source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.riam @ 1550

Last change on this file since 1550 was 1446, checked in by maronga, 10 years ago

removed blanks from <> strings in .mrun.config files / adapted hlrn_watchdog for HLRN-III

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 11.3 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.riam 1446 2014-08-07 10:08:56Z suehring $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
20%host_identifier   sx-*                                       necriam
21#
22#
23# The next block contains all informations for compiling the PALM code
24# and for generating and running the PALM executable using MPI. Replace all
25# required paths (given in <>) by the respective paths valid on your host.
26# Also replace <hi> by your host identifier (see above) in each line!
27# Compilernames, cpp-options and compiler-options are assuming
28# an Intel-Compiler and mpich2 on this host! Please change
29# appropriately, if you are using a different compiler / MPI-Version.
30#
31#
32%compiler_name     sxmpif90                                   necriam parallel
33%compiler_name_ser sxf90                                      necriam parallel
34%cpp_options       -Ep:-D__mpi2:-DMPI_REAL=MPI_REAL8:-DMPI_2REAL=MPI_2REAL8:-DSCFFT=DZFFT:-DCSFFT=ZDFFT:-D__netcdf:-D__netcdf_64bit  necriam parallel
35%netcdf_inc        -I:/home/COAR/NC/tatuyama/pub/netcdf-3.6.0-p1/include      necriam parallel
36%netcdf_lib        -L/home/COAR/NC/tatuyama/pub/netcdf-3.6.0-p1/lib:-lnetcdf  necriam parallel
37%dvr_inc           -I:/home/COAR/NC/raasch/dvr/lib           necriam parallel
38%dvr_lib           -L/home/COAR/NC/raasch/dvr/lib:-lDVRP2:-lftp  necriam parallel
39%fopts             -C:hopt:-Wf:\'-init:stack=nan:-init:heap=nan:-A:idbl4:-pvctl:fullmsg\':-ftrace:-P:stack:-pi:auto:-pi:line=1000  necriam parallel
40%lopts             -C:hopt:-Wf:\'-init:stack=nan:-init:heap=nan:-A:idbl4\':-ftrace:-P:stack:-pi:auto:-pi:line=1000:-L/SX/opt/mathkeisan/MK3_0/lib0/:-l:fft  necriam parallel
41%memory            4000                                       necriam parallel
42%cpumax            1000                                       necriam parallel
43%numprocs          4                                          necriam parallel
44%tmp_data_catalog  /work/<replace_by_your_username>/restart_data  necriam parallel
45%tmp_user_catalog  /work/<replace_by_your_username>               necriam parallel
46%remote_username   <replace_by_your_username>                     necriam parallel
47#
48%write_binary                true                             restart
49#
50#----------------------------------------------------------------------------
51# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
52#----------------------------------------------------------------------------
53#IC:
54#
55#----------------------------------------------------------------------------
56# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
57#----------------------------------------------------------------------------
58EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
59EC:pwd; ls -al
60#
61#----------------------------------------------------------------------------
62# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
63#----------------------------------------------------------------------------
64#
65# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
66OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
67OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
68#
69# Combine all particle information files
70OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
71#
72# Collect plot data (2d/3d) into one file
73OC:combine_plot_fields.x
74#
75#----------------------------------------------------------------------------
76# List of input-files
77#----------------------------------------------------------------------------
78PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
79PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
80TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
81NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
82LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
83BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
84PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
85DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
86DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
87DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
88DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
89DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
90DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
91DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
92DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
93DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
94DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
95#
96#----------------------------------------------------------------------------
97# List of output-files
98#----------------------------------------------------------------------------
99BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
100PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
101#
102RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
103RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
104HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
105HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
106CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
107CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
108#
109DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
110DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
111DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
112DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
113DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
114DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
115DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
116DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
117DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
118DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
119DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
120DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
121DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
122DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
123DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
124DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
125DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
126DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
127DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
128DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
129DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
130DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
131DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
132DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
133DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
134DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
135DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
136DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
137DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
138DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
139DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
140DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
141DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
142DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
143DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
144DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
145DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
146DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
147DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
148DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
149DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
150DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
151DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
152DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
153DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
154DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
155DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
156DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
157DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
158DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
159DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
160DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
161DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
162DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
163DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
164#
165DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
166DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
167PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
168PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
169PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
170# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.