSETZUNGSLAUF, FUER
3598             # STILLES ABARBEITEN (OHNE INTERAKTIVE RUECKFAGEN) UND FUER
3599             # BATCH-BETRIEB (NUR WICHTIG, FALLS BATCH AUF LOKALER MASCHINE
3600             # DURCHGEFUEHRT WERDEN SOLL) EINFUEGEN, FALLS NICHT BEREITS VOR-
3601             # HANDEN
3602          [[ $(echo $mc | grep -c "\-C") = 0 ]]  &&  mc="$mc -C"
3603          [[ $(echo $mc | grep -c "\-v") = 0 ]]  &&  mc="$mc -v"
3604          [[ $(echo $mc | grep -c "\-b") = 0 ]]  &&  mc="$mc -b"
3605          if [[ $(echo $mc | grep -c "#") != 0 ]]
3606          then
3607             mc=`echo $mc | sed 's/#/f/g'`
3608          fi
3609
3610
3611             # JOB STARTEN
3612          printf "\n\n  *** initiating restart-run on \"$return_addres\" using command:\n"
3613          echo "      $mc"
3614          printf "\n$striche\n"
3615          if [[ $localhost != $fromhost ]]
3616          then
3617
3618             if [[ $localhost = nech  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms  ||  $localhost = lctit ]]
3619             then
3620                echo "*** ssh will be used to initiate restart-runs!"
3621                echo "    return_addres=\"$return_addres\" "
3622                echo "    return_username=\"$return_username\" "
3623                if [[ $return_addres = 172.20.25.41 ]]
3624                then
3625                      # WORKAROUND AUF SCIROCCO AM TIT
3626                   print  "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "  |  ssh $return_addres -l $return_username 
3627                else
3628                   ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "
3629                fi
3630             else
3631                printf "\n  +++ no restart mechanism available for host \"$localhost\" "
3632                locat=restart; exit
3633             fi
3634
3635                # WARTEN, DAMIT SICH RESTART JOB IN QUEUE EINREIHEN KANN, BEVOR
3636                # DER AKTUELLE JOB ENDET
3637             sleep 30
3638
3639          else
3640
3641                # BEI RECHNUNGEN AUF LOKALER MASCHINE KANN MRUN DIREKT AUFGE-
3642                # RUFEN WERDEN
3643             cd $LOCAL_PWD
3644             eval  $mc                # ' MUESSEN AUSGEWERTET WERDEN
3645             cd -  > /dev/null
3646          fi
3647          printf "\n$striche\n  *** restart-run initiated \n"
3648
3649
3650             # EVENTUELL INPUT-DATEIEN, DIE VON TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS
3651             # GEHOLT WORDEN SIND, LOESCHEN
3652          (( i = 0 ))
3653          while (( i < iin ))
3654          do
3655             (( i = i + 1 ))
3656             if [[ "${got_tmp[$i]}" = true   &&  $keep_data_from_previous_run = false ]]
3657             then
3658                rm -r  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
3659             fi
3660          done
3661
3662       else
3663
3664          printf "\n  +++ no restart-run possible, since errors occured"
3665          printf "\n      during the archive process"
3666       fi
3667
3668    fi
3669
3670
3671   
3672       # EVTL. EMAIL-BENACHRICHTIGUNG UEBER ABGESCHLOSSENEN LAUF
3673    if [[ "$email_notification" != "" ]]
3674    then
3675
3676       if [[ $localhost != $fromhost ]]
3677       then
3678          if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3679          then
3680             echo "PALM restart run necessary"        >   email_text
3681             echo "description header of actual run:" >>  email_text
3682             cat  CONTINUE_RUN                        >>  email_text
3683             echo "mrun-command to restart:"          >>  email_text
3684             echo "$mc"                               >>  email_text
3685          else
3686             echo "PALM run with base filename \"$fname\" on host \"$localhost\" finished"  >  email_text
3687          fi
3688          mail  $email_notification  <  email_text
3689          printf "\n  *** email notification sent to \"$email_notification\" "
3690       fi
3691    fi
3692
3693
3694
3695       # ALLE ARBEITEN BEENDET. TEMPORAERER KATALOG KANN GELOESCHT WERDEN
3696    cd  $HOME
3697    [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
3698
3699 else
3700
3701
3702       # FALLS AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
3703       # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
3704
3705       # MRUN-BEFEHL FUER REMOTE-MASCHINE ZUSAMMENSTELLEN
3706    mrun_com="$mrun_script_name -a $afname -c $config_file -d $fname -f $filetransfer_protocol -h $host -H $fromhost -m $memory -t $cpumax -q $queue -R $return_addres -U $return_username -u $remote_username"
3707    [[ "$cpp_opts" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -D \"$cpp_opts\""
3708    [[ $do_compile = true ]]      &&  mrun_com=${mrun_com}" -s \"$source_list\""
3709    [[ "$input_list" != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -i \"$input_list\""
3710    [[ $ignore_archive_error = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -I"
3711    [[ $keep_data_from_previous_run = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -k"
3712    [[ "$additional_conditions" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -K \"$additional_conditions\""
3713#    [[ "$makefile" != "$source_path/Makefile" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -M \"$makefile\""
3714    [[ "$output_list" != "" ]]    &&  mrun_com=${mrun_com}" -o \"$output_list\""
3715    [[ "$read_from_config" = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -S"
3716    [[ $do_trace = true ]]        &&  mrun_com=${mrun_com}" -x"
3717    [[ "$numprocs" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -X $numprocs"
3718    if [[ $use_openmp = true ]]
3719    then
3720       mrun_com=${mrun_com}" -O"
3721       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $threads_per_task"
3722    else
3723       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $tasks_per_node"
3724    fi
3725    [[ $store_on_archive_system = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -A"
3726    [[ $package_list != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -p \"$package_list\""
3727    [[ $return_password != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -P $return_password"
3728    [[ $delete_temporary_catalog = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -B"
3729    [[ $node_usage != default ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -n $node_usage"
3730    if [[ $do_remote = true ]]
3731    then
3732       printf "\n>>>> MRUN-command on execution host:\n>>>> $mrun_com \n"
3733    fi
3734
3735
3736       # ZUSAMMENSTELLUNG DES JOBSCRIPTS AUF DATEI jobfile
3737    jobfile=jobfile.$RANDOM
3738
3739
3740       # TEMPORAERES VERZEICHNIS GENERIEREN UND NACH DORT WECHSELN
3741    echo  "mkdir  $TEMPDIR"      >>  $jobfile
3742    echo  "cd  $TEMPDIR"         >>  $jobfile
3743
3744
3745       # EVENTUELL FEHLERVERFOLGUNG AKTIVIEREN
3746    if [[ $do_trace = true ]]
3747    then
3748       echo  "set -x"                                    >>  $jobfile
3749    else
3750       echo  "set +vx"                                   >>  $jobfile
3751    fi
3752
3753
3754       # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL)
3755       # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES
3756    if [[ $do_compile = true ]]
3757    then
3758
3759       source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname
3760
3761           # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN
3762           # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE
3763           # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI)
3764       echo  "mkdir  SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
3765       echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                 >>  $jobfile
3766       echo  "cd     SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
3767
3768       for  filename  in  $source_list
3769       do
3770             # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3771          echo  "cat > $filename << \"%END%\""              >>  $jobfile
3772          cat   $source_catalog/$filename                   >>  $jobfile
3773          echo  " "                                         >>  $jobfile
3774          echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
3775          echo  " "                                         >>  $jobfile
3776       done
3777
3778       if [[ "$use_makefile" = true ]]
3779       then
3780             # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3781          echo  "cat > Makefile << \"%END%\""               >>  $jobfile
3782          cat   $source_catalog/Makefile                    >>  $jobfile
3783          echo  " "                                         >>  $jobfile
3784          echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
3785          echo  " "                                         >>  $jobfile
3786       fi
3787
3788       echo  "cd -  > /dev/null"                         >>  $jobfile
3789
3790    fi
3791
3792
3793       # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI
3794       # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3795    echo  "cat > $config_file << \"%END%\""      >>  $jobfile
3796    cat   $config_file                           >>  $jobfile
3797    echo  "%END%"                                >>  $jobfile
3798    echo  " "                                    >>  $jobfile
3799
3800
3801       # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION
3802       # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3803    echo  "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\""  >>  $jobfile
3804    cat   ${PALM_BIN}/$mrun_script_name          >>  $jobfile
3805    echo  "%END%"                                >>  $jobfile
3806    if [[ $host = lctit ]]
3807    then
3808       echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >>  $jobfile
3809       echo "mv  mrun_new  $mrun_script_name"    >>  $jobfile
3810    fi
3811    echo  "chmod u+x $mrun_script_name"          >>  $jobfile
3812    echo  "execute_mrun=true"                    >>  $jobfile
3813    echo  " "                                    >>  $jobfile
3814
3815       # EVTL. BENOETIGTE INPUT-DATEIEN PER FTP HOLEN ODER DEM JOB DIREKT
3816       # MITGEBEN UND AUF DEM REMOTE-RECHNER IM BENUTZERVERZEICHNIS ABLEGEN
3817       # FALLS DIESES NICHT EXISTIERT, WIRD VERSUCHT, DAS JEWEILS LETZTE
3818       # UNTERVERZEICHNIS DES PFADNAMENS ANZULEGEN
3819    if [[ $do_remote = true ]]
3820    then
3821       (( i = 0 ))
3822       while (( i < iin ))
3823       do
3824          (( i = i + 1 ))
3825          echo  "[[ ! -d ${pathin[$i]} ]]  &&  mkdir -p  ${pathin[$i]}"  >>  $jobfile
3826          if [[ "${transin[$i]}" = job ]]
3827          then
3828             echo  "cat > ${remotepathin[$i]} <<\"%END%\""    >>  $jobfile
3829             eval cat   ${pathin[$i]}/${frelin[$i]}           >>  $jobfile
3830             echo  " "                                        >>  $jobfile
3831             echo  "%END%"                                    >>  $jobfile
3832          else
3833             if [[ $filetransfer_protocol = ftp ]]
3834             then
3835                echo  "ftpcopy -b -o -g -s $return_addres ${remotepathin[$i]} \"${pathin[$i]}\" ${frelin[$i]}" >>  $jobfile
3836             else
3837                echo  "batch_scp -b -o -g -s -u $return_username $return_addres ${remotepathin[$i]} \"${pathin[$i]}\" ${frelin[$i]}" >>  $jobfile
3838             fi
3839          fi
3840
3841             # UEBERPRUEFEN, OB DATEI ANGELEGT WERDEN KONNTE
3842          echo  "if [[ \$? = 1 ]]"                    >>  $jobfile
3843          echo  "then"                                >>  $jobfile
3844          echo  "   echo \" \" "                      >>  $jobfile
3845          echo  "   echo \"+++ file ${remotepathin[$i]} could not be created\" "   >>  $jobfile
3846          echo  "   echo \"    please check, if directory exists on $host!\" "  >>  $jobfile
3847          echo  "   echo \"+++ MRUN will not be continued\" "  >>  $jobfile
3848          echo  "   execute_mrun=false"               >>  $jobfile
3849          echo  "fi"                                  >>  $jobfile
3850       done
3851    fi
3852
3853       # ARBEITSKATALOG AUF DER LOKALEN MASCHINE FUER EVENTUELLE
3854       # FORTSETZUNGSLAUEFE PER ENV-VARIABLE UEBERGEBEN
3855    echo  "LOCAL_PWD=$working_directory"                >>  $jobfile
3856    echo  "export LOCAL_PWD"                            >>  $jobfile
3857
3858       # EBENSO LOKALEN MRUN-KATALOG UEBERGEBEN
3859    echo  "LOCAL_MRUN_PATH=$PALM_BIN"                   >>  $jobfile
3860    echo  "export LOCAL_MRUN_PATH"                      >>  $jobfile
3861
3862       # WORKAROUND FUER RIAM-NEC-JOBS WEGEN PROFILE-SCHWIERIGKEITEN
3863    if [[ $localhost_realname = "gate" ]]
3864    then
3865       echo  "export PALM_BIN=$PALM_BIN"                >>  $jobfile
3866    fi
3867
3868       # MRUN AUF ZIELRECHNER AUFRUFEN
3869    echo  "set -x"                                      >>  $jobfile
3870    echo  "[[ \$execute_mrun = true ]]  &&  ./$mrun_com"  >>  $jobfile
3871
3872    echo  'ls -al; echo `pwd`'                          >>  $jobfile
3873    echo  "cd \$HOME"                                   >>  $jobfile
3874    echo  "rm -rf  $TEMPDIR"                            >>  $jobfile
3875
3876
3877
3878
3879       # JOB PER SUBJOB STARTEN
3880    if [[ $silent = false ]]
3881    then
3882       printf "\n     "
3883    else
3884       printf "\n\n"
3885    fi
3886
3887    subjob  $job_on_file  -h $host  -u $remote_username  -q $queue  -m $memory  -N $node_usage -t $cpumax  $XOPT  $TOPT  $OOPT  -n $fname  -f $filetransfer_protocol  -v   $jobfile
3888    rm -rf  $jobfile
3889
3890
3891 fi  # ENDE REMOTE-TEIL
3892
3893
3894
3895     # ENDE DER PROZEDUR
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.