source: palm/trunk/SOURCE/data_output_mask.f90 @ 1963

Last change on this file since 1963 was 1961, checked in by suehring, 8 years ago

last commit documented

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 24.6 KB
RevLine 
[1691]1!> @file data_output_mask.f90
[1320]2!--------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of PALM.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
6! of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
7! either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
8!
9! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
10! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
11! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
12!
13! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
14! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
15!
[1818]16! Copyright 1997-2016 Leibniz Universitaet Hannover
[1320]17!--------------------------------------------------------------------------------!
18!
19! Current revisions:
20! -----------------
[1961]21!
22!
[1320]23! Former revisions:
24! -----------------
25! $Id: data_output_mask.f90 1961 2016-07-12 16:37:58Z suehring $
26!
[1961]27! 1960 2016-07-12 16:34:24Z suehring
28! Separate humidity and passive scalar
29!
[1784]30! 2016-03-06 18:36:17Z raasch
31! name change of netcdf routines and module + related changes,
32! switch back of netcdf data format moved from time integration routine to here
33!
[1960]34! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
[1692]35! Added output of radiative heating rates for RRTMG
36!
[1691]37! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
38! Code annotations made doxygen readable
39!
40! 1585 2015-04-30 07:05:52Z maronga
[1586]41! Added support for RRTMG
42!
[1585]43! 1438 2014-07-22 14:14:06Z heinze
[1439]44! +nr, qc, qr
45!
[1438]46! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
[1360]47! New particle structure integrated.
48!
[1359]49! 1353 2014-04-08 15:21:23Z heinze
[1354]50! REAL constants provided with KIND-attribute
51!
[1353]52! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
[1329]53!
54!
[1321]55! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
56! ONLY-attribute added to USE-statements,
57! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
58! kinds are defined in new module kinds,
59! revision history before 2012 removed,
60! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
61! all variable declaration statements
62!
[1320]63! 1318 2014-03-17 13:35:16Z raasch
64! barrier argument removed from cpu_log,
65! module interfaces removed
66!
67! 1092 2013-02-02 11:24:22Z raasch
68! unused variables removed
69!
70! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
71! code put under GPL (PALM 3.9)
72!
73! 1031 2012-10-19 14:35:30Z raasch
74! netCDF4 without parallel file support implemented
75!
76! 1007 2012-09-19 14:30:36Z franke
77! Bugfix: calculation of pr must depend on the particle weighting factor,
78! missing calculation of ql_vp added
79!
80! 410 2009-12-04 17:05:40Z letzel
81! Initial version
82!
83! Description:
84! ------------
[1682]85!> Masked data output in netCDF format for current mask (current value of mid).
[1320]86!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]87 SUBROUTINE data_output_mask( av )
[1320]88
[1691]89 
[1682]90
[1320]91#if defined( __netcdf )
92    USE arrays_3d,                                                             &
[1960]93        ONLY:  e, nr, p, pt, q, qc, ql, ql_c, ql_v, qr, rho, s, sa, tend, u,   &
[1438]94               v, vpt, w
[1320]95   
96    USE averaging,                                                             &
[1438]97        ONLY:  e_av, lpt_av, nr_av, p_av, pc_av, pr_av, pt_av, q_av, qc_av,    &
98               ql_av, ql_c_av, ql_v_av, ql_vp_av, qv_av, qr_av, rho_av, s_av,  &
99               sa_av, u_av, v_av, vpt_av, w_av 
[1320]100   
101    USE cloud_parameters,                                                      &
102        ONLY:  l_d_cp, pt_d_t
103   
104    USE control_parameters,                                                    &
[1783]105        ONLY:  cloud_physics, domask, domask_no, domask_time_count, mask_i,    &
106               mask_j, mask_k, mask_size, mask_size_l, mask_start_l,           &
107               max_masks, message_string, mid, nz_do3d, simulated_time
[1320]108    USE cpulog,                                                                &
109        ONLY:  cpu_log, log_point
[1438]110
[1320]111    USE indices,                                                               &
112        ONLY:  nbgp, nxl, nxr, nyn, nys, nzb, nzt
113       
114    USE kinds
115   
[1783]116    USE NETCDF
[1320]117   
[1783]118    USE netcdf_interface,                                                      &
119        ONLY:  id_set_mask, id_var_domask, id_var_time_mask, nc_stat,          &
120               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[1320]121   
122    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]123        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
124               particle_advection_start, prt_count
[1320]125   
126    USE pegrid
127
[1585]128    USE radiation_model_mod,                                                   &
129        ONLY:  rad_lw_in, rad_lw_in_av, rad_lw_out, rad_lw_out_av,             &
[1691]130               rad_lw_cs_hr, rad_lw_cs_hr_av, rad_lw_hr, rad_lw_hr_av,         &
131               rad_sw_in, rad_sw_in_av, rad_sw_out, rad_sw_out_av,             &
132               rad_sw_cs_hr, rad_sw_cs_hr_av, rad_sw_hr, rad_sw_hr_av
[1585]133
[1691]134
[1320]135    IMPLICIT NONE
136
[1682]137    INTEGER(iwp) ::  av       !<
138    INTEGER(iwp) ::  ngp      !<
139    INTEGER(iwp) ::  i        !<
140    INTEGER(iwp) ::  if       !<
141    INTEGER(iwp) ::  j        !<
142    INTEGER(iwp) ::  k        !<
143    INTEGER(iwp) ::  n        !<
[1783]144    INTEGER(iwp) ::  netcdf_data_format_save !<
[1682]145    INTEGER(iwp) ::  psi      !<
146    INTEGER(iwp) ::  sender   !<
147    INTEGER(iwp) ::  ind(6)   !<
[1320]148   
[1682]149    LOGICAL ::  found         !<
150    LOGICAL ::  resorted      !<
[1320]151   
[1682]152    REAL(wp) ::  mean_r       !<
153    REAL(wp) ::  s_r2         !<
154    REAL(wp) ::  s_r3         !<
[1320]155   
[1682]156    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf    !<
[1320]157#if defined( __parallel )
[1682]158    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  total_pf    !<
[1320]159#endif
[1682]160    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !<
[1320]161
162!
163!-- Return, if nothing to output
164    IF ( domask_no(mid,av) == 0 )  RETURN
165
166    CALL cpu_log (log_point(49),'data_output_mask','start')
167
168!
[1783]169!-- Parallel netcdf output is not tested so far for masked data, hence
170!-- netcdf_data_format is switched back to non-paralell output.
171    netcdf_data_format_save = netcdf_data_format
172    IF ( netcdf_data_format == 5 ) netcdf_data_format = 3
173    IF ( netcdf_data_format == 6 ) netcdf_data_format = 4
174
175!
[1320]176!-- Open output file.
[1327]177    IF ( myid == 0  .OR.  netcdf_data_format > 4 )  THEN
[1320]178       CALL check_open( 200+mid+av*max_masks )
179    ENDIF 
180
181!
182!-- Allocate total and local output arrays.
183#if defined( __parallel )
184    IF ( myid == 0 )  THEN
185       ALLOCATE( total_pf(mask_size(mid,1),mask_size(mid,2),mask_size(mid,3)) )
186    ENDIF
187#endif
188    ALLOCATE( local_pf(mask_size_l(mid,1),mask_size_l(mid,2), &
189                       mask_size_l(mid,3)) )
190
191!
192!-- Update the netCDF time axis.
193    domask_time_count(mid,av) = domask_time_count(mid,av) + 1
[1327]194    IF ( myid == 0  .OR.  netcdf_data_format > 4 )  THEN
[1320]195       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_mask(mid,av), id_var_time_mask(mid,av), &
196                               (/ simulated_time /),                          &
197                               start = (/ domask_time_count(mid,av) /),       &
198                               count = (/ 1 /) )
[1783]199       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_mask', 460 )
[1320]200    ENDIF
201
202!
203!-- Loop over all variables to be written.
204    if = 1
205
206    DO  WHILE ( domask(mid,av,if)(1:1) /= ' ' )
207!
208!--    Reallocate local_pf on PE 0 since its shape changes during MPI exchange
209       IF ( netcdf_data_format < 5   .AND.  myid == 0  .AND.  if > 1 )  THEN
210          DEALLOCATE( local_pf )
211          ALLOCATE( local_pf(mask_size_l(mid,1),mask_size_l(mid,2), &
212                             mask_size_l(mid,3)) )
213       ENDIF
214!
215!--    Store the variable chosen.
216       resorted = .FALSE.
217       SELECT CASE ( TRIM( domask(mid,av,if) ) )
218
219          CASE ( 'e' )
220             IF ( av == 0 )  THEN
221                to_be_resorted => e
222             ELSE
223                to_be_resorted => e_av
224             ENDIF
225
226          CASE ( 'lpt' )
227             IF ( av == 0 )  THEN
228                to_be_resorted => pt
229             ELSE
230                to_be_resorted => lpt_av
231             ENDIF
232
[1438]233          CASE ( 'nr' )
234             IF ( av == 0 )  THEN
235                to_be_resorted => nr
236             ELSE
237                to_be_resorted => nr_av
238             ENDIF
239
[1320]240          CASE ( 'p' )
241             IF ( av == 0 )  THEN
242                to_be_resorted => p
243             ELSE
244                to_be_resorted => p_av
245             ENDIF
246
247          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
248             IF ( av == 0 )  THEN
249                tend = prt_count
250                CALL exchange_horiz( tend, nbgp )
251                DO  i = 1, mask_size_l(mid,1)
252                   DO  j = 1, mask_size_l(mid,2)
253                      DO  k = 1, mask_size_l(mid,3)
254                         local_pf(i,j,k) =  tend(mask_k(mid,k), &
255                                   mask_j(mid,j),mask_i(mid,i))
256                      ENDDO
257                   ENDDO
258                ENDDO
259                resorted = .TRUE.
260             ELSE
261                CALL exchange_horiz( pc_av, nbgp )
262                to_be_resorted => pc_av
263             ENDIF
264
[1359]265          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1320]266             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]267                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
268                   DO  i = nxl, nxr
269                      DO  j = nys, nyn
270                         DO  k = nzb, nz_do3d
271                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
272                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
273                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
274                            s_r2 = 0.0_wp
275                            s_r3 = 0.0_wp
276                            DO  n = 1, number_of_particles
277                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
278                                  s_r2 = s_r2 + grid_particles(k,j,i)%particles(n)%radius**2 * &
279                                         grid_particles(k,j,i)%particles(n)%weight_factor
280                                  s_r3 = s_r3 + grid_particles(k,j,i)%particles(n)%radius**3 * &
281                                         grid_particles(k,j,i)%particles(n)%weight_factor
282                               ENDIF
283                            ENDDO
284                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
285                               mean_r = s_r3 / s_r2
286                            ELSE
287                               mean_r = 0.0_wp
288                            ENDIF
289                            tend(k,j,i) = mean_r
[1320]290                         ENDDO
291                      ENDDO
292                   ENDDO
[1359]293                   CALL exchange_horiz( tend, nbgp )
294                ELSE
295                   tend = 0.0_wp
296                ENDIF
[1320]297                DO  i = 1, mask_size_l(mid,1)
298                   DO  j = 1, mask_size_l(mid,2)
299                      DO  k = 1, mask_size_l(mid,3)
300                         local_pf(i,j,k) =  tend(mask_k(mid,k), &
301                                   mask_j(mid,j),mask_i(mid,i))
302                      ENDDO
303                   ENDDO
304                ENDDO
305                resorted = .TRUE.
306             ELSE
307                CALL exchange_horiz( pr_av, nbgp )
308                to_be_resorted => pr_av
309             ENDIF
310
311          CASE ( 'pt' )
312             IF ( av == 0 )  THEN
313                IF ( .NOT. cloud_physics ) THEN
314                   to_be_resorted => pt
315                ELSE
316                   DO  i = 1, mask_size_l(mid,1)
317                      DO  j = 1, mask_size_l(mid,2)
318                         DO  k = 1, mask_size_l(mid,3)
319                            local_pf(i,j,k) =  &
320                                 pt(mask_k(mid,k),mask_j(mid,j),mask_i(mid,i)) &
321                                 + l_d_cp * pt_d_t(mask_k(mid,k)) * &
322                                   ql(mask_k(mid,k),mask_j(mid,j),mask_i(mid,i))
323                         ENDDO
324                      ENDDO
325                   ENDDO
326                   resorted = .TRUE.
327                ENDIF
328             ELSE
329                to_be_resorted => pt_av
330             ENDIF
331
332          CASE ( 'q' )
333             IF ( av == 0 )  THEN
334                to_be_resorted => q
335             ELSE
336                to_be_resorted => q_av
337             ENDIF
338
[1438]339          CASE ( 'qc' )
340             IF ( av == 0 )  THEN
341                to_be_resorted => qc
342             ELSE
343                to_be_resorted => qc_av
344             ENDIF
345
[1320]346          CASE ( 'ql' )
347             IF ( av == 0 )  THEN
348                to_be_resorted => ql
349             ELSE
350                to_be_resorted => ql_av
351             ENDIF
352
353          CASE ( 'ql_c' )
354             IF ( av == 0 )  THEN
355                to_be_resorted => ql_c
356             ELSE
357                to_be_resorted => ql_c_av
358             ENDIF
359
360          CASE ( 'ql_v' )
361             IF ( av == 0 )  THEN
362                to_be_resorted => ql_v
363             ELSE
364                to_be_resorted => ql_v_av
365             ENDIF
366
367          CASE ( 'ql_vp' )
368             IF ( av == 0 )  THEN
[1359]369                IF ( simulated_time >= particle_advection_start )  THEN
370                   DO  i = nxl, nxr
371                      DO  j = nys, nyn
372                         DO  k = nzb, nz_do3d
373                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
374                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
375                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
376                            DO  n = 1, number_of_particles
377                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
378                                  tend(k,j,i) = tend(k,j,i) + &
[1320]379                                          particles(n)%weight_factor / &
380                                          prt_count(k,j,i)
[1359]381                               ENDIF
382                            ENDDO
[1320]383                         ENDDO
384                      ENDDO
385                   ENDDO
[1359]386                   CALL exchange_horiz( tend, nbgp )
387                ELSE
388                   tend = 0.0_wp
389                ENDIF
[1320]390                DO  i = 1, mask_size_l(mid,1)
391                   DO  j = 1, mask_size_l(mid,2)
392                      DO  k = 1, mask_size_l(mid,3)
393                         local_pf(i,j,k) =  tend(mask_k(mid,k), &
394                                   mask_j(mid,j),mask_i(mid,i))
395                      ENDDO
396                   ENDDO
397                ENDDO
398                resorted = .TRUE.
399             ELSE
400                CALL exchange_horiz( ql_vp_av, nbgp )
401                to_be_resorted => ql_vp_av
402             ENDIF
403
404          CASE ( 'qv' )
405             IF ( av == 0 )  THEN
406                DO  i = 1, mask_size_l(mid,1)
407                   DO  j = 1, mask_size_l(mid,2)
408                      DO  k = 1, mask_size_l(mid,3)
409                         local_pf(i,j,k) =  &
410                              q(mask_k(mid,k),mask_j(mid,j),mask_i(mid,i)) -  &
411                              ql(mask_k(mid,k),mask_j(mid,j),mask_i(mid,i))
412                      ENDDO
413                   ENDDO
414                ENDDO
415                resorted = .TRUE.
416             ELSE
417                to_be_resorted => qv_av
418             ENDIF
419
[1438]420          CASE ( 'qr' )
421             IF ( av == 0 )  THEN
422                to_be_resorted => qr
423             ELSE
424                to_be_resorted => qr_av
425             ENDIF
426
[1691]427          CASE ( 'rad_lw_in' )
428             IF ( av == 0 )  THEN
429                to_be_resorted => rad_lw_in
430             ELSE
431                to_be_resorted => rad_lw_in_av
432             ENDIF
433
434          CASE ( 'rad_lw_out' )
435             IF ( av == 0 )  THEN
436                to_be_resorted => rad_lw_out
437             ELSE
438                to_be_resorted => rad_lw_out_av
439             ENDIF
440
441          CASE ( 'rad_lw_cs_hr' )
442             IF ( av == 0 )  THEN
443                to_be_resorted => rad_lw_cs_hr
444             ELSE
445                to_be_resorted => rad_lw_cs_hr_av
446             ENDIF
447
448          CASE ( 'rad_lw_hr' )
449             IF ( av == 0 )  THEN
450                to_be_resorted => rad_lw_hr
451             ELSE
452                to_be_resorted => rad_lw_hr_av
453             ENDIF
454
[1585]455          CASE ( 'rad_sw_in' )
456             IF ( av == 0 )  THEN
457                to_be_resorted => rad_sw_in
458             ELSE
459                to_be_resorted => rad_sw_in_av
460             ENDIF
461
462          CASE ( 'rad_sw_out' )
463             IF ( av == 0 )  THEN
464                to_be_resorted => rad_sw_out
465             ELSE
466                to_be_resorted => rad_sw_out_av
467             ENDIF
468
[1691]469          CASE ( 'rad_sw_cs_hr' )
[1585]470             IF ( av == 0 )  THEN
[1691]471                to_be_resorted => rad_sw_cs_hr
[1585]472             ELSE
[1691]473                to_be_resorted => rad_sw_cs_hr_av
[1585]474             ENDIF
475
[1691]476          CASE ( 'rad_sw_hr' )
[1585]477             IF ( av == 0 )  THEN
[1691]478                to_be_resorted => rad_sw_hr
[1585]479             ELSE
[1691]480                to_be_resorted => rad_sw_hr_av
[1585]481             ENDIF
482
[1320]483          CASE ( 'rho' )
484             IF ( av == 0 )  THEN
485                to_be_resorted => rho
486             ELSE
487                to_be_resorted => rho_av
488             ENDIF
489
490          CASE ( 's' )
491             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]492                to_be_resorted => s
[1320]493             ELSE
494                to_be_resorted => s_av
495             ENDIF
496
497          CASE ( 'sa' )
498             IF ( av == 0 )  THEN
499                to_be_resorted => sa
500             ELSE
501                to_be_resorted => sa_av
502             ENDIF
503
504          CASE ( 'u' )
505             IF ( av == 0 )  THEN
506                to_be_resorted => u
507             ELSE
508                to_be_resorted => u_av
509             ENDIF
510
511          CASE ( 'v' )
512             IF ( av == 0 )  THEN
513                to_be_resorted => v
514             ELSE
515                to_be_resorted => v_av
516             ENDIF
517
518          CASE ( 'vpt' )
519             IF ( av == 0 )  THEN
520                to_be_resorted => vpt
521             ELSE
522                to_be_resorted => vpt_av
523             ENDIF
524
525          CASE ( 'w' )
526             IF ( av == 0 )  THEN
527                to_be_resorted => w
528             ELSE
529                to_be_resorted => w_av
530             ENDIF
531
532          CASE DEFAULT
533!
534!--          User defined quantity
535             CALL user_data_output_mask(av, domask(mid,av,if), found, local_pf )
536             resorted = .TRUE.
537
538             IF ( .NOT. found )  THEN
539                WRITE ( message_string, * ) 'no output available for: ', &
540                                            TRIM( domask(mid,av,if) )
541                CALL message( 'data_output_mask', 'PA0327', 0, 0, 0, 6, 0 )
542             ENDIF
543
544       END SELECT
545
546!
547!--    Resort the array to be output, if not done above
548       IF ( .NOT. resorted )  THEN
549          DO  i = 1, mask_size_l(mid,1)
550             DO  j = 1, mask_size_l(mid,2)
551                DO  k = 1, mask_size_l(mid,3)
552                   local_pf(i,j,k) =  to_be_resorted(mask_k(mid,k), &
553                                      mask_j(mid,j),mask_i(mid,i))
554                ENDDO
555             ENDDO
556          ENDDO
557       ENDIF
558
559!
560!--    I/O block. I/O methods are implemented
561!--    (1) for parallel execution
562!--     a. with netCDF 4 parallel I/O-enabled library
563!--     b. with netCDF 3 library
564!--    (2) for serial execution.
565!--    The choice of method depends on the correct setting of preprocessor
566!--    directives __parallel and __netcdf4_parallel as well as on the parameter
567!--    netcdf_data_format.
568#if defined( __parallel )
569#if defined( __netcdf4_parallel )
570       IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
571!
572!--       (1) a. Parallel I/O using netCDF 4 (not yet tested)
573          nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_mask(mid,av),  &
574               id_var_domask(mid,av,if),  &
575               local_pf,  &
576               start = (/ mask_start_l(mid,1), mask_start_l(mid,2),  &
577                          mask_start_l(mid,3), domask_time_count(mid,av) /),  &
578               count = (/ mask_size_l(mid,1), mask_size_l(mid,2),  &
579                          mask_size_l(mid,3), 1 /) )
[1783]580          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_mask', 461 )
[1320]581       ELSE
582#endif
583!
584!--       (1) b. Conventional I/O only through PE0
585!--       PE0 receives partial arrays from all processors of the respective mask
586!--       and outputs them. Here a barrier has to be set, because otherwise
587!--       "-MPI- FATAL: Remote protocol queue full" may occur.
588          CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
589
590          ngp = mask_size_l(mid,1) * mask_size_l(mid,2) * mask_size_l(mid,3)
591          IF ( myid == 0 )  THEN
592!
593!--          Local array can be relocated directly.
594             total_pf( &
595               mask_start_l(mid,1):mask_start_l(mid,1)+mask_size_l(mid,1)-1, &
596               mask_start_l(mid,2):mask_start_l(mid,2)+mask_size_l(mid,2)-1, &
597               mask_start_l(mid,3):mask_start_l(mid,3)+mask_size_l(mid,3)-1 ) &
598               = local_pf
599!
600!--          Receive data from all other PEs.
601             DO  n = 1, numprocs-1
602!
603!--             Receive index limits first, then array.
604!--             Index limits are received in arbitrary order from the PEs.
605                CALL MPI_RECV( ind(1), 6, MPI_INTEGER, MPI_ANY_SOURCE, 0,  &
606                     comm2d, status, ierr )
607!
608!--             Not all PEs have data for the mask
609                IF ( ind(1) /= -9999 )  THEN
610                   ngp = ( ind(2)-ind(1)+1 ) * (ind(4)-ind(3)+1 ) *  &
611                         ( ind(6)-ind(5)+1 )
612                   sender = status(MPI_SOURCE)
613                   DEALLOCATE( local_pf )
614                   ALLOCATE(local_pf(ind(1):ind(2),ind(3):ind(4),ind(5):ind(6)))
615                   CALL MPI_RECV( local_pf(ind(1),ind(3),ind(5)), ngp,  &
616                        MPI_REAL, sender, 1, comm2d, status, ierr )
617                   total_pf(ind(1):ind(2),ind(3):ind(4),ind(5):ind(6)) &
618                        = local_pf
619                ENDIF
620             ENDDO
621
622             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_mask(mid,av),  &
623                  id_var_domask(mid,av,if), total_pf, &
624                  start = (/ 1, 1, 1, domask_time_count(mid,av) /), &
625                  count = (/ mask_size(mid,1), mask_size(mid,2), &
626                             mask_size(mid,3), 1 /) )
[1783]627             CALL netcdf_handle_error( 'data_output_mask', 462 )
[1320]628
629          ELSE
630!
631!--          If at least part of the mask resides on the PE, send the index
632!--          limits for the target array, otherwise send -9999 to PE0.
633             IF ( mask_size_l(mid,1) > 0 .AND.  mask_size_l(mid,2) > 0 .AND. &
634                  mask_size_l(mid,3) > 0  ) &
635                  THEN
636                ind(1) = mask_start_l(mid,1)
637                ind(2) = mask_start_l(mid,1) + mask_size_l(mid,1) - 1
638                ind(3) = mask_start_l(mid,2)
639                ind(4) = mask_start_l(mid,2) + mask_size_l(mid,2) - 1
640                ind(5) = mask_start_l(mid,3)
641                ind(6) = mask_start_l(mid,3) + mask_size_l(mid,3) - 1
642             ELSE
643                ind(1) = -9999; ind(2) = -9999
644                ind(3) = -9999; ind(4) = -9999
645                ind(5) = -9999; ind(6) = -9999
646             ENDIF
647             CALL MPI_SEND( ind(1), 6, MPI_INTEGER, 0, 0, comm2d, ierr )
648!
649!--          If applicable, send data to PE0.
650             IF ( ind(1) /= -9999 )  THEN
651                CALL MPI_SEND( local_pf(1,1,1), ngp, MPI_REAL, 0, 1, comm2d, &
652                     ierr )
653             ENDIF
654          ENDIF
655!
656!--       A barrier has to be set, because otherwise some PEs may proceed too
657!--       fast so that PE0 may receive wrong data on tag 0.
658          CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
659#if defined( __netcdf4_parallel )
660       ENDIF
661#endif
662#else
663!
664!--    (2) For serial execution of PALM, the single processor (PE0) holds all
665!--    data and writes them directly to file.
666       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_mask(mid,av),  &
667            id_var_domask(mid,av,if),       &
668            local_pf, &
669            start = (/ 1, 1, 1, domask_time_count(mid,av) /), &
670            count = (/ mask_size_l(mid,1), mask_size_l(mid,2), &
671                       mask_size_l(mid,3), 1 /) )
[1783]672       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_mask', 463 )
[1320]673#endif
674
675       if = if + 1
676
677    ENDDO
678
679!
680!-- Deallocate temporary arrays.
681    DEALLOCATE( local_pf )
682#if defined( __parallel )
683    IF ( myid == 0 )  THEN
684       DEALLOCATE( total_pf )
685    ENDIF
686#endif
687
[1783]688!
689!-- Switch back to original format given by user (see beginning of this routine)
690    netcdf_data_format = netcdf_data_format_save
[1320]691
692    CALL cpu_log( log_point(49), 'data_output_mask', 'stop' )
693#endif
694
695 END SUBROUTINE data_output_mask
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.