Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.lcxe6 @ 2259

Last change on this file since 2259 was 2236, checked in by suehring, 7 years ago

Add NetCDF input file for topography
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 14.7 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.lcxe6 2236 2017-05-31 10:26:34Z gronemeier $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
20%host_identifier   hexagon*  lcxe6
21#
22#
23# The next block contains all informations for compiling the PALM code
24# and for generating and running the PALM executable using MPI. Replace all
25# required paths (given in <>) by the respective paths valid on your host.
26# Also replace <hi> by your host identifier (see above) in each line!
27# Compilernames, cpp-options and compiler-options are assuming
28# an Intel-Compiler and mpich2 on this host! Please change
29# appropriately, if you are using a different compiler / MPI-Version.
30#
31# Additional hints: during mrun error messages will occur related to the
32# "module swap" command. You can simply ignore those messages. If you do not
33# know your project account, check the output of the "cost" command on hexagon
34#
35%tmp_user_catalog    /work/<replace_by_your_CrayXE6_username>                                                         lcxe6 parallel
36%tmp_data_catalog    /work/<replace_by_your_CrayXE6_username>/tmp/                                                    lcxe6 parallel
37%compiler_name       ftn                                                                                              lcxe6 parallel
38%compiler_name_ser   ftn                                                                                              lcxe6 parallel
39%cpp_options         -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__fftw:-D__netcdf:-D__intel_openmp_bug lcxe6 parallel
40%mopts               -j:4                                                                                             lcxe6 parallel
41%fopts               -O3:-r8:-fp-model:source:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian lcxe6 parallel
42%lopts               -O3:-r8:-fp-model:source:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-Vaxlib lcxe6 parallel
43%remote_username      <replace_by_your_CrayXE6_username>                                                              lcxe6 parallel
44%memory              1000                                                                                             lcxe6 parallel
45%project_account     <replace_by_your_project_account>                                                                lcxe6 parallel
46%modules             modules:Base-opts:pmi:cray-mpich:netcdf-hdf5parallel:xtpe-network-gemini:gni-headers:fftw           lcxe6 parallel
47%login_init_cmd      .:/opt/modules/default/init/ksh\;:.:/etc/bash.bashrc.local\;:module:swap:PrgEnv-cray:PrgEnv-intel\;:module:unload:xtpe-interlagos     lcxe6 parallel
48%email_notification  <replace_by_your_email_address>                                                                  lcxe6 parallel
49#
50 %tmp_user_catalog    /work/<replace_by_your_CrayXE6_username>                                                         lcxe6 parallel trace
51%tmp_data_catalog    /work/<replace_by_your_CrayXE6_username>/tmp/                                                    lcxe6 parallel trace
52%compiler_name       ftn                                                                                              lcxe6 parallel trace
53%compiler_name_ser   ftn                                                                                              lcxe6 parallel trace
54%cpp_options         -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__fftw:-D__netcdf:-D__intel_openmp_bug lcxe6 parallel trace
55%mopts               -j:4                                                                                             lcxe6 parallel trace
56%fopts               -C:-check:nooutput_conversion:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-O0:-r8:-fp-model:source:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian lcxe6 parallel trace
57%lopts               -C:-check:nooutput_conversion:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-O0:-r8:-fp-model:source:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-Vaxlib                       lcxe6 parallel trace
58%remote_username      <replace_by_your_CrayXE6_username>                                                              lcxe6 parallel trace
59%memory              1000                                                                                             lcxe6 parallel trace
60%project_account     <replace_by_your_project_account>                                                                lcxe6 parallel trace
61%modules             modules:Base-opts:pmi:cray-mpich:netcdf-hdf5parallel:xtpe-network-gemini:gni-headers:fftw           lcxe6 parallel trace
62%login_init_cmd      .:/opt/modules/default/init/ksh\;:.:/etc/bash.bashrc.local\;:module:swap:PrgEnv-cray:PrgEnv-intel\;:module:unload:xtpe-interlagos     lcxe6 parallel trace
63%email_notification  <replace_by_your_emai_address>                                                                  lcxe6 parallel trace
64#           
65%write_binary        true                             restart
66#
67#----------------------------------------------------------------------------
68# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
69#----------------------------------------------------------------------------
70#IC:
71#
72#----------------------------------------------------------------------------
73# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
74#----------------------------------------------------------------------------
75EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
76EC:pwd; ls -al
77#
78#----------------------------------------------------------------------------
79# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
80#----------------------------------------------------------------------------
81#
82# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
83OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
84OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
85#
86# Combine all particle information files
87OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
88#
89#----------------------------------------------------------------------------
90# List of input-files
91#----------------------------------------------------------------------------
92PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
93PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
94TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
95TOPOGRAPHY_DATA_NC       in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo_nc
96NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
97LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
98WTM_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _wtm
99BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
100PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
101DATA_1D_FL_NETCDF        in:locopt     flf      $base_data/$fname/OUTPUT   _fl     nc
102DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
103DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
104DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
105DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
106DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
107DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
108DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
109DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
110DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
111DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
112#
113#----------------------------------------------------------------------------
114# List of output-files
115#----------------------------------------------------------------------------
116BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
117PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
118#
119RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
120RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
121HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
122HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
123CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
124CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
125TURBINE_PARAMETERS01  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters01
126TURBINE_PARAMETERS02  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters02
127TURBINE_PARAMETERS03  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters03
128TURBINE_PARAMETERS04  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters04
129#
130DATA_1D_FL_NETCDF    out:loc:tr   fl#:flf   $base_data/$fname/OUTPUT  _fl     nc
131DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
132DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
133DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
134DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
135DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
136DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
137DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
138DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
139DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
140DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
141DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
142DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
143DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
144DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
145DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
146DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
147DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
148DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
149DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
150DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
151DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
152DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
153DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
154DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
155DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
156DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
157DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
158DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
159DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
160DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
161DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
162DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
163DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
164DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
165DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
166DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
167DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
168DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
169DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
170DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
171DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
172DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
173DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
174DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
175DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
176DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
177DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
178DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
179DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
180DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
181DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
182DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
183DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
184DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
185DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
186#
187DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
188DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
189PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
190PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
191PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
192# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |