Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.kiaps @ 1441

Last change on this file since 1441 was 1402, checked in by raasch, 11 years ago

output of location messages complemented, output of location bar added
(Makefile, check_parameters, cpulog, init_pegrid, init_3d_model, message, palm, parin, time_integration, new: progress_bar)
preprocessor switch intel_compiler added, -r8 compiler options removed
(.mrun.config.default, .mrun.config.imuk, .mrun.config.kiaps)

batch_job added to envpar-NAMELIST
(mrun, parin)
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 10.6 KB
RevLine 
[1043]1#$Id: .mrun.config.kiaps 1402 2014-05-09 14:25:13Z raasch $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19%host_identifier    login* lckiaps
20%host_identifier    node*  lckiaps
21#
22#
23# The next block contains all informations for compiling the PALM code
24# and for generating and running the PALM executable using MPI. Replace all
25# required paths (given in <>) by the respective paths valid on your host.
26#
27%login_init_cmd      .:/cm/local/apps/environment-modules/3.2.6/init/ksh  lckiaps parallel
28%modules             pgi/11.10:PrgEnv-pgi/1.1:mpich2/1.4.1p1:netcdf       lckiaps parallel
29%tmp_user_catalog    /home/data/<replace by your kiaps username>          lckiaps parallel
30%tmp_data_catalog    /home/data/<replace by your kiaps username>          lckiaps parallel
31%compiler_name       mpif90                            lckiaps parallel
32%compiler_name_ser   pgf90                             lckiaps parallel
33%cpp_options         -Mpreprocess:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf lckiaps parallel
34%netcdf_inc          -I:/opt/kiaps/apps/netcdf/4.1.3/pgi/11.10/include  lckiaps parallel
35%netcdf_lib          -L/opt/kiaps/apps/netcdf/4.1.3/pgi/11.10/lib:-lnetcdf:-lnetcdff  lckiaps parallel
36%mopts               -j:4                              lckiaps parallel
[1402]37%fopts               -fastsse                          lckiaps parallel
38%lopts               -fastsse                          lckiaps parallel
[1043]39%remote_username     <replace by your kiaps username>  lckiaps parallel
40%memory              1500                              lckiaps parallel
41#             
42%write_binary        true                             restart
43#
44#----------------------------------------------------------------------------
45# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
46#----------------------------------------------------------------------------
47#IC:
48#
49#----------------------------------------------------------------------------
50# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
51#----------------------------------------------------------------------------
52EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
53EC:pwd; ls -al
54#
55#----------------------------------------------------------------------------
56# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
57#----------------------------------------------------------------------------
58#
59# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
60OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
61OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
62#
63# Combine all particle information files
64OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
65#
66#----------------------------------------------------------------------------
67# List of input-files
68#----------------------------------------------------------------------------
69PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
70PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
71TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
[1241]72NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
73LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
[1043]74BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
75PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
76DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
77DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
78DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
79DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
80DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
81DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
82DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
83DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
84DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
85DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
86#
87#----------------------------------------------------------------------------
88# List of output-files
89#----------------------------------------------------------------------------
90BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
91PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
92#
93RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
94RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
95HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
96HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
97CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
98CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
99#
100DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
101DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
102DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
103DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
104DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
105DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
106DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
107DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
108DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
109DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
110DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
111DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
112DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
113DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
114DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
115DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
116DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
117DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
118DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
119DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
120DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
121DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
122DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
123DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
124DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
125DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
126DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
127DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
128DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
129DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
130DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
131DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
132DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
133DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
134DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
135DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
136DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
137DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
138DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
139DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
140DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
141DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
142DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
143DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
144DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
145DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
146DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
147DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
148DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
149DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
150DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
151DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
152DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
153DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
154DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
155#
156DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
157DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
158PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
159PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
160PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
161# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |