source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 1274

Last change on this file since 1274 was 1274, checked in by heinze, 11 years ago

Adjustments for lccrayh

  • Property svn:keywords set to Id Rev
File size: 58.9 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2
3# subjob - script for automatic generation and submission of batch-job files
4#          for various batch queuing systems
5
6#--------------------------------------------------------------------------------#
7# This file is part of PALM.
8#
9# PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
10# of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
11# either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
12#
13# PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
14# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
15# A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16#
17# You should have received a copy of the GNU General Public License along with
18# PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19#
20# Copyright 1997-2012  Leibniz University Hannover
21#--------------------------------------------------------------------------------#
22#
23# Current revisions:
24# ------------------
25# adjustments for lccrayh
26#
27# Former revisions:
28# -----------------
29# $Id: subjob 1274 2014-01-09 13:14:54Z heinze $
30#
31# 1266 2013-12-11 12:07:34Z heinze
32# further adjustments for lccrayb (use msub instead of qsub)
33#
34# 1264 2013-12-09 12:46:09Z fricke
35# Bugfix: Using number of nodes instead of number of processors (lccrayb)
36#
37# 1262 2013-12-09 10:57:20Z fricke
38# further adjustments for lccrayb
39#
40# 1260 2013-12-04 12:48:04Z raasch
41# jaboticaba admitted
42#
43# 1255 2013-11-07 14:43:35Z raasch
44# further adjustments for lccrayb
45#
46# 1224 2013-09-16 07:27:23Z raasch
47# first adjustments for lccrayb
48#
49# 1202 2013-07-10 16:22:07Z witha
50# adjustments for Forwind cluster (lcflow)
51#
52# 1199 2013-07-05 14:52:22Z raasch
53# adjustments for CSC Helsinki (lccrayf)
54#
55# use of cluster/express queue enabled (ibmh)
56# vinessa added (imuk)
57#
58# 1103 2013-02-20 02:15:53Z raasch
59# bash compatibility adjustments (usage of OPTIND, output formatting with printf
60# instead typeset -L/R),
61# further adjustments for lckyuh
62#
63# 2013-02-10 01:47:43Z raasch
64# adjustments for Kyushu-Univeristy computing center (lckyuh - hayaka)
65# and for Forwind cluster (lcflow)
66#
67# 1094 2013-02-03 01:52:12Z raasch
68# new option -P for explicit setting of ssh/scp port,
69# decalpha parts (yonsei) removed
70#
71# 2013-02-02 07:06:13Z raasch
72# adjustments for Kyushu-University computing center (lckyut - tatara)
73# old changelog messages removed
74#
75# 1046 2012-11-09 14:38:45Z maronga
76# code put under GPL (PALM 3.9)
77#
78# 08/07/94 - Siggi - first version finished
79# 29/06/94 - Siggi - script development started
80#--------------------------------------------------------------------------------#
81# subjob - script for automatic generation and submission of batch-job files
82#          for various batch queuing systems
83#--------------------------------------------------------------------------------#
84
85
86    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
87 delete_dayfile=false
88 email_notification=none
89 group_number=none
90 locat=normal
91 no_default_queue=none
92 no_submit=false
93 job_catalog="~/job_queue"
94 job_name=none
95 local_user=$LOGNAME
96 node_usage=shared
97 numprocs=0
98 punkte="..........................................................."
99 submcom=qsub
100 queue=default
101 remote_host=none
102 remote_user=""
103 verify=true
104
105 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
106 typeset  -i   inumprocs  mpi_tasks=nodes=processes_per_node=0 tasks_per_node=threads_per_task=1
107
108
109
110    # FEHLERBEHANDLUNG
111    # BEI EXIT:
112 trap 'if [[ $locat != normal ]]
113       then
114          case  $locat  in
115             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
116                       printf " by typing:"
117                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
118             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
119             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
120                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
121          esac
122          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
123          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
124       fi' exit
125
126
127    # BEI TERMINAL-BREAK:
128 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
129       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
130       exit
131      ' 2
132
133
134
135
136    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
137 local_host=$(hostname)
138
139
140
141    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
142    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
143    # Note: One of the entries for "lck" or "lckordi" always has to be
144    # comment out, because the hostname (node*) is same for both machines
145 case  $local_host  in
146     (ambiel-lx)             local_addres=134.106.74.48;  local_host=lcfor;;
147     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
148     (austru)                local_addres=130.75.105.128; local_host=lcmuk;;
149     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
150     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
151     (bd1)                   local_addres=130.73.232.64;  local_host=lcsgib;;
152     (bd2)                   local_addres=130.73.232.65;  local_host=lcsgib;;
153     (bd3)                   local_addres=130.73.232.66;  local_host=lcsgib;;
154     (bd4)                   local_addres=130.73.232.67;  local_host=lcsgib;;
155     (b01*|bicegate1)        local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
156     (b04*)                  local_addres=133.5.4.33;     local_host=lckyuh;;
157     (bicegate2)             local_addres=130.73.232.103; local_host=lcsgib;;
158     (blizzard1)             local_addres=136.172.40.15;  local_host=ibmh;;
159     (blogin*|bxc*)          local_addres=130.73.233.1;   local_host=lccrayb;;
160     (hlogin*|hxc*)          local_addres=130.75.4.1;     local_host=lccrayh;;
161     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
162     (buran)                 local_addres=130.75.105.58;  local_host=lcmuk;;
163     (caurus)                local_addres=130.75.105.19;  local_host=lcmuk;;
164     (climate*)              local_addres=165.132.26.68;  local_host=lcyon;;
165     (clogin*)               local_addres=86.50.166.21;   local_host=lccrayf;;
166     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
167     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
168     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
169     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
170     (flow01)                local_addres=10.141.255.71;  local_host=lcflow;;
171     (flow02)                local_addres=10.141.255.72;  local_host=lcflow;;
172     (node*)                 local_addres=165.132.26.61   local_host=lck;;
173   #  (node*)                 local_addres=210.219.61.8    local_host=lckordi;;
174     (gaia*)                 local_addres=150.183.146.24; local_host=ibmkisti;;
175     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
176     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
177     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
178     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
179     (hayaka*)               local_addres=133.5.4.33;     local_host=lckyuh;;
180     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxe6;;
181     (hd1)                   local_addres=130.75.4.104;   local_host=lcsgih;;
182     (hd2)                   local_addres=130.75.4.105;   local_host=lcsgih;;
183     (hd3)                   local_addres=130.75.4.106;   local_host=lcsgih;;
184     (hd4)                   local_addres=130.75.4.107;   local_host=lcsgih;;
185     (hicegate0)             local_addres=130.75.4.101;   local_host=lcsgih;;
186     (h01*|hicegate1)        local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
187     (hicegate2)             local_addres=130.75.4.103;   local_host=lcsgih;;
188     (hx*)                   local_addres=133.3.51.11;    local_host=lckyoto;;
189     (inferno)               local_addres=130.75.105.5;   local_host=lcmuk;;
190     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
191     (jaboticaba)            local_addres=150.163.25.181; local_host=lcbr;;
192     (sno)                   local_addres=130.75.105.113; local_host=lcmuk;;
193     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
194     (login*)                local_addres=118.128.66.223; local_host=lckiaps;;
195     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
196     (meller)                local_addres=134.106.74.155; local_host=lcfor;;
197     (meteo-login*)          local_addres=193.166.211.144;local_host=lcxt5m;;
198     (hexagon*)              local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxe6;;
199     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
200     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
201     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
202     (paesano)               local_addres=130.75.105.46;  local_host=lcmuk;;
203     (pcj*)                  local_addres=172.31.120.1;   local_host=lckyut;;
204     (pingui)                local_addres=134.106.74.118; local_host=lcfor;;
205     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
206     (rte*)                  local_addres=133.5.185.60;   local_host=lcrte;;
207     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
208     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgib;;
209     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
210     (shiokaze-lx)           local_addres=134.106.74.123; local_host=lcfor;;
211     (sisu-login*)           local_addres=86.50.166.21;   local_host=lccrayf;;
212     (solano)                local_addres=130.75.105.110; local_host=lcmuk;;
213     (sugoka*)               local_addres=172.31.120.1;   local_host=lckyut;;
214     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
215     (sx-*)                  local_addres=172.16.1.131;   local_host=necriam;;
216     (t2a*)                  local_addres=10.1.6.165;     local_host=lctit;;
217     (urban*)                local_addres=147.46.30.151   local_host=lcsb;;
218     (vinessa)               local_addres=130.75.105.112; local_host=lcmuk;;
219     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
220     (*.cc.kyushu-u.ac.jp)   local_addres=133.5.4.129;    local_host=ibmku;;
221     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
222                             printf "\n      please contact the PALM group at IMUK";
223                             locat=parameter; exit;;
224 esac
225
226
227
228    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
229 remote_host=$local_host
230
231
232
233
234    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
235 while  getopts  :c:dDe:g:h:m:n:N:O:P:q:t:T:u:vX:  option
236 do
237   case  $option  in
238       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
239       (d)   delete_dayfile=true;;
240       (D)   no_submit=true;;
241       (e)   email_notification=$OPTARG;;
242       (g)   group_number=$OPTARG;;
243       (h)   remote_host=$OPTARG;;
244       (m)   memory=$OPTARG;;
245       (n)   job_name=$OPTARG;;
246       (N)   node_usage=$OPTARG;;
247       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
248       (P)   scp_port=$OPTARG;;
249       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
250       (t)   cputime=$OPTARG;;
251       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
252       (u)   remote_user=$OPTARG;;
253       (v)   verify=false;;
254       (X)   numprocs=$OPTARG;;
255       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
256             locat=option; exit;;
257   esac
258 done
259
260
261    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
262 (( to_shift = $OPTIND - 1 ))
263 shift $to_shift; file_to_send=$1
264
265
266    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
267 if [ "$1" = "?" ]
268 then
269   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
270    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
271    printf "\n      Description of available options:\n"
272    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
273    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
274    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
275    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
276    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
277    printf "\n              ibm, ibmh, ibmkisti, ibmku, ibms, ibmy, lc...,"
278    printf "\n              lckiaps, lctit, nech, necriam, unics"
279    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
280    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
281    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
282    printf "\n        -P    ssh/scp port                        default port"
283    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
284    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
285    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
286    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
287    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
288    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
289    printf "\n "
290    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
291    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
292    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
293    exit
294 fi
295
296
297
298    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
299 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
300 then
301    printf "\n  +++ job-file missing"
302    locat=parameter; exit
303 else
304    if [[ -f $file_to_send ]]
305    then
306       true
307    else
308       printf "\n  +++ job-file: "
309       printf "\n           $file_to_send"
310       printf "\n      does not exist"
311       locat=parameter; exit
312    fi
313 fi
314
315
316
317    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
318    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
319 if [[ $job_name = none ]]
320 then
321    job_name=$file_to_send
322 fi
323 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
324 then
325    printf "\n  +++ job-file name: "
326    printf "\n           $job_name"
327    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
328    locat=parameter; exit
329 fi
330
331
332
333
334    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
335    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
336 if [[ $remote_host = none ]]
337 then
338    printf "\n  +++ host missing"
339    locat=option; exit
340 else
341    case  $remote_host  in
342        (ibm)     queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
343        (ibmh)    queue=cluster; remote_addres=136.172.40.15; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
344        (ibmkisti) queue=class.32plus; remote_addres=150.183.146.24; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
345        (ibmku)   queue=s4; remote_addres=133.5.4.129; submcom=/usr/local/bin/llsubmit;;
346        (ibms)    queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
347        (ibmy)    queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
348        (lccrayb) queue=testq; remote_addres=130.73.233.1; submcom=/opt/moab/7.2.6/bin/msub;;
349        (lccrayh) queue=mpp1testq; remote_addres=130.75.4.1; submcom=/opt/moab/7.2.6/bin/msub;;
350        (lccrayf) queue=small; remote_addres=86.50.166.21; submcom=/opt/slurm/default/bin/sbatch;;
351        (lcfimm)  remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
352        (lcflow)  remote_addres=10.140.1.71; submcom=/cm/shared/apps/sge/6.2u5p2/bin/lx26-amd64/qsub;;
353        (lckyoto) remote_addres=133.3.51.11; submcom=/thin/local/bin/qsub;;
354        (lcsgib)  queue=smallq; remote_addres=130.73.232.104; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
355        (lcsgih)  queue=smallq; remote_addres=130.75.4.101; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
356        (lck)     remote_addres=165.132.26.61; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
357        (lckiaps) remote_addres=118.128.66.223; submcom=/cm/shared/apps/pbspro/11.0.2.110766/bin/qsub;;
358        (lckordi) remote_addres=210.219.61.8; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
359        (lckyuh)  remote_addres=133.5.4.33; submcom=/usr/bin/pjsub;;
360        (lckyut)  remote_addres=133.5.4.37; submcom=/usr/bin/pjsub;;
361        (lcsb)    remote_addres=147.46.30.151; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
362        (lctit)   queue=S; remote_addres=10.1.6.165; submcom=/opt/pbs/tools/bin/t2sub;;
363        (lcxe6)   remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.5.10/bin/qsub;;
364        (lcxt5m)  remote_addres=193.166.211.144; submcom=/opt/pbs/10.1.0.91350/bin/qsub;;
365        (lcyon)   remote_addres=165.132.26.68; submcom=/usr/torque/bin/qsub;;
366        (nech)    qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
367        (necriam) qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=172.16.1.131; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
368        (vpp)     qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
369        (unics)   qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
370        (*)       printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
371                  locat=parameter; exit;;
372    esac
373 fi
374
375
376    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
377 if [[ $no_default_queue != none ]]
378 then
379    error=false
380    ndq=$no_default_queue
381    case  $remote_host  in
382        (ibm)    case  $ndq  in
383                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
384                     (*)                                     error=true;;
385                 esac;;
386        (ibmh)   case  $ndq  in
387                     (cluster|express)  error=false;;
388                     (*)                                     error=true;;
389                 esac;;
390        (ibmkisti)   case  $ndq  in
391                     (class.32plus|class.1-2|class.2-32)  error=false;;
392                     (*)                                     error=true;;
393                 esac;;
394        (ibmku)  case  $ndq  in
395                     (sdbg1|sdbg2|sdbg4|s4|s16|s32|s32-s)    error=false;;
396                     (*)                                     error=true;;
397                 esac;;
398        (ibms)   case  $ndq  in
399                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
400                     (*)                                     error=true;;
401                 esac;;
402        (ibmy)   case  $ndq  in
403                     (parallel)                              error=false;;
404                     (*)                                     error=true;;
405                 esac;;
406        (lccrayb) case  $ndq  in
407                     (mpp1q|testq|specialm1q)                error=false;;
408                     (*)                                     error=true;;
409                 esac;;
410        (lccrayh) case  $ndq  in
411                     (mpp1q|mpp1testq|specialm1q|dataq)      error=false;;
412                     (*)                                     error=true;;
413                 esac;;
414        (lccrayf) case  $ndq  in
415                     (usup|test*|small|large)                error=false;;
416                     (*)                                     error=true;;
417                 esac;;
418        (lcflow) case  $ndq  in
419                     (cfd_lom_long.q|cfd_him_long.q|cfd_lom_serl.q|cfd_lom_shrt.q|cfd_him_shrt.q)  error=false;;
420                     (*)                                     error=true;;
421                 esac;;
422        (lckiaps) case  $ndq  in
423                     (express|normal)                        error=false;;
424                     (*)                                     error=true;;
425                 esac;;
426        (lckyoto) case  $ndq  in
427                     (eh|ph)                                 error=false;;
428                     (*)                                     error=true;;
429                 esac;;
430        (lckyuh) case  $ndq  in
431                     (fx-dbg|fx-single|fx-small|fx-middle|fx-large)  error=false;;
432                     (*)                                     error=true;;
433                 esac;;
434        (lckyut) case  $ndq  in
435                     (cx-dbg|cx-single|cx-small|cx-middle|cx-large)  error=false;;
436                     (*)                                     error=true;;
437                 esac;;
438        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
439                     (testq|serialq|smallq|mediumq|bigq|workq|dataq|permq|special1q)       error=false;;
440                     (*)                                     error=true;;
441                 esac;;
442        (lctit)  case  $ndq  in
443                     (G|L128|L256|L512H|S|S96|V)             error=false;;
444                     (*)                                     error=true;;
445                 esac;;
446        (t3eb)   case  $ndq  in
447                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
448                     (*)    error=true;;
449                 esac;;
450        (necriam) case  $ndq  in
451                     (SP|SS|P6)  error=false;;
452                     (*)    error=true;;
453                 esac;;
454        (t3eh)   case  $ndq  in
455                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
456                     (*)    error=true;;
457                 esac;;
458        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
459                     (low|normal|high)  error=false;;
460                     (*)    error=true;;
461                 esac;;
462        (t3es)  case  $ndq  in
463                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
464                     (*)    error=true;;
465                 esac;;
466        (unics)  case  $ndq  in
467                     (unics|ht)  error=false;;
468                     (*)         error=true;;
469                 esac;;
470    esac
471    if [[ $error = true ]]
472    then
473       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
474       locat=parameter; exit
475    else
476       queue=$no_default_queue
477    fi
478 fi
479
480
481
482    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
483    # AUFTEILEN
484 done=false
485 while [[ $done = false ]]
486 do
487    if (( $cputime <= 0 ))
488    then
489       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
490       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
491       printf "\n  >>> "
492       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
493    else
494       done=true
495    fi
496 done
497 if [[ $remote_host = nech ]]
498 then
499    if (( tasks_per_node != 0 ))
500    then
501       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
502    elif [[ $numprocs != 0 ]]
503    then
504       (( cputime = cputime * numprocs ))
505    fi
506 fi
507 (( stunden  = cputime / 3600 ))
508 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
509 (( minuten  = resttime / 60 ))
510 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
511 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
512
513
514
515    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
516 done=false
517 while [[ $done = false ]]
518 do
519    if (( memory <= 0 ))
520    then
521       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
522       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
523       printf "\n  >>> "
524       read  memory  1>/dev/null  2>&1
525    else
526       done=true
527    fi
528 done
529
530 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = necriam ]]
531 then
532    if (( tasks_per_node != 0 ))
533    then
534       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
535    elif [[ $numprocs != 0 ]]
536    then
537       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
538    else
539       (( Memory = memory / 1000 ))
540    fi
541 elif [[ $remote_host = lctit ]]
542 then
543    (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
544 fi
545
546
547    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
548 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
549 then
550    (( memory = memory * threads_per_task ))
551 fi
552
553
554    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
555 if (( tasks_per_node != 0 ))
556 then
557    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
558 fi
559
560
561    # Calculate number of processes per node
562 (( processes_per_node = tasks_per_node * threads_per_task ))
563
564
565    # Calculate number of MPI tasks
566 (( mpi_tasks = numprocs / threads_per_task ))
567
568
569    # Set port number option for calls of ssh/scp, subjob and batch_scp scripts
570 if [[ "$scp_port" != "" ]]
571 then
572    PORTOPT="-P $scp_port"
573    SSH_PORTOPT="-p $scp_port"
574 fi
575
576
577    # HEADER-AUSGABE
578 if [[ $verify = true ]]
579 then
580    printf "\n\n"
581    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
582    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
583    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "$spalte2"
584    printf "|                                                              | \n"
585    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
586    spalte1=$(echo local_host$punkte | cut -c-20)
587    spalte2=$punkte$local_host
588    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
589    spalte1=$(echo remote_host$punkte | cut -c-20)
590    spalte2=$punkte$remote_host
591    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
592    spalte1=$(echo queue$punkte | cut -c-20)
593    spalte2=$punkte$queue
594    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
595    spalte1=$(echo memory$punkte | cut -c-20)
596    spalte2="$punkte$memory mb"
597    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
598    spalte1=$(echo cputime$punkte | cut -c-20)
599    spalte2="$punkte$cputime sec"
600    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
601    spalte1=$(echo job_name$punkte | cut -c-20)
602    spalte2="$punkte$job_name"
603    printf "| %-20s%40s | \n" "$spalte1" "${spalte2: -40}"
604    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
605
606
607       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
608    antwort="dummy"
609    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
610    do
611       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
612    done
613    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
614    then
615       locat=verify; exit
616    fi
617    printf "\n"
618 fi
619
620
621
622    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
623 kennung=$RANDOM
624 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
625 job_to_send=job_to_send_$kennung
626 if [[ $delete_dayfile = false ]]
627 then
628    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
629    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
630 else
631    remote_dayfile=/dev/null
632 fi
633
634
635
636    # Generate the batch job scripts (qsub/msub/LoadLeveler)
637 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
638 then
639
640       # General LoadLeveler settings
641    execute_in_shell="#!/bin/ksh"
642    use_shell="# @ shell = /bin/ksh"
643    consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
644    class="# @ class = $queue"
645    environment="# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes"
646    network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
647    data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
648    image_size="# @ image_size = 50"
649    wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring"
650
651    if [[ $email_notification = none ]]
652    then
653       notify_user=""
654    else
655       notify_user="# @ notify_user = $email_notification"
656       if [[ $delete_dayfile = true ]]
657       then
658          notification='# @ notification = never'
659       fi
660    fi
661
662    if [[ $remote_host = ibmh ]]
663    then
664       data_limit=""
665       network_to_use=""
666       class="# @ class = $queue"
667       environment=""
668       rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
669       task_affinity="# @ task_affinity = core(1)"
670    elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
671    then
672       network_to_use="# @ network.MPI = sn_all,shared,US"
673       wall_clock_limit="# @ wall_clock_limit = $timestring"
674       if [[ $threads_per_task = 1 ]]
675       then
676          rset="# @ rset = RSET_MCM_AFFINITY"
677          mcm_affinity_options="# @ mcm_affinity_options = mcm_mem_pref mcm_sni_none mcm_distribute"
678       fi
679       environment=""
680       use_shell=""
681       data_limit=""
682       image_size=""
683    elif [[ $remote_host = ibmku ]]
684    then
685       execute_in_shell="#!/usr/bin/ksh"
686       use_shell="# @ shell = /usr/bin/ksh"
687       consumable_memory=""
688       environment=""
689       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
690       data_limit=""
691       image_size=""
692    elif [[ $remote_host = ibms ]]
693    then
694       network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
695    elif [[ $remote_host = ibmy ]]
696    then
697       consumable_memory=""
698       network_to_use=""
699    fi
700
701    cat > $job_to_send << %%END%%
702$execute_in_shell
703$use_shell
704
705# @ job_type = parallel
706# @ job_name = $job_name
707# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
708# @ output = $remote_dayfile
709# @ error = $remote_dayfile
710$wall_clock_limit
711$image_size
712$class
713$environment
714$network_to_use
715$data_limit
716$rset
717$mcm_affinity_options
718$task_affinity
719$notification
720$notify_user
721
722%%END%%
723
724    if (( nodes > 0 ))
725    then
726
727       if [[ $remote_host != ibmkisti ]]
728       then
729
730          cat >> $job_to_send << %%END%%
731# @ node = $nodes
732# @ tasks_per_node = $processes_per_node
733# @ node_usage = $node_usage
734# @ queue
735
736%%END%%
737
738       else
739
740          cat >> $job_to_send << %%END%%
741# @ total_tasks = $mpi_tasks
742# @ blocking = unlimited
743# @ queue
744
745%%END%%
746
747       fi
748
749    else
750
751       if [[ $remote_host != ibmy ]]
752       then
753
754          cat >> $job_to_send << %%END%%
755# @ blocking = unlimited
756# @ total_tasks = $numprocs
757# @ node_usage = $node_usage
758# @ queue
759
760%%END%%
761
762       else
763
764          cat >> $job_to_send << %%END%%
765# @ node = 1
766# @ total_tasks = $numprocs
767# @ queue
768
769%%END%%
770
771       fi
772
773    fi
774
775       # workaround because of silly job filter on ibmkisti
776    if [[ $remote_host = ibmkisti  &&  $threads_per_task != 1 ]]
777    then
778       echo  "export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task"  >>  $job_to_send
779    fi
780
781 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
782 then
783
784    cat > $job_to_send << %%END%%
785#!/bin/ksh
786
787# @ job_type = serial
788# @ node_usage = $node_usage
789# @ job_name = palm
790# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
791# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
792# @ output = $remote_dayfile
793# @ error = $remote_dayfile
794$class
795$notification
796
797# @ queue
798
799%%END%%
800
801 elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
802 then
803
804    if [[ $numprocs != 0 ]]
805    then
806       cat > $job_to_send << %%END%%
807#!/bin/bash
808#PBS -N $job_name
809#PBS -l walltime=$timestring
810#PBS -l nodes=$nodes:ppn=$processes_per_node
811#PBS -o $remote_dayfile
812#PBS -j oe
813#PBS -q $queue
814
815$module_calls
816
817%%END%%
818
819    else
820
821       continue
822
823    fi
824
825 elif [[ $remote_host = lccrayf ]]
826 then
827
828    if [[ $numprocs != 0 ]]
829    then
830       cat > $job_to_send << %%END%%
831#!/bin/bash -l
832#SBATCH -J $job_name
833#SBATCH -t $timestring
834#SBATCH -N $nodes
835#SBATCH --ntasks-per-node=$processes_per_node
836#SBATCH -p $queue
837#SBATCH -o $remote_dayfile
838#SBATCH -e $remote_dayfile
839
840$init_cmds
841$module_calls
842
843%%END%%
844
845    else
846       cat > $job_to_send << %%END%%
847#!/bin/bash -l
848#SBATCH -J $job_name
849#SBATCH -t $timestring
850#SBATCH -l ncpus=1
851#SBATCH -l pmem=${memory}mb
852#SBATCH -m abe
853#SBATCH -o $remote_dayfile
854#SBATCH -e $remote_dayfile
855
856$init_cmds
857$module_calls
858
859%%END%%
860
861    fi
862
863 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
864 then
865
866    if [[ $numprocs != 0 ]]
867    then
868       cat > $job_to_send << %%END%%
869#!/bin/ksh
870#PBS -N $job_name
871#PBS -A $project_account
872#PBS -l walltime=$timestring
873#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$processes_per_node
874#PBS -l pmem=${memory}mb
875#PBS -m abe
876#PBS -o $remote_dayfile
877#PBS -j oe
878mpd &
879
880%%END%%
881
882    else
883       cat > $job_to_send << %%END%%
884#!/bin/ksh
885#PBS -N $job_name
886#PBS -A $project_account
887#PBS -l walltime=$timestring
888#PBS -l ncpus=1
889#PBS -l pmem=${memory}mb
890#PBS -m abe
891#PBS -o $remote_dayfile
892#PBS -j oe
893
894%%END%%
895
896    fi
897
898 elif [[ $remote_host = lcflow ]]
899 then
900    if [ $memory -gt 1800 ]; then
901      use_himem=""
902    else
903      use_himem="#"
904    fi
905    if [[ $numprocs != 0 ]]
906    then
907      pe_set="#$ -pe impi41 $numprocs"
908    else
909      pe_set="#$ -pe impi41 1"
910    fi
911    if [[ $queue = default ]]
912    then
913      queue_set=""
914    else
915      queue_set="#$ -q $queue"
916    fi
917    [[ "$disc_space" = "" ]]  &&  disc_space=50
918
919       cat > $job_to_send << %%END%%
920#!/bin/bash
921#$ -S /bin/bash
922#$ -N $job_name
923#$ -cwd
924#$ -l h_rt=$timestring
925#$ -l h_vmem=${memory}M
926#$ -o $remote_dayfile
927#$ -j y
928$pe_set
929#$ -R y
930${use_himem}#$ -l highmem=true
931#$ -l h_fsize=${disc_space}G
932$queue_set
933
934%%END%%
935
936 elif [[ $remote_host = lck || $remote_host = lckordi || $remote_host = lcsb ]]
937 then
938
939    if [[ $numprocs != 0 ]]
940    then
941       cat > $job_to_send << %%END%%
942#!/bin/ksh
943#PBS -N $job_name
944#PBS -l walltime=$timestring
945#PBS -l ncpus=$numprocs
946#PBS -l pmem=${memory}mb
947#PBS -o $remote_dayfile
948#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
949#PBS -j oe
950
951mpd &
952
953%%END%%
954
955    else
956       cat > $job_to_send << %%END%%
957#!/bin/ksh
958#PBS -N $job_name
959#PBS -l walltime=$timestring
960#PBS -l ncpus=1
961#PBS -l pmem=${memory}mb
962#PBS -o $remote_dayfile
963#PBS -j oe
964
965%%END%%
966
967    fi
968
969 elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
970 then
971
972    if [[ $numprocs != 0 ]]
973    then
974       cat > $job_to_send << %%END%%
975#!/bin/ksh
976#PBS -N $job_name
977#PBS -l walltime=$timestring
978#PBS -l select=1:ncpus=$numprocs
979#PBS -l pmem=${memory}mb
980#PBS -q $queue
981#PBS -o $remote_dayfile
982#PBS -j oe
983#PBS -V
984
985%%END%%
986
987    else
988       cat > $job_to_send << %%END%%
989#!/bin/ksh
990#PBS -N $job_name
991#PBS -l walltime=$timestring
992#PBS -l ncpus=1
993#PBS -l pmem=${memory}mb
994#PBS -o $remote_dayfile
995#PBS -j oe
996
997%%END%%
998
999    fi
1000
1001 elif [[ $remote_host = lcyon ]]
1002 then
1003
1004    if [[ $numprocs != 0 ]]
1005    then
1006       cat > $job_to_send << %%END%%
1007#!/bin/ksh
1008#PBS -N $job_name
1009#PBS -l walltime=$timestring
1010#PBS -l ncpus=$numprocs
1011#PBS -l pmem=${memory}mb
1012#PBS -o $remote_dayfile
1013#PBS -j oe
1014
1015%%END%%
1016
1017    else
1018       cat > $job_to_send << %%END%%
1019#!/bin/ksh
1020#PBS -N $job_name
1021#PBS -l walltime=$timestring
1022#PBS -l ncpus=1
1023#PBS -l pmem=${memory}mb
1024#PBS -o $remote_dayfile
1025#PBS -j oe
1026
1027%%END%%
1028
1029    fi
1030
1031 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
1032 then
1033
1034    if [[ "$sgi_feature" != "" ]]
1035    then
1036       feature_directive="#PBS -l feature=$sgi_feature"
1037    else
1038       feature_directive=""
1039    fi
1040
1041    if [[ $queue = dataq || $queue = permq ]]
1042    then
1043       feature_directive="#PBS -l feature=data"
1044    fi
1045
1046    if [[ $queue = testq  || $queue = mediumq  ||  $queue = bigq  ||  $queue = workq  ||  $queue = dataq  ||  $queue = permq ||  $queue = serialq  ||  $queue = special1q ]]
1047    then
1048       queue_directive="#PBS -q $queue"
1049    else
1050       queue_directive=""
1051    fi
1052
1053    if [[ $email_notification = none ]]
1054    then
1055       email_directive=""
1056    else
1057       email_directive="#PBS -M $email_notification"
1058    fi
1059
1060    if [[ $numprocs != 0 ]]
1061    then
1062       cat > $job_to_send << %%END%%
1063#!/bin/bash
1064#PBS -N $job_name
1065#PBS -l walltime=$timestring
1066#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${processes_per_node}
1067#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
1068#PBS -o $remote_dayfile
1069#PBS -j oe
1070$feature_directive
1071$queue_directive
1072$email_directive
1073
1074eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
1075#. /usr/share/modules/init/bash
1076$init_cmds
1077$module_calls
1078
1079echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
1080
1081%%END%%
1082
1083    else
1084       cat > $job_to_send << %%END%%
1085#PBS -S /bin/bash
1086#PBS -N $job_name
1087#PBS -l walltime=$timestring
1088#PBS -l ncpus=1
1089#PBS -o $remote_dayfile
1090#PBS -j oe
1091$queue_directive
1092$email_directive
1093
1094eval \`/sw/swdist/bin/modulesinit\`
1095#. /usr/share/modules/init/bash
1096$init_cmds
1097$module_calls
1098
1099%%END%%
1100
1101    fi
1102
1103 elif [[ $remote_host = lcxe6 ]]
1104 then
1105
1106    if [[ $numprocs != 0 ]]
1107    then
1108       cat > $job_to_send << %%END%%
1109#!/bin/ksh
1110#PBS -S /bin/ksh
1111#PBS -N $job_name
1112#PBS -A $project_account
1113#PBS -j oe
1114#PBS -l walltime=$timestring
1115#PBS -l mppwidth=${numprocs}
1116#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
1117#PBS -m abe
1118#PBS -o $remote_dayfile
1119$email_directive
1120
1121$init_cmds
1122$module_calls
1123
1124%%END%%
1125
1126    else
1127       cat > $job_to_send << %%END%%
1128#!/bin/ksh
1129#PBS -S /bin/ksh
1130#PBS -N $job_name
1131#PBS -A $project_account
1132#PBS -j oe
1133#PBS -l walltime=$timestring
1134#PBS -l ncpus=1
1135#PBS -l pmem=${memory}mb
1136#PBS -m abe
1137$email_directive
1138#PBS -o $remote_dayfile
1139
1140$init_cmds
1141$module_calls
1142
1143%%END%%
1144
1145    fi
1146
1147 elif [[ $remote_host = lckyoto ]]
1148 then
1149
1150       cat > $job_to_send << %%END%%
1151#!/bin/ksh
1152# @\$-o $remote_dayfile
1153# @\$-eo -oi
1154# @\$-lP 16
1155# @\$-lp 1
1156# @\$-lm 28gb  -llm unlimited -ls unlimited
1157# @\$-q $queue
1158# @\$-Pvn abs_pack
1159##for intel? @\$-Pvn abs_unpack -Pvs unpack -Pvc unpack
1160#. /thin/local/etc/setprofile/intel-11.0.sh
1161#. /thin/local/etc/setprofile/mvapich2-1.4+intel-11.0.sh
1162. ~/.myprofile
1163#. /home2/t/t51254/palm/current_version/myprofile
1164#. /thin/apps/pgi/mpi.sh
1165#
1166env
1167#
1168set -x
1169
1170%%END%%
1171
1172 elif [[ $remote_host = lcxt5m ]]
1173 then
1174
1175    if [[ $numprocs != 0 ]]
1176    then
1177       cat > $job_to_send << %%END%%
1178#!/bin/ksh
1179#PBS -S /bin/ksh
1180#PBS -N $job_name
1181#PBS -j oe
1182#PBS -l walltime=$timestring
1183#PBS -l mppwidth=${numprocs}
1184#PBS -l mppnppn=${processes_per_node}
1185#PBS -m abe
1186#PBS -o $remote_dayfile
1187
1188$init_cmds
1189$module_calls
1190
1191%%END%%
1192
1193    else
1194       cat > $job_to_send << %%END%%
1195#!/bin/ksh
1196#PBS -S /bin/ksh
1197#PBS -N $job_name
1198#PBS -j oe
1199#PBS -l walltime=$timestring
1200#PBS -l ncpus=1
1201#PBS -l pmem=${memory}mb
1202#PBS -m abe
1203#PBS -o $remote_dayfile
1204
1205$init_cmds
1206$module_calls
1207
1208%%END%%
1209
1210    fi
1211
1212 elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1213 then
1214    cat > $job_to_send << %%END%%
1215#!/bin/bash
1216#PJM -L "rscgrp=$queue"
1217#PJM -L "node=$nodes"
1218#PJM --mpi "proc=$numprocs"
1219#PJM -L "elapse=$timestring"
1220#PJM -o $remote_dayfile
1221#PJM -j
1222#PJM -X
1223#PJM --no-stging
1224
1225export LANG=en_US.UTF-8
1226%%END%%
1227
1228 elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1229 then
1230    cat > $job_to_send << %%END%%
1231#!/bin/bash
1232#PJM -L "rscgrp=$queue"
1233#PJM -L "vnode=$numprocs"
1234#PJM -L "vnode-core=1"
1235#PJM -L "elapse=$timestring"
1236#PJM --mpi proc=$numprocs
1237#PJM -o $remote_dayfile
1238#PJM -j
1239#PJM -X
1240#PJM --no-stging
1241
1242export LANG=en_US.UTF-8
1243%%END%%
1244
1245 elif [[ $remote_host = nech ]]
1246 then
1247
1248    if (( nodes > 1 ))
1249    then
1250       cat > $job_to_send << %%END%%
1251#!/bin/ksh
1252#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
1253#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1254#PBS -b $nodes
1255#PBS -o $remote_dayfile
1256#PBS -N palm
1257#PBS -j o
1258#PBS -T mpisx
1259
1260%%END%%
1261
1262    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1263    then
1264       cat > $job_to_send << %%END%%
1265#!/bin/ksh
1266#PBS -l cpunum_prc=$processes_per_node,cputim_job=$cputime
1267#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
1268#PBS -o $remote_dayfile
1269#PBS -N palm
1270#PBS -j o
1271
1272%%END%%
1273
1274    else
1275       cat > $job_to_send << %%END%%
1276#!/bin/ksh
1277#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
1278#PBS -o $remote_dayfile
1279#PBS -j o
1280
1281%%END%%
1282
1283    fi
1284
1285 elif [[ $remote_host = necriam ]]
1286 then
1287
1288    if (( nodes > 1 ))
1289    then
1290       cat > $job_to_send << %%END%%
1291#!/bin/ksh
1292#PBS -b $nodes
1293#PBS -o $remote_dayfile
1294#PBS -N $job_name
1295#PBS -j o
1296#PBS -v MPIPROGINV=YES
1297
1298%%END%%
1299
1300    elif [[ $numprocs != 0 ]]
1301    then
1302       cat > $job_to_send << %%END%%
1303#!/bin/ksh
1304#PBS -q ${queue}
1305#PBS -o $remote_dayfile
1306#PBS -N $job_name
1307#PBS -j o
1308#PBS -v MPIPROGINV=YES
1309
1310%%END%%
1311
1312    else
1313       cat > $job_to_send << %%END%%
1314#!/bin/ksh
1315#PBS -o $remote_dayfile
1316#PBS -j o
1317
1318%%END%%
1319
1320    fi
1321
1322 elif [[ $remote_host = lctit ]]
1323 then
1324    cat > $job_to_send << %%END%%
1325#!/bin/ksh
1326$init_cmds
1327$module_calls
1328
1329%%END%%
1330
1331       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
1332    if [[ $tasks_per_node != $processes_per_node ]]
1333    then
1334       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1335    else
1336       submcom="$submcom -W group_list=$group_number -N $job_name -l walltime=$timestring -l select=$nodes:ncpus=$processes_per_node:mpiprocs=$tasks_per_node:mem=${Memory}gb -l place=scatter -o $remote_dayfile -j oe -q $queue "
1337    fi
1338
1339 else
1340
1341    cat > $job_to_send << %%END%%
1342# @\$-q ${queue}
1343# @\$-l${qsubtime} $timestring
1344# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
1345# @\$-o $remote_dayfile
1346# @\$-eo
1347
1348%%END%%
1349
1350 fi
1351
1352
1353    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
1354    # BEI EXIT VERANLASSEN
1355    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
1356    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
1357 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
1358 then
1359    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
1360    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
1361    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
1362    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $remote_host = lccrayb  ||  $remote_host = lccrayh  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lcflow  ||  $remote_host = lckiaps  ||  $remote_host = lckyu* ]]
1363    then
1364       if [[ $remote_host = ibmh ]]
1365       then
1366          return_queue=c1
1367       elif [[ $remote_host = ibmkisti ]]
1368       then
1369          return_queue=class.1-2
1370       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1371       then
1372          return_queue=sdbg2
1373       elif [[ $remote_host = ibms ]]
1374       then
1375          return_queue=p_normal
1376       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
1377       then
1378          return_queue=serial
1379       elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
1380       then
1381          return_queue=serialq
1382       elif [[ $remote_host = necriam ]]
1383       then
1384          return_queue=SP
1385       elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
1386       then
1387          return_queue=dataq
1388       elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
1389       then
1390          return_queue=express
1391       elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1392       then
1393          return_queue=cx-single
1394       elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1395       then
1396          return_queue=cx-single
1397       else
1398          return_queue=unknown
1399       fi
1400
1401       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1402       then
1403
1404          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1405          then
1406             echo "echo \"#!/usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1407             echo "echo \"# @ shell = /usr/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1408          else
1409             echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1410          fi
1411          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1412          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1413          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1414          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
1415          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1416          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1417          if [[ $host != "ibmh" ]]
1418          then
1419             echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1420          fi
1421          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1422          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
1423
1424          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
1425          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
1426
1427          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
1428          echo "echo \"batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1429          if [[ $remote_host = ibmku ]]
1430          then
1431             echo "echo \"rm  scpjob.$kennung\" >> scpjob.$kennung"   >>  $job_to_send
1432          fi
1433          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
1434
1435       elif [[ $remote_host = nech ]]
1436       then
1437          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
1438          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1439          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
1440          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1441          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1442          echo " "                                 >>  $job_to_send
1443          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1444          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
1445          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1446          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1447          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1448
1449       elif [[ $remote_host = necriam ]]
1450       then
1451          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1452          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
1453          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1454          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
1455          echo " "                                 >>  $job_to_send
1456          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1457          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1458          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1459          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1460
1461       elif [[ $remote_host = lckyuh ]]
1462       then
1463          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1464          echo "#!/bin/bash"                       >>  $job_to_send
1465          echo "#PJM -L \"node=1\""                >>  $job_to_send
1466          echo "#PJM -L \"rscgrp=$return_queue\""  >>  $job_to_send
1467          echo "#PJM --no-stging"                  >>  $job_to_send
1468          echo "#PJM -L \"elapse=30:00\""          >>  $job_to_send
1469          echo "#PJM -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1470          echo "#PJM -j"                           >>  $job_to_send
1471          echo " "                                 >>  $job_to_send
1472          echo "export LANG=en_US.UTF-8"           >>  $job_to_send
1473          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1474          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1475          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1476          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1477
1478       elif [[ $remote_host = lckyut ]]
1479       then
1480          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1481          echo "#!/bin/bash"                       >>  $job_to_send
1482          echo "#PJM -L \"vnode=1\""               >>  $job_to_send
1483          echo "#PJM -L \"rscgrp=$return_queue\""  >>  $job_to_send
1484          echo "#PJM --no-stging"                  >>  $job_to_send
1485          echo "#PJM -L \"elapse=30:00\""          >>  $job_to_send
1486          echo "#PJM -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1487          echo "#PJM -j"                           >>  $job_to_send
1488          echo " "                                 >>  $job_to_send
1489          echo "export LANG=en_US.UTF-8"           >>  $job_to_send
1490          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1491          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1492          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1493          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1494
1495       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1496       then
1497          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1498          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1499          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
1500          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
1501          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
1502          echo "#PBS -l feature=data"                    >>  $job_to_send
1503          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1504          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
1505          echo " "                                 >>  $job_to_send
1506          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
1507          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1508          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1509          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1510          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1511
1512       elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
1513       then
1514          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"        >>  $job_to_send
1515          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
1516          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
1517          echo "#PBS -l walltime=00:30:00"               >>  $job_to_send
1518          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
1519          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
1520          echo "#PBS -j oe"                              >>  $job_to_send
1521          echo " "                                       >>  $job_to_send
1522          echo "set -x"                                  >>  $job_to_send
1523          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1524          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1525          echo "%%END%%"                                 >>  $job_to_send
1526
1527       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1528       then
1529          echo "cat > scpjob.${kennung}.tmp << %%END%%"                  >>  $job_to_send
1530          echo "#!/bin/bash"                                             >>  $job_to_send
1531          echo "SGEPREFIX -S /bin/bash"                                  >>  $job_to_send
1532          echo "SGEPREFIX -N transfer_$job_name"                         >>  $job_to_send
1533          echo "SGEPREFIX -cwd"                                          >>  $job_to_send
1534          echo "SGEPREFIX -l h_rt=01:00:00"                              >>  $job_to_send
1535          echo "SGEPREFIX -l h_vmem=500M"                                >>  $job_to_send
1536          echo "SGEPREFIX -l excl_flow=false"                            >>  $job_to_send
1537          echo "SGEPREFIX -j y"                                          >>  $job_to_send
1538          echo "SGEPREFIX -o ${local_host}_${job_name}_scpjob_$kennung"  >>  $job_to_send 
1539          echo " "                                                       >>  $job_to_send 
1540          echo "set -x"                                                  >>  $job_to_send 
1541          echo "export PALM_BIN=$PALM_BIN" | sed -e 's:'$HOME':$HOME:'   >>  $job_to_send
1542          echo "export PATH=\$PATH:\$PALM_BIN"                           >>  $job_to_send
1543          echo ""                                 >>  $job_to_send         
1544          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1545          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1546          echo "rm -f scpjob.${kennung}"                                 >>  $job_to_send         
1547          echo "%%END%%"                                                 >>  $job_to_send
1548          echo "sed -e 's/SGEPREFIX/#$/g' scpjob.${kennung}.tmp > scpjob.${kennung}" >>  $job_to_send         
1549          echo "rm -f scpjob.${kennung}.tmp"                             >>  $job_to_send         
1550
1551       else
1552
1553          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
1554          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
1555          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
1556          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
1557          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
1558          then
1559             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
1560          fi
1561          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
1562#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
1563          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
1564          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
1565          echo " "                                 >>  $job_to_send
1566          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1567          then
1568             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
1569             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
1570          fi
1571          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
1572          echo "batch_scp  $PORTOPT  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
1573          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
1574          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
1575       fi
1576
1577       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1578       then
1579          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1580       elif [[ $remote_host = lccrayb || $remote_host = lccrayh ]]
1581       then
1582          echo "msub -q $return_queue  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1583       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1584       then
1585          echo "rm -rf \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1586          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"                         >>  $job_to_send
1587          echo "msub  scpjob.$kennung"                               >>  $job_to_send
1588       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1589       then
1590          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1591       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1592       then
1593          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1594       elif [[ $remote_host = lckiaps ]]
1595       then
1596          echo "mv  scpjob.$kennung  $job_catalog"           >>  $job_to_send
1597          echo "ssh $SSH_PORTOPT ${remote_username}@${remote_addres}  \"$submcom ${job_catalog}/scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
1598          echo "rm  ${job_catalog}/scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1599       elif [[ $remote_host = lckyu* ]]
1600       then
1601          echo "scp $PORTOPT scpjob.$kennung  ${remote_username}@${remote_addres}:job_queue"           >>  $job_to_send
1602          echo "ssh $SSH_PORTOPT ${remote_username}@${remote_addres}  \"cd job_queue; $submcom scpjob.$kennung; rm scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
1603       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1604       then
1605          echo "mv  scpjob.$kennung  $job_catalog"           >>  $job_to_send
1606          echo "/usr/bin/ssh ${remote_username}@${remote_addres}  \"$init_cmds $module_calls cd $job_catalog; $submcom scpjob.$kennung\" "  >>  $job_to_send
1607       else
1608          echo "$submcom  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
1609       fi
1610       if [[ $remote_host != ibmku  &&  $remote_host != lckiaps ]]
1611       then
1612          echo "rm  scpjob.$kennung"            >>  $job_to_send
1613       fi
1614       if [[ $remote_host = nech ]]
1615       then
1616          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1617       fi
1618    else
1619#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1620       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1621    fi
1622    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1623    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1624    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1625 fi
1626
1627
1628
1629    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1630 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1631
1632 if [[ $remote_host = ibm ]]
1633 then
1634    echo " "         >>  $job_to_send
1635    echo "exit"      >>  $job_to_send
1636 fi
1637
1638    # remove job file
1639 if [[ $remote_host = lctit  ||  $remote_host = ibmku  ||  $remote_host = lcflow ]]
1640 then
1641    echo " "                               >>  $job_to_send
1642    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1643 fi
1644
1645
1646
1647    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1648 if [[ -z $remote_user ]]
1649 then
1650    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1651    then
1652       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1653    fi
1654 fi
1655
1656
1657
1658    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1659 if [[ $no_submit = false ]]
1660 then
1661    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1662    then
1663       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1664       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1665       then
1666          job_catalog_save=$job_catalog
1667          job_catalog=job_queue
1668       elif [[ $remote_host = nech ]]
1669       then
1670          job_catalog_save=$job_catalog
1671          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1672       fi
1673       if [[ $remote_host = nech ]]
1674       then
1675             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1676             # TRANSFERIERT WERDEN
1677          scp  $PORTOPT  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1678       else
1679          scp  $PORTOPT  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1680       fi
1681       if [[ $? = 1 ]]
1682       then
1683          locat=scp; exit
1684       fi
1685       if [[ $remote_host = ibms ]]
1686       then
1687          job_catalog=$job_catalog_save
1688       fi
1689       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1690    else
1691       eval  job_catalog=$job_catalog
1692       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1693    fi
1694
1695
1696
1697       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1698    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1699    then
1700       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1701
1702       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  &&  $prio = true ]]
1703       then
1704          printf "\n >>> submit with HLRN qos-feature hiprio...\n"
1705          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom -l qos=hiprio $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1706       elif [[ $remote_host = ibmku ]]
1707       then
1708          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
1709       elif [[ $remote_host = lcflow ]]
1710       then
1711          /usr/bin/ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "$init_cmds $module_calls cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"
1712       else
1713          ssh  $SSH_PORTOPT $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1714       fi
1715
1716       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1717    else
1718       cd  $job_catalog
1719       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $local_host | cut -c1-6) = lccray ]]
1720       then
1721          eval  $submcom  $job_on_remhost
1722       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxe6  ||  $localhost = lck  || $localhost = lckordi ||  $localhost = lcyon || $localhost = lcsb  ||  $localhost = lckyu* ]]
1723       then
1724          chmod  u+x  $job_on_remhost
1725          eval  $submcom  $job_on_remhost
1726       elif [[ $local_host = nech ]]
1727       then
1728          if [[ $queue = default ]]
1729          then
1730             eval  $submcom  $job_on_remhost
1731          else
1732             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost
1733          fi
1734       else
1735          qsub  $job_on_remhost
1736       fi
1737
1738          # Jobfile must not be deleted on lctit/ibmku!! This will be done
1739          # only at the end of the job.
1740       if [[ $local_host != lctit  &&  $local_host != ibmku  &&  $local_host != lcflow ]]
1741       then
1742          rm  $job_on_remhost
1743       fi
1744       cd  -  > /dev/null
1745    fi
1746 fi
1747
1748
1749
1750    # ABSCHLUSSARBEITEN
1751
1752 if [[ $no_submit = false ]]
1753 then
1754    rm  -f $job_to_send
1755 fi
1756 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.