Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.default @ 96

Last change on this file since 96 was 86, checked in by raasch, 18 years ago

small bugfixes
File size: 17.9 KB
RevLine 
[1]1#column 1          column 2                                   column 3
2#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
3#----------------------------------------------------------------------------
4%mainprog          palm.f90
[40]5%base_directory    $HOME/palm/current_version
6%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
7%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
[1]8%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
9%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
10%use_makefile      true
11#
[83]12# Enter your own host below by adding another line containing in the second
13# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
14# third column the host identifier. Depending on your system, the first
15# characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
16# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
17%host_identifier   bora        lcmuk
18%host_identifier   cs*         nech
19%host_identifier   hreg*-en0   ibmh
20%host_identifier   hanni*-en0  ibmh
21%host_identifier   breg*-en0   ibmb
22%host_identifier   berni*-en0  ibmb
[86]23%host_identifier   tgg*        lctit
[83]24#
[40]25#%remote_username   <replace by your linux cluster username>     lcmuk parallel
[1]26%tmp_user_catalog  /tmp                                          lcmuk parallel
27%compiler_name     mpif90                                        lcmuk parallel
[36]28%compiler_name_ser ifort                                         lcmuk parallel
[83]29%cpp_options       -DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__netcdf_64bit:-D__intel_openmp_bug   lcmuk parallel
30%netcdf_inc        -I:/muksoft/packages/netcdf/linux/include            lcmuk parallel
31%netcdf_lib        -L/muksoft/packages/netcdf/linux/lib:-lnetcdf        lcmuk parallel
[1]32%fopts             -axW:-cpp:-openmp:-r8:-nbs:-convert:little_endian     lcmuk parallel
33%lopts             -axW:-cpp:-openmp:-r8:-nbs:-Vaxlib                    lcmuk parallel
34#%hostfile          $base_directory/.hostfile                    lcmuk parallel
35#
[40]36#%remote_username  <replace by your linux cluster username>      lcmuk
[1]37%tmp_user_catalog  /tmp                                          lcmuk
38%compiler_name     ifort                                         lcmuk
39%fopts             -axW:-cpp:-r8:-nbs:-convert:little:endian     lcmuk
40%lopts             -axW:-cpp:-r8:-nbs:-Vaxlib                    lcmuk
41#
[40]42#%remote_username  <replace by your linux cluster username>      lcmuk trace
[1]43%tmp_user_catalog  /tmp                                          lcmuk trace
44%compiler_name     ifort                                         lcmuk trace
45%fopts             -axW:-cpp:-g:-CB:-inline_debug_info:-r8:-nbs:-convert:little:endian     lcmuk trace
46%lopts             -axW:-cpp:-g:-CB:-inline_debug_info:-r8:-nbs:-Vaxlib                    lcmuk trace
47#
[86]48#%remote_username   <replace by your tsubame username>              lctit parallel
49#%tmp_user_catalog  <replace by your user_catalog>                  lctit parallel
50#%tmp_data_catalog  <replace by your data_catalog>                  lctit parallel
51%cpp_options       -Mpreprocess:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf  lctit parallel
52%netcdf_inc        -I:/home2/usr5/mkanda/netcdf-3.6.2/include      lctit parallel
53%netcdf_lib        -L/home2/usr5/mkanda/netcdf-3.6.2/lib:-lnetcdf  lctit parallel
54%compiler_name_ser pgf95                                           lctit parallel
55%compiler_name     mpif90                                          lctit parallel
56%fopts             -r8:-fast:-fastsse                              lctit parallel
57%lopts             -r8:-fast:-fastsse                              lctit parallel
58#
[40]59#%remote_username   <replace by your HLRN username>           ibmh parallel
[1]60%compiler_name     mpxlf95_r                                  ibmh parallel
[36]61%compiler_name_ser xlf95                                      ibmh parallel
[83]62%cpp_options       -qsuffix=cpp=f90:-WF,-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION,-D__netcdf=__netcdf,-D__netcdf_64bit=__netcdf_64bit  ibmh parallel
63%dvrp_inc          -I/home/h/nikevita/lib_stable/optimize     ibmh parallel
64%dvrp_lib          -L/home/h/nikevita/lib_stable/optimize:-lDVRP2:-lftp  ibmh parallel
65%netcdf_inc        -I:/aws/dataformats/netcdf-3.6.0-p1/64-32/include-64 ibmh parallel
66%netcdf_lib        -L/aws/dataformats/netcdf-3.6.0-p1/64-32/lib:-lnetcdf        ibmh parallel
67%fopts             -O3:-g:-qfloat=nomaf:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qtune=pwr4:-qarch=pwr4:-qnosave:-qnoescape    ibmh parallel
68%lopts             -O3:-g:-qfloat=nomaf:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qtune=pwr4:-qarch=pwr4:-qnosave:-qnoescape:-lesslsmp   ibmh parallel
[1]69%memory            1630                                       ibmh parallel
70%cpumax            1000                                       ibmh parallel
71%numprocs          4                                          ibmh parallel
[40]72#%tmp_data_catalog  /fastfs/work/<replace by your HLRN username>/palm_restart_data    ibmh parallel
73#%email_notification  <replace by your email addres>          ibmh parallel
[1]74#
[40]75#%remote_username   <replace by your HLRN username>           ibmh parallel debug
[1]76%compiler_name     mpxlf95_r                                  ibmh parallel debug
[36]77%compiler_name_ser xlf95                                      ibmh parallel debug
[83]78%fopts             -qnoopt:-g:-C:-qinitauto=FFFFFFFF:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qnosave:-qnoescape:-qflttrap=overflow::zerodivide::invalid::enable:-qsigtrap    ibmh parallel debug
79%lopts             -qnoopt:-g:-C:-qinitauto=FFFFFFFF:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qnosave:-qnoescape:-qflttrap=overflow::zerodivide::invalid::enable:-qsigtrap:-lesslsmp  ibmh parallel debug
[1]80%memory            1000                                       ibmh parallel debug
81%cpumax            1000                                       ibmh parallel debug
82%numprocs          4                                          ibmh parallel debug
[40]83#%tmp_data_catalog  /fastfs/work/<replace by your HLRN username>/palm_restart_data    ibmh parallel debug
[1]84#
[40]85#%remote_username   <replace by your HLRN username>           ibmb parallel
[1]86%compiler_name     mpxlf95_r                                  ibmb parallel
[36]87%compiler_name_ser xlf95                                      ibmb parallel
[1]88%fopts             -O3:-g:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qtune=pwr4:-qarch=pwr4:-qnosave:-qnoescape    ibmb parallel
89%lopts             -O3:-g:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qtune=pwr4:-qarch=pwr4:-qnosave:-qnoescape:-lesslsmp  ibmb parallel
90%memory            1630                                       ibmb parallel
91%cpumax            1000                                       ibmb parallel
92%numprocs          4                                          ibmb parallel
[63]93#%tmp_data_catalog  /fastfs/work/<replace by your HLRN username>/palm_restart_data    ibmb parallel debug
[1]94#
[40]95#%remote_username   <replace by your DKRZ username>           nech parallel
[1]96%compiler_name     sxmpif90                                   nech parallel
[36]97%compiler_name_ser sxf90                                      nech parallel
[83]98%cpp_options       -Ep:-DMPI_REAL=MPI_REAL8:-DMPI_2REAL=MPI_2REAL8:-DSCFFT=DZFFT:-DCSFFT=ZDFFT:-D__netcdf:-D__netcdf_64bit  nech parallel
99%netcdf_inc        -I:/pool/SX-6/netcdf/netcdf-3.6.0-p1/include  nech parallel
100%netcdf_lib        -L/pool/SX-6/netcdf/netcdf-3.6.0-p1/lib:-lnetcdf  nech parallel
[1]101%fopts             -C:hopt:-Wf:\'-init:stack=nan:-init:heap=nan:-A:idbl4:-pvctl:fullmsg\':-ftrace:-P:stack:-pi:auto:-pi:line=1000  nech parallel
102%lopts             -C:hopt:-Wf:\'-init:stack=nan:-init:heap=nan:-A:idbl4\':-ftrace:-P:stack:-pi:auto:-pi:line=1000:-L/SX/opt/MathKeisan/MK1_6/lib/:-l:fft  nech parallel
103%memory            4000                                       nech parallel
104%cpumax            1000                                       nech parallel
105%numprocs          4                                          nech parallel
106%tmp_data_catalog  $WRKSHR/palm_restart_data                  nech parallel
[40]107#%email_notification  <replace by your email addres>          nech parallel
[1]108#
[40]109#%remote_username   <replace by your NEC-username>             neck parallel
[17]110%compiler_name     sxmpif90                                   neck parallel
[36]111%compiler_name_ser sxf90                                      neck parallel
[83]112%cpp_options       -Ep:-DMPI_REAL=MPI_REAL8:-DMPI_2REAL=MPI_2REAL8:-DSCFFT=DZFFT:-DCSFFT=ZDFFT:-D__netcdf:-D__netcdf_64bit  neck parallel
113%netcdf_inc        -I:/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/netcdf-3.6.0-p1/include  neck parallel
114%netcdf_lib        -L/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/netcdf-3.6.0-p1/lib:-lnetcdf  neck parallel
115%dvrp_inc          -I/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/dvrp          neck parallel
116%dvrp_lib          -L/home/DSRC/NC/tatuyama/pub/dvrp:-lDVRP2:-lftp  neck parallel
[17]117%fopts             -C:hopt:-Wf:\'-init:stack=nan:-init:heap=nan:-A:idbl4:-pvctl:fullmsg\':-ftrace:-P:stack:-pi:auto:-pi:line=1000  neck parallel
118%lopts             -C:hopt:-Wf:\'-init:stack=nan:-init:heap=nan:-A:idbl4\':-ftrace:-P:stack:-pi:auto:-pi:line=1000:-L/SX/opt/MathKeisan/MK1_6/lib/:-l:fft  neck parallel
119%memory            4000                                       neck parallel
120%cpumax            1000                                       neck parallel
121%numprocs          4                                          neck parallel
[40]122#%tmp_user_catalog  <replace by your temporary directory>     neck parallel
123#%tmp_data_catalog  <replace by your temp. dir.>/palm_restart_data   neck parallel
[17]124#
[1]125%source_path       $base_directory/SOURCE                     ibmy parallel
126%compiler_name     mpxlf95_r                                  ibmy parallel
[36]127%compiler_name_ser xlf95                                      ibmy parallel
[1]128%fopts             -O3:-g:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qtune=pwr4:-qarch=pwr4:-qnosave:-qnoescape    ibmy parallel
129%lopts             -O3:-g:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qtune=pwr4:-qarch=pwr4:-qnosave:-qnoescape    ibmy parallel
130%memory            1000                                       ibmy parallel
131%cpumax            1000                                       ibmy parallel
132%numprocs          4                                          ibmy parallel
133%remote_username   raasch                                     ibmy parallel
134%tmp_data_catalog  /usr1/users/raasch/work                    ibmy parallel
135%tmp_user_catalog  /usr1/users/raasch/work                    ibmy parallel
136%email_notification  raasch@muk.uni-hannover.de               ibmy parallel
137#
138%compiler_name     mpxlf95_r                                  ibmy parallel trace
[36]139%compiler_name_ser xlf95                                      ibmy parallel trace
[1]140%fopts             -qnoopt:-g:-C:-qinitauto=FFFFFFFF:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qnosave:-qnoescape:-qflttrap=overflow::zerodivide::invalid::enable:-qsigtrap  ibmy parallel trace
141%lopts             -qnoopt:-g:-C:-qinitauto=FFFFFFFF:-qrealsize=8:-Q:-q64:-qmaxmem=-1:-qnosave:-qnoescape:-qflttrap=overflow::zerodivide::invalid::enable:-qsigtrap  ibmy parallel trace
142%memory            1000                                       ibmy parallel trace
143%cpumax            1000                                       ibmy parallel trace
144%numprocs          4                                          ibmy parallel trace
145%remote_username   raasch                                     ibmy parallel trace
146%tmp_data_catalog  /usr1/users/raasch/work                    ibmy parallel trace
147%tmp_user_catalog  /usr1/users/raasch/work                    ibmy parallel trace
148%email_notification  raasch@muk.uni-hannover.de               ibmy parallel trace
149#
150%write_binary                true                             restart
151#
152#----------------------------------------------------------------------------
153# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
154#----------------------------------------------------------------------------
155#IC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = t3e ]]  &&  assign -F cachea:512:1:1 f:BININ
156#
157#----------------------------------------------------------------------------
158# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
159#----------------------------------------------------------------------------
160EC:[[ \$locat = compile && ( \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = t3e ) ]]  &&  cat  cflist.out
161EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
162EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/*
163EC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = t3e ]]  &&  ls -al
164EC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = ibm ]]  &&  ls -al
165#
166#----------------------------------------------------------------------------
167# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
168#----------------------------------------------------------------------------
169#
170OC:[[ -f CPU_MEASURES/_0000 ]]  &&  cat  CPU_MEASURES/* >> CPU_MEASURE_ALL
171# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
172OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
173OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
174#
175# Combine all particle information files
176OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
177#
178# Extend number of files to be opened simultaneously (sometimes necessary
179# for combine_plot_fields
180#OC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = t3e ]]  &&  limit -v -f 255 -p 0
181#
182# Combine the 2D- and 3D-plot-data of the subdomains (one file per PE) to
183# one file respectively
184OC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = t3e ]]  &&  combine_plot_fields.x
185OC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = ibm ]]  &&  combine_plot_fields.x
186OC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = nec ]]  &&  combine_plot_fields.x
187OC:[[ \$( echo \$localhost | cut -c1-3 ) = dec ]]  &&  combine_plot_fields.x
188#
189# Combine parameter files necessary for plot software (iso2d + AVS)
190OC:[[ -f PLOT2D_XY_GLOBAL   ]]  &&  cat  PLOT2D_XY_LOCAL >> PLOT2D_XY_GLOBAL
191OC:[[ -f PLOT2D_XZ_GLOBAL   ]]  &&  cat  PLOT2D_XZ_LOCAL >> PLOT2D_XZ_GLOBAL
192OC:[[ -f PLOT2D_YZ_GLOBAL   ]]  &&  cat  PLOT2D_YZ_LOCAL >> PLOT2D_YZ_GLOBAL
193OC:[[ -f PLOT3D_FLD         ]]  &&  cat  PLOT3D_FLD_COOR >> PLOT3D_FLD
194#
195# tar all 3D-plot-data files in case that compressed output is switched on
196OC:[[ -f PLOT3D_COMPRESSED  ]]  &&  tar cf  PLOT3D_DATA  PLOT3D_DATA_*
197#
198#----------------------------------------------------------------------------
199# List of input-files
200#----------------------------------------------------------------------------
[18]201PARIN                    in:job        d3#   $base_data/$fname/INPUT    _p3d
202PARIN                    in:job        d3f   $base_data/$fname/INPUT    _p3df
203TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#   $base_data/$fname/INPUT    _topo
204BININ                    in:loc:flpe   d3f   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
205PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf  $base_data/$fname/RESTART  _rprt
206DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf   $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
207DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf   $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
208DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf   $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
209DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf  $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
210DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf   $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
211DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf   $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
212DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf   $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
213DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf   $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
214DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df   $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
215DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf  $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
[1]216#
217#----------------------------------------------------------------------------
218# List of output-files
219#----------------------------------------------------------------------------
[18]220BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
221PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
[1]222#
[18]223RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
224RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
225HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
226HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
227CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
228CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
229DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#     $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
230DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf     $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
231PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#     $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
232PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf     $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
[1]233#
[18]234DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
235#DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc      pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
236DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
237DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
238DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
239DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
240DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
241DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
242DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
243DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
244DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
245DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
246DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
247DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
248DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
[1]249#
[18]250PLOT3D_FLD        out:loc:tr   avs     $base_data/$fname/OUTPUT      _fld  fld
251PLOT3D_COOR       out:loc:tr   avs     $base_data/$fname/OUTPUT      _avscor
252PLOT3D_DATA       out:loc:tr   avs     $base_data/$fname/OUTPUT      _avs
253PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT    _prt_dat
254
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |