source: palm/trunk/SCRIPTS/mrun @ 243

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usage of totalview debugger implemented in mrun

  • Property svn:keywords set to Id Rev
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Line 
1#!/bin/ksh
2# mrun - Plot-Shellskript
3# $Id: mrun 223 2009-01-13 16:31:47Z letzel $
4
5     # Prozedur zum Starten von Modellaeufen
6
7     # letzte Aenderung:
8     # 03/03/94 - Siggi - Entwicklungsbeginn
9     # 21/03/94 - Siggi - Entwicklungsabschluss (Version 1.0)
10     # 09/12/94 - Siggi - allexport unterbunden; statt dessen werden jetzt ein-
11     #                    zelne Variable exportiert. Dies ist noetig, weil an-
12     #                    sonsten irgendein Speicher ueberlaeuft und von mrun
13     #                    aufgerufene Programme (z.B. stageout) mit Fehlern
14     #                    abbrechen (too many arguments)
15     # 20/06/95 - Siggi - noclobber muss explizit abgeschaltet, da jetzt
16     #                    defaultmaessig im RRZN-Profile eingeschaltet
17     # 10/06/97 - Siggi - Zusaetzliche Option -C bei cpp, damit // nicht
18     #                    wegfallen
19     # 25/04/00 - Siggi - Version 1.5
20     #                    remote_addres und remote_user in return_addres bzw.
21     #                    return_username umbenannt, return_username wird dem
22     #                    mrun-Aufruf im Job ueber Option -U mitgegeben.
23     #                    Neue Variable remote_username, die beim interaktiven
24     #                    mrun-Aufruf zwingend ueber die neue Option -u oder
25     #                    in der Konfigurationsdatei angegeben werden muss.
26     # 08/02/01 - Siggi - Alle mrun-Meldungen ins englische uebersetzt,
27     #                    Version 1.7
28     # 05/05/02 - Siggi - Uebersetzungen mittels make-Mechanismus moeglich
29     # 21/11/02 - Siggi - ENV-Variable XLFRTEOPTS wird vor Ausfuehrung auf
30     #                    IBM gesetzt, um Record-Laenge der NAMELIST-Dateien,
31     #                    zu bestimmen; Praeprozessoroptionen haben nun alle
32     #                    die Form -Dtext=text, weil auf IBM sonst text durch
33     #                    die leere Zeichenkette ersetzt wird
34     # 01/08/03 - Siggi  - Test of implementing dvrp+1PE on ibm
35     # 07/01/04 - Siggi  - additional preprocessor directive for ibm included
36     #                     (-D$OMP=OMP) in order to avoid problems with
37     #                     OMP_NUM_THREADS
38     # 04/01/05 - Siggi  - archiving on hanni and berni is done in separate
39     #                     tar files, one for each node used
40     # 07/01/04 - Siggi  - old code for t3e, vpp and hpcs eliminated
41     # 09/01/05 - Siggi  - workaround for getting the IP address on gfdl3
42     # 17/01/05 - Siggi  - job for data transfer to local machine now within
43     #                     job class c1 (HLRN)
44     # 27/01/05 - Siggi  - IP address workaround for gfdl3 removed
45     # 28/01/05 - Siggi  - tar-filenames on $PERM (HLRN) now include the
46     #                     base filename and cycle number
47     # 16/02/05 - Gerald - hababai validated
48     # 14/03/05 - Siggi  - abort on NEC after first runtime error (F_ERRCNT)
49     # 29/03/05 - Marcus - berni*-en0 validated
50     # 21/04/05 - Siggi  - transfer-job-protocol for avs-data is no more stored
51     # 24/04/05 - Siggi  - netcdf support on lcmuk
52     # 25/04/05 - Siggi  - netcdf support on gfld3 (decalpha)
53     # 11/05/05 - Siggi  - files with non-numeric extensions (.xxx after cycle
54     #                     number) can now be used within interactive runs
55     # 12/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibm
56     # 13/05/05 - Siggi  - error in tar-filenames on $PERM (HLRN) removed
57     # 18/05/05 - Siggi  - netcdf support on nec
58     # 24/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibms
59     # 14/06/05 - Siggi  - sleep interval after submit of restart job increased
60     #                     to 30 seconds
61     # 28/06/05 - Siggi  - bora adjusted to new intel compiler (LD_LIBRARY_
62     #                     PATH is temporarily set)
63     # 07/09/05 - Siggi  - setting of MP_EAGER_LIMIT switched off because it
64     #                     caused warnings in the job protocol
65     # 20/10/05 - Siggi  - update of netcdf-version on decalpha (gfdl3)
66     # 25/10/05 - Siggi  - error in listing files for getting the cycle number
67     #                     removed
68     # 26/10/05 - Siggi  - new paths for dvrp-library, transfer of catalogs
69     #                     realized by file attribute trpe
70     # 28/10/05 - Siggi  - if existing, the file extension is output in case
71     #                     of missing input file - no job abort in case of
72     #                     missing input files with file extensions
73     #                     (preliminary solution)
74     # 31/10/05 - Siggi  - data transfer from nech now within seperate job
75     # 04/11/05 - Siggi  - netcdf 3.6.0-p1 on ibmh/ibmb
76     # 07/12/05 - Siggi  - gallego and elephanta admitted
77     # 30/12/05 - Siggi  - gfdl5 (ibmy) admitted
78     # 10/01/06 - Siggi  - cpp directive for NetCDF 64bit support
79     # 20/01/06 - Siggi  - cpp directive for ibmy
80     # 09/02/06 - Siggi  - ibmy admitted for batch mode
81     # 13/04/06 - Siggi  - ostria admitted
82     # 18/04/06 - Siggi  - usage of OpenMP implemented (additional option -O)
83     # 10/05/06 - Siggi  - environment variable XLSMPOPTS set on IBM for
84     #                     optimization of OpenMP runs (option stacksize is
85     #                     necessary for large gridpoint numbers because
86     #                     otherwise a segmentation fault occurs)
87     # 23/05/05 - Siggi  - lctit (SUN Fire X4600) admitted
88     # 21/08/06 - Siggi  - standard mrun path on scirocco is as on bora
89     # 23/08/06 - Siggi  - netcdf support for scirocco (notebook)
90     # 20/09/06 - Marcus - add DVRP library on nech
91     # 24/10/06 - Siggi  - Environment variables for PALM steering are written
92     #                     on local NAMELIST file ENVPAR
93     # 24/11/06 - Siggi  - levanto admitted, maestro switched to ifc 9.1
94     # 28/11/06 - Siggi  - call to interpret_config.x_levanto because of SuSe 10
95     # 06/02/07 - Siggi  - add DVRP library on lcmuk
96     # 07/02/07 - Siggi  - revision of source code handling, source code is
97     #                     now expected in directory given by source_path and
98     #                     not in the current working directory, source code
99     #                     files provided in add_source_path are allways
100     #                     compiled, source code to be compiled is allways
101     #                     sampled in SOURCES_FOR_RUN_$fname which is a
102     #                     subdirectory of the current working directory,
103     #                     -s TEST  changed to  -s WRITE_PERMIT  or -s WP,
104     #                     adapted for RIAM (neck)
105     #                     bugfix for cycle number of output file (extout)
106     #                     all hpmuk-related code removed
107     # 14/02/07 - Siggi  - dvrp support for neck added
108     # 28/02/07 - Siggi  - empty lines in configuration file are accepted
109     #                     mrun_path replaced by PALM_BIN,
110     #                     all machines are calling interpret_config.x
111     # 14/03/07 - Siggi  - fimm admitted, revision number added to terminal
112     #                     output
113     # 16/03/07 - Siggi  - adjustments for lctit
114     # 29/03/07 - Siggi  - global revision transfered to batch job by new
115     #                     option -G
116     # 30/03/07 - Siggi  - compilation "by hand" removed, cpp-directives/options
117     #                     + netcdf/dvrp-options are read from configuration
118     #                     file, host identifier (local_host) is read from
119     #                     config file, code related to ftp filetransfer
120     #                     removed (incl. option -f)
121     # 19/06/07 - Siggi  - time limit for cdata jobs increased
122     # 25/07/07 - Siggi  - two sets of executables can be started on lcmuk,
123     #                     if new option -Y (coupling) is given,
124     #                     output of executables to aout_output removed,
125     #                     messages are immediately written to stdout instead
126     # 03/08/07 - Marcus - add XOPT="-X $numprocs" for lcfimm
127     # 09/08/07 - Marcus - workaround on lcfimm to propagate environment
128     #                     variables out to the nodes in coupled mode -disabled-
129     # 13/08/07 - Marcus - start local restart jobs per ssh on lcfimm
130     # 28/08/07 - Marcus - completely remove workaround on lcfimm to propagate
131     #                     environment variables out to the nodes in coupled mode
132     # 15/10/07 - Siggi  - Preliminary adjustments for lctit, based on Jin's
133     #                     suggestions
134     # 19/10/07 - Marcus - further adjustments for lctit: add new optional
135     #                     argument -g group_number, admit all sla* node_usage
136     #                     queues
137     # 30/10/07 - Marcus - further adjustments for queues on lctit
138     # 14/02/08 - Bjoern - link of restart files with long file name possible
139     # 28/02/08 - Marcus - If environment variable link_local_output is set to
140     #                     true, mrun tries "ln -f" on local output and resorts
141     #                     to "cp" or "cp -r" on error
142     # 15/04/08 - Siggi  - argument -c introduced to most of the subjob calls,
143     #                     which allows the user to choose his own job catalog
144     #                     by setting job_catalog in the configuration file
145     #                     (default is ~/job_queue),
146     #                     workaround for mpiexec with -env option,
147     #                     adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
148     #                     Science)
149     # 22/05/08 - Marcus - If environment variable link_local_input is set to
150     #                     true, mrun tries "ln -f" on local input and resorts
151     #                     to "cp" or "cp -r" on error
152     # 27/05/08 - Siggi  - PATH is set to PALM_BIN everywhere (missing so far)
153     # 14/07/08 - Siggi  - adjustments for lcsgih
154     # 08/08/08 - Marcus - typo removed in lcxt4 branch
155     # 17/09/08 - Siggi  - restart mechanism adjusted for lcsgi
156     # 02/10/08 - BjornM - argument "-Y" modified, adjustments for coupled runs
157     # 21/10/08 - Siggi  - bugfix for the case that -K has more than one
158     #                     argument
159     # 08/11/08 - Siggi  - bugfix for depository path settings in configuration
160     #                     file
161     # 11/11/08 - Siggi  - rules for using user code files changed: user
162     #                     code splitted into one file per subroutine,
163     #                     user can provide his/her own makefile, only
164     #                     default source-code filenames are allowed
165     # 14/11/08 - Siggi  - cond1 and cond2 are part of the depository name
166     # 08/01/09 - Siggi  - mpi module on sgi machines to be used can be set
167     #                     with environment variable mpilib
168     # 13/01/09 - Siggi  - totalview on hice/bice can be used in debug mode
169     #                     using environment variable totalview
170
171
172 
173    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
174
175 set +o allexport    # SICHERHEITSHALBER UNTERBINDEN, DA SONST EVTL. STAGEOUT
176                     # NICHT LAUEFT (TOO MANY ARGUMENTS - PROBLEM)
177 set +o noclobber    # EXISTIERENDE DATEIEN DUERFEN UEBERSCHRIEBEN WERDEN
178
179 AddFilenames=""
180 additional_conditions=""
181 add_source_path=""
182 afname=""
183 archive_save=true
184 archive_system=none
185 compiler_name=""
186 cond1=""
187 cond2="" 
188 config_file=.mrun.config
189 coupled_dist=""
190 coupled_mode="mpi1"
191 cpp_opts=""
192 cpp_options=""
193 cpumax=0
194 cpurest=0
195 delete_temporary_catalog=true
196 do_batch=false
197 do_compile=true
198 do_remote=false
199 do_stagein=true
200 do_stageout=true
201 do_trace=false
202 email_notification=""
203 exclude=""
204 executable=""
205 execution_error=false
206 fimm=false
207 fname=test
208 fromhost=""
209 global_revision=""
210 group_number=none
211 host=""
212 host_file=""
213 hp=""
214 ignore_archive_error=false
215 input_list=""
216 interpreted_config_file=""
217 job_catalog="~/job_queue"
218 job_on_file=""
219 keep_data_from_previous_run=false
220 link_local_input=false
221 link_local_output=false
222 localhost_realname=$(hostname)
223 local_compile=false
224 locat=normal
225 mainprog=""
226 makefile=""
227 mc=$0
228 while [[ $(echo $mc | grep -c "/") != 0 ]]
229 do
230    mc=`echo $mc | cut -f2- -d"/"`
231 done
232 module_files=""
233 mrun_script_name=$mc
234 netcdf_inc=""
235 netcdf_lib=""
236 netcdf_support=false
237 node_usage=default
238 numprocs=""
239 numprocs_atmos=0
240 numprocs_ocean=0
241 OOPT=""
242 openmp=false
243 output_list=""
244 package_list=""
245 punkte="..........................................................."
246 queue=none
247 read_from_config=""
248 restart_run=false
249 return_addres=$(nslookup `hostname` 2>&1 | grep "Address:" | tail -1 | awk '{print $2}')
250 if [[ $return_addres = 130.75.105.158 ]]
251 then
252    return_addres=172.20.25.41
253    echo "+++ WARNING: return_addres changed to $return_addres !!!!!"
254 fi
255# if [[ $return_addres = 210.117.65.1 ]]
256# if [[ $(nslookup `hostname` 2>&1 | grep -c 210.117.65.1) = 1 ]]
257# then
258#    [[ $localhost_realname = gfdl3.yonsei.ac.kr ]]  &&  return_addres=165.132.26.56
259# fi
260 return_password=""
261 return_username=$LOGNAME
262 remotecall=false
263 remote_username=""
264 run_coupled_model=false
265 run_mode=""
266 scirocco=false
267 store_on_archive_system=true
268 striche="  ----------------------------------------------------------------------------"
269 silent=false
270 source_list=""
271 source_path=SOURCE
272 tasks_per_node=""
273 threads_per_task=1
274 tmpcreate=false
275 tmp_data_catalog=""
276 transfer_problems=false
277 usern=$LOGNAME
278 working_directory=`pwd`
279 TOPT=""
280 XOPT=""
281 zeit=$( date | cut -c 12-19 )
282
283 typeset -i  iec=0 iic=0 iin=0 ioc=0 iout=0 memory=0 stagein_anz=0 stageout_anz=0
284 typeset -i  cputime i ii iia iii iio icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
285
286 typeset  -R30 calltime
287 typeset  -L20 spalte1
288 typeset  -L40 spalte2
289 typeset  -L60 spalte3
290 typeset  -L35 string1=`date`
291 typeset  -L12 string2=$usern
292 typeset  -L12 string3=$localhost_realname
293 typeset  -L12 string4
294 typeset  -L12 string5
295 typeset  -L30 version="MRUN  2.0 Rev$Rev: 223 $"
296
297
298
299    # EINZELNE VARIABLE FUER HAUPTPROGRAMM EXPORTIEREN
300 export  cpurest fname host localhost return_addres return_username remotecall tasks_per_node
301
302    # FOLGENDE VARIABLEN MUESSEN FUER DIE INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI
303    # EXPORTIERT WERDEN
304 export  afname config_file cpp_opts cpumax do_batch do_trace fname fromhost
305 export  group_number input_list memory numprocs output_list queue run_mode
306
307
308 
309    # FEHLERBEHANDLUNG
310    # BEI EXIT:
311 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
312       if [[ $locat != localhost ]]
313       then
314#          if [[ ! -f ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik ]]
315#          then
316#             cat  >  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik  <<  %STATEND%
317#MRUN-calls on $localhost
318#
319#date and time                      user        localhost   remotehost  termination mrun-command
320#--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
321#%STATEND%
322#             chmod  666  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
323#          fi
324#
325#             # EINTRAG IN DIE STATISTIK-DATEI
326#          string4=$host
327#          string5=$locat
328#          if [[ "$job_on_file" = ""  &&  $locat != control_c  &&  $locat != user_abort ]]
329#          then
330#             if [[ $do_batch = true ]]
331#             then
332#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mrun_com \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
333#             else
334#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mc \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
335#             fi
336#          fi
337          echo " " > /dev/null
338       fi
339
340       if [[ $locat != normal  &&  $locat != control_c  &&  $locat != local_compile ]]
341       then
342
343              # EVENTUELLE ERROR-KOMMANDOS ABARBEITEN
344          (( i = 0 ))
345          while (( i < iec ))
346          do
347             (( i = i + 1 ))
348             printf "\n  *** Execution of ERROR-command:\n"
349             printf "  >>> ${err_command[$i]}\n"
350             eval  ${err_command[$i]}
351          done
352          if [[ -n $interpreted_config_file ]]  then
353             rm -rf  $interpreted_config_file
354          fi
355          if [[ -n .mrun_environment ]]  then
356             rm -rf  .mrun_environment
357          fi
358          if [[ $tmpcreate = true ]]
359          then
360             printf "\n  *** Contents of \"$TEMPDIR\":\n"
361             ls -al; cd
362             [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
363          fi
364          if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
365          then
366             rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
367          fi
368          printf "\n\n+++ MRUN killed \n\n"
369       elif [[ $locat != control_c ]]
370       then
371          printf "\n\n --> all actions finished\n\n"
372          printf "     Bye, bye $usern !!\n\n"
373       fi' exit
374
375
376    # BEI TERMINAL-BREAK:
377 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
378       [[ $tmpcreate = true ]]  &&  (cd; rm -rf $TEMPDIR)
379       if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
380       then
381          rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
382       fi
383       printf "\n+++ MRUN killed by \"^C\" \n\n"
384       locat=control_c
385       exit
386      ' 2
387
388
389    # CHECK IF THE PATH FOR THE PALM BINARIES (SCRIPTS+UTILITY-PROGRAMS) HAS
390    # BEEN SET
391 if [[ "$PALM_BIN" = "" ]]
392 then
393    printf "\n  +++ environment variable PALM_BIN has not been set"
394    printf "\n      please set it to the directory where the PALM scripts are located"
395    locat=palm_bin; exit
396 fi
397 export PATH=$PALM_BIN:$PATH
398
399
400
401    # SHELLSCRIPT-OPTIONEN EINLESEN UND KOMMANDO NEU ZUSAMMENSETZEN, FALLS ES
402    # FUER FOLGEJOBS BENOETIGT WIRD
403 while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:Fg:G:h:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX:Y: option
404 do
405   case  $option  in
406       (a)   afname=$OPTARG;;
407       (A)   store_on_archive_system=false; mc="$mc -A";;
408       (b)   do_batch=true; mc="$mc -b";;
409       (B)   delete_temporary_catalog=false; mc="$mc -B";;
410       (c)   config_file=$OPTARG; mc="$mc -c$OPTARG";;
411       (C)   restart_run=true; mc="$mc -C";;
412       (d)   fname=$OPTARG; mc="$mc -d$OPTARG";;
413       (D)   cpp_opts="$cpp_opts $OPTARG"; mc="$mc -D'$OPTARG'";;
414       (F)   job_on_file="-D"; mc="$mc -F";;
415       (g)   group_number=$OPTARG; mc="$mc -g$OPTARG";;
416       (G)   global_revision=$OPTARG; mc="$mc -G'$OPTARG'";;
417       (h)   host=$OPTARG; mc="$mc -h$OPTARG";;
418       (H)   fromhost=$OPTARG; mc="$mc -H$OPTARG";;
419       (i)   input_list=$OPTARG; mc="$mc -i'$OPTARG'";;
420       (I)   ignore_archive_error=true; mc="$mc -I";;
421       (k)   keep_data_from_previous_run=true; mc="$mc -k";;
422       (K)   additional_conditions="$OPTARG"; mc="$mc -K'$OPTARG'";;
423       (m)   memory=$OPTARG; mc="$mc -m$OPTARG";;
424       (M)   makefile=$OPTARG; mc="$mc -M$OPTARG";;
425       (n)   node_usage=$OPTARG; mc="$mc -n$OPTARG";; 
426       (o)   output_list=$OPTARG; mc="$mc -o'$OPTARG'";;
427       (O)   use_openmp=true; mc="$mc -O";;
428       (p)   package_list=$OPTARG; mc="$mc -p'$OPTARG'";;
429       (P)   return_password=$OPTARG; mc="$mc -P$OPTARG";;
430       (q)   queue=$OPTARG; mc="$mc -q$OPTARG";;
431       (r)   run_mode=$OPTARG; mc="$mc -r'$OPTARG'";;
432       (R)   remotecall=true;return_addres=$OPTARG; mc="$mc -R$OPTARG";;
433       (s)   source_list=$OPTARG; mc="$mc -s'$OPTARG'";;
434       (S)   read_from_config=false; mc="$mc -S";;
435       (t)   cpumax=$OPTARG; mc="$mc -t$OPTARG";;
436       (T)   tasks_per_node=$OPTARG; mc="$mc -T$OPTARG";;
437       (u)   remote_username=$OPTARG; mc="$mc -u$OPTARG";;
438       (U)   return_username=$OPTARG; mc="$mc -U$OPTARG";;
439       (v)   silent=true; mc="$mc -v";;
440       (x)   do_trace=true;set -x; mc="$mc -x";;
441       (X)   numprocs=$OPTARG; mc="$mc -X$OPTARG";;
442       (Y)   run_coupled_model=true; coupled_dist=$OPTARG; mc="$mc -Y'$OPTARG'";;
443       (\?)  printf "\n  +++ unknown option $OPTARG \n"
444             printf "\n  --> type \"$0 ?\" for available options \n"
445             locat=parameter;exit;;
446   esac
447 done
448
449
450    # EVTL. POSITIONSPARAMETER EINLESEN
451    # ZUR ZEIT GIBT ES NUR DEN PARAMETER ? (=KURZINFO)
452 shift OPTIND-1
453
454
455    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
456 if [[ "$1" = "?" ]]
457 then
458   (printf "\n  *** mrun can be called as follows:\n"
459    printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X.. -Y.. <modus>\n"
460    printf "\n      Description of available options:\n"
461    printf "\n      Option  Description                              Default-Value"
462    printf "\n        -a    base name of input files                 equiv. -d"
463    printf "\n        -A    no archiving when using file-attribute fl"
464    printf "\n        -b    batch-job on local machine               ---"
465    printf "\n        -B    do not delete temporary directory at end ---"
466    printf "\n        -c    configuration file                       .mrun.config"
467    printf "\n        -d    base name of files attached to program   test"
468    printf "\n        -D    preprocessor(cpp)-directives             \"\" "
469    printf "\n        -F    create remote job file only              ---"
470    printf "\n        -h    execution host                           $localhost_realname"
471    printf "\n        -i    INPUT control list                       \"\" "
472    printf "\n        -I    archiving errors of previous batch-jobs"
473    printf "\n              will be ignored"
474    printf "\n        -k    keep data from previous run"
475    printf "\n        -K    additional conditions for controling"
476    printf "\n              usage of conditional code and"
477    printf "\n              env-variables in configuration file      \"\" "
478    printf "\n        -m    memory demand in MB (batch-jobs)         0 MB"
479    printf "\n        -M    Makefile name                            Makefile"
480    printf "\n        -n    node usage (shared/not_shared)           depending on -h"
481    printf "\n        -o    OUTPUT control list                      \"\" "
482    printf "\n        -O    use OpenMP                               ---"
483    printf "\n        -p    software package list                    \"\" "
484    printf "\n        -q    queue                                    \"$queue\" "
485    printf "\n        -r    run control list (combines -i -o)        \"\" "
486    printf "\n        -s    filenames of routines to be compiled     \"\" "
487    printf "\n              must end with .f, .f90, .F, or .c !"
488    printf "\n              use \"..\" for more than one file and wildcards"
489    printf "\n              -s TEST compiles all files with w-permit"
490    printf "\n        -S    config file interpreted by shellscript   ---"
491    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds (batch)      0"
492    printf "\n        -T    tasks per node                           depending on -h"
493    printf "\n        -u    username on remote machine               \"\" "
494    printf "\n        -v    no prompt for confirmation               ---"
495    printf "\n        -x    tracing of mrun for debug purposes       ---"
496    printf "\n        -X    # of processors (on parallel machines)   1"
497    printf "\n        -Y    run coupled model, \"#1 #2\" with" 
498    printf "\n              #1 atmosphere and #2 ocean processors    \"#/2 #/2\" depending on -X"
499    printf "\n "
500    printf "\n      Possible values of positional parameter <modus>:"
501    printf "\n        \"?\"       -  this outline \n\n") | more
502    exit
503 elif [[ "$1" != "" ]]
504 then
505    printf "\n  +++ positional parameter $1 unknown \n"
506    locat=parameter; exit
507 fi
508
509
510
511    # KURZE STARTMELDUNG
512 printf "\n*** $version "
513 printf "\n    will be executed.     Please wait ..."
514
515
516
517    # PRUEFEN, OB KONFIGURATIONS-DATEI VORHANDEN
518 if [[ ! -f $config_file ]]
519 then
520    printf "\n\n  +++ configuration file: "
521    printf "\n           $config_file"
522    printf "\n      does not exist"
523    locat=connect; exit 
524 fi
525
526
527    # HOST-IDENTIFIER (local_host) AUS KONFIGURATIONSDATEI BESTIMMEN
528 line=""
529 grep  "%host_identifier"  $config_file  >  tmp_mrun
530 while read line
531 do
532    if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
533    then
534       HOSTNAME=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
535       host_identifier=`echo $line | cut -d" " -s -f3`
536       if [[ $localhost_realname = $HOSTNAME ]]
537       then
538          localhost=$host_identifier
539          break
540       fi
541    fi
542 done < tmp_mrun
543
544 if [[ "$localhost" = "" ]]
545 then
546    printf "\n\n  +++ no host identifier found in configuration file \"$config_file\""
547    printf "\n      for local host \"$localhost_realname\"."
548    printf "\n      Please add line"
549    printf "\n      \"\%host_identifier $localhost_realname <identifier>\""
550    printf "\n      to the configuration file."
551    locat=localhost; exit
552 fi
553
554
555    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN SETZEN
556 case  $localhost_realname  in
557     (breg*-en0|berni*-en0)  archive_system=tivoli;;
558     (cs*)                   archive_system=ut;;
559     (fimm.bccs.uib.no)      fimm=true;;
560     (gate|n-sx)             PATH=$PALM_BIN:$PATH:/usr/bin/nqsII;;
561     (hreg*-en0|hanni*-en0)  archive_system=tivoli;;
562     (scirocco)              scirocco=true;;
563 esac
564
565
566 
567    # BASISNAME DER INPUT-DATEIEN GLEICH ALLGEMEINEM BASISNAMEN SETZEN,
568    # WENN NICHT VOM BENUTZER ANDERS BESTIMMT
569 [[ "$afname" = "" ]]  &&  afname=$fname
570
571
572    # EVTL. RUN-MODUS DEN I/O-LISTEN HINZUFUEGEN
573 if [[ "$run_mode" != "" ]]
574 then
575    input_list="$input_list $run_mode"
576    output_list="$output_list $run_mode"
577 fi
578
579
580    # RECHNERNAMEN ABSPEICHERN, VON DEM AUS JOB GESTARTET WIRD,
581    # ALLERDINGS NUR DANN, WENN NICHT PER OPTION -H BEREITS EIN WERT
582    # ZUGEWIESEN WURDE (MRUN MACHT DIES IMMER, WENN ES SELBST BATCH-JOBS
583    # STARTET)
584 if [[ "$fromhost" = "" ]]
585 then
586    fromhost=$localhost
587 fi
588
589
590     # PRUEFEN, OB MRUN NUR TESTWEISE AUF DER LOKALEN MASCHINE KOMPILIEREN SOLL
591 if [[ "$source_list" = LOCAL_COMPILE_TEST ]]
592 then
593    source_list=TEST
594    local_compile=true
595    host=$localhost
596 fi
597   
598
599    # PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
600    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
601    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
602    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
603 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
604 then
605    do_batch=true
606    do_remote=true
607    case  $host  in
608        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|neck|lcsgib|lcsgih|lctit|unics|lcxt4)  true;;
609        (*)  printf "\n"
610             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
611             printf "\n      is not available"
612             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
613    esac
614 else
615    host=$localhost
616 fi
617
618
619     # ZUSATZBEDINGUNGEN (OPTION -K) AUSWERTEN
620 if [[ -n $additional_conditions ]]
621 then
622#    echo $additional_conditions | cut -d" " -f1-3 | read  cond1  cond2  dummy
623    cond1=`echo $additional_conditions | cut -d" " -f1`
624    cond2=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f2`
625    dummy=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f3`
626    if [[ -n $dummy ]]
627    then
628       printf "\n  +++ more than 2 additional conditions given for Option \"-K\""
629       locat=options; exit
630    fi
631 fi
632
633
634      # KOPPLUNGSEIGENSCHAFTEN (-Y) AUSWERTEN UND coupled_mode BESTIMMEN
635 if [[ $run_coupled_model = true ]] 
636 then
637
638    if  [[ -n $coupled_dist ]]
639    then
640
641       numprocs_atmos=`echo $coupled_dist | cut -d" " -s -f1`
642       numprocs_ocean=`echo $coupled_dist | cut -d" " -s -f2`
643
644       if (( $numprocs_ocean + $numprocs_atmos != $numprocs ))
645       then
646
647          printf "\n  +++ number of processors does not fit to specification by \"-Y\"."
648          printf "\n      PEs (total)     : $numprocs"
649          printf "\n      PEs (atmosphere): $numprocs_atmos"
650          printf "\n      PEs (ocean)     : $numprocs_ocean"
651          locat=coupling; exit
652
653          # REARRANGING BECAUSE CURRENTLY ONLY 1:1 TOPOLOGIES ARE SUPPORTED
654          # THIS SHOULD BE REMOVED IN FUTURE
655       elif (( $numprocs_ocean != $numprocs_atmos ))
656       then
657
658          printf "\n  +++ currently only 1:1 topologies are supported"
659          printf "\n      PEs (total)     : $numprocs"
660          printf "\n      PEs (atmosphere): $numprocs_atmos"
661          printf "\n      PEs (ocean)     : $numprocs_ocean"
662          (( numprocs_atmos = $numprocs / 2 ))
663          (( numprocs_ocean = $numprocs / 2 ))
664          printf "\n  +++ rearranged topology to $numprocs_atmos:$numprocs_ocean"
665
666       fi
667
668    else
669
670       (( numprocs_ocean = $numprocs / 2 ))
671       (( numprocs_atmos = $numprocs / 2 ))
672
673    fi
674    coupled_dist=`echo "$numprocs_atmos $numprocs_ocean"`
675
676       # GET coupled_mode FROM THE CONFIG FILE
677    line=""
678    grep  "%cpp_options.*-D__mpi2.*$host" $config_file  >  tmp_mrun
679    while read line
680    do
681       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" &&  ( $(echo $line | cut -d" " -s -f4) = $cond1 || $(echo $line | cut -d" " -s -f4)  = $cond2 ) ]]
682       then
683          coupled_mode="mpi2"
684       fi
685    done < tmp_mrun
686
687 fi
688
689
690    # PRUEFEN, OB EVTL. BEI VORHERGEHENDEM LAUF (KETTENJOB) EINE
691    # ARCHIVIERUNG FEHLGESCHLAGEN IST
692 if [[ -f ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname ]]
693 then
694    if [[ $ignore_archive_error = false ]]
695    then
696       printf "\n  +++ data archiving of previous run failed"
697       printf "\n      see directory \~/job_queue on remote machine"
698       locat=archive; exit
699    else
700       printf "\n  +++ warning: data archiving in a previous run failed"
701       printf "\n      MRUN continues, trying to get backup copy"
702    fi
703 fi
704
705
706
707    # LESEN UND INTERPRETIEREN DER KONFIGURATIONS-DATEI VOM SHELLSCRIPT AUS
708    # VORUEBERGEHEND ZWINGEND AUF LINUX-RECHNERN
709 if [[ "$read_from_config" = false ]]
710 then
711
712    [[ $silent = false ]]  &&  printf "\n    Reading the configuration file... "
713    while  read zeile
714    do
715        [[ $silent = false ]]  &&  printf "."
716
717
718          # ZUERST EVENTUELL VORKOMMENDE ENVIRONMENT-VARIABLEN DURCH IHRE WERTE
719          # ERSETZEN
720       eval  zeile=\"$zeile\"
721
722
723          # INTERPRETATION DER ZEILE
724       if [[ "$(echo $zeile)" = "" ]]
725       then
726             # LEERZEILE, KEINE AKTION
727          continue
728
729       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "#" ]]
730       then
731
732             # ZEILE IST KOMMENTARZEILE
733          true
734
735       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "%" ]]
736       then
737
738             # ZEILE DEFINIERT ENVIRONMENT-VARIABLE
739          zeile=$(echo $zeile | cut -c2-)
740#          echo $zeile | cut -d" " -f1-5 | read  var  value  for_host  for_cond1  for_cond2
741          var=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
742          value=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
743          for_host=`echo $zeile | cut -d" " -s -f3`
744          for_cond1=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
745          for_cond2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
746
747          if [[ "$for_host" = ""  ||  ( "$for_host" = $host  &&  "$for_cond1" = "$cond1"  &&  "$for_cond2" = "$cond2" )  ||  $(echo "$input_list$output_list"|grep -c "$for_host") != 0 ]]
748          then
749
750                # BEI COMPILER- CPP- ODER LINKEROPTIONEN EVTL ":" DURCH " "
751                # ERSETZEN. "::" WIRD DURCH ":" ERSETZT.
752             value=`echo $value | sed 's/::/%DUM%/g' | sed 's/:/ /g' | sed 's/%DUM%/:/g'`
753
754
755                # ENVIRONMENT-VARIABLE WIRD WERT AUS KONFIGURATIONSDATEI
756                # ZUGEWIESEN, WENN SIE SELBST NOCH KEINEN WERT UEBER DIE
757                # ENTSPRECHENDE SCRIPT-OPTION ERHALTEN HAT. SOLCHE
758                # VARIABLEN HAETTEN DANN DEN WERT "" ODER IM INTEGER-FALL DEN
759                # WERT 0.  ALLGEMEINE REGEL ALSO: SCRIPT-OPTION GEHT UEBER
760                # KONFIGURATIONSDATEI
761             if [[ "$(eval echo \$$var)" = ""  ||  "$(eval echo \$$var)" = "0" ]]
762             then
763                eval  $var=\$value
764
765                   # EVTL. BILDSCHIRMAUSGABEN DER ENVIRONMENT-VARIABLEN
766                if [[ $do_trace = true ]]
767                then
768                   printf "\n*** ENVIRONMENT-VARIABLE $var = $value"
769                fi
770             fi
771
772                # WENN ENVIRONMENT-VARIABLE HOST VEREINBART, DANN SOFORT AUSWERTEN
773                # WERT VON do-remote WIRD BEI DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT
774                # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
775                # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
776             if [[ $var = host ]]
777             then
778                if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
779                then
780                   do_batch=true
781                   do_remote=true
782                   case  $host  in
783                       (ibm|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|neck|unics|lcxt4)  true;;
784                       (*)  printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
785                            printf "\n      is not available"
786                            locat=nqs; exit;;
787                   esac
788                else
789                   host=$localhost
790                fi
791             fi
792
793                # VOM BENUTZER DEFINIERTE ENVIRONMENT VARIABLEN MUESSEN PRINZIPIELL
794                # EXPORTIERT WERDEN, DA SIE VIELLEICHT IN WEITER UNTEN AUFZURUFEN-
795                # DEN PROGRAMMEN BENOETIGT WERDEN
796             export  $var
797          fi
798
799
800
801
802       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "EC:" ]]
803       then
804
805             # ZEILE DEFINIERT ERROR-KOMMANDO
806          (( iec = iec + 1 ))
807          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
808          err_command[$iec]="$zeile"
809
810       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "IC:" ]]
811       then
812
813             # ZEILE DEFINIERT INPUT-KOMMANDO
814          (( iic = iic + 1 ))
815          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
816          in_command[$iic]="$zeile"
817
818       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "OC:" ]]
819       then
820
821             # ZEILE DEFINIERT OUTPUT-KOMMANDO
822          (( ioc = ioc + 1 ))
823          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
824          out_command[$ioc]="$zeile"
825
826       else
827
828             # ZEILE DEFINIERT DATEIVERBINDUNG. EINLESEN DER DATEIEIGENSCHAFTEN
829             # s2a: in/out - Feld
830             # s2b: loc    - Feld (optional)
831             # s2c: tr/ar  - Feld (optional)
832#          echo $zeile | cut -d" " -f1-2 | read  s1  s2
833          s1=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
834          s2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
835          s2a=$(echo $s2 | cut -d":" -f1)
836          if [[ $(echo $s2 | grep -c ":") = 0 ]]
837          then
838             s2b=""
839             s2c=""
840          else
841#             echo $s2 | cut -d":" -f2-3 | sed 's/:/ /g' | read  s2b  s2c
842             s2b=`echo $s2 | cut -d":" -f2 | sed 's/:/ /g'`
843             s2c=`echo $s2 | cut -d":" -s -f3 | sed 's/:/ /g'`
844          fi
845#          echo $zeile | cut -d" " -f3-6 | read  s3  s4  s5  s6
846          s3=`echo $zeile | cut -d" " -f3`
847          s4=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
848          s5=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
849          s6=`echo $zeile | cut -d" " -s -f6`
850
851       
852             # ABSPEICHERN DER DATEIVERBINDUNG, FALLS IN INPUT- ODER OUTPUT-LIST
853             # VERMERKT. VARIABLE S3 KANN AUCH LISTE ENTHALTEN (FELDTRENNER ":")
854             # DATEIVERBINDUNG WIRD DANN NICHT ABGESPEICHERT UND GEPRUEFT, WENN
855             # PROGRAMMLAUF AUF REMOTE-MASCHINE ERFOLGT UND DATEI NUR LOKAL VOR-
856             # HANDEN SEIN MUSS (D.H. s2b = loc)
857          IFSALT="$IFS"; IFS="$IFS:"
858          if [[ "$s2a" = in  &&  ! ( $do_remote = true  &&  ( "$s2b" = loc  ||  "$s2b" = locopt ) ) ]]
859          then
860             found=false
861             for  actual  in  $input_list
862             do
863                for  formal  in  $s3
864                do
865                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-" ]]  &&  found=true
866                done
867             done
868             if [[ $found = true ]]
869             then
870                (( iin = iin + 1 ))
871                localin[$iin]=$s1; transin[$iin]=$s2b; actionin[$iin]=$s2c;
872                typein[$iin]=$s3; pathin[$iin]=$s4; endin[$iin]=$s5;
873                extin[$iin]=$s6
874             fi
875          elif [[ "$s2a" = out  &&  ! ( $do_remote = true  &&  "$s2b" = loc ) ]]
876          then
877             found=false
878             for  actual  in  $output_list
879             do
880                for  formal  in  $s3 
881                do
882                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-"  ]]  &&  found=true
883                done
884             done
885             if [[ $found = true ]]
886             then
887                (( iout = iout + 1 ))
888                localout[$iout]=$s1; actionout[$iout]=$s2c; typeout[$iout]=$s3;
889                pathout[$iout]=$s4; endout[$iout]=$s5; extout[$iout]=$s6
890             fi
891          elif [[ "$s2a" != in  &&  "$s2a" != out ]]
892          then
893             printf "\n  +++ I/O-attribute in configuration file $config_file has the invalid"
894             printf "\n      value \"$s2\". Only \"in\" and \"out\" are allowed!"
895             locat=connect; exit
896          fi
897          IFS="$IFSALT"
898       fi
899    done < $config_file
900
901 else
902
903
904       # INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI MITTELS FORTRAN 90 - PROGRAMM
905    [[ $silent = false ]]  &&  printf "..."
906    export  cond1 cond2 config_file do_remote do_trace input_list localhost output_list
907    export  interpreted_config_file=.icf.$RANDOM
908
909
910
911       # ENVIRONMENT-VARIABLEN FUER INTERPRET_CONFIG UEBER NAMELIST_DATEI ZUR
912       # VERFUEGUNG STELLEN
913    cat  >  .mrun_environment  <<  %%END%%
914 &mrun_environment  cond1 = '$cond1', cond2 = '$cond2',
915                    config_file = '$config_file', do_remote = '$do_remote',
916                    do_trace = '$do_trace', host = '$host',
917                    input_list = '$input_list', icf = '$interpreted_config_file',
918                    localhost = '$localhost', output_list = '$output_list' /
919
920%%END%%
921
922       # WERTE VON MRUN-OPTIONEN SICHERN UND DAMIT GEGEBENENFALLS SPAETER DIE
923       # IN DER KONFIGURAIONSDATEI ANGEGEBENEN WERTE UEBERSTEUERN
924    mrun_memory=$memory
925    mrun_group_number=$group_number
926    mrun_cpumax=$cpumax
927    mrun_numprocs=$numprocs
928
929    if [[ $localhost_realname = "gate" ]]
930    then
931       interpret_config_gate.x
932    else
933       interpret_config.x
934    fi
935    rm .mrun_environment
936
937
938       # AUSFUEHRUNG DER GENERIERTEN SHELL-KOMMANDOS IN DIESER SHELL
939    chmod  u+x  $interpreted_config_file
940    export PATH=$PATH:.
941    . $interpreted_config_file
942    rm  $interpreted_config_file
943
944
945       # OPTIONSWERTE UEBERSTEUERN KONFIGURATIONSDATEI
946    [[ $mrun_memory     != 0  ]]  &&  memory=$mrun_memory
947    [[ "$mrun_group_number" != "none" ]]  &&  group_number=$mrun_group_number
948    [[ $mrun_cpumax     != 0  ]]  &&  cpumax=$mrun_cpumax
949    [[ "$mrun_numprocs" != "" ]]  &&  numprocs=$mrun_numprocs
950
951 fi
952
953
954    # QUELLTEXTVERZEICHNIS AUF LOKALER MASCHINE AUS KONFIGURATIONSDATEI
955    # BESTIMMEN (WUERDE SONST EVTL. DAS VERZEICHNIS DES JEWEILS UNTER -h
956    # ANGEGEBENEN REMOTE-RECHNERS SEIN)
957    # BEI BATCH-JOBS SIND DIE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE SCHON KOMPLETT
958 if [[ "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
959 then
960
961       # ZUERST PRUEFEN, OB EIN GLOBALER QUELLTEXTPFAD FUER ALLE RECHNER
962       # VEREINBART WURDE
963    source_path=""
964    line=""
965    grep "%source_path" $config_file  >  tmp_mrun
966    while read line
967    do
968       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
969       then
970          if [[ "$(echo $line | cut -d" " -f3)" = "" ]]
971          then
972             global_source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
973          fi
974       fi
975    done  <  tmp_mrun
976
977    line=""
978    found=false
979    grep  " $localhost" $config_file | grep "%source_path"  >  tmp_mrun
980    while read line
981    do
982       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
983       then
984          if [[ $found = true ]]
985          then
986             printf "\n\n  +++ more than one source path found in configuration file"
987             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
988             locat=source_path; exit
989          fi
990          source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
991          found=true
992       fi
993    done  <  tmp_mrun
994    rm  tmp_mrun
995
996    if [[ "$source_path" = "" ]]
997    then
998       if [[ "$global_source_path" != "" ]]
999       then
1000          source_path=$global_source_path
1001       else
1002          printf "\n\n  +++ no source path found in configuration file"
1003          printf "\n      for local host \"$localhost\" "
1004          locat=source_path; exit
1005       fi
1006    fi
1007    eval source_path=$source_path
1008
1009    if [[ ! -d $source_path ]]
1010    then
1011       printf "\n\n  +++ source path \"$source_path\" on local host"
1012       printf "\n      \"$localhost\" does not exist"
1013       locat=source_path; exit
1014    fi
1015
1016 fi
1017
1018
1019    # GLOBALE REVISIONSNUMMER ERMITTELN (FORTSETZUNGSLAEUFEN WIRD DIESE
1020    # DURCH OPTION -G MITGETEILT)
1021 if [[ "$global_revision" = "" ]]
1022 then
1023    global_revision=`svnversion $source_path  2>/dev/null`
1024    global_revision="Rev: $global_revision"
1025 fi
1026
1027
1028    # NOCHMAL PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
1029    # (HOST KANN IN KONFIGURATIONSDATEI ANDERS FESTGELEGT WORDEN SEIN)
1030    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
1031    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
1032    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
1033 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
1034 then
1035    do_batch=true
1036    do_remote=true
1037    case  $host  in
1038        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lcsgib|lcsgih|lctit|nech|neck|unics|lcxt4)  true;;
1039        (*)  printf "\n"
1040             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
1041             printf "\n      is not available"
1042             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
1043    esac
1044 else
1045    host=$localhost
1046 fi
1047
1048
1049    # PRUEFUNG EINIGER PROZESSORZAHLANGABEN BEI RECHNUNGEN AUF PARALLELRECHNERN
1050 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
1051 then
1052
1053       # PRUEFEN, OB DIE ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN PES ANGEGEBEN WURDE
1054    if [[ ! -n $numprocs ]]
1055    then
1056       printf "\n"
1057       printf "\n  +++ option \"-K parallel\" requires additional specification"
1058       printf "\n      of the number of processors to be used by"
1059       printf "\n      mrun-option \"-X\" or by environment-variable"
1060       printf "\n      \"numprocs\" in the configuration file"
1061       locat=numprocs; (( iec = 0 )); exit 
1062    fi
1063
1064       # PRUEFEN, OB DIE PROZESSORANZAHL PRO KNOTEN ANGEGEBEN WURDE (GGF.
1065       # DEFAULT-WERT SETZEN) UND OB SIE EIN GANZZAHLIGER TEILER DER
1066       # GESAMTPROZESSORANZAHL IST
1067    if [[ $host = nech  ||  $host = neck  ||  $host = ibmh  ||  $host = ibmb  ||  $host = ibms ]]
1068    then
1069       [[ "$tasks_per_node" = "" ]]  &&  tasks_per_node=6
1070       (( ival = $tasks_per_node ))
1071       (( pes = numprocs ))
1072#       if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics+1PE) = 1 ]]
1073#       then
1074#          (( pes = pes - 1 ))
1075#       fi
1076       (( ii = pes / ival ))
1077       if (( pes - ii * ival > 0 ))
1078       then
1079          printf "\n"
1080          printf "\n  +++ tasks per node (option \"-T\") must be an integral"
1081          printf "\n      divisor of the total number of processors (option \"-X\")"
1082          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
1083          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1084       fi
1085    fi
1086
1087       # IBMY HAT NUR EINEN KNOTEN
1088    if [[ $host = ibmy ]]
1089    then
1090       if [[ "$tasks_per_node" != ""  &&  "$tasks_per_node" != "$numprocs" ]]
1091       then
1092          printf "\n"
1093          printf "\n  +++ on ibmy, tasks per node (option \"-T\") must be equal to the"
1094          printf "\n      total number of processors (option \"-X\")"
1095          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
1096          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1097       fi
1098    fi
1099
1100       # FALLS OPENMP PARALLELISIERUNG VERWENDET WERDEN SOLL, ANZAHL VON THREADS
1101       # SETZEN UND ZAHL DER TASKS PRO KNOTEN AUF 1 SETZEN
1102    if [[ $use_openmp = true ]]
1103    then
1104       threads_per_task=$tasks_per_node
1105       tasks_per_node=1
1106    fi
1107    OOPT="-O $threads_per_task"
1108    TOPT="-T $tasks_per_node"
1109
1110       # GESAMTZAHL DER KNOTEN BESTIMMEN
1111    if [[ "$tasks_per_node" != "" ]]
1112    then
1113       (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
1114    fi
1115
1116       # PRUEFEN, OB NODE USAGE EINEN ERLAUBTEN WERT HAT BZW. DEN DEFAULT
1117       # SETZEN
1118    if [[ $node_usage = default ]]
1119    then
1120       if [[ $host = ibms ]]
1121       then
1122          node_usage=shared
1123       elif [[ $host = lctit ]]
1124       then
1125          node_usage=sla3
1126       elif [[ $(echo $host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
1127       then
1128          node_usage=singlejob
1129       else
1130          node_usage=not_shared
1131       fi
1132    fi
1133
1134    if [[ $node_usage != shared  &&  $node_usage != not_shared  &&  $node_usage != singlejob  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != novice  ]]
1135    then
1136       printf "\n"
1137       printf "\n  +++ node usage (option \"-n\") is only allowed to be set"
1138       printf "\n      \"shared\" or \"not_shared\""
1139       locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1140    fi
1141
1142 fi
1143
1144    # PRUEFEN, OB HOSTFILE EXISTIERT
1145 if [[ -n $hostfile ]]
1146 then
1147    if [[ ! -f $hostfile ]]
1148    then
1149       printf "\n"
1150       printf "\n  +++ hostfile \"$hostfile\" does not exist"
1151       locat=hostfile; exit
1152    fi
1153 fi
1154
1155    # PRUEFEN, OB RHOSTS DATEI EXISTIERT. GEGEBENENFALLS ANLEGEN BZW. ERWEITERN
1156 if [[ $host = ibmy  &&  $do_remote = false ]]
1157 then
1158    if [[ ! -f $HOME/.rhosts ]]
1159    then
1160       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >  $HOME/.rhosts
1161       printf "\n\n  *** file:"
1162       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1163       printf "\n      was created\n"
1164    fi
1165    if [[ $(grep -c gfdl5.yonsei.ac.kr $HOME/.rhosts) = 0 ]]
1166    then
1167       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >>  $HOME/.rhosts
1168       printf "\n\n  *** file:"
1169       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1170       printf "\n      was extended by the name of the current host\n"
1171    fi
1172 fi
1173
1174
1175
1176    # FALLS NICHT VORGEGEBEN, DEFAULT-QUEUE AUF DER ZIELMASCHINE FESTLEGEN
1177 if [[ $queue = none ]]
1178 then
1179    case  $host  in
1180        (ibmb)       if [[ $node_usage = shared ]]
1181                     then
1182                        queue=cshare
1183                     else
1184                        queue=csolo
1185                     fi;;
1186        (ibmh)       if [[ $node_usage = shared ]]
1187                     then
1188                        queue=cshare
1189                     else
1190                        queue=csolo
1191                     fi;;
1192        (ibmy)       queue=parallel;;
1193        (lcsgib)     queue=bigq;;
1194        (lcsgih)     queue=bigq;;
1195        (lctit)      queue=sla3;;
1196        (nech)       queue=none;;
1197        (neck)       queue=P;;
1198        (unics)      queue=unics;;
1199    esac
1200 fi
1201
1202
1203    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN DER INPUT-FILES BILDEN,
1204    # INPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1205    # ERMITTELN
1206 (( i = 0 ))
1207 while (( i < iin ))
1208 do
1209    (( i = i + 1 ))
1210    (( maxcycle = 0 ))
1211
1212       # NAMENSBILDUNG (EVTL. IST FESTER DATEINAME VORGEGEBEN)
1213    if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1214    then
1215       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1216                                                    # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1217       eval filename=${pathin[$i]}/${endin[$i]}
1218    else
1219       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1220                                                             # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1221       eval filename=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}
1222    fi
1223
1224       # PRUEFEN AUF VORHANDENSEIN
1225    if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1226          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1227          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1228    then
1229          # DATEIEN MIT EXTENSION (Z.B. NC) MUESSEN NICHT ZWINGEND VORHANDEN
1230          # SEIN, DESHALB IN SOLCHEN FAELLEN KEIN ABBRUCH. DIES IST NUR EINE
1231          # VORUEBERGEHENDE LOESUNG (OKT 05). NICHT ZWINGEND BENOETIGTE
1232          # EINGABEDATEIEN SOLLTEN EINE SPEZIELLE OPTION IN DER DATEI-
1233          # VERBINDUNGSANWEISUNG BEKOMMEN (Z.B. inopt?)
1234       if [[ "${transin[$i]}" != "locopt" ]]
1235       then
1236          printf "\n\n  +++ INPUT-file: "
1237          if [[ "${extin[$i]}" = "" ]]
1238          then
1239             printf "\n           $filename"
1240          else
1241             printf "\n           $filename.${extin[$i]}"
1242          fi
1243          printf "\n      does not exist\n"
1244          locat=input; exit
1245       else
1246          transin[$i]="unavailable"
1247       fi
1248    else
1249
1250          # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1251       ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1252       ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1253       while  read zeile
1254       do
1255          cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1256          if [[ "$cycle" = "$zeile" ]]
1257          then
1258             (( icycle = 0 ))
1259          elif [[ "$cycle" = "${extin[$i]}" ]]
1260          then
1261             (( icycle = 0 ))
1262          else
1263             (( icycle = $cycle ))
1264          fi
1265          if (( icycle > maxcycle ))
1266          then
1267             (( maxcycle = icycle ))
1268             file_to_be_used=$zeile
1269          fi
1270       done <filelist
1271       rm filelist
1272
1273          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN
1274       if (( maxcycle > 0 ))
1275       then
1276          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1277          then
1278             filename=${filename}.$maxcycle.${extin[$i]}
1279          else
1280             filename=${filename}.$maxcycle
1281          fi
1282       else
1283          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1284          then
1285             filename=${filename}.${extin[$i]}
1286          fi
1287       fi
1288       
1289          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1290          # DA SPAETER BEI RUECKSPEICHERN VOM ARCHIVSYSTEM EVTL. BENOETIGT
1291       absnamein[$i]=$filename
1292       if (( maxcycle > 0 ))
1293       then
1294          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1295          then
1296             frelin[$i]=${endin[$i]}.$maxcycle
1297          else
1298             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}.$maxcycle
1299          fi
1300       else
1301          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1302          then
1303             frelin[$i]=${endin[$i]}
1304          else
1305             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}
1306          fi
1307       fi
1308
1309    fi
1310 done
1311       
1312
1313    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN (OHNE $ ODER ~) DER OUTPUT-FILES BILDEN,
1314    # OUTPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1315    # ERMITTELN ODER, FALLS NICHT VORHANDEN, PRUEFEN, OB SIE SICH ANLEGEN LASSEN
1316    # DIESE AKTIONEN FINDEN NICHT STATT, WENN PROGRAMM AUF REMOTE-MASCHINE
1317    # RECHNET UND DATEI ANSCHLIESSEND TRANSFERIERT WERDEN SOLL!
1318 (( i = 0 ))
1319 while (( i < iout ))
1320 do
1321    (( i = i + 1 ))
1322    if [[ ! ( $fromhost != $localhost  &&  ( "${actionout[$i]}" = tr || "${actionout[$i]}" = tra || "${actionout[$i]}" = trpe ) ) ]]
1323    then
1324       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
1325       then
1326          actionout[$i]=""
1327       elif [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
1328       then
1329          actionout[$i]=a
1330       fi
1331       (( maxcycle = 0 ))
1332       eval filename=${pathout[$i]}/${fname}${endout[$i]}
1333       eval catalogname=${pathout[$i]}
1334       if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1335             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1336             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1337       then
1338     
1339             # OUTPUT-DATEI NICHT VORHANDEN. PRUEFEN, OB ANLEGEN MOEGLICH.
1340          if  cat /dev/null > $filename 
1341          then
1342             rm  $filename
1343          else
1344
1345                # PRUEFEN, OB KATALOG VORHANDEN UND EVTL. DIESEN ANLEGEN
1346             if [[ ! -d $catalogname ]]
1347             then
1348                if  mkdir -p  $catalogname
1349                then
1350                   printf "\n\n  *** directory:"
1351                   printf "\n           $catalogname"
1352                   printf "\n      was created\n"
1353                else
1354                   printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1355                   printf "\n           $filename"
1356                   printf "\n      cannot be created, because directory does not exist"
1357                   printf "\n      and cannot be created either"
1358                   printf "\n"
1359                   locat=output  ; exit
1360                fi 2>/dev/null
1361             else
1362                printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1363                printf "\n           $filename"
1364                printf "\n      cannot be created, although directory exists"
1365                printf "\n"
1366                locat=output  ; exit
1367             fi
1368          fi 2>/dev/null
1369       else
1370
1371             # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1372          ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1373          ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1374          while  read zeile
1375          do
1376             cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1377             if [[ "$cycle" = "$zeile"  ||  "$cycle" = ${extout[$i]} ]]
1378             then
1379                (( icycle = 1 ))
1380             else
1381                (( icycle = $cycle + 1 ))
1382             fi
1383             if (( icycle > maxcycle ))
1384             then
1385                (( maxcycle = icycle ))
1386             fi
1387          done <filelist
1388          rm filelist
1389       fi
1390
1391          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN UND PRUEFEN, OB SICH
1392          # DATEI AUCH WIRKLICH ANLEGEN LAESST. IM APPEND-FALL MUSS AN DEN
1393          # HOECHSTEN VORHANDENEN ZYKLUS-ANGEHAENGT WERDEN. ANLAGEPRUEFUNG
1394          # IST DANN NATUERLICH NICHT ZULAESSIG BZW. MOEGLICH
1395       if [[ "${actionout[$i]}" != a ]]
1396       then
1397          if (( maxcycle > 0 ))
1398          then
1399             filename=${filename}.$maxcycle
1400             if  cat /dev/null > $filename 
1401             then
1402                rm  $filename
1403             else
1404                printf "\n  +++ OUTPUT-file:"
1405                printf "\n           $filename"
1406                printf "\n      cannot be created"
1407                locat=output  ; exit
1408             fi
1409          fi
1410       else
1411          (( maxcycle = maxcycle - 1 ))
1412          if (( maxcycle > 0 ))
1413          then
1414             filename=${filename}.$maxcycle
1415          fi
1416       fi
1417       
1418          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1419          # DA SPAETER BEI ABLAGE AUF ARCHIVSYSTEM BZW. FUER
1420          # DATEI OUTPUT_FILE_CONNECTIONS EVTL. BENOETIGT
1421       pathout[$i]=$filename
1422       if (( maxcycle > 0 ))
1423       then
1424          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}.$maxcycle
1425       else
1426          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}
1427       fi
1428
1429    fi
1430 done
1431
1432
1433     # DAS DVRP-PAKET ERFORDERT EINE ENTSPRECHENDE BIBLIOTHEK
1434 if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
1435 then
1436    if [[ "$dvrp_inc" = "" ]]
1437    then
1438       printf "\n\n  +++ no value for \"dvrp_inc\" given in configuration file"
1439       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1440       locat=dvrp; exit
1441    fi
1442    if [[ "$dvrp_lib" = "" ]]
1443    then
1444       printf "\n\n  +++ no value for \"dvrp_lib\" given in configuration file"
1445       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1446       locat=dvrp; exit
1447    fi
1448 fi
1449
1450
1451     # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM ODER NUR EIN AUSFUEHRBARES
1452     # PROGRAMM VEREINBART WURDE (IN DIESEM FALL BRAUCHT IM WEITEREN NICHT
1453     # UEBERSETZT ZU WERDEN)
1454 if [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" = "" ]]
1455 then
1456    printf "\n  +++ neither main program nor executable defined"
1457    locat=source; exit
1458 elif [[ "$mainprog" != ""  &&  "$executable" != "" ]]
1459 then
1460    printf "\n  +++ main program as well as executable defined"
1461    locat=source; exit
1462 elif [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" != "" ]]
1463 then
1464    do_compile=false
1465 fi
1466
1467
1468    # SOURCE-VERZEICHNIS ZUM AUFSAMMELN DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE
1469    # ERZEUGEN. HIERHIN WERDEN SPAETER IM FALL VON BATCH-JOBS AUCH DAS MRUN-
1470    # SCRIPTS SOWIE DIE KONFIGURATIONSDATEI KOPIERT
1471 if [[ $restart_run != true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1472 then
1473    rm -rf  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1474    mkdir   SOURCES_FOR_RUN_$fname
1475 fi
1476
1477
1478    # ALLE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE ZUSAMMENSAMMELN
1479    # BEI BATCH-JOBS IST DIES NICHT NOETIG, WEIL DIE PROGRAMMTEILE BEREITS DURCH
1480    # DEN MRUN-AUFRUF ERMITTELT SIND, DER DEN BATCH-JOB GENERIERT HAT, UND
1481    # IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_... ABGELEGT SIND
1482 if [[ $do_compile = true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1483 then
1484
1485    [[ "$source_list" = LM ]]  &&  source_list=LOCALLY_MODIFIED
1486    [[ "$source_list" = WP ]]  &&  source_list=WRITE_PERMIT
1487
1488
1489       # EVTL. ZU UEBERSETZENDE PROGRAMMTEILE DADURCH BESTIMMEN, DASS GEPRUEFT
1490       # WIRD, WELCHE DATEIEN WRITE-PERMIT BESITZEN (DATEIEN SOLLTEN DESHALB
1491       # UNTER RCS-KONTROLLE STEHEN). MIT DER VARIABLEN EXCLUDE KOENNEN
1492       # BESTIMMTE DATEIEN GRUNDSAETZLICH VON DER UEBERSETZUNG AUSGESCHLOSSEN
1493       # WERDEN. DIES IST NUR BEI MANUELLEM START VON MRUN DURCH DEN BENUTZER
1494       # MOEGLICH, DA BEI AUTOMATISCHEN RESTARTS TEST DURCH DIE TATSAECHLICH
1495       # ZU UBERSETZENDEN DATEIEN ERSETZT IST.
1496       # ALLE ERMITTELTEN DATEIEN WERDEN IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_...
1497       # GESAMMELT
1498    if [[ "$source_list" = WRITE_PERMIT ]]
1499    then
1500
1501       source_list=""
1502       cd  $source_path
1503
1504
1505          # ALLE MOEGLICHEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1506       Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1507       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Names"
1508       Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1509       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1510       Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1511       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1512       Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1513       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1514       Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1515       [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1516
1517
1518          # DATEIEN MIT WRITE-PERMIT NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1519       for  dateiname  in  $Filenames
1520       do
1521          if [[ -w $dateiname ]]
1522          then
1523             if [[ "$exclude" = ""  ||  $(echo $exclude | grep -c $dateiname) = 0 ]]
1524             then
1525                cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1526                source_list=$source_list"$dateiname "
1527             fi
1528          fi
1529       done
1530
1531       cd -  > /dev/null
1532
1533
1534    elif [[ "$source_list" = LOCALLY_MODIFIED ]]
1535    then
1536
1537          # MODIFIZIERTE DATEIEN DER SVN-ARBEITSKOPIE BESTIMMEN
1538       source_list=""
1539       cd  $source_path
1540
1541
1542          # PRUEFEN, OB VERZEICHNIS UEBERHAUPT UNTER SVN-KONTROLLE STEHT
1543       if [[ ! -d .svn ]]
1544       then
1545          printf "\n\n  +++ source directory"
1546          printf "\n         \"$source_path\" "
1547          printf "\n         is not under control of \"subversion\"."
1548          printf "\n         Please do not use mrun-option \"-s LOCALLY MODIFIED\"\n"
1549       fi
1550
1551
1552          # ALLE MODIFIZIERTEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1553       Filenames=""
1554       svn status  >  tmp_mrun
1555       while  read line
1556       do
1557          firstc=`echo $line | cut -c1`
1558          if [[ $firstc = M  ||  $firstc = "?" ]]
1559          then
1560             Name=`echo "$line" | cut -c8-`
1561             extension=`echo $Name | cut -d. -f2`
1562             if [[ "$extension" = f90 || "$extension" = F90 || "$extension" = f || "$extension" = F || "$extension" = c ]]
1563             then
1564                Filenames="$Filenames "$Name
1565             fi
1566          fi
1567       done < tmp_mrun
1568
1569
1570          # DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1571       for  dateiname  in  $Filenames
1572       do
1573          cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1574          source_list=$source_list"$dateiname "
1575       done
1576
1577       cd -  > /dev/null
1578
1579
1580       # MITTELS OPTION -s ANGEGEBENE DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1581       # BEI AUTOMATISCHEN FORTSETZUNGSLAEUFEN SIND DORT SCHON ALLE DATEIEN
1582       # VORHANDEN
1583    elif [[ "$source_list" != ""  &&  $restart_run != true ]]
1584    then
1585
1586       cd  $source_path
1587
1588       for  filename  in  $source_list
1589       do
1590
1591             # QUELLTEXT-DATEI DARF KEINE PFADE BEINHALTEN
1592          if [[ $(print $filename | grep -c "/") != 0 ]]
1593          then
1594             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1595             printf "\n      must not contain (\"/\") "
1596             locat=source; exit
1597          fi
1598
1599          if [[ ! -f $filename ]]
1600          then
1601             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1602             printf "\n      does not exist"
1603             locat=source; exit
1604          else
1605             cp  $filename  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1606          fi
1607
1608       done
1609
1610       cd -  > /dev/null
1611
1612    fi
1613
1614
1615       # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM VORHANDEN UND ES EVTL. IN DER
1616       # LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE MIT ENTHALTEN IST (WENN
1617       # NICHT, WIRD ES DIESER LISTE HINZUGEFUEGT)
1618    if [[ $restart_run != true ]]
1619    then
1620
1621       if [[ ! -f "$source_path/$mainprog" ]]
1622       then
1623          printf "\n\n  +++ main program:  $mainprog"
1624          printf "\n      does not exist in source directory"
1625          printf "\n      \"$source_path\"\n"
1626          locat=source; exit
1627       else
1628          if [[ $(echo $source_list | grep -c $mainprog) = 0 ]]
1629          then
1630             cp  $source_path/$mainprog  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1631             source_list=${mainprog}" $source_list"
1632          fi
1633       fi
1634    fi
1635
1636
1637       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1638       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1639    if [[ "$restart_run" != true ]]
1640    then
1641       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1642       if [[ ! -f $makefile ]]
1643       then
1644          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1645          locat=make; exit
1646       else
1647          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1648       fi
1649    fi
1650
1651
1652       # DATEIEN AUS ZUSAETZLICHEM QUELLVERZEICHNIS HINZUFUEGEN
1653    if [[ $restart_run != true  &&  "$add_source_path" != "" ]]
1654    then
1655
1656          # GIBT ES DAS VERZEICHNIS UEBERHAUPT?
1657       if [[ ! -d $add_source_path ]]
1658       then
1659          printf "\n\n  +++ WARNING: additional source code directory"
1660          printf "\n      \"$add_source_path\" "
1661          printf "\n      does not exist or is not a directory."
1662          printf "\n      No source code will be used from this directory!\n"
1663          add_source_path=""
1664          sleep 3
1665       else
1666
1667          cd $add_source_path
1668          found=false
1669
1670          Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1671          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$Names"
1672          Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1673          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1674          Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1675          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1676          Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1677          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1678          Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1679          [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1680
1681          cd -  > /dev/null
1682          cd  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1683
1684             # COPY MAKEFILE IF EXISTING
1685          if [[ -f $add_source_path/Makefile ]]
1686          then
1687             printf "\n\n  *** user Makefile from directory"
1688             printf "\n      \"$add_source_path\" is used \n"
1689             sleep 1
1690             cp  $add_source_path/Makefile  .
1691          fi
1692
1693          for  dateiname  in  $AddFilenames
1694          do
1695             if [[ -f $dateiname ]]
1696             then
1697                printf "\n  +++ source code file \"$dateiname\" found in additional"
1698                printf "\n      source code directory \"$add_source_path\" "
1699                printf "\n      but was also given with option \"-s\" which means that it should be taken"
1700                printf "\n      from directory \"$source_path\"."
1701                locat=source; exit
1702             fi
1703
1704             cp  $add_source_path/$dateiname  .
1705             source_list="$source_list $dateiname"
1706
1707                # CHECK IF FILE IS CONTAINED IN MAKEFILE
1708             if [[ $(grep -c $dateiname Makefile) = 0 ]]
1709             then
1710                printf "\n\n  +++ user file \"$dateiname\" "
1711                printf "\n      is not listed in Makefile \n"
1712                locat=source; exit
1713             else
1714
1715                # Default User-Interface von der Liste entfernen, falls Datei
1716                # ein User-Interface enthaelt
1717#             if [[ $( cat $dateiname | grep -c "END SUBROUTINE user_parin" ) != 0 ]]
1718#             then
1719#                if [[ $dateiname != user_interface.f90  &&  -f user_interface.f90 ]]
1720#                then
1721#                   rm -rf  user_interface.f90
1722#                   source_list=`echo $source_list | sed -e 's/user_interface.f90//'`
1723#                   printf "\n\n  *** default \"user_interface.f90\" removed from the files to be translated"
1724#                   printf "\n      since a user-interface is found in file"
1725#                   printf "\n      \"$add_source_path/$dateiname\" \n"
1726#                   sleep 3
1727#                else
1728                if [[ $found = false ]]
1729                then
1730                   found=true
1731                   printf "\n\n  *** following user file(s) added to the"
1732                   printf " files to be translated:\n      "
1733                fi
1734                printf "$dateiname  "
1735                sleep 0.5
1736             fi
1737          done
1738          [[ $found = true ]]  &&  printf "\n"
1739          cd -  > /dev/null
1740       fi
1741    fi
1742
1743
1744       # ALLE UNTERPROGRAMME, DIE ZU VEREINBARTEN SOFTWAREPAKETEN GEHOEREN,
1745       # DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN HINZUFUEGEN
1746    if [[ $restart_run != true  &&  -n $package_list ]]
1747    then
1748
1749       cd  $source_path
1750
1751       for  package  in  $package_list
1752       do
1753
1754          [[ $package = "dvrp_graphics+1PE" ]]  &&  package=dvrp_graphics
1755
1756             # ERMITTELE ALLE DATEIEN, DIE ZUM PAKET GEHOEREN
1757             # FEHLERMELDUNGEN WERDEN ABGEFANGEN, DA * AUCH VERZEICHNISSNAMEN
1758             # LIEFERT
1759          package_source_list=`grep "defined( __$package " * 2>/dev/null | cut -f1 -d:`
1760
1761
1762             # FUEGE DIESE DATEIEN DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN
1763             # HINZU, FALLS SIE NOCH NICHT DAZUGEHOEREN
1764          for  source_list_name  in  $package_source_list
1765          do
1766             if [[ $(echo $source_list | grep -c $source_list_name) = 0 ]]
1767             then
1768
1769                    # NUR DATEIEN MIT GUELTIGEN ENDUNGEN VERWENDEN
1770                ending=`echo $source_list_name | cut -f2 -d.`
1771                if [[ "$ending" = f90  ||  "$ending" = F90  ||  "$ending" = f  ||  "$ending" = F  ||  "$ending" = c ]]
1772                then
1773                   cp  $source_list_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1774                   source_list="$source_list $source_list_name"
1775                fi
1776             fi
1777          done
1778       done
1779
1780       cd -  > /dev/null
1781    fi
1782
1783
1784       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1785       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1786#    if [[ "$restart_run" != true ]]
1787#    then
1788#       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1789#       if [[ ! -f $makefile ]]
1790#       then
1791#          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1792#          locat=make; exit
1793#       else
1794#          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1795#       fi
1796#    fi
1797
1798 fi  # do_compile=true
1799
1800
1801    # FALLS PROGRAMMTEILE UEBERSETZT WERDEN SOLLEN, FOLGEN JETZT EINIGE
1802    # UEBERPRUEFUNGEN UND DAS SETZEN DER PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN
1803 if [[ $do_compile = true ]]
1804 then
1805
1806       # PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN ZUM SELEKTIVEN AUSWAEHLEN VON CODETEILEN
1807       # ZUSAMMENSETZEN
1808       # DIREKTIVEN ZUM AKTIVIEREN VON RECHNERSPEZIFISCHEM CODE
1809    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1810    then
1811       cpp_options="${cpp_options},-D__ibm=__ibm"
1812    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = nec ]]
1813    then
1814       cpp_options="$cpp_options -D__nec"
1815    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-2) = lc ]]
1816    then
1817       cpp_options="$cpp_options -D__lc"
1818    else
1819       cpp_options="$cpp_options -D__$localhost"
1820    fi
1821
1822       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -K BESTIMMT WERDEN (Z.B. PARALLEL)
1823    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1824    then
1825       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond1=__$cond1"
1826       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond2=__$cond2"
1827    else
1828       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond1"
1829       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond2"
1830    fi
1831
1832       # DIREKTIVEN DIE SOFTWAREPAKETE AKTIVIEREN (OPTION -p)
1833    if [[ -n $package_list ]]
1834    then
1835       for  package  in  $package_list
1836       do
1837          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1838          then
1839             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1840             then
1841                cpp_options="${cpp_options},-D__$package=__$package"
1842             else
1843                cpp_options="${cpp_options},-D__dvrp_graphics=__dvrp_graphics"
1844                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1845             fi
1846          else
1847             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1848             then
1849                cpp_options="$cpp_options -D__$package"
1850             else
1851                cpp_options="$cpp_options -D__dvrp_graphics"
1852                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1853             fi
1854          fi
1855       done
1856    fi
1857
1858       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -D FESTGELEGT SIND
1859    if [[ -n $cpp_opts ]]
1860    then
1861       for  popts  in  $cpp_opts
1862       do
1863          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1864          then
1865             cpp_options="${cpp_options},-D__$popts=__$popts"
1866          else
1867             cpp_options="$cpp_options -D__$popts"
1868          fi
1869       done
1870    fi
1871
1872 else
1873
1874
1875       # BEI LOKALEN RECHNUNGEN PRUEFEN, OB EXECUTABLE VORHANDEN
1876    if [[ $do_remote = false ]]
1877    then
1878       if [[ ! -f $executable ]]
1879       then
1880          printf "\n  +++ executable file:  $executable"
1881          printf "\n      does not exist"
1882          locat=executable; exit
1883       fi
1884    fi
1885 fi
1886
1887
1888    # JOBMODUS FESTSTELLEN
1889 if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH  &&  $localhost != lctit  ||  "$QUEUE" != interactive  &&  $localhost = lctit ]]
1890 then
1891    jobmo=BATCH
1892 else
1893    jobmo=INTERACTIVE
1894 fi
1895
1896
1897    # HOSTSPEZIFISCHE DEFAULT-COMPILER SETZEN, FALLS NICHT BEREITS
1898    # DURCH BENUTZER ANDERWEITIG VEREINBART
1899 if [[ "$compiler_name" = "" ]]
1900 then
1901
1902    printf "\n  +++ no compiler specified for \"$host $cond1 $cond2\""
1903    locat=compiler_name; exit
1904
1905 fi
1906
1907
1908    # COMPILER AUF NECK UEBERSCHREIBEN
1909 [[ $localhost = neck ]]  &&  compiler_name=mpif90
1910
1911
1912
1913    # TEMPORAEREN KATALOGNAMEN BESTIMMEN
1914 kennung=$RANDOM
1915 if [[ "$tmp_user_catalog" = "" ]]
1916 then
1917    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1918    then
1919       tmp_user_catalog=$TMPDIR
1920    elif [[ $localhost = nech ]]
1921    then
1922       tmp_user_catalog=$WRKSHR
1923    else
1924       tmp_user_catalog=/tmp
1925    fi
1926 fi
1927 TEMPDIR=$tmp_user_catalog/${usern}.$kennung
1928
1929
1930    # KATALOGNAMEN FUER ZWISCHENSPEICHERUNG VON FORTSETZUNGSLAUFDATEIEN
1931    # BESTIMMEN
1932 if [[ "$tmp_data_catalog" = "" ]]
1933 then
1934    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1935    then
1936       tmp_data_catalog=$WORK/mrun_restart_data
1937    elif [[ $localhost = nech ]]
1938    then
1939       tmp_data_catalog=$WRKSHR/mrun_restart_data
1940    else
1941       tmp_data_catalog=/tmp/mrun_restart_data
1942    fi
1943 fi
1944
1945
1946    # EVENTUELL BEI LOKALEN RECHNUNGEN $-ZEICHEN IN ENVIRONMENT-VARIABLEN
1947    # ERSETZEN
1948 if [[ $do_remote = false  &&  $do_compile = true ]]
1949 then
1950    eval  fopts=\"$fopts\"
1951    eval  lopts=\"$lopts\"
1952 fi
1953
1954
1955
1956    # COMPILE- UND LINK-OPTIONEN BESTIMMEN
1957 fopts="$fopts $netcdf_inc $dvrp_inc"
1958 lopts="$lopts $netcdf_lib $dvrp_lib"
1959 ROPTS="$ropts"
1960 if [[ ( $(echo $host | cut -c1-3) = nec  ||  $(echo $host | cut -c1-3) = ibm  ||  $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib  ||  $host = lctit  ||  $host = lcfimm  ||  $host = lcxt4 )  &&  -n $numprocs ]]
1961 then
1962    XOPT="-X $numprocs"
1963 fi
1964
1965
1966
1967    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT. (CPUMAX WIRD ALS ENV-VARIABLE VOM HAUTPRO-
1968    # GRAMM BENOETIGT
1969 done=false
1970 while [[ $done = false ]]
1971 do
1972    cputime=$cpumax
1973    if (( $cputime == 0 ))
1974    then
1975       printf "\n  +++ cpu-time is undefined"
1976       printf "\n  >>> Please type CPU-time in seconds as INTEGER:"
1977       printf "\n  >>> "
1978       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
1979    else
1980       done=true
1981    fi
1982    cpumax=$cputime
1983 done
1984
1985 (( minuten = cputime / 60 ))
1986 (( sekunden = cputime - minuten * 60 ))
1987
1988
1989    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
1990 if [[ $do_batch = true ]]
1991 then
1992    done=false
1993    while [[ $done = false ]]
1994    do
1995       if (( memory == 0 ))
1996       then
1997          printf "\n  +++ memory demand is undefined"
1998          printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
1999          printf "\n  >>> "
2000          read  memory  1>/dev/null  2>&1
2001       else
2002          done=true
2003       fi
2004    done
2005 fi
2006
2007
2008    # PRUEFEN, OB FUER REMOTE-RECHNUNGEN EIN BENUTZERNAME ANGEGEBEN WURDE
2009 if [[ $do_remote = true  &&  -z $remote_username ]]
2010 then
2011    while [[ -z $remote_username ]]
2012    do
2013       printf "\n  +++ username on remote host \"$host\" is undefined"
2014       printf "\n  >>> Please type username:"
2015       printf "\n  >>> "
2016       read  remote_username
2017    done
2018    mc="$mc -u$remote_username"
2019 fi
2020
2021
2022    # SET DEFAULT VALUE FOR MPI MODULE TO BE USED ON SGI-ALTIX
2023 if [[ $host = lcsgib  ||  $host = lcsgih ]]
2024 then
2025    [[ "$mpilib" = "" ]]  &&  export mpilib=mpt
2026 fi
2027
2028
2029
2030###########################################################################
2031# HEADER-AUSGABE
2032###########################################################################
2033
2034
2035 calltime=$(date)
2036 printf "\n"
2037# [[ $silent = false ]]  &&  clear
2038 printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
2039 printf "| $version$calltime | \n"
2040 printf "|                                                              | \n"
2041 spalte1="called on:"; spalte2=$localhost_realname
2042 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2043 if [[ $local_compile = false ]]
2044 then
2045    if [[ $do_remote = true ]]
2046    then
2047       spalte1="execution on:"; spalte2="$host (username: $remote_username)"
2048    else
2049       spalte1="execution on:"; spalte2="$host ($localhost_realname)"
2050    fi
2051 else
2052    spalte1="compiling test only!"; spalte2=""
2053 fi
2054 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2055 if [[ -n $numprocs ]]
2056 then
2057    spalte1="number of PEs:"; spalte2=$numprocs
2058    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2059 fi
2060 if [[ -n $tasks_per_node ]]
2061 then
2062    spalte1="tasks per node:"; spalte2="$tasks_per_node (number of nodes: $nodes)"
2063    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2064 fi
2065 if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2066 then
2067    spalte1="threads per task:"; spalte2="$threads_per_task"
2068    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2069 fi
2070 printf "|                                                              | \n"
2071 if [[ $do_compile = true ]]
2072 then
2073    spalte1=cpp-directives:; spalte2=$cpp_options
2074    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2075    zeile=$(echo "$cpp_options" | cut -c41-)
2076    while [[ "$zeile" != "" ]]
2077    do
2078       spalte1=""
2079       spalte2=$zeile
2080       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2081       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2082    done
2083
2084    spalte1=compiler-options:; spalte2="$fopts"
2085    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2086    zeile=$(echo "$fopts" | cut -c41-)
2087    while [[ "$zeile" != "" ]]
2088    do
2089       spalte1=""
2090       spalte2=$zeile
2091       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2092       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2093    done
2094
2095    spalte1=linker-options:; spalte2=$lopts
2096    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2097    zeile=$(echo "$lopts" | cut -c41-)
2098    while [[ "$zeile" != "" ]]
2099    do
2100       spalte1=""
2101       spalte2=$zeile
2102       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2103       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
2104    done
2105
2106    spalte1="main program":; spalte2=$mainprog
2107    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2108 else
2109    spalte1=executable:; spalte2=$executable
2110    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2111 fi
2112 printf "|                                                              | \n"
2113 spalte1="base name of files":; spalte2=$fname
2114 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2115 if [[ $fname != $afname ]]
2116 then
2117    spalte1="base name of input files":; spalte2=$afname
2118    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2119 fi
2120 spalte1="INPUT control list":; spalte2=$input_list
2121 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2122 spalte1="OUTPUT control list":; spalte2=$output_list
2123 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2124
2125 if [[ $do_batch = true  ||  "$LOADLBATCH" = yes ]]
2126 then
2127    spalte1="memory demand / PE":; spalte2="$memory MB"
2128    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2129    spalte1=CPU-time:; spalte2="$minuten:$sekunden"
2130    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
2131 fi
2132
2133 if [[ $do_compile = true ]]
2134 then
2135    printf "|                                                              | \n"
2136    printf "| Files to be compiled:                                        | \n"
2137    zeile=$source_list
2138    while [[ "$zeile" != "" ]]
2139    do
2140       spalte3=$zeile
2141       printf "| $spalte3 | \n"
2142       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c61-)
2143    done
2144 fi
2145 printf "#--------------------------------------------------------------#"
2146
2147
2148
2149    # BEDINGTE AUSGABE DER DATEIVERBINDUNGEN
2150 if [[ $do_trace = true ]]
2151 then
2152    (( i = 0 ))
2153    while (( i < iin ))
2154    do
2155       (( i = i + 1 ))
2156       if (( i == 1 ))
2157       then
2158          printf "\n\n >>> INPUT-file assignments:\n"
2159       fi
2160       printf "\n     ${localin[$i]} :  ${absnamein[$i]}"
2161    done
2162    (( i = 0 ))
2163    while (( i < iout ))
2164    do
2165       (( i = i + 1 ))
2166       if (( i == 1 ))
2167       then
2168          printf "\n\n >>> OUTPUT-file assignments:\n"
2169       fi
2170       printf "\n     ${localout[$i]} :  ${pathout[$i]}"
2171    done
2172    (( i = 0 ))
2173    while (( i < iic ))
2174    do
2175       (( i = i + 1 ))
2176       if (( i == 1 ))
2177       then
2178          printf "\n\n >>> INPUT-commands:\n"
2179       fi
2180       printf "\n     ${in_command[$i]}" 
2181    done
2182    (( i = 0 ))
2183    while (( i < ioc ))
2184    do
2185       (( i = i + 1 ))
2186       if (( i == 1 ))
2187       then
2188          printf "\n\n >>> OUTPUT-commands:\n"
2189       fi
2190       printf "\n     ${out_command[$i]}" 
2191    done
2192 fi
2193
2194
2195    # ABFRAGEN BEI AUFRUF AUF LOKALER MASCHINE
2196 if [[ $remotecall = false  &&  $silent = false  &&  $jobmo != BATCH ]]
2197 then
2198    antwort=dummy
2199    printf "\n\n"
2200    while [[ "$antwort" != y  &&  "$antwort" != Y  &&  "$antwort" != n  &&  "$antwort" != N ]]
2201    do
2202       printf " >>> everything o.k. (y/n) ?  "
2203       read  antwort
2204    done
2205    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
2206    then
2207       locat=user_abort; (( iec = 0 )); exit
2208    fi
2209    if [[ $do_batch = true ]]
2210    then
2211       printf " >>> batch-job will be created and submitted"
2212    else
2213       if [[ $local_compile = false ]]
2214       then
2215          printf " >>> MRUN will now continue to execute on this machine"
2216       else
2217          printf " >>> a test compilation will now be carried out on this machine"
2218       fi
2219    fi
2220 fi
2221 
2222
2223
2224
2225     # FALLS AUF DIESER MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
2226     # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
2227 if [[ $do_batch = false ]]
2228 then
2229
2230
2231       # TEMPORAEREN KATALOG ERZEUGEN
2232    mkdir -p  $TEMPDIR
2233    chmod  go+rx  $TEMPDIR
2234    tmpcreate=true
2235
2236
2237       # SAEMTLICHE QUELLTEXT-DATEIEN BZW. AUSFUEHRBARES PROGRAMM IN
2238       # TEMPORAERES VERZEICHNIS KOPIEREN
2239    if [[ $do_compile = true ]]
2240    then
2241
2242          # ON NEC, COMPILATION IS DONE ON HOST CROSS VIA CROSS COMPILING
2243          # CREATE A TEMPORARY DIRECTORY ON THAT MACHINE (HOME MOUNTED VIA NFS)
2244       if [[ $localhost = nech ]]
2245       then
2246          TEMPDIR_COMPILE=$HOME/work/${usern}.$kennung
2247          if  mkdir -p  $TEMPDIR_COMPILE
2248          then
2249             printf "\n  *** \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2250             printf "\n      is generated as temporary directory for cross compiling\n"
2251          else
2252             printf "\n  +++ creating directory \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2253             printf "\n      needed for cross compilation failed"
2254             locat=compile
2255             exit
2256          fi
2257       else
2258          TEMPDIR_COMPILE=$TEMPDIR
2259       fi
2260
2261
2262          # PFADNAMEN FUER DAS MAKE-DEPOSITORY ERMITTELN
2263       line=""
2264       grep "%depository_path" $config_file  >  tmp_mrun
2265       while read line
2266       do
2267          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2268          then
2269             if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f3)" = "" ]]
2270             then
2271                global_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2272             fi
2273          fi
2274       done < tmp_mrun
2275
2276       line=""
2277       grep  " $localhost" $config_file | grep "%depository_path"  >  tmp_mrun
2278       while read line
2279       do
2280          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2281          then
2282             if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f4)" = "$cond1"  &&  "$(echo $line | cut -d" " -s -f5)" = "$cond2" ]]
2283             then
2284                local_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2285             fi
2286          fi
2287       done < tmp_mrun
2288
2289       if [[ "$local_depository_path" = "" ]]
2290       then
2291          if [[ "$global_depository_path" != "" ]]
2292          then
2293             local_depository_path=$global_depository_path
2294          else
2295             printf "\n\n  +++ no depository path found in configuration file"
2296             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
2297             printf "\n      please set \"\%depository_path\" in configuration file\n"
2298             locat=config_file; exit
2299          fi
2300       fi
2301       eval local_depository_path=$local_depository_path
2302       [[ "$cond1" != "" ]]  &&  local_depository_path=${local_depository_path}_$cond1
2303       [[ "$cond2" != "" ]]  &&  local_depository_path=${local_depository_path}_$cond2
2304
2305
2306       basename=`print $mainprog | cut -f1 -d"."`
2307       eval make_depository=${local_depository_path}/${basename}_current_version.tar
2308       if [[ ! -f $make_depository ]]
2309       then
2310          printf "\n"
2311          printf "\n  *** WARNING: make depository \"$make_depository\" not found"
2312          printf "\n               \"make\" will fail, if the Makefile or other source files are missing\n"
2313       else
2314          cp  $make_depository  $TEMPDIR_COMPILE
2315          cd  $TEMPDIR_COMPILE
2316          tar -xf  $make_depository  >  /dev/null  2>&1
2317          cd -  > /dev/null
2318       fi
2319
2320       cp  SOURCES_FOR_RUN_$fname/*  $TEMPDIR_COMPILE
2321
2322          # FALLS USER-INTERFACE VORHANDEN UND AUF DATEI MIT ANDEREM NAMEN
2323          # ALS user_interface.f90 LIEGT, DIESEN GEAENDERTEN NAMEN INS
2324          # MAKEFILE EINTRAGEN
2325#       cd  $TEMPDIR_COMPILE
2326#       interface_file=`grep -l "END SUBROUTINE user_parin" $source_list`
2327#       if [[ "$interface_file" != "" ]]
2328#       then
2329#          interface_file=`echo $interface_file | cut -d"." -f1`
2330#          mv  Makefile  Makefile_old
2331#          sed "s/user_interface/$interface_file/g"  Makefile_old  >  Makefile
2332#       fi
2333#       cd -  > /dev/null
2334    else
2335       cp  $executable   ${TEMPDIR}/a.out
2336    fi
2337
2338
2339       # WECHSEL IN TEMPORAEREN KATALOG
2340    cd $TEMPDIR
2341    printf "\n  *** changed to temporary directory: $TEMPDIR"
2342
2343
2344       # OUTPUT-DATEI-VERBINDUNGEN AUF TEMPORAERER DATEI ABLEGEN
2345       # DIESE DATEI KANN VON SPAETER AUFZURUFENDEN BENUTZERPROZEDUREN GELESEN
2346       # WERDEN, UM ZU LOKALEN DATEINAMEN GEHOERENDE PERMANENTE NAMEN ZU
2347       # ERMITTELN
2348    (( i = 0 ))
2349    while (( i < iout ))
2350    do
2351       (( i = i + 1 ))
2352       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = tra  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
2353       then
2354          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2355       else
2356          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${frelout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2357       fi
2358    done
2359
2360
2361       # EVTL. UEBERSETZUNGSAKTIONEN STARTEN
2362    if [[ $do_compile = true ]]
2363    then
2364
2365
2366          # COMPILING WITH MAKE (ON NEC COMPILER IS CALLED ON HOST CROSS)
2367       printf "\n\n\n  *** compilation starts \n$striche\n"
2368       printf "  *** compilation with make using following options:\n"
2369       printf "      make depository:          $make_depository"
2370       printf "      compilername:             $compiler_name\n"
2371       printf "      options:                  $fopts\n"
2372       printf "      preprocessor-directives:  $cpp_options \n"
2373       printf "      linker-options:           $lopts \n"
2374       printf "      source code files:        $source_list \n"
2375
2376       if [[ $localhost = nech ]]
2377       then
2378          ssh  136.172.44.192 -l $usern ". /SX/opt/etc/initsx.sh; cd \$HOME/work/${usern}.$kennung; sxmake -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2379          cp  $TEMPDIR_COMPILE/a.out  .
2380          [[ $? != 0 ]]  &&  compile_error=true
2381          rm -rf  $TEMPDIR_COMPILE
2382       elif [[ $localhost = lcsgib ]]
2383       then
2384          printf "      compiler is called via ssh on \"bicegate\" using module \"$mpilib\" \n"
2385          ssh  130.73.232.102  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load $mpilib; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2386          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
2387          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
2388       elif [[ $localhost = lcsgih ]]
2389       then
2390          printf "      compiler is called via ssh on \"hicegate2\" using module \"$mpilib\" \n"
2391          ssh  130.75.4.103  -l $usern  ". /usr/share/modules/init/bash; module load $mpilib; cd $TEMPDIR; make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" 2>&1 "
2392          [[ ! -f a.out ]]  &&  compile_error=true
2393          continue   # ANDERENFALLS IST STATUS=1, FALLS A.OUT VORHANDEN
2394       else
2395          [[ $localhost = lctit ]]  &&  export LM_LICENSE_FILE=27050@tggls
2396          make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT="$cpp_options"  F90FLAGS="$fopts"  LDFLAGS="$lopts"
2397       fi
2398
2399       if [[ $? != 0  ||  "$compile_error" = true  ||  "$module_compile_error" = true ]]
2400       then
2401          printf "\n  +++ error occured while compiling or linking"
2402          locat=compile
2403
2404  # WORKAROUND: REMOVE IF CONSTRUCT LATER, BUT KEEP THE EXIT!
2405#          if [[ $localhost != lcsgib  &&  $localhost != lcsgih ]]
2406#          then
2407             exit
2408#          else
2409#             locat=normal
2410#          fi
2411       else
2412          printf "$striche\n  *** compilation finished \n"
2413       fi
2414    fi
2415
2416
2417       # FALLS NUR TESTWEISE KOMPILIERT WERDEN SOLLTE, IST MRUN JETZT FERTIG
2418    if [[ $local_compile = true ]]
2419    then
2420       cd  $HOME
2421       rm -rf $TEMPDIR
2422       locat=local_compile; exit
2423    fi
2424
2425
2426       # BEREITSTELLEN DER INPUT-DATEIEN
2427       # SCHLEIFE UEBER ALLE VOM BENUTZER ANGEGEBENEN DATEIEN
2428    (( i = 0 ))
2429    while (( i < iin ))
2430    do
2431       (( i = i + 1 ))
2432       if (( i == 1 ))
2433       then
2434          printf "\n\n  *** providing INPUT-files:\n$striche"
2435       fi
2436
2437
2438          # OPTIONALE DATEIEN BEI NICHTVORHANDENSEIN UEBERGEHEN
2439       if [[ "${transin[$i]}" = unavailable ]]
2440       then
2441          if [[ "${extin[$i]}" = ""  ||  "${extin[$i]}" = " " ]]
2442          then
2443             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}\" "
2444             printf "\n               is not available!"
2445          else
2446             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}.${extin[$i]}\" "
2447             printf "\n               is not available!"
2448          fi
2449          continue
2450       fi
2451
2452          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2453       files_for_pes=false; datentyp=file
2454       if [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2455       then
2456          files_for_pes=true; datentyp=directory
2457          actionin[$i]=""
2458       elif [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2459       then
2460          actionin[$i]=""
2461       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2462       then
2463          files_for_pes=true; datentyp=directory
2464          actionin[$i]="ar"
2465       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2466       then
2467          actionin[$i]="ar"
2468       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2469       then
2470          files_for_pes=true; datentyp=directory
2471          actionin[$i]="fl"
2472       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2473       then
2474          actionin[$i]="fl"
2475       fi
2476
2477       if [[ $files_for_pes = true ]]
2478       then
2479          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}/....  to  ${localin[$i]}"
2480       else
2481          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}  to  ${localin[$i]}"
2482       fi
2483
2484          # INPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. ES WIRD GEPRUEFT,
2485          # OB DIESE DATEI NOCH AUF DEM TEMPORAEREN DATENKATALOG VORHANDEN
2486          # IST. FALLS NICHT, WIRD VERSUCHT, SIE ANSCHLIESSEND VOM ARCHIV-
2487          # SERVER ZU HOLEN
2488       if [[ "${actionin[$i]}" = fl ]]
2489       then
2490          printf "\n      $datentyp will be fetched from temporary directory \"${tmp_data_catalog}\" !"
2491          if [[ $files_for_pes = false ]]
2492          then
2493             if [[ -f "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2494             then
2495                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2496                got_tmp[$i]=true
2497             elif [[ -f "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2498             then
2499                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2500                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2501                cp  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2502             else
2503                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2504                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2505                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2506                actionin[$i]=ar
2507             fi
2508          else
2509             if [[ -d "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2510             then
2511                mkdir  ${localin[$i]}
2512                cd $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2513                for file in $(ls *)
2514                do
2515                   ln $file $TEMPDIR/${localin[$i]}
2516                done
2517                cd $TEMPDIR
2518                got_tmp[$i]=true
2519             elif [[ -d "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2520             then
2521                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2522                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2523                cp -r  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2524             else
2525                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2526                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2527                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2528                actionin[$i]=ar
2529             fi
2530          fi
2531       fi
2532
2533
2534          # DATEI LIEGT AUF ARCHIV-SERVER
2535       if [[ "${actionin[$i]}" = ar ]]
2536       then
2537
2538          if [[ $files_for_pes = false ]]
2539          then
2540             printf "\n      file will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2541          else
2542             printf "\n      directory will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2543          fi
2544
2545          file_restored=false
2546
2547          if [[ $archive_system = asterix ]]
2548          then
2549             do_stagein=true
2550             (( stagein_anz = 0 ))
2551             while [[ $do_stagein = true ]]
2552             do
2553                if [[ $files_for_pes = false ]]
2554                then
2555                   stagein  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2556                else
2557                   stagein  -t  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2558                fi
2559                cat  STAGEIN_OUTPUT
2560                if [[ $(grep -c "st.msg:i24"  STAGEIN_OUTPUT) != 0 ]]
2561                then
2562                   file_restored=true
2563                   do_stagein=false
2564                else
2565                   (( stagein_anz = stagein_anz + 1 ))
2566                   if (( stagein_anz == 10 ))
2567                   then
2568                      printf "\n  +++ stagein stoped after 10 tries"
2569                      locat=stage
2570                      exit
2571                   fi
2572                   printf "\n  +++ restoring from archive failed, trying again:"
2573                   sleep 900
2574                fi
2575             done
2576          elif [[ $archive_system = DMF ]]
2577          then
2578             if [[ $files_for_pes = false ]]
2579             then
2580                printf "\n  +++ restoring of single files impossible with $archive_system !\n"
2581                locat=DMF
2582                exit
2583             else
2584                find  $ARCHIVE/${frelin[$i]}  -type m  -print  |  dmget
2585                cp  -r $ARCHIVE/${frelin[$i]}  $PWD
2586                file_restored=true
2587             fi
2588          elif [[ $archive_system = tivoli ]]
2589          then
2590             if [[ $files_for_pes = false ]]
2591             then
2592                if [[ $localhost = ibmh ]]
2593                then
2594                   ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2595                else
2596                   ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2597                fi
2598             else
2599                (( inode = 0 ))
2600                while (( inode < nodes ))
2601                do
2602                   if [[ $localhost = ibmh ]]
2603                   then
2604                      ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2605                   else
2606                      ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2607                   fi
2608                   (( inode = inode + 1 ))
2609                done
2610             fi
2611             file_restored=true
2612          elif [[ $archive_system = ut ]]
2613          then
2614             if [[ $files_for_pes = false ]]
2615             then
2616                cp  $UT/${frelin[$i]}  .
2617             else
2618                (( inode = 0 ))
2619                while (( inode < nodes ))
2620                do
2621                   tar  xf  $UT/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar
2622                   (( inode = inode + 1 ))
2623                done
2624             fi
2625             file_restored=true
2626          else
2627             printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"   restore impossible!"
2628             locat=rearchive
2629             exit
2630          fi
2631
2632          if [[ $file_restored = true ]]
2633          then
2634
2635                # DATEI AUCH AUF TEMPORAERES DATENVERZEICHNIS LEGEN, DAMIT
2636                # SIE BEI WEITEREN ZUGRIFFEN NOCH VORHANDEN IST
2637             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog; chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
2638             if [[ $files_for_pes = false ]]
2639             then
2640                ln  -f  ${frelin[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2641             else
2642                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2643                ln  -f  ${frelin[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2644             fi
2645             got_tmp[$i]=true
2646
2647                # DATEI UNTER LOKALEM NAMEN ZUR VERFUEGUNG STELLEN
2648             mv  ${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2649
2650          fi
2651       fi
2652
2653
2654          # DATEI LIEGT IM VOM BENUTZER ANGEGEBENEN VERZEICHNIS
2655       if [[ "${actionin[$i]}" = ""  ||  "${actionin[$i]}" = "di"  ||  "${actionin[$i]}" = "npe" ]]
2656       then
2657
2658          if [[ "${actionin[$i]}" = "npe"  &&  -n $numprocs ]]
2659          then
2660
2661                # DATEI WIRD FUER DIE PROZESSOREN EINES PARALLERECHNERS BEREITGESTELLT
2662             printf "\n      file will be provided for $numprocs processors"
2663             mkdir  ${localin[$i]}
2664             ival=$numprocs
2665             (( ii = 0 ))
2666             while (( ii <= ival-1 ))
2667             do
2668                if (( ii < 10 ))
2669                then
2670                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_000$ii
2671                elif (( ii < 100 ))
2672                then
2673                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_00$ii
2674                elif (( ii < 1000 ))
2675                then
2676                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_0$ii
2677                else
2678                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_$ii
2679                fi
2680                (( ii = ii + 1 ))
2681             done
2682
2683          else
2684
2685             if [[ $files_for_pes = true ]]
2686             then
2687
2688                   # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
2689                   # DATEIEN WERDEN BEREITGESTELLT, INDEM ZUERST DER GESAMTE
2690                   # KATALOGINHALT KOPIERT UND DANN DIE EINZELNEN DATEIEN
2691                   # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
2692                printf "\n      providing $numprocs files for the respective processors"
2693                mkdir  ${localin[$i]}
2694                if [[ $link_local_input = true ]]
2695                    then
2696                    printf "      using ln -f\n"
2697                    cd ${absnamein[$i]}
2698                    for file in $(ls *)
2699                      do
2700                      ln -f $file  ${localin[$i]}
2701                    done
2702                    cd $TEMPDIR
2703                fi
2704                # If "ln -f" fails of if "$link_local_input = false" do a normal "cp -r"
2705                if [[ ! -f "${localin[$i]}/_0000" ]]
2706                    then
2707                    if [[ $link_local_input = true ]]
2708                        then
2709                        printf "      ln failed for .../_0000, using cp...\n"
2710                    fi
2711                    cp -r  ${absnamein[$i]}/*  ${localin[$i]}
2712                fi
2713
2714             else
2715                   # BEREITSTELLUNG AUF EINPROZESSORRECHNERN
2716                if [[ $link_local_input = true ]]
2717                then
2718                    printf "      using ln -f\n"
2719                    ln -f  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2720                fi
2721                # If "ln -f" fails of if "$link_local_input = false" do a normal "cp"
2722                if [[ ! -f "${localin[$i]}" ]]
2723                then
2724                    if [[ $link_local_input = true ]]
2725                    then
2726                        printf "      ln failed, using cp...\n"
2727                    fi
2728                    cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2729                fi
2730             fi
2731          fi
2732       fi
2733
2734    done
2735    if (( i != 0 ))
2736    then
2737       printf "\n$striche\n  *** all INPUT-files provided \n"
2738    fi
2739
2740
2741       # NAMELIST-DATEI MIT WERTEN VON ENVIRONMENT-VARIABLEN ERZEUGEN (ZU
2742       # LESEN VON PALM)
2743    cat  >  ENVPAR  <<  %%END%%
2744 &envpar  run_identifier = '$fname', host = '$localhost',
2745          write_binary = '$write_binary', tasks_per_node = $tasks_per_node,
2746          maximum_cpu_time_allowed = ${cpumax}.,
2747          revision = '$global_revision' /
2748
2749%%END%%
2750
2751
2752       # EVENTUELLE INPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2753    (( i = 0 ))
2754    while (( i < iic ))
2755    do
2756       (( i = i + 1 ))
2757       if (( i == 1 ))
2758       then
2759          printf "\n\n  *** execution of INPUT-commands:\n$striche"
2760       fi
2761       printf "\n  >>> ${in_command[$i]}"
2762       eval  ${in_command[$i]}
2763       if (( i == iic ))
2764       then
2765          printf "\n$striche\n"
2766       fi
2767    done
2768
2769
2770       # VERBLEIBENDE CPU-ZEIT BERECHNEN
2771    cpurest=${cpumax}.
2772
2773
2774       # PROGRAMMSTART
2775    printf "\n\n  *** execution starts in directory\n      \"`pwd`\"\n$striche\n"
2776    PATH=$PATH:$TEMPDIR
2777
2778    if [[ "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ]]
2779    then
2780       if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH ]]
2781       then
2782          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-5) != lcsgi ]]
2783          then
2784             printf "\n  +++ debug is allowed in interactive mode only"
2785             locat=debug
2786             exit
2787          fi
2788       fi
2789       if [[ $localhost = decalpha ]]
2790       then
2791          dxladebug  a.out
2792       elif [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
2793       then
2794
2795             # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2796          export MP_SHARED_MEMORY=yes
2797          export AIXTHREADS_SCOPE=S
2798          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2799          export AUTHSTATE=files
2800          export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2801
2802             # FOLLOWING OPTIONS ARE MANDATORY FOR TOTALVIEW
2803          export MP_ADAPTER_USE=shared
2804          export MP_CPU_USE=multiple
2805          export MP_TIMEOUT=1200
2806
2807          unset  MP_TASK_AFFINITY
2808
2809             # SO FAR, TOTALVIEW NEEDS HOSTFILE MECHANISM FOR EXECUTION
2810          #(( ii = 1 ))
2811          #while (( ii <= $numprocs ))
2812          #do
2813          #   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2814          #   (( ii = ii + 1 ))
2815          #done
2816          #export MP_HOSTFILE=hostfile
2817
2818          if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2819          then
2820             totalview   poe  a.out  $ROPTS
2821          else
2822             echo totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2823             export TVDSVRLAUNCHCMD=ssh
2824             totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2825          fi
2826       elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-5) = lcsgi ]]
2827       then
2828             # CURRENTLY NO DEBUGGER ON LCSGI
2829          if [[ $run_coupled_model = true ]]
2830          then
2831             printf "\n  +++ no debug in coupled mode available on \"$localhost\" "
2832             locat=debug
2833             exit
2834          else
2835             echo "no_coupling"  >  runfile_atmos
2836          fi
2837          (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
2838          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2839          echo "OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"
2840          if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2841          then
2842             printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
2843          fi
2844          printf "\n\n"
2845          if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
2846          then
2847#             export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
2848             if [[ "$totalview" = true ]]
2849             then
2850                printf "\n     running totalview debugger"
2851                mpiexec_mpt -tv -n $ii   ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2852             else
2853                mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2854             fi
2855          elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
2856          then
2857#             ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
2858#             export MV2_NUM_PORTS=2
2859#             export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
2860             mpiexec    ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
2861          fi
2862       else 
2863          printf "\n  +++ no debug available on \"$localhost\" "
2864          printf "\n      or not implemented in mrun so far"
2865          locat=debug
2866          exit
2867       fi
2868    else
2869       if [[ -n $numprocs ]]
2870       then
2871
2872             # RUNNING THE PROGRAM ON PARALLEL MACHINES
2873          if [[ $(echo $host | cut -c1-3) = ibm ]]
2874          then
2875                # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2876             export MP_SHARED_MEMORY=yes
2877             export AIXTHREAD_SCOPE=S
2878             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2879             export XLSMPOPTS="spins=0:yields=0:stack=20000000"
2880             export AUTHSTATE=files
2881             export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2882             #  export MP_PRINTENV=yes
2883
2884                # TUNING-VARIABLEN ZUR VERBESSERUNG DER KOMMUNIKATION
2885                # ZEIGEN ABER DERZEIT (SEP 04, FEDERATION) KAUM WIRKUNG
2886             export MP_WAIT_MODE=poll
2887             [[ $node_usage = not_shared ]]  &&  export MP_SINGLE_THREAD=yes
2888#             export MP_EAGER_LIMIT=65535
2889
2890#                # TESTWEISE FUER TURBOMPI (JAN 05)
2891#             export MPJ_MTAB=128
2892#             export MPJ_ALLTOALL=1
2893#             export MPJ_ALLTOALLV=1
2894
2895             if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2896             then
2897                printf "\n--- Control: OMP_NUM_THREADS = \"$OMP_NUM_THREADS\" \n"
2898                if [[ "$cond1" = hpmcount  ||  "$cond2" = hpmcount ]]
2899                then
2900                   /opt/optibm/HPM_2_4_1/bin/hpmcount  a.out  $ROPTS
2901                else
2902                   poe ./a.out  $ROPTS
2903                fi
2904             else
2905                if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms ]]
2906                then
2907                   poe  a.out  -procs $numprocs  -nodes 1  -rmpool 0  $ROPTS
2908                elif [[ $localhost = ibmy ]]
2909                then
2910                   if [[ -f $hostfile ]]
2911                   then
2912                      cp  $hostfile  hostfile
2913                   else
2914                      (( ii = 1 ))
2915                      while (( ii <= $numprocs ))
2916                      do
2917                         echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2918                         (( ii = ii + 1 ))
2919                      done
2920                   fi
2921                   export MP_HOSTFILE=hostfile
2922                   ./a.out  -procs $tasks_per_node  $ROPTS
2923                else
2924                   if [[ "$host_file" = "" ]]
2925                   then
2926                      printf "\n  +++ no hostfile given in configuration file"
2927                      locat=config_file
2928                      exit
2929                   else
2930                      eval host_file=$host_file
2931                   fi
2932                   export MP_HOSTFILE=$host_file
2933                   poe  a.out  -procs $numprocs  -tasks_per_node $numprocs  $ROPTS
2934                fi
2935             fi
2936          elif [[ $host = nech  ||  $host = neck ]]
2937          then
2938             (( ii = nodes ))
2939             if [[ $ii = 1 ]]
2940             then
2941                export F_ERRCNT=0        # acceptable number of errors before program is stopped
2942                export MPIPROGINF=YES
2943                #  export F_TRACE=YES|FMT1|FMT2  # output of ftrace informations to job protocol
2944                echo "*** execution on single node with mpirun"
2945                mpirun  -np $numprocs  ./a.out  $ROPTS
2946             else
2947                (( i = 0 ))
2948                while (( i < ii ))
2949                do
2950                   echo "-h $i  -p $tasks_per_node  -e ./mpi_exec_shell"  >>  multinode_config
2951                   (( i = i + 1 ))
2952                done
2953
2954                echo "#!/bin/sh"                         >   mpi_exec_shell
2955                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2956                echo "set -u"                            >>  mpi_exec_shell
2957                echo "F_ERRCNT=0"                        >>  mpi_exec_shell
2958                echo "MPIPROGINV=YES"                    >>  mpi_exec_shell
2959                echo "OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task" >>  mpi_exec_shell
2960                echo "cpurest=$cpurest"                  >>  mpi_exec_shell
2961                echo "fname=$fname"                      >>  mpi_exec_shell
2962                echo "localhost=$localhost"              >>  mpi_exec_shell
2963                echo "return_addres=$return_addres"      >>  mpi_exec_shell
2964                echo "return_username=$return_username"  >>  mpi_exec_shell
2965                echo "tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  mpi_exec_shell
2966                echo "write_binary=$write_binary"        >>  mpi_exec_shell
2967                echo "use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2968                echo "  "                                >>  mpi_exec_shell
2969                echo "export F_ERRCNT"                   >>  mpi_exec_shell
2970                echo "export MPIPROGINV"                 >>  mpi_exec_shell
2971                echo "export OMP_NUM_THREADS"            >>  mpi_exec_shell
2972                echo "export cpurest"                    >>  mpi_exec_shell
2973                echo "export fname"                      >>  mpi_exec_shell
2974                echo "export localhost"                  >>  mpi_exec_shell
2975                echo "export return_addres"              >>  mpi_exec_shell
2976                echo "export return_username"            >>  mpi_exec_shell
2977                echo "export tasks_per_node"             >>  mpi_exec_shell
2978                echo "export write_binary"               >>  mpi_exec_shell
2979                echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2980                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2981                echo "exec  ./a.out"                     >>  mpi_exec_shell
2982
2983                chmod u+x  mpi_exec_shell
2984                export MPIPROGINF=YES
2985                mpirun  -f multinode_config  &
2986                wait
2987
2988             fi
2989          elif [[ $(echo $host | cut -c1-2) = lc  &&  $host != lctit ]]
2990          then
2991
2992                # COPY HOSTFILE FROM SOURCE DIRECTORY OR CREATE IT, IF IT
2993                # DOES NOT EXIST
2994             if [[ $host != lcsgih  &&  $host != lcsgib ]]
2995             then
2996                if [[ -f $hostfile ]]
2997                then
2998                   cp  $hostfile  hostfile
2999                else
3000                   (( ii = 1 ))
3001                   while (( ii <= $numprocs / $threads_per_task ))
3002                   do
3003                      echo  $localhost_realname  >>  hostfile
3004                      (( ii = ii + 1 ))
3005                   done
3006                fi
3007                eval zeile=\"`head -n $ii  hostfile`\"
3008                printf "\n  *** running on: $zeile"
3009             fi
3010
3011             (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
3012             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
3013             echo "OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"
3014             if [[ $threads_per_task != 1 ]]
3015             then
3016                printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
3017             fi
3018             if [[ $run_coupled_model = false ]]
3019             then
3020                echo "no_coupling"  >  runfile_atmos
3021                printf "\n\n"
3022                if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
3023                then
3024                   if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
3025                   then
3026#                      export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
3027                      mpiexec_mpt -np $ii   ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
3028                   elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
3029                   then
3030#                      ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
3031#                      export MV2_NUM_PORTS=2
3032#                      export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
3033                      mpiexec    ./a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
3034                   fi
3035                elif [[ $host = lcxt4 ]]
3036                then
3037                   aprun  -n $ii  -N $tasks_per_node  a.out  $ROPTS  < runfile_atmos
3038                else
3039                   mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  < runfile_atmos  $ROPTS
3040                fi
3041             else
3042
3043                    # currently there is no full MPI-2 support on ICE and XT4
3044                (( iia = $numprocs_atmos / $threads_per_task ))
3045                (( iio = $numprocs_ocean / $threads_per_task ))
3046                printf "\n      coupled run ($iia atmosphere, $iio ocean)"
3047                printf "\n      using $coupled_mode coupling"
3048                printf "\n\n"
3049
3050                if [[ $coupled_mode = "mpi2" ]]
3051                then
3052                   echo "atmosphere_to_ocean $iia $iio"  >  runfile_atmos
3053                   echo "ocean_to_atmosphere $iia $iio"  >  runfile_ocean
3054                   if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
3055                   then
3056
3057                      if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
3058                      then
3059#                         export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
3060                         mpiexec_mpt -np $iia  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
3061                         mpiexec_mpt -np $iio  ./a.out  $ROPTS < runfile_ocean &
3062                      elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
3063                      then
3064#                         ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
3065#                         export MV2_NUM_PORTS=2
3066#                         export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
3067                         mpiexec -n $iia  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos &
3068                         mpiexec -n $iio  ./a.out  $ROPTS < runfile_ocean &
3069                      fi
3070
3071                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
3072                   then
3073
3074                      aprun  -n $iia  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS  &
3075                      aprun  -n $iio  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_ocean  $ROPTS  &
3076
3077                   else
3078                          # WORKAROUND BECAUSE mpiexec WITH -env option IS NOT AVAILABLE ON SOME SYSTEMS
3079                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iia  a.out  $ROPTS  <  runfile_atmos &
3080                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iio  a.out  $ROPTS  <  runfile_ocean &
3081#                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iia  -env coupling_mode atmosphere_to_ocean  a.out  $ROPTS  &
3082#                       mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iio  -env coupling_mode ocean_to_atmosphere  a.out  $ROPTS  &
3083                   fi
3084                   wait
3085
3086                else
3087
3088                   echo "coupled_run $iia $iio"  >  runfile_atmos
3089                   if [[ $host = lcsgih  ||  $host = lcsgib ]]
3090                   then
3091
3092                      if [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mpt ]]
3093                      then
3094#                         export MPI_LAUNCH_TIMEOUT=360
3095                         mpiexec_mpt -np $ii  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos
3096                      elif [[ $( echo $mpilib | cut -c1-3 ) = mva ]]
3097                      then
3098#                         ulimit -s 300000   # A too large stack size causes problems
3099#                         export MV2_NUM_PORTS=2
3100#                         export MV2_CPU_MAPPING=0:1:2:3
3101                         mpiexec  ./a.out  $ROPTS < runfile_atmos
3102                      fi
3103
3104                   elif [[ $host = lcxt4 ]]
3105                   then
3106
3107                      aprun  -n $ii  -N $tasks_per_node  a.out < runfile_atmos  $ROPTS
3108
3109                   fi
3110                   wait
3111                fi
3112
3113#             if [[ $scirocco = true ]]
3114#             then
3115#                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS
3116#             else
3117#                mpirun  -machinefile hostfile  -np $ii  a.out  $ROPTS
3118#             fi
3119             fi
3120          elif [[ $host = decalpha ]]
3121          then
3122             dmpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
3123          elif [[ $host = lctit ]]
3124          then
3125             export runfile=runfile.$kennung
3126
3127             echo "cd $PWD"                                  >   $runfile
3128             echo "export OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"  >>  $runfile
3129             echo "export cpurest=$cpurest"                  >>  $runfile
3130             echo "export fname=$fname"                      >>  $runfile
3131             echo "export localhost=$localhost"              >>  $runfile
3132             echo "export return_addres=$return_addres"      >>  $runfile
3133             echo "export return_username=$return_username"  >>  $runfile
3134             echo "export tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  $runfile
3135             echo "export write_binary=$write_binary"        >>  $runfile
3136             echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  $runfile
3137             echo "./a.out"                                  >>  $runfile
3138             chmod  u+x  $runfile
3139
3140             if [[ "$QUEUE" = interactive ]]
3141             then
3142                mpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
3143             else
3144                 (( mem_tsubame = $memory / 1024.0 ))
3145                 echo "Memory for Tsubame for each process in GB:", $mem_tsubame
3146#                n1ge  -fore  -g 1S060156  -mpi $numprocs  -mem 4  -N palm  -q $queue  a.out  $ROPTS
3147               /n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge -fore -g $group_number -mpi ${numprocs}:$tasks_per_node -mem $mem_tsubame -N palm -rt $minuten -q $queue  a.out  $ROPTS
3148             fi
3149
3150             rm  $runfile
3151          else
3152             mpprun  -n $numprocs  a.out  $ROPTS
3153          fi
3154          [[ $? != 0 ]]  &&  execution_error=true
3155
3156
3157             # PERFORMANCE-AUSWERTUNG MIT APPRENTICE
3158          if [[ "$cond1" = apprentice  ||  "$cond2" = apprentice ]]
3159          then
3160             apprentice
3161          fi
3162       else
3163          a.out  $ROPTS
3164       fi
3165    fi
3166    if [[ $? != 0  ||  $execution_error = true ]]
3167    then
3168
3169          # ABBRUCH BEI LAUFZEITFEHLER
3170#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
3171       printf "\n  +++ runtime error occured"
3172       locat=execution
3173       exit
3174    else
3175#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
3176       printf "\n$striche\n  *** execution finished \n"
3177    fi
3178
3179
3180
3181       # EVENTUELLE OUTPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
3182    (( i = 0 ))
3183    while (( i < ioc ))
3184    do
3185       (( i = i + 1 ))
3186       if (( i == 1 ))
3187       then
3188          printf "\n\n  *** execution of OUTPUT-commands:\n$striche"
3189       fi
3190       printf "\n  >>> ${out_command[$i]}"
3191       eval  ${out_command[$i]}
3192       if (( i == ioc ))
3193       then
3194          printf "\n$striche\n"
3195       fi
3196    done
3197
3198
3199       # EVTL. INHALT DES AKTUELLEN VERZEICHNISSES AUSGEBEN
3200    if [[ $do_trace = true ]]
3201    then
3202       printf "\n\n"
3203       ls -al
3204    fi
3205
3206
3207
3208       # OUTPUT-DATEIEN AN IHRE ZIELORTE KOPIEREN
3209    (( i = 0 ))
3210    while (( i < iout ))
3211    do
3212       (( i = i + 1 ))
3213       if (( i == 1 ))
3214       then
3215          printf "\n\n  *** saving OUTPUT-files:\n$striche"
3216       fi
3217
3218          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
3219       files_for_pes=false; filetyp=file
3220       if [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
3221       then
3222          files_for_pes=true; filetyp=directory
3223          actionout[$i]=""
3224       elif [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
3225       then
3226          actionout[$i]=""
3227       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
3228       then
3229          files_for_pes=true; filetyp=directory
3230          actionout[$i]="ar"
3231       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3232       then
3233          actionout[$i]="ar"
3234       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
3235       then
3236          files_for_pes=true; filetyp=directory
3237          actionout[$i]="fl"
3238       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3239       then
3240          actionout[$i]="fl"
3241       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  -n $numprocs ]]
3242       then
3243          files_for_pes=true; filetyp=directory
3244          actionout[$i]="tr"
3245       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  ! -n $numprocs ]]
3246       then
3247          actionout[$i]="tr"
3248       fi
3249
3250       if [[ ! -f ${localout[$i]}  &&  $files_for_pes = false ]]
3251       then
3252          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}  does not exist\n"
3253       elif [[ ! -f ${localout[$i]}/_0000  &&  $files_for_pes = true ]]
3254       then
3255          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}/....  does not exist\n"
3256       else
3257
3258
3259             # KOPIEREN PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3260             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3261             # REMOTE-RECHNUNGEN
3262          if [[ "${actionout[$i]}" = tr ]]
3263          then
3264             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3265             then
3266                if [[ $files_for_pes = false ]]
3267                then
3268                   cps=""
3269                   cst=""
3270                else
3271                   cps=-c
3272                   cst="/"
3273                fi
3274                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3275                then
3276
3277                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3278                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3279                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3280                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3281                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3282                   then
3283                      ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3284                   else
3285                      mkdir  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3286                      ln  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3287                   fi
3288
3289                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3290                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3291
3292                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP in seperate job to"
3293                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst"
3294                   printf "\n              or higher cycle\n"
3295                   echo "batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3296
3297                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3298
3299                   if [[ $localhost = nech ]]
3300                   then
3301                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3302                   else
3303                      if [[ "$LOGNAME" = b323013 ]]
3304                      then
3305                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3306                      else
3307                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3308                      fi
3309                   fi
3310
3311                else
3312
3313                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3314                   transfer_failed=false
3315                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP to"
3316                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst\n"
3317                   batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3318                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3319
3320                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3321                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3322                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3323                   then
3324                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3325                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3326
3327                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3328                         # ANLEGEN.
3329                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3330                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3331                      then
3332                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3333                         printf "      $local_catalog \n"
3334                         mkdir -p  $local_catalog
3335                      fi
3336                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3337                      transfer_problems=true
3338                   fi
3339                fi
3340             else
3341
3342                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR KOPIERT WIRD
3343                actionout[$i]=""
3344             fi
3345          fi
3346
3347
3348             # APPEND PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3349             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3350             # REMOTE-RECHNUNGEN
3351          if [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
3352          then
3353             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3354             then
3355                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3356                then
3357
3358                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3359                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3360                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3361                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3362                   ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3363
3364                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3365                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3366
3367                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP in seperate job to"
3368                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3369                   printf "\n              or higher cycle\n"
3370                   echo "batch_scp -A -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3371
3372                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3373
3374                   if [[ $localhost = nech ]]
3375                   then
3376                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3377                   else
3378                      if [[ $LOGNAME = b323013 ]]
3379                      then
3380                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3381                      else
3382                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  -c $job_catalog  transfer_${localout[$i]}
3383                      fi
3384                   fi
3385
3386                else
3387
3388                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3389                   transfer_failed=false
3390                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP to"
3391                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3392                   batch_scp -A -b -m -u $return_username  $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3393                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3394
3395                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3396                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3397                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3398                   then
3399                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3400                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3401
3402                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3403                         # ANLEGEN
3404                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3405                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3406                      then
3407                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3408                         printf "      $local_catalog \n"
3409                         mkdir -p  $local_catalog
3410                      fi
3411
3412                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3413                      transfer_problems=true
3414                   fi
3415                fi
3416             else
3417
3418                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR APPEND AUF
3419                   # LOKALER MASCHINE DURCHGEFUEHRT WIRD
3420                actionout[$i]=a
3421             fi
3422          fi
3423
3424
3425             # OUTPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. DATEI WIRD PER
3426             # LINK AUF DEN TEMPORAEREN DATENKATALOG GELEGT. OPTION -f WIRD
3427             # VERWENDET, FALLS DORT NOCH EINE DATEI GLEICHEN NAMENS VORHANDEN
3428             # SEIN SOLLTE. ANSCHLIESSEND WIRD SEINE ARCHIVIERUNG ANGESTOSSEN
3429          if [[ "${actionout[$i]}" = fl ]]
3430          then
3431             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3432             chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3433             if [[ $files_for_pes = false ]]
3434             then
3435                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3436                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3437                ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3438             else
3439                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/....  to"
3440                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3441                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3442                cd ${localout[$i]}
3443                for file in $(ls *)
3444                do
3445                   ln -f $file $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3446                done
3447                cd $TEMPDIR
3448             fi
3449
3450
3451                # ARCHIVIERUNGSJOB WIRD ERZEUGT UND ABGESCHICKT
3452             if [[ $store_on_archive_system = true ]]
3453             then
3454
3455                if [[ $archive_system = asterix ]]
3456                then
3457                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3458                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3459                   then
3460                      echo "stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3461                   else
3462                      echo "stageout -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3463                   fi
3464                   echo "cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"               >> archive_${frelout[$i]}
3465                   echo "if [[ \$(grep -c \"st.msg:150\"  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung) != 0 ]]" >> archive_${frelout[$i]}
3466                   echo "then"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3467                   echo "   do_stageout=false"                       >> archive_${frelout[$i]}
3468                   echo "else"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3469                   echo "   echo \"  +++ $filetyp ${frelout[$i]}  could not be stored on archive-system\" " >> archive_${frelout[$i]}
3470                   echo "   cat  /dev/null  >  ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname" >> archive_${frelout[$i]}
3471                   echo "   cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung  >  ~/job_queue/archive_${frelout[$i]}_error" >> archive_${frelout[$i]}
3472                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} will be copied to \$WORK as backup\" " >> archive_${frelout[$i]}
3473                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3474                   then
3475                      echo "   cp   ${frelout[$i]}  \$WORK"                    >> archive_${frelout[$i]}
3476                   else
3477                      echo "   cp -r  ${frelout[$i]}  \$WORK/${frelout[$i]}"   >> archive_${frelout[$i]}
3478                   fi
3479                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} saved\" " >> archive_${frelout[$i]}
3480                   echo "fi"                                         >> archive_${frelout[$i]}
3481                   echo "rm  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"              >> archive_${frelout[$i]}
3482                elif [[ $archive_system = DMF ]]
3483                then
3484                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3485                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3486                   then
3487                      printf "\n  +++ archiving of single files impossible with $archive_system !\n"
3488                      locat=DMF
3489                      exit
3490                   else
3491                         # FUER RECHNER IN JUELICH. DORT KOENNTEN AUCH
3492                         # EINZELNE DATEIEN GESICHERT WERDEN (SPAETER KORR.)
3493                      echo "rm -rf  \$ARCHIVE/${frelout[$i]}"     >> archive_${frelout[$i]}
3494                      echo "cp -r  ${frelout[$i]}  \$ARCHIVE"     >> archive_${frelout[$i]}
3495                   fi
3496                elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3497                then
3498                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3499                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3500                   then
3501                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3502                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3503                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3504                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3505                   else
3506
3507                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3508                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3509                      echo "[[ ! -d \$PERM/${frelout[$i]} ]] && mkdir $PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3510                      cd  $tmp_data_catalog
3511                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3512                      cd -  > /dev/null
3513                      (( inode = 0 ))
3514                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3515                      while (( inode < nodes ))
3516                      do
3517#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3518                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3519                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3520#                         echo "*** tasks_per_node = \"$tasks_per_node\" "
3521#                         echo "*** files = \"$files\" "
3522#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3523                         echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3524                         echo "dsmc incremental  \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar" >> archive_${frelout[$i]}
3525                         echo "dsmmigrate \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar"        >> archive_${frelout[$i]}
3526                         (( inode = inode + 1 ))
3527                      done
3528#                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3529#                      echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3530                   fi
3531                elif [[ $archive_system = ut ]]
3532                then
3533                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3534                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3535                   then
3536                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3537                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3538                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3539                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3540                   else
3541
3542                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3543                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3544                      echo "[[ ! -d \$UT/${frelout[$i]} ]] && mkdir $UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3545                      cd  $tmp_data_catalog
3546                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3547                      cd -  > /dev/null
3548                      (( inode = 0 ))
3549                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3550                      while (( inode < nodes ))
3551                      do
3552                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3553                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3554                         echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3555                         (( inode = inode + 1 ))
3556                      done
3557                   fi
3558                elif [[ $archive_system = none ]]
3559                then
3560                   printf "              +++ archiving on $localhost not available!\n"
3561                fi
3562
3563                if [[ $archive_system != none ]]
3564                then
3565                   if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb ]]
3566                   then
3567#                      subjob  -d  -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  -c $job_catalog  archive_${frelout[$i]}
3568                      subjob   -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  -c $job_catalog  archive_${frelout[$i]}
3569                   elif [[ $localhost = nech ]]
3570                   then
3571                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3572                   fi
3573                   printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3574                fi
3575             else
3576                printf "              +++ caution: option -A is switched on. No archiving on $archive_system!\n"
3577             fi
3578
3579
3580                # LEERDATEI IM BENUTZERVERZEICHNIS ANLEGEN, DAMIT BEKANNT IST,
3581                # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3582             if [[ $files_for_pes = false ]]
3583             then
3584                cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3585             else
3586                mkdir -p  ${pathout[$i]}
3587             fi
3588
3589          fi
3590
3591
3592             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE ZUM ARCHIV-SYSTEM
3593             # AUSSERDEM MUSS LEERDATEI ANGELEGT WERDEN, DAMIT BEKANNT IST,
3594             # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3595             # FALLS IRGENDEINE (VON MEHREREN) ARCHIVIERUNGEN SCHIEF GEHT,
3596             # WIRD FLAG GESETZT UND BLEIBT AUCH BEI WEITEREN ORDNUNGS-
3597             # GEMAESSEN ARCHIVIERUNGEN GESETZT
3598          if [[ "${actionout[$i]}" = ar ]]
3599          then
3600             if [[ $files_for_pes = false ]]
3601             then
3602                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3603                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3604                printf "\n              File will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3605             else
3606                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to"
3607                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3608                printf "\n              Directory will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3609             fi
3610             mv  ${localout[$i]}  ${frelout[$i]}
3611
3612             file_saved=false
3613
3614             if [[ $archive_system = asterix ]]
3615             then
3616                do_stageout=true
3617                (( stageout_anz = 0 ))
3618                while [[ $do_stageout = true ]]
3619                do
3620                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3621                   then
3622                      stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3623                   else
3624                      stageout  -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3625                   fi
3626                   cat  STAGE_OUTPUT
3627                   if [[ $(grep -c "st.msg:150"  STAGE_OUTPUT) != 0 ]]
3628                   then
3629                      file_saved=true
3630                      do_stageout=false
3631                   else
3632                      if [[ $files_for_pes = false ]]
3633                      then
3634                         printf "\n  +++ file ${frelout[$i]}  could not be saved on archive-system"
3635                      else
3636                         printf "\n  +++ directory ${frelout[$i]} could not be saved on archive-system"
3637                      fi
3638                      (( stageout_anz = stageout_anz + 1 ))
3639                      if (( stageout_anz == 10 ))
3640                      then
3641                         printf "\n  +++ stoped after 10 unsuccessful tries!"
3642                         archive_save=false
3643                         do_stageout=false
3644                      else
3645                         printf "\n  *** new try to store on archive after 15 min:"
3646                         sleep 900
3647                      fi
3648                   fi
3649                done
3650             elif [[ $archive_system = DMF ]]
3651             then
3652                if [[ $files_for_pes = false ]]
3653                then
3654                   printf "\n  +++ archiving of single files impossible on $archive_system!\n"
3655                   locat=DMF
3656                   exit
3657                else
3658                   rm -rf  $ARCHIVE/${frelout[$i]}
3659                   cp -r  ${frelout[$i]}  $ARCHIVE
3660                fi
3661                file_saved=true
3662             elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3663             then
3664                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3665                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3666                   # GELEGT WERDEN
3667                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3668                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3669                if [[ $files_for_pes = false ]]
3670                then
3671                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3672                else
3673                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3674                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3675                fi
3676
3677                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3678                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3679                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3680                if [[ $files_for_pes = false ]]
3681                then
3682                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3683                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3684                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3685                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3686                else
3687                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3688                   echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3689                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3690                fi
3691
3692                subjob  -v  -d  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  -c $job_catalog  archive_${frelout[$i]}
3693                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3694                file_saved=true
3695
3696             elif [[ $archive_system = ut ]]
3697             then
3698                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3699                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3700                   # GELEGT WERDEN
3701                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3702                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3703                if [[ $files_for_pes = false ]]
3704                then
3705                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3706                else
3707                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3708                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3709                fi
3710
3711                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3712                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3713                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3714                if [[ $files_for_pes = false ]]
3715                then
3716                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3717                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3718                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3719                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3720                else
3721                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3722                   echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3723                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3724                fi
3725
3726                subjob  -v  -c /pf/b/$usern/job_queue  -d  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3727                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3728                file_saved=true
3729
3730             else
3731                printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"  archiving impossible!"
3732                archive_save=false
3733             fi
3734             if [[ $file_saved = true ]]
3735             then
3736                if [[ $files_for_pes = false ]]
3737                then
3738                   cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3739                else
3740                   mkdir -p  ${pathout[$i]}
3741                fi
3742             fi
3743          fi
3744
3745             # APPEND AUF LOKALER MASCHINE
3746          if [[ "${actionout[$i]}" = "a" ]]
3747          then
3748             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append to  ${pathout[$i]}\n"
3749             cat  ${localout[$i]}  >>  ${pathout[$i]}
3750          fi
3751
3752             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE
3753             # ES MUSS KOPIERT WERDEN, DA MOVE NICHT UEBER FILESYSTEM HINAUS MOEGLICH
3754          if [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = false ]]
3755          then
3756
3757                # KOPIEREN AUF EINPROZESSORMASCHINE
3758             if [[ "${extout[$i]}" != " "  &&  "${extout[$i]}" != "" ]]
3759             then
3760                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}\n"
3761                if [[ $link_local_output = true ]]
3762                then
3763                    printf "      using ln -f\n"
3764                    ln -f  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3765                fi
3766                # If "ln -f" fails of if "$link_local_output = false" do a normal "cp"
3767                if [[ ! -f "${pathout[$i]}.${extout[$i]}" ]]
3768                then
3769                    if [[ $link_local_output = true ]]
3770                    then
3771                        printf "      ln failed, using cp...\n"
3772                    fi
3773                    cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3774                fi
3775             else
3776                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}\n"
3777                if [[ $link_local_output = true ]]
3778                then
3779                    printf "      using ln -f\n"
3780                    ln -f  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3781                fi
3782                # If "ln -f" fails of if "$link_local_output = false" do a normal "cp"
3783                if [[ ! -f "${pathout[$i]}" ]]
3784                then
3785                    if [[ $link_local_output = true ]]
3786                    then
3787                        printf "      ln failed, using cp...\n"
3788                    fi
3789                    cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3790                fi
3791             fi
3792
3793          elif [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = true ]]
3794          then
3795
3796                # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
3797                # DATEIEN WERDEN ERST IN EINEM KATALOG GESAMMELT UND DIESER
3798                # WIRD DANN KOPIERT
3799                # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
3800             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to  ${pathout[$i]}\n"
3801             if [[ $link_local_output = true ]]
3802             then
3803                 printf "      using ln -f\n"
3804                 mkdir  ${pathout[$i]}
3805                 cd ${localout[$i]}
3806                 for file in $(ls *)
3807                 do
3808                   ln -f $file  ${pathout[$i]}
3809                 done
3810                 cd $TEMPDIR
3811             fi
3812             # If "ln -f" fails of if "$link_local_output = false" do a normal "cp -r"
3813             if [[ ! -f "${pathout[$i]}/_0000" ]]
3814             then
3815                 if [[ $link_local_output = true ]]
3816                 then
3817                     printf "      ln failed for .../_0000, using cp...\n"
3818                 fi
3819                 cp -r  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3820             fi
3821
3822          fi
3823       fi
3824    done
3825    if (( i != 0 ))
3826    then
3827       if [[ $transfer_problems = true ]]
3828       then
3829          printf "\n$striche\n  *** OUTPUT-files saved"
3830          printf "\n  +++ WARNING: some data transfers failed! \n"
3831       else
3832          printf "\n$striche\n  *** all OUTPUT-files saved \n"
3833       fi
3834    fi
3835
3836
3837       # EVENTUELL FOLGEJOB STARTEN
3838       # DATEI CONTINUE_RUN MUSS VOM BENUTZERPROGRAMM AUS ERZEUGT WERDEN
3839    if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3840    then
3841
3842       if [[ $archive_save = true ]]
3843       then
3844
3845             # ZUERST IN MRUN-AUFRUF OPTIONEN FUER FORTSETZUNGSLAUF, FUER
3846             # STILLES ABARBEITEN (OHNE INTERAKTIVE RUECKFAGEN) UND FUER
3847             # BATCH-BETRIEB (NUR WICHTIG, FALLS BATCH AUF LOKALER MASCHINE
3848             # DURCHGEFUEHRT WERDEN SOLL) EINFUEGEN, FALLS NICHT BEREITS VOR-
3849             # HANDEN
3850          [[ $(echo $mc | grep -c "\-C") = 0 ]]  &&  mc="$mc -C"
3851          [[ $(echo $mc | grep -c "\-v") = 0 ]]  &&  mc="$mc -v"
3852          [[ $(echo $mc | grep -c "\-b") = 0 ]]  &&  mc="$mc -b"
3853          if [[ $(echo $mc | grep -c "#") != 0 ]]
3854          then
3855             mc=`echo $mc | sed 's/#/f/g'`
3856          fi
3857
3858
3859             # JOB STARTEN
3860          printf "\n\n  *** initiating restart-run on \"$return_addres\" using command:\n"
3861          echo "      $mc"
3862          printf "\n$striche\n"
3863          if [[ $localhost != $fromhost ]]
3864          then
3865
3866             if [[ $localhost = lcsgih  ||  $localhost = lcsgib  ||  $localhost = nech  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms  ||  $localhost = lctit ]]
3867             then
3868                echo "*** ssh will be used to initiate restart-runs!"
3869                echo "    return_addres=\"$return_addres\" "
3870                echo "    return_username=\"$return_username\" "
3871                if [[ $return_addres = 172.20.25.41 ]]
3872                then
3873                      # WORKAROUND AUF SCIROCCO AM TIT
3874                   print  "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "  |  ssh $return_addres -l $return_username 
3875                else
3876                   ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "
3877                fi
3878             else
3879                printf "\n  +++ no restart mechanism available for host \"$localhost\" "
3880                locat=restart; exit
3881             fi
3882
3883                # WARTEN, DAMIT SICH RESTART JOB IN QUEUE EINREIHEN KANN, BEVOR
3884                # DER AKTUELLE JOB ENDET
3885             sleep 30
3886
3887          else
3888
3889                # BEI RECHNUNGEN AUF LOKALER MASCHINE KANN MRUN DIREKT AUFGE-
3890                # RUFEN WERDEN, AUSSER AUF lcfimm
3891             cd $LOCAL_PWD
3892             if [[ $localhost = lcfimm ]]
3893             then
3894                ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc " 
3895             else
3896                eval  $mc                # ' MUESSEN AUSGEWERTET WERDEN
3897             fi
3898             cd -  > /dev/null
3899          fi
3900          printf "\n$striche\n  *** restart-run initiated \n"
3901
3902
3903             # EVENTUELL INPUT-DATEIEN, DIE VON TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS
3904             # GEHOLT WORDEN SIND, LOESCHEN
3905          (( i = 0 ))
3906          while (( i < iin ))
3907          do
3908             (( i = i + 1 ))
3909             if [[ "${got_tmp[$i]}" = true   &&  $keep_data_from_previous_run = false ]]
3910             then
3911                rm -r  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
3912             fi
3913          done
3914
3915       else
3916
3917          printf "\n  +++ no restart-run possible, since errors occured"
3918          printf "\n      during the archive process"
3919       fi
3920
3921    fi
3922
3923
3924   
3925       # EVTL. EMAIL-BENACHRICHTIGUNG UEBER ABGESCHLOSSENEN LAUF
3926    if [[ "$email_notification" != "" ]]
3927    then
3928
3929       if [[ $localhost != $fromhost ]]
3930       then
3931          if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3932          then
3933             echo "PALM restart run necessary"        >   email_text
3934             echo "description header of actual run:" >>  email_text
3935             cat  CONTINUE_RUN                        >>  email_text
3936             echo "mrun-command to restart:"          >>  email_text
3937             echo "$mc"                               >>  email_text
3938          else
3939             echo "PALM run with base filename \"$fname\" on host \"$localhost\" finished"  >  email_text
3940          fi
3941          mail  $email_notification  <  email_text
3942          printf "\n  *** email notification sent to \"$email_notification\" "
3943       fi
3944    fi
3945
3946
3947
3948       # ALLE ARBEITEN BEENDET. TEMPORAERER KATALOG KANN GELOESCHT WERDEN
3949    cd  $HOME
3950    [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
3951
3952 else
3953
3954
3955       # FALLS AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
3956       # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
3957
3958       # MRUN-BEFEHL FUER REMOTE-MASCHINE ZUSAMMENSTELLEN
3959    mrun_com="$mrun_script_name -a $afname -c $config_file -d $fname -h $host -H $fromhost -m $memory -t $cpumax -q $queue -R $return_addres -U $return_username -u $remote_username"
3960    [[ "$cpp_opts" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -D \"$cpp_opts\""
3961    [[ "$global_revision" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -G \"$global_revision\""
3962    [[ $group_number != none ]]   &&  mrun_com=${mrun_com}" -g $group_number"
3963    [[ $do_compile = true ]]      &&  mrun_com=${mrun_com}" -s \"$source_list\""
3964    [[ "$input_list" != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -i \"$input_list\""
3965    [[ $ignore_archive_error = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -I"
3966    [[ $keep_data_from_previous_run = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -k"
3967    [[ "$additional_conditions" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -K \"$additional_conditions\""
3968#    [[ "$makefile" != "$source_path/Makefile" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -M \"$makefile\""
3969    [[ "$output_list" != "" ]]    &&  mrun_com=${mrun_com}" -o \"$output_list\""
3970    [[ "$read_from_config" = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -S"
3971    [[ $do_trace = true ]]        &&  mrun_com=${mrun_com}" -x"
3972    [[ "$numprocs" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -X $numprocs"
3973    if [[ $use_openmp = true ]]
3974    then
3975       mrun_com=${mrun_com}" -O"
3976       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $threads_per_task"
3977    else
3978       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $tasks_per_node"
3979    fi
3980    [[ $store_on_archive_system = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -A"
3981    [[ $package_list != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -p \"$package_list\""
3982    [[ $return_password != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -P $return_password"
3983    [[ $delete_temporary_catalog = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -B"
3984    [[ $node_usage != default  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != novice ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -n $node_usage"
3985    [[ $run_coupled_model = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -Y \"$coupled_dist\""
3986    if [[ $do_remote = true ]]
3987    then
3988       printf "\n>>>> MRUN-command on execution host:\n>>>> $mrun_com \n"
3989    fi
3990
3991
3992       # ZUSAMMENSTELLUNG DES JOBSCRIPTS AUF DATEI jobfile
3993    jobfile=jobfile.$RANDOM
3994
3995
3996       # TEMPORAERES VERZEICHNIS GENERIEREN UND NACH DORT WECHSELN
3997    echo  "mkdir  $TEMPDIR"      >>  $jobfile
3998    echo  "cd  $TEMPDIR"         >>  $jobfile
3999
4000
4001       # EVENTUELL FEHLERVERFOLGUNG AKTIVIEREN
4002    if [[ $do_trace = true ]]
4003    then
4004       echo  "set -x"                                    >>  $jobfile
4005    else
4006       echo  "set +vx"                                   >>  $jobfile
4007    fi
4008
4009
4010       # BEREITSTELLUNG VON QUELLTEXTEN, MRUN-SCRIPTS UND KONFIGURATIONS-
4011       # DATEI FUER DEN JOB
4012    if [[ $( echo $host | cut -c1-5 ) = lcsgi ]]
4013    then
4014
4015          # KONFIGURATIONSDATEI UND MRUN_SCRIPT IN DAS SOURCE-VERZEICHNIS
4016          # KOPIEREN
4017       if [[ $restart_run != true ]]
4018       then
4019          cp  $config_file  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
4020          cp  ${PALM_BIN}/$mrun_script_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
4021       fi
4022
4023          # SOURCE-VERZEICHNIS VOM LOKALEN RECHNER PER SCP TRANSFERIEREN
4024       echo  "set -x"  >>  $jobfile
4025       echo  "scp  -r  $return_username@$return_addres:$working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname ."  >>  $jobfile
4026       echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                      >>  $jobfile
4027
4028          # QUELLTEXTE, MRUN-SCRIPT UND KONFIGURATIONSDATEI IN DAS AKTUELLE
4029          # ARBEITSVERZEICHNIS VERSCHIEBEN
4030       echo  "mv  SOURCES_FOR_RUN_$fname/$config_file  . "       >>  $jobfile
4031       echo  "mv  SOURCES_FOR_RUN_$fname/$mrun_script_name  . "  >>  $jobfile
4032       echo  "execute_mrun=true"                                 >>  $jobfile
4033       echo  " "                                                 >>  $jobfile
4034
4035    else
4036
4037          # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL)
4038          # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES
4039       if [[ $do_compile = true ]]
4040       then
4041
4042          source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname
4043
4044              # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN
4045              # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE
4046              # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI)
4047          echo  "mkdir  SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
4048          echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                 >>  $jobfile
4049          echo  "cd     SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
4050
4051          for  filename  in  $source_list
4052          do
4053                # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4054             echo  "cat > $filename << \"%END%\""              >>  $jobfile
4055             cat   $source_catalog/$filename                   >>  $jobfile
4056             echo  " "                                         >>  $jobfile
4057             echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
4058             echo  " "                                         >>  $jobfile
4059          done
4060
4061             # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4062          echo  "cat > Makefile << \"%END%\""               >>  $jobfile
4063          cat   $source_catalog/Makefile                    >>  $jobfile
4064          echo  " "                                         >>  $jobfile
4065          echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
4066          echo  " "                                         >>  $jobfile
4067
4068          echo  "cd -  > /dev/null"                         >>  $jobfile
4069
4070       fi
4071
4072
4073          # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI
4074          # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4075       echo  "cat > $config_file << \"%END%\""      >>  $jobfile
4076       cat   $config_file                           >>  $jobfile
4077       echo  "%END%"                                >>  $jobfile
4078       echo  " "                                    >>  $jobfile
4079
4080
4081          # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION
4082          # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
4083       echo  "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\""  >>  $jobfile
4084       cat   ${PALM_BIN}/$mrun_script_name          >>  $jobfile
4085       echo  "%END%"                                >>  $jobfile
4086       if [[ $host = lctit ]]
4087       then
4088          echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >>  $jobfile
4089          echo "mv  mrun_new  $mrun_script_name"    >>  $jobfile
4090       fi
4091       echo  "chmod u+x $mrun_script_name"          >>  $jobfile
4092       echo  "execute_mrun=true"                    >>  $jobfile
4093       echo  " "                                    >>  $jobfile
4094
4095    fi
4096
4097
4098       # EVTL. BENOETIGTE INPUT-DATEIEN PER FTP HOLEN ODER DEM JOB DIREKT
4099       # MITGEBEN UND AUF DEM REMOTE-RECHNER IM BENUTZERVERZEICHNIS ABLEGEN
4100       # FALLS DIESES NICHT EXISTIERT, WIRD VERSUCHT, DAS JEWEILS LETZTE
4101       # UNTERVERZEICHNIS DES PFADNAMENS ANZULEGEN
4102    if [[ $do_remote = true ]]
4103    then
4104       (( i = 0 ))
4105       while (( i < iin ))
4106       do
4107          (( i = i + 1 ))
4108          echo  "[[ ! -d ${pathin[$i]} ]]  &&  mkdir -p  ${pathin[$i]}"  >>  $jobfile
4109          if [[ "${transin[$i]}" = job ]]
4110          then
4111             echo  "cat > ${remotepathin[$i]} <<\"%END%\""    >>  $jobfile
4112             eval cat   ${pathin[$i]}/${frelin[$i]}           >>  $jobfile
4113             echo  " "                                        >>  $jobfile
4114             echo  "%END%"                                    >>  $jobfile
4115          else
4116             echo  "batch_scp -b -o -g -s -u $return_username $return_addres ${remotepathin[$i]} \"${pathin[$i]}\" ${frelin[$i]}" >>  $jobfile
4117          fi
4118
4119             # UEBERPRUEFEN, OB DATEI ANGELEGT WERDEN KONNTE
4120          echo  "if [[ \$? = 1 ]]"                    >>  $jobfile
4121          echo  "then"                                >>  $jobfile
4122          echo  "   echo \" \" "                      >>  $jobfile
4123          echo  "   echo \"+++ file ${remotepathin[$i]} could not be created\" "   >>  $jobfile
4124          echo  "   echo \"    please check, if directory exists on $host!\" "  >>  $jobfile
4125          echo  "   echo \"+++ MRUN will not be continued\" "  >>  $jobfile
4126          echo  "   execute_mrun=false"               >>  $jobfile
4127          echo  "fi"                                  >>  $jobfile
4128       done
4129    fi
4130
4131       # ARBEITSKATALOG AUF DER LOKALEN MASCHINE FUER EVENTUELLE
4132       # FORTSETZUNGSLAUEFE PER ENV-VARIABLE UEBERGEBEN
4133    echo  "LOCAL_PWD=$working_directory"                >>  $jobfile
4134    echo  "export LOCAL_PWD"                            >>  $jobfile
4135
4136       # EBENSO LOKALEN MRUN-KATALOG UEBERGEBEN
4137    echo  "LOCAL_MRUN_PATH=$PALM_BIN"                   >>  $jobfile
4138    echo  "export LOCAL_MRUN_PATH"                      >>  $jobfile
4139
4140       # WORKAROUND FUER RIAM-NEC-JOBS WEGEN PROFILE-SCHWIERIGKEITEN
4141    if [[ $localhost_realname = "gate"  ||  $localhost = lctit ]]
4142    then
4143       echo  "export PALM_BIN=$PALM_BIN"                >>  $jobfile
4144    fi
4145
4146       # MRUN AUF ZIELRECHNER AUFRUFEN
4147    echo  "set -x"                                      >>  $jobfile
4148    echo  "[[ \$execute_mrun = true ]]  &&  ./$mrun_com"  >>  $jobfile
4149
4150    echo  'ls -al; echo `pwd`'                          >>  $jobfile
4151    echo  "cd \$HOME"                                   >>  $jobfile
4152    echo  "rm -rf  $TEMPDIR"                            >>  $jobfile
4153
4154
4155
4156
4157       # JOB PER SUBJOB STARTEN
4158    if [[ $silent = false ]]
4159    then
4160       printf "\n     "
4161    else
4162       printf "\n\n"
4163    fi
4164
4165    subjob  $job_on_file  -h $host  -u $remote_username -g $group_number -q $queue  -m $memory  -N $node_usage -t $cpumax  $XOPT  $TOPT  $OOPT  -n $fname  -v  -c $job_catalog  $jobfile
4166    rm -rf  $jobfile
4167
4168
4169 fi  # ENDE REMOTE-TEIL
4170
4171
4172
4173     # ENDE DER PROZEDUR
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.