source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 693

Last change on this file since 693 was 693, checked in by raasch, 10 years ago

New:
---
adjustments for ibmkisti (pres, batch_scp, mbuild, mrun, subjob)

new default configuration files .mrun.config.yonsei2011 and .config_block_for_ibmkisti

Changed:


Errors:


bugfix: weighting coefficient added to ibm branch (pres)

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 48.5 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 693 2011-03-08 08:27:49Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95     # 23/09/08 - Gerald- paesano admitted
96     # 02/10/08 - Siggi - PBS adjustments for lcxt4
97     # 02/03/09 - Siggi - Adjustments for new NEC-SX9 at RIAM
98     # 16/04/09 - Marcus- Adjustments for lcsgib and lcsgih
99     # 21/04/09 - Siggi - adjustments for new IBM at DKRZ, which is now ibmh
100     # 18/05/09 - Siggi - Settings for serial jobs on lcsgi changed
101     # 24/06/09 - BjornM- adjustments for lcxt4 (loading modules manually)
102     # 08/07/09 - Siggi - option -e added (email notification on lcsgih/b)
103     # 20/07/09 - Siggi - On lcsgi, jobs for returning the job protocol are
104     #                    now run on the data nodes (feature=data)
105     # 25/08/09 - BjornM- adapted for lck
106     # 26/08/09 - Marcus- caurus admitted; optional qos feature hiprio on lcsgi
107     # 03/09/09 - Siggi - PBS sgi feature directive only used if explicitly
108     #                    set in the config file by the user
109     # 16/10/09 - Carolin-adjustments for archiving on SGI-ICE of binary files;
110     #                    adding special1q
111     # 01/12/09 - BjornM- re-adjustments for lcxt4, added sno (130.75.105.113)
112     # 16/10/09 - Carolin-adding permq
113     # 01/02/10 - Siggi - adapted for lcxt5m and lckyoto (Fujitsu HX600)
114     # 03/02/10 - Siggi - bug in serial jobs removed
115     # 26/02/10 - BjornM- re-adjustments for lcxt4 (new modules, email
116     #                    notification)
117     # 01/03/10 - Siggi - loading of modules controlled by environment variable
118     #                    module_calls
119     # 17/08/10 - BjornM- re-adjustments for lcxt4 (location of qsub)
120     # 25/08/10 - BjornM- account geofysisk replaced by guest for lcxt4
121     # 25/08/10 - Siggi - new variable project_account in pbs-statements for
122     #                    lcxt4
123     # 08/12/10 - Siggi - initialization of the module command changed for
124     #                    SGI-ICE/lcsgi
125     #                    adjustments for Kyushu Univ. (lcrte, ibmku)
126     # 14/12/10 - Siggi - adjustments for new Tsubame system at Tokyo
127     #                    institute of technology (lctit)
128     # 02/02/11 - Siggi - further asjustments for Tsubame concerning openMP
129     # 06/03/11 - Siggi - adjustments for ibmkisti
130
131
132
133
134    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
135 delete_dayfile=false
136 email_notification=none
137 group_number=none
138 locat=normal
139 no_default_queue=none
140 no_submit=false
141 job_catalog="~/job_queue"
142 job_name=none
143 local_user=$LOGNAME
144 node_usage=shared
145 numprocs=0
146 punkte="..........................................................."
147 submcom=qsub
148 queue=default
149 remote_host=none
150 remote_user=""
151 verify=true
152
153 typeset  -i   cputime=0  memory=0  Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
154 typeset  -i   inumprocs  nodes=0  processes_per_node=0 tasks_per_node=0  threads_per_task=1
155 typeset  -L20 spalte1
156 typeset  -R40 spalte2
157 typeset  -L60 spalte3
158
159
160
161    # FEHLERBEHANDLUNG
162    # BEI EXIT:
163 trap 'if [[ $locat != normal ]]
164       then
165          case  $locat  in
166             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
167                       printf " by typing:"
168                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
169             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
170             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
171                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
172          esac
173          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
174          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
175       fi' exit
176
177
178    # BEI TERMINAL-BREAK:
179 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
180       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
181       exit
182      ' 2
183
184
185
186
187    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
188 local_host=$(hostname)
189
190
191
192    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
193    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
194 case  $local_host  in
195     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
196     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
197     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
198     (bd1)                   local_addres=130.73.232.64;  local_host=lcsgib;;
199     (bd2)                   local_addres=130.73.232.65;  local_host=lcsgib;;
200     (bd3)                   local_addres=130.73.232.66;  local_host=lcsgib;;
201     (bd4)                   local_addres=130.73.232.67;  local_host=lcsgib;;
202     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
203     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
204     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
205     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
206     (caurus)                local_addres=130.75.105.19;  local_host=lcmuk;;
207     (climate*)              local_addres=165.132.26.68;  local_host=lcyon;;
208     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
209     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
210     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
211     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
212     (node*)                 local_addres=165.132.26.61   local_host=lck;;
213     (gaia*)                 local_addres=150.183.146.24; local_host=ibmkisti;;
214     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
215     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
216     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
217     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
218     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
219     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
220     (hd1)                   local_addres=130.75.4.104;   local_host=lcsgih;;
221     (hd2)                   local_addres=130.75.4.105;   local_host=lcsgih;;
222     (hd3)                   local_addres=130.75.4.106;   local_host=lcsgih;;
223     (hd4)                   local_addres=130.75.4.107;   local_host=lcsgih;;
224     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
225     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
226     (hx*)                   local_addres=133.3.51.11;    local_host=lckyoto;;
227     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
228     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
229     (sno)                   local_addres=130.75.105.113; local_host=lcmuk;;
230     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
231     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
232     (meteo-login*)          local_addres=193.166.211.144;local_host=lcxt5m;;
233     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
234     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
235     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
236     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
237     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
238     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
239     (rte*)                  local_addres=133.5.185.60;   local_host=lcrte;;
240     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
241     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
242     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
243     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
244     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
245     (t2a*)                  local_addres=10.1.6.165;     local_host=lctit;;
246     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
247     (*.cc.kyushu-u.ac.jp)   local_addres=133.5.4.129;    local_host=ibmku;;
248     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
249                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
250                             locat=parameter; exit;;
251 esac
252
253
254
255    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
256 remote_host=$local_host
257
258
259
260
261    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
262 while  getopts  :c:dDe:g:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
263 do
264   case  $option  in
265       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
266       (d)   delete_dayfile=true;;
267       (D)   no_submit=true;;
268       (e)   email_notification=$OPTARG;;
269       (g)   group_number=$OPTARG;;
270       (h)   remote_host=$OPTARG;;
271       (m)   memory=$OPTARG;;
272       (n)   job_name=$OPTARG;;
273       (N)   node_usage=$OPTARG;;
274       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
275       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
276       (t)   cputime=$OPTARG;;
277       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
278       (u)   remote_user=$OPTARG;;
279       (v)   verify=false;;
280       (X)   numprocs=$OPTARG;;
281       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
282             locat=option; exit;;
283   esac
284 done
285
286
287    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
288 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
289
290
291    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
292 if [ "$1" = "?" ]
293 then
294   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
295    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
296    printf "\n      Description of available options:\n"
297    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
298    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
299    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
300    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
301    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
302    printf "\n              ibm, ibmh, ibmkisti, ibmku, ibms, ibmy, lc...,"
303    printf "\n              lctit, nech, necriam, unics"
304    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
305    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
306    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
307    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
308    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
309    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
310    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
311    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
312    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
313    printf "\n "
314    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
315    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
316    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
317    exit
318 fi
319
320
321
322    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
323 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
324 then
325    printf "\n  +++ job-file missing"
326    locat=parameter; exit
327 else
328    if [[ -f $file_to_send ]]
329    then
330       true
331    else
332       printf "\n  +++ job-file: "
333       printf "\n           $file_to_send"
334       printf "\n      does not exist"
335       locat=parameter; exit
336    fi
337 fi
338
339
340
341    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
342    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
343 if [[ $job_name = none ]]
344 then
345    job_name=$file_to_send
346 fi
347 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
348 then
349    printf "\n  +++ job-file name: "
350    printf "\n           $job_name"
351    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
352    locat=parameter; exit
353 fi
354
355
356
357
358    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
359    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
360 if [[ $remote_host = none ]]
361 then
362    printf "\n  +++ host missing"
363    locat=option; exit
364 else
365    case  $remote_host  in
366        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
367        (ibmh)    queue=no_class; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
368        (ibmkisti) queue=class.32plus; remote_addres=150.183.146.24; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
369        (ibmku)   queue=s4; remote_addres=133.5.4.129; submcom=/usr/local/bin/llsubmit;;
370        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
371        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
372        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
373        (lckyoto) remote_addres=133.3.51.11; submcom=/thin/local/bin/qsub;;
374        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.104; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
375        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.101; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
376        (lck)     remote_addres=165.132.26.61; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
377        (lctit)   queue=S; remote_addres=10.1.6.165; submcom=/opt/pbs/tools/bin/t2sub;;
378        (lcxt4)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.4.9-snap.201005191035/bin/qsub;;
379        (lcxt5m)  remote_addres=193.166.211.144; submcom=/opt/pbs/10.1.0.91350/bin/qsub;;
380        (lcyon)   remote_addres=165.132.26.68; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
381        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
382        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
383        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
384        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
385        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
386                  locat=parameter; exit;;
387    esac
388 fi
389
390
391    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
392 if [[ $no_default_queue != none ]]
393 then
394    error=false
395    ndq=$no_default_queue
396    case  $remote_host  in
397        (ibm)    case  $ndq  in
398                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
399                     (*)                                     error=true;;
400                 esac;;
401        (ibmh)   case  $ndq  in
402                     (no_class)  error=false;;
403                     (*)                                     error=true;;
404                 esac;;
405        (ibmkisti)   case  $ndq  in
406                     (class.32plus|class.1-2|class.2-32)  error=false;;
407                     (*)                                     error=true;;
408                 esac;;
409        (ibmku)  case  $ndq  in
410                     (sdbg1|sdbg2|sdbg4|s4|s16|s32|s32-s)    error=false;;
411                     (*)                                     error=true;;
412                 esac;;
413        (ibms)   case  $ndq  in
414                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
415                     (*)                                     error=true;;
416                 esac;;
417        (ibmy)   case  $ndq  in
418                     (parallel)                              error=false;;
419                     (*)                                     error=true;;
420                 esac;;
421        (lckyoto) case  $ndq  in
422                     (eh|ph)                                 error=false;;
423                     (*)                                     error=true;;
424                 esac;;
425        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
426                     (testq|serialq|smallq|mediumq|bigq|workq|dataq|permq|special1q)       error=false;;
427                     (*)                                     error=true;;
428                 esac;;
429        (lctit)  case  $ndq  in
430                     (G|L128|L256|L512H|S|S96|V)             error=false;;
431                     (*)                                     error=true;;
432                 esac;;
433        (t3eb)   case  $ndq  in
434                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
435                     (*)    error=true;;
436                 esac;;
437        (necriam) case  $ndq  in
438                     (SP|SS|P6)  error=false;;
439                     (*)    error=true;;
440                 esac;;
441        (t3eh)   case  $ndq  in
442                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
443                     (*)    error=true;;
444                 esac;;
445        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
446                     (low|normal|high)  error=false;;
447                     (*)    error=true;;
448                 esac;;
449        (t3es)  case  $ndq  in
450                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
451                     (*)    error=true;;
452                 esac;;
453        (unics)  case  $ndq  in
454                     (unics|ht)  error=false;;
455                     (*)         error=true;;
456                 esac;;
457    esac
458    if [[ $error = true ]]
459    then
460       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
461       locat=parameter; exit
462    else
463       queue=$no_default_queue
464    fi
465 fi
466
467
468
469    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
470    # AUFTEILEN
471 done=false
472 while [[ $done = false ]]
473 do
474    if (( $cputime <= 0 ))
475    then
476       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
477       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
478       printf "\n  >>> "
479       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
480    else
481       done=true
482    fi
483 done
484 if [[ $remote_host = nech ]]
485 then
486    if (( tasks_per_node != 0 ))
487    then
488       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
489    elif [[ $numprocs != 0 ]]
490    then
491       (( cputime = cputime * numprocs ))
492    fi
493 fi
494 (( stunden  = cputime / 3600 ))
495 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
496 (( minuten  = resttime / 60 ))
497 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
498 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
499
500
501
502    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
503 done=false
504 while [[ $done = false ]]
505 do
506    if (( memory <= 0 ))
507    then
508       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
509       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
510       printf "\n  >>> "
511       read  memory  1>/dev/null  2>&1
512    else
513       done=true
514    fi
515 done
516
517 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
518 then
519    if (( tasks_per_node != 0 ))
520    then
521       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
522    elif [[ $numprocs != 0 ]]
523    then
524       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
525    else
526       (( Memory = memory / 1000 ))
527    fi
528 elif [[ $remote_host = lctit ]]
529 then
530    (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
531 fi
532
533
534    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
535 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
536 then
537    (( memory = memory * threads_per_task ))
538 fi
539
540
541    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
542 if (( tasks_per_node != 0 ))
543 then
544    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
545 fi
546
547    # Calculate number of processes per node
548 (( processes_per_node = tasks_per_node * threads_per_task ))
549
550
551    # HEADER-AUSGABE
552 if [[ $verify = true ]]
553 then
554    printf "\n\n"
555    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
556    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
557    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
558    printf "|                                                              | \n"
559    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
560    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
561    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
562    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
563    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
564    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
565    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
566    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
567    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
568    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
569    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
570    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
571    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
572    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
573
574
575       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
576    antwort="dummy"
577    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
578    do
579       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
580    done
581    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
582    then
583       locat=verify; exit
584    fi
585    printf "\n"
586 fi
587
588
589
590    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
591 kennung=$RANDOM
592 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
593 job_to_send=job_to_send_$kennung
594 if [[ $delete_dayfile = false ]]
595 then
596    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
597    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
598 else
599    remote_dayfile=/dev/null
600 fi
601
602
603
604    # Generate the batch job scripts (qsub/msub/LoadLeveler)
605 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
606 then
607
608       # General LoadLeveler settings
609    execute_in_shell="#!/bin/ksh"
610    use_shell="# @ shell = /bin/ksh"
611    consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
612    class="# @ class = $queue"
613    environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
614    network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
615    data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
616    image_size="# @ image_size = 50"
617    wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring"
618
619    if [[ $email_notification = none ]]
620    then
621       notify_user=""
622    else
623       notify_user="# @ notify_user = $email_notification"
624       if [[ $delete_dayfile = true ]]
625       then
626          notification='# @ notification = never'
627       fi
628    fi
629
630    if [[ $remote_host = ibmh ]]
631    then
632       data_limit=""
633       network_to_use=""
634       class=""
635       environment=""
636    elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
637    then
638       network_to_use="# @ network.MPI = sn_all,shared,US"
639       wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = $timestring"
640       rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
641       mcm_affinity_options="# @ mcm_affinity_options = mcm_mem_pref mcm_sni_none mcm_distribute"
642       environment=""
643       use_shell=""
644       data_limit=""
645       image_size=""
646    elif [[ $remote_host = ibmku ]]
647    then
648       execute_in_shell="#!/usr/bin/ksh"
649       use_shell="# @ shell = /usr/bin/ksh"
650       consumable_memory=""
651       environment=""
652       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
653       data_limit=""
654       image_size=""
655    elif [[ $remote_host = ibms ]]
656    then
657       network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
658    elif [[ $remote_host = ibmy ]]
659    then
660       consumable_memory=""
661       network_to_use=""
662    fi
663
664    cat > $job_to_send << %%END%%
665$execute_in_shell
666$use_shell
667
668# @ job_type = parallel
669# @ job_name = $job_name
670# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
671# @ output = $remote_dayfile
672# @ error = $remote_dayfile
673$wall_clock_limit
674$image_size
675$class
676$environment
677$network_to_use
678$data_limit
679$rset
680$mcm_affinity_options
681$notification
682$notify_user
683
684%%END%%
685
686    if (( nodes > 0 ))
687    then
688
689       if [[ $remote_host != ibmkisti ]]
690       then
691
692          cat >> $job_to_send << %%END%%
693# @ node = $nodes
694# @ tasks_per_node = $processes_per_node
695# @ node_usage = $node_usage
696# @ queue
697
698%%END%%
699
700       else
701
702          cat >> $job_to_send << %%END%%
703# @ total_tasks = $numprocs
704# @ blocking = unlimited
705# @ queue
706
707%%END%%
708
709       fi
710
711    else
712
713       if [[ $remote_host != ibmy ]]
714       then
715
716          cat >> $job_to_send << %%END%%
717# @ blocking = unlimited
718# @ total_tasks = $numprocs
719# @ node_usage = $node_usage
720# @ queue
721
722%%END%%
723
724       else
725
726          cat >> $job_to_send << %%END%%
727# @ node = 1
728# @ total_tasks = $numprocs
729# @ queue
730
731%%END%%
732
733       fi
734
735    fi
736
737 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
738 then
739
740    cat > $job_to_send << %%END%%
741#!/bin/ksh
742
743# @ job_type = serial
744# @ node_usage = $node_usage
745# @ job_name = palm
746# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
747# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
748# @ output = $remote_dayfile
749# @ error = $remote_dayfile
750$class
751$notification
752
753# @ queue
754
755%%END%%
756
757 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
758 then
759
760    if [[ $numprocs != 0 ]]
761    then
762       cat > $job_to_send << %%END%%
763#!/bin/ksh
764#PBS -N $job_name
765#PBS -A $project_account
766#PBS -l walltime=$timestring
767#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$processes_per_node
768#PBS -l pmem=${memory}mb
769#PBS -m abe
770#PBS -o $remote_dayfile
771#PBS -j oe
772mpd &
773
774%%END%%
775
776    else
777       cat > $job_to_send << %%END%%
778#!/bin/ksh
779#PBS -N $job_name
780#PBS -A $project_account
781#PBS -l walltime=$timestring
782#PBS -l ncpus=1
783#PBS -l pmem=${memory}mb
784#PBS -m abe
785#PBS -o $remote_dayfile
786#PBS -j oe
787
788%%END%%
789
790    fi
791
792 elif [[ $remote_host = lck ]]
793 then
794
795    if [[ $numprocs != 0 ]]
796    then
797       cat > $job_to_send << %%END%%
798#!/bin/ksh
799#PBS -N $job_name
800#PBS -l walltime=$timestring
801#PBS -l ncpus=$numprocs
802#PBS -l pmem=${memory}mb
803#PBS -o $remote_dayfile
804#PBS -j oe
805
806mpd &
807
808%%END%%
809
810    else
811       cat > $job_to_send << %%END%%
812#!/bin/ksh
813#PBS -N $job_name
814#PBS -l walltime=$timestring
815#PBS -l ncpus=1
816#PBS -l pmem=${memory}mb
817#PBS -o $remote_dayfile
818#PBS -j oe
819
820%%END%%
821
822    fi
823
824 elif [[ $remote_host = lcyon ]]
825 then
826
827    if [[ $numprocs != 0 ]]
828    then
829       cat > $job_to_send << %%END%%
830#!/bin/ksh
831#PBS -N $job_name
832#PBS -l walltime=$timestring
833#PBS -l ncpus=$numprocs
834#PBS -l pmem=${memory}mb
835#PBS -o $remote_dayfile
836#PBS -j oe
837
838%%END%%
839
840    else
841       cat > $job_to_send << %%END%%
842#!/bin/ksh
843#PBS -N $job_name
844#PBS -l walltime=$timestring
845#PBS -l ncpus=1
846#PBS -l pmem=${memory}mb
847#PBS -o $remote_dayfile
848#PBS -j oe
849
850%%END%%
851
852    fi
853
854 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
855 then
856
857    if [[ "$sgi_feature" != "" ]]
858    then
859       feature_directive="#PBS -l feature=$sgi_feature"
860    else
861       feature_directive=""
862    fi
863   
864    if [[ $queue = dataq || $queue = permq ]]
865    then
866       feature_directive="#PBS -l feature=data"
867    fi
868
869    if [[ $queue = testq  ||  $queue = workq  ||  $queue = dataq  ||  $queue = permq ||  $queue = serialq  ||  $queue = special1q ]]
870    then
871       queue_directive="#PBS -q $queue"
872    else
873       queue_directive=""
874    fi
875
876    if [[ $email_notification = none ]]
877    then
878       email_directive=""
879    else
880       email_directive="#PBS -M $email_notification"
881    fi
882
883    if [[ $numprocs != 0 ]]
884    then
885       cat > $job_to_send << %%END%%
886#!/bin/bash
887#PBS -N $job_name
888#PBS -l walltime=$timestring
889#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
890#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
891#PBS -o $remote_dayfile
892#PBS -j oe
893$feature_directive
894$queue_directive
895$email_directive
896
897eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
898#. /usr/share/modules/init/bash
899$module_calls
900
901echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
902
903%%END%%
904
905    else
906       cat > $job_to_send << %%END%%
907#PBS -S /bin/bash
908#PBS -N $job_name
909#PBS -l walltime=$timestring
910#PBS -l ncpus=1
911#PBS -o $remote_dayfile
912#PBS -j oe
913$queue_directive
914$email_directive
915
916eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
917#. /usr/share/modules/init/bash
918$module_calls
919
920%%END%%
921
922    fi
923
924 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
925 then
926
927    if [[ $numprocs != 0 ]]
928    then
929       cat > $job_to_send << %%END%%
930#!/bin/ksh
931#PBS -S /bin/ksh
932#PBS -N $job_name
933#PBS -A $project_account
934#PBS -j oe
935#PBS -l walltime=$timestring
936#PBS -l mppwidth=${numprocs}
937#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
938#PBS -m abe
939#PBS -o $remote_dayfile
940$email_directive
941
942. /opt/modules/default/init/ksh
943$module_calls
944
945%%END%%
946
947    else
948       cat > $job_to_send << %%END%%
949#!/bin/ksh
950#PBS -S /bin/ksh
951#PBS -N $job_name
952#PBS -A $project_account
953#PBS -j oe
954#PBS -l walltime=$timestring
955#PBS -l ncpus=1
956#PBS -l pmem=${memory}mb
957#PBS -m abe
958$email_directive
959#PBS -o $remote_dayfile
960
961. /opt/modules/default/init/ksh
962$module_calls
963
964%%END%%
965
966    fi
967
968 elif [[ $remote_host = lckyoto ]]
969 then
970
971       cat > $job_to_send << %%END%%
972#!/bin/ksh
973# @\$-o $remote_dayfile
974# @\$-eo -oi
975# @\$-lP 16
976# @\$-lp 1   
977# @\$-lm 28gb  -llm unlimited -ls unlimited
978# @\$-q $queue
979# @\$-Pvn abs_pack
980##for intel? @\$-Pvn abs_unpack -Pvs unpack -Pvc unpack
981#. /thin/local/etc/setprofile/intel-11.0.sh
982#. /thin/local/etc/setprofile/mvapich2-1.4+intel-11.0.sh
983. ~/.myprofile
984#. /home2/t/t51254/palm/current_version/myprofile
985#. /thin/apps/pgi/mpi.sh
986#
987env
988#
989set -x
990
991%%END%%
992
993 elif [[ $remote_host = lcxt5m ]]
994 then
995
996    if [[ $numprocs != 0 ]]
997    then
998       cat > $job_to_send << %%END%%
999#!/bin/ksh
1000#PBS -S /bin/ksh
1001#PBS -N $job_name
1002#PBS -j oe
1003#PBS -l walltime=$timestring
1004#PBS -l mppwidth=${numprocs}
1005#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
1006#PBS -m abe
1007#PBS -o $remote_dayfile
1008
1009. /opt/modules/default/init/ksh
1010$module_calls
1011
1012%%END%%
1013
1014    else
1015       cat > $job_to_send << %%END%%
1016#!/bin/ksh
1017#PBS -S /bin/ksh
1018#PBS -N $job_name
1019#PBS -j oe
1020#PBS -l walltime=$timestring
1021#PBS -l ncpus=1
1022#PBS -l pmem=${memory}mb
1023#PBS -m abe
1024#PBS -o $remote_dayfile
1025
1026. /opt/modules/default/init/ksh
1027$module_calls
1028
1029%%END%%
1030
1031    fi
1032
1033 elif [[ $remote_host = nech ]]
1034 then
1035
1036    if (( nodes > 1 ))
1037    then
1038       cat > $job_to_send << %%END%%
1039#!/bin/ksh
1040#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
1041#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1042#PBS -b $nodes
1043#PBS -o $remote_dayfile
1044#PBS -N palm
1045#PBS -j o
1046#PBS -T mpisx
1047
1048%%END%%
1049
1050    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1051    then
1052       cat > $job_to_send << %%END%%
1053#!/bin/ksh
1054#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
1055#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1056#PBS -o $remote_dayfile
1057#PBS -N palm
1058#PBS -j o
1059
1060%%END%%
1061
1062    else
1063       cat > $job_to_send << %%END%%
1064#!/bin/ksh
1065#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
1066#PBS -o $remote_dayfile
1067#PBS -j o
1068
1069%%END%%
1070
1071    fi
1072
1073 elif [[ $remote_host = necriam ]]
1074 then
1075
1076    if (( nodes > 1 ))
1077    then
1078       cat > $job_to_send << %%END%%
1079#!/bin/ksh
1080#PBS -b $nodes
1081#PBS -o $remote_dayfile
1082#PBS -N $job_name
1083#PBS -j o
1084#PBS -v MPIPROGINV=YES
1085
1086%%END%%
1087
1088    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1089    then
1090       cat > $job_to_send << %%END%%
1091#!/bin/ksh
1092#PBS -q ${queue}
1093#PBS -o $remote_dayfile
1094#PBS -N $job_name
1095#PBS -j o
1096#PBS -v MPIPROGINV=YES
1097
1098%%END%%
1099
1100    else
1101       cat > $job_to_send << %%END%%
1102#!/bin/ksh
1103#PBS -o $remote_dayfile
1104#PBS -j o
1105
1106%%END%%
1107
1108    fi
1109
1110 elif [[ $remote_host = lctit ]]
1111 then
1112    cat > $job_to_send << %%END%%
1113#!/bin/ksh
1114
1115$module_calls
1116
1117%%END%%
1118
1119       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
1120    if [[ $tasks_per_node != $processes_per_node ]]
1121    then
1122       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1123    else
1124       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -l place=scatter -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1125    fi
1126
1127 else
1128
1129    cat > $job_to_send << %%END%%
1130# @\$-q ${queue}
1131# @\$-l${qsubtime} $timestring
1132# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
1133# @\$-o $remote_dayfile
1134# @\$-eo
1135
1136%%END%%
1137
1138 fi
1139
1140
1141    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
1142    # BEI EXIT VERANLASSEN
1143    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
1144    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
1145 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
1146 then
1147    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
1148    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
1149    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
1150    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec ]]
1151    then
1152       if [[ $remote_host = ibmh ]]
1153       then
1154          return_queue=c1
1155       elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
1156       then
1157          return_queue=class.1-2
1158       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1159       then
1160          return_queue=sdbg2
1161       elif [[ $remote_host = ibms ]]
1162       then
1163          return_queue=p_normal
1164       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
1165       then
1166          return_queue=serial
1167       elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
1168       then
1169          return_queue=serialq
1170       elif [[ $remote_host = necriam ]]
1171       then
1172          return_queue=SP
1173       else
1174          return_queue=unknown
1175       fi
1176
1177       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1178       then
1179
1180          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1181          then
1182             echo "echo \"#!/usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1183             echo "echo \"# @ shell = /usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1184          else
1185             echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1186          fi
1187          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1188          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1189          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1190          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
1191          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1192          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1193          if [[ $host != "ibmh" ]]
1194          then
1195             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1196          fi
1197          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1198          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
1199
1200          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1201          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
1202
1203          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
1204          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1205          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1206          then
1207             echo "echo \"rm  scpjob.$kennung\" >> scpjob.$kennung"   >>  $job_to_send
1208          fi
1209          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
1210
1211       elif [[ $remote_host = nech ]]
1212       then
1213          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
1214          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1215          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
1216          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1217          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1218          echo " "                                 >>  $job_to_send
1219          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1220          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
1221          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1222          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1223          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1224
1225       elif [[ $remote_host = necriam ]]
1226       then
1227          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1228          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
1229          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1230          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1231          echo " "                                 >>  $job_to_send
1232          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1233          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1234          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1235          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1236
1237       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1238       then
1239          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1240          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1241          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
1242          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
1243          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
1244          echo "#PBS -l feature=data"                    >>  $job_to_send
1245          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1246          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
1247          echo " "                                 >>  $job_to_send
1248          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
1249          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1250          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1251          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1252          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1253
1254       else
1255
1256          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1257          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1258          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1259          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1260          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1261          then
1262             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1263          fi
1264          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1265#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1266          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1267          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1268          echo " "                                 >>  $job_to_send
1269          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1270          then
1271             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1272             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1273          fi
1274          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1275          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1276          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1277          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1278       fi
1279
1280       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1281       then
1282          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1283       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1284       then
1285          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1286          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1287       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1288       then
1289          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1290       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1291       then
1292          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1293       else
1294          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1295       fi
1296       if [[ $remote_host != ibmku ]]
1297       then
1298          echo "rm  scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1299       fi
1300       if [[ $remote_host = nech ]]
1301       then
1302          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1303       fi
1304    else
1305#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1306       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1307    fi
1308    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1309    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1310    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1311 fi
1312
1313
1314
1315    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1316 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1317
1318 if [[ $remote_host = ibm ]]
1319 then
1320    echo " "         >>  $job_to_send
1321    echo "exit"      >>  $job_to_send
1322 fi
1323
1324    # remove job file
1325 if [[ $remote_host = lctit  ||  $remote_host = ibmku ]]
1326 then
1327    echo " "                               >>  $job_to_send
1328    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1329 fi
1330
1331
1332
1333    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1334 if [[ -z $remote_user ]]
1335 then
1336    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1337    then
1338       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1339    fi
1340 fi
1341
1342
1343
1344    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1345 if [[ $no_submit = false ]]
1346 then
1347    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1348    then
1349       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1350       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1351       then
1352          job_catalog_save=$job_catalog
1353          job_catalog=job_queue
1354       elif [[ $remote_host = nech ]]
1355       then
1356          job_catalog_save=$job_catalog
1357          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1358       fi
1359       if [[ $local_host = decalpha ]]
1360       then
1361             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1362             # PASSWORT AB
1363          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1364       elif [[ $remote_host = nech ]]
1365       then
1366             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1367             # TRANSFERIERT WERDEN
1368          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1369       else
1370          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1371       fi
1372       if [[ $? = 1 ]]
1373       then
1374          locat=scp; exit
1375       fi
1376       if [[ $remote_host = ibms ]]
1377       then
1378          job_catalog=$job_catalog_save
1379       fi
1380       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1381    else
1382       eval  job_catalog=$job_catalog
1383       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1384    fi
1385
1386
1387
1388       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1389    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1390    then
1391       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1392
1393       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  &&  $prio = true ]]
1394       then
1395          printf "\n >>> submit with HLRN qos-feature hiprio...\n"
1396          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom -l qos=hiprio $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1397       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1398       then
1399          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
1400       else
1401          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1402       fi
1403
1404       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1405    else
1406       cd  $job_catalog
1407       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1408       then
1409          eval  $submcom  $job_on_remhost
1410       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4  ||  $localhost = lck  ||  $localhost = lcyon ]]
1411       then
1412          chmod  u+x  $job_on_remhost
1413          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1414          eval  $submcom  $job_on_remhost
1415       elif [[ $local_host = nech ]]
1416       then
1417          if [[ $queue = default ]]
1418          then
1419             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1420          else
1421             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1422          fi
1423       else
1424          qsub  $job_on_remhost
1425       fi
1426
1427          # Jobfile must not be deleted on lctit/ibmku!! This will be done
1428          # only at the end of the job.
1429       if [[ $local_host != lctit  &&  $local_host != ibmku ]]
1430       then
1431          rm  $job_on_remhost
1432       fi
1433       cd  -  > /dev/null
1434    fi
1435 fi
1436
1437
1438
1439    # ABSCHLUSSARBEITEN
1440
1441 if [[ $no_submit = false ]]
1442 then
1443    rm  $job_to_send
1444 fi
1445 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.