Changeset 4298 for palm/trunk


Ignore:
Timestamp:
Nov 21, 2019 3:59:16 PM (21 months ago)
Author:
suehring
Message:

Bugfixes: Calculation of 2-m temperature adjusted to the case the 2-m level is above the first grid level; salsa: close netcdf input files after reading; open netcdf input files with read-only attribute instead of write attribute

Location:
palm/trunk/SOURCE
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • palm/trunk/SOURCE/netcdf_data_input_mod.f90

    r4280 r4298  
    2525! -----------------
    2626! $Id$
     27! Open input files with read-only attribute instead of write attribute.
     28!
     29! 4280 2019-10-29 14:34:15Z monakurppa
    2730! Remove id_emis flags from get_variable_4d_to_3d_real and
    2831! get_variable_5d_to_4d_real
     
    41544157#if defined( __netcdf4_parallel )
    41554158!
    4156 !--    If __netcdf4_parallel is defined, parrallel NetCDF will be used
    4157 !--    unconditionally
    4158        nc_stat = NF90_OPEN( filename, IOR( NF90_WRITE, NF90_MPIIO ), id,  &
     4159!--    If __netcdf4_parallel is defined, parrallel NetCDF will be used.
     4160       nc_stat = NF90_OPEN( filename, IOR( NF90_NOWRITE, NF90_MPIIO ), id,     &
    41594161                            COMM = comm2d, INFO = MPI_INFO_NULL )
    41604162!
    4161 !--    Check for possible Netcdf 3 file.
     4163!--    In case the previous open call fails, check for possible Netcdf 3 file,
     4164!--    and open it. However, this case, disable parallel access.
    41624165       IF( nc_stat /= NF90_NOERR )  THEN
    41634166          nc_stat = NF90_OPEN( filename, NF90_NOWRITE, id )
     
    41674170       ENDIF
    41684171#else
    4169 !      All MPI processes open und read
     4172!
     4173!--    All MPI processes open the file and read it (but not in parallel).
    41704174       nc_stat = NF90_OPEN( filename, NF90_NOWRITE, id )
    41714175#endif
  • palm/trunk/SOURCE/salsa_mod.f90

    r4295 r4298  
    2626! -----------------
    2727! $Id$
     28! Bugfix, close netcdf input files after reading
     29!
     30! 4295 2019-11-14 06:15:31Z monakurppa
    2831!
    2932!
     
    21542157
    21552158          DEALLOCATE( pr_z, pr_mass_fracs_a, pr_mass_fracs_b )
     2159!
     2160!--       Close input file
     2161          CALL close_input_file( id_dyn )
    21562162
    21572163       ELSE
     
    21592165                           ' for SALSA missing!'
    21602166          CALL message( 'salsa_mod: aerosol_init', 'PA0607', 1, 2, 0, 6, 0 )
    2161 !
    2162 !--       Close input file
    2163           CALL close_input_file( id_dyn )
     2167
    21642168       ENDIF   ! netcdf_extend
    21652169
     
    22532257             ENDIF
    22542258          ENDDO
     2259!
     2260!--       Close input file
     2261          CALL close_input_file( id_dyn )
    22552262
    22562263       ELSEIF ( .NOT. netcdf_extend  .AND.  .NOT.  salsa_gases_from_chem )  THEN
     
    22582265                           ' for SALSA missing!'
    22592266          CALL message( 'salsa_mod: aerosol_init', 'PA0610', 1, 2, 0, 6, 0 )
    2260 !
    2261 !--       Close input file
    2262           CALL close_input_file( id_dyn )
     2267
    22632268       ENDIF   ! netcdf_extend
    22642269#else
     
    1270212707                        'PA0662', 2, 2, 0, 6, 0 )
    1270312708       ENDIF
     12709       
     12710       CALL close_input_file( salsa_nest_offl%id_dynamic )
    1270412711#endif
    1270512712    ENDIF
  • palm/trunk/SOURCE/surface_layer_fluxes_mod.f90

    r4258 r4298  
    2626! -----------------
    2727! $Id$
     28! Calculation of 2-m temperature adjusted to the case the 2-m level is above
     29! the first grid point.
     30!
     31! 4258 2019-10-07 13:29:08Z suehring
    2832! Initialization of Obukhov lenght also at vertical surfaces (if allocated).
    2933!
     
    105109               debug_output_timestep,                                          &
    106110               do_output_at_2m, humidity,                                      &
    107                ibc_e_b, ibc_pt_b, indoor_model, initializing_actions,          &
    108                intermediate_timestep_count, intermediate_timestep_count_max,   &
     111               ibc_e_b, ibc_pt_b, indoor_model,                                &
    109112               land_surface, large_scale_forcing, lsf_surf, message_string,    &
    110113               neutral, passive_scalar, pt_surface, q_surface,                 &
    111                run_coupled, surface_pressure, simulated_time, terminate_run,   &
     114               run_coupled, surface_pressure, simulated_time,                  &
    112115               time_since_reference_point, urban_surface,                      &
    113116               use_free_convection_scaling, zeta_max, zeta_min
     
    117120
    118121    USE indices,                                                               &
    119         ONLY:  nxl, nxr, nys, nyn, nzb
     122        ONLY:  nzt
    120123
    121124    USE kinds
     
    18561859       IMPLICIT NONE
    18571860
    1858        CHARACTER (LEN = *), INTENT(IN)       :: z_char       !< string identifier to identify z level
    1859        INTEGER(iwp)                          :: i, j, k, m   !< running indices
     1861       CHARACTER (LEN = *), INTENT(IN) :: z_char !< string identifier to identify z level
     1862       INTEGER(iwp)                    :: i      !< grid index x-dimension
     1863       INTEGER(iwp)                    :: j      !< grid index y-dimension
     1864       INTEGER(iwp)                    :: k      !< grid index z-dimension
     1865       INTEGER(iwp)                    :: kk     !< running index along the z-dimension
     1866       INTEGER(iwp)                    :: m      !< running index for surface elements
    18601867
    18611868       
     
    18731880                surf%pt_10cm(m) = surf%pt_surface(m) + surf%ts(m) / kappa      &
    18741881                                   * ( LOG( 0.1_wp /  surf%z0h(m) )            &
    1875                                   - psi_h( 0.1_wp / surf%ol(m) )               &
     1882                                     - psi_h( 0.1_wp / surf%ol(m) )            &
    18761883                                     + psi_h( surf%z0h(m) / surf%ol(m) ) )
    18771884                                   
    18781885             ENDDO
    18791886
    1880 
     1887!
     1888!--       2-m temperature. Note, this is only calculated for output reasons at
     1889!--       horizontal upward-facing surfaces.
    18811890          CASE ( '2m' )
    18821891     
     
    18861895                j = surf%j(m)
    18871896                k = surf%k(m)
    1888 
    1889                 surf%pt_2m(m) = surf%pt_surface(m) + surf%ts(m) / kappa        &
     1897!
     1898!--             If 2-m level is below the first grid level, MOST is
     1899!--             used for calculation of 2-m temperature.
     1900                IF ( surf%z_mo(m) > 2.0_wp )  THEN
     1901                   surf%pt_2m(m) = surf%pt_surface(m) + surf%ts(m) / kappa     &
    18901902                                   * ( LOG( 2.0_wp /  surf%z0h(m) )            &
    18911903                                     - psi_h( 2.0_wp / surf%ol(m) )            &
    18921904                                     + psi_h( surf%z0h(m) / surf%ol(m) ) )
     1905!
     1906!--             If 2-m level is above the first grid level, 2-m temperature
     1907!--             is linearly interpolated between the two nearest vertical grid
     1908!--             levels. Note, since 2-m temperature is only computed for
     1909!--             horizontal upward-facing surfaces, only a vertical
     1910!--             interpolation is necessary.
     1911                ELSE
     1912!
     1913!--                zw(k-1) defines the height of the surface.
     1914                   kk = k
     1915                   DO WHILE ( zu(kk) - zw(k-1) < 2.0_wp  .AND.  kk <= nzt )
     1916                      kk = kk + 1
     1917                   ENDDO               
     1918!
     1919!--                kk defines the index of the first grid level >= 2m.
     1920                   surf%pt_2m(m) = pt(kk-1,j,i) +                              &
     1921                                 ( zw(k-1) + 2.0_wp - zu(kk-1)     ) *         &
     1922                                 ( pt(kk,j,i)       - pt(kk-1,j,i) ) /         &
     1923                                 ( zu(kk)           - zu(kk-1)     )
     1924                ENDIF
    18931925
    18941926             ENDDO
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.