Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.imuk_gpu @ 2254

Last change on this file since 2254 was 2236, checked in by suehring, 8 years ago

Add NetCDF input file for topography
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 12.8 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.imuk_gpu 2236 2017-05-31 10:26:34Z knoop $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11#
12%host_identifier   inferno      lcmuk
13#
14# pure MPI version
15%remote_username   <replace_by_your_IMUK_username>               lcmuk parallel pgi
16%tmp_user_catalog  /localdata                                    lcmuk parallel pgi
17%compiler_name     mpif90                                        lcmuk parallel pgi
18%compiler_name_ser pgf90                                         lcmuk parallel pgi
19%cpp_options       -Mpreprocess:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__nopointer   lcmuk parallel pgi
20%mopts             -j:4                                          lcmuk parallel pgi
21%fopts             -Mcray=pointer:-fastsse:-r8                   lcmuk parallel pgi
22%lopts             -Mcray=pointer:-fastsse:-r8                   lcmuk parallel pgi
23#
24# pure MPI version with debug options
25%remote_username   <replace_by_your_IMUK_username>               lcmuk parallel pgidbg
26%tmp_user_catalog  /localdata                                    lcmuk parallel pgidbg
27%compiler_name     mpif90                                        lcmuk parallel pgidbg
28%compiler_name_ser pgf90                                         lcmuk parallel pgidbg
29%cpp_options       -Mpreprocess:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__nopointer   lcmuk parallel pgidbg
30%mopts             -j:4                                          lcmuk parallel pgidbg
31%fopts             -Mcray=pointer:-O0:-C:-g:-Mbounds:-Mchkstk:-traceback:-r8   lcmuk parallel pgidbg
32%lopts             -Mcray=pointer:-O0:-C:-g:-Mbounds:-Mchkstk:-traceback:-r8   lcmuk parallel pgidbg
33#
34# pure GPU version
35%remote_username   <replace_by_your_IMUK_username>                       lcmuk pgigpu
36%tmp_user_catalog  /localdata                                            lcmuk pgigpu
37%compiler_name     pgf90                                                 lcmuk pgigpu
38%compiler_name_ser pgf90                                                 lcmuk pgigpu
39%cpp_options       -Mpreprocess:-D__nopointer:-D__openacc:-D__cuda_fft   lcmuk pgigpu
40%mopts             -j:4                                                  lcmuk pgigpu
41%fopts             -acc:-ta=nvidia,5.0,nocache:-Minfo=acc:-Mcray=pointer:-fastsse:-r8:-Mcuda=cuda5.0    lcmuk pgigpu
42%lopts             -acc:-ta=nvidia,5.0,nocache:-Minfo=acc:-Mcray=pointer:-fastsse:-r8:-Mcuda=cuda5.0:-L/muksoft/packages/pgi/2013-133/linux86-64/2013/cuda/5.0/l
43ib64:-lcufft    lcmuk pgigpu
44#
45# MPI+GPU
46%remote_username   <replace_by_your_IMUK_username>               lcmuk parallel pgigpu
47%tmp_user_catalog  /localdata                                    lcmuk parallel pgigpu
48%compiler_name     mpif90                                        lcmuk parallel pgigpu
49%compiler_name_ser pgf90                                         lcmuk parallel pgigpu
50%cpp_options       -Mpreprocess:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__nopointer:-D__openacc:-D__cuda_fft   lcmuk parallel pgigpu
51%mopts             -j:4                                          lcmuk parallel pgigpu
52%fopts             -acc:-ta=nvidia,5.0,nocache:-Minfo=acc:-Mcray=pointer:-fastsse:-r8:-Mcuda=cuda5.0    lcmuk parallel pgigpu
53%lopts             -acc:-ta=nvidia,5.0,nocache:-Minfo=acc:-Mcray=pointer:-fastsse:-r8:-Mcuda=cuda5.0:-L/muksoft/packages/pgi/2013-133/linux86-64/2013/cuda/5.0/l
54ib64:-lcufft   lcmuk parallel pgigpu
55#
56%write_binary                true                             restart
57#
58#----------------------------------------------------------------------------
59# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
60#----------------------------------------------------------------------------
61#IC:
62#
63#----------------------------------------------------------------------------
64# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
65#----------------------------------------------------------------------------
66EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
67EC:pwd; ls -al
68#
69#----------------------------------------------------------------------------
70# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
71#----------------------------------------------------------------------------
72#
73# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
74OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
75OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
76#
77# Combine all particle information files
78OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
79#
80#----------------------------------------------------------------------------
81# List of input-files
82#----------------------------------------------------------------------------
83PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
84PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
85TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
86TOPOGRAPHY_DATA_NC       in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo_nc
87NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
88LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
89WTM_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _wtm
90BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
91PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
92DATA_1D_FL_NETCDF        in:locopt     flf      $base_data/$fname/OUTPUT   _fl     nc
93DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
94DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
95DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
96DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
97DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
98DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
99DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
100DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
101DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
102DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
103#
104#----------------------------------------------------------------------------
105# List of output-files
106#----------------------------------------------------------------------------
107BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
108PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
109#
110RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
111RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
112HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
113HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
114CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
115CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
116TURBINE_PARAMETERS01  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters01
117TURBINE_PARAMETERS02  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters02
118TURBINE_PARAMETERS03  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters03
119TURBINE_PARAMETERS04  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters04
120#
121DATA_1D_FL_NETCDF    out:loc:tr   fl#:flf   $base_data/$fname/OUTPUT  _fl      nc
122DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
123DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
124DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
125DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
126DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy      nc
127DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av   nc
128DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz      nc
129DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av   nc
130DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz      nc
131DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av   nc
132DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d      nc
133DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av   nc
134DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
135DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
136DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
137DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
138DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
139DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
140DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
141DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
142DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
143DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
144DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
145DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
146DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
147DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
148DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
149DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
150DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
151DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
152DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
153DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
154DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
155DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
156DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
157DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
158DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
159DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
160DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
161DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
162DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
163DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
164DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
165DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
166DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
167DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
168DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
169DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
170DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
171DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
172DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
173DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
174DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
175DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
176DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
177#
178DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
179DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
180PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
181PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
182PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
183# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |