Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/palm_wd @ 3994

Last change on this file since 3994 was 3943, checked in by maronga, 6 years ago

bugfixes in urban surface model; output of greenz roof transpiration added/corrected; minor formatting improvements
  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 39.9 KB
Line 
1#!/usr/bin/env python
2# -*- coding: utf-8 -*-
3#--------------------------------------------------------------------------------#
4# This file is part of the PALM model system.
5#
6# PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
7# of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
8# either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
9#
10# PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12# A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13#
14# You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15# PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16#
17# Copyright 1997-2018  Leibniz Universitaet Hannover
18#--------------------------------------------------------------------------------#
19#
20# Current revisions:
21# -----------------
22#
23#
24# Former revisions:
25# -----------------
26# $Id: palm_wd 3943 2019-05-02 09:50:41Z suehring $
27# Adjustments and bugfixes
28#
29#
30# 2825 2018-02-20 21:48:27Z maronga
31# Modified header
32#
33# 2718 2018-01-02 08:49:38Z maronga
34# Corrected "Former revisions" section
35#
36# 2696 2017-12-14 17:12:51Z kanani
37# Change in file header (GPL part)
38#
39# 2416 2017-09-06 14:28:14Z maronga
40# Adapted for palmrun
41#
42# 1754 2016-02-22 13:50:22Z maronga
43#
44# 1753 2016-02-22 13:49:49Z maronga
45# Bugfix: use of global variables is required after updating configuration file
46#
47# 1751 2016-02-15 07:44:16Z maronga
48# Bugfixes: runs on multiple hosts caused crash of the watchdog. Progress bar
49# occasionally showed wrong progress.
50# New: Hosts can be switched on/off and update_frequency can be modified via
51# File->Options. Security check for cancelation of jobs.
52#
53# 1618 2015-07-13 06:52:15Z maronga
54# Added steering via configuration file .wd.config, to be place in the local
55# palm directory. Watchdog save files are automatically created upon first start.
56#
57# 1613 2015-07-08 14:53:29Z maronga
58# Bugfix: tooltip for queuing name did not show up on first update.
59# New: added contect menu for showing the parameter file and the run control
60# output
61#
62# 1611 2015-07-07 12:23:22Z maronga
63# Initial revision
64#
65#
66# Description:
67# ------------
68# PALM watchdog client for monitoring batch jobs on a variety of hosts specified
69# by the user
70#
71# Instructions:
72# -------------
73# 1) Modify the header section of palm_wd
74# 2) Move .wd.olddata and .wd.newdata to your palm directory
75#    (e.g. /home/user/current_version/.wd.newdata etc.)
76# 3) Modify a copy of palm_wdd for each host to be monitored and move it to the
77#    respective hosts
78# 4) Start the client either from mrungui or from shell by "nohup palm_wd&"
79
80# To do:
81# ------
82# 1) Add "Options", "Help" and "Manual"
83# 2) Move user settings to a configuration file
84#------------------------------------------------------------------------------!
85
86import ConfigParser as configparser
87import datetime
88import os
89from PyQt4 import QtGui, QtCore, uic
90from PyQt4.QtCore import pyqtSlot,SIGNAL,SLOT
91import shutil
92import subprocess as sub
93import sys
94import time
95
96# Determine PALM directories
97#  Check if configuration files exists and quit otherwise
98input_config = ".wd.config"
99
100for i in range(0,len(sys.argv)): 
101   out = sub.check_output("echo $PALM_BIN", shell=True, stderr=sub.STDOUT)
102   input_config = str(sys.argv[i])
103   palm_bin = out.rstrip()
104   palm_dir = out.split("palm")[0] + "palm/" + out.split("palm")[1].split("/")[1]
105       
106config = configparser.RawConfigParser(allow_no_value=True)
107
108if ( os.path.isfile(input_config) == False ):
109   print ("Error. No configuration file " + input_config + " found.")
110   raise SystemExit   
111else:
112   print(os.path.isfile(input_config))
113
114print(input_config)
115
116config.read(input_config) 
117
118config = ConfigParser.RawConfigParser()
119config.read(palm_dir + '/.wd.config')
120
121description = []
122hostname = []
123username = []
124pycall = []
125
126
127for i in range(0,len(config.sections())):
128
129    description_tmp = config.sections()[i]
130 
131    if ( description_tmp != 'Settings' ):
132     
133       if ( config.get(description_tmp, 'enabled') == 'true' ):
134          description.append(description_tmp)
135          hostname.append(config.get(description_tmp, 'hostname'))
136          username.append(config.get(description_tmp, 'username')) 
137          pycall.append(config.get(description_tmp, 'pycall'))
138    else:
139       update_frequency = int(config.get(description_tmp, 'update_frequency'))*60000
140
141# Check if .wd.olddata and .wd.newdata exist. Otherwise create the files
142if ( os.path.exists(palm_dir + '/.wd.olddata') == False ):
143   print "No .wd.olddata found. Creating..."
144   file1 = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'a')
145   file1.close()
146   
147
148if ( os.path.exists(palm_dir + '/.wd.newdata') == False ):
149   print "No .wd.newdata found. Creating..." 
150   file1 = open(palm_dir + '/.wd.newdata', 'a')
151   file1.close()
152
153# Dummy variables for the jobname and the progressbars
154jobname = ""
155timestamp = ""
156pbars = []
157job_data_list = []
158
159# Message box for showing RUN_CONTROL output
160class MessageBoxScroll(QtGui.QMessageBox):
161    def __init__(self):
162        QtGui.QMessageBox.__init__(self)
163        self.setSizeGripEnabled(True)
164
165    def event(self, e):
166        result = QtGui.QMessageBox.event(self, e)
167
168        self.setMinimumHeight(100)
169        self.setMaximumHeight(16777215)
170        self.setMinimumWidth(400)
171        self.setMaximumWidth(16777215)
172        self.setSizePolicy(QtGui.QSizePolicy.Expanding, QtGui.QSizePolicy.Expanding)
173
174        textEdit = self.findChild(QtGui.QTextEdit)
175        if textEdit != None :
176            textEdit.setMinimumHeight(800)
177            textEdit.setMaximumHeight(16777215)
178            textEdit.setMinimumWidth(1000)
179            textEdit.setMaximumWidth(16777215)
180            textEdit.setSizePolicy(QtGui.QSizePolicy.Expanding, QtGui.QSizePolicy.Expanding)
181            f = QtGui.QFont('not_a_font') #
182            f.setStyleHint(f.TypeWriter, f.PreferDefault)
183            textEdit.setFont(f)
184
185        return result
186
187
188# Message box for showing RUN_CONTROL output
189class OptionBox(QtGui.QDialog):
190    def __init__(self):
191     
192        super(OptionBox, self).__init__()
193     
194        uic.loadUi(palm_bin + '/palm_wd_files/wdoptions.ui', self)
195       
196        hostname = []
197        self.checkbox = []
198        j = -1
199        ypos = 0
200   
201        self.vbox = QtGui.QVBoxLayout(self)
202        self.vbox.setSpacing(0)
203        self.vbox.setMargin(0)       
204   
205        config.read(palm_dir + '/.wd.config')
206   
207        for i in range(0,len(config.sections())):
208
209           description_tmp = config.sections()[i]
210 
211           if ( description_tmp != 'Settings' ):
212              description.append(description_tmp)
213              hostname.append(config.get(description_tmp, 'hostname'))
214             
215              j = j + 1
216              self.checkbox.append(j)
217              self.checkbox[j] = QtGui.QCheckBox(description_tmp, self)   
218              ypos = ypos + 20
219              self.checkbox[j].move(10,0)
220              if ( config.get(description_tmp, 'enabled') == 'true' ):
221                 self.checkbox[j].toggle()
222                       
223              self.vbox.addWidget(self.checkbox[j])
224           else:
225              self.update_spin.setValue(int(config.get(description_tmp, 'update_frequency')))
226     
227        self.hostBox.setLayout(self.vbox)
228        self.hostBox.setGeometry(0, 0, 272, 50+ypos)
229        self.settingBox.setGeometry(281, 0, 214, 50+ypos)
230        self.ok.setGeometry(385, 50+ypos, 111, 24)
231        self.cancel.setGeometry(270, 50+ypos, 111, 24)
232       
233        self.setGeometry(0, 0, 500, 80+ypos)
234        self.show()
235       
236        return
237
238#   save updtes to file
239    def SaveAndClose(self):
240     
241       for i in range(0,len(self.checkbox)):
242         
243          if ( self.checkbox[i].checkState() == 0 ):
244             config.set(str(self.checkbox[i].text()),'enabled','false')
245          else:
246             config.set(str(self.checkbox[i].text()),'enabled','true')       
247       
248       config.set('Settings','update_frequency',self.update_spin.text()) 
249
250       with open(palm_dir + '/.wd.config', 'wb') as configfile:
251          config.write(configfile)
252
253
254       self.close()
255     
256       return
257
258
259
260# MainWindow class
261class Watchdog(QtGui.QMainWindow):
262   
263    def __init__(self):
264        super(Watchdog, self).__init__()
265       
266        self.InitUi()   
267       
268   
269    # Initialized MainWindow UI
270    def InitUi(self):
271
272        # Load predefined mainwindow
273        uic.loadUi(palm_bin + '/palm_wd_files/wd.ui', self)
274
275        # Resize columns and set number of rows to zero. Column 6 is hidden and
276        # contains the remote jobname (e.g. hannover.174610)
277        self.table.setColumnWidth(0,230)
278        self.table.setColumnWidth(1,80)
279        self.table.setColumnWidth(2,50)
280        self.table.setColumnWidth(3,80)     
281        self.table.setColumnWidth(4,180)
282        self.table.setColumnWidth(5,115)   
283        self.table.setColumnHidden(6, True)
284        self.table.setRowCount(0) 
285   
286        # Display MainWindow
287        self.show()
288        QtGui.QApplication.processEvents()
289
290        # Start refresh timer. On timeout perform update
291        self.timer = QtCore.QTimer(self)
292        self.timer.timeout.connect(self.Refresh)
293        self.timer.setSingleShot(False)
294        self.timer.start(update_frequency)
295
296        # The timetimer counts the time since last update
297        self.timetimer= QtCore.QElapsedTimer()
298        self.timetimer.start()
299
300        # The labeltimer induces the update of the remaining time in the UI
301        self.labeltimer = QtCore.QTimer(self)
302        self.labeltimer.timeout.connect(self.UpdateLabel)
303        self.labeltimer.setSingleShot(False)
304
305        # Update in the UI will be performed at each 1/10 of the update interval
306        self.labeltimer.start(update_frequency/10)   
307        self.label.setText("Next update in " + str(update_frequency/1000/60) + "min")
308
309        # Update the list now
310        self.Refresh()
311       
312
313    # Add a custom context menu
314    def OpenContextMenu(self, position):
315        menu = QtGui.QMenu()
316       
317        # "Show details" -> fetch details for the selected job
318        detailsjobAction = menu.addAction('Show job details')     
319        detailsjobAction.setStatusTip('Display detailed info for job')
320        detailsjobAction.triggered.connect(self.ShowDetails)
321
322        # "Show parameter file" -> show the contents of PARIN
323        parinAction = menu.addAction('Show parameter file')     
324        parinAction.setStatusTip('Display the parameter file of the job (e.g. PARIN / _p3d)')
325        parinAction.triggered.connect(self.ShowPARIN)
326       
327        rcAction = menu.addAction('Show run control file')     
328        rcAction.setStatusTip('Display the current run control file (e.g. RUN_CONTROL / _rc)')
329        rcAction.triggered.connect(self.ShowRC)
330       
331        # "Cancel job" -> remove job from queuing system
332        canceljobAction = menu.addAction('Cancel job')
333        canceljobAction.setStatusTip('Remove job from queueing system')
334        canceljobAction.triggered.connect(self.CancelJob)
335       
336        # "Force stop" -> force termination of job
337        stopjobAction = menu.addAction('Force stop')
338        stopjobAction.setStatusTip('Terminate job properly')
339        stopjobAction.triggered.connect(self.DoStop)
340   
341        # "Force restart" -> force rermination and restart of job
342        restartjobAction = menu.addAction('Force restart')
343        restartjobAction.setStatusTip('Terminate job properly and initiate restart')
344        restartjobAction.triggered.connect(self.DoRestart)
345 
346        # "Remove from list" -> remove a completed job from the list
347        removefromlistAction = menu.addAction('Remove from list')     
348        removefromlistAction.setStatusTip('Remove finished job')
349        removefromlistAction.triggered.connect(lambda: self.RemoveFromList(-1))     
350
351       
352        # Activate/deactive contect menu items based on the status of the runs
353        state = self.table.item(self.table.currentRow(),3).text()
354        if (state == "Canceled" or state == "Completed" or state == "Terminated"):
355            detailsjobAction.setEnabled(False)
356            canceljobAction.setEnabled(False) 
357            removefromlistAction.setEnabled(True) 
358        else:
359            detailsjobAction.setEnabled(True)
360            canceljobAction.setEnabled(True) 
361            removefromlistAction.setEnabled(False)   
362 
363        if ( state == "Running" ):
364            stopjobAction.setEnabled(True) 
365            restartjobAction.setEnabled(True)   
366            parinAction.setEnabled(True)
367            rcAction.setEnabled(True)         
368        else:
369            stopjobAction.setEnabled(False) 
370            restartjobAction.setEnabled(False)   
371            parinAction.setEnabled(False)
372            rcAction.setEnabled(False) 
373           
374        # Show the context menu
375        action = menu.exec_(self.table.mapToGlobal(position))
376
377
378    # Collecting watchdog data and display in the UI
379    def Refresh(self):
380     
381        # Use global variables
382        global pbars
383        global update_frequency
384
385        # Deactivate timer processes until update is finished
386        # QtGui.QApplication.processEvents() updates the UI whenever needed
387        self.labeltimer.stop() 
388        self.label.setText("Updating...") 
389        QtGui.QApplication.processEvents()
390        self.setEnabled(False)
391        QtGui.QApplication.processEvents()
392
393        # Get current timestamp
394        timestamp = datetime.datetime.now().strftime("%d/%m/%Y %H:%M")
395       
396        # Open an empty file for the watchdog data       
397        file = open(palm_dir + '/.wd.newdata', 'w')
398       
399 
400        # Set all required variables to their initial values. Sorting must be
401        # disabled.
402        self.table.setRowCount(0) 
403        self.table.setSortingEnabled(False)
404        i = -1
405        job_data_list = []
406        pbars = []
407       
408        # Scan all hosts in the variable hostname. For each host perform the
409        # update loop
410        for h in range(0,len(hostname)):
411         
412            # Perform ssh command
413            host    = username[h] + "@" + hostname[h]
414            ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd queue " + username[h]],
415                           shell=False,
416                           stdout=sub.PIPE,
417                           stderr=sub.PIPE)
418            result = ssh.stdout.readlines()
419            result = filter(None, result)
420 
421 
422            # Delete all job data
423            job_data_tmp = []
424            job_data = []
425            job_data_n = []   
426            job_progress = 0
427
428            # In case of errors display error message
429            if ( len(result) < 1 ):
430                error = ssh.stderr.readlines()
431                if ( error != [] ):
432                    notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Collect data',"Error. An error occured during read of job data for user " + username[h] +" for host " + description[h] + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
433
434            # No error -> save job data
435            else:       
436
437                # Successively write to job_data
438                for j in range(0,len(result)):
439   
440                    job_data_tmp.append(j)
441                    job_data_tmp[j] = result[j].split(" ")
442                    job_data_tmp[j] = filter(None, job_data_tmp[j])
443 
444                    job_data.append(j)   
445                    job_data[j] = [job_data_tmp[j][0], description[h], job_data_tmp[j][2],                 
446                                   job_data_tmp[j][3], int(float(job_data_tmp[j][4])*100), job_data_tmp[j][5], 
447                                   job_data_tmp[j][1], job_data_tmp[j][6].rstrip()]
448                    job_data_n.append(j)
449                    job_data_n[j] = job_data_tmp[j][1]
450
451            del(result)
452
453
454
455            # Now read the data from the last update from file. These data are
456            # already in the prefered format
457            file2 = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'r')
458            result = file2.readlines()
459            file2.close()
460
461            job_data_old = []
462            job_data_old_n = []
463            k = -1
464            for j in range(0,len(result)):
465                if ( result[j].split()[1] == description[h] ):
466                    k = k + 1
467                    job_data_old.append(k)
468                    job_data_old[k] = result[j].split(" ")
469                    job_data_old[k] = filter(None, job_data_old[k])
470                    job_data_old[k] = [line.rstrip('\n') for line in job_data_old[k]]
471                    job_data_old_n.append(k)
472                    job_data_old_n[k] = job_data_old[k][6]
473
474            # Merge the job_data and job_data_old to find completed, new and
475            # still queued jobs     
476            if ( len(job_data_n) > 0 and len(job_data_old_n) > 0 ):
477               jobs_full  = list(set(job_data_old_n) | set(job_data_n))
478               jobs_known    = list(set(job_data_old_n) & set(job_data_n))
479               jobs_complete = set(job_data_old_n) - set(job_data_n)
480               jobs_new      = set(job_data_n) - set(job_data_old_n)
481            elif ( len(job_data_n) > 0 ):
482               jobs_full  = job_data_n
483               jobs_known    = []
484               jobs_new = job_data_n
485               jobs_complete = []
486            elif ( len(job_data_old_n) > 0 ):
487               jobs_full  = job_data_old_n
488               jobs_known    = []
489               jobs_new = []
490               jobs_complete = job_data_old_n   
491            else:
492               jobs_full  = []
493               jobs_known    = []         
494               jobs_new = []
495               jobs_complete = []
496
497            # Display all known jobs
498            to_display = [list(job_data_n).index(item) for item in list(jobs_known) if list(jobs_known) and list(job_data_n)]
499            for j in range(0,len(to_display)):
500                i = i + 1
501                self.table.insertRow(i)
502                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][0])
503                item.setToolTip("Queuing name: " + job_data[to_display[j]][6])
504                self.table.setItem(i, 0, item)           
505                self.table.setItem(i, 1, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][1])) 
506                self.table.setItem(i, 2, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][2]))   
507                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][3]))
508                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][5])
509                item.setToolTip("Estimated job start: " + job_data[to_display[j]][7])               
510                self.table.setItem(i, 5, item) 
511                self.table.setItem(i, 6, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][6])) 
512                self.table.item(i,2).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
513                self.table.item(i,5).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
514                pbars.append(i)
515                pbars[i] = QtGui.QProgressBar(self)
516                pbars[i].setValue(int(job_data[to_display[j]][4])) 
517 
518                # Apply a color depending on the status of the job
519                if ( job_data[to_display[j]][3] == "Running" ):
520                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i]) 
521                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
522                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
523                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
524                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
525                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
526                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
527                else:
528                    pbars[j].setEnabled(False)
529                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i])
530                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
531                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
532                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
533                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
534                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
535                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
536               
537                # Save the job data to file
538                job_data_list.append(i)
539                job_data_list[i] = job_data[to_display[j]][0]
540               
541                printstring = str(job_data[to_display[j]][0]) + " " + \
542                              str(job_data[to_display[j]][1]) + " " + \
543                              str(job_data[to_display[j]][2]) + " " + \
544                              str(job_data[to_display[j]][3]) + " " + \
545                              str(job_data[to_display[j]][4]) + " " + \
546                              str(job_data[to_display[j]][5]) + " " + \
547                              str(job_data[to_display[j]][6]) + " " + \
548                              str(job_data[to_display[j]][7]) + "\n"
549                file.write(printstring)
550
551
552            # Display all new jobs
553            to_display = [list(job_data_n).index(item) for item in list(jobs_new) if list(jobs_new) and list(job_data_n)]
554            for j in range(0,len(to_display)):
555                i = i + 1
556                self.table.insertRow(i)
557                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][0])
558                item.setToolTip("Queuing name: " + job_data[to_display[j]][6])
559                self.table.setItem(i, 0, item)   
560                self.table.setItem(i, 1, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][1])) 
561                self.table.setItem(i, 2, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][2]))   
562                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][3])) 
563                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][5])
564                item.setToolTip("Estimated job start: " + job_data[to_display[j]][7])               
565                self.table.setItem(i, 5, item) 
566                self.table.setItem(i, 6, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][6])) 
567                self.table.item(i,2).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
568                self.table.item(i,5).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
569               
570                pbars.append(i)
571                pbars[i] = QtGui.QProgressBar(self)
572                pbars[i].setValue(int(job_data[to_display[j]][4]))   
573
574                # Apply a color depending on the status of the job
575                if ( job_data[to_display[j]][3] == "Running" ):
576                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i])           
577                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
578                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
579                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
580                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
581                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
582                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
583                else:
584                    pbars[j].setEnabled(False)
585                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i])
586                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
587                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
588                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
589                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
590                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
591                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
592         
593                # Save job data to file
594                job_data_list.append(i)
595                job_data_list[i] = job_data[to_display[j]][0]
596               
597                printstring = str(job_data[to_display[j]][0]) + " " + \
598                              str(job_data[to_display[j]][1]) + " " + \
599                              str(job_data[to_display[j]][2]) + " " + \
600                              str(job_data[to_display[j]][3]) + " " + \
601                              str(job_data[to_display[j]][4]) + " " + \
602                              str(job_data[to_display[j]][5]) + " " + \
603                              str(job_data[to_display[j]][6]) + " " + \
604                              str(job_data[to_display[j]][7]) + "\n"
605                file.write(printstring)
606
607
608            # Display all completed/canceled/aborted jobs. The watchdog cannot
609            # distinguish why the job has been finished
610            to_display = [list(job_data_old_n).index(item) for item in list(jobs_complete) if list(jobs_complete) and list(job_data_old_n)]
611            for j in range(0,len(to_display)):
612                i = i + 1
613                self.table.insertRow(i)
614                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][0])
615                item.setToolTip("Queuing name: " + job_data_old[to_display[j]][6])
616                self.table.setItem(i, 0, item)         
617                self.table.setItem(i, 1, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][1])) 
618                self.table.setItem(i, 2, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][2]))   
619                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][3])) 
620                pbars.append(i)
621                pbars[j] = QtGui.QProgressBar(self)
622                pbars[j].setValue(int(job_data_old[to_display[j]][4])) 
623                pbars[j].setEnabled(False)
624                self.table.setCellWidget(i,4,pbars[j]) 
625                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][5])
626                item.setToolTip("Estimated job start: " + job_data_old[to_display[j]][7])               
627                self.table.setItem(i, 5, item) 
628                self.table.setItem(i, 6, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][6])) 
629                self.table.item(i,2).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
630                self.table.item(i,5).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
631                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem("Completed"))
632               
633                # Apply a color depending on the status of the job
634                self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
635                self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
636                self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
637                self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
638                self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
639                self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
640
641         
642                # Save job data to file
643                job_data_list.append(i)
644                job_data_list[i] = job_data_old[to_display[j]][0]
645
646                printstring = str(job_data_old[to_display[j]][0]) + " " + \
647                              str(job_data_old[to_display[j]][1]) + " " + \
648                              str(job_data_old[to_display[j]][2]) + " " + \
649                              str(job_data_old[to_display[j]][3]) + " " + \
650                              str(job_data_old[to_display[j]][4]) + " " + \
651                              str(job_data_old[to_display[j]][5]) + " " + \
652                              str(job_data_old[to_display[j]][6]) + " " + \
653                              str(job_data_old[to_display[j]][7]) + "\n"
654                file.write(printstring)
655
656            del(jobs_complete)
657            del(jobs_new)
658            del(result)
659            del(job_data_old)
660            del(job_data_old_n)
661           
662        file.close()
663
664       
665        # Update is complete, sorting can thus be re-enabled               
666        self.table.setSortingEnabled(True) 
667
668        # Update the logfile
669        if ( os.path.isfile(palm_dir + '/.wd.newdata') ):
670            shutil.copy(palm_dir + '/.wd.newdata',palm_dir + '/.wd.olddata')
671
672        # Re-enable timer processes             
673        self.setEnabled(True)
674        self.label2.setText("Last update: " + timestamp)
675        self.label.setText("Update complete.")
676        self.timetimer.start()
677        self.timer.start(update_frequency)
678        self.labeltimer.start(update_frequency/10)
679        self.UpdateLabel()
680        QtGui.QApplication.processEvents()
681       
682    # Canceling selected job from table
683    def CancelJob(self):
684
685        # Return internal jobname
686        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
687        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()     
688 
689        # Check description of job in order to login on the correct host
690        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
691       
692        querybox = QtGui.QMessageBox()
693        querybox.setText("Attention!\nYou are trying to cancel a job. It will not be able to terminate properly.")
694        querybox.setInformativeText("Do you really want to cancel " + jobname + " on host " + descr + "?")
695        querybox.setStandardButtons(QtGui.QMessageBox.Yes | QtGui.QMessageBox.No)
696        querybox.setDefaultButton(QtGui.QMessageBox.No)
697        returnvalue = querybox.exec_()
698       
699        if ( returnvalue == QtGui.QMessageBox.Yes ):
700       
701           for h in range(0,len(description)):
702               if ( descr == description[h] ):
703                  host = username[h] + "@" + hostname[h]
704
705           ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd cancel " + jobname],
706                              shell=False,
707                              stdout=sub.PIPE,
708                              stderr=sub.PIPE)
709           result = ssh.stdout.readlines()
710           result = filter(None, result)
711       
712           # In case of error display a warning message
713           if ( len(result) == 0 ):
714               error = ssh.stderr.readlines()
715               notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Cancel job',"Error. Could not cancel job " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
716
717           # Otherwise inform the user and mark the job in the table
718           else:
719               self.table.setItem(self.table.currentRow(),3,QtGui.QTableWidgetItem("Canceled"))
720               notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Cancel job',"Job" + jobname + " canceled!\n\nServer message:\n" + ''.join(result))
721
722
723    # Show detailed information on job. For documentation see above
724    def ShowDetails(self):
725
726        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text() 
727        descr   = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
728        for h in range(0,len(description)):
729            if ( descr == description[h] ):
730                host = username[h] + "@" + hostname[h]
731
732        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd check " + jobname],
733                           shell=False,
734                           stdout=sub.PIPE,
735                           stderr=sub.PIPE)
736        result = ssh.stdout.readlines()
737        result = filter(None, result)
738
739        if ( len(result) == 0 ):
740            error = ssh.stderr.readlines()
741            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Show job details',"Error. Could not fetch job details for " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
742        else:
743            notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Job details',"Details for job " + jobname + ":\n\n" + ''.join(result))
744
745
746    # Perform a forced stop on the job
747    def DoStop(self):
748
749        # Return internal jobname
750        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
751        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()   
752        # Check description of job in order to login on the correct host
753        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
754        for h in range(0,len(description)):
755            if ( descr == description[h] ):
756                host = username[h] + "@" + hostname[h]
757                user = username[h]
758
759        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd stop " + jobrealname],
760                           shell=False,
761                           stdout=sub.PIPE,
762                           stderr=sub.PIPE)
763        result = ssh.stdout.readlines()
764        result = filter(None, result) 
765       
766        # In case of error display a warning message
767        if ( len(result) == 0 ):
768            error = ssh.stderr.readlines()
769            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Proper termination of job',"Error. Could not stop job " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
770
771        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
772        else:
773            self.table.setItem(self.table.currentRow(),3,QtGui.QTableWidgetItem("Terminated"))
774            notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Terminate job',"Termination of job " + jobname + " was initiated!\n\nServer message:\n" + ''.join(result))
775
776
777    # Perform a forced stop on the job
778    def DoRestart(self):
779
780        # Return internal jobname
781        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
782        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()   
783         
784        # Check description of job in order to login on the correct host
785        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
786        for h in range(0,len(description)):
787            if ( descr == description[h] ):
788                host = username[h] + "@" + hostname[h]
789                user = username[h]
790
791        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd restart " + jobrealname],
792                           shell=False,
793                           stdout=sub.PIPE,
794                           stderr=sub.PIPE)
795        result = ssh.stdout.readlines()
796        result = filter(None, result)
797       
798        # In case of error display a warning message
799        if ( len(result) == 0 ):
800            error = ssh.stderr.readlines()
801            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Proper termination of job',"Error. Could not stop job " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
802
803        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
804        else:
805            self.table.setItem(self.table.currentRow(),3,QtGui.QTableWidgetItem("Terminated"))
806            notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Terminate job for restart',"Restart for job" + jobname + " was initiated!\n\nServer message:\n" + ''.join(result))
807           
808
809    # Read the PARIN file of the job
810    def ShowPARIN(self):
811
812        # Return internal jobname
813        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
814        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()     
815 
816        # Check description of job in order to login on the correct host
817        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
818        for h in range(0,len(description)):
819            if ( descr == description[h] ):
820                host = username[h] + "@" + hostname[h]
821                user = username[h]
822
823        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd parin " + jobrealname],
824                           shell=False,
825                           stdout=sub.PIPE,
826                           stderr=sub.PIPE)
827        result = ssh.stdout.readlines()
828        result = filter(None, result)
829       
830        # In case of error display a warning message
831        if ( len(result) == 0 ):
832            error = ssh.stderr.readlines()
833            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Showing parameter file',"Error. Could not fetch parameter file for job " + jobrealname + " (" + jobname + ").\n\nError message:\n" + ''.join(error))
834
835        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
836        else:
837           mb = MessageBoxScroll()
838           mb.setText("Parameter file for job: " + jobrealname + "")
839           mb.setDetailedText(''.join(result))
840           mb.exec_()
841
842    # Read the PARIN file of the job
843    def ShowRC(self):
844
845        # Return internal jobname and real job name
846        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
847        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()     
848 
849        # Check description of job in order to login on the correct host
850        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
851        for h in range(0,len(description)):
852            if ( descr == description[h] ):
853                host = username[h] + "@" + hostname[h]
854                user = username[h]
855
856        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, pycall[h] + " palm_wdd rc " + jobrealname],
857                           shell=False,
858                           stdout=sub.PIPE,
859                           stderr=sub.PIPE)
860        result = ssh.stdout.readlines()
861        result = filter(None, result)
862       
863        # In case of error display a warning message
864        if ( len(result) == 0 ):
865            error = ssh.stderr.readlines()
866            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Showing run control',"Error. Could not fetch run control file for job " + jobrealname + "(" + jobname + ").\n\nError message:\n" + ''.join(error))
867
868        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
869        else:
870           mb = MessageBoxScroll()
871           lastline = result[len(result)-2].split()[2]
872           mb.setText("Simulated time for job " + jobrealname + " is currently: " + lastline)
873           mb.setDetailedText(''.join(result))
874           mb.exec_()
875
876    # Remove a job from list - removes the current row from the table and from
877    # save file
878    def RemoveFromList(self, row):
879        if ( row == -1 ):
880            row = self.table.currentRow()
881
882        # Read data from save file
883        job_to_delete = self.table.item(row,6).text()
884        self.table.removeRow(row)
885        file = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'r')
886        result = file.readlines()
887        result = filter(None, result)
888        file.close()
889        file = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'w')
890       
891        job_data_old = []
892       
893        if ( len(result) == 0 ):
894            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Read from .wd.olddata',"Error message:\n\nCould not read from file. I/O error.")
895        else: 
896            # Save data in array job_data_old
897            for j in range(0,len(result)):
898                job_data_old.append(j)
899                job_data_old[j] = result[j].split(" ")
900                job_data_old[j] = filter(None, job_data_old[j])
901                job_data_old[j] = [line.rstrip('\n') for line in job_data_old[j]]
902               
903                # Check if line j is the selected job, if not -> save to file
904                if ( job_data_old[j][6] != job_to_delete ):
905                    printstring = str(job_data_old[j][0]) + " " + \
906                                  str(job_data_old[j][1]) + " " + \
907                                  str(job_data_old[j][2]) + " " + \
908                                  str(job_data_old[j][3]) + " " + \
909                                  str(job_data_old[j][4]) + " " + \
910                                  str(job_data_old[j][5]) + " " + \
911                                  str(job_data_old[j][6]) + " " + \
912                                  str(job_data_old[j][7]) + "\n"
913                    file.write(printstring)
914           
915        file.close() 
916
917    # Remove all completed jobs from list
918    def ClearList(self):
919     
920       num_of_lines = self.table.rowCount()
921       
922       # Delete all lines with completed/canceled jobs from list. The counter
923       # must decrease as the line numbers would be messed up otherwise
924       for j in range(num_of_lines-1,-1,-1): 
925           state = self.table.item(j,3).text()
926           if ( state == "Completed" or state == "Canceled" or state == "Terminated"):
927              self.RemoveFromList(j)
928         
929    # Update the label
930    def UpdateLabel(self):
931        remaining_time = (update_frequency - self.timetimer.elapsed()) / 1000 / 60
932        self.label.setText("Next update in " + str(remaining_time) + " min")
933       
934
935    # Enter Options menu
936    def Options(self):
937 
938#       disable mainwindow 
939        self.setEnabled(False)
940     
941#       show Options Dialog     
942        opt = OptionBox()
943        opt.exec_()
944
945        self.UpdateHosts()
946        self.setEnabled(True)
947
948# Update settings
949    def UpdateHosts(self):
950
951       global update_frequency
952       global description
953       global hostname
954       global username
955       
956       description = []
957       hostname = []
958       username = []
959
960       for i in range(0,len(config.sections())):
961
962          description_tmp = config.sections()[i]
963 
964          if ( description_tmp != 'Settings' ):
965     
966             if ( config.get(description_tmp, 'enabled') == 'true' ):
967                description.append(description_tmp)
968                hostname.append(config.get(description_tmp, 'hostname'))
969                username.append(config.get(description_tmp, 'username')) 
970          else:
971             update_frequency = int(config.get(description_tmp, 'update_frequency'))*60000
972
973
974# Main loop       
975def main():
976   
977    app = QtGui.QApplication(sys.argv)
978    res = Watchdog() 
979    sys.exit(app.exec_())
980
981
982if __name__ == '__main__':
983    main()   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |