Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/UTIL/chemistry/gasphase_preproc/kpp/src/code_matlab.c @ 3800

Last change on this file since 3800 was 2696, checked in by kanani, 7 years ago

Merge of branch palm4u into trunk
File size: 22.1 KB
Line 
1/******************************************************************************
2
3  KPP - The Kinetic PreProcessor
4        Builds simulation code for chemical kinetic systems
5
6  Copyright (C) 1995-1996 Valeriu Damian and Adrian Sandu
7  Copyright (C) 1997-2005 Adrian Sandu
8
9  KPP is free software; you can redistribute it and/or modify it under the
10  terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
11  Foundation (http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html); either version 2 of the
12  License, or (at your option) any later version.
13
14  KPP is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
15  WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
16  FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more
17  details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License along
20  with this program; if not, consult http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html or
21  write to the Free Software Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330,
22  Boston, MA  02111-1307,  USA.
23
24  Adrian Sandu
25  Computer Science Department
26  Virginia Polytechnic Institute and State University
27  Blacksburg, VA 24060
28  E-mail: sandu@cs.vt.edu
29
30******************************************************************************/
31
32
33#include "gdata.h"
34#include "code.h"
35#include <unistd.h>
36#include <string.h>
37
38#define MAX_LINE 120
39
40void FatalError( int status, char *fmt, char *buf );
41
42char *MATLAB_types[] = { "",              /* VOID */ 
43                    "INTEGER",            /* INT */
44                    "REAL",               /* FLOAT */
45                    /*"REAL(dp)", */            /* DOUBLE */
46                    "DOUBLE PRECISION",   /* DOUBLE */
47                    "CHARACTER(LEN=12)",  /* STRING */
48                    "CHARACTER(LEN=100)"  /* DOUBLESTRING */
49                  };
50
51/*************************************************************************************************/
52void MATLAB_WriteElm( NODE * n )
53{
54ELEMENT *elm;
55char * name;
56char maxi[20];
57char maxj[20];
58
59  elm = n->elm;
60  name = varTable[ elm->var ]->name;
61
62  switch( n->type ) {
63    case CONST: bprintf("%g", elm->val.cnst);
64                break;
65    case ELM:   bprintf("%s", name);
66                break;
67    case VELM:  if( elm->val.idx.i >= 0 ) sprintf( maxi, "%d", elm->val.idx.i+1 );
68                  else sprintf( maxi, "%s", varTable[ -elm->val.idx.i ]->name );
69                bprintf("%s(%s)", name, maxi ); 
70                break;
71    case MELM:  if( elm->val.idx.i >= 0 ) sprintf( maxi, "%d", elm->val.idx.i+1 );
72                  else sprintf( maxi, "%s", varTable[ -elm->val.idx.i ]->name );
73                if( elm->val.idx.j >= 0 ) sprintf( maxj, "%d", elm->val.idx.j+1 );
74                  else sprintf( maxj, "%s", varTable[ -elm->val.idx.j ]->name );
75                bprintf("%s(%s,%s)", name, maxi, maxj );
76                break;
77    case EELM:  bprintf("(%s)", elm->val.expr );
78                break;
79  }
80}
81
82/*************************************************************************************************/
83void MATLAB_WriteSymbol( int op )
84{
85  switch( op ) {
86    case ADD:   bprintf("+"); 
87                AllowBreak();
88                break;
89    case SUB:   bprintf("-"); 
90                AllowBreak();
91                break;
92    case MUL:   bprintf("*"); 
93                AllowBreak();
94                break;
95    case DIV:   bprintf("/"); 
96                AllowBreak();
97                break;
98    case POW:   bprintf("^");
99                break;         
100    case O_PAREN: bprintf("(");
101                AllowBreak();
102                break;           
103    case C_PAREN: bprintf(")");
104                break;           
105    case NONE:
106                break;           
107  }
108}
109
110/*************************************************************************************************/
111void MATLAB_WriteAssign( char *ls, char *rs )
112{
113int start;
114int linelg;
115int i, j;
116int ifound, jfound;
117char c;
118int first;
119int crtident;
120
121/* Max no of continuation lines in F95 standard is 39 */
122int number_of_lines = 1, MAX_NO_OF_LINES = 36;
123
124/*  Operator Mapping: 0xaa = '*' | 0xab = '+' | 0xac = ','
125                      0xad = '-' | 0xae ='.' | 0xaf = '/' */                 
126/* char op_mult=0xaa, op_plus=0xab, op_minus=0xad, op_dot=0xae, op_div=0xaf; */               
127char op_plus='+', op_minus='-'; /* op_mult='*', op_dot='.', op_div='/'; */           
128 
129  crtident = 3 + ident * 2;
130  bprintf("%*s%s = ", crtident, "", ls);
131  start = strlen( ls ) + 2;
132  linelg = 70 - crtident - start - 1;
133
134  first = 1;
135  while( strlen(rs) > linelg ) {
136    ifound = 0; jfound = 0;
137    if ( number_of_lines >= MAX_NO_OF_LINES ) {
138     /* If a new line needs to be started.
139          Note: the approach below will create erroneous code if the +/- is within a subexpression, e.g. for
140          A*(B+C) one cannot start a new continuation line by splitting at the + sign */
141     for( j=linelg; j>5; j-- ) /* split row here if +, -, or comma */
142       if ( ( rs[j] == op_plus )||( rs[j] == op_minus )||( rs[j]==',' ) ) { 
143        jfound = 1; i=j; break;
144        }
145    }
146    if ( ( number_of_lines < MAX_NO_OF_LINES )||( !jfound ) ) {
147     for( i=linelg; i>10; i-- ) /* split row here if operator or comma */
148       if ( ( rs[i] & 0x80 )||( rs[i]==',' ) ) {
149        ifound = 1; break;
150        }
151     if( i <= 10 ) {
152      printf("\n Warning: possible error in continuation lines for %s = ...",ls);
153      i = linelg;
154     }
155    } 
156    while ( rs[i-1] & 0x80 ) i--; /* put all operators on the next row */
157    while ( rs[i] == ',' ) i++; /* put commas on the current row */
158   
159    c = rs[i]; 
160    rs[i] = 0;
161   
162    if ( first ) { /* first line in a split row */
163      bprintf("%s", rs ); 
164      linelg++;
165      first = 0;
166    } else {/* continuation line in a split row - but not last line*/
167      bprintf(" ...\n     %*s%s", start, "", rs );                     
168      if ( jfound ) {
169         bprintf(" ;\n%*s%s = %s", crtident, "", ls, ls);
170         number_of_lines = 1;
171         }
172    } 
173    rs[i] = c;
174    rs += i;  /* jump to the first not-yet-written character */
175    number_of_lines++;
176  }
177 
178  if ( number_of_lines > MAX_NO_OF_LINES ) {
179     printf("\n Warning: %d continuation lines for %s = ...",number_of_lines,ls);
180     }
181
182  if ( first ) bprintf("%s ;\n", rs );  /* non-split row */
183          else bprintf(" ...\n     %*s%s;\n", start, "", rs ); /* last line in a split row */
184
185
186  FlushBuf();
187}
188
189
190/*************************************************************************************************/
191void MATLAB_WriteComment( char *fmt, ... )
192{
193Va_list args;
194char buf[ MAX_LINE ];
195
196  va_start( args, fmt );
197  vsprintf( buf, fmt, args );
198  va_end( args );
199 
200  fprintf( currentFile, "%c ", '%' );
201  bprintf( "%-65s\n", buf );
202
203  FlushBuf();
204}
205
206/*************************************************************************************************/
207char * MATLAB_Decl( int v )
208{
209static char buf[120];
210/* VARIABLE *var;
211char *baseType;
212char maxi[20];
213char maxj[20]; */
214
215  buf[0] = 0; return buf; /* Nothing to declare in matlab */
216/*  var = varTable[ v ];
217  baseType = MATLAB_types[ var->baseType ];
218 
219  *buf = 0;
220
221  switch( var->type ) {
222    case ELM:   sprintf( buf, "%s :: %s",
223                        baseType, var->name );
224                break;
225    case VELM: 
226                if( var->maxi > 0 ) sprintf( maxi, "%d", var->maxi );
227                  else sprintf( maxi, "%s", varTable[ -var->maxi ]->name ); 
228                if( (var->maxi == 0) ||
229                    ((var->maxi < 0) && (varTable[ -var->maxi ]->maxi == 0)) )
230                  strcat( maxi, "+1");
231                sprintf( buf, "%s, DIMENSION(%s) :: %s",       
232                        baseType, maxi, var->name );
233                break;
234    case MELM:  if( var->maxi > 0 ) sprintf( maxi, "%d", var->maxi );
235                  else sprintf( maxi, "%s", varTable[ -var->maxi ]->name ); 
236                if( (var->maxi == 0) ||
237                    ((var->maxi < 0) && (varTable[ -var->maxi ]->maxi == 0)) )
238                  strcat( maxi, "+1");
239                if( var->maxj > 0 ) sprintf( maxj, "%d", var->maxj );
240                  else sprintf( maxj, "%s", varTable[ -var->maxj ]->name ); 
241                if( (var->maxj == 0) ||
242                    ((var->maxj < 0 ) && (varTable[ -var->maxj ]->maxi == 0)) )
243                  strcat( maxj, "+1");
244                sprintf( buf, "%s, DIMENSION(%s,%s) :: %s",                     
245                         baseType, maxi, maxj,var->name ); 
246                break;
247    default:
248                printf( "Can not declare type %d\n", var->type );
249                break;
250  }
251  return buf;
252*/
253}
254
255/*************************************************************************************************/
256char * MATLAB_DeclareData( int v, void * values, int n)
257{
258int i;
259int nlines, nmax;
260int split;
261static char buf[120];
262VARIABLE *var;
263int * ival;
264double * dval;
265char ** cval;
266char *baseType;
267char maxi[20];
268char maxj[20];
269int maxCols = MAX_COLS;
270char dsbuf[55];
271 
272 int splitsize;
273 int maxi_mod;
274 int maxi_div;
275 
276 char mynumber[30];
277
278  var = varTable[ v ];
279  ival = (int*) values;
280  dval = (double *) values;
281  cval = (char **) values;
282
283  nlines = 1;
284  nmax = 1;
285  split = 0;
286  var -> maxi = max( n, 1 );
287
288  baseType = MATLAB_types[ var->baseType ];
289 
290  *buf = 0;
291
292  switch( var->type ) {                         /* changed here */
293    case ELM:   
294           /* bprintf( "  %s :: %s = ", baseType, var->name );
295                switch ( var->baseType ) {
296                  case INT: bprintf( "%d", *ival ); break;
297                  case DOUBLE: bprintf( "%f", *dval); break;
298                  case REAL: bprintf( "%lg", *dval ); break;
299                  case STRING: bprintf( "'%3s'", *cval ); break;
300                } */
301                break;
302     case VELM:
303      splitsize = 36; /*elements*/
304      maxi_mod = var->maxi % splitsize;
305      maxi_div = var->maxi / splitsize;
306
307      if( var->maxi > 0 ) sprintf( maxi, "%d", var->maxi );
308                  else sprintf( maxi, "%s", varTable[ -var->maxi ]->name ); 
309                if( (var->maxi == 0) || 
310                    ((var->maxi < 0) && (varTable[ -var->maxi ]->maxi == 0)) )
311                  strcat( maxi, "+1");
312                if( var->maxj > 0 ) sprintf( maxj, "%d", var->maxj );
313                  else sprintf( maxj, "%s", varTable[ -var->maxj ]->name ); 
314                if( (var->maxj == 0) || 
315                    ((var->maxj < 0 ) && (varTable[ -var->maxj ]->maxi == 0)) )
316                  strcat( maxj, "+1");       
317                  /* now list values */
318        /* if ( (var->baseType==STRING)||(var->baseType==DOUBLESTRING) ) {
319           bprintf( "%s(1:%s,:) = [ ... \n", var->name, maxi) ;
320        } else {
321           bprintf( "%s(1:%s) = [ ... \n", var->name, maxi) ;
322        }*/
323        if ( (var->baseType==STRING)||(var->baseType==DOUBLESTRING) ) {
324           bprintf( "%s = [ ... \n", var->name, maxi) ; 
325        } else {
326           bprintf( "%s = [ ... \n", var->name, maxi) ;
327        }
328       
329        /* if the array is defined in one piece, then the for loop will
330           go from 0 to n. Otherwise, there will be partial arrays from
331           i_from to i_to which are of size splitsize except for the
332           last one which is usually smaller and contains the rest */
333        for ( i=0; i < n; i++ ) {
334          switch( var -> baseType ) {
335          case INT:
336            bprintf( "%4d", ival[i] ); maxCols =12; break;
337          case DOUBLE:
338            sprintf(mynumber, "%12.6e",dval[i]);
339            bprintf( "  %s", mynumber ); maxCols = 5; break;
340          case REAL:
341            bprintf( "%12.6e", dval[i] ); maxCols = 5; break;
342          case STRING:
343            bprintf( "'%12s'", cval[i] ); maxCols = 3; break;
344          case DOUBLESTRING:
345            strncpy( dsbuf, cval[i], 54 ); dsbuf[54]='\0';
346            bprintf( "'%48s'", dsbuf ); maxCols=1; break;
347          }
348          if( i < n-1 ) {
349            bprintf( ";" );
350            if( (i+1) % maxCols == 0 ) {
351              bprintf( " ... \n" );
352              nlines++;
353            }
354          }
355         }
356        bprintf( " ];\n" );
357        break;
358                               
359    case MELM:  if( var->maxi > 0 ) sprintf( maxi, "%d", var->maxi );
360                  else sprintf( maxi, "%s", varTable[ -var->maxi ]->name ); 
361                if( (var->maxi == 0) || 
362                    ((var->maxi < 0) && (varTable[ -var->maxi ]->maxi == 0)) )
363                  strcat( maxi, "+1");
364                if( var->maxj > 0 ) sprintf( maxj, "%d", var->maxj );
365                  else sprintf( maxj, "%s", varTable[ -var->maxj ]->name ); 
366                if( (var->maxj == 0) || 
367                    ((var->maxj < 0 ) && (varTable[ -var->maxj ]->maxi == 0)) )
368                  strcat( maxj, "+1");
369                sprintf( buf, "%s, DIMENSION(%s,%s) :: %s\n",   /* changed here */             
370                         baseType, maxi, maxj,var->name ); 
371                break;
372    default:
373                printf( "Can not declare type %d", var->type );
374                break;
375  }
376  return buf;
377}
378
379/*************************************************************************************************/
380void MATLAB_Declare( int v )
381{
382  if( varTable[ v ]->comment ) {
383    MATLAB_WriteComment( "%s - %s", 
384                    varTable[ v ]->name, varTable[ v ]->comment );
385  }
386  FlushBuf();
387  bprintf("  %s\n", MATLAB_Decl(v) );
388
389  FlushBuf();
390}
391
392/*************************************************************************************************/
393void MATLAB_ExternDeclare( int v )
394{
395  if( varTable[ v ]->comment ) {
396    MATLAB_WriteComment( "%s - %s", 
397                    varTable[ v ]->name, varTable[ v ]->comment );
398  }
399  FlushBuf();
400  bprintf(" global %s;\n", varTable[ v ]->name );
401  FlushBuf();
402}
403
404
405/*************************************************************************************************/
406void MATLAB_GlobalDeclare( int v )
407{
408}
409
410
411/*************************************************************************************************/
412void MATLAB_DeclareConstant( int v, char *val ) 
413{
414VARIABLE *var;
415int ival;
416char dummy_val[100];           /* used just to avoid strange behaviour of
417                                  sscanf when compiled with gcc */
418                                 
419  strcpy(dummy_val,val);val = dummy_val;
420
421  var = varTable[ v ];
422 
423  if( sscanf(val, "%d", &ival) == 1 )
424    if( ival == 0 ) var->maxi = 0;
425               else var->maxi = 1;
426  else
427    var->maxi = -1;       
428 
429  if( var->comment ) 
430    MATLAB_WriteComment( "%s - %s", var->name, var->comment );
431
432  switch( var->type ) {
433    case CONST: bprintf(" global %s;",var->name, val );
434              bprintf(" %s = %s; \n", var->name, val );
435                break;       
436    default:
437                printf( "Invalid constant %d", var->type );
438                break;
439  }
440
441  FlushBuf();
442}
443
444
445/*************************************************************************************************/
446void MATLAB_WriteVecData( VARIABLE * var, int min, int max, int split ) 
447{
448char buf[80];
449
450  if( split )
451    sprintf( buf, "%6sdata( %s(i), i = %d, %d ) / &\n%5s",             
452                " ", var->name, min, max, " " );
453  else
454    sprintf( buf, "%6sdata %s / &\n%5s",
455                    " ", var->name, " " );
456                                     
457  FlushThisBuf( buf );
458  bprintf( " / \n\n" );
459  FlushBuf();       
460}
461
462/*************************************************************************************************/
463void MATLAB_DeclareDataOld( int v, int * values, int n )
464{
465int i;
466int nlines, min, max;
467int split;
468VARIABLE *var;
469int * ival;
470double * dval;
471char **cval;
472int maxCols = MAX_COLS;
473char dsbuf[55];
474
475  var = varTable[ v ];
476  ival = (int*) values;
477  dval = (double*) values;
478  cval = (char**) values;
479   
480  nlines = 1;
481  min = max = 1;
482  split = 0;
483
484  switch( var->type ) {
485     case VELM: if( n <= 0 ) break;
486               for( i = 0; i < n; i++ ) {
487                 switch( var->baseType ) {
488                   case INT: bprintf( "%3d",  ival[i] ); maxCols=12; break;
489                   case DOUBLE:
490                   case REAL:bprintf( "%5lg", dval[i] ); maxCols=8; break;
491                   case STRING:bprintf( "'%s'", cval[i] ); maxCols=5; break;
492                   case DOUBLESTRING:
493                        strncpy( dsbuf, cval[i], 54 ); dsbuf[54]='\0';
494                        bprintf( "'%48s'", dsbuf ); maxCols=1; break;
495                 }
496                 if( ( (i+1) % 12 == 0 ) && ( nlines > MAX_LINES ) ) {
497                     split = 1; nlines = 1;
498                     MATLAB_WriteVecData( var, min, max, split ); 
499                     min = max + 1;
500                 } 
501                 else { 
502                   if( i < n-1 ) bprintf( "," );
503                   if( (i+1) % maxCols == 0 ) { 
504                     bprintf( "\n%5s", " " );
505                     nlines++;                 
506                   } 
507                 } 
508                 max ++;
509               }
510               MATLAB_WriteVecData( var, min, max-1, split );
511               break;
512                                                                 
513    case ELM:  bprintf( "%6sdata %s / ", " ", var->name );
514               switch( var->baseType ) {
515                 case INT: bprintf( "%d",  *ival ); break;
516                 case DOUBLE:
517                 case REAL:bprintf( "%lg", *dval ); break;
518                 case STRING:bprintf( "'%s'", *cval ); break;
519                 case DOUBLESTRING:                     
520                        strncpy( dsbuf, *cval, 54 ); dsbuf[54]='\0';
521                        bprintf( "'%s'", dsbuf ); maxCols=1; break;
522                        /* bprintf( "'%50s'", *cval ); break; */
523               }
524               bprintf( " / \n" );
525               FlushBuf();
526               break;
527    default:
528               printf( "\n Function not defined !\n" );
529               break;
530  }
531}
532
533/*************************************************************************************************/
534void MATLAB_InitDeclare( int v, int n, void * values )
535{
536VARIABLE * var;
537
538  var = varTable[ v ];
539  var->maxi = max( n, 1 );
540
541  NewLines(1); 
542  MATLAB_DeclareData( v, values, n );
543}
544
545/*************************************************************************************************/
546void MATLAB_FunctionStart( int f, int *vars )
547{
548int i;
549int v;
550char * name;
551int narg;
552
553  name = varTable[ f ]->name;
554  narg = varTable[ f ]->maxi;
555
556  bprintf("function  " );
557  if( narg >= 1 ) {
558    v = vars[ narg-1 ];
559    bprintf("[ %s ] = ", varTable[ v ]->name );
560  }
561  bprintf(" %s_%s ( ", rootFileName, name );
562  for( i = 0; i < narg-1; i++ ) {
563    v = vars[ i ];
564    bprintf("%s ", varTable[ v ]->name );
565    if (i<narg-2) bprintf(", ");
566  }
567  bprintf(")\n");
568
569  FlushBuf();
570}                 
571
572/*************************************************************************************************/
573void MATLAB_FunctionPrototipe( int f, ... )
574{
575char * name;
576int narg;
577
578  name = varTable[ f ]->name;
579  narg = varTable[ f ]->maxi;
580
581  bprintf("      EXTERNAL %s\n", name );
582
583  FlushBuf();
584}
585
586/*************************************************************************************************/
587void MATLAB_FunctionBegin( int f, ... )
588{
589Va_list args;
590int i;
591int vars[20];
592char * name;
593int narg;
594char buf[200];
595time_t t;
596
597  name = varTable[ f ]->name;
598  narg = varTable[ f ]->maxi;
599
600 /*Adi - each Matlab functin requires a separate file*/
601  sprintf( buf, "%s_%s.m", rootFileName, varTable[ f ]->name ); 
602  mex_funFile = fopen(buf, "w");
603  if( mex_funFile == 0 ) {
604    FatalError(3,"%s: Can't create file", buf );
605  } 
606  UseFile( mex_funFile );
607 /*Adi*/
608 
609   
610  Va_start( args, f );
611  for( i = 0; i < narg; i++ ) 
612    vars[ i ] = va_arg( args, int );
613  va_end( args );
614   
615  CommentFncBegin( f, vars );
616 
617  WriteDelim();
618  WriteComment("");
619  WriteComment("Generated by KPP - symbolic chemistry Kinetics PreProcessor" );
620  WriteComment("    KPP is developed at CGRER labs University of Iowa by" );
621  WriteComment("    Valeriu Damian & Adrian Sandu" );
622  WriteComment("");
623  WriteComment("%-20s : %s", "File", buf  );
624  strcpy( buf, (char*)ctime( &t ) ); 
625  buf[ (int)strlen(buf) - 1 ] = 0;
626  WriteComment("%-20s : %s", "Time", buf );
627  WriteComment("%-20s : %s", "Working directory", getcwd(buf, 200) );
628  WriteComment("%-20s : %s", "Equation file", eqFileName );
629  WriteComment("%-20s : %s", "Output root filename", rootFileName );
630  WriteComment("");
631  WriteDelim();
632  NewLines(1);
633 
634  MATLAB_FunctionStart( f, vars );
635  NewLines(1);
636
637  FlushBuf();
638
639  MapFunctionComment( f, vars );
640}
641
642/*************************************************************************************************/
643void MATLAB_FunctionEnd( int f )
644{
645  bprintf("      \nreturn\n\n");
646
647  FlushBuf();
648
649  CommentFunctionEnd( f );
650 
651 /*Adi*/
652  fclose(mex_funFile);
653 
654
655}
656
657/*************************************************************************************************/
658void MATLAB_Inline( char *fmt, ... )
659{
660Va_list args;
661char buf[ 1000 ];
662
663  if( useLang != MATLAB_LANG ) return;
664 
665  Va_start( args, fmt );
666  vsprintf( buf, fmt, args );
667  va_end( args );
668  bprintf( "%s\n", buf );
669 
670  FlushBuf();
671}
672
673/*************************************************************************************************/
674void Use_MATLAB()
675{ 
676  WriteElm          = MATLAB_WriteElm;
677  WriteSymbol       = MATLAB_WriteSymbol; 
678  WriteAssign       = MATLAB_WriteAssign;
679  WriteComment      = MATLAB_WriteComment;
680  DeclareConstant   = MATLAB_DeclareConstant;
681  Declare           = MATLAB_Declare;
682  ExternDeclare     = MATLAB_ExternDeclare;
683  GlobalDeclare     = MATLAB_GlobalDeclare;
684  InitDeclare       = MATLAB_InitDeclare;
685
686  FunctionStart     = MATLAB_FunctionStart;
687  FunctionPrototipe = MATLAB_FunctionPrototipe;
688  FunctionBegin     = MATLAB_FunctionBegin;
689  FunctionEnd       = MATLAB_FunctionEnd;
690
691  OpenFile( &param_headerFile,   rootFileName, "_Parameters.m","Parameter Definition File" );
692  OpenFile( &driverFile, rootFileName, "_Main.m", "Main Program File" );
693  OpenFile( &rateFile, rootFileName, "_Rates.m", 
694                   "The Reaction Rates File" );
695  if ( useStoicmat ) {
696     OpenFile( &stoichiomFile, rootFileName, "_Stoichiom.m", 
697                   "The Stoichiometric Chemical Model File" );
698     OpenFile( &sparse_stoicmFile, rootFileName, "_StoichiomSP.m", 
699                   "Sparse Stoichiometric Data Structures File" );
700  }               
701  OpenFile( &utilFile, rootFileName, "_Util.m", 
702                   "Auxiliary Routines File" );
703  OpenFile( &sparse_dataFile, rootFileName, "_Sparse.m",
704                       "Sparse Data Definition File" );
705  OpenFile( &global_dataFile, rootFileName, "_Global_defs.m", "Global Data Definition File" );
706  if ( useJacSparse ) {
707     OpenFile( &sparse_jacFile, rootFileName, "_JacobianSP.m",
708         "Sparse Jacobian Data Structures File" ); 
709  }
710  if ( useHessian ) {
711     OpenFile( &sparse_hessFile, rootFileName, "_HessianSP.m",
712         "Sparse Hessian Data Structures File" );
713  }     
714  OpenFile( &mapFile, rootFileName, ".map", 
715                   "Map File with Human-Readable Information" );
716  OpenFile( &monitorFile, rootFileName, "_Monitor.m", 
717                   "Utility Data Definition File" );
718} 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |