source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 195

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further adjustments and bugfixes for SGI system

  • Property svn:keywords set to Id
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RevLine 
[1]1#!/bin/ksh
[82]2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
[169]3# $Id: subjob 191 2008-08-27 14:34:51Z steinfeld $
[1]4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
[5]81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
[35]82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
[82]83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
[102]84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
[108]85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
[113]86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
[118]87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
[122]89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
[125]90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
[129]91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
[164]92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
[179]94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
[1]95
96
97    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
98 delete_dayfile=false
[122]99 group_number=none
[1]100 locat=normal
101 no_default_queue=none
102 no_submit=false
103 job_catalog="~/job_queue"
104 job_name=none
105 local_user=$LOGNAME
106 node_usage=shared
107 numprocs=1
108 punkte="..........................................................."
109 submcom=qsub
110 queue=default
111 remote_host=none
112 remote_user=""
113 verify=true
114
115 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
116 typeset  -i   inumprocs  nodes=tasks_per_node=threads_per_task=1
117 typeset  -L20 spalte1
118 typeset  -R40 spalte2
119 typeset  -L60 spalte3
120
121
122
123    # FEHLERBEHANDLUNG
124    # BEI EXIT:
125 trap 'if [[ $locat != normal ]]
126       then
127          case  $locat  in
128             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
129                       printf " by typing:"
130                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
131             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
132             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
133                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
134          esac
135          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
136          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
137       fi' exit
138
139
140    # BEI TERMINAL-BREAK:
141 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
142       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
143       exit
144      ' 2
145
146
147
148
149    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
150 local_host=$(hostname)
151
152
153
154    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
155    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
156 case  $local_host  in
157     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
[102]158     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
[5]159     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
[1]160     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
[12]161     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
[181]162     (b01*)                  local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgih;;
[108]163     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[1]164     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
[5]165     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
[108]166     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
[101]167     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
[35]168     (gate|n-sx)             local_addres=133.5.178.11;   local_host=neck;;
[1]169     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
170     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
[5]171     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
172     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
[164]173     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
[1]174     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
[181]175     (h01*)                  local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[5]176     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
177     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
178     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
[164]179     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
[1]180     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
[5]181     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
182     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
183     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
[1]184     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
[181]185     (service100)            local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
[1]186     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
[181]187     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
188     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgih;;
[1]189     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
190     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
191     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
192                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
193                             locat=parameter; exit;;
194 esac
195
196
197
198    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
199 remote_host=$local_host
200
201
202
203
204    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
[122]205 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
[1]206 do
207   case  $option  in
208       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
209       (d)   delete_dayfile=true;;
210       (D)   no_submit=true;;
[125]211       (g)   group_number=$OPTARG;;
[1]212       (h)   remote_host=$OPTARG;;
213       (m)   memory=$OPTARG;;
214       (n)   job_name=$OPTARG;;
215       (N)   node_usage=$OPTARG;;
216       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
217       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
218       (t)   cputime=$OPTARG;;
219       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
220       (u)   remote_user=$OPTARG;;
221       (v)   verify=false;;
222       (X)   numprocs=$OPTARG;;
223       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
224             locat=option; exit;;
225   esac
226 done
227
228
229    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
230 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
231
232
233    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
234 if [ "$1" = "?" ]
235 then
236   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
237    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
238    printf "\n      Description of available options:\n"
239    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
240    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
241    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
242    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
243    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
[5]244    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
[35]245    printf "\n              lctit, nech, neck, unics"
[1]246    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
247    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
248    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
249    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
250    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
251    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
252    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
253    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
254    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
255    printf "\n "
256    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
257    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
258    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
259    exit
260 fi
261
262
263
264    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
265 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
266 then
267    printf "\n  +++ job-file missing"
268    locat=parameter; exit
269 else
270    if [[ -f $file_to_send ]]
271    then
272       true
273    else
274       printf "\n  +++ job-file: "
275       printf "\n           $file_to_send"
276       printf "\n      does not exist"
277       locat=parameter; exit
278    fi
279 fi
280
281
282
283    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
284    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
285 if [[ $job_name = none ]]
286 then
287    job_name=$file_to_send
288 fi
289 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
290 then
291    printf "\n  +++ job-file name: "
292    printf "\n           $job_name"
293    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
294    locat=parameter; exit
295 fi
296
297
298
299
300    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
301    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
302 if [[ $remote_host = none ]]
303 then
304    printf "\n  +++ host missing"
305    locat=option; exit
306 else
307    case  $remote_host  in
308        (ibm)    queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
309        (ibmb)   queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
310        (ibmh)   queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
311        (ibms)   queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
312        (ibmy)   queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
[108]313        (lcfimm) remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
[191]314        (lcsgib) queue=smallq; remote_addres=130.73.232.102; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
315        (lcsgih) queue=smallq; remote_addres=130.75.4.102; submcom=/opt/moab/bin/msub;;
[118]316        (lctit)  queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
[164]317        (lcxt4)  remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
[1]318        (nech)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
[35]319        (neck)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=133.5.178.11; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
[1]320        (vpp)    qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
321        (unics)  qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
322        (*)      printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
323                 locat=parameter; exit;;
324    esac
325 fi
326
327
328    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
329 if [[ $no_default_queue != none ]]
330 then
331    error=false
332    ndq=$no_default_queue
333    case  $remote_host  in
334        (ibm)    case  $ndq  in
335                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
336                     (*)                                     error=true;;
337                 esac;;
338        (ibmb)   case  $ndq  in
339                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
340                     (*)                                     error=true;;
341                 esac;;
342        (ibmh)   case  $ndq  in
[113]343                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
[1]344                     (*)                                     error=true;;
345                 esac;;
346        (ibms)   case  $ndq  in
347                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
348                     (*)                                     error=true;;
349                 esac;;
350        (ibmy)   case  $ndq  in
351                     (parallel)                              error=false;;
352                     (*)                                     error=true;;
353                 esac;;
[191]354        (lcsgib|lcsgih)   case  $ndq  in
355                     (testq|smallq|bigq)                     error=false;;
356                     (*)                                     error=true;;
357                 esac;;
[1]358        (lctit)  case  $ndq  in
[129]359                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
[1]360                     (*)                                     error=true;;
361                 esac;;
362        (t3eb)   case  $ndq  in
363                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
364                     (*)    error=true;;
365                 esac;;
366        (t3eh)   case  $ndq  in
367                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
368                     (*)    error=true;;
369                 esac;;
370        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
371                     (low|normal|high)  error=false;;
372                     (*)    error=true;;
373                 esac;;
374        (t3es)  case  $ndq  in
375                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
376                     (*)    error=true;;
377                 esac;;
378        (unics)  case  $ndq  in
379                     (unics|ht)  error=false;;
380                     (*)         error=true;;
381                 esac;;
382    esac
383    if [[ $error = true ]]
384    then
385       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
386       locat=parameter; exit
387    else
388       queue=$no_default_queue
389    fi
390 fi
391
392
393
394    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
395 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
396 then
397    node_usage=shared
398 fi
399
400
401
402    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
403    # AUFTEILEN
404 done=false
405 while [[ $done = false ]]
406 do
407    if (( $cputime <= 0 ))
408    then
409       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
410       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
411       printf "\n  >>> "
412       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
413    else
414       done=true
415    fi
416 done
417 if [[ $remote_host = nech ]]
418 then
419    if (( tasks_per_node != 0 ))
420    then
421       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
422    elif [[ $numprocs != 0 ]]
423    then
424       (( cputime = cputime * numprocs ))
425    fi
426 fi
427 (( stunden  = cputime / 3600 ))
428 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
429 (( minuten  = resttime / 60 ))
430 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
431 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
432
433
434
435    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
436 done=false
437 while [[ $done = false ]]
438 do
439    if (( memory <= 0 ))
440    then
441       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
442       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
443       printf "\n  >>> "
444       read  memory  1>/dev/null  2>&1
445    else
446       done=true
447    fi
448 done
449
[35]450 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = neck ]]
[1]451 then
452    if (( tasks_per_node != 0 ))
453    then
454       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
455    elif [[ $numprocs != 0 ]]
456    then
457       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
458    else
459       (( Memory = memory / 1000 ))
460    fi
461 fi
462
463
464    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
465 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
466 then
467    (( memory = memory * threads_per_task ))
468 fi
469
470
471    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
472 if (( tasks_per_node != 0 ))
473 then
474    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
475 fi
476
477
478
479    # HEADER-AUSGABE
480 if [[ $verify = true ]]
481 then
482    printf "\n\n"
483    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
484    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
485    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
486    printf "|                                                              | \n"
487    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
488    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
489    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
490    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
491    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
492    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
493    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
494    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
495    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
496    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
497    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
498    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
499    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
500    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
501
502
503       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
504    antwort="dummy"
505    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
506    do
507       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
508    done
509    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
510    then
511       locat=verify; exit
512    fi
513    printf "\n"
514 fi
515
516
517
518    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
519 kennung=$RANDOM
520 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
521 job_to_send=job_to_send_$kennung
522 if [[ $delete_dayfile = false ]]
523 then
524    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
525    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
526 else
527    remote_dayfile=/dev/null
528    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
529    then
530       notification='# @ notification = never'
531    fi
532 fi
533
534
535
536    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
537 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
538 then
539
540    if [[ $remote_host = ibmy ]]
541    then
542       consumable_memory=""
543    else
544       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
545    fi
546    if [[ $queue = cdev ]]
547    then
548       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
549       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
550    else
551       if [[ $remote_host = ibms ]]
552       then
553          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
554       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
555       then
556          network_to_use=""
557       else
558          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
559          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
560       fi
561    fi
562
563    cat > $job_to_send << %%END%%
564#!/bin/ksh
565
566# @ job_type = parallel
567# @ job_name = palm
568# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
569# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
570# @ output = $remote_dayfile
571# @ error = $remote_dayfile
572# @ image_size = 50
573# @ class = $queue
574# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
575$network_to_use
576$data_limit
577$notification
578
579%%END%%
580
581    if (( nodes > 0 ))
582    then
583
584       cat >> $job_to_send << %%END%%
585# @ node = $nodes
586# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
587# @ node_usage = $node_usage
588# @ queue
589
590%%END%%
591
592    else
593
594       if [[ $remote_host != ibmy ]]
595       then
596
597          cat >> $job_to_send << %%END%%
598# @ blocking = unlimited
599# @ total_tasks = $numprocs
600# @ node_usage = $node_usage
601# @ queue
602
603%%END%%
604
605       else
606
607          cat >> $job_to_send << %%END%%
608# @ node = 1
609# @ total_tasks = $numprocs
610# @ queue
611
612%%END%%
613
614       fi
615
616    fi
617
618 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
619 then
620
621    cat > $job_to_send << %%END%%
622#!/bin/ksh
623
624# @ job_type = serial
625# @ node_usage = $node_usage
626# @ job_name = palm
627# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
628# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
629# @ output = $remote_dayfile
630# @ error = $remote_dayfile
631# @ class = $queue
632$notification
633
634# @ queue
635
636%%END%%
637
[108]638 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
639 then
640
641    if [[ $numprocs != 0 ]]
642    then
643       cat > $job_to_send << %%END%%
644#!/bin/ksh
645#PBS -N $job_name
646#PBS -A nersc
647#PBS -l walltime=$timestring
648#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
649#PBS -l pmem=${memory}mb
650#PBS -m abe
651#PBS -M igore@nersc.no
652#PBS -o $remote_dayfile
653#PBS -j oe
654mpd &
655
656%%END%%
657
[168]658    else
659       cat > $job_to_send << %%END%%
660#!/bin/ksh
661#PBS -N $job_name
662#PBS -A nersc
663#PBS -l walltime=$timestring
664#PBS -l ncpus=1
665#PBS -l pmem=${memory}mb
666#PBS -m abe
667#PBS -M igore@nersc.no
668#PBS -o $remote_dayfile
669#PBS -j oe
670
671%%END%%
672
673    fi
674
[181]675 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
[179]676 then
677
[191]678    if [[ $queue = testq ]]
679    then
680       queue_directive="#PBS -q $queue"
681    else
682       queue_directive=""
683    fi
684
[179]685    if [[ $numprocs != 0 ]]
686    then
687       cat > $job_to_send << %%END%%
[181]688#!/bin/bash
[179]689#PBS -N $job_name
690#PBS -l walltime=$timestring
[181]691#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
692#PBS -l feature=$sgi_feature
693#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
[179]694#PBS -o $remote_dayfile
695#PBS -j oe
[191]696$queue_directive
[179]697
698. /usr/share/modules/init/bash
[182]699# module load mvapich/mvapich-0.9.9-intel
[191]700module load mvapich2
[179]701module load netcdf
[181]702export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
703echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
[179]704
705%%END%%
706
707    else
708       cat > $job_to_send << %%END%%
709#PBS -S /bin/bash
710#PBS -N $job_name
711#PBS -l walltime=$timestring
712#PBS -l ncpus=1
713#PBS -o $remote_dayfile
714#PBS -e $remote_dayfile
715
716%%END%%
717
718    fi
719
[164]720 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
721 then
722
723    if [[ $numprocs != 0 ]]
724    then
725       cat > $job_to_send << %%END%%
726#!/bin/ksh
727#PBS -S /bin/ksh
728#PBS -N $job_name
729#PBS -A nersc
730#PBS -l walltime=$timestring
731#PBS -l mppwidth=${numprocs}
732#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
733#PBS -m abe
734#PBS -M igore@nersc.no
735#PBS -o $remote_dayfile
736#PBS -e $remote_dayfile
737
738%%END%%
739
[108]740    else
741       cat > $job_to_send << %%END%%
742#!/bin/ksh
[168]743#PBS -S /bin/ksh
[108]744#PBS -N $job_name
745#PBS -A nersc
746#PBS -l walltime=$timestring
747#PBS -l ncpus=1
748#PBS -l pmem=${memory}mb
749#PBS -m abe
750#PBS -M igore@nersc.no
751#PBS -o $remote_dayfile
[168]752#PBS -e $remote_dayfile
[108]753
754%%END%%
755
756    fi
757
[1]758 elif [[ $remote_host = nech ]]
759 then
760
761    if (( nodes > 1 ))
762    then
763       cat > $job_to_send << %%END%%
764#!/bin/ksh
765#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
766#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
767#PBS -b $nodes
768#PBS -o $remote_dayfile
769#PBS -N palm
770#PBS -j o
771#PBS -T mpisx
772
773%%END%%
774
775    elif [[ $numprocs != 0 ]]
776    then
777       cat > $job_to_send << %%END%%
778#!/bin/ksh
779#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
780#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
781#PBS -o $remote_dayfile
782#PBS -N palm
783#PBS -j o
784
785%%END%%
786
787    else
788       cat > $job_to_send << %%END%%
789#!/bin/ksh
790#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
791#PBS -o $remote_dayfile
792#PBS -j o
793
794%%END%%
795
796    fi
797
[35]798 elif [[ $remote_host = neck ]]
799 then
800
801    if (( nodes > 1 ))
802    then
803       cat > $job_to_send << %%END%%
804#!/bin/ksh
805#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
806#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
807#PBS -b $nodes
808#PBS -o $remote_dayfile
809#PBS -N palm
810#PBS -j o
811#PBS -T mpisx
812
813%%END%%
814
815    elif [[ $numprocs != 0 ]]
816    then
817       cat > $job_to_send << %%END%%
818#!/bin/ksh
819#PBS -q ${queue}
820#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
821#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
822#PBS -o $remote_dayfile
823#PBS -N palm
824#PBS -j o
825#PBS -T mpisx
826
827%%END%%
828
829    else
830       cat > $job_to_send << %%END%%
831#!/bin/ksh
832#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
833#PBS -o $remote_dayfile
834#PBS -j o
835
836%%END%%
837
838    fi
839
[1]840 elif [[ $remote_host = lctit ]]
841 then
842    cat > $job_to_send << %%END%%
843#!/bin/bash
844#$ -S /bin/bash
845cd $job_catalog
[69]846export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
847echo \$PATH
[1]848
849%%END%%
850
851       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
[118]852  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
[122]853    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
[1]854
855 else
856
857    cat > $job_to_send << %%END%%
858# @\$-q ${queue}
859# @\$-l${qsubtime} $timestring
860# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
861# @\$-o $remote_dayfile
862# @\$-eo
863
864%%END%%
865
866 fi
867
868
869    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
870    # BEI EXIT VERANLASSEN
871    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
872    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
873 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
874 then
875    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
876    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
877    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
[181]878    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
[1]879    then
880       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
881       then
882          return_queue=c1
883       elif [[ $remote_host = ibms ]]
884       then
885          return_queue=p_normal
886       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
887       then
888          return_queue=serial
889       elif [[ $remote_host = lctit ]]
890       then
[118]891          return_queue=sla3
[35]892       elif [[ $remote_host = neck ]]
[1]893       then
[35]894          return_queue=S
[1]895       else
896          return_queue=unknown
897       fi
898
899       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
900       then
901
902          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
903          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
904          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
905          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
906          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
907          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
908          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
909          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
910          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
911          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
912
913          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
914          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
915
916          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
917          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
918          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
919
920       elif [[ $remote_host = nech ]]
921       then
922          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
923          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
924          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
925          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
926          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
927          echo " "                                 >>  $job_to_send
928          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
929          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
930          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
931          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
932          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
933
[35]934       elif [[ $remote_host = neck ]]
935       then
936          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
937          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
938          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
939          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
940          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
941          echo " "                                 >>  $job_to_send
942          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
943          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
944          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
945          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
946
[181]947       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
948       then
949          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
950          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
951          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
952          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
953          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
954          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
955          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
956          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
957          echo " "                                 >>  $job_to_send
958          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
959          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
960          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
961          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
962          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
963
[1]964       elif [[ $remote_host = lctit ]]
965       then
966          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
967          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
968          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
969          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
970          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
971          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
972          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
973
974       else
975
976          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
977          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
978          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
979          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
980          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
981          then
982             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
983          fi
984          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
985#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
986          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
987          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
988          echo " "                                 >>  $job_to_send
989          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
990          then
991             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
992             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
993          fi
994          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
995          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
996          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
997          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
998       fi
999
1000       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1001       then
1002          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
[181]1003       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1004       then
1005          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1006          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
[1]1007       elif [[ $remote_host = lctit ]]
1008       then
1009          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
1010          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1011          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1012          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1013       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1014       then
1015          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1016       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1017       then
1018          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1019       else
1020          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1021       fi
1022       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1023       if [[ $remote_host = nech ]]
1024       then
1025          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1026       fi
1027    else
1028#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1029       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1030    fi
1031    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1032    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1033    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1034 fi
1035
1036
1037
1038    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1039 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
[69]1040
[1]1041 if [[ $remote_host = ibm ]]
1042 then
1043    echo " "         >>  $job_to_send
1044    echo "exit"      >>  $job_to_send
1045 fi
[69]1046 if [[ $remote_host = lctit ]]
1047 then
1048    echo " "                               >>  $job_to_send
1049    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1050 fi
[1]1051
1052
1053
1054    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1055 if [[ -z $remote_user ]]
1056 then
1057    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1058    then
1059       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1060    fi
1061 fi
1062
1063
1064
1065    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1066 if [[ $no_submit = false ]]
1067 then
1068    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1069    then
1070       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
[82]1071       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
[1]1072       then
[82]1073          job_catalog_save=$job_catalog
1074          job_catalog=job_queue
1075       elif [[ $remote_host = nech ]]
1076       then
1077          job_catalog_save=$job_catalog
1078          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1079       fi
1080       if [[ $local_host = decalpha ]]
1081       then
1082             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1083             # PASSWORT AB
1084          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1085       elif [[ $remote_host = nech ]]
1086       then
1087             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1088             # TRANSFERIERT WERDEN
1089          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1090       else
[82]1091          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
[1]1092       fi
[82]1093       if [[ $? = 1 ]]
1094       then
1095          locat=scp; exit
1096       fi
1097       if [[ $remote_host = ibms ]]
1098       then
1099          job_catalog=$job_catalog_save
1100       fi
[1]1101       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1102    else
1103       eval  job_catalog=$job_catalog
1104       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1105    fi
1106
1107
1108
1109       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1110    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1111    then
1112       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
[82]1113       if [[ $remote_host != lctit ]]
[1]1114       then
[191]1115          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
[1]1116       else
[82]1117             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1118             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1119             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1120          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1121          echo "first try" > send_protocol
1122          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1123          do
1124             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1125             then
1126                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1127             else
1128                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1129             fi
1130             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1
1131             cat send_protocol
1132          done
1133          sleep 10
1134          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1135          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1136          rm  send_protocol
1137       fi
[1]1138
1139       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1140    else
1141       cd  $job_catalog
1142       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1143       then
1144          eval  $submcom  $job_on_remhost
[164]1145       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
[108]1146       then
1147          eval  $submcom  $job_on_remhost
1148          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1149          chmod  u+x  $job_on_remhost
[1]1150       elif [[ $local_host = nech ]]
1151       then
1152          if [[ $queue = default ]]
1153          then
1154             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1155          else
1156             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1157          fi
1158       else
1159          qsub  $job_on_remhost
1160       fi
[69]1161          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1162       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
[1]1163       cd  -  > /dev/null
1164    fi
1165 fi
1166
1167
1168
1169    # ABSCHLUSSARBEITEN
1170
1171 if [[ $no_submit = false ]]
1172 then
1173    rm  $job_to_send
1174 fi
1175 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.