source: palm/trunk/SCRIPTS/mrun @ 367

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adapted for machine lck

  • Property svn:keywords set to Id Rev
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Line 
1#!/bin/ksh
2# mrun - Plot-Shellskript
3# $Id: mrun 367 2009-08-25 08:35:52Z maronga $
4
5     # Prozedur zum Starten von Modellaeufen
6
7     # letzte Aenderung:
8     # 03/03/94 - Siggi - Entwicklungsbeginn
9     # 21/03/94 - Siggi - Entwicklungsabschluss (Version 1.0)
10     # 09/12/94 - Siggi - allexport unterbunden; statt dessen werden jetzt ein-
11     #                    zelne Variable exportiert. Dies ist noetig, weil an-
12     #                    sonsten irgendein Speicher ueberlaeuft und von mrun
13     #                    aufgerufene Programme (z.B. stageout) mit Fehlern
14     #                    abbrechen (too many arguments)
15     # 20/06/95 - Siggi - noclobber muss explizit abgeschaltet, da jetzt
16     #                    defaultmaessig im RRZN-Profile eingeschaltet
17     # 10/06/97 - Siggi - Zusaetzliche Option -C bei cpp, damit // nicht
18     #                    wegfallen
19     # 25/04/00 - Siggi - Version 1.5
20     #                    remote_addres und remote_user in return_addres bzw.
21     #                    return_username umbenannt, return_username wird dem
22     #                    mrun-Aufruf im Job ueber Option -U mitgegeben.
23     #                    Neue Variable remote_username, die beim interaktiven
24     #                    mrun-Aufruf zwingend ueber die neue Option -u oder
25     #                    in der Konfigurationsdatei angegeben werden muss.
26     # 08/02/01 - Siggi - Alle mrun-Meldungen ins englische uebersetzt,
27     #                    Version 1.7
28     # 05/05/02 - Siggi - Uebersetzungen mittels make-Mechanismus moeglich
29     # 21/11/02 - Siggi - ENV-Variable XLFRTEOPTS wird vor Ausfuehrung auf
30     #                    IBM gesetzt, um Record-Laenge der NAMELIST-Dateien,
31     #                    zu bestimmen; Praeprozessoroptionen haben nun alle
32     #                    die Form -Dtext=text, weil auf IBM sonst text durch
33     #                    die leere Zeichenkette ersetzt wird
34     # 01/08/03 - Siggi  - Test of implementing dvrp+1PE on ibm
35     # 07/01/04 - Siggi  - additional preprocessor directive for ibm included
36     #                     (-D$OMP=OMP) in order to avoid problems with
37     #                     OMP_NUM_THREADS
38     # 04/01/05 - Siggi  - archiving on hanni and berni is done in separate
39     #                     tar files, one for each node used
40     # 07/01/04 - Siggi  - old code for t3e, vpp and hpcs eliminated
41     # 09/01/05 - Siggi  - workaround for getting the IP address on gfdl3
42     # 17/01/05 - Siggi  - job for data transfer to local machine now within
43     #                     job class c1 (HLRN)
44     # 27/01/05 - Siggi  - IP address workaround for gfdl3 removed
45     # 28/01/05 - Siggi  - tar-filenames on $PERM (HLRN) now include the
46     #                     base filename and cycle number
47     # 16/02/05 - Gerald - hababai validated
48     # 14/03/05 - Siggi  - abort on NEC after first runtime error (F_ERRCNT)
49     # 29/03/05 - Marcus - berni*-en0 validated
50     # 21/04/05 - Siggi  - transfer-job-protocol for avs-data is no more stored
51     # 24/04/05 - Siggi  - netcdf support on lcmuk
52     # 25/04/05 - Siggi  - netcdf support on gfld3 (decalpha)
53     # 11/05/05 - Siggi  - files with non-numeric extensions (.xxx after cycle
54     #                     number) can now be used within interactive runs
55     # 12/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibm
56     # 13/05/05 - Siggi  - error in tar-filenames on $PERM (HLRN) removed
57     # 18/05/05 - Siggi  - netcdf support on nec
58     # 24/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibms
59     # 14/06/05 - Siggi  - sleep interval after submit of restart job increased
60     #                     to 30 seconds
61     # 28/06/05 - Siggi  - bora adjusted to new intel compiler (LD_LIBRARY_
62     #                     PATH is temporarily set)
63     # 07/09/05 - Siggi  - setting of MP_EAGER_LIMIT switched off because it
64     #                     caused warnings in the job protocol
65     # 20/10/05 - Siggi  - update of netcdf-version on decalpha (gfdl3)
66     # 25/10/05 - Siggi  - error in listing files for getting the cycle number
67     #                     removed
68     # 26/10/05 - Siggi  - new paths for dvrp-library, transfer of catalogs
69     #                     realized by file attribute trpe
70     # 28/10/05 - Siggi  - if existing, the file extension is output in case
71     #                     of missing input file - no job abort in case of
72     #                     missing input files with file extensions
73     #                     (preliminary solution)
74     # 31/10/05 - Siggi  - data transfer from nech now within seperate job
75     # 04/11/05 - Siggi  - netcdf 3.6.0-p1 on ibmh/ibmb
76     # 07/12/05 - Siggi  - gallego and elephanta admitted
77     # 30/12/05 - Siggi  - gfdl5 (ibmy) admitted
78     # 10/01/06 - Siggi  - cpp directive for NetCDF 64bit support
79     # 20/01/06 - Siggi  - cpp directive for ibmy
80     # 09/02/06 - Siggi  - ibmy admitted for batch mode
81     # 13/04/06 - Siggi  - ostria admitted
82     # 18/04/06 - Siggi  - usage of OpenMP implemented (additional option -O)
83     # 10/05/06 - Siggi  - environment variable XLSMPOPTS set on IBM for
84     #                     optimization of OpenMP runs (option stacksize is
85     #                     necessary for large gridpoint numbers because
86     #                     otherwise a segmentation fault occurs)
87     # 23/05/05 - Siggi  - lctit (SUN Fire X4600) admitted
88     # 21/08/06 - Siggi  - standard mrun path on scirocco is as on bora
89     # 23/08/06 - Siggi  - netcdf support for scirocco (notebook)
90     # 20/09/06 - Marcus - add DVRP library on nech
91     # 24/10/06 - Siggi  - Environment variables for PALM steering are written
92     #                     on local NAMELIST file ENVPAR
93     # 24/11/06 - Siggi  - levanto admitted, maestro switched to ifc 9.1
94     # 28/11/06 - Siggi  - call to interpret_config.x_levanto because of SuSe 10
95     # 06/02/07 - Siggi  - add DVRP library on lcmuk
96     # 07/02/07 - Siggi  - revision of source code handling, source code is
97     #                     now expected in directory given by source_path and
98     #                     not in the current working directory, source code
99     #                     files provided in add_source_path are allways
100     #                     compiled, source code to be compiled is allways
101     #                     sampled in SOURCES_FOR_RUN_$fname which is a
102     #                     subdirectory of the current working directory,
103     #                     -s TEST  changed to  -s WRITE_PERMIT  or -s WP,
104     #                     adapted for RIAM (neck)
105     #                     bugfix for cycle number of output file (extout)
106     #                     all hpmuk-related code removed
107     # 14/02/07 - Siggi  - dvrp support for neck added
108     # 28/02/07 - Siggi  - empty lines in configuration file are accepted
109     #                     mrun_path replaced by PALM_BIN,
110     #                     all machines are calling interpret_config.x
111     # 14/03/07 - Siggi  - fimm admitted, revision number added to terminal
112     #                     output
113     # 16/03/07 - Siggi  - adjustments for lctit
114     # 29/03/07 - Siggi  - global revision transfered to batch job by new
115     #                     option -G
116     # 30/03/07 - Siggi  - compilation "by hand" removed, cpp-directives/options
117     #                     + netcdf/dvrp-options are read from configuration
118     #                     file, host identifier (local_host) is read from
119     #                     config file, code related to ftp filetransfer
120     #                     removed (incl. option -f)
121     # 19/06/07 - Siggi  - time limit for cdata jobs increased
122     # 25/07/07 - Siggi  - two sets of executables can be started on lcmuk,
123     #                     if new option -Y (coupling) is given,
124     #                     output of executables to aout_output removed,
125     #                     messages are immediately written to stdout instead
126     # 03/08/07 - Marcus - add XOPT="-X $numprocs" for lcfimm
127     # 09/08/07 - Marcus - workaround on lcfimm to propagate environment
128     #                     variables out to the nodes in coupled mode -disabled-
129     # 13/08/07 - Marcus - start local restart jobs per ssh on lcfimm
130     # 28/08/07 - Marcus - completely remove workaround on lcfimm to propagate
131     #                     environment variables out to the nodes in coupled mode
132     # 15/10/07 - Siggi  - Preliminary adjustments for lctit, based on Jin's
133     #                     suggestions
134     # 19/10/07 - Marcus - further adjustments for lctit: add new optional
135     #                     argument -g group_number, admit all sla* node_usage
136     #                     queues
137     # 30/10/07 - Marcus - further adjustments for queues on lctit
138     # 14/02/08 - Bjoern - link of restart files with long file name possible
139     # 28/02/08 - Marcus - If environment variable link_local_output is set to
140     #                     true, mrun tries "ln -f" on local output and resorts
141     #                     to "cp" or "cp -r" on error
142     # 15/04/08 - Siggi  - argument -c introduced to most of the subjob calls,
143     #                     which allows the user to choose his own job catalog
144     #                     by setting job_catalog in the configuration file
145     #                     (default is ~/job_queue),
146     #                     workaround for mpiexec with -env option,
147     #                     adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
148     #                     Science)
149     # 22/05/08 - Marcus - If environment variable link_local_input is set to
150     #                     true, mrun tries "ln -f" on local input and resorts
151     #                     to "cp" or "cp -r" on error
152     # 27/05/08 - Siggi  - PATH is set to PALM_BIN everywhere (missing so far)
153     # 14/07/08 - Siggi  - adjustments for lcsgih
154     # 08/08/08 - Marcus - typo removed in lcxt4 branch
155     # 17/09/08 - Siggi  - restart mechanism adjusted for lcsgi
156     # 02/10/08 - BjornM - argument "-Y" modified, adjustments for coupled runs
157     # 21/10/08 - Siggi  - bugfix for the case that -K has more than one
158     #                     argument
159     # 08/11/08 - Siggi  - bugfix for depository path settings in configuration
160     #                     file
161     # 11/11/08 - Siggi  - rules for using user code files changed: user
162     #                     code splitted into one file per subroutine,
163     #                     user can provide his/her own makefile, only
164     #                     default source-code filenames are allowed
165     # 14/11/08 - Siggi  - cond1 and cond2 are part of the depository name
166     # 08/01/09 - Siggi  - mpi module on sgi machines to be used can be set
167     #                     with environment variable mpilib
168     # 13/01/09 - Siggi  - totalview on hice/bice can be used in debug mode
169     #                     using environment variable totalview
170     # 25/02/09 - Siggi  - cputime-option (-t) is allowed to be omitted for
171     #                     interactive runs
172     # 05/03/09 - Siggi  - adjustments for new NEC-SX9 at RIAM (necriam)
173     # 16/03/09 - Siggi  - dvrp_lib, dvrp_inc replaced by dvr_lib, dvr_inc,
174     #                     dvr streaming server is automatically started using
175     #                     new variable dvr_server and a configuration file
176     #                     .dvrserver.config,
177     #                     processing of dvr output files using new script
178     #                     process_dvr_output implemented, in order to make
179     #                     dvr application more user friendly
180     # 20/03/09 - Marcus - update of n1ge command for lctit
181     # 16/04/09 - Siggi  - new option -y for precursor (uncoupled) ocean runs
182     #                     to be followed by a coupled atmosphere-ocean run
183     # 21/04/09 - Siggi  - adjustments for new IBM at DKRZ, which is now ibmh
184     # 24/06/09 - BjornM - adjustments for coupled/precursor runs on ibmy
185     # 08/07/09 - Siggi  - default value for email_notification is none,
186     #                     option -e added to subjob
187     # 19/08/09 - Marcus - MPI debug option
188     # 21/08/09 - Marcus - totalview on hice/bice also available for mvapich2
189     # 25/08/09 - BjornM - adpated for lck
190
191 
192    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
193
194 set +o allexport    # SICHERHEITSHALBER UNTERBINDEN, DA SONST EVTL. STAGEOUT
195                     # NICHT LAUEFT (TOO MANY ARGUMENTS - PROBLEM)
196 set +o noclobber    # EXISTIERENDE DATEIEN DUERFEN UEBERSCHRIEBEN WERDEN
197
198 AddFilenames=""
199 additional_conditions=""
200 add_source_path=""
201 afname=""
202 archive_save=true
203 archive_system=none
204 compiler_name=""
205 cond1=""
206 cond2="" 
207 config_file=.mrun.config
208 coupled_dist=""
209 coupled_mode="mpi1"
210 cpp_opts=""
211 cpp_options=""
212 cpumax=0
213 cpurest=0
214 delete_temporary_catalog=true
215 do_batch=false
216 do_compile=true
217 do_remote=false
218 do_stagein=true
219 do_stageout=true
220 do_trace=false
221 email_notification="none"
222 exclude=""
223 executable=""
224 execution_error=false
225 fimm=false
226 fname=test
227 fromhost=""
228 global_revision=""
229 group_number=none
230 host=""
231 host_file=""
232 hp=""
233 ignore_archive_error=false
234 input_list=""
235 interpreted_config_file=""
236 job_catalog="~/job_queue"
237 job_on_file=""
238 keep_data_from_previous_run=false
239 link_local_input=false
240 link_local_output=false
241 localhost_realname=$(hostname)
242 local_compile=false
243 local_dvrserver_running=.FALSE.
244 locat=normal
245 mainprog=""
246 makefile=""
247 mc=$0
248 while [[ $(echo $mc | grep -c "/") != 0 ]]
249 do
250    mc=`echo $mc | cut -f2- -d"/"`
251 done
252 module_files=""
253 mrun_script_name=$mc
254 netcdf_inc=""
255 netcdf_lib=""
256 netcdf_support=false
257 node_usage=default
258 numprocs=""
259 numprocs_atmos=0
260 numprocs_ocean=0
261 OOPT=""
262 openmp=false
263 output_list=""
264 package_list=""
265 punkte="..........................................................."
266 queue=none
267 read_from_config=""
268 restart_run=false
269 return_addres=$(nslookup `hostname` 2>&1 | grep "Address:" | tail -1 | awk '{print $2}')
270 if [[ $return_addres = 130.75.105.158 ]]
271 then
272    return_addres=172.20.25.41
273    echo "+++ WARNING: return_addres changed to $return_addres !!!!!"
274 fi
275 return_password=""
276 return_username=$LOGNAME
277 remotecall=false
278 remote_username=""
279 run_coupled_model=false
280 run_mode=""
281 scirocco=false
282 store_on_archive_system=true
283 striche="  ----------------------------------------------------------------------------"
284 silent=false
285 source_list=""
286 source_path=SOURCE
287 tasks_per_node=""
288 threads_per_task=1
289 tmpcreate=false
290 tmp_data_catalog=""
291 transfer_problems=false
292 usern=$LOGNAME
293 working_directory=`pwd`
294 TOPT=""
295 XOPT=""
296 zeit=$( date | cut -c 12-19 )
297
298 typeset -i  iec=0 iic=0 iin=0 ioc=0 iout=0 memory=0 stagein_anz=0 stageout_anz=0
299 typeset -i  cputime i ii iia iii iio icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
300
301 typeset  -R30 calltime
302 typeset  -L20 spalte1
303 typeset  -L40 spalte2
304 typeset  -L60 spalte3
305 typeset  -L35 string1=`date`
306 typeset  -L12 string2=$usern
307 typeset  -L12 string3=$localhost_realname
308 typeset  -L12 string4
309 typeset  -L12 string5
310 typeset  -L30 version="MRUN  2.0 Rev$Rev: 367 $"
311
312
313
314    # EINZELNE VARIABLE FUER HAUPTPROGRAMM EXPORTIEREN
315 export  cpurest fname host localhost return_addres return_username remotecall tasks_per_node
316
317    # FOLGENDE VARIABLEN MUESSEN FUER DIE INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI
318    # EXPORTIERT WERDEN
319 export  afname config_file cpp_opts cpumax do_batch do_trace fname fromhost
320 export  group_number input_list memory numprocs output_list queue run_mode
321
322
323 
324    # FEHLERBEHANDLUNG
325    # BEI EXIT:
326 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
327       if [[ $locat != localhost ]]
328       then
329#          if [[ ! -f ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik ]]
330#          then
331#             cat  >  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik  <<  %STATEND%
332#MRUN-calls on $localhost
333#
334#date and time                      user        localhost   remotehost  termination mrun-command
335#--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
336#%STATEND%
337#             chmod  666  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
338#          fi
339#
340#             # EINTRAG IN DIE STATISTIK-DATEI
341#          string4=$host
342#          string5=$locat
343#          if [[ "$job_on_file" = ""  &&  $locat != control_c  &&  $locat != user_abort ]]
344#          then
345#             if [[ $do_batch = true ]]
346#             then
347#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mrun_com \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
348#             else
349#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mc \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
350#             fi
351#          fi
352          echo " " > /dev/null
353       fi
354
355       if [[ $locat != normal  &&  $locat != control_c  &&  $locat != local_compile ]]
356       then
357
358              # EVENTUELLE ERROR-KOMMANDOS ABARBEITEN
359          (( i = 0 ))
360          while (( i < iec ))
361          do
362             (( i = i + 1 ))
363             printf "\n  *** Execution of ERROR-command:\n"
364             printf "  >>> ${err_command[$i]}\n"
365             eval  ${err_command[$i]}
366          done
367          if [[ -n $interpreted_config_file ]]  then
368             rm -rf  $interpreted_config_file
369          fi
370          if [[ -n .mrun_environment ]]  then
371             rm -rf  .mrun_environment
372          fi
373          if [[ $tmpcreate = true ]]
374          then
375             printf "\n  *** Contents of \"$TEMPDIR\":\n"
376             ls -al; cd
377             [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
378          fi
379          if [[ "$dvrserver_id" != "" ]]
380          then
381             echo "+++ killing dvrserver_id=$dvrserver_id"
382             kill $dvrserver_id
383          fi
384          if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
385          then
386             rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
387          fi
388          printf "\n\n+++ MRUN killed \n\n"
389       elif [[ $locat != control_c ]]
390       then
391          printf "\n\n --> all actions finished\n\n"
392          printf "     Bye, bye $usern !!\n\n"
393       fi' exit
394
395
396    # BEI TERMINAL-BREAK:
397 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
398       [[ $tmpcreate = true ]]  &&  (cd; rm -rf $TEMPDIR)
399       if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
400       then
401          rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
402       fi
403       if [[ "$dvrserver_id" != "" ]]
404       then
405          echo "+++ killing dvrserver_id=$dvrserver_id"
406          kill $dvrserver_id
407       fi
408       printf "\n+++ MRUN killed by \"^C\" \n\n"
409       locat=control_c
410       exit
411      ' 2
412
413
414    # CHECK IF THE PATH FOR THE PALM BINARIES (SCRIPTS+UTILITY-PROGRAMS) HAS
415    # BEEN SET
416 if [[ "$PALM_BIN" = "" ]]
417 then
418    printf "\n  +++ environment variable PALM_BIN has not been set"
419    printf "\n      please set it to the directory where the PALM scripts are located"
420    locat=palm_bin; exit
421 fi
422 export PATH=$PALM_BIN:$PATH
423
424
425
426    # SHELLSCRIPT-OPTIONEN EINLESEN UND KOMMANDO NEU ZUSAMMENSETZEN, FALLS ES
427    # FUER FOLGEJOBS BENOETIGT WIRD
428 while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:Fg:G:h:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX:yY: option
429 do
430   case  $option  in
431       (a)   afname=$OPTARG;;
432       (A)   store_on_archive_system=false; mc="$mc -A";;
433       (b)   do_batch=true; mc="$mc -b";;
434       (B)   delete_temporary_catalog=false; mc="$mc -B";;
435       (c)   config_file=$OPTARG; mc="$mc -c$OPTARG";;
436       (C)   restart_run=true; mc="$mc -C";;
437       (d)   fname=$OPTARG; mc="$mc -d$OPTARG";;
438       (D)   cpp_opts="$cpp_opts $OPTARG"; mc="$mc -D'$OPTARG'";;
439       (F)   job_on_file="-D"; mc="$mc -F";;
440       (g)   group_number=$OPTARG; mc="$mc -g$OPTARG";;
441       (G)   global_revision=$OPTARG; mc="$mc -G'$OPTARG'";;
442       (h)   host=$OPTARG; mc="$mc -h$OPTARG";;
443       (H)   fromhost=$OPTARG; mc="$mc -H$OPTARG";;
444       (i)   input_list=$OPTARG; mc="$mc -i'$OPTARG'";;
445       (I)   ignore_archive_error=true; mc="$mc -I";;
446       (k)   keep_data_from_previous_run=true; mc="$mc -k";;
447       (K)   additional_conditions="$OPTARG"; mc="$mc -K'$OPTARG'";;
448       (m)   memory=$OPTARG; mc="$mc -m$OPTARG";;
449       (M)   makefile=$OPTARG; mc="$mc -M$OPTARG";;
450       (n)   node_usage=$OPTARG; mc="$mc -n$OPTARG";; 
451       (o)   output_list=$OPTARG; mc="$mc -o'$OPTARG'";;
452       (O)   use_openmp=true; mc="$mc -O";;
453       (p)   package_list=$OPTARG; mc="$mc -p'$OPTARG'";;
454       (P)   return_password=$OPTARG; mc="$mc -P$OPTARG";;
455       (q)   queue=$OPTARG; mc="$mc -q$OPTARG";;
456       (r)   run_mode=$OPTARG; mc="$mc -r'$OPTARG'";;
457       (R)   remotecall=true;return_addres=$OPTARG; mc="$mc -R$OPTARG";;
458       (s)   source_list=$OPTARG; mc="$mc -s'$OPTARG'";;
459       (S)   read_from_config=false; mc="$mc -S";;
460       (t)   cpumax=$OPTARG; mc="$mc -t$OPTARG";;
461       (T)   tasks_per_node=$OPTARG; mc="$mc -T$OPTARG";;
462       (u)   remote_username=$OPTARG; mc="$mc -u$OPTARG";;
463       (U)   return_username=$OPTARG; mc="$mc -U$OPTARG";;
464       (v)   silent=true; mc="$mc -v";;
465       (x)   do_trace=true;set -x; mc="$mc -x";;
466       (X)   numprocs=$OPTARG; mc="$mc -X$OPTARG";;
467       (y)   ocean_file_appendix=true; mc="$mc -y";;
468       (Y)   run_coupled_model=true; coupled_dist=$OPTARG; mc="$mc -Y'$OPTARG'";;
469       (\?)  printf "\n  +++ unknown option $OPTARG \n"
470             printf "\n  --> type \"$0 ?\" for available options \n"
471             locat=parameter;exit;;
472   esac
473 done
474
475
476    # EVTL. POSITIONSPARAMETER EINLESEN
477    # ZUR ZEIT GIBT ES NUR DEN PARAMETER ? (=KURZINFO)
478 shift OPTIND-1
479
480
481    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
482 if [[ "$1" = "?" ]]
483 then
484   (printf "\n  *** mrun can be called as follows:\n"
485    printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X.. -y -Y.. <modus>\n"
486    printf "\n      Description of available options:\n"
487    printf "\n      Option  Description                              Default-Value"
488    printf "\n        -a    base name of input files                 equiv. -d"
489    printf "\n        -A    no archiving when using file-attribute fl"
490    printf "\n        -b    batch-job on local machine               ---"
491    printf "\n        -B    do not delete temporary directory at end ---"
492    printf "\n        -c    configuration file                       .mrun.config"
493    printf "\n        -d    base name of files attached to program   test"
494    printf "\n        -D    preprocessor(cpp)-directives             \"\" "
495    printf "\n        -F    create remote job file only              ---"
496    printf "\n        -h    execution host                           $localhost_realname"
497    printf "\n        -i    INPUT control list                       \"\" "
498    printf "\n        -I    archiving errors of previous batch-jobs"
499    printf "\n              will be ignored"
500    printf "\n        -k    keep data from previous run"
501    printf "\n        -K    additional conditions for controling"
502    printf "\n              usage of conditional code and"
503    printf "\n              env-variables in configuration file      \"\" "
504    printf "\n        -m    memory demand in MB (batch-jobs)         0 MB"
505    printf "\n        -M    Makefile name                            Makefile"
506    printf "\n        -n    node usage (shared/not_shared)           depending on -h"
507    printf "\n        -o    OUTPUT control list                      \"\" "
508    printf "\n        -O    use OpenMP                               ---"
509    printf "\n        -p    software package list                    \"\" "
510    printf "\n        -q    queue                                    \"$queue\" "
511    printf "\n        -r    run control list (combines -i -o)        \"\" "
512    printf "\n        -s    filenames of routines to be compiled     \"\" "
513    printf "\n              must end with .f, .f90, .F, or .c !"
514    printf "\n              use \"..\" for more than one file and wildcards"
515    printf "\n              -s TEST compiles all files with w-permit"
516    printf "\n        -S    config file interpreted by shellscript   ---"
517    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds (batch)      0"
518    printf "\n        -T    tasks per node                           depending on -h"
519    printf "\n        -u    username on remote machine               \"\" "
520    printf "\n        -v    no prompt for confirmation               ---"
521    printf "\n        -x    tracing of mrun for debug purposes       ---"
522    printf "\n        -X    # of processors (on parallel machines)   1"
523    printf "\n        -y    add appendix \"_O\" to all local output"
524    printf "\n              files (ocean precursor runs followed by"
525    printf "\n              coupled atmosphere-ocean runs)           ---"
526    printf "\n        -Y    run coupled model, \"#1 #2\" with" 
527    printf "\n              #1 atmosphere and #2 ocean processors    \"#/2 #/2\" depending on -X"
528    printf "\n "
529    printf "\n      Possible values of positional parameter <modus>:"
530    printf "\n        \"?\"       -  this outline \n\n") | more
531    exit
532 elif [[ "$1" != "" ]]
533 then
534    printf "\n  +++ positional parameter $1 unknown \n"
535    locat=parameter; exit
536 fi
537
538
539
540    # KURZE STARTMELDUNG
541 printf "\n*** $version "
542 printf "\n    will be executed.     Please wait ..."
543
544
545
546    # PRUEFEN, OB KONFIGURATIONS-DATEI VORHANDEN
547 if [[ ! -f $config_file ]]
548 then
549    printf "\n\n  +++ configuration file: "
550    printf "\n           $config_file"
551    printf "\n      does not exist"
552    locat=connect; exit 
553 fi
554
555
556    # HOST-IDENTIFIER (local_host) AUS KONFIGURATIONSDATEI BESTIMMEN
557 line=""
558 grep  "%host_identifier"  $config_file  >  tmp_mrun
559 while read line
560 do
561    if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
562    then
563       HOSTNAME=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
564       host_identifier=`echo $line | cut -d" " -s -f3`
565       if [[ $localhost_realname = $HOSTNAME ]]
566       then
567          localhost=$host_identifier
568          break
569       fi
570    fi
571 done < tmp_mrun
572
573 if [[ "$localhost" = "" ]]
574 then
575    printf "\n\n  +++ no host identifier found in configuration file \"$config_file\""
576    printf "\n      for local host \"$localhost_realname\"."
577    printf "\n      Please add line"
578    printf "\n      \"\%host_identifier $localhost_realname <identifier>\""
579    printf "\n      to the configuration file."
580    locat=localhost; exit
581 fi
582
583
584    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN SETZEN
585 case  $localhost_realname  in
586     (breg*-en0|berni*-en0)  archive_system=tivoli;;
587     (cs*)                   archive_system=ut;;
588     (fimm.bccs.uib.no)      fimm=true;;
589     (gate|n-sx)             PATH=$PALM_BIN:$PATH:/usr/bin/nqsII;;
590     (hreg*-en0|hanni*-en0)  archive_system=tivoli;;
591     (scirocco)              scirocco=true;;
592 esac
593
594
595 
596    # BASISNAME DER INPUT-DATEIEN GLEICH ALLGEMEINEM BASISNAMEN SETZEN,
597    # WENN NICHT VOM BENUTZER ANDERS BESTIMMT
598 [[ "$afname" = "" ]]  &&  afname=$fname
599
600
601    # EVTL. RUN-MODUS DEN I/O-LISTEN HINZUFUEGEN
602 if [[ "$run_mode" != "" ]]
603 then
604    input_list="$input_list $run_mode"
605    output_list="$output_list $run_mode"
606 fi
607
608
609    # RECHNERNAMEN ABSPEICHERN, VON DEM AUS JOB GESTARTET WIRD,
610    # ALLERDINGS NUR DANN, WENN NICHT PER OPTION -H BEREITS EIN WERT
611    # ZUGEWIESEN WURDE (MRUN MACHT DIES IMMER, WENN ES SELBST BATCH-JOBS
612    # STARTET)
613 if [[ "$fromhost" = "" ]]
614 then
615    fromhost=$localhost
616 fi
617
618
619     # PRUEFEN, OB MRUN NUR TESTWEISE AUF DER LOKALEN MASCHINE KOMPILIEREN SOLL
620 if [[ "$source_list" = LOCAL_COMPILE_TEST ]]
621 then
622    source_list=TEST
623    local_compile=true
624    host=$localhost
625 fi
626   
627
628    # PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
629    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
630    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
631    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
632 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
633 then
634    do_batch=true
635    do_remote=true
636    case  $host  in
637        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|necriam|lcsgib|lcsgih|lctit|unics|lcxt4|lck)  true;;
638        (*)  printf "\n"
639             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
640             printf "\n      is not available"
641             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
642    esac
643 else
644    host=$localhost
645 fi
646
647
648     # ZUSATZBEDINGUNGEN (OPTION -K) AUSWERTEN
649 if [[ -n $additional_conditions ]]
650 then
651#    echo $additional_conditions | cut -d" " -f1-3 | read  cond1  cond2  dummy
652    cond1=`echo $additional_conditions | cut -d" " -f1`
653    cond2=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f2`
654    dummy=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f3`
655    if [[ -n $dummy ]]
656    then
657       printf "\n  +++ more than 2 additional conditions given for Option \"-K\""
658       locat=options; exit
659    fi
660 fi
661
662
663      # KOPPLUNGSEIGENSCHAFTEN (-Y) AUSWERTEN UND coupled_mode BESTIMMEN
664 if [[ $run_coupled_model = true ]] 
665 then
666
667    if  [[ -n $coupled_dist ]]
668    then
669
670       numprocs_atmos=`echo $coupled_dist | cut -d" " -s -f1`
671       numprocs_ocean=`echo $coupled_dist | cut -d" " -s -f2`
672
673       if (( $numprocs_ocean + $numprocs_atmos != $numprocs ))
674       then
675
676          printf "\n  +++ number of processors does not fit to specification by \"-Y\"."
677          printf "\n      PEs (total)     : $numprocs"
678          printf "\n      PEs (atmosphere): $numprocs_atmos"
679          printf "\n      PEs (ocean)     : $numprocs_ocean"
680          locat=coupling; exit
681
682          # REARRANGING BECAUSE CURRENTLY ONLY 1:1 TOPOLOGIES ARE SUPPORTED
683          # THIS SHOULD BE REMOVED IN FUTURE
684       elif (( $numprocs_ocean != $numprocs_atmos ))
685       then
686
687          printf "\n  +++ currently only 1:1 topologies are supported"
688          printf "\n      PEs (total)     : $numprocs"
689          printf "\n      PEs (atmosphere): $numprocs_atmos"
690          printf "\n      PEs (ocean)     : $numprocs_ocean"
691          (( numprocs_atmos = $numprocs / 2 ))
692          (( numprocs_ocean = $numprocs / 2 ))
693          printf "\n  +++ rearranged topology to $numprocs_atmos:$numprocs_ocean"
694
695       fi
696
697    else
698
699       (( numprocs_ocean = $numprocs / 2 ))
700       (( numprocs_atmos = $numprocs / 2 ))
701
702    fi
703    coupled_dist=`echo "$numprocs_atmos $numprocs_ocean"`
704
705       # GET coupled_mode FROM THE CONFIG FILE
706    line=""
707    grep  "%cpp_options.*-D__mpi2.*$host" $config_file  >  tmp_mrun
708    while read line
709    do
710       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" &&  ( $(echo $line | cut -d" " -s -f4) = $cond1 || $(echo $line | cut -d" " -s -f4)  = $cond2 ) ]]
711       then
712          coupled_mode="mpi2"
713       fi
714    done < tmp_mrun
715
716 fi
717
718
719    # PRUEFEN, OB EVTL. BEI VORHERGEHENDEM LAUF (KETTENJOB) EINE
720    # ARCHIVIERUNG FEHLGESCHLAGEN IST
721 if [[ -f ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname ]]
722 then
723    if [[ $ignore_archive_error = false ]]
724    then
725       printf "\n  +++ data archiving of previous run failed"
726       printf "\n      see directory \~/job_queue on remote machine"
727       locat=archive; exit
728    else
729       printf "\n  +++ warning: data archiving in a previous run failed"
730       printf "\n      MRUN continues, trying to get backup copy"
731    fi
732 fi
733
734
735
736    # LESEN UND INTERPRETIEREN DER KONFIGURATIONS-DATEI VOM SHELLSCRIPT AUS
737    # VORUEBERGEHEND ZWINGEND AUF LINUX-RECHNERN
738 if [[ "$read_from_config" = false ]]
739 then
740
741    [[ $silent = false ]]  &&  printf "\n    Reading the configuration file... "
742    while  read zeile
743    do
744        [[ $silent = false ]]  &&  printf "."
745
746
747          # ZUERST EVENTUELL VORKOMMENDE ENVIRONMENT-VARIABLEN DURCH IHRE WERTE
748          # ERSETZEN
749       eval  zeile=\"$zeile\"
750
751
752          # INTERPRETATION DER ZEILE
753       if [[ "$(echo $zeile)" = "" ]]
754       then
755             # LEERZEILE, KEINE AKTION
756          continue
757
758       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "#" ]]
759       then
760
761             # ZEILE IST KOMMENTARZEILE
762          true
763
764       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "%" ]]
765       then
766
767             # ZEILE DEFINIERT ENVIRONMENT-VARIABLE
768          zeile=$(echo $zeile | cut -c2-)
769#          echo $zeile | cut -d" " -f1-5 | read  var  value  for_host  for_cond1  for_cond2
770          var=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
771          value=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
772          for_host=`echo $zeile | cut -d" " -s -f3`
773          for_cond1=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
774          for_cond2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
775
776          if [[ "$for_host" = ""  ||  ( "$for_host" = $host  &&  "$for_cond1" = "$cond1"  &&  "$for_cond2" = "$cond2" )  ||  $(echo "$input_list$output_list"|grep -c "$for_host") != 0 ]]
777          then
778
779                # BEI COMPILER- CPP- ODER LINKEROPTIONEN EVTL ":" DURCH " "
780                # ERSETZEN. "::" WIRD DURCH ":" ERSETZT.
781             value=`echo $value | sed 's/::/%DUM%/g' | sed 's/:/ /g' | sed 's/%DUM%/:/g'`
782
783
784                # ENVIRONMENT-VARIABLE WIRD WERT AUS KONFIGURATIONSDATEI
785                # ZUGEWIESEN, WENN SIE SELBST NOCH KEINEN WERT UEBER DIE
786                # ENTSPRECHENDE SCRIPT-OPTION ERHALTEN HAT. SOLCHE
787                # VARIABLEN HAETTEN DANN DEN WERT "" ODER IM INTEGER-FALL DEN
788                # WERT 0.  ALLGEMEINE REGEL ALSO: SCRIPT-OPTION GEHT UEBER
789                # KONFIGURATIONSDATEI
790             if [[ "$(eval echo \$$var)" = ""  ||  "$(eval echo \$$var)" = "0" ]]
791             then
792                eval  $var=\$value
793
794                   # EVTL. BILDSCHIRMAUSGABEN DER ENVIRONMENT-VARIABLEN
795                if [[ $do_trace = true ]]
796                then
797                   printf "\n*** ENVIRONMENT-VARIABLE $var = $value"
798                fi
799             fi
800
801                # WENN ENVIRONMENT-VARIABLE HOST VEREINBART, DANN SOFORT AUSWERTEN
802                # WERT VON do-remote WIRD BEI DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT
803                # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
804                # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
805             if [[ $var = host ]]
806             then
807                if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
808                then
809                   do_batch=true
810                   do_remote=true
811                   case  $host  in
812                       (ibm|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|necriam|unics|lcxt4|lck)  true;;
813                       (*)  printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
814                            printf "\n      is not available"
815                            locat=nqs; exit;;
816                   esac
817                else
818                   host=$localhost
819                fi
820             fi
821
822                # VOM BENUTZER DEFINIERTE ENVIRONMENT VARIABLEN MUESSEN PRINZIPIELL
823                # EXPORTIERT WERDEN, DA SIE VIELLEICHT IN WEITER UNTEN AUFZURUFEN-
824                # DEN PROGRAMMEN BENOETIGT WERDEN
825             export  $var
826          fi
827
828
829
830
831       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "EC:" ]]
832       then
833
834             # ZEILE DEFINIERT ERROR-KOMMANDO
835          (( iec = iec + 1 ))
836          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
837          err_command[$iec]="$zeile"
838
839       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "IC:" ]]
840       then
841
842             # ZEILE DEFINIERT INPUT-KOMMANDO
843          (( iic = iic + 1 ))
844          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
845          in_command[$iic]="$zeile"
846
847       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "OC:" ]]
848       then
849
850             # ZEILE DEFINIERT OUTPUT-KOMMANDO
851          (( ioc = ioc + 1 ))
852          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
853          out_command[$ioc]="$zeile"
854
855       else
856
857             # ZEILE DEFINIERT DATEIVERBINDUNG. EINLESEN DER DATEIEIGENSCHAFTEN
858             # s2a: in/out - Feld
859             # s2b: loc    - Feld (optional)
860             # s2c: tr/ar  - Feld (optional)
861#          echo $zeile | cut -d" " -f1-2 | read  s1  s2
862          s1=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
863          s2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
864          s2a=$(echo $s2 | cut -d":" -f1)
865          if [[ $(echo $s2 | grep -c ":") = 0 ]]
866          then
867             s2b=""
868             s2c=""
869          else
870#             echo $s2 | cut -d":" -f2-3 | sed 's/:/ /g' | read  s2b  s2c
871             s2b=`echo $s2 | cut -d":" -f2 | sed 's/:/ /g'`
872             s2c=`echo $s2 | cut -d":" -s -f3 | sed 's/:/ /g'`
873          fi
874#          echo $zeile | cut -d" " -f3-6 | read  s3  s4  s5  s6
875          s3=`echo $zeile | cut -d" " -f3`
876          s4=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
877          s5=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
878          s6=`echo $zeile | cut -d" " -s -f6`
879
880       
881             # ABSPEICHERN DER DATEIVERBINDUNG, FALLS IN INPUT- ODER OUTPUT-LIST
882             # VERMERKT. VARIABLE S3 KANN AUCH LISTE ENTHALTEN (FELDTRENNER ":")
883             # DATEIVERBINDUNG WIRD DANN NICHT ABGESPEICHERT UND GEPRUEFT, WENN
884             # PROGRAMMLAUF AUF REMOTE-MASCHINE ERFOLGT UND DATEI NUR LOKAL VOR-
885             # HANDEN SEIN MUSS (D.H. s2b = loc)
886          IFSALT="$IFS"; IFS="$IFS:"
887          if [[ "$s2a" = in  &&  ! ( $do_remote = true  &&  ( "$s2b" = loc  ||  "$s2b" = locopt ) ) ]]
888          then
889             found=false
890             for  actual  in  $input_list
891             do
892                for  formal  in  $s3
893                do
894                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-" ]]  &&  found=true
895                done
896             done
897             if [[ $found = true ]]
898             then
899                (( iin = iin + 1 ))
900                localin[$iin]=$s1; transin[$iin]=$s2b; actionin[$iin]=$s2c;
901                typein[$iin]=$s3; pathin[$iin]=$s4; endin[$iin]=$s5;
902                extin[$iin]=$s6
903             fi
904          elif [[ "$s2a" = out  &&  ! ( $do_remote = true  &&  "$s2b" = loc ) ]]
905          then
906             found=false
907             for  actual  in  $output_list
908             do
909                for  formal  in  $s3 
910                do
911                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-"  ]]  &&  found=true
912                done
913             done
914             if [[ $found = true ]]
915             then
916                (( iout = iout + 1 ))
917                localout[$iout]=$s1; actionout[$iout]=$s2c; typeout[$iout]=$s3;
918                pathout[$iout]=$s4; endout[$iout]=$s5; extout[$iout]=$s6
919             fi
920          elif [[ "$s2a" != in  &&  "$s2a" != out ]]
921          then
922             printf "\n  +++ I/O-attribute in configuration file $config_file has the invalid"
923             printf "\n      value \"$s2\". Only \"in\" and \"out\" are allowed!"
924             locat=connect; exit
925          fi
926          IFS="$IFSALT"
927       fi
928    done < $config_file
929
930 else
931
932
933       # INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI MITTELS FORTRAN 90 - PROGRAMM
934    [[ $silent = false ]]  &&  printf "..."
935    export  cond1 cond2 config_file do_remote do_trace input_list localhost output_list
936    export  interpreted_config_file=.icf.$RANDOM
937
938
939
940       # ENVIRONMENT-VARIABLEN FUER INTERPRET_CONFIG UEBER NAMELIST_DATEI ZUR
941       # VERFUEGUNG STELLEN
942    cat  >  .mrun_environment  <<  %%END%%
943 &mrun_environment  cond1 = '$cond1', cond2 = '$cond2',
944                    config_file = '$config_file', do_remote = '$do_remote',
945                    do_trace = '$do_trace', host = '$host',
946                    input_list = '$input_list', icf = '$interpreted_config_file',
947                    localhost = '$localhost', output_list = '$output_list' /
948
949%%END%%
950
951       # WERTE VON MRUN-OPTIONEN SICHERN UND DAMIT GEGEBENENFALLS SPAETER DIE
952       # IN DER KONFIGURAIONSDATEI ANGEGEBENEN WERTE UEBERSTEUERN
953    mrun_memory=$memory
954    mrun_group_number=$group_number
955    mrun_cpumax=$cpumax
956    mrun_numprocs=$numprocs
957
958    if [[ $localhost_realname = "sx-fep" ]]
959    then
960       /home/COAR/NC/raasch/pub/interpret_config_necriam.x
961    else
962       interpret_config.x
963    fi
964    rm .mrun_environment
965
966
967       # AUSFUEHRUNG DER GENERIERTEN SHELL-KOMMANDOS IN DIESER SHELL
968    chmod  u+x  $interpreted_config_file
969    export PATH=$PATH:.
970    . $interpreted_config_file
971    rm  $interpreted_config_file
972
973
974       # OPTIONSWERTE UEBERSTEUERN KONFIGURATIONSDATEI
975    [[ $mrun_memory     != 0  ]]  &&  memory=$mrun_memory
976    [[ "$mrun_group_number" != "none" ]]  &&  group_number=$mrun_group_number
977    [[ $mrun_cpumax     != 0  ]]  &&  cpumax=$mrun_cpumax
978    [[ "$mrun_numprocs" != "" ]]  &&  numprocs=$mrun_numprocs
979
980 fi
981
982
983    # QUELLTEXTVERZEICHNIS AUF LOKALER MASCHINE AUS KONFIGURATIONSDATEI
984    # BESTIMMEN (WUERDE SONST EVTL. DAS VERZEICHNIS DES JEWEILS UNTER -h
985    # ANGEGEBENEN REMOTE-RECHNERS SEIN)
986    # BEI BATCH-JOBS SIND DIE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE SCHON KOMPLETT
987 if [[ "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
988 then
989
990       # ZUERST PRUEFEN, OB EIN GLOBALER QUELLTEXTPFAD FUER ALLE RECHNER
991       # VEREINBART WURDE
992    source_path=""
993    line=""
994    grep "%source_path" $config_file  >  tmp_mrun
995    while read line
996    do
997       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
998       then
999          if [[ "$(echo $line | cut -d" " -f3)" = "" ]]
1000          then
1001             global_source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
1002          fi
1003       fi
1004    done  <  tmp_mrun
1005
1006    line=""
1007    found=false
1008    grep  " $localhost" $config_file | grep "%source_path"  >  tmp_mrun
1009    while read line
1010    do
1011       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
1012       then
1013          if [[ $found = true ]]
1014          then
1015             printf "\n\n  +++ more than one source path found in configuration file"
1016             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
1017             locat=source_path; exit
1018          fi
1019          source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
1020          found=true
1021       fi
1022    done  <  tmp_mrun
1023    rm  tmp_mrun
1024
1025    if [[ "$source_path" = "" ]]
1026    then
1027       if [[ "$global_source_path" != "" ]]
1028       then
1029          source_path=$global_source_path
1030       else
1031          printf "\n\n  +++ no source path found in configuration file"
1032          printf "\n      for local host \"$localhost\" "
1033          locat=source_path; exit
1034       fi
1035    fi
1036    eval source_path=$source_path
1037
1038    if [[ ! -d $source_path ]]
1039    then
1040       printf "\n\n  +++ source path \"$source_path\" on local host"
1041       printf "\n      \"$localhost\" does not exist"
1042       locat=source_path; exit
1043    fi
1044
1045 fi
1046
1047
1048    # GLOBALE REVISIONSNUMMER ERMITTELN (FORTSETZUNGSLAEUFEN WIRD DIESE
1049    # DURCH OPTION -G MITGETEILT)
1050 if [[ "$global_revision" = "" ]]
1051 then
1052    global_revision=`svnversion $source_path  2>/dev/null`
1053    global_revision="Rev: $global_revision"
1054 fi
1055
1056
1057    # NOCHMAL PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
1058    # (HOST KANN IN KONFIGURATIONSDATEI ANDERS FESTGELEGT WORDEN SEIN)
1059    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
1060    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
1061    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
1062 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
1063 then
1064    do_batch=true
1065    do_remote=true
1066    case  $host  in
1067        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|necriam|unics|lcxt4|lck)  true;;
1068        (*)  printf "\n"
1069             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
1070             printf "\n      is not available"
1071             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
1072    esac
1073 else
1074    host=$localhost
1075 fi
1076
1077
1078    # PRUEFUNG EINIGER PROZESSORZAHLANGABEN BEI RECHNUNGEN AUF PARALLELRECHNERN
1079 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
1080 then
1081
1082       # PRUEFEN, OB DIE ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN PES ANGEGEBEN WURDE
1083    if [[ ! -n $numprocs ]]
1084    then
1085       printf "\n"
1086       printf "\n  +++ option \"-K parallel\" requires additional specification"
1087       printf "\n      of the number of processors to be used by"
1088       printf "\n      mrun-option \"-X\" or by environment-variable"
1089       printf "\n      \"numprocs\" in the configuration file"
1090       locat=numprocs; (( iec = 0 )); exit 
1091    fi
1092
1093       # PRUEFEN, OB DIE PROZESSORANZAHL PRO KNOTEN ANGEGEBEN WURDE (GGF.
1094       # DEFAULT-WERT SETZEN) UND OB SIE EIN GANZZAHLIGER TEILER DER
1095       # GESAMTPROZESSORANZAHL IST
1096    if [[ $host = nech  ||  $host = necriam  ||  $host = ibmh  ||  $host = ibmb  ||  $host = ibms ]]
1097    then
1098       [[ "$tasks_per_node" = "" ]]  &&  tasks_per_node=6
1099       (( ival = $tasks_per_node ))
1100       (( pes = numprocs ))
1101#       if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics+1PE) = 1 ]]
1102#       then
1103#          (( pes = pes - 1 ))
1104#       fi
1105       (( ii = pes / ival ))
1106       if (( pes - ii * ival > 0 ))
1107       then
1108          printf "\n"
1109          printf "\n  +++ tasks per node (option \"-T\") must be an integral"
1110          printf "\n      divisor of the total number of processors (option \"-X\")"
1111          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
1112          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1113       fi
1114    fi
1115
1116       # IBMY HAT NUR EINEN KNOTEN
1117    if [[ $host = ibmy ]]
1118    then
1119       if [[ "$tasks_per_node" != ""  &&  "$tasks_per_node" != "$numprocs" ]]
1120       then
1121          printf "\n"
1122          printf "\n  +++ on ibmy, tasks per node (option \"-T\") must be equal to the"
1123          printf "\n      total number of processors (option \"-X\")"
1124          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
1125          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1126       fi
1127    fi
1128
1129       # FALLS OPENMP PARALLELISIERUNG VERWENDET WERDEN SOLL, ANZAHL VON THREADS
1130       # SETZEN UND ZAHL DER TASKS PRO KNOTEN AUF 1 SETZEN
1131    if [[ $use_openmp = true ]]
1132    then
1133       threads_per_task=$tasks_per_node
1134       tasks_per_node=1
1135    fi
1136    OOPT="-O $threads_per_task"
1137    TOPT="-T $tasks_per_node"
1138
1139       # GESAMTZAHL DER KNOTEN BESTIMMEN
1140    if [[ "$tasks_per_node" != "" ]]
1141    then
1142       (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
1143    fi
1144
1145       # PRUEFEN, OB NODE USAGE EINEN ERLAUBTEN WERT HAT BZW. DEN DEFAULT
1146       # SETZEN
1147    if [[ $node_usage = default ]]
1148    then
1149       if [[ $host = ibms ]]
1150       then
1151          node_usage=shared
1152       elif [[ $host = lctit ]]
1153       then
1154          node_usage=RAM64GB
1155       elif [[ $(echo $host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1156       then
1157          node_usage=singlejob
1158       else
1159          node_usage=not_shared
1160       fi
1161    fi
1162
1163    if [[ $node_usage != shared  &&  $node_usage != not_shared  &&  $node_usage != singlejob  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != RAM64GB  ]]
1164    then
1165       printf "\n"
1166       printf "\n  +++ node usage (option \"-n\") is only allowed to be set"
1167       printf "\n      \"shared\" or \"not_shared\""
1168       locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1169    fi
1170
1171 fi
1172
1173    # PRUEFEN, OB HOSTFILE EXISTIERT
1174 if [[ -n $hostfile ]]
1175 then
1176    if [[ ! -f $hostfile ]]
1177    then
1178       printf "\n"
1179       printf "\n  +++ hostfile \"$hostfile\" does not exist"
1180       locat=hostfile; exit
1181    fi
1182 fi
1183
1184    # PRUEFEN, OB RHOSTS DATEI EXISTIERT. GEGEBENENFALLS ANLEGEN BZW. ERWEITERN
1185 if [[ $host = ibmy  &&  $do_remote = false ]]
1186 then
1187    if [[ ! -f $HOME/.rhosts ]]
1188    then
1189       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >  $HOME/.rhosts
1190       printf "\n\n  *** file:"
1191       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1192       printf "\n      was created\n"
1193    fi
1194    if [[ $(grep -c gfdl5.yonsei.ac.kr $HOME/.rhosts) = 0 ]]
1195    then
1196       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >>  $HOME/.rhosts
1197       printf "\n\n  *** file:"
1198       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1199       printf "\n      was extended by the name of the current host\n"
1200    fi
1201 fi
1202
1203
1204
1205    # FALLS NICHT VORGEGEBEN, DEFAULT-QUEUE AUF DER ZIELMASCHINE FESTLEGEN
1206 if [[ $queue = none ]]
1207 then
1208    case  $host  in
1209        (ibmb)       if [[ $node_usage = shared ]]
1210                     then
1211                        queue=cshare
1212                     else
1213                        queue=csolo
1214                     fi;;
1215        (ibmh)       queue=no_class;;
1216        (ibmy)       queue=parallel;;
1217        (lcsgib)     queue=bigq;;
1218        (lcsgih)     queue=bigq;;
1219        (lctit)      queue=RAM64GB;;
1220        (nech)       queue=none;;
1221        (necriam)    queue=SP;;
1222        (unics)      queue=unics;;
1223    esac
1224 fi
1225
1226
1227    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN DER INPUT-FILES BILDEN,
1228    # INPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1229    # ERMITTELN
1230 (( i = 0 ))
1231 while (( i < iin ))
1232 do
1233    (( i = i + 1 ))
1234    (( maxcycle = 0 ))
1235
1236       # NAMENSBILDUNG (EVTL. IST FESTER DATEINAME VORGEGEBEN)
1237    if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1238    then
1239       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1240                                                    # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1241       eval filename=${pathin[$i]}/${endin[$i]}
1242    else
1243       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1244                                                             # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1245       eval filename=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}
1246    fi
1247
1248       # PRUEFEN AUF VORHANDENSEIN
1249    if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1250          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1251          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1252    then
1253          # DATEIEN MIT EXTENSION (Z.B. NC) MUESSEN NICHT ZWINGEND VORHANDEN
1254          # SEIN, DESHALB IN SOLCHEN FAELLEN KEIN ABBRUCH. DIES IST NUR EINE
1255          # VORUEBERGEHENDE LOESUNG (OKT 05). NICHT ZWINGEND BENOETIGTE
1256          # EINGABEDATEIEN SOLLTEN EINE SPEZIELLE OPTION IN DER DATEI-
1257          # VERBINDUNGSANWEISUNG BEKOMMEN (Z.B. inopt?)
1258       if [[ "${transin[$i]}" != "locopt" ]]
1259       then
1260          printf "\n\n  +++ INPUT-file: "
1261          if [[ "${extin[$i]}" = "" ]]
1262          then
1263             printf "\n           $filename"
1264          else
1265             printf "\n           $filename.${extin[$i]}"
1266          fi
1267          printf "\n      does not exist\n"
1268          locat=input; exit
1269       else
1270          transin[$i]="unavailable"
1271       fi
1272    else
1273
1274          # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1275       ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1276       ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1277       while  read zeile
1278       do
1279          cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1280          if [[ "$cycle" = "$zeile" ]]
1281          then
1282             (( icycle = 0 ))
1283          elif [[ "$cycle" = "${extin[$i]}" ]]
1284          then
1285             (( icycle = 0 ))
1286          else
1287             (( icycle = $cycle ))
1288          fi
1289          if (( icycle > maxcycle ))
1290          then
1291             (( maxcycle = icycle ))
1292             file_to_be_used=$zeile
1293          fi
1294       done <filelist
1295       rm filelist
1296
1297          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN
1298       if (( maxcycle > 0 ))
1299       then
1300          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1301          then
1302             filename=${filename}.$maxcycle.${extin[$i]}
1303          else
1304             filename=${filename}.$maxcycle
1305          fi
1306       else
1307          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1308          then
1309             filename=${filename}.${extin[$i]}
1310          fi
1311       fi
1312       
1313          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1314          # DA SPAETER BEI RUECKSPEICHERN VOM ARCHIVSYSTEM EVTL. BENOETIGT
1315       absnamein[$i]=$filename
1316       if (( maxcycle > 0 ))
1317       then
1318          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1319          then
1320             frelin[$i]=${endin[$i]}.$maxcycle
1321          else
1322             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}.$maxcycle
1323          fi
1324       else
1325          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1326          then
1327             frelin[$i]=${endin[$i]}
1328          else
1329             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}
1330          fi
1331       fi
1332
1333    fi
1334 done
1335       
1336
1337    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN (OHNE $ ODER ~) DER OUTPUT-FILES BILDEN,
1338    # OUTPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1339    # ERMITTELN ODER, FALLS NICHT VORHANDEN, PRUEFEN, OB SIE SICH ANLEGEN LASSEN
1340    # DIESE AKTIONEN FINDEN NICHT STATT, WENN PROGRAMM AUF REMOTE-MASCHINE
1341    # RECHNET UND DATEI ANSCHLIESSEND TRANSFERIERT WERDEN SOLL!
1342 (( i = 0 ))
1343 while (( i < iout ))
1344 do
1345    (( i = i + 1 ))
1346    if [[ ! ( $fromhost != $localhost  &&  ( "${actionout[$i]}" = tr || "${actionout[$i]}" = tra || "${actionout[$i]}" = trpe ) ) ]]
1347    then
1348       if [[ "${actionout[$i]}" = tr ]]
1349       then
1350          actionout[$i]=""
1351       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe ]]
1352       then
1353          actionout[$i]=pe
1354       elif [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
1355       then
1356          actionout[$i]=a
1357       fi
1358       (( maxcycle = 0 ))
1359       eval filename=${pathout[$i]}/${fname}${endout[$i]}
1360       eval catalogname=${pathout[$i]}
1361       if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1362             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1363             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1364       then
1365     
1366             # OUTPUT-DATEI NICHT VORHANDEN. PRUEFEN, OB ANLEGEN MOEGLICH.
1367          if  cat /dev/null > $filename 
1368          then
1369             rm  $filename
1370          else
1371
1372                # PRUEFEN, OB KATALOG VORHANDEN UND EVTL. DIESEN ANLEGEN
1373             if [[ ! -d $catalogname ]]
1374             then
1375                if  mkdir -p  $catalogname
1376                then
1377                   printf "\n\n  *** directory:"
1378                   printf "\n           $catalogname"
1379                   printf "\n      was created\n"
1380                else
1381                   printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1382                   printf "\n           $filename"
1383                   printf "\n      cannot be created, because directory does not exist"
1384                   printf "\n      and cannot be created either"
1385                   printf "\n"
1386                   locat=output  ; exit
1387                fi 2>/dev/null
1388             else
1389                printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1390                printf "\n           $filename"
1391                printf "\n      cannot be created, although directory exists"
1392                printf "\n"
1393                locat=output  ; exit
1394             fi
1395          fi 2>/dev/null
1396       else
1397
1398             # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1399          ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1400          ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1401          while  read zeile
1402          do
1403             cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1404             if [[ "$cycle" = "$zeile"  ||  "$cycle" = ${extout[$i]} ]]
1405             then
1406                (( icycle = 1 ))
1407             else
1408                (( icycle = $cycle + 1 ))
1409             fi
1410             if (( icycle > maxcycle ))
1411             then
1412                (( maxcycle = icycle ))
1413             fi
1414          done <filelist
1415          rm filelist
1416       fi
1417
1418          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN UND PRUEFEN, OB SICH
1419          # DATEI AUCH WIRKLICH ANLEGEN LAESST. IM APPEND-FALL MUSS AN DEN
1420          # HOECHSTEN VORHANDENEN ZYKLUS-ANGEHAENGT WERDEN. ANLAGEPRUEFUNG
1421          # IST DANN NATUERLICH NICHT ZULAESSIG BZW. MOEGLICH
1422       if [[ "${actionout[$i]}" != a ]]
1423       then
1424          if (( maxcycle > 0 ))
1425          then
1426             filename=${filename}.$maxcycle
1427             if  cat /dev/null > $filename 
1428             then
1429                rm  $filename
1430             else
1431                printf "\n  +++ OUTPUT-file:"
1432                printf "\n           $filename"
1433                printf "\n      cannot be created"
1434                locat=output  ; exit
1435             fi
1436          fi
1437       else
1438          (( maxcycle = maxcycle - 1 ))
1439          if (( maxcycle > 0 ))
1440          then
1441             filename=${filename}.$maxcycle
1442          fi
1443       fi
1444       
1445          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1446          # DA SPAETER BEI ABLAGE AUF ARCHIVSYSTEM BZW. FUER
1447          # DATEI OUTPUT_FILE_CONNECTIONS EVTL. BENOETIGT
1448       pathout[$i]=$filename
1449       if (( maxcycle > 0 ))
1450       then
1451          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}.$maxcycle
1452       else
1453          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}
1454       fi
1455
1456    fi
1457 done
1458
1459
1460     # DAS DVR-PAKET ERFORDERT EINE ENTSPRECHENDE BIBLIOTHEK
1461 if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
1462 then
1463    if [[ "$dvr_inc" = "" ]]
1464    then
1465       printf "\n\n  +++ no value for \"dvr_inc\" given in configuration file"
1466       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1467       locat=dvr; exit
1468    fi
1469    if [[ "$dvr_lib" = "" ]]
1470    then
1471       printf "\n\n  +++ no value for \"dvr_lib\" given in configuration file"
1472       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1473       locat=dvr; exit
1474    fi
1475 fi
1476
1477
1478     # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM ODER NUR EIN AUSFUEHRBARES
1479     # PROGRAMM VEREINBART WURDE (IN DIESEM FALL BRAUCHT IM WEITEREN NICHT
1480     # UEBERSETZT ZU WERDEN)
1481 if [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" = "" ]]
1482 then
1483    printf "\n  +++ neither main program nor executable defined"
1484    locat=source; exit
1485 elif [[ "$mainprog" != ""  &&  "$executable" != "" ]]
1486 then
1487    printf "\n  +++ main program as well as executable defined"
1488    locat=source; exit
1489 elif [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" != "" ]]
1490 then
1491    do_compile=false
1492 fi
1493
1494
1495    # SOURCE-VERZEICHNIS ZUM AUFSAMMELN DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE
1496    # ERZEUGEN. HIERHIN WERDEN SPAETER IM FALL VON BATCH-JOBS AUCH DAS MRUN-
1497    # SCRIPTS SOWIE DIE KONFIGURATIONSDATEI KOPIERT
1498 if [[ $restart_run != true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1499 then
1500    rm -rf  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1501    mkdir   SOURCES_FOR_RUN_$fname
1502 fi
1503
1504
1505    # ALLE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE ZUSAMMENSAMMELN
1506    # BEI BATCH-JOBS IST DIES NICHT NOETIG, WEIL DIE PROGRAMMTEILE BEREITS DURCH
1507    # DEN MRUN-AUFRUF ERMITTELT SIND, DER DEN BATCH-JOB GENERIERT HAT, UND
1508    # IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_... ABGELEGT SIND
1509 if [[ $do_compile = true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1510 then
1511
1512    [[ "$source_list" = LM ]]  &&  source_list=LOCALLY_MODIFIED
1513    [[ "$source_list" = WP ]]  &&  source_list=WRITE_PERMIT
1514
1515
1516       # EVTL. ZU UEBERSETZENDE PROGRAMMTEILE DADURCH BESTIMMEN, DASS GEPRUEFT
1517       # WIRD, WELCHE DATEIEN WRITE-PERMIT BESITZEN (DATEIEN SOLLTEN DESHALB
1518       # UNTER RCS-KONTROLLE STEHEN). MIT DER VARIABLEN EXCLUDE KOENNEN
1519       # BESTIMMTE DATEIEN GRUNDSAETZLICH VON DER UEBERSETZUNG AUSGESCHLOSSEN
1520       # WERDEN. DIES IST NUR BEI MANUELLEM START VON MRUN DURCH DEN BENUTZER
1521       # MOEGLICH, DA BEI AUTOMATISCHEN RESTARTS TEST DURCH DIE TATSAECHLICH
1522       # ZU UBERSETZENDEN DATEIEN ERSETZT IST.
1523       # ALLE ERMITTELTEN DATEIEN WERDEN IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_...
1524       # GESAMMELT
1525    if [[ "$source_list" = WRITE_PERMIT ]]
1526    then
1527
1528       source_list=""
1529       cd  $source_path
1530
1531
1532          # ALLE MOEGLICHEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1533       Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1534       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Names"
1535       Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1536       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1537       Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1538       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1539       Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1540       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1541       Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1542       [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1543
1544
1545          # DATEIEN MIT WRITE-PERMIT NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1546       for  dateiname  in  $Filenames
1547       do
1548          if [[ -w $dateiname ]]
1549          then
1550             if [[ "$exclude" = ""  ||  $(echo $exclude | grep -c $dateiname) = 0 ]]
1551             then
1552                cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1553                source_list=$source_list"$dateiname "
1554             fi
1555          fi
1556       done
1557
1558       cd -  > /dev/null
1559
1560
1561    elif [[ "$source_list" = LOCALLY_MODIFIED ]]
1562    then
1563
1564          # MODIFIZIERTE DATEIEN DER SVN-ARBEITSKOPIE BESTIMMEN
1565       source_list=""
1566       cd  $source_path
1567
1568
1569          # PRUEFEN, OB VERZEICHNIS UEBERHAUPT UNTER SVN-KONTROLLE STEHT
1570       if [[ ! -d .svn ]]
1571       then
1572          printf "\n\n  +++ source directory"
1573          printf "\n         \"$source_path\" "
1574          printf "\n         is not under control of \"subversion\"."
1575          printf "\n         Please do not use mrun-option \"-s LOCALLY_MODIFIED\"\n"
1576       fi
1577
1578
1579          # ALLE MODIFIZIERTEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1580       Filenames=""
1581       svn status  >  tmp_mrun
1582       while  read line
1583       do
1584          firstc=`echo $line | cut -c1`
1585          if [[ $firstc = M  ||  $firstc = "?" ]]
1586          then
1587             Name=`echo "$line" | cut -c8-`
1588             extension=`echo $Name | cut -d. -f2`
1589             if [[ "$extension" = f90 || "$extension" = F90 || "$extension" = f || "$extension" = F || "$extension" = c ]]
1590             then
1591                Filenames="$Filenames "$Name
1592             fi
1593          fi
1594       done < tmp_mrun
1595
1596
1597          # DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1598       for  dateiname  in  $Filenames
1599       do
1600          cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1601          source_list=$source_list"$dateiname "
1602       done
1603
1604       cd -  > /dev/null
1605
1606
1607       # MITTELS OPTION -s ANGEGEBENE DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1608       # BEI AUTOMATISCHEN FORTSETZUNGSLAEUFEN SIND DORT SCHON ALLE DATEIEN
1609       # VORHANDEN
1610    elif [[ "$source_list" != ""  &&  $restart_run != true ]]
1611    then
1612
1613       cd  $source_path
1614
1615       for  filename  in  $source_list
1616       do
1617
1618             # QUELLTEXT-DATEI DARF KEINE PFADE BEINHALTEN
1619          if [[ $(print $filename | grep -c "/") != 0 ]]
1620          then
1621             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1622             printf "\n      must not contain (\"/\") "
1623             locat=source; exit
1624          fi
1625
1626          if [[ ! -f $filename ]]
1627          then
1628             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1629             printf "\n      does not exist"
1630             locat=source; exit
1631          else
1632             cp  $filename  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1633          fi
1634
1635       done
1636
1637       cd -  > /dev/null
1638
1639    fi
1640
1641
1642       # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM VORHANDEN UND ES EVTL. IN DER
1643       # LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE MIT ENTHALTEN IST (WENN
1644       # NICHT, WIRD ES DIESER LISTE HINZUGEFUEGT)
1645    if [[ $restart_run != true ]]
1646    then
1647
1648       if [[ ! -f "$source_path/$mainprog" ]]
1649       then
1650          printf "\n\n  +++ main program:  $mainprog"
1651          printf "\n      does not exist in source directory"
1652          printf "\n      \"$source_path\"\n"
1653          locat=source; exit
1654       else
1655          if [[ $(echo $source_list | grep -c $mainprog) = 0 ]]
1656          then
1657             cp  $source_path/$mainprog  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1658             source_list=${mainprog}" $source_list"
1659          fi
1660       fi
1661    fi
1662
1663
1664       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1665       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1666    if [[ "$restart_run" != true ]]
1667    then
1668       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1669       if [[ ! -f $makefile ]]
1670       then
1671          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1672          locat=make; exit
1673       else
1674          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1675       fi
1676    fi
1677
1678
1679       # DATEIEN AUS ZUSAETZLICHEM QUELLVERZEICHNIS HINZUFUEGEN
1680    if [[ $restart_run != true  &&  "$add_source_path" != "" ]]
1681    then
1682
1683          # GIBT ES DAS VERZEICHNIS UEBERHAUPT?
1684       if [[ ! -d $add_source_path ]]
1685       then
1686          printf "\n\n  +++ WARNING: additional source code directory"
1687          printf "\n      \"$add_source_path\" "
1688          printf "\n      does not exist or is not a directory."
1689          printf "\n      No source code will be used from this directory!\n"
1690          add_source_path=""
1691          sleep 3
1692       else
1693
1694          cd $add_source_path
1695          found=false
1696
1697          Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1698          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$Names"
1699          Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1700          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1701          Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1702          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1703          Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1704          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1705          Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1706          [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1707
1708          cd -  > /dev/null
1709          cd  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1710
1711             # COPY MAKEFILE IF EXISTING
1712          if [[ -f $add_source_path/Makefile ]]
1713          then
1714             printf "\n\n  *** user Makefile from directory"
1715             printf "\n      \"$add_source_path\" is used \n"
1716             sleep 1
1717             cp  $add_source_path/Makefile  .
1718          fi
1719
1720          for  dateiname  in  $AddFilenames
1721          do
1722             if [[ -f $dateiname ]]
1723             then
1724                printf "\n  +++ source code file \"$dateiname\" found in additional"
1725                printf "\n      source code directory \"$add_source_path\" "
1726                printf "\n      but was also given with option \"-s\" which means that it should be taken"
1727                printf "\n      from directory \"$source_path\"."
1728                locat=source; exit
1729             fi
1730
1731             cp  $add_source_path/$dateiname  .
1732             source_list="$source_list $dateiname"
1733
1734                # CHECK IF FILE IS CONTAINED IN MAKEFILE
1735             if [[ $(grep -c $dateiname Makefile) = 0 ]]
1736             then
1737                printf "\n\n  +++ user file \"$dateiname\" "
1738                printf "\n      is not listed in Makefile \n"
1739                locat=source; exit
1740             else
1741
1742                # Default User-Interface von der Liste entfernen, falls Datei
1743                # ein User-Interface enthaelt
1744#             if [[ $( cat $dateiname | grep -c "END SUBROUTINE user_parin" ) != 0 ]]
1745#             then
1746#                if [[ $dateiname != user_interface.f90  &&  -f user_interface.f90 ]]
1747#                then
1748#                   rm -rf  user_interface.f90
1749#                   source_list=`echo $source_list | sed -e 's/user_interface.f90//'`
1750#                   printf "\n\n  *** default \"user_interface.f90\" removed from the files to be translated"
1751#                   printf "\n      since a user-interface is found in file"
1752#                   printf "\n      \"$add_source_path/$dateiname\" \n"
1753#                   sleep 3
1754#                else
1755                if [[ $found = false ]]
1756                then
1757                   found=true
1758                   printf "\n\n  *** following user file(s) added to the"
1759                   printf " files to be translated:\n      "
1760                fi
1761                printf "$dateiname  "
1762                sleep 0.5
1763             fi
1764          done
1765          [[ $found = true ]]  &&  printf "\n"
1766          cd -  > /dev/null
1767       fi
1768    fi
1769
1770
1771       # ALLE UNTERPROGRAMME, DIE ZU VEREINBARTEN SOFTWAREPAKETEN GEHOEREN,
1772       # DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN HINZUFUEGEN
1773    if [[ $restart_run != true  &&  -n $package_list ]]
1774    then
1775
1776       cd  $source_path
1777
1778       for  package  in  $package_list
1779       do
1780
1781          [[ $package = "dvrp_graphics+1PE" ]]  &&  package=dvrp_graphics
1782
1783             # ERMITTELE ALLE DATEIEN, DIE ZUM PAKET GEHOEREN
1784             # FEHLERMELDUNGEN WERDEN ABGEFANGEN, DA * AUCH VERZEICHNISSNAMEN
1785             # LIEFERT
1786          package_source_list=`grep "defined( __$package " * 2>/dev/null | cut -f1 -d:`
1787
1788
1789             # FUEGE DIESE DATEIEN DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN
1790             # HINZU, FALLS SIE NOCH NICHT DAZUGEHOEREN
1791          for  source_list_name  in  $package_source_list
1792          do
1793             if [[ $(echo $source_list | grep -c $source_list_name) = 0 ]]
1794             then
1795
1796                    # NUR DATEIEN MIT GUELTIGEN ENDUNGEN VERWENDEN
1797                ending=`echo $source_list_name | cut -f2 -d.`
1798                if [[ "$ending" = f90  ||  "$ending" = F90  ||  "$ending" = f  ||  "$ending" = F  ||  "$ending" = c ]]
1799                then
1800                   cp  $source_list_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1801                   source_list="$source_list $source_list_name"
1802                fi
1803             fi
1804          done
1805       done
1806
1807       cd -  > /dev/null
1808    fi
1809
1810
1811       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1812       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1813#    if [[ "$restart_run" != true ]]
1814#    then
1815#       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1816#       if [[ ! -f $makefile ]]
1817#       then
1818#          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1819#          locat=make; exit
1820#       else
1821#          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1822#       fi
1823#    fi
1824
1825 fi  # do_compile=true
1826
1827
1828    # FALLS PROGRAMMTEILE UEBERSETZT WERDEN SOLLEN, FOLGEN JETZT EINIGE
1829    # UEBERPRUEFUNGEN UND DAS SETZEN DER PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN
1830 if [[ $do_compile = true ]]
1831 then
1832
1833       # PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN ZUM SELEKTIVEN AUSWAEHLEN VON CODETEILEN
1834       # ZUSAMMENSETZEN
1835       # DIREKTIVEN ZUM AKTIVIEREN VON RECHNERSPEZIFISCHEM CODE
1836    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1837    then
1838       cpp_options="${cpp_options},-D__ibm=__ibm"
1839    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = nec ]]
1840    then
1841       cpp_options="$cpp_options -D__nec"
1842    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-2) = lc ]]
1843    then
1844       cpp_options="$cpp_options -D__lc"
1845    else
1846       cpp_options="$cpp_options -D__$localhost"
1847    fi
1848
1849       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -K BESTIMMT WERDEN (Z.B. PARALLEL)
1850    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1851    then
1852       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond1=__$cond1"
1853       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond2=__$cond2"
1854    else
1855       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond1"
1856       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond2"
1857    fi
1858
1859       # DIREKTIVEN DIE SOFTWAREPAKETE AKTIVIEREN (OPTION -p)
1860    if [[ -n $package_list ]]
1861    then
1862       for  package  in  $package_list
1863       do
1864          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1865          then
1866             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1867             then
1868                cpp_options="${cpp_options},-D__$package=__$package"
1869             else
1870                cpp_options="${cpp_options},-D__dvrp_graphics=__dvrp_graphics"
1871                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1872             fi
1873          else
1874             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1875             then
1876                cpp_options="$cpp_options -D__$package"
1877             else
1878                cpp_options="$cpp_options -D__dvrp_graphics"
1879                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1880             fi
1881          fi
1882       done
1883    fi
1884
1885       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -D FESTGELEGT SIND
1886    if [[ -n $cpp_opts ]]
1887    then
1888       for  popts  in  $cpp_opts
1889       do
1890          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1891          then
1892             cpp_options="${cpp_options},-D__$popts=__$popts"
1893          else
1894             cpp_options="$cpp_options -D__$popts"
1895          fi
1896       done
1897    fi
1898
1899 else
1900
1901
1902       # BEI LOKALEN RECHNUNGEN PRUEFEN, OB EXECUTABLE VORHANDEN
1903    if [[ $do_remote = false ]]
1904    then
1905       if [[ ! -f $executable ]]
1906       then
1907          printf "\n  +++ executable file:  $executable"
1908          printf "\n      does not exist"
1909          locat=executable; exit
1910       fi
1911    fi
1912 fi
1913
1914
1915    # JOBMODUS FESTSTELLEN
1916 if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH  &&  $localhost != lctit  ||  "$QUEUE" != interactive  &&  $localhost = lctit ]]
1917 then
1918    jobmo=BATCH
1919 else
1920    jobmo=INTERACTIVE
1921 fi
1922
1923
1924    # HOSTSPEZIFISCHE DEFAULT-COMPILER SETZEN, FALLS NICHT BEREITS
1925    # DURCH BENUTZER ANDERWEITIG VEREINBART
1926 if [[ "$compiler_name" = "" ]]
1927 then
1928
1929    printf "\n  +++ no compiler specified for \"$host $cond1 $cond2\""
1930    locat=compiler_name; exit
1931
1932 fi
1933
1934
1935    # COMPILER AUF RIAMS NEC UEBERSCHREIBEN
1936 [[ $localhost = necriam ]]  &&  compiler_name=mpif90
1937
1938
1939
1940    # TEMPORAEREN KATALOGNAMEN BESTIMMEN
1941 kennung=$RANDOM
1942 if [[ "$tmp_user_catalog" = "" ]]
1943 then
1944    if [[ $localhost = ibmh ]]
1945    then
1946       tmp_user_catalog=$SCRATCH
1947    elif [[ $localhost = nech ]]
1948    then
1949       tmp_user_catalog=$WRKSHR
1950    else
1951       tmp_user_catalog=/tmp
1952    fi
1953 fi
1954 TEMPDIR=$tmp_user_catalog/${usern}.$kennung
1955
1956
1957    # KATALOGNAMEN FUER ZWISCHENSPEICHERUNG VON FORTSETZUNGSLAUFDATEIEN
1958    # BESTIMMEN
1959 if [[ "$tmp_data_catalog" = "" ]]
1960 then
1961    if [[ $localhost = ibmb ]]
1962    then
1963       tmp_data_catalog=$WORK/mrun_restart_data
1964    elif [[ $localhost = nech ]]
1965    then
1966       tmp_data_catalog=$WRKSHR/mrun_restart_data
1967    else
1968       tmp_data_catalog=/tmp/mrun_restart_data
1969    fi
1970 fi
1971
1972
1973    # EVENTUELL BEI LOKALEN RECHNUNGEN $-ZEICHEN IN ENVIRONMENT-VARIABLEN
1974    # ERSETZEN
1975 if [[ $do_remote = false  &&  $do_compile = true ]]
1976 then
1977    eval  fopts=\"$fopts\"
1978    eval  lopts=\"$lopts\"
1979 fi
1980
1981
1982
1983    # COMPILE- UND LINK-OPTIONEN BESTIMMEN
1984 fopts="$fopts $netcdf_inc $dvr_inc"
1985 lopts="$lopts $netcdf_lib $dvr_lib"
1986 ROPTS="$ropts"
1987 if [[ ( $(echo $host | cut -c1-3) = nec  ||  $(echo $host | cut -c1-3) = ibm  ||  $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib  ||  $host = lctit  ||  $host = lcfimm  ||  $host = lcxt4 || $host = lck )  &&  -n $numprocs ]]
1988 then
1989    XOPT="-X $numprocs"
1990 fi
1991
1992
1993
1994    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT. (CPUMAX WIRD ALS ENV-VARIABLE VOM HAUTPRO-
1995    # GRAMM BENOETIGT
1996 done=false
1997 while [[ $done = false ]]
1998 do
1999    cputime=$cpumax
2000    if (( $cputime == 0 ))
2001    then
2002       if [[ $do_batch = true ]]
2003       then
2004          printf "\n  +++ cpu-time is undefined"
2005          printf "\n  >>> Please type CPU-time in seconds as INTEGER:"
2006          printf "\n  >>> "
2007          read  cputime  1>/dev/null  2>&1
2008       else
2009          cputime=10000000   # NO CPU LIMIT FOR INTERACTIVE RUNS
2010       fi
2011    else
2012       done=true
2013    fi
2014    cpumax=$cputime
2015 done
2016
2017 (( minuten = cputime / 60 ))
2018 (( sekunden = cputime - minuten * 60 ))
2019
2020
2021    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
2022 if [[ $do_batch = true ]]
2023 then
2024    done=false
2025    while [[ $done = false ]]
2026    do
2027       if (( memory == 0 ))
2028       then
2029          printf "\n  +++ memory demand is undefined"
2030          printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
2031          printf "\n  >>> "
2032          read  memory  1>/dev/null  2>&1
2033       else
2034          done=true
2035       fi
2036    done
2037 fi
2038
2039
2040    # PRUEFEN, OB FUER REMOTE-RECHNUNGEN EIN BENUTZERNAME ANGEGEBEN WURDE
2041 if [[ $do_remote = true  &&  -z $remote_username ]]
2042 then
2043    while [[ -z $remote_username ]]
2044    do
2045       printf "\n  +++ username on remote host \"$host\" is undefined"
2046       printf "\n  >>> Please type username:"
2047       printf "\n  >>> "
2048       read  remote_username
2049    done
2050    mc="$mc -u$remote_username"
2051 fi
2052
2053
2054    # SET DEFAULT VALUE FOR MPI MODULE TO BE USED ON SGI-ALTIX
2055 if [[ $host = lcsgib  ||  $host = lcsgih ]]
2056 then
2057    [[ "$mpilib" = "" ]]  &&  export mpilib=mpt
2058 fi
2059
2060
2061
2062###########################################################################
2063# HEADER-AUSGABE
2064###########################################################################
2065
2066
2067 calltime=$(date)
2068 printf "\n"
2069# [[ $silent = false ]]  &&  clear
2070 printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
2071 printf "| $version$calltime | \n"
2072 printf "|                                                              | \n"
2073 spalte1="called on:"; spalte2=$localhost_realname
2074 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2075 if [[ $local_compile = false ]]
2076 then
2077    if [[ $do_remote = true ]]
2078    then
2079       spalte1="execution on:"; spalte2="$host (username: $remote_username)"
2080    else
2081       spalte1="execution on:"; spalte2="$host ($localhost_realname)"
2082    fi
2083 else
2084    spalte1="compiling test only!"; spalte2=""
2085 fi
2086 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2087 if [[ -n $numprocs ]]
2088 then
2089    spalte1="number of PEs:"; spalte2=$numprocs
2090    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2091 fi
2092 if [[ -n $tasks_per_node ]]
2093 then
2094    spalte1="tasks per node:"; spalte2="$tasks_per_node (number of nodes: $nodes)"
2095    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2096 fi
2097 if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2098 then
2099    spalte1="threads per task:"; spalte2="$threads_per_task"
2100    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2101 fi
2102 printf "|                                                              | \n"
2103 if [[ $do_compile = true ]]
2104 then
2105    spalte1=cpp-directives:; spalte2=$cpp_options
2106    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2107    zeile=$(echo "$cpp_options" | cut -c41-)
2108    while [[ "$zeile" != "" ]]
2109    do
2110       spalte1=""
2111       spalte2=$zeile
2112       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2113       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2114    done
2115
2116    spalte1=compiler-options:; spalte2="$fopts"
2117    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2118    zeile=$(echo "$fopts" | cut -c41-)
2119    while [[ "$zeile" != "" ]]
2120    do
2121       spalte1=""
2122       spalte2=$zeile
2123       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2124       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2125    done
2126
2127    spalte1=linker-options:; spalte2=$lopts
2128    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2129    zeile=$(echo "$lopts" | cut -c41-)
2130    while [[ "$zeile" != "" ]]
2131    do
2132       spalte1=""
2133       spalte2=$zeile
2134       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2135       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2136    done
2137
2138    spalte1="main program":; spalte2=$mainprog
2139    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2140 else
2141    spalte1=executable:; spalte2=$executable
2142    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2143 fi
2144 printf "|                                                              | \n"
2145 spalte1="base name of files":; spalte2=$fname
2146 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2147 if [[ $fname != $afname ]]
2148 then
2149    spalte1="base name of input files":; spalte2=$afname
2150    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2151 fi
2152 spalte1="INPUT control list":; spalte2=$input_list
2153 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2154 spalte1="OUTPUT control list":; spalte2=$output_list
2155 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2156
2157 if [[ $do_batch = true  ||  "$LOADLBATCH" = yes ]]
2158 then
2159    spalte1="memory demand / PE":; spalte2="$memory MB"
2160    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2161    spalte1=CPU-time:; spalte2="$minuten:$sekunden"
2162    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2163 fi
2164
2165 if [[ $do_compile = true ]]
2166 then
2167    printf "|                                                              | \n"
2168    printf "| Files to be compiled:                                        | \n"
2169    zeile=$source_list
2170    while [[ "$zeile" != "" ]]
2171    do
2172       spalte3=$zeile
2173       printf "| $spalte3 | \n"
2174       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c61-)
2175    done
2176 fi
2177 printf "#--------------------------------------------------------------#"
2178
2179
2180
2181    # BEDINGTE AUSGABE DER DATEIVERBINDUNGEN
2182 if [[ $do_trace = true ]]
2183 then
2184    (( i = 0 ))
2185    while (( i < iin ))
2186    do
2187       (( i = i + 1 ))
2188       if (( i == 1 ))
2189       then
2190          printf "\n\n >>> INPUT-file assignments:\n"
2191       fi
2192       printf "\n     ${localin[$i]} :  ${absnamein[$i]}"
2193    done
2194    (( i = 0 ))
2195    while (( i < iout ))
2196    do
2197       (( i = i + 1 ))
2198       if (( i == 1 ))
2199       then
2200          printf "\n\n >>> OUTPUT-file assignments:\n"
2201       fi
2202       printf "\n     ${localout[$i]} :  ${pathout[$i]}"
2203    done
2204    (( i = 0 ))
2205    while (( i < iic ))
2206    do
2207       (( i = i + 1 ))
2208       if (( i == 1 ))
2209       then
2210          printf "\n\n >>> INPUT-commands:\n"
2211       fi
2212       printf "\n     ${in_command[$i]}" 
2213    done
2214    (( i = 0 ))
2215    while (( i < ioc ))
2216    do
2217       (( i = i + 1 ))
2218       if (( i == 1 ))
2219       then
2220          printf "\n\n >>> OUTPUT-commands:\n"
2221       fi
2222       printf "\n     ${out_command[$i]}" 
2223    done
2224 fi
2225
2226
2227    # ABFRAGEN BEI AUFRUF AUF LOKALER MASCHINE
2228 if [[ $remotecall = false  &&  $silent = false  &&  $jobmo != BATCH ]]
2229 then
2230    antwort=dummy
2231    printf "\n\n"
2232    while [[ "$antwort" != y  &&  "$antwort" != Y  &&  "$antwort" != n  &&  "$antwort" != N ]]
2233    do
2234       printf " >>> everything o.k. (y/n) ?  "
2235       read  antwort
2236    done
2237    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
2238    then
2239       locat=user_abort; (( iec = 0 )); exit
2240    fi
2241    if [[ $do_batch = true ]]
2242    then
2243       printf " >>> batch-job will be created and submitted"
2244    else
2245       if [[ $local_compile = false ]]
2246       then
2247          printf " >>> MRUN will now continue to execute on this machine"
2248       else
2249          printf " >>> a test compilation will now be carried out on this machine"
2250       fi
2251    fi
2252 fi
2253 
2254
2255
2256
2257     # FALLS AUF DIESER MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
2258     # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
2259 if [[ $do_batch = false ]]
2260 then
2261
2262
2263       # TEMPORAEREN KATALOG ERZEUGEN
2264    mkdir -p  $TEMPDIR
2265    chmod  go+rx  $TEMPDIR
2266    tmpcreate=true
2267
2268
2269       # SAEMTLICHE QUELLTEXT-DATEIEN BZW. AUSFUEHRBARES PROGRAMM IN
2270       # TEMPORAERES VERZEICHNIS KOPIEREN
2271    if [[ $do_compile = true ]]
2272    then
2273
2274          # ON NEC, COMPILATION IS DONE ON HOST CROSS VIA CROSS COMPILING
2275          # CREATE A TEMPORARY DIRECTORY ON THAT MACHINE (HOME MOUNTED VIA NFS)
2276       if [[ $localhost = nech ]]
2277       then
2278          TEMPDIR_COMPILE=$HOME/work/${usern}.$kennung
2279          if  mkdir -p  $TEMPDIR_COMPILE
2280          then
2281             printf "\n  *** \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2282             printf "\n      is generated as temporary directory for cross compiling\n"
2283          else
2284             printf "\n  +++ creating directory \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2285             printf "\n      needed for cross compilation failed"
2286             locat=compile
2287             exit
2288          fi
2289       else
2290          TEMPDIR_COMPILE=$TEMPDIR
2291       fi
2292
2293
2294          # PFADNAMEN FUER DAS MAKE-DEPOSITORY ERMITTELN
2295       line=""
2296       grep "%depository_path" $config_file  >  tmp_mrun
2297       while read line
2298       do
2299          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2300          then
2301             if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f3)" = "" ]]
2302             then
2303                global_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2304             fi
2305          fi
2306       done < tmp_mrun
2307
2308       line=""
2309       grep  " $localhost" $config_file | grep "%depository_path"  >  tmp_mrun
2310       while read line
2311       do
2312          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2313          then
2314             if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f4)" = "$cond1"  &&  "$(echo $line | cut -d" " -s -f5)" = "$cond2" ]]
2315             then
2316                local_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2317             fi
2318          fi
2319       done < tmp_mrun
2320
2321       if [[ "$local_depository_path" = "" ]]
2322       then
2323          if [[ "$global_depository_path" != "" ]]
2324          then
2325             local_depository_path=$global_depository_path
2326          else
2327             printf "\n\n  +++ no depository path found in configuration file"
2328             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
2329             printf "\n      please set \"\%depository_path\" in configuration file\n"
2330             locat=config_file; exit
2331          fi
2332       fi
2333       eval local_depository_path=$local_depository_path
2334       [[ "$cond1" != "" ]]  &&  local_depository_path=${local_depository_path}_$cond1
2335       [[ "$cond2" != "" ]]  &&  local_depository_path=${local_depository_path}_$cond2
2336
2337
2338       basename=`print $mainprog | cut -f1 -d"."`
2339       eval make_depository=${local_depository_path}/${basename}_current_version.tar
2340       if [[ ! -f $make_depository ]]
2341       then
2342          printf "\n"
2343          printf "\n  *** WARNING: make depository \"$make_depository\" not found"
2344          printf "\n               \"make\" will fail, if the Makefile or other source files are missing\n"
2345       else
2346          cp  $make_depository  $TEMPDIR_COMPILE
2347          cd  $TEMPDIR_COMPILE
2348          tar -xf  $make_depository  >  /dev/null  2>&1
2349          cd -  > /dev/null
2350       fi
2351
2352       cp  SOURCES_FOR_RUN_$fname/*  $TEMPDIR_COMPILE
2353
2354          # FALLS USER-INTERFACE VORHANDEN UND AUF DATEI MIT ANDEREM NAMEN
2355          # ALS user_interface.f90 LIEGT, DIESEN GEAENDERTEN NAMEN INS
2356          # MAKEFILE EINTRAGEN
2357#       cd  $TEMPDIR_COMPILE
2358#       interface_file=`grep -l "END SUBROUTINE user_parin" $source_list`
2359#       if [[ "$interface_file" != "" ]]
2360#       then
2361#          interface_file=`echo $interface_file | cut -d"." -f1`
2362#          mv  Makefile  Makefile_old
2363#          sed "s/user_interface/$interface_file/g"  Makefile_old  >  Makefile
2364#       fi
2365#       cd -  > /dev/null
2366    else
2367       cp  $executable   ${TEMPDIR}/a.out
2368    fi
2369
2370
2371       # WECHSEL IN TEMPORAEREN KATALOG
2372    cd $TEMPDIR
2373    printf "\n  *** changed to temporary directory: $TEMPDIR"
2374
2375
2376       # OUTPUT-DATEI-VERBINDUNGEN AUF TEMPORAERER DATEI ABLEGEN
2377       # DIESE DATEI KANN VON SPAETER AUFZURUFENDEN BENUTZERPROZEDUREN GELESEN
2378       # WERDEN, UM ZU LOKALEN DATEINAMEN GEHOERENDE PERMANENTE NAMEN ZU
2379       # ERMITTELN
2380    (( i = 0 ))
2381    while (( i < iout ))
2382    do
2383       (( i = i + 1 ))
2384       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = tra  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
2385       then
2386          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2387       else
2388          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${frelout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2389       fi
2390    done
2391
2392
2393       # EVTL. UEBERSETZUNGSAKTIONEN STARTEN
2394    if [[ $do_compile = true ]]
2395    then
2396
2397
2398          # COMPILING WITH MAKE (ON NEC COMPILER IS CALLED ON HOST CROSS)
2399       printf "\n\n\n  *** compilation starts \n$striche\n"
2400       printf "  *** compilation with make using following options:\n"
2401       printf "      make depository:          $make_depository"
2402       printf "      compilername:             $compiler_name\n"
2403       printf "      options:                  $fopts\n"
2404       printf "      preprocessor-directives:  $cpp_options \n"
2405       printf "      linker-options:           $lopts \n"
2406       printf "      source code files:        $source_list \n"
2407
2408       if [[ $localhost = nech ]]
2409       then
2410          ssh  136.172.44.192 -l $usern ". /SX/opt/etc/initsx.sh; cd \$HOME/work/${usern}.$kennung; sxmake -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2411          cp  $TEMPDIR_COMPILE/a.out  .
2412          [[ $? != 0 ]]  &&  compile_error=true
2413          rm -rf  $TEMPDIR_COMPILE
2414       elif [[ $localhost = ibmh ]]
2415       then
2416          printf "      compiler is called via ssh on \"plogin1\" \n"
2417          ssh  plogin1  -l $usern  "export PATH=/sw/ibm/xlf/12.1.0.3/usr/bin:$PATH; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2418          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
2419          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
2420       elif [[ $localhost = lcsgib ]]
2421       then
2422          printf "      compiler is called via ssh on \"bicegate\" using module \"$mpilib\" \n"
2423          ssh  130.73.232.103  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load $mpilib; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2424          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
2425          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
2426       elif [[ $localhost = lcsgih ]]
2427       then
2428          printf "      compiler is called via ssh on \"hicegate2\" using module \"$mpilib\" \n"
2429          ssh  130.75.4.103  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load ifort/11.0.069; module load $mpilib; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" 2>&1 "
2430          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
2431          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
2432       else
2433          [[ $localhost = lctit ]]  &&  export LM_LICENSE_FILE=27050@tggls
2434          make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT="$cpp_options"  F90FLAGS="$fopts"  LDFLAGS="$lopts"
2435       fi
2436
2437       if [[ $? != 0  ||  "$compile_error" = true  ||  "$module_compile_error" = true ]]
2438       then
2439          printf "\n  +++ error occured while compiling or linking"
2440          locat=compile
2441
2442  # WORKAROUND: REMOVE IF CONSTRUCT LATER, BUT KEEP THE EXIT!
2443#          if [[ $localhost != lcsgib  &&  $localhost != lcsgih ]]
2444#          then
2445             exit
2446#          else
2447#             locat=normal
2448#          fi
2449       else
2450          printf "$striche\n  *** compilation finished \n"
2451       fi
2452    fi
2453
2454
2455       # FALLS NUR TESTWEISE KOMPILIERT WERDEN SOLLTE, IST MRUN JETZT FERTIG
2456    if [[ $local_compile = true ]]
2457    then
2458       cd  $HOME
2459       rm -rf $TEMPDIR
2460       locat=local_compile; exit
2461    fi
2462
2463
2464       # BEREITSTELLEN DER INPUT-DATEIEN
2465       # SCHLEIFE UEBER ALLE VOM BENUTZER ANGEGEBENEN DATEIEN
2466    (( i = 0 ))
2467    while (( i < iin ))
2468    do
2469       (( i = i + 1 ))
2470       if (( i == 1 ))
2471       then
2472          printf "\n\n  *** providing INPUT-files:\n$striche"
2473       fi
2474
2475
2476          # OPTIONALE DATEIEN BEI NICHTVORHANDENSEIN UEBERGEHEN
2477       if [[ "${transin[$i]}" = unavailable ]]
2478       then
2479          if [[ "${extin[$i]}" = ""  ||  "${extin[$i]}" = " " ]]
2480          then
2481             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}\" "
2482             printf "\n               is not available!"
2483          else
2484             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}.${extin[$i]}\" "
2485             printf "\n               is not available!"
2486          fi
2487          continue
2488       fi
2489
2490          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2491       files_for_pes=false; datentyp=file
2492       if [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2493       then
2494          files_for_pes=true; datentyp=directory
2495          actionin[$i]=""
2496       elif [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2497       then
2498          actionin[$i]=""
2499       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2500       then
2501          files_for_pes=true; datentyp=directory
2502          actionin[$i]="ar"
2503       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2504       then
2505          actionin[$i]="ar"
2506       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2507       then
2508          files_for_pes=true; datentyp=directory
2509          actionin[$i]="fl"
2510       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2511       then
2512          actionin[$i]="fl"
2513       fi
2514
2515       if [[ $files_for_pes = true ]]
2516       then
2517          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}/....  to  ${localin[$i]}"
2518       else
2519          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}  to  ${localin[$i]}"
2520       fi
2521
2522          # INPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. ES WIRD GEPRUEFT,
2523          # OB DIESE DATEI NOCH AUF DEM TEMPORAEREN DATENKATALOG VORHANDEN
2524          # IST. FALLS NICHT, WIRD VERSUCHT, SIE ANSCHLIESSEND VOM ARCHIV-
2525          # SERVER ZU HOLEN
2526       if [[ "${actionin[$i]}" = fl ]]
2527       then
2528          printf "\n      $datentyp will be fetched from temporary directory \"${tmp_data_catalog}\" !"
2529          if [[ $files_for_pes = false ]]
2530          then
2531             if [[ -f "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2532             then
2533                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2534                got_tmp[$i]=true
2535             elif [[ -f "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2536             then
2537                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2538                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2539                cp  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2540             else
2541                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2542                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2543                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2544                actionin[$i]=ar
2545             fi
2546          else
2547             if [[ -d "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2548             then
2549                mkdir  ${localin[$i]}
2550                cd $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2551                for file in $(ls *)
2552                do
2553                   ln $file $TEMPDIR/${localin[$i]}
2554                done
2555                cd $TEMPDIR
2556                got_tmp[$i]=true
2557             elif [[ -d "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2558             then
2559                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2560                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2561                cp -r  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2562             else
2563                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2564                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2565                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2566                actionin[$i]=ar
2567             fi
2568          fi
2569       fi
2570
2571
2572          # DATEI LIEGT AUF ARCHIV-SERVER
2573       if [[ "${actionin[$i]}" = ar ]]
2574       then
2575
2576          if [[ $files_for_pes = false ]]
2577          then
2578             printf "\n      file will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2579          else
2580             printf "\n      directory will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2581          fi
2582
2583          file_restored=false
2584
2585          if [[ $archive_system = asterix ]]
2586          then
2587             do_stagein=true
2588             (( stagein_anz = 0 ))
2589             while [[ $do_stagein = true ]]
2590             do
2591                if [[ $files_for_pes = false ]]
2592                then
2593                   stagein  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2594                else
2595                   stagein  -t  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2596                fi
2597                cat  STAGEIN_OUTPUT
2598                if [[ $(grep -c "st.msg:i24"  STAGEIN_OUTPUT) != 0 ]]
2599                then
2600                   file_restored=true
2601                   do_stagein=false
2602                else
2603                   (( stagein_anz = stagein_anz + 1 ))
2604                   if (( stagein_anz == 10 ))
2605                   then
2606                      printf "\n  +++ stagein stoped after 10 tries"
2607                      locat=stage
2608                      exit
2609                   fi
2610                   printf "\n  +++ restoring from archive failed, trying again:"
2611                   sleep 900
2612                fi
2613             done
2614          elif [[ $archive_system = DMF ]]
2615          then
2616             if [[ $files_for_pes = false ]]
2617             then
2618                printf "\n  +++ restoring of single files impossible with $archive_system !\n"
2619                locat=DMF
2620                exit
2621             else
2622                find  $ARCHIVE/${frelin[$i]}  -type m  -print  |  dmget
2623                cp  -r $ARCHIVE/${frelin[$i]}  $PWD
2624                file_restored=true
2625             fi
2626          elif [[ $archive_system = tivoli ]]
2627          then
2628             if [[ $files_for_pes = false ]]
2629             then
2630                if [[ $localhost = ibmh ]]
2631                then
2632                   ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2633                else
2634                   ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2635                fi
2636             else
2637                (( inode = 0 ))
2638                while (( inode < nodes ))
2639                do
2640                   if [[ $localhost = ibmh ]]
2641                   then
2642                      ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2643                   else
2644                      ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2645                   fi
2646                   (( inode = inode + 1 ))
2647                done
2648             fi
2649             file_restored=true
2650          elif [[ $archive_system = ut ]]
2651          then
2652             if [[ $files_for_pes = false ]]
2653             then
2654                cp  $UT/${frelin[$i]}  .
2655             else
2656                (( inode = 0 ))
2657                while (( inode < nodes ))
2658                do
2659                   tar  xf  $UT/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar
2660                   (( inode = inode + 1 ))
2661                done
2662             fi
2663             file_restored=true
2664          else
2665             printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"   restore impossible!"
2666             locat=rearchive
2667             exit
2668          fi
2669
2670          if [[ $file_restored = true ]]
2671          then
2672
2673                # DATEI AUCH AUF TEMPORAERES DATENVERZEICHNIS LEGEN, DAMIT
2674                # SIE BEI WEITEREN ZUGRIFFEN NOCH VORHANDEN IST
2675             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog; chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
2676             if [[ $files_for_pes = false ]]
2677             then
2678                ln  -f  ${frelin[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2679             else
2680                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2681                ln  -f  ${frelin[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2682             fi
2683             got_tmp[$i]=true
2684
2685                # DATEI UNTER LOKALEM NAMEN ZUR VERFUEGUNG STELLEN
2686             mv  ${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2687
2688          fi
2689       fi
2690
2691
2692          # DATEI LIEGT IM VOM BENUTZER ANGEGEBENEN VERZEICHNIS
2693       if [[ "${actionin[$i]}" = ""  ||  "${actionin[$i]}" = "di"  ||  "${actionin[$i]}" = "npe" ]]
2694       then
2695
2696          if [[ "${actionin[$i]}" = "npe"  &&  -n $numprocs ]]
2697          then
2698
2699                # DATEI WIRD FUER DIE PROZESSOREN EINES PARALLERECHNERS BEREITGESTELLT
2700             printf "\n      file will be provided for $numprocs processors"
2701             mkdir  ${localin[$i]}
2702             ival=$numprocs
2703             (( ii = 0 ))
2704             while (( ii <= ival-1 ))
2705             do
2706                if (( ii < 10 ))
2707                then
2708                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_000$ii
2709                elif (( ii < 100 ))
2710                then
2711                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_00$ii
2712                elif (( ii < 1000 ))
2713                then
2714                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_0$ii
2715                else
2716                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_$ii
2717                fi
2718                (( ii = ii + 1 ))
2719             done
2720
2721          else
2722
2723             if [[ $files_for_pes = true ]]
2724             then
2725
2726                   # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
2727                   # DATEIEN WERDEN BEREITGESTELLT, INDEM ZUERST DER GESAMTE
2728                   # KATALOGINHALT KOPIERT UND DANN DIE EINZELNEN DATEIEN
2729                   # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
2730                printf "\n      providing $numprocs files for the respective processors"
2731                mkdir  ${localin[$i]}
2732                if [[ $link_local_input = true ]]
2733                    then
2734                    printf "      using ln -f\n"
2735                    cd ${absnamein[$i]}
2736                    for file in $(ls *)
2737                      do
2738                      ln -f $file  ${localin[$i]}
2739                    done
2740                    cd $TEMPDIR
2741                fi
2742                # If "ln -f" fails of if "$link_local_input = false" do a normal "cp -r"
2743                if [[ ! -f "${localin[$i]}/_0000" ]]
2744                    then
2745                    if [[ $link_local_input = true ]]
2746                        then
2747                        printf "      ln failed for .../_0000, using cp...\n"
2748                    fi
2749                    cp -r  ${absnamein[$i]}/*  ${localin[$i]}
2750                fi
2751
2752             else
2753                   # BEREITSTELLUNG AUF EINPROZESSORRECHNERN
2754                if [[ $link_local_input = true ]]
2755                then
2756                    printf "      using ln -f\n"
2757                    ln -f  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2758                fi
2759                # If "ln -f" fails of if "$link_local_input = false" do a normal "cp"
2760                if [[ ! -f "${localin[$i]}" ]]
2761                then
2762                    if [[ $link_local_input = true ]]
2763                    then
2764                        printf "      ln failed, using cp...\n"
2765                    fi
2766                    cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2767                fi
2768             fi
2769          fi
2770       fi
2771
2772    done
2773    if (( i != 0 ))
2774    then
2775       printf "\n$striche\n  *** all INPUT-files provided \n"
2776    fi
2777
2778
2779       # EVENTUELLE INPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2780    (( i = 0 ))
2781    while (( i < iic ))
2782    do
2783       (( i = i + 1 ))
2784       if (( i == 1 ))
2785       then
2786          printf "\n\n  *** execution of INPUT-commands:\n$striche"
2787       fi
2788       printf "\n  >>> ${in_command[$i]}"
2789       eval  ${in_command[$i]}
2790       if (( i == iic ))
2791       then
2792          printf "\n$striche\n"
2793       fi
2794    done
2795
2796
2797       # VERBLEIBENDE CPU-ZEIT BERECHNEN
2798    cpurest=${cpumax}.
2799
2800
2801       # START DVR STREAMING SERVER
2802    if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
2803    then
2804       if [[ "$dvr_server" != "" ]]
2805       then
2806
2807          printf "\n\n  *** preparing the dvr streaming server configuration file"
2808
2809             # Check, if a dvr server is already running
2810          running_dvrserver_id=`echo $(ps -edaf | grep .dvrserver.config | grep -v grep) | cut -d" " -f2`
2811          if [[ "$running_dvrserver_id" != "" ]]
2812          then
2813
2814             printf "\n\n  +++ WARNING: A dvr server with id=$running_dvrserver_id is already running!"
2815             printf "\n      This server is used instead starting a new one!"
2816             printf "\n      If required, script \"process_dvr_output\" has to be run manually."
2817
2818          else
2819
2820                # COPY CONFIGURATION FILE FOR STREAMING SERVER FROM REPOSITORY TO HERE
2821             if [[ -f ${PALM_BIN}/.dvrserver.config ]]
2822             then
2823                cp  ${PALM_BIN}/.dvrserver.config  .
2824
2825                   # Entering the BASEDIR, UID and GID into this file
2826                user_id=`id -u`
2827                group_id=`id -g`
2828                   # & is needed as seperator, because TEMPDIR contains /
2829                sed "s&<replace by dvr data directory>&${TEMPDIR}&g" .dvrserver.config > .dvrserver.1
2830                sed "s/<replace by user id>/$user_id/g"    .dvrserver.1 > .dvrserver.2
2831                sed "s/<replace by group id>/$group_id/g"  .dvrserver.2 > .dvrserver.3
2832                mv  .dvrserver.3  .dvrserver.config
2833                rm  .dvrserver.1  .dvrserver.2
2834
2835                   # Start dvr server in background, get his id and print on terminal
2836                $dvr_server  .dvrserver.config  >>  DVR_LOGFILE  2>&1  &
2837                dvrserver_id=`echo $(ps -edaf | grep .dvrserver.config) | cut -d" " -f2`
2838                printf "\n  *** streaming server with id=$dvrserver_id is started in background"
2839                local_dvrserver_running=.TRUE.
2840             else
2841                printf "\n  +++ missing file \".dvrserver.config\" in directory:"
2842                printf "\n      \"$PALM_BIN\" "
2843                locat=dvr
2844                exit
2845             fi
2846
2847          fi
2848
2849       else
2850          printf "\n\n  --- INFORMATIVE: no dvr streaming server will be started"
2851       fi
2852    fi
2853
2854
2855       # NAMELIST-DATEI MIT WERTEN VON ENVIRONMENT-VARIABLEN ERZEUGEN (ZU
2856       # LESEN VON PALM)
2857    cat  >  ENVPAR  <<  %%END%%
2858 &envpar  run_identifier = '$fname', host = '$localhost',
2859          write_binary = '$write_binary', tasks_per_node = $tasks_per_node,
2860          maximum_cpu_time_allowed = ${cpumax}.,
2861          revision = '$global_revision',
2862          local_dvrserver_running = $local_dvrserver_running /
2863
2864%%END%%
2865
2866
2867       # PROGRAMMSTART
2868    printf "\n\n  *** execution starts in directory\n      \"`pwd`\"\n$striche\n"
2869    PATH=$PATH:$TEMPDIR
2870
2871       # MPI debug option (argument checking, slows down execution due to increased latency)
2872    if [[ "$mpi_debug" = true ]]
2873    then
2874       export MPI_CHECK_ARGS=1
2875       printf "\n  +++ MPI_CHECK_ARGS=$MPI_CHECK_ARGS"
2876    fi
2877
2878    if [[ "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ]]
2879    then
2880       if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH ]]
2881       then
2882          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-5) != lcsgi ]]
2883          then
2884             printf "\n  +++ debug is allowed in interactive mode only"
2885             locat=debug
2886             exit
2887          fi
2888       fi
2889       if [[ $localhost = decalpha ]]
2890       then
2891          dxladebug  a.out
2892       elif [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
2893       then
2894
2895             # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2896          export MP_SHARED_MEMORY=yes
2897          export AIXTHREADS_SCOPE=S
2898          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2899          export AUTHSTATE=files
2900          export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2901
2902             # FOLLOWING OPTIONS ARE MANDATORY FOR TOTALVIEW
2903          export MP_ADAPTER_USE=shared
2904          export MP_CPU_USE=multiple
2905          export MP_TIMEOUT=1200
2906
2907          unset  MP_TASK_AFFINITY
2908
2909             # SO FAR, TOTALVIEW NEEDS HOSTFILE MECHANISM FOR EXECUTION
2910          #(( ii = 1 ))
2911          #while (( ii <= $numprocs ))
2912          #do
2913          #   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2914          #   (( ii = ii + 1 ))
2915          #done
2916          #export MP_HOSTFILE=hostfile
2917
2918          if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2919          then
2920             totalview   poe  a.out  $ROPTS
2921          else
2922             echo totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2923             export TVDSVRLAUNCHCMD=ssh
2924             totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2925          fi
2926       elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-5) = lcsgi ]]
2927       then
2928             # CURRENTLY NO DEBUGGER ON LCSGI
2929          if [[ $run_coupled_model = true ]]
2930          then
2931             printf "\n  +++ no debug in coupled mode available on \"$localhost\" "
2932             locat=debug
2933             exit
2934          else
2935             echo "no_coupling"  >  runfile_atmos
2936          fi
2937          (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
2938          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2939          echo "OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"
2940          if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2941          then
2942             printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
2943          fi
2944          printf "\n\n"
2945          if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
2946          then
2947#             export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
2948             if [[ "$totalview" = true ]]
2949             then
2950                printf "\n     running totalview debugger"
2951                mpiexec_mpt -tv -n $ii   ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2952             else
2953                mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2954             fi
2955          elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
2956          then
2957#             ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
2958#             export MV2_NUM_PORTS=2
2959#             export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
2960             if [[ "$totalview" = true ]]
2961             then
2962                printf "\n     running totalview debugger"
2963                mpiexec -tv ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2964             else
2965                mpiexec    ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2966             fi
2967          fi
2968       else 
2969          printf "\n  +++ no debug available on \"$localhost\" "
2970          printf "\n      or not implemented in mrun so far"
2971          locat=debug
2972          exit
2973       fi
2974    else
2975       if [[ -n $numprocs ]]
2976       then
2977             # RUNNING THE PROGRAM ON PARALLEL MACHINES
2978          if [[ $(echo $host | cut -c1-3) = ibm ]]
2979          then
2980                # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2981             if [[ $host != ibmh ]]
2982             then
2983                export MP_SHARED_MEMORY=yes
2984                export AIXTHREAD_SCOPE=S
2985                export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2986                export XLSMPOPTS="spins=0:yields=0:stack=20000000"
2987                export AUTHSTATE=files
2988                export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2989                #  export MP_PRINTENV=yes
2990
2991                   # TUNING-VARIABLEN ZUR VERBESSERUNG DER KOMMUNIKATION
2992                   # ZEIGEN ABER DERZEIT (SEP 04, FEDERATION) KAUM WIRKUNG
2993                export MP_WAIT_MODE=poll
2994                [[ $node_usage = not_shared ]]  &&  export MP_SINGLE_THREAD=yes
2995             fi
2996             if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2997             then
2998                printf "\n--- Control: OMP_NUM_THREADS = \"$OMP_NUM_THREADS\" \n"
2999                if [[ "$cond1" = hpmcount  ||  "$cond2" = hpmcount ]]
3000                then
3001                   /opt/optibm/HPM_2_4_1/bin/hpmcount  a.out  $ROPTS
3002                else
3003                   if [[ $run_coupled_model = false ]]
3004                   then
3005                      if [[ "$ocean_file_appendix" = true ]]
3006                      then
3007                         echo "precursor_ocean"  >  runfile_atmos
3008                      else
3009                         echo "precursor_atmos"  >  runfile_atmos
3010                      fi
3011                   else
3012                      (( iia = $numprocs_atmos / $threads_per_task ))
3013                      (( iio = $numprocs_ocean / $threads_per_task ))
3014                      printf "\n      coupled run ($iia atmosphere, $iio ocean)"
3015                      printf "\n      using $coupled_mode coupling"
3016                      printf "\n\n"
3017                      echo "coupled_run $iia $iio"  >  runfile_atmos
3018                   fi
3019                   poe ./a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos
3020                fi
3021             else
3022                if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms ]]
3023                then
3024                   poe  a.out  -procs $numprocs  -nodes 1  -rmpool 0  $ROPTS
3025                elif [[ $localhost = ibmy ]]
3026                then
3027                   if [[ -f $hostfile ]]
3028                   then
3029                      cp  $hostfile  hostfile
3030                   else
3031                      (( ii = 1 ))
3032                      while (( ii <= $numprocs ))
3033                      do
3034                         echo  $localhost_realname  >>  hostfile
3035                         (( ii = ii + 1 ))
3036                      done
3037                   fi
3038                   export MP_HOSTFILE=hostfile
3039                   if [[ $run_coupled_model = false ]]
3040                   then
3041                      if [[ "$ocean_file_appendix" = true ]]
3042                      then
3043                         echo "precursor_ocean"  >  runfile_atmos
3044                      else
3045                         echo "precursor_atmos"  >  runfile_atmos
3046                      fi
3047                   else
3048                      (( iia = $numprocs_atmos / $threads_per_task ))
3049                      (( iio = $numprocs_ocean / $threads_per_task ))
3050                      printf "\n      coupled run ($iia atmosphere, $iio ocean)"
3051                      printf "\n      using $coupled_mode coupling"
3052                      printf "\n\n"
3053                      echo "coupled_run $iia $iio"  >  runfile_atmos
3054                   fi
3055                   ./a.out  -procs $tasks_per_node  $ROPTS  <  runfile_atmos
3056
3057                else
3058                   if [[ "$host_file" = "" ]]
3059                   then
3060                      printf "\n  +++ no hostfile given in configuration file"
3061                      locat=config_file
3062                      exit
3063                   else
3064                      eval host_file=$host_file
3065                   fi
3066                   export MP_HOSTFILE=$host_file
3067                   poe  a.out  -procs $numprocs  -tasks_per_node $numprocs  $ROPTS
3068                fi
3069             fi
3070          elif [[ $host = nech  ||  $host = necriam ]]
3071          then
3072             (( ii = nodes ))
3073             if [[ $ii = 1 ]]
3074             then
3075                export F_ERRCNT=0        # acceptable number of errors before program is stopped
3076                export MPIPROGINF=YES
3077                #  export F_TRACE=YES|FMT1|FMT2  # output of ftrace informations to job protocol
3078                echo "*** execution on single node with mpirun"
3079                mpirun  -np $numprocs  ./a.out  $ROPTS
3080             else
3081                (( i = 0 ))
3082                while (( i < ii ))
3083                do
3084                   echo "-h $i  -p $tasks_per_node  -e ./mpi_exec_shell"  >>  multinode_config
3085                   (( i = i + 1 ))
3086                done
3087
3088                echo "#!/bin/sh"                         >   mpi_exec_shell
3089                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
3090                echo "set -u"                            >>  mpi_exec_shell
3091                echo "F_ERRCNT=0"                        >>  mpi_exec_shell
3092                echo "MPIPROGINV=YES"                    >>  mpi_exec_shell
3093                echo "OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task" >>  mpi_exec_shell
3094                echo "cpurest=$cpurest"                  >>  mpi_exec_shell
3095                echo "fname=$fname"                      >>  mpi_exec_shell
3096                echo "localhost=$localhost"              >>  mpi_exec_shell
3097                echo "return_addres=$return_addres"      >>  mpi_exec_shell
3098                echo "return_username=$return_username"  >>  mpi_exec_shell
3099                echo "tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  mpi_exec_shell
3100                echo "write_binary=$write_binary"        >>  mpi_exec_shell
3101                echo "use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
3102                echo "  "                                >>  mpi_exec_shell
3103                echo "export F_ERRCNT"                   >>  mpi_exec_shell
3104                echo "export MPIPROGINV"                 >>  mpi_exec_shell
3105                echo "export OMP_NUM_THREADS"            >>  mpi_exec_shell
3106                echo "export cpurest"                    >>  mpi_exec_shell
3107                echo "export fname"                      >>  mpi_exec_shell
3108                echo "export localhost"                  >>  mpi_exec_shell
3109                echo "export return_addres"              >>  mpi_exec_shell
3110                echo "export return_username"            >>  mpi_exec_shell
3111                echo "export tasks_per_node"             >>  mpi_exec_shell
3112                echo "export write_binary"               >>  mpi_exec_shell
3113                echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
3114                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
3115                echo "exec  ./a.out"                     >>  mpi_exec_shell
3116
3117                chmod u+x  mpi_exec_shell
3118                export MPIPROGINF=YES
3119                mpirun  -f multinode_config  &
3120                wait
3121
3122             fi
3123          elif [[ $(echo $host | cut -c1-2) = lc  &&  $host != lctit ]]
3124          then
3125
3126                # COPY HOSTFILE FROM SOURCE DIRECTORY OR CREATE IT, IF IT
3127                # DOES NOT EXIST
3128             if [[ $host != lcsgih  &&  $host != lcsgib ]]
3129             then
3130                if [[ -f $hostfile ]]
3131                then
3132                   cp  $hostfile  hostfile
3133                else
3134                   (( ii = 1 ))
3135                   while (( ii <= $numprocs / $threads_per_task ))
3136                   do
3137                      echo  $localhost_realname  >>  hostfile
3138                      (( ii = ii + 1 ))
3139                   done
3140                fi
3141                eval zeile=\"`head -n $ii  hostfile`\"
3142                printf "\n  *** running on: $zeile"
3143             fi
3144
3145             (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
3146             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
3147#             echo "OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"
3148             if [[ $threads_per_task != 1 ]]
3149             then
3150                printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
3151             fi
3152             if [[ $run_coupled_model = false ]]
3153             then
3154                if [[ "$ocean_file_appendix" = true ]]
3155                then
3156                   echo "precursor_ocean"  >  runfile_atmos
3157                else
3158                   echo "precursor_atmos"  >  runfile_atmos
3159                fi
3160                printf "\n\n"
3161                if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
3162                then
3163                   if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
3164                   then
3165#                      export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
3166                          # MPI_DSM_DISTRIBUTE not necessary when MPI_DSM_CPULIST is set
3167                          # export MPI_DSM_DISTRIBUTE=1
3168                          # MPI_DSM_CPULIST: pin MPI processes to cores
3169                       export MPI_DSM_CPULIST="0,1,4,5,2,3,6,7:allhosts"
3170                          # MPI_IB_RAILS: use both IB rails on ICE2
3171                      export MPI_BUFS_PER_HOST=512
3172                      export MPI_IB_RAILS=2
3173                      mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
3174                   elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
3175                   then
3176#                      ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
3177#                      export MV2_NUM_PORTS=2
3178#                      export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
3179                      mpiexec -np $ii  ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
3180                   fi
3181                elif [[ $host = lcxt4 ]]
3182                then
3183                   aprun  -n $ii  -N $tasks_per_node  a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
3184                else
3185                   mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  < runfile_atmos  $ROPTS
3186                fi
3187             else
3188
3189                    # currently there is no full MPI-2 support on ICE and XT4
3190                (( iia = $numprocs_atmos / $threads_per_task ))
3191                (( iio = $numprocs_ocean / $threads_per_task ))
3192                printf "\n      coupled run ($iia atmosphere, $iio ocean)"
3193                printf "\n      using $coupled_mode coupling"
3194                printf "\n\n"
3195
3196                if [[ $coupled_mode = "mpi2" ]]
3197                then
3198                   echo "atmosphere_to_ocean $iia $iio"  >  runfile_atmos
3199                   echo "ocean_to_atmosphere $iia $iio"  >  runfile_ocean
3200                   if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
3201                   then
3202
3203                      if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
3204                      then
3205#                         export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
3206                         mpiexec_mpt -np $iia  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
3207                         mpiexec_mpt -np $iio  ./a.out  $ROPTS < runfile_ocean &
3208                      elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
3209                      then
3210#                         ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
3211#                         export MV2_NUM_PORTS=2
3212#                         export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
3213                         mpiexec -n $iia  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
3214                         mpiexec -n $iio  ./a.out  $ROPTS < runfile_ocean &
3215                      fi
3216
3217                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
3218                   then
3219
3220                      aprun  -n $iia  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS  &
3221                      aprun  -n $iio  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_ocean  $ROPTS  &
3222
3223                   else
3224                          # WORKAROUND BECAUSE mpiexec WITH -env option IS NOT AVAILABLE ON SOME SYSTEMS
3225                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iia  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos &
3226                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iio  a.out  $ROPTS  <  runfile_ocean &
3227#                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iia  -env coupling_mode atmosphere_to_ocean  a.out  $ROPTS  &
3228#                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iio  -env coupling_mode ocean_to_atmosphere  a.out  $ROPTS  &
3229                   fi
3230                   wait
3231
3232                else
3233
3234                   echo "coupled_run $iia $iio"  >  runfile_atmos
3235                   if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
3236                   then
3237
3238                      if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
3239                      then
3240#                         export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
3241                         mpiexec_mpt -np $ii  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos
3242                      elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
3243                      then
3244#                         ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
3245#                         export MV2_NUM_PORTS=2
3246#                         export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
3247                         mpiexec  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos
3248                      fi
3249
3250                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
3251                   then
3252
3253                      aprun  -n $ii  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS
3254
3255                   elif [[ $host = lck ]]
3256                   then
3257                         mpiexec -n $ii  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
3258                   fi
3259                   wait
3260                fi
3261
3262#             if [[ $scirocco = true ]]
3263#             then
3264#                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS
3265#             else
3266#                mpirun  -machinefile hostfile  -np $ii  a.out  $ROPTS
3267#             fi
3268             fi
3269          elif [[ $host = decalpha ]]
3270          then
3271             dmpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
3272          elif [[ $host = lctit ]]
3273          then
3274             export runfile=runfile.$kennung
3275
3276             echo "cd $PWD"                                  >   $runfile
3277             echo "export OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"  >>  $runfile
3278             echo "export cpurest=$cpurest"                  >>  $runfile
3279             echo "export fname=$fname"                      >>  $runfile
3280             echo "export localhost=$localhost"              >>  $runfile
3281             echo "export return_addres=$return_addres"      >>  $runfile
3282             echo "export return_username=$return_username"  >>  $runfile
3283             echo "export tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  $runfile
3284             echo "export write_binary=$write_binary"        >>  $runfile
3285             echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  $runfile
3286             echo "./a.out"                                  >>  $runfile
3287             chmod  u+x  $runfile
3288
3289             if [[ "$QUEUE" = interactive ]]
3290             then
3291                mpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
3292             else
3293                 (( mem_tsubame = $memory / 1024.0 ))
3294                 echo "Memory for Tsubame for each process in GB:", $mem_tsubame
3295#                n1ge  -fore  -g 1S060156  -mpi $numprocs  -mem 4  -N palm  -q $queue  a.out  $ROPTS
3296#               /n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge -fore -g $group_number -mpi ${numprocs}:$tasks_per_node -mem $mem_tsubame -N palm -rt $minuten -q $queue  a.out  $ROPTS
3297                 n1ge -fore -g $group_number -mpi ${numprocs}:$tasks_per_node -mem $mem_tsubame -N palm -rt $minuten -q $queue  a.out  $ROPTS
3298             fi
3299
3300             rm  $runfile
3301          else
3302             mpprun  -n $numprocs  a.out  $ROPTS
3303          fi
3304          [[ $? != 0 ]]  &&  execution_error=true
3305
3306
3307             # PERFORMANCE-AUSWERTUNG MIT APPRENTICE
3308          if [[ "$cond1" = apprentice  ||  "$cond2" = apprentice ]]
3309          then
3310             apprentice
3311          fi
3312       else
3313          a.out  $ROPTS
3314       fi
3315    fi
3316    if [[ $? != 0  ||  $execution_error = true ]]
3317    then
3318
3319          # ABBRUCH BEI LAUFZEITFEHLER
3320#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
3321       printf "\n  +++ runtime error occured"
3322       locat=execution
3323       exit
3324    else
3325#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
3326       printf "\n$striche\n  *** execution finished \n"
3327
3328          # Stop the dvr streaming server and process the dvr output in order
3329          # to create dvrs- and html-files containing all streams
3330       if [[ "$dvrserver_id" != "" ]]
3331       then
3332          kill $dvrserver_id
3333          printf "\n  *** dvr server with id=$dvrserver_id has been stopped"
3334
3335             # If there is a directory, data have been output by the
3336             # streaming server. Otherwise, user has chosen dvrp_output=local
3337          if [[ -d DATA_DVR ]]
3338          then
3339
3340                # Add the current dvr configuration file to the dvr output
3341                # directory
3342             cp  .dvrserver.config  DATA_DVR
3343
3344                # Process the dvr output (option -s for also generating
3345                # sequence mode data)
3346             process_dvr_output  -d DATA_DVR  -f $fname  -s
3347
3348          else
3349
3350                # Process the local output
3351             process_dvr_output  -l  -d DATA_DVR  -f $fname
3352
3353          fi
3354
3355       elif [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
3356       then
3357
3358             # Process dvr output generated in local mode (dvrp_output=local)
3359          process_dvr_output  -l  -d DATA_DVR  -f $fname
3360
3361       fi
3362    fi
3363
3364
3365
3366       # EVENTUELLE OUTPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
3367    (( i = 0 ))
3368    while (( i < ioc ))
3369    do
3370       (( i = i + 1 ))
3371       if (( i == 1 ))
3372       then
3373          printf "\n\n  *** execution of OUTPUT-commands:\n$striche"
3374       fi
3375       printf "\n  >>> ${out_command[$i]}"
3376       eval  ${out_command[$i]}
3377       if (( i == ioc ))
3378       then
3379          printf "\n$striche\n"
3380       fi
3381    done
3382
3383
3384       # EVTL. INHALT DES AKTUELLEN VERZEICHNISSES AUSGEBEN
3385    if [[ $do_trace = true ]]
3386    then
3387       printf "\n\n"
3388       ls -al
3389    fi
3390
3391
3392
3393       # OUTPUT-DATEIEN AN IHRE ZIELORTE KOPIEREN
3394    (( i = 0 ))
3395    while (( i < iout ))
3396    do
3397       (( i = i + 1 ))
3398       if (( i == 1 ))
3399       then
3400          printf "\n\n  *** saving OUTPUT-files:\n$striche"
3401       fi
3402
3403          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
3404       files_for_pes=false; filetyp=file
3405       if [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
3406       then
3407          files_for_pes=true; filetyp=directory
3408          actionout[$i]=""
3409       elif [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
3410       then
3411          actionout[$i]=""
3412       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
3413       then
3414          files_for_pes=true; filetyp=directory
3415          actionout[$i]="ar"
3416       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3417       then
3418          actionout[$i]="ar"
3419       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
3420       then
3421          files_for_pes=true; filetyp=directory
3422          actionout[$i]="fl"
3423       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3424       then
3425          actionout[$i]="fl"
3426       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  -n $numprocs ]]
3427       then
3428          files_for_pes=true; filetyp=directory
3429          actionout[$i]="tr"
3430       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3431       then
3432          actionout[$i]="tr"
3433       fi
3434
3435       if [[ ! -f ${localout[$i]}  &&  $files_for_pes = false ]]
3436       then
3437          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}  does not exist\n"
3438       elif [[ ! -d ${localout[$i]}  &&  $files_for_pes = true ]]
3439       then
3440          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}/....  does not exist\n"
3441       else
3442
3443
3444             # KOPIEREN PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3445             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3446             # REMOTE-RECHNUNGEN
3447          if [[ "${actionout[$i]}" = tr ]]
3448          then
3449             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3450             then
3451                if [[ $files_for_pes = false ]]
3452                then
3453                   cps=""
3454                   cst=""
3455                else
3456                   cps=-c
3457                   cst="/"
3458                fi
3459                if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3460                then
3461
3462                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3463                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3464                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3465                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3466                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3467                   then
3468                      ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3469                   else
3470                      mkdir  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3471                      ln  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3472                   fi
3473
3474                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3475                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3476
3477                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP in seperate job to"
3478                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst"
3479                   printf "\n              or higher cycle\n"
3480                   echo "batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3481
3482                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3483
3484                   if [[ $localhost = nech ]]
3485                   then
3486                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3487                   else
3488                      if [[ "$LOGNAME" = b323013 ]]
3489                      then
3490                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3491                      else
3492                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3493                      fi
3494                   fi
3495
3496                else
3497
3498                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3499                   transfer_failed=false
3500                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP to"
3501                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst\n"
3502                   batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3503                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3504
3505                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3506                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3507                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3508                   then
3509                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3510                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3511
3512                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3513                         # ANLEGEN.
3514                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3515                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3516                      then
3517                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3518                         printf "      $local_catalog \n"
3519                         mkdir -p  $local_catalog
3520                      fi
3521                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3522                      transfer_problems=true
3523                   fi
3524                fi
3525             else
3526
3527                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR KOPIERT WIRD
3528                actionout[$i]=""
3529             fi
3530          fi
3531
3532
3533             # APPEND PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3534             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3535             # REMOTE-RECHNUNGEN
3536          if [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
3537          then
3538             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3539             then
3540                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3541                then
3542
3543                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3544                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3545                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3546                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3547                   ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3548
3549                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3550                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3551
3552                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP in seperate job to"
3553                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3554                   printf "\n              or higher cycle\n"
3555                   echo "batch_scp -A -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3556
3557                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3558
3559                   if [[ $localhost = nech ]]
3560                   then
3561                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3562                   else
3563                      if [[ $LOGNAME = b323013 ]]
3564                      then
3565                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3566                      else
3567                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3568                      fi
3569                   fi
3570
3571                else
3572
3573                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3574                   transfer_failed=false
3575                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP to"
3576                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3577                   batch_scp -A -b -m -u $return_username  $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3578                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3579
3580                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3581                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3582                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3583                   then
3584                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3585                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3586
3587                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3588                         # ANLEGEN
3589                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3590                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3591                      then
3592                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3593                         printf "      $local_catalog \n"
3594                         mkdir -p  $local_catalog
3595                      fi
3596
3597                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3598                      transfer_problems=true
3599                   fi
3600                fi
3601             else
3602
3603                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR APPEND AUF
3604                   # LOKALER MASCHINE DURCHGEFUEHRT WIRD
3605                actionout[$i]=a
3606             fi
3607          fi
3608
3609
3610             # OUTPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. DATEI WIRD PER
3611             # LINK AUF DEN TEMPORAEREN DATENKATALOG GELEGT. OPTION -f WIRD
3612             # VERWENDET, FALLS DORT NOCH EINE DATEI GLEICHEN NAMENS VORHANDEN
3613             # SEIN SOLLTE. ANSCHLIESSEND WIRD SEINE ARCHIVIERUNG ANGESTOSSEN
3614          if [[ "${actionout[$i]}" = fl ]]
3615          then
3616             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3617             chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3618             if [[ $files_for_pes = false ]]
3619             then
3620                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3621                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3622                ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3623             else
3624                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/....  to"
3625                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3626                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3627                cd ${localout[$i]}
3628                for file in $(ls *)
3629                do
3630                   ln -f $file $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3631                done
3632                cd $TEMPDIR
3633             fi
3634
3635
3636                # ARCHIVIERUNGSJOB WIRD ERZEUGT UND ABGESCHICKT
3637             if [[ $store_on_archive_system = true ]]
3638             then
3639
3640                if [[ $archive_system = asterix ]]
3641                then
3642                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3643                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3644                   then
3645                      echo "stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3646                   else
3647                      echo "stageout -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3648                   fi
3649                   echo "cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"               >> archive_${frelout[$i]}
3650                   echo "if [[ \$(grep -c \"st.msg:150\"  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung) != 0 ]]" >> archive_${frelout[$i]}
3651                   echo "then"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3652                   echo "   do_stageout=false"                       >> archive_${frelout[$i]}
3653                   echo "else"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3654                   echo "   echo \"  +++ $filetyp ${frelout[$i]}  could not be stored on archive-system\" " >> archive_${frelout[$i]}
3655                   echo "   cat  /dev/null  >  ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname" >> archive_${frelout[$i]}
3656                   echo "   cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung  >  ~/job_queue/archive_${frelout[$i]}_error" >> archive_${frelout[$i]}
3657                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} will be copied to \$WORK as backup\" " >> archive_${frelout[$i]}
3658                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3659                   then
3660                      echo "   cp   ${frelout[$i]}  \$WORK"                    >> archive_${frelout[$i]}
3661                   else
3662                      echo "   cp -r  ${frelout[$i]}  \$WORK/${frelout[$i]}"   >> archive_${frelout[$i]}
3663                   fi
3664                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} saved\" " >> archive_${frelout[$i]}
3665                   echo "fi"                                         >> archive_${frelout[$i]}
3666                   echo "rm  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"              >> archive_${frelout[$i]}
3667                elif [[ $archive_system = DMF ]]
3668                then
3669                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3670                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3671                   then
3672                      printf "\n  +++ archiving of single files impossible with $archive_system !\n"
3673                      locat=DMF
3674                      exit
3675                   else
3676                         # FUER RECHNER IN JUELICH. DORT KOENNTEN AUCH
3677                         # EINZELNE DATEIEN GESICHERT WERDEN (SPAETER KORR.)
3678                      echo "rm -rf  \$ARCHIVE/${frelout[$i]}"     >> archive_${frelout[$i]}
3679                      echo "cp -r  ${frelout[$i]}  \$ARCHIVE"     >> archive_${frelout[$i]}
3680                   fi
3681                elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3682                then
3683                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3684                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3685                   then
3686                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3687                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3688                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3689                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3690                   else
3691
3692                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3693                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3694                      echo "[[ ! -d \$PERM/${frelout[$i]} ]] && mkdir $PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3695                      cd  $tmp_data_catalog
3696                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3697                      cd -  > /dev/null
3698                      (( inode = 0 ))
3699                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3700                      while (( inode < nodes ))
3701                      do
3702#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3703                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3704                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3705#                         echo "*** tasks_per_node = \"$tasks_per_node\" "
3706#                         echo "*** files = \"$files\" "
3707#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3708                         echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3709                         echo "dsmc incremental  \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar" >> archive_${frelout[$i]}
3710                         echo "dsmmigrate \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar"        >> archive_${frelout[$i]}
3711                         (( inode = inode + 1 ))
3712                      done
3713#                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3714#                      echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3715                   fi
3716                elif [[ $archive_system = ut ]]
3717                then
3718                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3719                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3720                   then
3721                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3722                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3723                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3724                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3725                   else
3726
3727                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3728                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3729                      echo "[[ ! -d \$UT/${frelout[$i]} ]] && mkdir $UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3730                      cd  $tmp_data_catalog
3731                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3732                      cd -  > /dev/null
3733                      (( inode = 0 ))
3734                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3735                      while (( inode < nodes ))
3736                      do
3737                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3738                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3739                         echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3740                         (( inode = inode + 1 ))
3741                      done
3742                   fi
3743                elif [[ $archive_system = none ]]
3744                then
3745                   printf "              +++ archiving on $localhost not available!\n"
3746                fi
3747
3748                if [[ $archive_system != none ]]
3749                then
3750                   if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb ]]
3751                   then
3752#                      subjob  -d  -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  -c $job_catalog  archive_${frelout[$i]}
3753                      subjob   -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  -c $job_catalog  archive_${frelout[$i]}
3754                   elif [[ $localhost = nech ]]
3755                   then
3756                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3757                   fi
3758                   printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3759                fi
3760             else
3761                printf "              +++ caution: option -A is switched on. No archiving on $archive_system!\n"
3762             fi
3763
3764
3765                # LEERDATEI IM BENUTZERVERZEICHNIS ANLEGEN, DAMIT BEKANNT IST,
3766                # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3767             if [[ $files_for_pes = false ]]
3768             then
3769                cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3770             else
3771                mkdir -p  ${pathout[$i]}
3772             fi
3773
3774          fi
3775
3776
3777             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE ZUM ARCHIV-SYSTEM
3778             # AUSSERDEM MUSS LEERDATEI ANGELEGT WERDEN, DAMIT BEKANNT IST,
3779             # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3780             # FALLS IRGENDEINE (VON MEHREREN) ARCHIVIERUNGEN SCHIEF GEHT,
3781             # WIRD FLAG GESETZT UND BLEIBT AUCH BEI WEITEREN ORDNUNGS-
3782             # GEMAESSEN ARCHIVIERUNGEN GESETZT
3783          if [[ "${actionout[$i]}" = ar ]]
3784          then
3785             if [[ $files_for_pes = false ]]
3786             then
3787                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3788                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3789                printf "\n              File will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3790             else
3791                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to"
3792                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3793                printf "\n              Directory will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3794             fi
3795             mv  ${localout[$i]}  ${frelout[$i]}
3796
3797             file_saved=false
3798
3799             if [[ $archive_system = asterix ]]
3800             then
3801                do_stageout=true
3802                (( stageout_anz = 0 ))
3803                while [[ $do_stageout = true ]]
3804                do
3805                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3806                   then
3807                      stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3808                   else
3809                      stageout  -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3810                   fi
3811                   cat  STAGE_OUTPUT
3812                   if [[ $(grep -c "st.msg:150"  STAGE_OUTPUT) != 0 ]]
3813                   then
3814                      file_saved=true
3815                      do_stageout=false
3816                   else
3817                      if [[ $files_for_pes = false ]]
3818                      then
3819                         printf "\n  +++ file ${frelout[$i]}  could not be saved on archive-system"
3820                      else
3821                         printf "\n  +++ directory ${frelout[$i]} could not be saved on archive-system"
3822                      fi
3823                      (( stageout_anz = stageout_anz + 1 ))
3824                      if (( stageout_anz == 10 ))
3825                      then
3826                         printf "\n  +++ stoped after 10 unsuccessful tries!"
3827                         archive_save=false
3828                         do_stageout=false
3829                      else
3830                         printf "\n  *** new try to store on archive after 15 min:"
3831                         sleep 900
3832                      fi
3833                   fi
3834                done
3835             elif [[ $archive_system = DMF ]]
3836             then
3837                if [[ $files_for_pes = false ]]
3838                then
3839                   printf "\n  +++ archiving of single files impossible on $archive_system!\n"
3840                   locat=DMF
3841                   exit
3842                else
3843                   rm -rf  $ARCHIVE/${frelout[$i]}
3844                   cp -r  ${frelout[$i]}  $ARCHIVE
3845                fi
3846                file_saved=true
3847             elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3848             then
3849                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3850                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3851                   # GELEGT WERDEN
3852                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3853                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3854                if [[ $files_for_pes = false ]]
3855                then
3856                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3857                else
3858                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3859                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3860                fi
3861
3862                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3863                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3864                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3865                if [[ $files_for_pes = false ]]
3866                then
3867                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3868                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3869                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3870                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3871                else
3872                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3873                   echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3874                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3875                fi
3876
3877                subjob  -v  -d  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  -c $job_catalog  archive_${frelout[$i]}
3878                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3879                file_saved=true
3880
3881             elif [[ $archive_system = ut ]]
3882             then
3883                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3884                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3885                   # GELEGT WERDEN
3886                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3887                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3888                if [[ $files_for_pes = false ]]
3889                then
3890                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3891                else
3892                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3893                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3894                fi
3895
3896                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3897                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3898                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3899                if [[ $files_for_pes = false ]]
3900                then
3901                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3902                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3903                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3904                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3905                else
3906                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3907                   echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3908                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3909                fi
3910
3911                subjob  -v  -c /pf/b/$usern/job_queue  -d  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3912                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3913                file_saved=true
3914
3915             else
3916                printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"  archiving impossible!"
3917                archive_save=false
3918             fi
3919             if [[ $file_saved = true ]]
3920             then
3921                if [[ $files_for_pes = false ]]
3922                then
3923                   cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3924                else
3925                   mkdir -p  ${pathout[$i]}
3926                fi
3927             fi
3928          fi
3929
3930             # APPEND AUF LOKALER MASCHINE
3931          if [[ "${actionout[$i]}" = "a" ]]
3932          then
3933             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append to  ${pathout[$i]}\n"
3934             cat  ${localout[$i]}  >>  ${pathout[$i]}
3935          fi
3936
3937             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE
3938             # ES MUSS KOPIERT WERDEN, DA MOVE NICHT UEBER FILESYSTEM HINAUS MOEGLICH
3939          if [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = false ]]
3940          then
3941
3942                # KOPIEREN AUF EINPROZESSORMASCHINE
3943             if [[ "${extout[$i]}" != " "  &&  "${extout[$i]}" != "" ]]
3944             then
3945                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}\n"
3946                if [[ $link_local_output = true ]]
3947                then
3948                    printf "      using ln -f\n"
3949                    ln -f  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3950                fi
3951                # If "ln -f" fails of if "$link_local_output = false" do a normal "cp"
3952                if [[ ! -f "${pathout[$i]}.${extout[$i]}" ]]
3953                then
3954                    if [[ $link_local_output = true ]]
3955                    then
3956                        printf "      ln failed, using cp...\n"
3957                    fi
3958                    cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3959                fi
3960             else
3961                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}\n"
3962                if [[ $link_local_output = true ]]
3963                then
3964                    printf "      using ln -f\n"
3965                    ln -f  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3966                fi
3967                # If "ln -f" fails of if "$link_local_output = false" do a normal "cp"
3968                if [[ ! -f "${pathout[$i]}" ]]
3969                then
3970                    if [[ $link_local_output = true ]]
3971                    then
3972                        printf "      ln failed, using cp...\n"
3973                    fi
3974                    cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3975                fi
3976             fi
3977
3978          elif [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = true ]]
3979          then
3980
3981                # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
3982                # DATEIEN WERDEN ERST IN EINEM KATALOG GESAMMELT UND DIESER
3983                # WIRD DANN KOPIERT
3984                # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
3985             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to  ${pathout[$i]}\n"
3986             if [[ $link_local_output = true ]]
3987             then
3988                 printf "      using ln -f\n"
3989                 mkdir  ${pathout[$i]}
3990                 cd ${localout[$i]}
3991                 for file in $(ls *)
3992                 do
3993                   ln -f $file  ${pathout[$i]}
3994                 done
3995                 cd $TEMPDIR
3996             fi
3997             # If "ln -f" fails of if "$link_local_output = false" do a normal "cp -r"
3998             if [[ ! -f "${pathout[$i]}/_0000" ]]
3999             then
4000                 if [[ $link_local_output = true ]]
4001                 then
4002                     printf "      ln failed for .../_0000, using cp...\n"
4003                 fi
4004                 cp -r  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
4005             fi
4006
4007          fi
4008       fi
4009    done
4010    if (( i != 0 ))
4011    then
4012       if [[ $transfer_problems = true ]]
4013       then
4014          printf "\n$striche\n  *** OUTPUT-files saved"
4015          printf "\n  +++ WARNING: some data transfers failed! \n"
4016       else
4017          printf "\n$striche\n  *** all OUTPUT-files saved \n"
4018       fi
4019    fi
4020
4021
4022       # EVENTUELL FOLGEJOB STARTEN
4023       # DATEI CONTINUE_RUN MUSS VOM BENUTZERPROGRAMM AUS ERZEUGT WERDEN
4024    if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
4025    then
4026
4027       if [[ $archive_save = true ]]
4028       then
4029
4030             # ZUERST IN MRUN-AUFRUF OPTIONEN FUER FORTSETZUNGSLAUF, FUER
4031             # STILLES ABARBEITEN (OHNE INTERAKTIVE RUECKFAGEN) UND FUER
4032             # BATCH-BETRIEB (NUR WICHTIG, FALLS BATCH AUF LOKALER MASCHINE
4033             # DURCHGEFUEHRT WERDEN SOLL) EINFUEGEN, FALLS NICHT BEREITS VOR-
4034             # HANDEN
4035          [[ $(echo $mc | grep -c "\-C") = 0 ]]  &&  mc="$mc -C"
4036          [[ $(echo $mc | grep -c "\-v") = 0 ]]  &&  mc="$mc -v"
4037          [[ $(echo $mc | grep -c "\-b") = 0 ]]  &&  mc="$mc -b"
4038          if [[ $(echo $mc | grep -c "#") != 0 ]]
4039          then
4040             mc=`echo $mc | sed 's/#/f/g'`
4041          fi
4042
4043
4044             # JOB STARTEN
4045          printf "\n\n  *** initiating restart-run on \"$return_addres\" using command:\n"
4046          echo "      $mc"
4047          printf "\n$striche\n"
4048          if [[ $localhost != $fromhost ]]
4049          then
4050
4051             if [[ $localhost = lcsgih  ||  $localhost = lcsgib  ||  $localhost = nech  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms  ||  $localhost = lctit ]]
4052             then
4053                echo "*** ssh will be used to initiate restart-runs!"
4054                echo "    return_addres=\"$return_addres\" "
4055                echo "    return_username=\"$return_username\" "
4056                if [[ $return_addres = 172.20.25.41 ]]
4057                then
4058                      # WORKAROUND AUF SCIROCCO AM TIT
4059                   print  "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "  |  ssh $return_addres -l $return_username 
4060                else
4061                   ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "
4062                fi
4063             else
4064                printf "\n  +++ no restart mechanism available for host \"$localhost\" "
4065                locat=restart; exit
4066             fi
4067
4068                # WARTEN, DAMIT SICH RESTART JOB IN QUEUE EINREIHEN KANN, BEVOR
4069                # DER AKTUELLE JOB ENDET
4070             sleep 30
4071
4072          else
4073
4074                # BEI RECHNUNGEN AUF LOKALER MASCHINE KANN MRUN DIREKT AUFGE-
4075                # RUFEN WERDEN, AUSSER AUF lcfimm
4076             cd $LOCAL_PWD
4077             if [[ $localhost = lcfimm ]]
4078             then
4079                ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc " 
4080             else
4081                eval  $mc                # ' MUESSEN AUSGEWERTET WERDEN
4082             fi
4083             cd -  > /dev/null
4084          fi
4085          printf "\n$striche\n  *** restart-run initiated \n"
4086
4087
4088             # EVENTUELL INPUT-DATEIEN, DIE VON TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS
4089             # GEHOLT WORDEN SIND, LOESCHEN
4090          (( i = 0 ))
4091          while (( i < iin ))
4092          do
4093             (( i = i + 1 ))
4094             if [[ "${got_tmp[$i]}" = true   &&  $keep_data_from_previous_run = false ]]
4095             then
4096                rm -r  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
4097             fi
4098          done
4099
4100       else
4101
4102          printf "\n  +++ no restart-run possible, since errors occured"
4103          printf "\n      during the archive process"
4104       fi
4105
4106    fi
4107
4108
4109   
4110       # EVTL. EMAIL-BENACHRICHTIGUNG UEBER ABGESCHLOSSENEN LAUF
4111    if [[ "$email_notification" != "none" ]]
4112    then
4113
4114       if [[ $localhost != $fromhost ]]
4115       then
4116          if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
4117          then
4118             echo "PALM restart run necessary"        >   email_text
4119             echo "description header of actual run:" >>  email_text
4120             cat  CONTINUE_RUN                        >>  email_text
4121             echo "mrun-command to restart:"          >>  email_text
4122             echo "$mc"                               >>  email_text
4123          else
4124             echo "PALM run with base filename \"$fname\" on host \"$localhost\" finished"  >  email_text
4125          fi
4126          mail  $email_notification  <  email_text
4127          printf "\n  *** email notification sent to \"$email_notification\" "
4128       fi
4129    fi
4130
4131
4132
4133       # ALLE ARBEITEN BEENDET. TEMPORAERER KATALOG KANN GELOESCHT WERDEN
4134    cd  $HOME
4135    [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
4136
4137 else
4138
4139
4140       # FALLS AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
4141       # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
4142
4143       # MRUN-BEFEHL FUER REMOTE-MASCHINE ZUSAMMENSTELLEN
4144    mrun_com="$mrun_script_name -a $afname -c $config_file -d $fname -h $host -H $fromhost -m $memory -t $cpumax -q $queue -R $return_addres -U $return_username -u $remote_username"
4145    [[ "$cpp_opts" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -D \"$cpp_opts\""
4146    [[ "$global_revision" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -G \"$global_revision\""
4147    [[ $group_number != none ]]   &&  mrun_com=${mrun_com}" -g $group_number"
4148    [[ $do_compile = true ]]      &&  mrun_com=${mrun_com}" -s \"$source_list\""
4149    [[ "$input_list" != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -i \"$input_list\""
4150    [[ $ignore_archive_error = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -I"
4151    [[ $keep_data_from_previous_run = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -k"
4152    [[ "$additional_conditions" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -K \"$additional_conditions\""
4153#    [[ "$makefile" != "$source_path/Makefile" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -M \"$makefile\""
4154    [[ "$output_list" != "" ]]    &&  mrun_com=${mrun_com}" -o \"$output_list\""
4155    [[ "$read_from_config" = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -S"
4156    [[ $do_trace = true ]]        &&  mrun_com=${mrun_com}" -x"
4157    [[ "$numprocs" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -X $numprocs"
4158    if [[ $use_openmp = true ]]
4159    then
4160       mrun_com=${mrun_com}" -O"
4161       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $threads_per_task"
4162    else
4163       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $tasks_per_node"
4164    fi
4165    [[ $store_on_archive_system = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -A"
4166    [[ $package_list != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -p \"$package_list\""
4167    [[ $return_password != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -P $return_password"
4168    [[ $delete_temporary_catalog = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -B"
4169    [[ $node_usage != default  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != novice ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -n $node_usage"
4170    [[ "$ocean_file_appendix" = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -y"
4171    [[ $run_coupled_model = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -Y \"$coupled_dist\""
4172    if [[ $do_remote = true ]]
4173    then
4174       printf "\n>>>> MRUN-command on execution host:\n>>>> $mrun_com \n"
4175    fi
4176
4177
4178       # ZUSAMMENSTELLUNG DES JOBSCRIPTS AUF DATEI jobfile
4179    jobfile=jobfile.$RANDOM
4180
4181
4182       # TEMPORAERES VERZEICHNIS GENERIEREN UND NACH DORT WECHSELN
4183    echo  "mkdir  $TEMPDIR"      >>  $jobfile
4184    echo  "cd  $TEMPDIR"         >>  $jobfile
4185
4186
4187       # EVENTUELL FEHLERVERFOLGUNG AKTIVIEREN
4188    if [[ $do_trace = true ]]
4189    then
4190       echo  "set -x"                                    >>  $jobfile
4191    else
4192       echo  "set +vx"                                   >>  $jobfile
4193    fi
4194
4195
4196       # BEREITSTELLUNG VON QUELLTEXTEN, MRUN-SCRIPTS UND KONFIGURATIONS-
4197       # DATEI FUER DEN JOB
4198    if [[ $( echo $host | cut -c1-5 ) = lcsgi ]]
4199    then
4200
4201          # KONFIGURATIONSDATEI UND MRUN_SCRIPT IN DAS SOURCE-VERZEICHNIS
4202          # KOPIEREN
4203       if [[ $restart_run != true ]]
4204       then
4205          cp  $config_file  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
4206          cp  ${PALM_BIN}/$mrun_script_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
4207       fi
4208
4209          # SOURCE-VERZEICHNIS VOM LOKALEN RECHNER PER SCP TRANSFERIEREN
4210       echo  "set -x"  >>  $jobfile
4211       echo  "scp  -r  $return_username@$return_addres:$working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname ."  >>  $jobfile
4212       echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                      >>  $jobfile
4213
4214          # QUELLTEXTE, MRUN-SCRIPT UND KONFIGURATIONSDATEI IN DAS AKTUELLE
4215          # ARBEITSVERZEICHNIS VERSCHIEBEN
4216       echo  "mv  SOURCES_FOR_RUN_$fname/$config_file  . "       >>  $jobfile
4217       echo  "mv  SOURCES_FOR_RUN_$fname/$mrun_script_name  . "  >>  $jobfile
4218       echo  "execute_mrun=true"                                 >>  $jobfile
4219       echo  " "                                                 >>  $jobfile
4220
4221    else
4222
4223          # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL)
4224          # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES
4225       if [[ $do_compile = true ]]
4226       then
4227
4228          source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname
4229
4230              # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN
4231              # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE
4232              # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI)
4233          echo  "mkdir  SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
4234          echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                 >>  $jobfile
4235          echo  "cd     SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
4236
4237          for  filename  in  $source_list
4238          do
4239                # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4240             echo  "cat > $filename << \"%END%\""              >>  $jobfile
4241             cat   $source_catalog/$filename                   >>  $jobfile
4242             echo  " "                                         >>  $jobfile
4243             echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
4244             echo  " "                                         >>  $jobfile
4245          done
4246
4247             # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4248          echo  "cat > Makefile << \"%END%\""               >>  $jobfile
4249          cat   $source_catalog/Makefile                    >>  $jobfile
4250          echo  " "                                         >>  $jobfile
4251          echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
4252          echo  " "                                         >>  $jobfile
4253
4254          echo  "cd -  > /dev/null"                         >>  $jobfile
4255
4256       fi
4257
4258
4259          # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI
4260          # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4261       echo  "cat > $config_file << \"%END%\""      >>  $jobfile
4262       cat   $config_file                           >>  $jobfile
4263       echo  "%END%"                                >>  $jobfile
4264       echo  " "                                    >>  $jobfile
4265
4266
4267          # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION
4268          # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4269       echo  "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\""  >>  $jobfile
4270       cat   ${PALM_BIN}/$mrun_script_name          >>  $jobfile
4271       echo  "%END%"                                >>  $jobfile
4272       if [[ $host = lctit ]]
4273       then
4274          echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >>  $jobfile
4275          echo "mv  mrun_new  $mrun_script_name"    >>  $jobfile
4276       fi
4277       echo  "chmod u+x $mrun_script_name"          >>  $jobfile
4278       echo  "execute_mrun=true"                    >>  $jobfile
4279       echo  " "                                    >>  $jobfile
4280
4281    fi
4282
4283
4284       # EVTL. BENOETIGTE INPUT-DATEIEN PER FTP HOLEN ODER DEM JOB DIREKT
4285       # MITGEBEN UND AUF DEM REMOTE-RECHNER IM BENUTZERVERZEICHNIS ABLEGEN
4286       # FALLS DIESES NICHT EXISTIERT, WIRD VERSUCHT, DAS JEWEILS LETZTE
4287       # UNTERVERZEICHNIS DES PFADNAMENS ANZULEGEN
4288    if [[ $do_remote = true ]]
4289    then
4290       (( i = 0 ))
4291       while (( i < iin ))
4292       do
4293          (( i = i + 1 ))
4294          echo  "[[ ! -d ${pathin[$i]} ]]  &&  mkdir -p  ${pathin[$i]}"  >>  $jobfile
4295          if [[ "${transin[$i]}" = job ]]
4296          then
4297             echo  "cat > ${remotepathin[$i]} <<\"%END%\""    >>  $jobfile
4298             eval cat   ${pathin[$i]}/${frelin[$i]}           >>  $jobfile
4299             echo  " "                                        >>  $jobfile
4300             echo  "%END%"                                    >>  $jobfile
4301          else
4302             echo  "batch_scp -b -o -g -s -u $return_username $return_addres ${remotepathin[$i]} \"${pathin[$i]}\" ${frelin[$i]}" >>  $jobfile
4303          fi
4304
4305             # UEBERPRUEFEN, OB DATEI ANGELEGT WERDEN KONNTE
4306          echo  "if [[ \$? = 1 ]]"                    >>  $jobfile
4307          echo  "then"                                >>  $jobfile
4308          echo  "   echo \" \" "                      >>  $jobfile
4309          echo  "   echo \"+++ file ${remotepathin[$i]} could not be created\" "   >>  $jobfile
4310          echo  "   echo \"    please check, if directory exists on $host!\" "  >>  $jobfile
4311          echo  "   echo \"+++ MRUN will not be continued\" "  >>  $jobfile
4312          echo  "   execute_mrun=false"               >>  $jobfile
4313          echo  "fi"                                  >>  $jobfile
4314       done
4315    fi
4316
4317       # ARBEITSKATALOG AUF DER LOKALEN MASCHINE FUER EVENTUELLE
4318       # FORTSETZUNGSLAUEFE PER ENV-VARIABLE UEBERGEBEN
4319    echo  "LOCAL_PWD=$working_directory"                >>  $jobfile
4320    echo  "export LOCAL_PWD"                            >>  $jobfile
4321
4322       # EBENSO LOKALEN MRUN-KATALOG UEBERGEBEN
4323    echo  "LOCAL_MRUN_PATH=$PALM_BIN"                   >>  $jobfile
4324    echo  "export LOCAL_MRUN_PATH"                      >>  $jobfile
4325
4326       # WORKAROUND FUER RIAM-NEC-JOBS WEGEN PROFILE-SCHWIERIGKEITEN
4327    if [[ $localhost_realname = "gate"  ||  $localhost = lctit ]]
4328    then
4329       echo  "export PALM_BIN=$PALM_BIN"                >>  $jobfile
4330    fi
4331
4332       # MRUN AUF ZIELRECHNER AUFRUFEN
4333    echo  "set -x"                                      >>  $jobfile
4334    echo  "[[ \$execute_mrun = true ]]  &&  ./$mrun_com"  >>  $jobfile
4335
4336    echo  'ls -al; echo `pwd`'                          >>  $jobfile
4337    echo  "cd \$HOME"                                   >>  $jobfile
4338    echo  "rm -rf  $TEMPDIR"                            >>  $jobfile
4339
4340
4341
4342
4343       # JOB PER SUBJOB STARTEN
4344    if [[ $silent = false ]]
4345    then
4346       printf "\n     "
4347    else
4348       printf "\n\n"
4349    fi
4350
4351    subjob  $job_on_file  -h $host  -u $remote_username -g $group_number -q $queue  -m $memory  -N $node_usage -t $cpumax  $XOPT  $TOPT  $OOPT  -n $fname  -v  -c $job_catalog  -e $email_notification  $jobfile
4352    rm -rf  $jobfile
4353
4354
4355 fi  # ENDE REMOTE-TEIL
4356
4357
4358
4359     # ENDE DER PROZEDUR
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.