Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.cuhk @ 2299

Last change on this file since 2299 was 2264, checked in by raasch, 7 years ago

configuration files adapted to r2262
File size: 12.1 KB
RevLine 
[1657]1#$Id: .mrun.config.cuhk 1231 2013-09-20 11:25:45Z knoop $
[1235]2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
[1446]20%host_identifier   <replace_with_your_hostname>  lccuhk
[1235]21#
22#
23# The next block contains all informations for compiling the PALM code
[1657]24# and for generating and running the PALM executable using MPI.
[1235]25# Compilernames, cpp-options and compiler-options are assuming
[1657]26# an GNU-Compiler and mpich2 on this host! Please change
[1235]27# appropriately, if you are using a different compiler / MPI-Version.
28#
[1657]29# CUHK
30%remote_username   student                                       lccuhk parallel
31%tmp_user_catalog  $HOME/palm/tmp                                lccuhk parallel
[1235]32%compiler_name     mpif90                                        lccuhk parallel
[1657]33%compiler_name_ser gfortran                                      lccuhk parallel
34%cpp_options       -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__lc:-D__netcdf:-D__parallel   lccuhk parallel
35%netcdf_inc        -I:$HOME/opt/netcdf-3.6.3/include             lccuhk parallel
36%netcdf_lib        -L:$HOME/opt/netcdf-3.6.3/lib:-lnetcdf        lccuhk parallel
37%mopts             -j:8                                          lccuhk parallel
38%fopts             -Ofast                                        lccuhk parallel
39%lopts             -Ofast                                        lccuhk parallel
[1235]40#
[1657]41# CUHK debug/trace mode
42%remote_username   student                                       lccuhk parallel trace
43%tmp_user_catalog  $HOME/palm/tmp                                lccuhk parallel trace
[1235]44%compiler_name     mpif90                                        lccuhk parallel trace
[1657]45%compiler_name_ser gfortran                                      lccuhk parallel trace
46%cpp_options       -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__lc:-D__netcdf:-D__parallel   lccuhk parallel trace
47%netcdf_inc        -I:$HOME/opt/netcdf-3.6.3/include             lccuhk parallel trace
48%netcdf_lib        -L:$HOME/opt/netcdf-3.6.3/lib:-lnetcdf        lccuhk parallel trace
49%mopts             -j:8                                          lccuhk parallel trace
50%fopts             -O0:-Wall:-fbacktrace                         lccuhk parallel trace
51%lopts             -O0:-Wall:-fbacktrace                         lccuhk parallel trace
[1235]52#
53#
54%write_binary                true                             restart
55#
56#----------------------------------------------------------------------------
[2260]57# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
[1235]58#----------------------------------------------------------------------------
59#IC:
60#
61#----------------------------------------------------------------------------
62# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
63#----------------------------------------------------------------------------
64EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
65EC:pwd; ls -al
66#
67#----------------------------------------------------------------------------
68# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
69#----------------------------------------------------------------------------
70#
71# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
72OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
73OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
74#
75# Combine all particle information files
76OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
77#
78#----------------------------------------------------------------------------
79# List of input-files
80#----------------------------------------------------------------------------
81PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
82PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
83TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
[2236]84TOPOGRAPHY_DATA_NC       in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo_nc
[1241]85NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
86LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
[1914]87WTM_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _wtm
[2260]88STG_PROFILES             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _stgpr
[2264]89BININ                    in:loc:lnpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
90PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:lnpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
[1959]91DATA_1D_FL_NETCDF        in:locopt     flf      $base_data/$fname/OUTPUT   _fl     nc
[1235]92DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
93DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
94DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
95DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
96DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
97DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
98DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
99DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
100DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
101DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
102#
103#----------------------------------------------------------------------------
104# List of output-files
105#----------------------------------------------------------------------------
[2264]106BINOUT                    out:loc:lnpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
107PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:lnpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
[1235]108#
109RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
110RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
111HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
112HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
113CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
114CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
[1914]115TURBINE_PARAMETERS01  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters01
116TURBINE_PARAMETERS02  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters02
117TURBINE_PARAMETERS03  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters03
118TURBINE_PARAMETERS04  out:loc:tr  d3#:d3f   $base_data/$fname/MONITORING  _turbine_parameters04
[1235]119#
[1959]120DATA_1D_FL_NETCDF    out:loc:tr   fl#:flf   $base_data/$fname/OUTPUT  _fl     nc
[1235]121DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
122DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
123DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
124DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
125DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
126DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
127DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
128DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
129DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
130DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
131DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
132DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
133DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
134DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
135DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
136DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
137DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
138DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
139DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
140DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
141DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
142DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
143DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
144DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
145DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
146DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
147DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
148DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
149DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
150DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
151DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
152DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
153DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
154DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
155DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
156DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
157DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
158DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
159DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
160DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
161DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
162DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
163DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
164DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
165DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
166DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
167DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
168DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
169DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
170DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
171DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
172DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
173DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
[2260]174DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
[1235]175#
176DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
177DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
178PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
179PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
[2264]180PARTICLE_DATA     out:loc:lnpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
[1235]181# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |