source: palm/trunk/SOURCE/parin.f90 @ 493

Last change on this file since 493 was 493, checked in by raasch, 12 years ago

New:
---
Output in NetCDF4-format. New d3par-parameter netcdf_data_format.

(check_open, check_parameters, close_file, data_output_2d, data_output_3d, header, modules, netcdf, parin)

Modules to be loaded for compilation (mbuild) or job execution (mrun)
can be given in the configuration file using variable modules. Example:

%modules ifort/11.0.069:netcdf lcsgih parallel

This method replaces the (undocumented) mpilib-variable.

WARNING: All fixed settings of modules in the scripts mbuild, mrun, and subjob
have been removed! Please set the modules variable appropriately in your
configuration file. (mbuild, mrun, subjob)

Changed:


Parameters netcdf_64bit and netcdf_64bit_3d have been removed. Use
netcdf_data_format = 2 for choosing the classic 64bit-offset format (this is
the default). The offset-format can not be set independently for the
3d-output-data any more.

Parameters netcdf_format_mask, netcdf_format_mask_av, and variables
nc_format_mask, format_parallel_io removed. They are replaced by the new
parameter netcdf_data_format. (check_open, close_file,
data_output_mask, header, init_masks, modules, parin)

Errors:


bugfix in trunk/UTIL/Makefile: forgot to compile for interpret_config

Bugfix: timeseries data have to be collected by PE0 (user_statistics)

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 15.7 KB
Line 
1 SUBROUTINE parin
2
3!------------------------------------------------------------------------------!
4! Current revisions:
5! -----------------
6! +netcdf_data_format in d3par, -netcdf_64bit, -netcdf_64bit_3d
7!
8! Former revisions:
9! -----------------
10! $Id: parin.f90 493 2010-03-01 08:30:24Z raasch $
11!
12! 449 2010-02-02 11:23:59Z raasch
13! +wall_humidityflux, wall_scalarflux
14! +ws_vertical_gradient, ws_vertical_gradient_level
15!
16! 410 2009-12-04 17:05:40Z letzel
17! masked data output: + dt_domask, mask_01~20_x|y|z, mask_01~20_x|y|z_loop,
18! mask_scale_x|y|z, masks, skip_time_domask
19!
20! 291 2009-04-16 12:07:26Z raasch
21! +local_dvrserver_running in envpar
22! Output of messages replaced by message handling routine.
23! +canyon_height, canyon_width_x, canyon_width_y, canyon_wall_left,
24! canyon_wall_south, conserve_volume_flow_mode, coupling_start_time,
25! dp_external, dp_level_b, dp_smooth, dpdxy, u_bulk, v_bulk in inipar
26! topography_grid_convention moved from userpar
27!
28! 197 2008-09-16 15:29:03Z raasch
29! +cthf,leaf_surface_concentration, scalar_exchange_coefficient
30! +inflow_damping_height, inflow_damping_width, recycling_width,
31! turbulent_inflow in inipar, -skip_time_dosp in d3par,
32! allocation of hom_sum moved from init_3d_model to here,
33! npex, npey moved from inipar to d3par, setting of myid_char_14 removed,
34! lad is allways allocated
35!
36! 138 2007-11-28 10:03:58Z letzel
37! +canopy_mode, drag_coefficient, lad_surface, lad_vertical_gradient,
38! lad_vertical_gradient_level, pch_index, plant_canopy,
39! +allocation of leaf area density field
40!
41! 108 2007-08-24 15:10:38Z letzel
42! +e_init, top_momentumflux_u|v in inipar, +dt_coupling in d3par
43!
44! 95 2007-06-02 16:48:38Z raasch
45! +bc_sa_t, bottom_salinityflux, ocean, sa_surface, sa_vertical_gradient,
46! sa_vertical_gradient_level, top_salinityflux in inipar,
47! sa_init is allocated
48!
49! 87 2007-05-22 15:46:47Z raasch
50! Size of hom increased by the maximum number of user-defined profiles,
51! var_hom renamed pr_palm
52!
53! 82 2007-04-16 15:40:52Z raasch
54! +return_addres, return_username in envpar
55!
56! 75 2007-03-22 09:54:05Z raasch
57! +dt_max, netcdf_64bit_3d, precipitation_amount_interval in d3par,
58! +loop_optimization, pt_reference in inipar, -data_output_ts,
59! moisture renamed humidity
60!
61! 20 2007-02-26 00:12:32Z raasch
62! +top_heatflux, use_top_fluxes in inipar
63!
64! 3 2007-02-13 11:30:58Z raasch
65! +netcdf_64bit_3d in d3par,
66! RCS Log replace by Id keyword, revision history cleaned up
67!
68! Revision 1.57  2007/02/11 13:11:22  raasch
69! Values of environment variables are now read from file ENVPAR instead of
70! reading them with a system call, + NAMELIST envpar
71!
72! Revision 1.1  1997/07/24 11:22:50  raasch
73! Initial revision
74!
75!
76! Description:
77! ------------
78! This subroutine reads variables controling the run from the NAMELIST files
79!------------------------------------------------------------------------------!
80
81    USE arrays_3d
82    USE averaging
83    USE control_parameters
84    USE dvrp_variables
85    USE grid_variables
86    USE indices
87    USE model_1d
88    USE pegrid
89    USE profil_parameter
90    USE statistics
91
92    IMPLICIT NONE
93
94    INTEGER ::  idum
95
96
97    NAMELIST /inipar/  adjust_mixing_length, alpha_surface, bc_e_b, bc_lr, &
98                       bc_ns, bc_p_b, bc_p_t, bc_pt_b, bc_pt_t, bc_q_b, &
99             bc_q_t,bc_s_b, bc_s_t, bc_sa_t, bc_uv_b, bc_uv_t, &
100             bottom_salinityflux, building_height, building_length_x, &
101             building_length_y, building_wall_left, building_wall_south, &
102             canopy_mode, canyon_height, canyon_width_x, canyon_width_y, &
103             canyon_wall_left, canyon_wall_south, cloud_droplets, &
104             cloud_physics, conserve_volume_flow, conserve_volume_flow_mode, &
105             coupling_start_time, cthf, cut_spline_overshoot, &
106             damp_level_1d, dissipation_1d, dp_external, dp_level_b, &
107             dp_smooth, dpdxy, drag_coefficient, dt, dt_pr_1d, &
108             dt_run_control_1d, dx, dy, dz, dz_max, dz_stretch_factor, & 
109             dz_stretch_level, e_init, e_min, end_time_1d, fft_method, &
110             galilei_transformation, grid_matching, humidity, &
111             inflow_damping_height, inflow_damping_width, &
112             inflow_disturbance_begin, inflow_disturbance_end, &
113             initializing_actions, km_constant, km_damp_max, lad_surface, &
114             lad_vertical_gradient, lad_vertical_gradient_level, &
115             leaf_surface_concentration, long_filter_factor, &
116             loop_optimization, mixing_length_1d, masks, momentum_advec, &
117             netcdf_precision, nsor_ini, nx, ny, &
118             nz, ocean, omega, outflow_damping_width, overshoot_limit_e, &
119             overshoot_limit_pt, overshoot_limit_u, overshoot_limit_v, &
120             overshoot_limit_w, passive_scalar, pch_index, phi, & 
121             plant_canopy, prandtl_layer, precipitation, pt_reference, &
122             pt_surface, pt_surface_initial_change, pt_vertical_gradient, &
123             pt_vertical_gradient_level, q_surface, q_surface_initial_change, &
124             q_vertical_gradient, q_vertical_gradient_level, radiation, &
125             random_generator, random_heatflux, recycling_width, rif_max, &
126             rif_min, roughness_length, sa_surface, sa_vertical_gradient, &
127             sa_vertical_gradient_level, scalar_advec, &
128             scalar_exchange_coefficient, statistic_regions, &
129             surface_heatflux, surface_pressure, surface_scalarflux, &
130             surface_waterflux, s_surface, s_surface_initial_change, &
131             s_vertical_gradient, s_vertical_gradient_level, timestep_scheme, &
132             topography, topography_grid_convention, top_heatflux, &
133             top_momentumflux_u, top_momentumflux_v, &
134             top_salinityflux, turbulent_inflow, ug_surface, &
135             ug_vertical_gradient, ug_vertical_gradient_level, u_bulk, &
136             ups_limit_e, ups_limit_pt, ups_limit_u, ups_limit_v, ups_limit_w, &
137             use_surface_fluxes, use_top_fluxes, use_ug_for_galilei_tr, &
138             use_upstream_for_tke, vg_surface, vg_vertical_gradient, &
139             vg_vertical_gradient_level, v_bulk, wall_adjustment, &
140             wall_heatflux, wall_humidityflux, wall_scalarflux, &
141             ws_vertical_gradient, ws_vertical_gradient_level
142
143
144    NAMELIST /d3par/   averaging_interval,  averaging_interval_pr, &
145                       call_psolver_at_all_substeps, cfl_factor, &
146                       create_disturbances, cross_normalized_x, &
147                       cross_normalized_y, cross_profiles, cross_ts_uymax, &
148                       cross_ts_uymin, cross_xtext, cycle_mg, data_output, &
149                       data_output_format, &
150                       data_output_mask_01, data_output_mask_02, &
151                       data_output_mask_03, data_output_mask_04, &
152                       data_output_mask_05, data_output_mask_06, &
153                       data_output_mask_07, data_output_mask_08, &
154                       data_output_mask_09, data_output_mask_10, &
155                       data_output_mask_11, data_output_mask_12, &
156                       data_output_mask_13, data_output_mask_14, &
157                       data_output_mask_15, data_output_mask_16, &
158                       data_output_mask_17, data_output_mask_18, &
159                       data_output_mask_19, data_output_mask_20, &
160                       data_output_pr, &
161                       data_output_2d_on_each_pe, disturbance_amplitude, &
162                       disturbance_energy_limit, disturbance_level_b, &
163                       disturbance_level_t, do2d_at_begin, do3d_at_begin, &
164                       do3d_compress, do3d_comp_prec, dt, dt_averaging_input, &
165                       dt_averaging_input_pr, dt_coupling, dt_data_output, &
166                       dt_data_output_av, dt_disturb, dt_domask, dt_dopr, &
167                       dt_dopr_listing, dt_dots, dt_do2d_xy, dt_do2d_xz, &
168                       dt_do2d_yz, dt_do3d, dt_max, dt_restart, dt_run_control,&
169                       end_time, force_print_header, &
170                       mask_scale_x, mask_scale_y, mask_scale_z, &
171                       mask_01_x, mask_02_x, mask_03_x, mask_04_x, &
172                       mask_05_x, mask_06_x, mask_07_x, mask_08_x, &
173                       mask_09_x, mask_10_x, mask_11_x, mask_12_x, &
174                       mask_13_x, mask_14_x, mask_15_x, mask_16_x, &
175                       mask_17_x, mask_18_x, mask_19_x, mask_20_x, &
176                       mask_01_y, mask_02_y, mask_03_y, mask_04_y, &
177                       mask_05_y, mask_06_y, mask_07_y, mask_08_y, &
178                       mask_09_y, mask_10_y, mask_11_y, mask_12_y, &
179                       mask_13_y, mask_14_y, mask_15_y, mask_16_y, &
180                       mask_17_y, mask_18_y, mask_19_y, mask_20_y, &
181                       mask_01_z, mask_02_z, mask_03_z, mask_04_z, &
182                       mask_05_z, mask_06_z, mask_07_z, mask_08_z, &
183                       mask_09_z, mask_10_z, mask_11_z, mask_12_z, &
184                       mask_13_z, mask_14_z, mask_15_z, mask_16_z, &
185                       mask_17_z, mask_18_z, mask_19_z, mask_20_z, &
186                       mask_01_x_loop, mask_02_x_loop, mask_03_x_loop, &
187                       mask_04_x_loop, mask_05_x_loop, mask_06_x_loop, &
188                       mask_07_x_loop, mask_08_x_loop, mask_09_x_loop, &
189                       mask_10_x_loop, mask_11_x_loop, mask_12_x_loop, &
190                       mask_13_x_loop, mask_14_x_loop, mask_15_x_loop, &
191                       mask_16_x_loop, mask_17_x_loop, mask_18_x_loop, &
192                       mask_19_x_loop, mask_20_x_loop, &
193                       mask_01_y_loop, mask_02_y_loop, mask_03_y_loop, &
194                       mask_04_y_loop, mask_05_y_loop, mask_06_y_loop, &
195                       mask_07_y_loop, mask_08_y_loop, mask_09_y_loop, &
196                       mask_10_y_loop, mask_11_y_loop, mask_12_y_loop, &
197                       mask_13_y_loop, mask_14_y_loop, mask_15_y_loop, &
198                       mask_16_y_loop, mask_17_y_loop, mask_18_y_loop, &
199                       mask_19_y_loop, mask_20_y_loop, &
200                       mask_01_z_loop, mask_02_z_loop, mask_03_z_loop, &
201                       mask_04_z_loop, mask_05_z_loop, mask_06_z_loop, &
202                       mask_07_z_loop, mask_08_z_loop, mask_09_z_loop, &
203                       mask_10_z_loop, mask_11_z_loop, mask_12_z_loop, &
204                       mask_13_z_loop, mask_14_z_loop, mask_15_z_loop, &
205                       mask_16_z_loop, mask_17_z_loop, mask_18_z_loop, &
206                       mask_19_z_loop, mask_20_z_loop, &
207                       mg_cycles, mg_switch_to_pe0_level, &
208                       netcdf_data_format, &
209                       ngsrb, normalizing_region, npex, npey, nsor, nz_do3d, &
210                       omega_sor, &
211                       prandtl_number, precipitation_amount_interval, &
212                       profile_columns, profile_rows, psolver, &
213                       rayleigh_damping_factor, rayleigh_damping_height, &
214                       residual_limit, restart_time, section_xy, section_xz, &
215                       section_yz, skip_time_data_output, &
216                       skip_time_data_output_av, skip_time_dopr, &
217                       skip_time_do2d_xy, skip_time_do2d_xz, &
218                       skip_time_do2d_yz, skip_time_do3d, skip_time_domask, &
219                       termination_time_needed, use_prior_plot1d_parameters, &
220                       z_max_do1d, z_max_do1d_normalized, z_max_do2d
221
222
223    NAMELIST /envpar/  host, local_dvrserver_running, maximum_cpu_time_allowed,  &
224                       revision, return_addres, return_username, run_identifier, &
225                       tasks_per_node, write_binary
226
227!
228!-- Open the NAMELIST-file which is send with this job
229    CALL check_open( 11 )
230
231!
232!-- Read the control parameters for initialization.
233!-- The namelist "inipar" must be provided in the NAMELIST-file. If this is
234!-- not the case and the file contains - instead of "inipar" - any other
235!-- namelist, a read error is created on t3e and control is transferred
236!-- to the statement with label 10. Therefore, on t3e machines one can not
237!-- distinguish between errors produced by a wrong "inipar" namelist or
238!-- because this namelist is totally missing.
239    READ ( 11, inipar, ERR=10, END=11 )
240    GOTO 12
241 10 message_string = 'errors in \$inipar &or no \$inipar-namelist ' // &
242                     'found (CRAY-machines only)'
243    CALL message( 'parin', 'PA0271', 1, 2, 0, 6, 0 )
244
245 11 message_string = 'no \$inipar-namelist found'
246    CALL message( 'parin', 'PA0272', 1, 2, 0, 6, 0 )
247
248!
249!-- If required, read control parameters from restart file (produced by
250!-- a prior run). All PEs are reading from file created by PE0 (see check_open)
251 12 IF ( TRIM( initializing_actions ) == 'read_restart_data' )  THEN
252
253       CALL read_var_list
254!
255!--    The restart file will be reopened when reading the subdomain data
256       CALL close_file( 13 )
257
258!
259!--    Increment the run count
260       runnr = runnr + 1
261
262    ENDIF
263
264!
265!-- Definition of names of areas used for computing statistics. They must
266!-- be defined at this place, because they are allowed to be redefined by
267!-- the user in user_parin.
268    region = 'total domain'
269
270!
271!-- Read runtime parameters given by the user for this run (namelist "d3par").
272!-- The namelist "d3par" can be omitted. In that case, default values are
273!-- used for the parameters.
274    READ ( 11, d3par, END=20 )
275
276!
277!-- Read control parameters for optionally used model software packages
278 20 CALL package_parin
279
280!
281!-- Read user-defined variables
282    CALL user_parin
283
284!
285!-- Check in case of initial run, if the grid point numbers are well defined
286!-- and allocate some arrays which are already needed in init_pegrid or
287!-- check_parameters. During restart jobs, these arrays will be allocated
288!-- in read_var_list. All other arrays are allocated in init_3d_model.
289    IF ( TRIM( initializing_actions ) /= 'read_restart_data' )  THEN
290
291       IF ( nx <= 0 )  THEN
292          WRITE( message_string, * ) 'no value or wrong value given for nx: ',&
293                                     'nx=', nx
294          CALL message( 'parin', 'PA0273', 1, 2, 0, 6, 0 )
295       ENDIF
296       IF ( ny <= 0 )  THEN
297          WRITE( message_string, * ) 'no value or wrong value given for ny: ',&
298                                     'ny=', ny
299          CALL message( 'parin', 'PA0274', 1, 2, 0, 6, 0 )
300       ENDIF
301       IF ( nz <= 0 )  THEN
302          WRITE( message_string, * ) 'no value or wrong value given for nz: ',&
303                                     'nz=', nz
304          CALL message( 'parin', 'PA0275', 1, 2, 0, 6, 0 )
305       ENDIF
306!
307!--    ATTENTION: in case of changes to the following statement please also
308!--    check the allocate statement in routine read_var_list
309       ALLOCATE( lad(0:nz+1),pt_init(0:nz+1), q_init(0:nz+1), sa_init(0:nz+1), &
310                 ug(0:nz+1), u_init(0:nz+1), v_init(0:nz+1), vg(0:nz+1),       &
311                 hom(0:nz+1,2,pr_palm+max_pr_user,0:statistic_regions),        &
312                 hom_sum(0:nz+1,pr_palm+max_pr_user,0:statistic_regions) )
313       hom = 0.0
314
315    ENDIF
316
317!
318!-- NAMELIST-file is not needed anymore
319    CALL close_file( 11 )
320
321!
322!-- Read values of environment variables (this NAMELIST file is generated by
323!-- mrun)
324    OPEN ( 90, FILE='ENVPAR', STATUS='OLD', FORM='FORMATTED', ERR=30 )
325    READ ( 90, envpar, ERR=31, END=32 )
326    CLOSE ( 90 )
327    RETURN
328
329 30 message_string = 'local file ENVPAR not found' // &
330                     '&some variables for steering may not be properly set'
331    CALL message( 'parin', 'PA0276', 0, 1, 0, 6, 0 )
332    RETURN
333
334 31 message_string = 'errors in local file ENVPAR' // &
335                     '&some variables for steering may not be properly set'
336    CALL message( 'parin', 'PA0277', 0, 1, 0, 6, 0 )
337    RETURN
338
339 32 message_string = 'no envpar-NAMELIST found in local file ENVPAR'  // &
340                     '&some variables for steering may not be properly set'
341    CALL message( 'parin', 'PA0278', 0, 1, 0, 6, 0 )
342
343 END SUBROUTINE parin
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.