source: palm/trunk/SOURCE/pmc_parent_mod.f90 @ 1989

Last change on this file since 1989 was 1939, checked in by hellstea, 8 years ago

last commit documented

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 30.4 KB
Line 
1 MODULE pmc_parent
2
3!-------------------------------------------------------------------------------!
4! This file is part of PALM.
5!
6! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
7! of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
8! either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
17! Copyright 1997-2016 Leibniz Universitaet Hannover
18!-------------------------------------------------------------------------------!
19!
20! Current revisions:
21! ------------------
22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: pmc_parent_mod.f90 1939 2016-06-13 15:26:42Z gronemeier $
27!
28! 1938 2016-06-13 15:26:05Z hellstea
29! Minor clean up.
30!
31! 1901 2016-05-04 15:39:38Z raasch
32! Module renamed. Code clean up. The words server/client changed to parent/child.
33!
34! 1900 2016-05-04 15:27:53Z raasch
35! re-formatted to match PALM style
36!
37! 1850 2016-04-08 13:29:27Z maronga
38! Module renamed
39!
40!
41! 1833 2016-04-07 14:23:03Z raasch
42! gfortran requires pointer attributes for some array declarations,
43! long line wrapped
44!
45! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
46! MPI module used by default on all machines
47!
48! 1797 2016-03-21 16:50:28Z raasch
49! introduction of different datatransfer modes
50!
51! 1791 2016-03-11 10:41:25Z raasch
52! Debug write-statements commented out
53!
54! 1786 2016-03-08 05:49:27Z raasch
55! change in child-parent data transfer: parent now gets data from child
56! instead that child put's it to the parent
57!
58! 1779 2016-03-03 08:01:28Z raasch
59! kind=dp replaced by wp,
60! error messages removed or changed to PALM style, dim_order removed
61! array management changed from linked list to sequential loop
62!
63! 1766 2016-02-29 08:37:15Z raasch
64! modifications to allow for using PALM's pointer version
65! +new routine pmc_s_set_active_data_array
66!
67! 1764 2016-02-28 12:45:19Z raasch
68! cpp-statement added (nesting can only be used in parallel mode)
69!
70! 1762 2016-02-25 12:31:13Z hellstea
71! Initial revision by K. Ketelsen
72!
73! Description:
74! ------------
75!
76! Parent part of Palm Model Coupler
77!-------------------------------------------------------------------------------!
78
79#if defined( __parallel )
80    USE, INTRINSIC ::  ISO_C_BINDING
81
82#if defined( __mpifh )
83    INCLUDE "mpif.h"
84#else
85    USE MPI
86#endif
87    USE kinds
88    USE pmc_general,                                                            &
89        ONLY: arraydef, childdef, da_namedef, da_namelen, pedef,                &
90              pmc_g_setname, pmc_max_array, pmc_max_models, pmc_sort
91
92    USE pmc_handle_communicator,                                                &
93        ONLY: m_model_comm,m_model_rank,m_model_npes, m_to_child_comm,          &
94              m_world_rank, pmc_parent_for_child
95
96    USE pmc_mpi_wrapper,                                                        &
97        ONLY: pmc_alloc_mem, pmc_bcast, pmc_time
98
99   IMPLICIT NONE
100
101   PRIVATE
102   SAVE
103
104   TYPE childindexdef
105      INTEGER                              ::  nrpoints       !<
106      INTEGER, DIMENSION(:,:), ALLOCATABLE ::  index_list_2d  !<
107   END TYPE childindexdef
108
109   TYPE(childdef), DIMENSION(pmc_max_models)       ::  children     !<
110   TYPE(childindexdef), DIMENSION(pmc_max_models)  ::  indchildren  !<
111
112   INTEGER ::  next_array_in_list = 0  !<
113
114
115   PUBLIC pmc_parent_for_child
116
117
118   INTERFACE pmc_parentinit
119      MODULE PROCEDURE  pmc_parentinit
120   END INTERFACE pmc_parentinit
121
122    INTERFACE pmc_s_set_2d_index_list
123        MODULE PROCEDURE pmc_s_set_2d_index_list
124    END INTERFACE pmc_s_set_2d_index_list
125
126    INTERFACE pmc_s_clear_next_array_list
127        MODULE PROCEDURE pmc_s_clear_next_array_list
128    END INTERFACE pmc_s_clear_next_array_list
129
130    INTERFACE pmc_s_getnextarray
131        MODULE PROCEDURE pmc_s_getnextarray
132    END INTERFACE pmc_s_getnextarray
133
134    INTERFACE pmc_s_set_dataarray
135        MODULE PROCEDURE pmc_s_set_dataarray_2d
136        MODULE PROCEDURE pmc_s_set_dataarray_3d
137    END INTERFACE pmc_s_set_dataarray
138
139    INTERFACE pmc_s_setind_and_allocmem
140        MODULE PROCEDURE pmc_s_setind_and_allocmem
141    END INTERFACE pmc_s_setind_and_allocmem
142
143    INTERFACE pmc_s_fillbuffer
144        MODULE PROCEDURE pmc_s_fillbuffer
145    END INTERFACE pmc_s_fillbuffer
146
147    INTERFACE pmc_s_getdata_from_buffer
148        MODULE PROCEDURE pmc_s_getdata_from_buffer
149    END INTERFACE pmc_s_getdata_from_buffer
150
151    INTERFACE pmc_s_set_active_data_array
152        MODULE PROCEDURE pmc_s_set_active_data_array
153    END INTERFACE pmc_s_set_active_data_array
154
155    PUBLIC pmc_parentinit, pmc_s_clear_next_array_list, pmc_s_fillbuffer,       &
156           pmc_s_getdata_from_buffer, pmc_s_getnextarray,                       &
157           pmc_s_setind_and_allocmem, pmc_s_set_active_data_array,              &
158           pmc_s_set_dataarray, pmc_s_set_2d_index_list
159
160 CONTAINS
161
162
163 SUBROUTINE pmc_parentinit
164
165    IMPLICIT NONE
166
167    INTEGER ::  childid   !<
168    INTEGER ::  i         !<
169    INTEGER ::  j         !<
170    INTEGER ::  istat     !<
171
172
173    DO  i = 1, SIZE( pmc_parent_for_child )-1
174
175       childid = pmc_parent_for_child( i )
176
177       children(childid)%model_comm = m_model_comm
178       children(childid)%inter_comm = m_to_child_comm(childid)
179
180!
181!--    Get rank and size
182       CALL MPI_COMM_RANK( children(childid)%model_comm,                        &
183                           children(childid)%model_rank, istat )
184       CALL MPI_COMM_SIZE( children(childid)%model_comm,                        &
185                           children(childid)%model_npes, istat )
186       CALL MPI_COMM_REMOTE_SIZE( children(childid)%inter_comm,                 &
187                                  children(childid)%inter_npes, istat )
188
189!
190!--    Intra communicater is used for MPI_GET
191       CALL MPI_INTERCOMM_MERGE( children(childid)%inter_comm, .FALSE.,         &
192                                 children(childid)%intra_comm, istat )
193       CALL MPI_COMM_RANK( children(childid)%intra_comm,                        &
194                           children(childid)%intra_rank, istat )
195
196       ALLOCATE( children(childid)%pes(children(childid)%inter_npes))
197
198!
199!--    Allocate array of TYPE arraydef for all child PEs to store information
200!--    of the transfer array
201       DO  j = 1, children(childid)%inter_npes
202         ALLOCATE( children(childid)%pes(j)%array_list(pmc_max_array) )
203       ENDDO
204
205       CALL get_da_names_from_child (childid)
206
207    ENDDO
208
209 END SUBROUTINE pmc_parentinit
210
211
212
213 SUBROUTINE pmc_s_set_2d_index_list( childid, index_list )
214
215     IMPLICIT NONE
216
217     INTEGER, INTENT(IN)                    :: childid     !<
218     INTEGER, DIMENSION(:,:), INTENT(INOUT) :: index_list  !<
219
220     INTEGER ::  ian    !<
221     INTEGER ::  ic     !<
222     INTEGER ::  ie     !<
223     INTEGER ::  ip     !<
224     INTEGER ::  is     !<
225     INTEGER ::  istat  !<
226     INTEGER ::  n      !<
227
228
229     IF ( m_model_rank == 0 )  THEN
230
231!
232!--     Sort to ascending parent PE order
233        CALL pmc_sort( index_list, 6 )
234
235        is = 1
236        DO  ip = 0, m_model_npes-1
237
238!
239!--        Split into parent PEs
240           ie = is - 1
241
242!
243!--        There may be no entry for this PE
244           IF ( is <= SIZE( index_list,2 )  .AND.  ie >= 0 )  THEN
245
246              DO WHILE ( index_list(6,ie+1 ) == ip )
247                 ie = ie + 1
248                 IF ( ie == SIZE( index_list,2 ) )  EXIT
249              ENDDO
250
251              ian = ie - is + 1
252
253           ELSE
254              is  = -1
255              ie  = -2
256              ian =  0
257           ENDIF
258
259!
260!--        Send data to other parent PEs
261           IF ( ip == 0 )  THEN
262              indchildren(childid)%nrpoints = ian
263              IF ( ian > 0)  THEN
264                  ALLOCATE( indchildren(childid)%index_list_2d(6,ian) )
265                  indchildren(childid)%index_list_2d(:,1:ian) =                 &
266                                                             index_list(:,is:ie)
267              ENDIF
268           ELSE
269              CALL MPI_SEND( ian, 1, MPI_INTEGER, ip, 1000, m_model_comm,       &
270                             istat )
271              IF ( ian > 0)  THEN
272                  CALL MPI_SEND( index_list(1,is), 6*ian, MPI_INTEGER, ip,      &
273                                 1001, m_model_comm, istat )
274              ENDIF
275           ENDIF
276           is = ie + 1
277
278        ENDDO
279
280     ELSE
281
282        CALL MPI_RECV( indchildren(childid)%nrpoints, 1, MPI_INTEGER, 0, 1000,  &
283                       m_model_comm, MPI_STATUS_IGNORE, istat )
284        ian = indchildren(childid)%nrpoints
285
286        IF ( ian > 0 )  THEN
287           ALLOCATE( indchildren(childid)%index_list_2d(6,ian) )
288           CALL MPI_RECV( indchildren(childid)%index_list_2d, 6*ian,            &
289                          MPI_INTEGER, 0, 1001, m_model_comm,                   &
290                          MPI_STATUS_IGNORE, istat)
291        ENDIF
292
293     ENDIF
294
295     CALL set_pe_index_list( childid, children(childid),                        &
296                             indchildren(childid)%index_list_2d,                &
297                             indchildren(childid)%nrpoints )
298
299 END SUBROUTINE pmc_s_set_2d_index_list
300
301
302
303 SUBROUTINE pmc_s_clear_next_array_list
304
305    IMPLICIT NONE
306
307    next_array_in_list = 0
308
309 END SUBROUTINE pmc_s_clear_next_array_list
310
311
312
313 LOGICAL FUNCTION pmc_s_getnextarray( childid, myname )
314
315!
316!-- List handling is still required to get minimal interaction with
317!-- pmc_interface
318!-- TODO: what does "still" mean? Is there a chance to change this!
319    CHARACTER(LEN=*), INTENT(OUT) ::  myname    !<
320    INTEGER(iwp), INTENT(IN)      ::  childid   !<
321
322    TYPE(arraydef), POINTER :: ar
323    TYPE(pedef), POINTER    :: ape
324
325    next_array_in_list = next_array_in_list + 1
326
327!
328!-- Array names are the same on all children PEs, so take first PE to get the name
329    ape => children(childid)%pes(1)
330
331    IF ( next_array_in_list > ape%nr_arrays )  THEN
332
333!
334!--    All arrays are done
335       pmc_s_getnextarray = .FALSE.
336       RETURN
337    ENDIF
338
339    ar => ape%array_list(next_array_in_list)
340    myname = ar%name
341
342!
343!-- Return true if legal array
344!-- TODO: what does this comment mean? Can there be non-legal arrays??
345    pmc_s_getnextarray = .TRUE.
346
347 END FUNCTION pmc_s_getnextarray
348
349
350
351 SUBROUTINE pmc_s_set_dataarray_2d( childid, array, array_2 )
352
353    IMPLICIT NONE
354
355    INTEGER,INTENT(IN) ::  childid   !<
356
357    REAL(wp), INTENT(IN), DIMENSION(:,:), POINTER           ::  array    !<
358    REAL(wp), INTENT(IN), DIMENSION(:,:), POINTER, OPTIONAL ::  array_2  !<
359
360    INTEGER               ::  nrdims      !<
361    INTEGER, DIMENSION(4) ::  dims        !<
362    TYPE(C_PTR)           ::  array_adr   !<
363    TYPE(C_PTR)           ::  second_adr  !<
364
365
366    dims      = 1
367    nrdims    = 2
368    dims(1)   = SIZE( array,1 )
369    dims(2)   = SIZE( array,2 )
370    array_adr = C_LOC( array )
371
372    IF ( PRESENT( array_2 ) )  THEN
373       second_adr = C_LOC(array_2)
374       CALL pmc_s_setarray( childid, nrdims, dims, array_adr,                   &
375                            second_adr = second_adr)
376    ELSE
377       CALL pmc_s_setarray( childid, nrdims, dims, array_adr )
378    ENDIF
379
380 END SUBROUTINE pmc_s_set_dataarray_2d
381
382
383
384 SUBROUTINE pmc_s_set_dataarray_3d( childid, array, nz_cl, nz, array_2 )
385
386    IMPLICIT NONE
387
388    INTEGER, INTENT(IN) ::  childid   !<
389    INTEGER, INTENT(IN) ::  nz        !<
390    INTEGER, INTENT(IN) ::  nz_cl     !<
391
392    REAL(wp), INTENT(IN), DIMENSION(:,:,:), POINTER           ::  array    !<
393    REAL(wp), INTENT(IN), DIMENSION(:,:,:), POINTER, OPTIONAL ::  array_2  !<
394
395    INTEGER               ::  nrdims      !<
396    INTEGER, DIMENSION(4) ::  dims        !<
397    TYPE(C_PTR)           ::  array_adr   !<
398    TYPE(C_PTR)           ::  second_adr  !<
399
400!
401!-- TODO: the next assignment seems to be obsolete. Please check!
402    dims      = 1
403    dims      = 0
404    nrdims    = 3
405    dims(1)   = SIZE( array,1 )
406    dims(2)   = SIZE( array,2 )
407    dims(3)   = SIZE( array,3 )
408    dims(4)   = nz_cl+dims(1)-nz  ! works for first dimension 1:nz and 0:nz+1
409
410    array_adr = C_LOC(array)
411
412!
413!-- In PALM's pointer version, two indices have to be stored internally.
414!-- The active address of the data array is set in swap_timelevel.
415    IF ( PRESENT( array_2 ) )  THEN
416      second_adr = C_LOC( array_2 )
417      CALL pmc_s_setarray( childid, nrdims, dims, array_adr,                    &
418                           second_adr = second_adr)
419    ELSE
420       CALL pmc_s_setarray( childid, nrdims, dims, array_adr )
421    ENDIF
422
423 END SUBROUTINE pmc_s_set_dataarray_3d
424
425
426
427 SUBROUTINE pmc_s_setind_and_allocmem( childid )
428
429    USE control_parameters,                                                     &
430        ONLY:  message_string
431
432    IMPLICIT NONE
433
434!
435!-- Naming convention for appendices:   _pc  -> parent to child transfer
436!--                                     _cp  -> child to parent transfer
437!--                                     send -> parent to child transfer
438!--                                     recv -> child to parent transfer
439    INTEGER, INTENT(IN) ::  childid   !<
440
441    INTEGER                        ::  arlen    !<
442    INTEGER                        ::  i        !<
443    INTEGER                        ::  ierr     !<
444    INTEGER                        ::  istat    !<
445    INTEGER                        ::  j        !<
446    INTEGER                        ::  myindex  !<
447    INTEGER                        ::  rcount   !< count MPI requests
448    INTEGER                        ::  tag      !<
449
450    INTEGER(idp)                   ::  bufsize  !< size of MPI data window
451    INTEGER(KIND=MPI_ADDRESS_KIND) ::  winsize  !<
452
453    INTEGER, DIMENSION(1024)       ::  req      !<
454
455    TYPE(C_PTR)             ::  base_ptr  !<
456    TYPE(pedef), POINTER    ::  ape       !<
457    TYPE(arraydef), POINTER ::  ar        !<
458
459    REAL(wp),DIMENSION(:), POINTER, SAVE ::  base_array_pc  !< base array for parent to child transfer
460    REAL(wp),DIMENSION(:), POINTER, SAVE ::  base_array_cp  !< base array for child to parent transfer
461
462!
463!-- Parent to child direction
464    myindex = 1
465    rcount  = 0
466    bufsize = 8
467
468!
469!-- First stride: compute size and set index
470    DO  i = 1, children(childid)%inter_npes
471
472       ape => children(childid)%pes(i)
473       tag = 200
474
475       DO  j = 1, ape%nr_arrays
476
477          ar  => ape%array_list(j)
478          IF ( ar%nrdims == 2 )  THEN
479             arlen = ape%nrele
480          ELSEIF ( ar%nrdims == 3 )  THEN
481             arlen = ape%nrele * ar%a_dim(4)
482          ELSE
483             arlen = -1
484          ENDIF
485          ar%sendindex = myindex
486
487          tag    = tag + 1
488          rcount = rcount + 1
489          CALL MPI_ISEND( myindex, 1, MPI_INTEGER, i-1, tag,                    &
490                          children(childid)%inter_comm, req(rcount), ierr )
491
492!
493!--       Maximum of 1024 outstanding requests
494!--       TODO: what does this limit mean?
495          IF ( rcount == 1024 )  THEN
496             CALL MPI_WAITALL( rcount, req, MPI_STATUSES_IGNORE, ierr )
497             rcount = 0
498          ENDIF
499
500          myindex = myindex + arlen
501          bufsize = bufsize + arlen
502          ar%sendsize = arlen
503
504       ENDDO
505
506       IF ( rcount > 0 )  THEN
507          CALL MPI_WAITALL( rcount, req, MPI_STATUSES_IGNORE, ierr )
508       ENDIF
509
510    ENDDO
511
512!
513!-- Create RMA (One Sided Communication) window for data buffer parent to
514!-- child transfer.
515!-- The buffer of MPI_GET (counterpart of transfer) can be PE-local, i.e.
516!-- it can but must not be part of the MPI RMA window. Only one RMA window is
517!-- required to prepare the data for
518!--                       parent -> child transfer on the parent side
519!-- and for
520!--                       child -> parent transfer on the child side
521    CALL pmc_alloc_mem( base_array_pc, bufsize )
522    children(childid)%totalbuffersize = bufsize * wp
523
524    winsize = bufsize * wp
525    CALL MPI_WIN_CREATE( base_array_pc, winsize, wp, MPI_INFO_NULL,             &
526                         children(childid)%intra_comm,                          &
527                         children(childid)%win_parent_child, ierr )
528
529!
530!-- Open window to set data
531    CALL MPI_WIN_FENCE( 0, children(childid)%win_parent_child, ierr )
532
533!
534!-- Second stride: set buffer pointer
535    DO  i = 1, children(childid)%inter_npes
536
537       ape => children(childid)%pes(i)
538
539       DO  j = 1, ape%nr_arrays
540
541          ar => ape%array_list(j)
542          ar%sendbuf = C_LOC( base_array_pc(ar%sendindex) )
543
544          IF ( ar%sendindex + ar%sendsize > bufsize )  THEN             
545             WRITE( message_string, '(a,i4,4i7,1x,a)' )                         &
546                    'parent buffer too small ',i,                               &
547                    ar%sendindex,ar%sendsize,ar%sendindex+ar%sendsize,          &
548                    bufsize,trim(ar%name)
549             CALL message( 'pmc_s_setind_and_allocmem', 'PA0429', 3, 2, 0, 6, 0 )
550          ENDIF
551       ENDDO
552    ENDDO
553
554!
555!-- Child to parent direction
556    bufsize = 8
557
558!
559!-- First stride: compute size and set index
560    DO  i = 1, children(childid)%inter_npes
561
562       ape => children(childid)%pes(i)
563       tag = 300
564
565       DO  j = 1, ape%nr_arrays
566
567          ar => ape%array_list(j)
568
569!
570!--       Receive index from child
571          tag = tag + 1
572          CALL MPI_RECV( myindex, 1, MPI_INTEGER, i-1, tag,                     &
573                         children(childid)%inter_comm, MPI_STATUS_IGNORE, ierr )
574
575          IF ( ar%nrdims == 3 )  THEN
576             bufsize = MAX( bufsize, ape%nrele * ar%a_dim(4) )
577          ELSE
578             bufsize = MAX( bufsize, ape%nrele )
579          ENDIF
580          ar%recvindex = myindex
581
582        ENDDO
583
584    ENDDO
585
586!
587!-- Create RMA (one sided communication) data buffer.
588!-- The buffer for MPI_GET can be PE local, i.e. it can but must not be part of
589!-- the MPI RMA window
590    CALL pmc_alloc_mem( base_array_cp, bufsize, base_ptr )
591    children(childid)%totalbuffersize = bufsize * wp
592
593    CALL MPI_BARRIER( children(childid)%intra_comm, ierr )
594
595!
596!-- Second stride: set buffer pointer
597    DO  i = 1, children(childid)%inter_npes
598
599       ape => children(childid)%pes(i)
600
601       DO  j = 1, ape%nr_arrays
602          ar => ape%array_list(j)
603          ar%recvbuf = base_ptr
604       ENDDO
605
606    ENDDO
607
608 END SUBROUTINE pmc_s_setind_and_allocmem
609
610
611
612 SUBROUTINE pmc_s_fillbuffer( childid, waittime )
613
614    IMPLICIT NONE
615
616    INTEGER, INTENT(IN)             ::  childid   !<
617
618    REAL(wp), INTENT(OUT), OPTIONAL ::  waittime  !<
619
620    INTEGER               ::  ierr     !<
621    INTEGER               ::  ij       !<
622    INTEGER               ::  ip       !<
623    INTEGER               ::  istat    !<
624    INTEGER               ::  j        !<
625    INTEGER               ::  myindex  !<
626
627    INTEGER, DIMENSION(1) ::  buf_shape
628
629    REAL(wp)                            ::  t1       !<
630    REAL(wp)                            ::  t2       !<
631    REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:)     ::  buf      !<
632    REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)   ::  data_2d  !<
633    REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  data_3d  !<
634
635    TYPE(pedef), POINTER    ::  ape  !<
636    TYPE(arraydef), POINTER ::  ar   !<
637
638!
639!-- Synchronization of the model is done in pmci_synchronize.
640!-- Therefor the RMA window can be filled without
641!-- sychronization at this point and a barrier is not necessary.
642!-- Please note that waittime has to be set in pmc_s_fillbuffer AND
643!-- pmc_c_getbuffer
644    IF ( PRESENT( waittime) )  THEN
645      t1 = pmc_time()
646      CALL MPI_BARRIER( children(childid)%intra_comm, ierr )
647      t2 = pmc_time()
648      waittime = t2- t1
649    ENDIF
650
651    DO  ip = 1, children(childid)%inter_npes
652
653       ape => children(childid)%pes(ip)
654
655       DO  j = 1, ape%nr_arrays
656
657          ar => ape%array_list(j)
658          myindex = 1
659
660          IF ( ar%nrdims == 2 )  THEN
661
662             buf_shape(1) = ape%nrele
663             CALL C_F_POINTER( ar%sendbuf, buf, buf_shape )
664             CALL C_F_POINTER( ar%data, data_2d, ar%a_dim(1:2) )
665             DO  ij = 1, ape%nrele
666                buf(myindex) = data_2d(ape%locind(ij)%j,ape%locind(ij)%i)
667                myindex = myindex + 1
668             ENDDO
669
670          ELSEIF ( ar%nrdims == 3 )  THEN
671
672             buf_shape(1) = ape%nrele*ar%a_dim(4)
673             CALL C_F_POINTER( ar%sendbuf, buf, buf_shape )
674             CALL C_F_POINTER( ar%data, data_3d, ar%a_dim(1:3) )
675             DO  ij = 1, ape%nrele
676                buf(myindex:myindex+ar%a_dim(4)-1) =                            &
677                        data_3d(1:ar%a_dim(4),ape%locind(ij)%j,ape%locind(ij)%i)
678                myindex = myindex + ar%a_dim(4)
679             ENDDO
680
681          ENDIF
682
683        ENDDO
684
685    ENDDO
686
687!
688!-- Buffer is filled
689    CALL MPI_BARRIER( children(childid)%intra_comm, ierr )
690
691 END SUBROUTINE pmc_s_fillbuffer
692
693
694
695 SUBROUTINE pmc_s_getdata_from_buffer( childid, waittime )
696
697    IMPLICIT NONE
698
699    INTEGER, INTENT(IN)             ::  childid      !<
700    REAL(wp), INTENT(OUT), OPTIONAL ::  waittime     !<
701
702    INTEGER                        ::  ierr          !<
703    INTEGER                        ::  ij            !<
704    INTEGER                        ::  ip            !<
705    INTEGER                        ::  istat         !<
706    INTEGER                        ::  j             !<
707    INTEGER                        ::  myindex       !<
708    INTEGER                        ::  nr            !<
709    INTEGER                        ::  target_pe     !<
710    INTEGER(kind=MPI_ADDRESS_KIND) ::  target_disp   !<
711
712    INTEGER, DIMENSION(1)          ::  buf_shape     !<
713
714    REAL(wp)                            ::  t1       !<
715    REAL(wp)                            ::  t2       !<
716    REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:)     ::  buf      !<
717    REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:)   ::  data_2d  !<
718    REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:,:) ::  data_3d  !<
719
720    TYPE(pedef), POINTER    ::  ape  !<
721    TYPE(arraydef), POINTER ::  ar   !<
722
723
724    t1 = pmc_time()
725
726!
727!-- Wait for child to fill buffer
728    CALL MPI_BARRIER( children(childid)%intra_comm, ierr )
729    t2 = pmc_time() - t1
730    IF ( PRESENT( waittime ) )  waittime = t2
731
732!
733!-- TODO: check next statement
734!-- Fence might do it, test later
735!-- CALL MPI_WIN_FENCE( 0, children(childid)%win_parent_child, ierr)
736    CALL MPI_BARRIER( children(childid)%intra_comm, ierr )
737
738    DO  ip = 1, children(childid)%inter_npes
739
740       ape => children(childid)%pes(ip)
741
742       DO  j = 1, ape%nr_arrays
743
744          ar => ape%array_list(j)
745
746          IF ( ar%recvindex < 0 )  CYCLE
747
748          IF ( ar%nrdims == 2 )  THEN
749             nr = ape%nrele
750          ELSEIF ( ar%nrdims == 3 )  THEN
751             nr = ape%nrele * ar%a_dim(4)
752          ENDIF
753
754          buf_shape(1) = nr
755          CALL C_F_POINTER( ar%recvbuf, buf, buf_shape )
756
757!
758!--       MPI passive target RMA
759          IF ( nr > 0 )  THEN
760             target_disp = ar%recvindex - 1
761
762!
763!--          Child PEs are located behind parent PEs
764             target_pe = ip - 1 + m_model_npes
765             CALL MPI_WIN_LOCK( MPI_LOCK_SHARED, target_pe, 0,                  &
766                                children(childid)%win_parent_child, ierr )
767             CALL MPI_GET( buf, nr, MPI_REAL, target_pe, target_disp, nr,       &
768                           MPI_REAL, children(childid)%win_parent_child, ierr )
769             CALL MPI_WIN_UNLOCK( target_pe,                                    &
770                                  children(childid)%win_parent_child, ierr )
771          ENDIF
772
773          myindex = 1
774          IF ( ar%nrdims == 2 )  THEN
775
776             CALL C_F_POINTER( ar%data, data_2d, ar%a_dim(1:2) )
777             DO  ij = 1, ape%nrele
778                data_2d(ape%locind(ij)%j,ape%locind(ij)%i) = buf(myindex)
779                myindex = myindex + 1
780             ENDDO
781
782          ELSEIF ( ar%nrdims == 3 )  THEN
783
784             CALL C_F_POINTER( ar%data, data_3d, ar%a_dim(1:3))
785             DO  ij = 1, ape%nrele
786                data_3d(1:ar%a_dim(4),ape%locind(ij)%j,ape%locind(ij)%i) =      &
787                                              buf(myindex:myindex+ar%a_dim(4)-1)
788                myindex = myindex + ar%a_dim(4)
789             ENDDO
790
791          ENDIF
792
793       ENDDO
794
795    ENDDO
796
797 END SUBROUTINE pmc_s_getdata_from_buffer
798
799
800
801 SUBROUTINE get_da_names_from_child( childid )
802
803!
804!-- Get data array description and name from child
805    IMPLICIT NONE
806
807    INTEGER, INTENT(IN) ::  childid  !<
808
809    TYPE(da_namedef) ::  myname  !<
810
811    DO
812       CALL pmc_bcast( myname%couple_index, 0, comm=m_to_child_comm(childid) )
813       IF ( myname%couple_index == -1 )  EXIT
814       CALL pmc_bcast( myname%parentdesc,   0, comm=m_to_child_comm(childid) )
815       CALL pmc_bcast( myname%nameonparent, 0, comm=m_to_child_comm(childid) )
816       CALL pmc_bcast( myname%childdesc,    0, comm=m_to_child_comm(childid) )
817       CALL pmc_bcast( myname%nameonchild,  0, comm=m_to_child_comm(childid) )
818
819       CALL pmc_g_setname( children(childid), myname%couple_index,              &
820                           myname%nameonparent )
821   ENDDO
822
823 END SUBROUTINE get_da_names_from_child
824
825
826
827 SUBROUTINE pmc_s_setarray(childid, nrdims, dims, array_adr, second_adr )
828
829!
830!-- Set array for child inter PE 0
831    IMPLICIT NONE
832
833    INTEGER, INTENT(IN)               ::  childid    !<
834    INTEGER, INTENT(IN)               ::  nrdims     !<
835    INTEGER, INTENT(IN), DIMENSION(:) ::  dims       !<
836
837    TYPE(C_PTR), INTENT(IN)           :: array_adr   !<
838    TYPE(C_PTR), INTENT(IN), OPTIONAL :: second_adr  !<
839
840    INTEGER ::  i  !< local counter
841
842    TYPE(pedef), POINTER    ::  ape  !<
843    TYPE(arraydef), POINTER ::  ar   !<
844
845
846    DO  i = 1, children(childid)%inter_npes
847
848       ape => children(childid)%pes(i)
849       ar  => ape%array_list(next_array_in_list)
850       ar%nrdims = nrdims
851       ar%a_dim  = dims
852       ar%data   = array_adr
853
854       IF ( PRESENT( second_adr ) )  THEN
855          ar%po_data(1) = array_adr
856          ar%po_data(2) = second_adr
857       ELSE
858          ar%po_data(1) = C_NULL_PTR
859          ar%po_data(2) = C_NULL_PTR
860       ENDIF
861
862    ENDDO
863
864 END SUBROUTINE pmc_s_setarray
865
866
867
868 SUBROUTINE pmc_s_set_active_data_array( childid, iactive )
869
870    IMPLICIT NONE
871
872    INTEGER, INTENT(IN) ::  childid   !<
873    INTEGER, INTENT(IN) ::  iactive   !<
874
875    INTEGER :: i   !<
876    INTEGER :: ip  !<
877    INTEGER :: j   !<
878
879    TYPE(pedef), POINTER    ::  ape  !<
880    TYPE(arraydef), POINTER ::  ar   !<
881
882    DO  ip = 1, children(childid)%inter_npes
883
884       ape => children(childid)%pes(ip)
885
886       DO  j = 1, ape%nr_arrays
887
888          ar => ape%array_list(j)
889          IF ( iactive == 1  .OR.  iactive == 2 )  THEN
890             ar%data = ar%po_data(iactive)
891          ENDIF
892
893       ENDDO
894
895    ENDDO
896
897 END SUBROUTINE pmc_s_set_active_data_array
898
899
900
901 SUBROUTINE set_pe_index_list( childid, mychild, index_list, nrp )
902
903    IMPLICIT NONE
904
905    INTEGER, INTENT(IN)                 ::  childid     !<
906    INTEGER, INTENT(IN), DIMENSION(:,:) ::  index_list  !<
907    INTEGER, INTENT(IN)                 ::  nrp         !<
908
909    TYPE(childdef), INTENT(INOUT)       ::  mychild     !<
910
911    INTEGER                                 :: i        !<
912    INTEGER                                 :: ierr     !<
913    INTEGER                                 :: ind      !<
914    INTEGER                                 :: indwin   !<
915    INTEGER                                 :: indwin2  !<
916    INTEGER                                 :: i2       !<
917    INTEGER                                 :: j        !<
918    INTEGER                                 :: rempe    !<
919    INTEGER(KIND=MPI_ADDRESS_KIND)          :: winsize  !<
920
921    INTEGER, DIMENSION(mychild%inter_npes)  :: remind   !<
922
923    INTEGER, DIMENSION(:), POINTER          :: remindw  !<
924    INTEGER, DIMENSION(:), POINTER          :: rldef    !<
925
926    TYPE(pedef), POINTER                    :: ape      !<
927
928!
929!-- First, count entries for every remote child PE
930    DO  i = 1, mychild%inter_npes
931       ape => mychild%pes(i)
932       ape%nrele = 0
933    ENDDO
934
935!
936!-- Loop over number of coarse grid cells
937    DO  j = 1, nrp
938       rempe = index_list(5,j) + 1   ! PE number on remote PE
939       ape => mychild%pes(rempe)
940       ape%nrele = ape%nrele + 1     ! Increment number of elements for this child PE
941    ENDDO
942
943    DO  i = 1, mychild%inter_npes
944       ape => mychild%pes(i)
945       ALLOCATE( ape%locind(ape%nrele) )
946    ENDDO
947
948    remind = 0
949
950!
951!-- Second, create lists
952!-- Loop over number of coarse grid cells
953    DO  j = 1, nrp
954       rempe = index_list(5,j) + 1
955       ape => mychild%pes(rempe)
956       remind(rempe)     = remind(rempe)+1
957       ind               = remind(rempe)
958       ape%locind(ind)%i = index_list(1,j)
959       ape%locind(ind)%j = index_list(2,j)
960    ENDDO
961
962!
963!-- Prepare number of elements for children PEs
964    CALL pmc_alloc_mem( rldef, mychild%inter_npes*2 )
965
966!
967!-- Number of child PEs * size of INTEGER (i just arbitrary INTEGER)
968    winsize = mychild%inter_npes*c_sizeof(i)*2
969
970    CALL MPI_WIN_CREATE( rldef, winsize, iwp, MPI_INFO_NULL,                    &
971                         mychild%intra_comm, indwin, ierr )
972
973!
974!-- Open window to set data
975    CALL MPI_WIN_FENCE( 0, indwin, ierr )
976
977    rldef(1) = 0            ! index on remote PE 0
978    rldef(2) = remind(1)    ! number of elements on remote PE 0
979
980!
981!-- Reserve buffer for index array
982    DO  i = 2, mychild%inter_npes
983       i2          = (i-1) * 2 + 1
984       rldef(i2)   = rldef(i2-2) + rldef(i2-1) * 2  ! index on remote PE
985       rldef(i2+1) = remind(i)                      ! number of elements on remote PE
986    ENDDO
987
988!
989!-- Close window to allow child to access data
990    CALL MPI_WIN_FENCE( 0, indwin, ierr )
991
992!
993!-- Child has retrieved data
994    CALL MPI_WIN_FENCE( 0, indwin, ierr )
995
996    i2 = 2 * mychild%inter_npes - 1
997    winsize = ( rldef(i2) + rldef(i2+1) ) * 2
998
999!
1000!-- Make sure, MPI_ALLOC_MEM works
1001    winsize = MAX( winsize, 1 )
1002
1003    CALL pmc_alloc_mem( remindw, INT( winsize ) )
1004
1005    CALL MPI_BARRIER( m_model_comm, ierr )
1006    CALL MPI_WIN_CREATE( remindw, winsize*c_sizeof(i), iwp, MPI_INFO_NULL,      &
1007                         mychild%intra_comm, indwin2, ierr )
1008!
1009!-- Open window to set data
1010    CALL MPI_WIN_FENCE( 0, indwin2, ierr )
1011
1012!
1013!-- Create the 2D index list
1014    DO  j = 1, nrp
1015       rempe = index_list(5,j) + 1    ! PE number on remote PE
1016       ape => mychild%pes(rempe)
1017       i2    = rempe * 2 - 1
1018       ind   = rldef(i2) + 1
1019       remindw(ind)   = index_list(3,j)
1020       remindw(ind+1) = index_list(4,j)
1021       rldef(i2)      = rldef(i2)+2
1022    ENDDO
1023
1024!
1025!-- All data are set
1026    CALL MPI_WIN_FENCE( 0, indwin2, ierr )
1027
1028!
1029!-- Don't know why, but this barrier is necessary before windows can be freed
1030!-- TODO: find out why this is required
1031    CALL MPI_BARRIER( mychild%intra_comm, ierr )
1032
1033    CALL MPI_WIN_FREE( indwin, ierr )
1034    CALL MPI_WIN_FREE( indwin2, ierr )
1035
1036!
1037!-- TODO: check if the following idea needs to be done
1038!-- Sollte funktionieren, Problem mit MPI implementation
1039!-- https://www.lrz.de/services/software/parallel/mpi/onesided
1040!-- CALL MPI_Free_mem (remindw, ierr)
1041
1042 END SUBROUTINE set_pe_index_list
1043
1044#endif
1045 END MODULE pmc_parent
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.