source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.forwind @ 1449

Last change on this file since 1449 was 1446, checked in by maronga, 10 years ago

removed blanks from <> strings in .mrun.config files / adapted hlrn_watchdog for HLRN-III

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 15.4 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.forwind 1446 2014-08-07 10:08:56Z maronga $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8################################################################################
9# Replace <replace_with_your_local_username> by your username on FLOW. Replace "/fw/"
10# by "/iwes/" if your user directory resides in /iwes/.
11################################################################################
12%output_data       /data/work/gpfs/fw/<replace_with_your_local_username>/palm/current_version/JOBS
13%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
14%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
15%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
16%use_makefile      true
17#
18#
19%host_identifier       flow*            lcflow
20%host_identifier       cfdl*            lcflow
21%host_identifier       cfdh*            lcflow
22%host_identifier       cfdx*            lcflow
23
24################################################################################
25# Replace <eplace_with_your_local_hostname> by the hostname of your desktop
26# an uncomment following line to enable job submission from you local desktop
27################################################################################
28#%host_identifier       <replace_with_your_local_hostname>           lcfor
29
30################################################################################
31# Configuration for Ubuntu Linux 12.04 LTS with gcc (4.6.3) and OpenMPI (1.4.3)
32#
33# The next block contains all informations for compiling the PALM code
34# and for generating and running the PALM executable using MPI on a Linux machine
35# with gcc and OpenMPI. Replace <replace_with_your_local_username> with your
36# username on your
37# local machine
38#
39# NOTE: - Other hosts may require different settings.
40#       - following packages are required:
41#         openmpi-common, libopenmpi-dev, libopenmpi, libnetcdf, libnetcdf-dev,
42#         gcc
43#       - depending on where you installed netcdf, you may have to adjust the paths
44#         given in %netcdf_inc and %netcdf_lib
45#
46################################################################################
47%remote_username   <replace_with_your_local_username>                        lcfor parallel
48%tmp_user_catalog  /tmp                                                      lcfor parallel
49%tmp_data_catalog  /tmp                                                      lcfor parallel
50%compiler_name     mpif90                                                    lcfor parallel
51%compiler_name_ser gfortran                                                  lcfor parallel
52%cpp_options       -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__lc:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__parallel  lcfor parallel
53%netcdf_inc        -I/usr/include                                            lcfor parallel
54%netcdf_lib        -L/usr/lib:-lnetcdff:-lnetcdf                             lcfor parallel
55%mopts             -j:4                                                      lcfor parallel
56%fopts             -Ofast:-IPA:-mtune=native:-march=native:-cpp:-fdefault-real-8:-fbackslash:-fconvert=little-endian   lcfor parallel
57%lopts             -Ofast:-IPA:-mtune=native:-march=native:-cpp:-fdefault-real-8:-fbackslash                           lcfor parallel
58
59################################################################################
60# Configuration for FLOW
61#
62# The next block contains all informations for compiling the PALM code
63# and for generating and running the PALM executable using MPI. Replace <USERNAME_FLOW>
64# with your username on FLOW and if necessary "/fw/" by "/iwes/".
65# The following 'lcflow parallel' block assumes PALM compilation and execution
66# on host flow. Please note that other hosts may require different settings.
67################################################################################
68%remote_username   <replace_with_your_FLOW_username>                                                                             lcflow parallel
69%tmp_user_catalog  /data/work/gpfs/fw/$remote_username/tmp                                                                       lcflow parallel
70%tmp_data_catalog  /data/work/gpfs/fw/$remote_username/palm_restart_data                                                         lcflow parallel
71%compiler_name     mpiifort                                                                                                      lcflow parallel
72%compiler_name_ser ifort                                                                                                         lcflow parallel
73%cpp_options       -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__lc:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__parallel  lcflow parallel
74%netcdf_inc        -I/cm/shared/apps/netcdf-fortran/4.2/intel/64/2011.0.013/include                                              lcflow parallel
75%netcdf_lib        -L/cm/shared/apps/netcdf-fortran/4.2/intel/64/2011.0.013/lib:-lnetcdff:-L/cm/shared/apps/netcdf/4.2.1.1/intel/64/2011.0.013/lib:-lnetcdf:-L/cm/shared/apps/hdf5/1.8.9/intel/64/2011.0.013/lib:-Wl,-rpath:/cm/shared/apps/hdf5/1.8.9/intel/64/2011.0.013/lib:-Wl,-rpath:/cm/shared/apps/netcdf/4.2.1.1/intel/64/2011.0.013/lib:-Wl,-rpath:/cm/shared/apps/netcdf-fortran/4.2/intel/64/2011.0.013/lib       lcflow parallel
76%mopts             -j:8                                                                                                          lcflow parallel
77%fopts             -xhost:-O3:-fpp:-r8:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian:-static-intel   lcflow parallel
78%lopts             -xhost:-O3:-fpp:-r8:-align:all:-ftz:-fno-alias:-no-scalar-rep:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-static-intel:-Wl,-rpath:/cm/shared/apps/intel/ics-2011.0.013/composerxe-2011.0.084/compiler/lib/intel64          lcflow parallel
79%login_init_cmd    .:/etc/bashrc                     lcflow parallel
80%modules           sge/6.2u5p2:netcdf/4.2.1.1/intel/64/2011.0.013:netcdf-fortran/4.2/intel/64/2011.0.013:intel/ics/64/2011.0.013:intel/impi/64/4.1.0.024:hdf5/1.8.9/intel/64/2011.0.013:qt4     lcflow parallel
81%memory            1800                                                                                                          lcflow parallel
82%disc_space        50                                                                                                            lcflow parallel
83#
84#
85%write_binary                true                             restart
86#
87#----------------------------------------------------------------------------
88# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
89#----------------------------------------------------------------------------
90#IC:
91#
92#----------------------------------------------------------------------------
93# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
94#----------------------------------------------------------------------------
95EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
96EC:pwd; ls -al
97#
98#----------------------------------------------------------------------------
99# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
100#----------------------------------------------------------------------------
101#
102# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
103OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
104OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
105#
106# Combine all particle information files
107OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
108#
109#----------------------------------------------------------------------------
110# List of input-files
111#----------------------------------------------------------------------------
112PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT     _p3d
113PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT     _p3df
114TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT     _topo
115NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
116LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
117BININ                    in:loc:flpe   d3f:rec  $base_data/$fname/RESTART   _d3d
118PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART   _rprt
119DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $output_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
120DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $output_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
121DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $output_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
122DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $output_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
123DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
124DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
125DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
126DATA_2D_XZ_AV_NETCDF     in:locopt     xzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
127DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
128DATA_2D_YZ_AV_NETCDF     in:locopt     yzf      $output_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
129DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $output_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
130DATA_3D_AV_NETCDF        in:locopt     3df      $output_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
131DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $output_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
132#
133#----------------------------------------------------------------------------
134# List of output-files
135#----------------------------------------------------------------------------
136BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
137PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
138#
139RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
140RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
141HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
142HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
143CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
144CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
145#
146DATA_1D_PR_NETCDF      out:loc    pr#       $output_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
147DATA_1D_PR_NETCDF      out:loc    prf       $output_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
148DATA_1D_SP_NETCDF      out:loc    sp#       $output_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
149DATA_1D_SP_NETCDF      out:loc    spf       $output_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
150DATA_1D_TS_NETCDF      out:loc    ts#       $output_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
151DATA_1D_TS_NETCDF      out:loc    tsf       $output_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
152DATA_1D_PTS_NETCDF     out:loc    pts#      $output_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
153DATA_1D_PTS_NETCDF     out:loc    ptsf      $output_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
154DATA_2D_XY_NETCDF      out:loc    xy#:xyf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xy      nc
155DATA_2D_XY_AV_NETCDF   out:loc    xy#:xyf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xy_av   nc
156DATA_2D_XZ_NETCDF      out:loc    xz#:xzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xz      nc
157DATA_2D_XZ_AV_NETCDF   out:loc    xz#:xzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _xz_av   nc
158DATA_2D_YZ_NETCDF      out:loc    yz#:yzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _yz      nc
159DATA_2D_YZ_AV_NETCDF   out:loc    yz#:yzf   $output_data/$fname/OUTPUT  _yz_av   nc
160DATA_3D_NETCDF         out:loc    3d#:3df   $output_data/$fname/OUTPUT  _3d      nc
161DATA_3D_AV_NETCDF      out:loc    3d#:3df   $output_data/$fname/OUTPUT  _3d_av   nc
162DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
163DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
164DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
165DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
166DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
167DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
168DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
169DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
170DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
171DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
172DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
173DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
174DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
175DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
176DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
177DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
178DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
179DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
180DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
181DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
182DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
183DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
184DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
185DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
186DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
187DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
188DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
189DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
190DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
191DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
192DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
193DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
194DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
195DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
196DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
197DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
198DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
199DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
200DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
201DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc    ma#:maf   $output_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
202DATA_PRT_NETCDF        out:loc:pe prt#:prtf $output_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
203DATA_DVR               out:loc:pe dvr       $output_data/$fname/OUTPUT  _dvr
204#
205DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
206DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
207PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
208PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
209PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
210# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.