Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.dkrz @ 1807

Last change on this file since 1807 was 1625, checked in by heinze, 9 years ago

fftw and netcdf libraries added
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 13.7 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.dkrz 1625 2015-07-20 10:33:04Z gronemeier $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11#%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19#
20# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
21%host_identifier   mlogin1*    lcbullhh
22%host_identifier   m1*         lcbullhh
23#
24# DKRZ Hamburg
25%project_account     <replace_by_your_DKRZ_project_account>                                                lcbullhh parallel
26%tmp_user_catalog    /work/<replace_by_your_DKRZ_project_account>/<replace_by_your_DKRZ_username>          lcbullhh parallel
27%tmp_data_catalog    /work/<replace_by_your_DKRZ_project_account>/<replace_by_your_DKRZ_username>/JOBS     lcbullhh parallel
28%compiler_name       mpif90                                                                                lcbullhh parallel
29%compiler_name_ser   ifort                                                                                 lcbullhh parallel
30%fftw_inc          -I:/sw/rhel6-x64/numerics/fftw-3.3.4-bullxmpi-gcc48/include                             lcbullhh parallel
31%fftw_lib          -L/sw/rhel6-x64/numerics/fftw-3.3.4-bullxmpi-gcc48/lib:-lfftw3                          lcbullhh parallel
32%netcdf_inc        -I:/sw/rhel6-x64/netcdf/netcdf_fortran-4.4.2-parallel-bullxmpi-intel14/include          lcbullhh parallel
33%netcdf_lib        -L/sw/rhel6-x64/netcdf/netcdf_fortran-4.4.2-parallel-bullxmpi-intel14/lib:-lnetcdff     lcbullhh parallel
34%cpp_options         -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__lc:-D__parallel:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__intel_compiler:-D__fftw=__fftw lcbullhh parallel
35%mopts               -j:4                                                                                  lcbullhh parallel
36%fopts               -O3:-nbs:-convert:little_endian                                                       lcbullhh parallel
37%lopts               -O3:-nbs:-convert:little_endian:-lc:-lm:-Wl,-rpath=/sw/rhel6-x64/netcdf/netcdf_fortran-4.4.2-parallel-bullxmpi-intel14/lib:-Wl,-rpath=/sw/rhel6-x64/numerics/fftw-3.3.4-bullxmpi-gcc48/lib             lcbullhh parallel
38%remote_username     <replace_by_your_DKRZ_username>                                                       lcbullhh parallel
39%memory              1500                                                                                  lcbullhh parallel
40%modules             intel:mxm:fca:bullxmpi_mlx:nag                                                        lcbullhh parallel
41#
42# HLRN-III Hannover debug/trace mode
43%project_account     <replace_by_your_DKRZ_project_account>                                                lcbullhh parallel trace
44%tmp_user_catalog    /work/<replace_by_your_DKRZ_project_account>/<replace_by_your_DKRZ_username>          lcbullhh parallel trace
45%tmp_data_catalog    /work/<replace_by_your_DKRZ_project_account>/<replace_by_your_DKRZ_username>/JOBS     lcbullhh parallel trace
46%compiler_name       mpif90                                                                                lcbullhh parallel trace
47%compiler_name_ser   ifort                                                                                 lcbullhh parallel trace
48%fftw_inc          -I:/sw/rhel6-x64/numerics/fftw-3.3.4-bullxmpi-gcc48/include                             lcbullhh parallel trace
49%fftw_lib          -L/sw/rhel6-x64/numerics/fftw-3.3.4-bullxmpi-gcc48/lib:-lfftw3                          lcbullhh parallel trace
50%netcdf_inc        -I:/sw/rhel6-x64/netcdf/netcdf_fortran-4.4.2-parallel-bullxmpi-intel14/include          lcbullhh parallel trace
51%netcdf_lib        -L/sw/rhel6-x64/netcdf/netcdf_fortran-4.4.2-parallel-bullxmpi-intel14/lib:-lnetcdff     lcbullhh parallel trace
52%cpp_options         -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__lc:-D__parallel:-D__netcdf:-D__netcdf4:-D__netcdf4_parallel:-D__intel_compiler:-D__fftw=__fftw lcbullhh parallel trace
53%mopts               -j:4                                                                                  lcbullhh parallel trace
54%fopts             -O0:-nbs:-convert:little_endian:-fpe0:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-C:-check:nooutput_conversion:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-align:all     lcbullhh parallel trace
55%lopts             -O0:-nbs:-convert:little_endian:-fpe0:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-C:-check:nooutput_conversion:-debug:-traceback:-g:-w:-xT:-align:all:-lc:-lm:-Wl,-rpath=/sw/rhel6-x64/netcdf/netcdf_fortran-4.4.2-parallel-bullxmpi-intel14/lib:-Wl,-rpath=/sw/rhel6-x64/numerics/fftw-3.3.4-bullxmpi-gcc48/lib             lcbullhh parallel trace
56%remote_username     <replace_by_your_DKRZ_username>                                                       lcbullhh parallel trace
57%memory              1500                                                                                  lcbullhh parallel trace
58%modules             intel:mxm:fca:bullxmpi_mlx:nag                                                        lcbullhh parallel trace
59#
60#
61%write_binary                true                             restart
62#
63#----------------------------------------------------------------------------
64# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
65#----------------------------------------------------------------------------
66#IC:
67#
68#----------------------------------------------------------------------------
69# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
70#----------------------------------------------------------------------------
71EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
72EC:pwd; ls -al
73#
74#----------------------------------------------------------------------------
75# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
76#----------------------------------------------------------------------------
77# Combine all particle information files
78OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
79#
80#----------------------------------------------------------------------------
81# List of input-files
82#----------------------------------------------------------------------------
83PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
84PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
85TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
86NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
87LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
88BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
89PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
90DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
91DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
92DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
93DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
94DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
95DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
96DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
97DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
98DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
99DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
100#
101#----------------------------------------------------------------------------
102# List of output-files
103#----------------------------------------------------------------------------
104BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
105PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
106#
107RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
108RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
109HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
110HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
111CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
112CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
113#
114DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr      nc
115DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp      nc
116DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts      nc
117DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts     nc
118DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy      nc
119DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av   nc
120DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz      nc
121DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av   nc
122DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz      nc
123DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av   nc
124DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d      nc
125DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av   nc
126DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
127DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
128DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
129DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
130DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
131DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
132DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
133DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
134DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
135DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
136DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
137DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
138DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
139DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
140DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
141DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
142DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
143DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
144DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
145DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
146DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
147DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
148DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
149DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
150DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
151DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
152DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
153DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
154DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
155DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
156DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
157DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
158DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
159DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
160DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
161DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
162DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
163DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
164DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
165DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
166DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
167DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt     nc
168DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
169#
170DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
171DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
172PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
173PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
174PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
175# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |