Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.lcxe6 @ 948

Last change on this file since 948 was 920, checked in by maronga, 12 years ago

Bugfixes for the parameter file check. New mrun option switches off combine_plot_fields
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 11.9 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.lcxe6 920 2012-06-05 09:56:53Z maronga $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
20%host_identifier   hexagon*  lcxe6
21#
22#
23# The next block contains all informations for compiling the PALM code
24# and for generating and running the PALM executable using MPI. Replace all
25# required paths (given in <>) by the respective paths valid on your host.
26# Also replace <hi> by your host identifier (see above) in each line!
27# Compilernames, cpp-options and compiler-options are assuming
28# an Intel-Compiler and mpich2 on this host! Please change
29# appropriately, if you are using a different compiler / MPI-Version.
30#
31%tmp_user_catalog    /work/<replace by your CrayXE6 username>                                                         lcxe6 parallel
32%tmp_data_catalog    /work/<replace by your CrayXE6 username>/tmp/                                                    lcxe6 parallel
33%compiler_name       ftn                                                                                              lcxe6 parallel
34%compiler_name_ser   ftn                                                                                              lcxe6 parallel
35%cpp_options         -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__intel_openmp_bug lcxe6 parallel
36%netcdf_inc          -I:/opt/cray/netcdf-hdf5parallel/default/netcdf-hdf5parallel-intel/include:-I/opt/cray/hdf5-parallel/default/hdf5-parallel-intel/include  lcxe6 parallel
37%netcdf_lib          -L/opt/cray/netcdf-hdf5parallel/default/netcdf-hdf5parallel-intel/lib:-lnetcdf:-lnetcdff:-L/opt/cray/hdf5-parallel/default/hdf5-parallel-intel/lib:-lhdf5_fortran:-lhdf5hl_fortran  lcxe6 parallel
38%mopts               -j:4                                                                                             lcxe6 parallel
39%fopts               -r8:-O3:-nbs:-convert:little_endian:-I:/opt/cray/mpt/default/xt/gemini/mpich2-intel/120/include  lcxe6 parallel
40%lopts               -r8:-O3:-nbs:-L:/opt/cray/mpt/default/xt/gemini/mpich2-intel/120/lib                             lcxe6 parallel
41%remote_username      <replace by your CrayXE6 username>                                                              lcxe6 parallel
42%memory              1500                                                                                             lcxe6 parallel
43%project_account     <replace by your project account (e.g. nersc, geofysisk)>                                        lcxe6 parallel
44%modules             modules:Base-opts:pmi:xt-mpich2:hdf5-parallel:netcdf-hdf5parallel:xtpe-network-gemini:gni-headers  lcxe6 parallel
45%login_init_cmd      .:/opt/modules/default/init/ksh\;:.:/etc/bash.bashrc.local\;:module:swap:PrgEnv-cray:PrgEnv-intel  lcxe6 parallel
46#%modules            PrgEnv-intel                                                                                     lcxe6 parallel
47%email_notification  <replace by your email address>                                                                  lcxe6 parallel
48#             
49%write_binary        true                             restart
50#
51#----------------------------------------------------------------------------
52# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
53#----------------------------------------------------------------------------
54#IC:
55#
56#----------------------------------------------------------------------------
57# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
58#----------------------------------------------------------------------------
59EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
60EC:pwd; ls -al
61#
62#----------------------------------------------------------------------------
63# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
64#----------------------------------------------------------------------------
65#
66# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
67OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
68OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
69#
70# Combine all particle information files
71OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
72#
73#----------------------------------------------------------------------------
74# List of input-files
75#----------------------------------------------------------------------------
76PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
77PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
78TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
79BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
80PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
81DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
82DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
83DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
84DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
85DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
86DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
87DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
88DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
89DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
90DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
91#
92#----------------------------------------------------------------------------
93# List of output-files
94#----------------------------------------------------------------------------
95BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
96PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
97#
98RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
99RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
100HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
101HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
102CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
103CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
104#
105DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
106DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
107DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
108DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
109DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
110DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
111DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
112DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
113DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
114DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
115DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
116DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
117DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
118DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
119DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
120DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
121DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
122DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
123DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
124DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
125DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
126DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
127DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
128DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
129DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
130DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
131DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
132DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
133DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
134DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
135DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
136DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
137DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
138DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
139DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
140DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
141DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
142DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
143DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
144DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
145DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
146DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
147DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
148DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
149DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
150DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
151DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
152DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
153DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
154DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
155DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
156DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
157DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
158DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
159DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
160#
161DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
162DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
163PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
164PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
165PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
166# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |