Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.imuk @ 1556

Last change on this file since 1556 was 1446, checked in by maronga, 10 years ago

removed blanks from <> strings in .mrun.config files / adapted hlrn_watchdog for HLRN-III
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 11.7 KB
RevLine 
[1440]1#$Id: .mrun.config.imuk 1446 2014-08-07 10:08:56Z maronga $
[246]2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
[892]11#%use_makefile      true
[246]12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
[281]15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
[246]17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
[1440]19# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
[1446]20%host_identifier   <replace_by_your_IMUK_hostname>     lcmuk
[246]21#
[1440]22# IMUK
[1446]23%remote_username   <replace_by_your_IMUK_username>                             lcmuk parallel
[1440]24%tmp_user_catalog  /localdata                                                  lcmuk parallel
[892]25%compiler_name     mpif90                                                      lcmuk parallel
26%compiler_name_ser ifort                                                       lcmuk parallel
[1440]27%cpp_options       -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__fftw:-D__intel_compiler  lcmuk parallel
28%netcdf_inc        -I:/muksoft/packages/netcdf/4_intel/include                 lcmuk parallel
29%netcdf_lib        -L/muksoft/packages/netcdf/4_intel/lib:-lnetcdf:-lnetcdff   lcmuk parallel
30%fftw_inc          -I:/muksoft/packages/fftw/3.3.4/include                     lcmuk parallel
31%fftw_lib          -L/muksoft/packages/fftw/3.3.4/lib64:-lfftw3                lcmuk parallel
[892]32%mopts             -j:4                                                        lcmuk parallel
[1440]33%fopts             -fpe0:-O3:-cpp:-fp-model:source:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-diag-disable:8290,8291  lcmuk parallel
34%lopts             -fpe0:-O3:-cpp:-fp-model:source:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-diag-disable:8290,8291  lcmuk parallel
[246]35#
[1440]36# IMUK debug/trace mode
[1446]37%remote_username   <replace_by_your_IMUK_username>                             lcmuk parallel trace
[1440]38%tmp_user_catalog  /localdata                                                  lcmuk parallel trace
[892]39%compiler_name     mpif90                                                      lcmuk parallel trace
40%compiler_name_ser ifort                                                       lcmuk parallel trace
[1440]41%cpp_options       -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__fftw:-D__intel_compiler   lcmuk parallel trace
42%netcdf_inc        -I:/muksoft/packages/netcdf/4_intel/include                 lcmuk parallel trace
43%netcdf_lib        -L/muksoft/packages/netcdf/4_intel/lib:-lnetcdf:-lnetcdff   lcmuk parallel trace
44%fftw_inc          -I:/muksoft/packages/fftw/3.3.4/include                     lcmuk parallel trace
45%fftw_lib          -L/muksoft/packages/fftw/3.3.4/lib64:-lfftw3                lcmuk parallel trace
46%fopts             -fpe0:-C:-check:nooutput_conversion:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-O0:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian:-diag-disable:8290,8291  lcmuk parallel trace
47%lopts             -fpe0:-C:-check:nooutput_conversion:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-O0:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-limf:-lm:-Vaxlib       lcmuk parallel trace
48#
[246]49%write_binary                true                             restart
50#
51#----------------------------------------------------------------------------
[892]52# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
[246]53#----------------------------------------------------------------------------
[281]54#IC:
[246]55#
56#----------------------------------------------------------------------------
57# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
58#----------------------------------------------------------------------------
59EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
[281]60EC:pwd; ls -al
[246]61#
62#----------------------------------------------------------------------------
63# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
64#----------------------------------------------------------------------------
65# Combine all particle information files
66OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
67#
68#----------------------------------------------------------------------------
69# List of input-files
70#----------------------------------------------------------------------------
[281]71PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
72PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
73TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
[1241]74NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
75LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
[281]76BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
77PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
78DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
79DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
80DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
81DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
82DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
83DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
84DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
85DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
86DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
87DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
[246]88#
89#----------------------------------------------------------------------------
90# List of output-files
91#----------------------------------------------------------------------------
92BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
93PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
94#
95RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
96RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
97HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
98HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
99CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
100CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
101#
[892]102DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
103DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
104DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
105DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
106DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy      nc
107DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av   nc
108DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz      nc
109DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av   nc
110DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz      nc
111DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av   nc
112DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d      nc
113DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av   nc
[410]114DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
115DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
116DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
117DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
118DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
119DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
120DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
121DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
122DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
123DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
124DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
125DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
126DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
127DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
128DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
129DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
130DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
131DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
132DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
133DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
134DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
135DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
136DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
137DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
138DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
139DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
140DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
141DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
142DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
143DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
144DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
145DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
146DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
147DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
148DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
149DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
150DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
151DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
152DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
153DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
[892]154DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
155DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
156DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
[246]157#
[281]158DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
159DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
160PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
161PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
162PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
[892]163# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |