Changeset 4601 for palm


Ignore:
Timestamp:
Jul 14, 2020 12:06:09 PM (5 months ago)
Author:
suehring
Message:

Chemistry: Bugfix in variable name separation in profile-output initialization; Bugfix in counting the number of chemistry profiles; Surface-data output: Minor simplification in name creation for IO variables in restart files; init_grid: minor formatting adjustments

Location:
palm/trunk/SOURCE
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • palm/trunk/SOURCE/chemistry_model_mod.f90

    r4581 r4601  
    2121! Current revisions:
    2222! -----------------
    23 ! 
    24 ! 
     23!
     24!
    2525! Former revisions:
    2626! -----------------
    2727! $Id$
     28! - Bugfix in variable name separation in profile-output initialization
     29! - Bugfix in counting the number of chemistry profiles
     30!
     31! 4581 2020-06-29 08:49:58Z suehring
    2832! Enable output of resolved-scale vertical fluxes of chemical species.
    2933!
     
    11091113                cs_pr_count_sp                 = cs_pr_count_sp + 1
    11101114                cs_pr_index_sp(cs_pr_count_sp) = lsp
    1111                 dopr_index(var_count)          = pr_palm + cs_pr_count_sp + cs_pr_count_fl_sgs + cs_pr_count_fl_res
     1115                dopr_index(var_count)          = pr_palm + cs_pr_count_sp +                        &
     1116                                                 cs_pr_count_fl_sgs + cs_pr_count_fl_res
    11121117                dopr_unit                      = 'ppm'
    11131118                IF ( spec_name(1:2) == 'PM')  THEN
    11141119                   dopr_unit = 'kg m-3'
    11151120                ENDIF
    1116                 hom(:,2, dopr_index(var_count),:) = SPREAD( zu, 2, statistic_regions+1 )
     1121                hom(:,2,dopr_index(var_count),:) = SPREAD( zu, 2, statistic_regions+1 )
    11171122                unit                              = dopr_unit
    11181123
     
    11251130          IF ( TRIM( variable(1:5) ) == 'kc_w"' )  THEN
    11261131             DO  lsp = 1, nspec
    1127                 index_start = INDEX( TRIM( variable ), TRIM( chem_species(lsp)%name ) )
    11281132                index_end   = LEN( TRIM( variable ) ) - 1
    1129                 IF ( index_start /= 0 )  THEN
    1130                    spec_name = TRIM( variable(index_start:index_end) )
    1131                    IF ( TRIM( spec_name ) == TRIM( chem_species(lsp)%name ) )  THEN
    1132                       cs_pr_count_fl_sgs                     = cs_pr_count_fl_sgs + 1
    1133                       cs_pr_index_fl_sgs(cs_pr_count_fl_sgs) = lsp
    1134                       dopr_index(var_count)                  = pr_palm + cs_pr_count_sp +          &
    1135                                                                cs_pr_count_fl_sgs +                &
    1136                                                                cs_pr_count_fl_res
    1137                       dopr_unit                              = 'm ppm s-1'
    1138                       IF ( spec_name(1:2) == 'PM')  THEN
    1139                          dopr_unit = 'kg m-2 s-1'
    1140                       ENDIF
    1141                       hom(:,2, dopr_index(var_count),:)    = SPREAD( zu, 2, statistic_regions+1 )
    1142                       unit                                 = dopr_unit
    1143 
    1144                       hom_index_fl_sgs(cs_pr_count_fl_sgs) = dopr_index(var_count)
     1133                index_start = 6
     1134                spec_name = TRIM( variable(index_start:index_end) )
     1135                IF ( TRIM( spec_name ) == TRIM( chem_species(lsp)%name ) )  THEN
     1136                   cs_pr_count_fl_sgs                     = cs_pr_count_fl_sgs + 1
     1137                   cs_pr_index_fl_sgs(cs_pr_count_fl_sgs) = lsp
     1138                   dopr_index(var_count)                  = pr_palm + cs_pr_count_sp +          &
     1139                                                            cs_pr_count_fl_sgs +                &
     1140                                                            cs_pr_count_fl_res
     1141                   dopr_unit                              = 'm ppm s-1'
     1142                   IF ( spec_name(1:2) == 'PM')  THEN
     1143                      dopr_unit = 'kg m-2 s-1'
    11451144                   ENDIF
     1145                   hom(:,2,dopr_index(var_count),:)     = SPREAD( zu, 2, statistic_regions+1 )
     1146                   unit                                 = dopr_unit
     1147
     1148                   hom_index_fl_sgs(cs_pr_count_fl_sgs) = dopr_index(var_count)
    11461149                ENDIF
    11471150             ENDDO
     
    11521155             spec_name = TRIM( variable(6:) )
    11531156             DO  lsp = 1, nspec
    1154                 index_start = INDEX( TRIM( variable ), TRIM( chem_species(lsp)%name ) )
     1157                index_start = 6
    11551158                index_end   = LEN( TRIM( variable ) ) - 1
    1156                 IF ( index_start /= 0 )  THEN
    1157                    spec_name = TRIM( variable(index_start:index_end) )
    1158                    IF ( TRIM( spec_name ) == TRIM( chem_species(lsp)%name ) )  THEN
    1159                       cs_pr_count_fl_res                     = cs_pr_count_fl_res + 1
    1160                       cs_pr_index_fl_res(cs_pr_count_fl_res) = lsp
    1161                       dopr_index(var_count)                  = pr_palm + cs_pr_count_sp +          &
    1162                                                                cs_pr_count_fl_sgs +                &
    1163                                                                cs_pr_count_fl_res
    1164                       dopr_unit                              = 'm ppm s-1'
    1165                       IF ( spec_name(1:2) == 'PM')  THEN
    1166                          dopr_unit = 'kg m-2 s-1'
    1167                       ENDIF
    1168                       hom(:,2, dopr_index(var_count),:)    = SPREAD( zu, 2, statistic_regions+1 )
    1169                       unit                                 = dopr_unit
    1170 
    1171                       hom_index_fl_res(cs_pr_count_fl_res) = dopr_index(var_count)
     1159                spec_name = TRIM( variable(index_start:index_end) )
     1160                IF ( TRIM( spec_name ) == TRIM( chem_species(lsp)%name ) )  THEN
     1161                   cs_pr_count_fl_res                     = cs_pr_count_fl_res + 1
     1162                   cs_pr_index_fl_res(cs_pr_count_fl_res) = lsp
     1163                   dopr_index(var_count)                  = pr_palm + cs_pr_count_sp +             &
     1164                                                            cs_pr_count_fl_sgs +                   &
     1165                                                            cs_pr_count_fl_res
     1166                   dopr_unit                              = 'm ppm s-1'
     1167                   IF ( spec_name(1:2) == 'PM')  THEN
     1168                      dopr_unit = 'kg m-2 s-1'
    11721169                   ENDIF
     1170                   hom(:,2, dopr_index(var_count),:)    = SPREAD( zu, 2, statistic_regions+1 )
     1171                   unit                                 = dopr_unit
     1172
     1173                   hom_index_fl_res(cs_pr_count_fl_res) = dopr_index(var_count)
    11731174                ENDIF
    11741175             ENDDO
     
    27102711    i = 1
    27112712
    2712     DO  WHILE ( data_output_pr(i)  /= ' '  .AND.  i <= 100 )
    2713 
     2713    DO  WHILE ( data_output_pr(i)  /= ' '  .AND.  i <= SIZE( data_output_pr ) )
    27142714       IF ( TRIM( data_output_pr(i)(1:3) ) == 'kc_' )  THEN
    27152715          max_pr_cs_tmp = max_pr_cs_tmp+1
  • palm/trunk/SOURCE/init_grid.f90

    r4564 r4601  
    2020! Current revisions:
    2121! -----------------
    22 ! 
    23 ! 
     22!
     23!
    2424! Former revisions:
    2525! -----------------
    2626! $Id$
     27! Minor formatting adjustments
     28!
     29! 4564 2020-06-12 14:03:36Z raasch
    2730! Vertical nesting method of Huq et al. (2019) removed
    2831!
     
    281284                                   'dz_stretch_level_end + 1 = ',              &
    282285                                   number_stretch_level_end+1
    283           CALL message( 'init_grid', 'PA0156', 1, 2, 0, 6, 0 )
     286       CALL message( 'init_grid', 'PA0156', 1, 2, 0, 6, 0 )
    284287    ENDIF
    285288   
     
    294297                                   'dz_stretch_level_start = ',                &
    295298                                   number_stretch_level_start
    296           CALL message( 'init_grid', 'PA0211', 1, 2, 0, 6, 0 )
     299       CALL message( 'init_grid', 'PA0211', 1, 2, 0, 6, 0 )
    297300    ENDIF
    298301   
     
    307310                                   'values for dz_stretch_level_end = ',       &
    308311                                   number_stretch_level_end
    309           CALL message( 'init_grid', 'PA0216', 1, 2, 0, 6, 0 )
     312       CALL message( 'init_grid', 'PA0216', 1, 2, 0, 6, 0 )
    310313    ENDIF
    311314
     
    345348       IF ( ANY( min_dz_stretch_level_end(1:number_stretch_level_start) >      &
    346349                 dz_stretch_level_end(1:number_stretch_level_start) ) ) THEN
    347              message_string= 'Each dz_stretch_level_end has to be larger ' //  &
    348                              'than its corresponding value for &' //           &
    349                              'dz_stretch_level_start + 4*MAX(dz(n),dz(n+1)) '//&
    350                              'to allow for smooth grid stretching'
    351              CALL message( 'init_grid', 'PA0224', 1, 2, 0, 6, 0 )
     350          message_string= 'Each dz_stretch_level_end has to be larger ' //     &
     351                          'than its corresponding value for &' //              &
     352                          'dz_stretch_level_start + 4*MAX(dz(n),dz(n+1)) '//   &
     353                          'to allow for smooth grid stretching'
     354          CALL message( 'init_grid', 'PA0224', 1, 2, 0, 6, 0 )
    352355       ENDIF
    353356       
     
    359362          WRITE( message_string, * ) 'Each dz_stretch_level_start has to be ',&
    360363                                     'larger than ', dz(1) * 1.5
    361              CALL message( 'init_grid', 'PA0226', 1, 2, 0, 6, 0 )
     364          CALL message( 'init_grid', 'PA0226', 1, 2, 0, 6, 0 )
    362365       ENDIF
    363366
  • palm/trunk/SOURCE/surface_data_output_mod.f90

    r4600 r4601  
    2525! -----------------
    2626! $Id$
     27! Minor simplification in name creation for IO variables in restart files.
     28!
     29! 4600 2020-07-13 18:50:12Z suehring
    2730! - Change: adjustmens for mpi-io - surface data is transformed to a 2D-based surface array
    2831!   before writing.
     
    47014704
    47024705    DO  nv = 1, dosurf_no(1)
    4703        IF ( nv < 10                     )  WRITE( dum, '(I1)') nv
    4704        IF ( nv < 100   .AND.  nv >= 10  )  WRITE( dum, '(I2)') nv
    4705        IF ( nv < 1000  .AND.  nv >= 100 )  WRITE( dum, '(I3)') nv
     4706       WRITE( dum, '(I3.3)' )  nv
    47064707
    47074708       CALL rd_mpi_io_check_array( 'surfaces%var_av' // TRIM( dum ), found = array_found )
     
    49544955             ENDDO
    49554956
    4956              IF ( nv < 10                     )  WRITE( dum, '(I1)') nv
    4957              IF ( nv < 100   .AND.  nv >= 10  )  WRITE( dum, '(I2)') nv
    4958              IF ( nv < 1000  .AND.  nv >= 100 )  WRITE( dum, '(I3)') nv
     4957             WRITE( dum, '(I3.3)' )  nv
    49594958
    49604959             CALL wrd_mpi_io_surface( 'surfaces%var_av' // TRIM( dum ), surf_out )
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.